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PAPILLOMAVIRUS

THÉMATIQUE À TAPER
(HPV)

Classification des papillomavirus (HPV)


Michel Segondya,*

RÉSUMÉ
SUMMARY
L papillomavirus
Les ill i humains
h i (HPV) présentent
é t t une très
t è grande
d diversité
di ité
génétique. Une centaine de types regroupés en genres et en espèces ont Classification of papillomaviruses (HPV)
été répertoriés. La classification des HPV est basée sur leur séquence Human papillomaviruses (HPV) are viruses
génomique, plus précisément au niveau du gène L1 codant pour la pro- displaying a high genetic diversity. About one
téine majeure de capside. Les différents types d’HPV se caractérisent par hundred HPV types which are classified in different
leur tropisme tissulaire et on distingue des types d’HPV à tropisme cutané genus and species have been identified. HPV
ou à tropisme muqueux. Ils se caractérisent également par leur pouvoir classification is based on the genomic sequence
oncogène et on distingue les types d’HPV à faible pouvoir oncogène of the L1 gene which encodes the major capsid
(HPV à bas risque) et ceux à fort pouvoir oncogène (HPV à haut risque). protein. The different HPV types are characterized
by their tissue tropism, and HPV types with
Papillomavirus – HPV – types – tropisme – pouvoir oncogène. either cutaneous or mucosal tropism can be
distinguished. They are also characterized by
their oncogenic potential and one can distinguish
between highly oncogenic HPV types (high-risk
1. Introduction HPV) and weakly oncogneic HPV types (low-
risk HPV).
Les papillomavirus sont des virus à ADN qui infectent les
épithéliums malpighiens de nombreuses espèces anima- Papillomavirus – HPV – types – tropism –
les. Les papillomavirus retrouvés chez l’homme portent le oncogenic potential.
nom de papillomavirus humains ou human papillomavirus
(HPV). L’étude de ces virus a été pendant longtemps limi-
tée par la quasi-impossibilité de les cultiver in vitro et ce
n’est qu’à partir des années 80 que le développement des
techniques de biologie moléculaire a permis de mettre en
évidence la place importante de ces virus en pathologie
humaine, en particulier dans la survenue de certains can-
cers. L’analyse des séquences génomiques de ces virus a
rapidement montré qu’il existait un grand nombre d’HPV complet de leur génome. Cependant, sur la base des
et ces séquences sont à la base de la classification des nombreuses séquences subgénomiques disponibles dans
HPV. On peut également différencier les HPV sur la base les bases de données, on estime que le nombre réel de
de leur tropisme ou de leur pouvoir oncogène. types d’HPV est beaucoup plus élevé.
En fonction des homologies de séquence et des analy-
ses phylogénétiques, les papillomavirus sont subdivisés
2. Diversité des papillomavirus en genres, familles et types. Au sein des différents types
de papillomavirus, on peut identifier des sous-types et
La famille des Papillomaviridae comporte de très nom- des variants.
breux virus infectant diverses espèces de mammifères et La diversité génétique des HPV s’accompagne d’une diver-
d’oiseaux. Ce sont les virus humains qui ont été étudiés sité biologique qui s’exprime notamment dans le tropisme
de la manière la plus extensive et une centaine de types des virus ou dans leur pouvoir oncogène.
d’HPV ont été actuellement identifiés par séquençage En ce qui concerne le tropisme, on distingue les HPV
qui ont un tropisme cutané et ceux qui ont un tropisme
muqueux. Les HPV à tropisme muqueux se localisent
essentiellement au niveau des muqueuses ano-génitales,
a Pôle d’infectiologie – Laboratoire de virologie
certains d’entre eux peuvent être également retrouvés au
Centre hospitalier universitaire de Montpellier
niveau de la sphère oro-pharyngée.
80, av. Augustin-Fliche
Le pouvoir oncogène des HPV concerne essentiellement
34295 Montpellier cedex 5
les HPV à tropisme muqueux et on distingue les HPV dits
à haut risque (high-risk HPV, HR-HPV) — qui sont les HPV
* Correspondance
que l'on peut retrouver dans des lésions de haut grade ou
m-segondy@chu-montpellier.fr
des carcinomes invasifs — et les HPV dits à bas risque
(low-risk HPV, LR-HPV) qui retrouvés dans des lésions ne
article reçu le 13 mars, accepté le 13 mai 2008. présentent pas un risque avéré d’évolution maligne.
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Tableau I – Classification des HPV 3. Classification des HPV
(d’après de Villiers et al. [1]).
Genre Espèce
Type Autre
