BACTÉRIOLOGIE

pour
MÉDICAL / DEN étudiants 2, 2018

PR FOTSING-KWETCHE
Ph.D Microbiologie
 CHAPITRE I:

INTRODUCTION GÉNÉRALE À
LA MICROBIOLOGIE
 Les étudiants devraient pouvoir
• Définir la microbiologie
• Largement faire la distinction entre vivant et non vivant
• Distinguer les procaryotes et les eucaryotes
• Définir les micro-organismes et distinguer les principales catégories de micro-
organismes impliqués dans la maladie (maladies infectieuses)
• Discuter taxonomie bactérienne
• Comprendre les mécanismes d'interaction entre les parasites et hôtes
• Décris Majeur mécanismes de transfert de matériel génétique et lien avec
l'aptitude et la résistance aux médicaments
• Discuter: parasites, pathogène, virulence, croissance et adaptation, résistance
aux agents antimicrobiens, moyens de protection contre les infections
microbiennes, etc.
• Comprendre les bases de la production et de la stérilisation de vaccins
bactériens
 INTRODUCTION GÉNÉRALE À LA
MICROBIOLOGIE
La microbiologie est une discipline
scientifique qui s'intéresse à l'étude des
organismes petits / minuscules (vivants et
non vivants), également appelés
microorganismes.
Ils peuvent
• être unicellulaire comme des bactéries,
des champignons unicellulaires
• apparaissent comme des amas
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE

• Les micro-organismes comprennent

– les eucaryotes tels que les champignons
et les protistes, et
– procaryotes comme les bactéries et les
algues.
• Pensés non classés comme organismes
vivants, les virus sont des études en
microbiologie.
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
Microbiologie est donc un terme large qui
comprend de nombreuses branches de
la biologie comme la virologie, la
mycologie, la parasitologie, la
bactériologie et autres.

Les microbes (organisme vivant

minuscule par définition) peuvent être
trouvés dans l'eau, le sol, l'air, la
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
 les voies respiratoires,
les voies génitales et digestives
féminines (des humains et des
animaux) et la peau.
Certains peuvent être utiles dans
des domaines tels que la
préparation de vaccins pour le
traitement des aliments (pain,
bière), la fertilisation des sols, la
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE

• Le terme «microbe» lui-même

n'a aucune signification
scientifique; mais il est
communément admis par les
scientifiques de se référer à de très
petits organismes.
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
• En relation avec leurs manifestations,
l'existence de micro-organismes a été
émise à la fin du Moyen Âge.

• MAIS ils n'ont pas été observés,

prouvés ou décrits avec précision et
correctement jusqu'à l'invention du
premier microscope en 1676 par Anton
Van Leeuwenhoek.
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
• Bien entendu, les microbes ne sont
pas par définition préjudiciables à la
santé et à la vie humaines.
• Au contraire, la majorité est
bénéfique pour toutes les formes de
vie supérieures, y compris les plantes
et les animaux.
– Ils sont les principaux fournisseurs de
tous les composants moléculaires
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
• Cependant, mla microbiologie est
devenue une science lorsque le
célèbre des chercheurs Louis Pasteur
et Robert H. ont observé dans les
années 1860-1870 que la présence de
microbes était associée au
développement de maladies.
– Le premier microorganisme a été isolé
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
Bien que trois cents ans se soient
écoulés / écoulés depuis la
découverte des microbes, on pense
qu'environ 1% seulement de tous
les micro-organismes ont été
étudiés à ce jour.
 INTRODUCTION À LA
MICROBIOLOGIE
• Plusieurs milliards de milliards de
microbes existent donc sur terre,
seuls quelques-uns d'entre eux sont
réellement nocifs pour les humains,
les animaux et les plantes.
• Les hôtes ont développé différentes
façons de réagir aux organismes
nuisibles
 Vue d'ensemble sur les micro-
• organismes
Tous les organismes vivants sont composés de
cellules. Toutes les cellules partagent / ont en
commun cinq propriétés importantes:
 nutrition,
 croissance,
 différenciation,
 communication, et
 évolution.

• Pour que toutes ces fonctions soient remplies, les

cellules génèrent continuellement de l'énergie.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• La production d'énergie est un aspect
important du métabolisme;
– d'autres aspects du métabolisme comprennent
des réactions chimiques qui provoquent
synthèse et assemblage de composés qui
composent la structure cellulaire.

• Fondamentalement, les réactions chimiques

dans les cellules sont catalysées par des
molécules de protéines appelées enzymes.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Ces protéines doivent avoir une structure
spécifique pour fonctionner et servir un
aspect spécifique de la vie cellulaire.
– C'est la raison pour laquelle il existe un
ensemble d'informations guidant la synthèse de
chaque protéine dans la cellule.
• Le jeu d'instructions est codé en séquences
de l'acide nucléique cellulaire
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Comme les microbes sont de très petits
organismes, leur présence a été simplement
émise il y a longtemps dans l'histoire, en
relation avec leurs manifestations.
• Comme indiqué précédemment, leur étude
n'est devenue une science que lorsqu'il a été
démontré qu'elles étaient associées à des
maladies.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Les humains sont exposés aux microbes à la
naissance
• Cette exposition conduit à l'un des trois
résultats suivants:
 colonisation transitoire,
 colonisation persistante ou
 interaction pathogène.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• La majorité des microbes sont incapables de
s'établir sur la peau ou les muqueuses et
sont considérés une découverte insignifiante
lorsqu'elle est récupérée dans des spécimens
biologiques.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Quelques exemples sont les moisissures et
la plupart des bacilles à Gram négatif non
fermentatifs qui peuvent être isolés dans le
sol, la végétation, l'eau et les produits
alimentaires.

