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BIOCHIMIE STRUCTURALE
BCPST 2_Semestre 3
1 Dr Hemayoro SAMA
Assitant
OBJECTIFS DU COURS
Connaitre les classes de biomolécules
2
PLAN DU COURS
CHAPITRE I: GLUCIDES
3
CHAPITRE I: GLUCIDES
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OBJECTIFS
09/01/2024
❑ Objectif Général
Connaître les structures chimiques et
stéréochimiques des molécules importantes
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pour la vie et fonctions des carbohydrates.
❑ Objectifs opérationnels
Définir sans erreurs un carbohydrate.
Classifier sans erreurs ni omissions un
carbohydrate.
Donner les propriétés chimiques, physiques
et importances des carbohydrates.
I. INTRODUCTION
Carbohydrates sont des composés universellement répandus dans la
09/01/2024
matière vivante ( 5% du poids sec chez les animaux et 70% du poids sec
7
Ce sont des molécules organiques de formule brute Cn(H2O)n dont les
09/01/2024
saccharose)
8
- Rôle économique (cellulose, amidon et saccharose)
constituants
09/01/2024
Le nombre d’atomes de carbone de l’ose et la nature du
carboxyle sont les deux critères de classification des oses.
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• Le nombre d’atomes de carbone : 3 C (triose) ; 6 C
(hexose)
• La nature du carbonyle : Aldéhyde → Aldose ;
Cétone → Cétose
• La combinaison de ces 2 critères caractérise
l’ose :
— Aldopentose, Aldohexose, …
— Cétopentose, Cétohexose, …
II.2. CRITÈRES DE CLASSIFICATION DES
OSIDES
09/01/2024
Les osides représentent des molécules dont l’hydrolyse fournit une ou
plusieurs molécules d’oses. On distingue les holosides et les hétérosides:
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Holosides
— Liaison de n molécules d’oses par des liaisons glycosidiques.
— Selon le nombre d’oses constitutifs : Di-, Tri, Tétra … holosides.
— Oligosides : jusqu’à quelques dizaines d’oses.
— Polyosides : quelques centaines d’oses (cellulose, amidon).
o Hétérosides
— Ils donnent par hydrolyse : oses + aglycone (partie non sucrée).
— Liaison à des Protéines (glycoprotéines), à des Lipides (glycolipides), à des
bases azotées (nucléosides).
BILAN
09/01/2024
11
Dr
He
may
oro
SA
MA
III. OSES
1. Définitions
➢ Composés les plus simples: chaîne carbonée
linéaire (au moins en théorie)
➢ Tous les carbones portent une fonction
alcool primaire ou secondaire sauf :
✓ Un aldéhyde en C1 ≡ Aldose
12
III. OSES
2. Nomenclature
Polarimètre du
physicien français
Léon Laurent
16
III. OSES
4. Pouvoir rotatoire
Exercice application 1:
On donne les pouvoirs rotatoires spécifiques suivants :
α-D-glucopyranose : 112° , β-D-glucopyranose :18,7° .
Calculez l’angle de déviation de la lumière polarisée d’une
solution de α-D-glucopyranose 0,5 M dans un tube de longueur
100 mm.
Quand on dissout une quantité de α-D-glucopyranose dans de l’eau
distillée on observe une diminution progressive du pouvoir
rotatoire de 112° vers 52,7°. Expliquez la raison de cette
diminution.
N.B : PM du glucose est supposé connu.
17
III. OSES
Expérience
- La cristallisation du D-glucose dans des solvants
différents (éthanol, pyrimidine) conduit non pas à un
seul produit mais à 2 produits dont les pouvoirs
rotatoires sont différents. Ces 2 formes ont été
qualifiées de forme α (+112°) et de forme β (+19°).
Ces deux formes sont dites anomères.
-On observe pour chacune des formes mises en
solution aqueuse, en fonction du temps, une évolution
du pouvoir rotatoire qui atteint pour chacune des
formes la même valeur +52.5°.
18
C'est le phénomène de mutarotation:
III. OSES
Cette expérience
suggère que le D-
glucose a un centre
chiral supplémentaire
et que lorsque
l'équilibre est atteint,
les 2 formes α et β
sont présentes en
solution dans les
rapports respectifs
suivants : 1/3 et 2/3.
19
III. OSES
5. présentation de Fischer : la nomenclature D et L.
➢ La nomenclature D et L des oses est une nomenclature
relative et par filiation.
➢ Tous les sucres seront préfixés par les lettres D ou L en
référence pour les aldoses à la configuration du
glycéraldéhyde et pour les cétoses à la configuration du
cétotétrose.