Commentaires
3.1. Basée sur la séquence génomique
principal types C’est la séquence nucléotidique du gène L1, codant
Bas risque, lésions pour la protéine majeure de capside, qui sert de base à
1 HPV 32 HPV 42
orales ou génitales
la classification des papillomavirus. Pour qu’un nouveau
Bas risque, lésions
HPV 3, 28, type d’HPV soit reconnu, il faut que le génome complet
2 HPV 10 cutanées, parfois
29, 78, 94
muqueuses du virus ait été séquencé et que sa séquence L1 présente
HPV 62, 72,
Bas risque, lésions une divergence de plus de 10 % avec la séquence L1
3 HPV 61 81, 83, 84,
muqueuses du type connu le plus proche génétiquement. Une diffé-
86, 87, 89
rence de 2 à 10 % définit l’appartenance à un sous-type
4 HPV 2 HPV 27, 57 Verrues vulgaires
et une différence de moins de 2 % définit un variant [1].
HPV 51, Haut risque, lésions
5 HPV 26
69, 82 muqueuses
Ainsi les virus initialement dénommés HPV 46, HPV 55
HPV 30, Haut risque, lésions et HPV 64 sont maintenant considérés comme les sous-
6 HPV 53 types respectifs de HPV 20, HPV 44 et HPV 34, en raison
56, 66 muqueuses
HPV 39, d’homologies supérieures à 90 %.
Haut risque, lésions
7 HPV 18 45, 59, 68, Les différents types de papillomavirus sont regroupés
muqueuses
70, 85
Alpha- en espèces qui sont désignées par un numéro d’espèce.
HPV 40, Bas risque lésions cu-
papillomavirus 8 HPV 7
43, 91 tanées et muqueuses
Une espèce regroupe les types présentant une homologie
HPV 31, de séquence L1 supérieure à 70 %.
Haut risque, lésions
9 HPV 16 33, 35, 52,
muqueuses
Les différentes espèces sont regroupées en genres (alpha-
58, 67 papillomavirus, beta-papillomavirus, etc.). L’appartenan-
Bas risque, condylo- ce à un même genre est définie par une homologie de
HPV 11, 13,
10 HPV 6 mes acuminés, papillo-
44, 74 séquence L1 supérieure à 60 %. Les HPV se répartissent
matose laryngée
Haut risque, lésions dans les genres alpha-papillomavirus, beta-papilloma-
11 HPV 34 HPV 73
muqueuses virus, gamma-papillomavirus, mu-papillomavirus et nu-
Papillomavirus singe papillomavirus. La classification des HPV est présentée
12 RhPV 1
Rhésus
dans le tableau I.
Bas risque, lésions
13 HPV 54
muqueuses
Bas risque, lésions
14 HPV 90
muqueuses
Bas risque, lésions
3.2. Basée sur le tropisme
15 HPV 71 On distingue habituellement les types HPV à tropisme
muqueuses
Lésions cutanées, cutané et ceux à tropisme muqueux. Cette distinc-
HPV 8, 12, généralement béni- tion n’est pas toujours absolue, certains types d’HPV
14, 19, 20, gnes. Lésions parfois n’ayant pas un tropisme strict pour la peau ou les muqueu-
1 HPV 5
21, 25, 36, malignes: épidermo-
47, 93 dysplasie verruciforme, ses (tableau II). Les HPV à tropisme muqueux appartiennent
immunodéprimés au genre alpha-papillomavirus, alors que les HPV à tropis-
Lésions cutanées, me cutané appartiennent essentiellement aux genres beta-
généralement béni- papillomavirus et gamma-papillomavirus ainsi qu’aux genres
HPV 15, 17,
gnes. Lésions parfois
2 HPV 9 22, 23, 37,
malignes: épidermo-
mu-papillomavirus et nu-papillomavirus (tableau I).
Beta- 38, 80
papillomavirus dysplasie verruciforme, Bien qu’une quarantaine de types d’HPV cutanés aient
immunodéprimés été identifiés par séquençage complet, le nombre de
3 HPV 49 HPV 75, 76
Lésions cutanées séquences subgénomiques ayant moins de 90 % d’ho-
bénignes
mologies avec des types connus indique qu’il y a plus
Lésions cutanées
4 HPV 92 pré-cancéreuses et
de 130 types putatifs et donc au total environ 170 types
cancéreuses d’HPV cutanés [2].
Lésions cutanées
5 HPV 96 pré-cancéreuses et
cancéreuses
1 HPV 4 HPV 65, 95 Lésions cutanées 3.3. Basée sur le potentiel oncogène
Le tableau III présente la répartition des principaux types
2 HPV 48 Lésions cutanées
Gamma-
d’HPV en fonction de leur potentiel oncogène [3, 4]. Il est
3 HPV 50 Lésions cutanées à noter que cette répartition ne prend en considération
papillomavirus
4 HPV 60 Lésions cutanées que les HPV à tropisme muqueux, cette classification
5 HPV 88 Lésions cutanées étant basée sur le risque de cancer du col de l’utérus
Verrues vulgaires, associé à HPV.
1 HPV 1
Mu- plantaires En ce qui concerne les HPV à tropisme cutané, il n’y a
papillomavirus
2 HPV 63
Verrues vulgaires, pas actuellement de classification en virus à bas risque
plantaires ou haut risque, bien que certains types d’HPV cutanés
Lésions cutanées,
Nu- soient indiscutablement associés au développement de
1 HPV 41 retrouvé dans carcino-
papillomavirus carcinomes cutanés.
mes cutanés