• Ces organismes sont incapables de

rivaliser avec la population microbienne
normale du corps ou ne peut survivre à la
surface de la peau.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes

• Le succès de ces interactions est influencé par

des facteurs microbiens et hôtes complexes,
notamment
– environnement propice,
– capacité à adhérer,
– résistance aux bactériocines,
– antibiotiques, et
– cellules phagocytaires.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Ces microbes existent généralement dans
une relation commensale avec leur hôte
humain et ne produisent des maladies que
lorsqu'ils envahissent des sites stériles
normaux tels que les tissus et les fluides
corporels.
• Tous les animaux vivants (y compris les
humains) sont utilisés par d'autres
organismes.
• L'évolution animale, avec le développement
d'organismes plus grands, plus complexes et
mieux réglementés, a augmenté le nombre et
la variété d'habitats que d'autres organismes
doivent coloniser.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• Le plus complexe et le meilleur réglementé
corps, ceux d'oiseaux et de mammifères à
sang chaud, fournissent les environnements
les plus nourrissants, favorables et
diversifiés,
– ces groupes d'animaux sont les plus fortement
colonisés.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes
• La plupart des maladies chez l'homme sont
causées par des infections par des bactéries
et des levures endogènes ou par une
exposition à des moisissures opportunistes,
des parasites et des virus.
• Cependant, certaines interactions entre les
microbes et les humains conduisent
généralement à des maladies.
• En cela, la maladie peut être qualifiée de
manque d'harmonie dans l'association /
l'interaction hôte-microbe.
Vue d'ensemble sur les micro-organismes
 Vue d'ensemble sur les micro-organismes
 Le commensalisme peut simplement être défini
comme une association dans laquelle une espèce
(généralement la plus petite) utilise le corps du
plus grand comme son habitat et peut s'en
servir pour acquérir des éléments nutritifs.
• Normalement inoffensifs, ces microbes peuvent
devenir nocifs si leurs conditions
environnementales changent d'une manière ou
d'une autre.
• Quelques exemples incluent
– bactéries du genre Bactériodes,
– membres de l'espèce Escherichia coli et quelques
staphylocoques.
Vue d'ensemble sur les micro-organismes
• Les microorganismes commensaux
peuvent profiter à leur hôte.
 Le mutualisme confère un bénéfice
réciproque aux deux organismes
impliqués.
 Très souvent, la relation est obligatoire pour
au moins un membre, et peut l'être pour les
deux.

 Un parasitisme classique peut résister à la

définition.
Cependant, le parasitisme peut être défini
comme une relation dans laquelle un seul
membre (le parasite) profite à l'association.
 Vue d'ensemble sur les micro-
organismes

• MAIS, pour être significative, la définition

du parasite / pathogène doit dépendre de
l'hôte.

– Certaines espèces qui causent de graves

dommages à un hôte peuvent être inoffensives ou
même rentables pour l'autre.
• Développer les deux alternatives extrêmes et
discuter des résultats
I.2 -Structure des procaryotes (cellule
procaryote)

• Par exemple: cellule bactérienne

Structure cellulaire bactérienne et
attributs associés
Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
• Sur la base de la constitution de l'enveloppe
cellulaire entière, les bactéries peuvent être
globalement divisées en
Gram-negetive et
Gram positif.
• Chez les bactéries à Gram positif, la paroi
cellulaire est un épais couche de
peptidoglycane, externe à la membrane
cellulaire.
– Cette couche peut contenir d'autres
macromolécules.
• En Gram négatif, la couche de
peptidodoglycane est mince et est recouverte
Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
 Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés

• Certains photosynthétiques mais font du soufre

pas de l'oxygène
• Encore un peu d'azote fixe pour les plantes
Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
• Les principaux constituants de la membrane
externe sont les lipopolysaccharides (lipide +
glucide) et les lipoprotéines.
• Les lipopolysaccharides de la membrane
confèrent à la cellule des propriétés antigéniques
et toxiques.
• Les bactéries peuvent être équipées de
– flagelles (mouvement cellulaire)
– pili (transfert d'informations génétiques entre
bactéries)
– Fimbriae (attachement à l'hôte)
 Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
• Certaines bactéries peuvent également avoir
une autre couche protectrice (capsule)
recouvrant l'enveloppe cellulaire.
– Cette capsule peut être totalement ou
partiellement formée.
• A la surface de la couche lipidique supérieure
des bactéries à Gram négatif, les
polysaccharides associés au lipide A forment
l'antigène O bactérien.
• La paroi cellulaire est composée de
pectidoglycane et d'acide lipotéichoïque.
 Structure cellulaire bactérienne et
attributs associés
• En fonction de leur forme, ils peuvent
ressembler à des tiges (Escherichia coli),
sphères (staphylocoques), en spirale
(tréponème) ou courbe (Vibrio).
Structure cellulaire bactérienne et attributs
associés
• Sur la base de leur affinité avec l'oxygène, ils
peuvent être classés comme aérobies,
anaérobies microaérophiles ou anéarobies
facultatifs.
– Toutes les bactéries pathogènes connues sont
hétérotrophes
– dépendance.
• Ils obtiennent l'énergie utilisée dans leurs
différentes fonctions vitales par oxydation de
molécules organiques (glucides, lipides et
protéines).
• Parmi les bactéries pathogènes, les bâtonnets à
CHAPITRE II:
BACTÉRIES
 I. Considérations générales
• Les bactéries sont l'organisme vivant le plus
diversifié et le plus abondant sur terre (selon les
estimations de certains auteurs, leur masse totale
est 15 fois supérieure à la masse de tous les
animaux).
• À quelques exceptions extrêmement rares, comme
Thiomargarita namibiensis, les bactéries sont tous
invisibles à l'œil nu.

• Toutes les bactéries sont des procaryotes

(certaines caractéristiques majeures
comprennent: la présence de paroi cellulaire,
l'absence de composant membranaire et
 I. Considérations générales
• Les bactéries peuvent être observées sous
différentes formes: sphérique (cocci), en
forme de bâtonnet (bacilles), en spirale
(bacilles) ou en forme de virgule (Vibrio).
– Mais d'autres formes intermédiaires existent
• Leur taxonomie repose sur des traits
phénotypiques et est utile pour
l'identification pratique de souches
inconnues.
 I. Considérations générales
• Dans la taxonomie conventionnelle, certaines
caractéristiques reçoivent une attention particulière.
• Sur la base des différences dans la structure de leur
paroi cellulaire, les bactéries peuvent être divisées en
deux grands groupes:
 Gram positif et
 Gram négatif.