➢ Ce préfixe sera suivi de la nature du pouvoir rotatoire de la
molécule (-) ou (+). En général ; la série D ou L d’un ose à
nC est indiquée par la configuration du Cn-1.
OH à droite≡ série D
OH à gauche ≡ série L
20
III. OSES
5. présentation de Fischer : la nomenclature
D et L.
21
III. OSES
6. Filiation des aldoses
22
III. OSES
7.Filiation des cétoses
23
III. OSES
6. Filiation des aldoses
24
III. OSES
6. Filiation des aldoses
25
III. OSES
6. Filiation des aldoses
26
III. OSES
6. Filiation des aldoses
27
III. OSES
7. Propriétés des oses
1) Les propriétés optiques de leurs solutions se limitent à la
modification de l'indice de réfraction et au pouvoir rotatoire. Ils
ne présentent pas d'absorption dans le visible ou l'ultraviolet.
2) Leur richesse en groupement hydroxyle leur confère des
propriétés polaires capables de multiples liaisons hydrogène:
avec l'eau: ils sont très hydrosolubles
29
III. OSES
7. Propriétés des oses
- Formation d'alditol à partir d'un aldose
La réaction implique exclusivement la forme ouverte de l'aldose
30
III. OSES
7. Propriétés des oses
Oxydation par l'iode en milieu basique
Aldose
31
III. OSES
7. Propriétés des oses
Oxydation douce
l'aldose R-CHO s'oxyde en acide aldonique R-COOH. Les cétoses ne
sont pas oxydés. Agents oxydants : I2, Br2 (alcaline), ou HNO3 dilué
δ- ϒ-
Gluconolacto Gluconolactone
ne 32
III. OSES
7. Propriétés des oses
Réaction avec la liqueur de Fehling en milieu basique
Aldose
Cétose
33
OSES
7. Propriétés des oses
– Oxydation forte = oxydation nitrique
L'oxydation forte d'un aldose conduit à l'attaque simultanée de l'alcool
primaire terminal et de l'aldéhyde. On obtient un di-acide carboxylique
appelé acide aldarique.
34
III. OSES
7. Propriétés des oses
– Oxydation forte = oxydation nitrique
La même réaction d'oxydation provoque la coupure
oxydante du squelette carboné des cétoses.
35
III. OSES
7. Propriétés des oses
-Déshydratation en milieu acide
En milieu acide concentré et à chaud, les oses (à partir de 5
C) sont déshydratés en furfural ou dérivé du furfural
36
III. OSES
– Déshydratation en
milieu acide
Les Furfurals et
dérivés se condensent
avec des phénols pour
donner des produits
colorés utilisés pour
la caractérisation et le
dosage colorimétrique
des oses.
37
III. OSES
41
III. OSES
8. Cyclisation des oses
Cyclisation des cetohexose : fructose
42
III. OSES
43
III. OSES
8. Cyclisation des oses
Exercice application 2
1. Ecrire les formes pyranique :
D-glucose, D-mannose, L-glucose,
2. Ecrire les formes furanique:
D-fructose, D-ribose, D-psicose
44
III. OSES
9. dérivés des oses
▪ Les Osamines
Ce sont des oses dans lesquels une fonction alcool a été
substituée par une amine. Les plus importantes sont des
hexosamines, dérivés du glucose ou du galactose par
substitution sur le C2:
45
III. OSES
10. Oses à intérêt biologique
❖ Les trioses
➢ le D(+)mannose
54
IV. OSIDES
3. Nomenclature et convention
La liaison osidique est définie non seulement par
les oses, mais également par l'anomère de l'ose
engageant sa fonction semi-acétalique que l'on
place à gauche, et par le numéro de l'atome de
l'autre ose.
55
IV. OSIDES
3.Nomenclature et convention
➢ x…osyl ((anomère) 1 n) y…ose (n est différent du
carbone anomérique)
➢ x…osyl ((anomère) 1 1 (anomère)) y…oside
osyl est remplacé osido
➢ x…osido ((anomère) 1 n) y…ose (n est différent du
carbone anomèrique)
➢ x…osido ((anomère) 1 1 (anomère)) y…oside
57
IV. OSIDES
3.Nomenclature et convention
Exemples:
α- D-glucopyranosyl (1 →4) D-glucopyranose, en abrégé : Glc (α1→ 4)
Glc
58
IV. OSIDES
3.Nomenclature et convention
Exemples:
- αD-glucopyranosyl (α1 →α1) αD-glucopyranoside, en abrégé : Glc (α1→
α1) Glc
59
IV. OSIDES
4. Diholosides
Exemples
Maltose :
α-Dglucopyrannosyl
(α1→4)αDglucopyrannose
fructofurannoside
IV. OSIDES
4. Diholosides
Exemples
Cellobiose:
Β-Dglucopyrannosyl (β1→4)α-D-
glucopyrannose
Lactose: 61
β-D-galactopyrannosyl (β1→4)α-D-glucopyrannose
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
Amidon
C’est un haut polymère insoluble dans l'eau froide bien
qu'hydrophile. C'est sous cette forme condensée que les
végétaux accumulent les glucides photosynthétisés. 2
fractions homogènes:
- l'amylose: 5 à 30% de l'amidon, soluble dans l'eau tiède,
cristallisable par refroidissement.
