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Le paysage énergétique et

l’entonnoir de repliement :
Le repliement en termes de paysage énergétique et d’entonnoir de
repliement, décrit le comportement thermodynamique d’un
ensemble de molécules dépliées (dénaturées) jusqu’à l’état native.
Cette vision, le repliement des protéines procède par
l’organisation progressive d’ensembles de structures
partiellement repliées, suivant de multiples chemins dépendant
des paramètres énergétiques et des conditions. Le nombre de
conformations diminue depuis le sommet jusqu’au bas de
l’entonnoir, en même temps l’entropie diminue aussi de la chaîne
polypeptidique.
 Les globules fondus :
-possèdent certain degré de structure secondaire
trouvée dans la protéine native
-les chaines latérales des acides aminés sont
désordonnées
-structure fluctuante

Figure 01: illustration de la notion paysage


énergétique
• Deux types d’entonnoirs :
lisse et rugueux
Conclusion :
Une forme en entonnoir :
 décrit l'hétérogénéité de conformation d'une protéine
 il permet d'expliquer le phénomène de dénaturation qui est la
résultante entre l'entropie de cette chaîne et les forces du
repliement
 permet d'expliquer certains comportements non classiques
observés dans les processus de repliement ultra-rapides
Le repliement est une transition du désordre vers l'ordre
Conclusion générale :
La compréhension des mécanismes
de repliement des protéines
représente une grande importance
dans la biologie. Il s’agit d’un
problème essentiel pour l’analyse
des divers événements impliqués
dans la régulation cellulaire, ainsi
que pour l’utilisation des gènes
séquencés

L’explication de ces mécanismes


permet le développement des
nouvelles stratégies thérapeutiques
pour le traitement des maladies
associées à des repliements
incorrects

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