• Chez les bactéries à Gram positif, la paroi cellulaire

(recouvrant la membrane plasmique) est constituée
d'un épais couche de peptidoglycanes (paroi
cellulaire bactérienne conférant force et rigidité à
 I. Considérations générales
• Dans les bactéries Gram-négatives, au-dessus
d'un mince paroi cellulaire, est une autre
bicouche phospholipidique dans laquelle des
molécules de protéine sont insérées.
• Cette membrane est autrement appelée
lipopolysaccharide
• le composant lipide A représentant l'endotoxine des
bactéries Gram-négatives; et le polysaccharide, l'antigène O
• Les protéines insérées peuvent être liées de
manière externe aux glucides / polysaccharides et
/ ou fournir les ouvertures appelées porines, qui
permettent aux nutriments, aux déchets et au
fluide de s'écouler dans et hors de la cellule
 I. Considérations générales
• Certains de ces canaux sont spécifiques tandis
que d'autres ne le sont pas.
• Les bactéries peuvent également être classées en
fonction de leur capacité à effectuer des
processus métaboliques utiles pour leur vie.
• En cela, ils peuvent être
– autotrophes s'ils ont les moyens de vivre
gratuitement ou
– hétérotrophes s'ils dépendent d'autres organismes
ou de leurs produits.
• Toutes les bactéries pathogènes connues sont
hétérotrophes
– dépendance.
 I. Considérations générales
• Certaines bactéries hétérotrophes connues
sous le nom d'organotrophes peuvent avoir
besoin de composés organiques comme
source de nutriments,
• D'autres, appelés chimiotropes, reposent sur
des composés chimiques aux mêmes fins
(c'est-à-dire: besoin similaire).
• Encore d'autres paramètres comme l'acidité
ou l'alcalinité, l'affinité avec l'oxygène, le sel,
la température pour une croissance optimale,
la pression, etc., peut aider à classer les
 I. Considérations générales
• Basé sur leur capacité à provoquer des
maladies, ils peuvent être appelés
– pathogène bactéries,
– pathogène opportuniste, ou alors
– bactéries non pathogènes.
• Les vrais agents pathogènes sont des
organismes dans lesquels des gènes codant
pour des produits nocifs ou d'autres traits
peuvent être détectés (comme des gènes codant
pour l'invasion cellulaire, la production de
toxines, etc.).
– Ces organismes sont capables de provoquer des
 I. Considérations générales
• Les agents pathogènes opportunistes peuvent ne
pas avoir de déterminants génétiques qui leur
permettraient de réaliser un processus infectieux
chez un hôte immuno-compétent.
– Si pour une raison ou une autre, cependant, les
barrières de l'hôte contre les infections sont brisées
(fragilisées / affaiblies), il peut en profiter, l'envahir et
provoquer des maladies.

• Certaines de ces bactéries comprennent des

membres de la flore commensale de la peau et de
l'intestin des humains et des animaux.
 I. Considérations générales
• Il est cependant important de gardez à
l'esprit que tout micro-organisme doit être
classé comme agent pathogène en ce qui
concerne un Hôte SPÉCIAL ou GAMME
d'hôtes dans lesquels ils peuvent provoquer
des maladies.
 II- Structure cellulaire
II.1- Forme et organisation cellulaire
• Les formes des bactéries sont déterminées par la
paroi cellulaire bactérienne et le cytosquelette
sous la membrane plasmique.
– Qu'est-ce qu'un protoplaste (discuter de sa survie)
• Ce cytosquelette est important car il peut
• influencer la capacité d'acquérir des nutriments,
• permettent aux bactéries de se fixer aux surfaces et de
nager dans les liquides et d'échapper à la prédation
(mouvement cellulaire).
 II- Enveloppe cellulaire
II.1- Forme et organisation cellulaire
 II- Structure cellulaire
II.1- Forme et organisation cellulaire
Coloration de Gram
• Développé en 1884 par Hans Gram
• Aide à classer les bactéries en deux groupes
– Gram positif
– Gram négatif
• Bactéries traitées avec du violet cristal violet (le colorant
de Gram) et du colorant rouge Safranin
– Sinon appelé double coloration (pourquoi double
coloration?)
• Finalement, les parois cellulaires se colorent en violet
(Gram positif) ou en rose rougeâtre (Gram négatif)
 Gram positif
• Les bactéries Gram
positives ont

– couche épaisse de
peptidoglycane (complexe
protéine-sucre)
– Bicouche lipidique simple
– Tache en violet en
conséquence
 II.4 Comment les bactéries ont évolué
Thermoacidophiles ou
Thermophiles
• Vivez dans des environnements extrêmement chauds
• Trouvé dans les évents volcaniques, les sources
chaudes, les fissures sur le fond de l'océan qui fuient
de l'acide
• Les archéobactéries sont non pathogènes, vivent
dans et autour d'autres organismes mais ne les
infectent pas.

• Extraction enzymatique pour des réactions

chimiques telles que la PCR (thermus aquaticus)
 II.3-Génome bactérien
• Le matériel génétique bactérien (génome)
consiste en un circulaire Molécule d'ADN
(chromosome bactérien)
– Contrairement à l'ADN des eucaryotes, l'ADN
bactérien ne contient pas d'introns
• La réplication du matériel génétique est donc
immédiatement suivie de la transcription et de
la traduction ultérieure.
– Cette transcription instantanée et la traduction
ultérieure sont en partie dues à l'absence
d'enveloppe nucléaire (aucun retard dû au
transfert de l'ARN du noyau vers le cytoplasme
 II.3-Génome bactérien
• L'ADN est attaché à des protéines de type
histone (qui régule l'expression des gènes
domestiques) pour former le chromosome.
• Dans certains cas, une molécule d'ADN extra-
chromosomique (pas aussi grosse que la
première) appelée plasmide bactérien se trouve
dans le cytoplasme des bactéries.
– Les plasmides contiennent généralement des gènes
codant pour des traits inhabituels.
• L'ARN est également présent molécules.
 II.3-Génome bactérien
• Dans les souches bactériennes pathogènes,
certaines séquences du génome bactérien
(appelés gènes) codent pour des traits de
virulence tels que la toxine, l'hémolysine et
l'invasion.
• Ces gènes peuvent être situés soit dans la
structure du chromosome bactérien, soit sur le
plasmide.
– Le plus souvent, les caractères inhabituels sont
acquis par transfert horizontal d'autres bactéries,
mais peuvent également être hérités (par transfert
vertical).
 II.3-Génome bactérien

• le la flexibilité du génome bactérien est un

facteur important permettant à ces organismes
de s'adapter facilement (s'adapter) à de
nouveaux environnements
 III- Interactions bactériennes
III.1- Communication de cellule à cellule
• Les bactéries peuvent produire des substances
chimiques dans leur environnement.
• Certaines de ces substances comme
bactériocines, agissent pour se protéger contre
la colonisation par d'autres micro-organismes.
• D'autres ont appelé autoinducteurs influencer le
comportement des membres de la même espèce.

