EXERCICE 8

-Le seul acide aminé sans pouvoir rotatoire : la glycine

- Le seul acide aminé précurseur de la sérotonine : le tryptophane
La réaction au BrCN indique qu'il y a une méthionine (Met) en 2ème
position, car il y a une coupure de la liaison peptidique (côté COOH). Il
n'est pas en dernière position car il n'y a pas de transformation en
homoserine (Hse).
Rappel: Le bromure de cyanogène (BrCN) coupe le côté COOH d'une
méthionine (Met). Si la méthionine est en dernière position, elle sera
transformée en homoserine (Hse)
- La réaction avec le réactif d'Edman indique que le 1er acide aminé du
fragment P2 ou le 3ème du peptide P0 (côté NH2) est un acide aminé
hétérocyclique. Le seul acide aminé hétérocyclique est la proline (histidine
et tryptophane en moindre degré).
Rappel: Le réactif d'Edman permet de séquencer jusqu'à 50 Acides aminés. Il
permet de révéler les acides aminés du côté NH2.
- La réaction avec la trypsine nous apprend qu'il y a un acide aminé
basique (Arg ou Lys) en 1ère position du peptide P0 et un autre qui peut
être en 4ème ou en 5ème position de P0 (car il y a une coupure du côté
COOH). Attention, il n'est pas exclu qu'il y ait un 3ème acide aminé basique
en 6ème position de P0, mais on ne dispose pas d'informations
nécessaires pour le déterminer.

Rappel: La trypsine, endopeptidase, coupe un acide aminé basique (Lysine ou

Arginine) du côté COOH. Elle ne coupe pas
après une histidine.
 Résumé: 1 NH2 2 3 4 5 6 COOH

Arg, Lys Met Pro ? ? ?

-Pour les 3 derniers Acides aminés restant, il y a un acide aminé basique
(Arg ou Lys) en 4ème ou 5ème position de P0, une glycine et un
tryptophane.
- De plus, les 6 acides aminés de la séquence doivent être tous différents.
- Avec ces informations, nous pouvons être sûr qu'il n'y a pas d'acide
aminé basique en dernière position
- La séquence ARG-MET-PRO-GLY-HIS-PHE (e) est à éliminer, car il manque
un tryptophane. Aussi, la trypsine ne peut pas couper après une histidine,
bien qu'il soit un acide aminé basique.
- La séquence ARG-MET-PRO-ARG-GLY-TRP (b) est à écarter, car il faut 6
acides aminés différents, or cette séquence montre 2 arginines.
- La séquence LYS-MET-PRO-ARG-GLY-PHE (d) est Impossible car il n'y a
pas de tryptophane et la trypsine ne peut pas couper après une histidine.
- La séquence HIS-MET-PRO-ARG-GLY-PHE (c) est à éliminer.En effet, elle
ne contient pas de tryptophane
- La séquence LYS-MET-PRO-TRP-ARG-GLY (a). Possible car cette
proposition respecte tous les critères énoncés.
Donc ici, seule la réponse a) est à retenir.