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PAPILLOMAVIRUS (HPV)

Tableau II – Distribution des types d’HPV 4. Conclusion


selon leur tropisme.
Tropisme Types En raison de leur implication dans le développement de lésions
cancéreuse, les HPV ont été l’objet d’études intensives au
1, 2, 4, 5, 8, 9, 12, 14, 15, 17, 19, 20, 21, 22, 23,
Cutané 25, 27, 36, 37, 38, 41, 47, 48, 49, 50, 57, 60, 63, cours des 20 dernières années. Ces études ont mis en évi-
65, 75, 76, 80, 88, 92, 93, 95, 96 dence l’extraordinaire diversité génétique de ces virus, cette
6, 11, 13, 16, 18, 26, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 39, 42, diversité étant associée avec des différences biologiques (tro-
44, 45, 51, 52, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 67, pisme, pouvoir oncogène). La liste des types d’HPV recensés
Muqueux
68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 81, 82, 83, 84, 85, 86,
87, 89, 90 ne demande qu’à s’allonger. Néanmoins, on peut raisonna-
blement penser que les HPV les plus importants tant par leur
Mixte 3, 7, 10, 28, 29, 40, 43, 78, 91, 94
fréquence chez l’homme que par leur rôle pathogène ont déjà
(d’après de Villiers et al. [1]) été identifiés.

Tableau III – Classification des HPV ano-génitaux Références


selon leur potentiel oncogène. [1] De Villiers E.M., Fauquet C., Broker T., Bernard H.U., zur Hausen
H., Classification of papillomaviruses, Virology 324 (2004) 17-27.
Classification Types [2] Forslund O., Genetic diversity of cutaneous human papillomaviru-
Haut risque 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 ses, J. Gen. Virol. 88 (2007) 2662-2669.
[3] Muñoz N., Bosch X., de Sanjosé S., Herrero R., Castellsagué X.,
Haut risque Shah K.V., Snijders P.J.F., Meijer C.J.L.M., Epidemiologic classifica-
26, 53, 66, 68, 73, 82
probable
tion of human papillomavirus types associated with cervical cancer,
Bas risque 6, 11, 13, 40, 42, 43, 44, 54, 61, 70, 72, 81, 89 N. Engl. J. Med. 348 (2003) 518-527.
Les HPV ano-génitaux non représentés dans le tableau sont considérés [4] Muñoz N., Castellsagué X., Berrington de Gonzalez A., Gissmann L.,
à risque indéterminé. (d’après Muñoz et al. [3, 4]) HPV in the etiology of human cancer, Vaccine 24. Suppl. 3 (2006) 1-10.

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