– L'autoinducteur peut déclencher l'expression de

certains gènes bactériens, lorsque la concentration
appropriée est atteinte dans le milieu.
 V. Pathogenèse
• UNE agent pathogène est un micro-organisme
capable de provoquer des maladies chez une
plante ou un animal. Pathogénicité fait
référence à la capacité de produire une
maladie dans un organisme hôte.
• Les microbes expriment leur pathogénicité au
moyen de leur virulence
• La virulence est un terme qui fait référence au
degré de pathogénicité du microbe.
 V. Pathogenèse
• D'où le déterminants de la virulence d'un
pathogène sont l'une quelconque de ses
caractéristiques génétiques, biochimiques ou
structurelles qui lui permettent de produire une
maladie chez un hôte.
• La relation entre un hôte et un pathogène est
dynamique, puisque chacun modifie les activités
et les fonctions de l'autre.
 V. Pathogenèse
• Le résultat d'une telle relation dépend de la
virulence de l'agent pathogène et du degré relatif
de résistance ou de sensibilité de l'hôte,
principalement en raison de l'efficacité des
mécanismes de défense de l'hôte.
• 1. L'envahissement est la capacité d'envahir les
tissus. Il englobe les mécanismes de colonisation
(adhérence et multiplication initiale), la production
de substances extracellulaires qui facilitent
l'invasion (invasines) et la capacité à contourner ou
à surmonter les mécanismes de défense de l'hôte.
 V. Pathogenèse
• 2. La toxigénèse est la capacité de produire des
toxines. Les bactéries peuvent produire deux types de
toxines appelées exotoxines et endotoxines.

• Les exotoxines sont libérées des cellules bactériennes

et peuvent agir sur des sites tissulaires retirés du site
de croissance bactérienne.

• Les endotoxines sont des substances associées aux

cellules.
• Classiquement, le terme endotoxine fait référence au
composant lipopolysaccharidique de la membrane
externe des bactéries Gram-négatives).
 V. Pathogenèse
• Tache acido-résistante de Mycobacterium tuberculosis,
l'agent de la tuberculose (TB).

• Cependant, des endotoxines peuvent être libérées des

cellules bactériennes en croissance et des cellules lysées
en raison d'une défense efficace de l'hôte (par exemple
lysozyme) ou des activités de certains antibiotiques (par
exemple pénicillines et céphalosporines).
 V. Pathogenèse
• Toxine diphtérique ADP-ribosylates inhibant la
synthèse des protéines.
– par action du facteur d'élongation (EF2) dans les
ribosomes
• Pseudomonas l'exotoxine A a un mode
d'action similaire à la toxine diphtérique.
 V. Pathogenèse

Mycobacterium
tuberculosis a causé plus
de morts humaines que
toute autre bactérie dans
l'histoire de l'humanité.

• Les bactéries sont les petits bâtonnets de

coloration rose.
• Bien que sa capacité à produire des maladies
soit multifactorielle, elle n'est pas
complètement élucidée.
 V. Pathogenèse
• Par conséquent, les toxines bactériennes, à la
fois solubles et associées aux cellules, peuvent
être transportées par le sang et la lymphe et
provoquer des effets cytotoxiques sur des sites
tissulaires éloignés du point d'origine
d'invasion ou de croissance.

• Certaines toxines bactériennes peuvent

également agir sur le site de colonisation et
jouer un rôle dans l'invasion.
• Plus d'un tiers de la population mondiale est
 V. Pathogenèse
• Exotoxines
• De nombreuses bactéries produisent des
protéines (exotoxines) qui modifient, par
action enzymatique, ou détruisent d'une autre
manière certaines structures cellulaires.
• Les effets des exotoxines sont généralement
observés de manière aiguë, car ils sont
suffisamment puissants pour que des effets
graves (par exemple la mort) en résultent
souvent.
 V. Pathogenèse
• Le botulisme, l'anthrax, le choléra et la
diphtérie en sont des exemples.

• Si l'hôte survit à l'infection aiguë, des

anticorps neutralisants (anti-toxines) sont
souvent déclenchés qui neutralisent l'effet de
l'exotoxine.
• Les classes d'exotoxines comprennent:
 V. Pathogenèse
• (1) Toxines qui agissent sur la matrice extracellulaire
du tissu conjonctif.
• par exemple Clostridium perfringens collagénase,
Staphylococcus aureus hyaluronidase.

• (2) Toxines qui ont un composant "B" se liant aux

cellules et un composant enzymatique actif "A"
(toxines de type AB)
• Ceux-ci inclus:
a) Ceux qui ont une activité de ribosylation de l'ADP,
par exemple la toxine cholérique, E. coli toxine
thermolabile, Pseudomonas aeruginosa et les toxines
diphtériques.
 V. Pathogenèse
• b) Ceux qui ont une activité lytique sur l'ARNr
28S, par exemple les toxines shiga et de type
shiga (vero).