- l'amylopectine: 70 à 95% de l'amidon donne à chaud un
empois visqueux (gel). L'amylose et l'amylopectine possèdent
une seule extrémité réductrice. La densité moléculaire de ces
extrémités est trop faible et l'amylose et l'amylopectine n'ont
pas la propriété des sucres réducteurs. L'hydrolyse de
l'amidon coupe le polymère en chaînes assez courtes : les
dextrines qui sont réductrices. 62
IV. OSIDES
L'amylose
L'amylose est un enchaînement linéaire parfaitement
répétitif de 1000 à 4000 monomères de D-glucose sans
branchement, liés par une liaison glycosidique (α1 →4).
63
IV. OSIDES
L'amylopectine
Elle se distingue par un nombre de glucose supérieur mais
surtout par une structure ramifiée. Sur la chaîne principale
(α1→ 4) des points de branchement, se répétant environ tous
les 20 à 30 résidus, sont formés par une liaison (α1→ 6) où le
carbone anomérique appartient à la ramification.
64
IV. OSIDES
Amidon: exemple d’échantillon
65
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
Le glycogène
Il est un polyglucose que les animaux mettent en
réserve dans le cytosol des hépatocytes et dans les
muscles . Sa structure est celle de l'amylopectine avec
les différences suivantes :
✓ les branchements ont lieu tous les 8 à 12 résidus et
même de 3 à 5 au centre de la molécule
✓ la longueur moyenne des chaînes ramifiées est plus
courte. Cette structure est donc plus compacte et plus
"buissonante" que celle de l'amylopectine. 66
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
L'inuline
De la famille des fructosanes, c'est un
composé de réserve, polymère de β-D-
fructofuranose de 30 à 100 unités liés par
des liaisons (β2 →1) que l'on trouve chez
certains végétaux : dahlias, artichauts,
topinambours. C'est le seul composé de
configuration β connu.
67
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
Les dextranes
Réserves des bactéries et levures, ce sont des polymères d'α-D-
glucose liés par des liaisons (α1 →6), avec d'occasionnels
branchements sur les C3 ou C4. Ils sont un composant de la
plaque dentaire, produit de la prolifération bactérienne
buccale.
Ils sont utilisés :
- comme substituts du plasma en thérapeutique
- comme phase pour la chromatographie liquide en basse
pression, par greffage de groupes fonctionnels ionisés pour les
échangeurs d'ions. 68
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
Cellulose
Présente chez certaines bactéries, elle est le constituant
majeur des fibres de parois végétales. La cellulose
représente la moitié du carbone disponible sur terre,
mais il ne constitue pas une source de glucose sauf
pour les ruminants. C'est un polymère linéaire dont
la liaison glycosidique est du type : (β1 →4).
Cette liaison est bloquée dans une configuration "tête-
bêche" stabilisée par les liaisons hydrogène entre
l'oxygène hétérocyclique d'un monomère et la
69
fonction OH porté par le C3 du monomère suivant.
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
Cellulose: exemple d’échantillons
70
IV. OSIDES
5. Polyosides homogènes
La chitine
Elle diffère de la cellulose que par le C2 du
glucose : son hydroxyle est remplacé par le
groupement acétylamine (voir les osamines du
paragraphe).
Ce polymère GlcNac (β1→ 4) a la même structure
que la cellulose. On le trouve dans le squelette
extérieur des invertébrés (crustacés, mollusques,
71
insectes)
GLUCIDES
2.2.OSIDES
2.2.5. Polyosides homogènes
La chitine: exemple d’échantillon
72
IV. OSIDES
6. Polyosides hétérogènes
Ils sont des chaînes d'oses ou de dérivés d'oses différents, la plupart du
temps limités à deux types.
les gommes, partie hydrophile des sécrétions des "gommiers"
comme les acacias sont des galactoarabanes très ramifiés.
l'agar-agar ou gélose, extrait des algues rouges et très employé en
microbiologie pour les cultures sur gel, est un polyoside complexe de
D et L-galactose irrégulièrement sulfaté. De ces algues, on extrait
aussi des carraghénates, épaississants et gélifiants employés
dans l'industrie alimentaire : ce sont des polymères linéaires d'unités
diosidiques de galactose sulfaté (carrabiose) liés par une liaison (β1→
4), les deux galactoses substitués étant liés par une liaison (β1→ 4).