• c) Ceux dont le site d'action est partiellement

caractérisé, par exemple la toxine botulique,
la toxine tétanique et la toxine mortelle du
charbon.
 Pathogénèse
• (3) Toxines endommageant la membrane
– par exemple Staphylococcus aureus toxine delta
• Toxines agissant de manière extracellulaire.
• Ceux-ci comprennent les protéases, les
collagénases et les hyaluronidases.
• Par exemple, Clostridium perfringens produit
une collagénase puissante, tandis que
Staphylococcus aureus produit une
hyaluronidase.
 Pathogénèse
• Les dommages à la matrice du tissu conjonctif
(par la hyaluronidase et la collagénase) peuvent
«relâcher» les fibres tissulaires

• Cela permet finalement à l'organisme de se

propager plus facilement à travers les tissus.
• L'exfoliation de Staphylococcus aureus qui
provoque la séparation des couches de
l'épiderme est également incluse dans ce
groupe.
 Pathogénèse
• Toxines A - B.
• Ces toxines sont constituées de deux
composants.
• Les toxines classiques qui agissent de cette
manière sont celles du choléra et de la
diphtérie.
 Pathogénèse
• (i) Exotoxines ribosylantes de l'ADP
• Toxine diphtérique (produite par Corynebacterium
diphtheriae) est codé par le gène phage tox.
– Puis l'acide nucléique viral

• B se lie aux cellules et A a une activité enzymatique.

• A est endocytosé et de l'endosome passe dans le
cytosol (comme Vibrio toxine, toxine hépatlabile
entérotoxigène E. coli , AB5 voir commentaires).
 Pathogénèse
• ii Toxines qui agissent sur l'ARNr 28S
• Les toxines shiga sont impliquées dans la pathogenèse
de la shigellose, tandis que les toxines de type shiga
(codées par phage) sont principalement produites par
entérohémorragie. E. coli (transduction).
– codés chromosomiquement et partagent un mode
d'action commun (AB5).
• Un fragment de la sous-unité A passe au ribosome,
provoquant les ribosome à lyser
• Cette mort est causée par l'inhibition de la synthèse des
protéines.
 Pathogénèse

• iii- Site d'action partiellement caractérisé

• Neurotoxines botuliques, tétanospasmine et
toxine létale de B. anthracis sont des
exotoxines de type AB.

• La toxine botulique provoque une inhibition

de la libération d'acétylcholine au niveau de la
jonction neuromusculaire.
 Pathogénèse
• La toxine tétanique est absorbée au niveau des
jonctions neuromusculaires et transportée dans les
axones vers les synapses.
• Cette toxine agit et inactive les fonctions de neurones
inhibiteurs.
• Les exotoxines du tétanos et du botulisme ont des
sous-unités B (bien que le mode d'action de leurs sous-
unités A ne soit pas encore entièrement compris).
• Le composant B de la toxine létale de B. anthracis est
l'antigène protecteur;
– cela sert également de sous-unité B pour la toxine
de l'œdème.
• Se rompre!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
 Toxines endommageant la membrane
• Ces toxines digèrent enzymatiquement le
phospholipide (ou protéines) des membranes ou se
comportent comme des détergents.
• Dans chaque cas, des trous sont percés dans la
membrane cellulaire et le contenu cytoplasmique
peut s'échapper.
• Un exemple de toxine endommageant la membrane
est la phospholipase («toxine») de Clostridium
perfringens (anaérobie stricte dans la partie distale du
DT).
– Il détruit les vaisseaux sanguins en arrêtant l'afflux
de cellules inflammatoires.
• Cette condition contribue à créer un
environnement anaérobie qui est important
pour la survie et la croissance de cette espèce
bactérienne (la virulence comme stratégie pour
survivre !!!!!).

• La toxine delta de Staphilococcus aureus (S.

aureus = brillant comme l'or après la coloration
de Gram) est une protéine extrêmement
hydrophobe.
• Cette toxine s'insère dans les membranes
cellulaires et on pense qu'elle a une action de
type détergent.
 Endotoxines
• Ce sont des composants de l'enveloppe des cellules
bactériennes.
• L'endotoxine classique et la plus puissante est le
lipopolysaccharide (le LPS des bactéries à Gram négatif)
– Il est responsable du choc septique.
• Il n'existe aucune thérapie efficace qui puisse inverser
l'activité toxique du lipide A ou du peptidoglycane chez
les patients.
• Le choc septique implique une hypotension (due à la
mise en commun tissulaire de liquides), une
coagulation intravasculaire disséminée et de la fièvre et
est souvent mortel en cas de défaillance massive du
système.
• En raison de son action, cette toxine
entraînera un manque d'oxygénation
adéquate des tissus sensibles tels que le
cerveau entraînant ?????? Vous connaissez le
reste, n'est-ce pas?

• Outre le LPS, le peptidoglycane présente de

nombreuses propriétés de type endotoxine.
• Les endotoxines sont "non spécifique"incitateurs
d'inflammation = antigènes (voir immunologie).
• Leur présence amène les cellules immunitaires à produire
des cytokines (y compris l'interleukine 1 et le facteur de
nécrose tumorale, TNF).
• Les endotoxines activent également la voie alternative du
complément.
• La production de ces cytokines entraîne l'attraction des
cellules polymorphonucléaires vers les sites d'infection.
• PG et LPS et certains autres composants de la paroi
cellulaire (par exemple l'acide teichoïque
pneumococcique) activent également la cascade du
complément alternatif.
– Les bactéries pathogènes se lieront au
complément et deviendront vulnérables à la
phagocytose en l'absence d'anticorps.
 VI. Immunopathologie
• Dans les infections aiguës et chroniques, le tissu
infecté sert d'observateur des résultats
d'immunopathologie.
– Cependant, une stimulation excessive de la production de
cytokines et de l'activation du complément par des
endotoxines peut provoquer des lésions tissulaires en
l'absence de réponse immunitaire.
• Les antigènes générés en continu libérés par des
microbes viables persistants provoqueront par la
suite des anticorps humoraux et une immunité à
médiation cellulaire, résultant en une
immunopathologie chronique.
 VI. Immunopathologie
• Dans certains cas, des antigènes peu dégradables
peuvent maintenir l'immunopathologie même en
l'absence de persistance d'agents vivants.
• C'est le cas du polysaccharide pneumococcique et des
parois cellulaires streptococciques du groupe A)
• D'autres antigènes bactériens réagissent de manière
croisée avec les antigènes des tissus de l'hôte,
provoquant le développement de l'auto-immunité
 VI. Immunopathologie

• C'est le cas de la protéine M de S. pyogenes

réagit de manière croisée avec la myosine de
mammifère.
• Ainsi, l'immunopathologie peut persister
même après l'infection et les antigènes
microbiens sont éliminés
 Le système immunitaire en résistance à
l'infection
• 1. Parasites extracellulaires.
• Les anticorps provoquent la lyse de l'organisme et / ou leur
opsonisation par les phagocytes, point auquel ils sont
rapidement tués.
• 2. Les parasites intracellulaires sont principalement tués par
l'immunité à médiation cellulaire.
• 3. Les exotoxines peuvent être neutralisées par les antitoxines.
Ceux-ci peuvent être déclenchés à l'aide de vaccins anatoxines
(les anatoxines sont antigéniques mais non toxiques).
– par exemple, cela se produit lors de la vaccination contre la diphtérie.
• 4. Certains organismes produisent des protéases IgA (y
comprisH. influenzae, S. pneumoniae, N. gonorrhoeae et N.
meningitidis) cela aide à survivre sur les surfaces externes.
 VII. Acquisition des propriétés
Virulence
• Les propriétés de virulence sont acquises
– par différents moyens
– Mécanismes
– Support génétique
– Implications environnementales
– etc.

• Pourquoi la virulence se développe-t-elle?

• Quelles sont les implications
• Qu'est-ce qui rend la virulence efficace?
(inoculum variable, DL50, implication de
l'hôte, etc.)
 Définitions et mécanismes
Évolution: changements intergénérationnels dans
le génome d'une espèce, entraînant la forme
physique, l'émergence, l'extinction

Sélection naturelle: (les mutations confèrent des

avantages ou des inconvénients aux
organismes)
Dérive génétique: acquisition aléatoire de
mutations
 Définitions
• Virulence: capacité d'un organisme à blesser
directement un hôte ou à précipiter un
processus d'automutilation chez l'hôte
– Capacité pour réduire la forme physique de
l'hôte
• Agent pathogène: un organisme qui peut
blesser un hôte
• Évolution de la virulence: acquisition d'un
phénotype entraînant une lésion de l'hôte
 Considérations supplémentaires

• L'agent pathogène est souvent spécifique à

l'hôte (sensibilité de l'hôte)
• Les blessures sont souvent fonction d'une
série d'événements, avant que l'hôte ne soit
réellement blessé, de sorte que les
événements préalables à la blessure peuvent
également être considérés comme des
facteurs de virulence.
• La susceptibilité de l'hôte est un concept
variable
 Comment évoluer?
• Acquisition d'ADN (transfert latéral)
• Perte d'ADN
• Réarrangements de l'ADN au sein des
organismes
• Variation allélique
 Acquisition d'ADN
• Plasmides (transformation)
• Bactériophages (transduction)
• Séquences d'insertion et transposons
• Intégrons
 Acquisition: Plasmides

• Extra chromosomique, réplique de

manière autonome
• Généralement circulaire
• Codent fréquemment la résistance, les
bactériocines, les protéases
• Promiscuité
• Interagir avec les locus sur le génome
 Acquisition: bactériophages
• S'intègre dans les chromosomes (prophages à
stabilité variable) ou les phages lytiques
• Peut coder des facteurs de virulence
 Acquisition: éléments transposables
(gènes sautants)
• Séquences d'insertion:
Petit: 750-2500 paires de bases
Gènes uniquement pour la mobilité
(transposase, régulateurs de transposase)
Répétitions inversées aux extrémités
 Acquisitions: transposons
• Éléments du SI flanquant d'autres gènes
• Taille variable, TN5, Tn10
Répétitions inversées aux extrémités
 Acquisitions: intégrons
• Acquérir des gènes dans des cassettes et
permettre leur expression

• Superintégrons: des centaines de gènes,

composants majeurs de l'architecture
chromosomique
 Architecture

• La plupart des agents pathogènes sont

mosaïques: épines dorsales entrecoupées d'îles
de pathogénicité
• V. cholerae: 2 chromosomes
– Grand: métabolisme, LPS, virulence
–Petit: résistance aux médicaments,
métabolisme de l'ADN, locus de
virulence potentiels
 La forme physique comme objectif de
une mutation réussie

Fitness ( F )
Se réfère à la capacité d'augmenter le nombre de
descendants (survivre et se reproduire); transmettre
et assurer la perpétuation des gènes à travers les
générations
F = 1 meilleur phénotype disponible dans des
conditions définies
Effets sur la forme physique des mutations
FNouveau=Fvieille - neutre
FNouveau>Fvieille - adaptatif
FNouveau<Fvieille - délétère

Sélection naturelle: FNouveau > Fvieille

Dérive génétique: FNouveau = Fvieille

FNouveau > Fvieille
FNouveau < Fvieille
Diversifier la sélection

- agit quand FNouveau > Fvieille seul

temporaire, mais à plusieurs
reprises
Goulots d'étranglement
- Restaure les populations après une radical réduction de
la taille
d'un événement catastrophique
- Pouvez réparer changements adaptatifs et conduisent à
la génétique homogénéisation.

génétique
mourir survivre
homogénéisation.
Effet fondateur
- processus semblable à un goulot d'étranglement
lorsqu'un petit échantillon de
organismes spatialement sépare de la population
principale

séjours
(par exemple sur un
continent)

se déplace
(par exemple à un
île)
Auto-stop de gène

- augmentation de la fréquence par un lien à un

changement adaptatif faisant l'objet d'une sélection positive
 Pourquoi les non-pathogènes
devenir des agents pathogènes

(i) La virulence est un sous-produit fortuit de

un commensal,
pas nécessaire pour l'agent pathogène expansion de la population

(ii) La virulence est adaptative pour le pathogène

 La virulence est coïncidente

L'hôte blessé est un spectateur

L'évolution cherche à augmenter la
forme physique dans le réservoir
prédominant
par exemple, E. coli O157: H7
La virulence est adaptative pour l'agent
pathogène