73
II. OSIDES
2.2.7 Etude structurale
Détermination des oses constitutifs: une
hydrolyse acide de manière à rompre toutes les
liaisons osidiques puis les oses sont séparés par
techniques chromatographiques, identifiés et
dosés individuellement
Dans le cas d’un heteroside il faut aussi
déterminer la nature de l’aglycone
Détermination de mode de liaison
74
IV. OSIDES
7. Etude structurale
➢ Détermination de mode de liaison
Methylation des hydroxyles libres
On fait réagir un agent methylant tel que ICH3 sur
un oside, seuls les –OH libres forment un ether-
oxyde du méthanol
Pour analyser la structure de l’oside on poursuit
l’expérience par une hydrolyse acide ménagé: les
liaisons osidiques seront rompues, ainsi que
l’éventuelle methylation portant sur la fonction
75
hémiacétalique (peu stable)
IV. OSIDES
7. Etude structurale
Détermination du mode de liaison
76
IV. OSIDES
7. Etude structurale
Détermination de mode de liaison
Exemple
77
IV. OSIDES
➢Détermination de mode de liaison: analyse
Seul le C1 β galactopyrannose ne Les C1 et C4 du β de glucopyrannose ne
présente pas de methylation: c’est présentent pas de methylation: l’un ou
donc le seul C qui peut être engagé l’autre était donc engagé dans la liaison
dans la liaison osidique avec le osidique . Or l’hydrolyse acide ménagée
glucose élimine la methylation sur la fonction
hemiacetalique du C1 même si celle-ci
avait lieu
78
IV. OSIDES
7. Etude structurale
Détermination de mode de liaison
Il ne peut s’agir que d’une liaison de type (β1→4)
L’oside étudié est le βD-galactopyranosyl (β1→4)
βDglucopyranose
79
IV. OSIDES
7. Etude structurale
Oxydation par L’acide périodique
L’acide périodique oxyde les molécules qui possèdent
2 groupements OH libres et contigus ou un
groupement OH et une fonction aldéhyde
(hemiacetalique libre et contigus
Lorsqu’un groupement OH est engagé dans une
liaison osidique, il n’est donc plus libre et ne peut plus
être oxydé par l’acide périodique.
Cela modifie donc les sites d’oxydation périodique sur
la molécule par rapport aux résultats obtenus pour le 80
même ose sous forme libre
IV. OSIDES
7. Etude structurale Oxydation par L’acide périodique
7. Etude structurale
Thréalase : enzyme intestinale qui est une α-glycosidase
spécifique des liaisons (α1 →α1)
Saccharase ou sucrase : enzyme intestinale, α-glucosidase, qui
hydrolyse la liaison (α1 →β2) du saccharose mais aussi la liaison
(α1 →4) du maltose.
Invertase : c'est une β-fructosidase spécifique de la liaison (α1
→β2). Elle n'hydrolyse pas le maltose.
Maltase : enzyme intestinale qui est une α-glucosidase spécifique
de la liaison (α1→ 4) du maltose et de la liaison (α1→ β2) du
saccharose 83
IV. OSIDES
7. Etude structurale
85
IV. OSIDES
7. Etude structurale
Exercice Application 3
La permethylation du diholoside A-B suivie d’hydrolyse acide douce a
donné les composés suivants :
• 2,3,4,6 tetra-O-methyl alpha-D- glucopyranose
• 1,3,4 tri-O-methyl beta-D-psicofuranose.
1. Donnez selon Haworth la structure et le nom du diholoside A-B
2. Quelle serait le résultat expérimental de la réaction de ce
diholoside avec le réactif de Fehling? Qu’en déduisez vous ?
Justifiez ?
3. Combien de molécules d’acide periodique faudra t-il pour oxyder ce
diholoside? Donner le nombre d’acide formique et de formaldéhyde
formé
4. Donnez de façon précise les noms des enzymes qui peuvent couper86ce
diholoside.
CONCLUSION
Groupe de composés aux fonctions très importantes.
Rôle énergétique : glucose(forme d’énergie
directement utilisable par les cellules), amidon(forme
de stockage du glucose chez les végétaux),
glycogène(forme de stockage du glucose chez les
animaux) …
Rôle structural : cellulose(constituant principal de
la paroi des cellules végétales, polymère de glucose),
chitine(polymère de N-acétylglucosamine, carapace
des arthropodes et paroi des mycètes)…
Signaux de reconnaissance et de
communication entre les cellules :
glycoprotéines membranaires (exemple des 87
antigènes des groupes sanguins A, B, O).