Les symptômes induits par l'organisme

permettent sa propagation
Exemple: V. cholerae, S. Typhi
Ajouter plus d'explications
Auto-stop de gène

- augmentation de la fréquence par un lien à un

changement adaptatif faisant l'objet d'une sélection
positive
Que savons-nous d'autre
à propos de O157: H7?
• stx1 et stx2
• eae (intimin)
• Région LEE
• grand plasmide
Goulots d'étranglement

- Restaure les populations après une radical réduction de

la taille
d'un événement catastrophique
- Pouvez réparer changements adaptatifs et conduisent
à la génétique homogénéisation.

mourir survivre
 Autres leçons de l'EHEC
Répertoires convergents

• les allèles intimin sont  (O157: H7) ou 

(presque tous les autres EHEC) ou «autres»
(oiseaux)
•
•Les allèles stx sont également assez
variables, et spécifiques à la lignée et à la
gamme d'hôtes
 Résumé

 Illuminez la structure et la fonction

 Démontrer des stratégies de contrôle
 Définir des réseaux intra-bactériens

En fait, l'acquisition, l'expression et la

régulation de l'expression génique peuvent
être un processus très complexe
 RÉSISTANCE AB DANS LES BACTÉRIES
INTRODUCTION
• La résistance fait référence à la propriété que tout
organisme vivant possède ou peut développer pour
éviter d'être affecté par d'autres organismes vivants
ou des entités non vivantes.
• Résistance aux antibiotiques est la capacité d'une
bactérie à résister aux effets d'un antibiotique
• Les antibiotiques ont joué un rôle essentiel dans la
lutte contre les maladies infectieuses causées par des
bactéries et d'autres microbes au cours des 60
dernières années.
– La chimiothérapie antimicrobienne a été l'une des
principales causes de l'augmentation spectaculaire
 RÉSISTANCE AB
introduction
• Cependant, les microbes pathogènes devenus
résistants à l'antibiothérapie constituent un
problème de santé publique croissant.
• L'une des raisons est que les microbes
(bactéries et autres microbes) sont
remarquablement résistants / flexibles et ont
développé plusieurs façons de résister aux
antibiotiques et à d'autres médicaments
antimicrobiens.
 RÉSISTANCE AB
introduction
• Le deuxième (peut-être le plus crucial) est l'utilisation
croissante et la mauvaise utilisation des antibiotiques
existants en médecine humaine et vétérinaire et en
agriculture.
– La flexibilité bactérienne est appréciée / remarquée
comme une conséquence de la consommation de
substances.
• Il est important de noter qu'à moins que les problèmes
de résistance aux antibiotiques ne soient détectés au fur
et à mesure qu'ils apparaissent et que des mesures
soient prises immédiatement pour les contenir, la
société pourrait être confrontée à des maladies
 RÉSISTANCE AB
introduction
• Fleming cherchait en 1928 des
composés antibactériens
potentiels.

Fleming a remarqué qu'une tache du moule Penicillium

notatum avait poussé sur une plaque contenant la bactérie
Staphylocoque et qu'autour du moule il y avait une zone où
aucun Staphylocoque pourrait grandir.
Plus tard, il a pu montrer que le bouillon de culture de la
moisissure empêchait la croissance de la Staphylocoque
même dilué jusqu'à 800 fois.
pénicilline, il a nommé la substance qui inhibait la croissance
bactérienne
 RÉSISTANCE AB
introduction
• En 1939, Ernst Chain et Howard Florey ont
développé un moyen d'isoler la pénicilline et
l'ont utilisé pour traiter les infections
bactériennes pendant la Seconde Guerre
mondiale.
Indication précoce de la résistance aux
antibiotiques
• On peut se demander lequel est venu premier :
antibiotiques ou alors résistance aux antibiotiques ?.
• La résistance aux antibiotiques se propageant après
l'utilisation de l'AB dans les thérapies, il serait tentant
de croire que le phénotype de résistance est apparu
après la découverte du premier AB.
• Il semble en fait dans la nature un pool de gènes
pour résistance aux antibiotiques existe depuis aussi
longtemps qu'il y en a eu pour la production
d'antibiotiques OOKK.
Les premières indications / signes
de résistance aux antibiotiques
• Cette fondation est étayée par le fait que la plupart
des microbes producteurs d'antibiotiques sont
résistants à l'effet du produit chimique qu'ils
produisent.
• La résistance à la pénicilline dans certaines souches
de staphylocoques a été reconnue presque
immédiatement après l'introduction du médicament
en 1946.
• Peu de temps après leur introduction à la fin des
années 40, une résistance à la streptomycine, au
chloramphénicol et à la tétracycline a été notée.
 Les premières indications / signes de
résistance aux antibiotiques
• En 1953, lors d'un Shigella épidémie au Japon, une
souche de Shigella dysenteriae résistant à plusieurs
molécules (médicament multiple), a été isolé

• Au fil des ans, et dans le présent, presque tous les

agents pathogènes bactériens connus ont développé
une résistance à un ou plusieurs antibiotiques utilisés
en clinique.
 Les premières indications / signes de
résistance aux antibiotiques
• Le développement ci-dessus met en évidence
le fait que la résistance à l'AB s'est développée
bien avant la découverte d'AB.
• Mais il convient de noter que des causes
spécifiques, élucidées ou à venir, sont
responsables de l'expression du phénotype:
– Système de vie communautaire microbienne
– Utilisation par l'homme d'agents antimicrobiens
chez l'homme, l'animal ou la plante à des fins
différentes (complément alimentaire, traitement
de maladies infectieuses / ID, etc.)
 Transfert horizontal
• Les bactéries transmettent également des gènes de
résistance aux médicaments entre les souches et
même entre les espèces comme c'est le cas avec la
virulence (transfert horizontal de gène HGT).
• les gènes de résistance aux antibiotiques des
staphylocoques sont transportés sur des plasmides qui
peuvent être échangés avec Bacille, streptocoque et
Entérocoque
– Fournir des moyens pour acquérir des gènes
supplémentaires et des combinaisons de gènes.
• Certains sont transportés sur des segments d'ADN qui
peuvent exister soit dans le chromosome, soit dans des
 Sélection de phénotypes de
•
résistance
comment la résistance évolue via
la sélection naturelle.
– Supérieur: une population de
bactéries avant exposition à un
antibiotique.
– Le milieu: le même après la
sélection due à l'exposition, la
phase dans laquelle la sélection a
eu lieu.
– Le plus bas: répartition de la
résistance dans une nouvelle
génération de bactéries (de bas en
 Plusieurs organismes résistants
• aux médicaments
Plusieurs organismes résistants aux médicaments
résistent au traitement avec plusieurs agents
antimicrobiens, souvent sans rapport avec eux.
• Certains des organismes les plus importants présentant
ce photype sont les suivants:
– 1- résistant à la méthicilline / oxacilline
Staphylococcus aureus (SARM)
• Associé nosocomial ou associé à la communauté
• Le SARM dans les établissements de santé provoque
souvent des infections graves et potentiellement
mortelles, telles que des infections du sang, des infections
du site opératoire ou une pneumonie.
Plusieurs organismes résistants
aux médicaments
– 2- Entérocoques résistants à la vancomycine (ERV)
• Le SARM et l'ERV sont les organismes résistants
aux médicaments les plus fréquemment
rencontrés chez les patients résidant dans des
établissements de santé non hospitaliers, tels
que les maisons de soins infirmiers et autres
établissements de soins de longue durée.
– 3- Bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE)
• résistant aux céphalosporines et aux
monobactames
• Les BLSE sont le plus souvent rencontrées en
milieu hospitalier (soins intensifs), mais le
 Plusieurs organismes résistants
aux médicaments
– 4- résistant à la pénicilline Streptococcus
pneumoniae (DSRP)
• Les DSRP sont plus courants chez les patients
recherchant des soins en ambulatoire tels que
les cabinets de médecins et les cliniques, en
particulier en milieu pédiatrique.
• Le traitement des infections causées par des souches
résistantes est un véritable défi thérapeutique
 Résistance croisée
• Cela se produit généralement dans les
antibiotiques de la même famille, par exemple
des résistances croisées entre pénicillines,
plus largement entre tous les β-lactamines
dont les céphalosporines.
Bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE)
• Les bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) sont des
bêta-lactamases associées aux plasmides qui ont
récemment été trouvées dans le Entérobactéries.
• Les BLSE peuvent provoquer l'hydrolyse de les
pénicillines, de nombreuses céphalosporines à spectre
étroit, de nombreuses céphalosporines à spectre
étendu, les oxyimino-céphalosporines (céfotaxime,
ceftazidime) et les monobactames (aztréonam).
• Des souches productrices de BLSE ont été isolées à
partir d'abcès, de sang, de pointes de cathéter, de
poumons, de liquide péritonéal, d'expectorations et de
cultures de gorge.
–
 Types de phénotype de résistance et
Mécanismes bactériens de résistance aux
antibiotiques
• La résistance peut être
– Liés au gène
• La formation de biofilm peut être un bras puissant contre
agents antibactériens
– Non lié au gène
• L'organisme peut présenter
– Résistance naturelle
– Résistance acquise
• Quels sont les premiers signes de résistance?
• Qui a observé ces signes?
• etc.
 Résistance naturelle
• La résistance naturelle signifie que les bactéries sont
«intrinsèquement» résistantes.
• Aussi appelé phénotype sauvage
– manque de système de transport ou Inaccessibilité
de la cible
– (c.-à-d. résistance à l'imperméabilité due à
l'absence d'un transporteur adéquat: résistance
aux aminosides chez les anaérobies stricts)
– Inactivation des médicaments: c.-à-d.
• AmpC cephalosporinase dans Klebsiella
– Systèmes d'efflux multidrogues:
• Acre dans E. coli, MexB dans P. aeruginosa
 Résistance naturelle
CARACTÉRISTIQUES
• Phénotype observé dans tous les individus de la même
espèce
• Codé chromosomiquement
• Exprimé de manière stable
– Streptomyces possède certains gènes responsables
de la résistance à son propre antibiotique.
• La multi résistance peut exister naturellement
– 1. Mycobactéries la résistance à la fois aux β-lactamines
et aux cyclines résulte de la combinaison d'une très
faible perméabilité de la paroi cellulaire bactérienne, de
la production d'enzymes d'inactivation d'antibiotiques
(β-lactamases, enzymes inactivant les aminosides) et
d'une faible affinité pour la cible (PBP, ADN gyrase).
 Résistance naturelle

– 2. Un autre exemple est P aeruginosa

• Il est résistant aux β-lactames, y compris les
céphalosporines de troisième génération, les
quinolones, le chloramphénicol et les cyclines.

• La cause principale est la très faible perméabilité de la

paroi cellulaire (les porines sont rares = petit nombre,
spécificité du substrat).
 Résistance naturelle
• P aeruginosa se caractérise par la production de
céphalosporinase inductible, un efflux actif et une
faible affinité pour la cible (ADN gyrase),
– trois mécanismes en synergie avec la faible
perméabilité de la paroi cellulaire microbienne.
– Pensé pour être à l'origine de nombreux
phénotypes de résistance diffuser
 Résistance acquise
• La résistance acquise fait référence aux bactéries qui
sont généralement sensibles aux antibiotiques, mais
sont susceptibles de développer une résistance.
• Il est spécifique à certaines souches qui ont un
comportement anormal vis-à-vis des antibiotiques par
rapport à l’espèce à laquelle ils appartiennent.
– Ce phénotype anormal résulte de modifications génétiques.

• EN RAISON DE LA MUTATION DE GÈNES

NATURELLEMENT PRÉSENTS SUR LE CHROMOSOME
BACTÉRIEN OU PAR ACQUISITION DE GÈNES
ÉTRANGERS.
 Résistance acquise
Caractéristiques
• Observé dans certaines souches de la même espèce
 La résistance acquise est souvent causée par
des mutations
gènes chromosomiques,
l'acquisition de génétique mobile éléments
plasmides ou transposons porteurs des gènes de
résistance aux antibiotiques (instable).
Pouvez être perdu lorsque le facteur de stress cesse
Éléments génétiques acquis inséré dans le
chromosome bactérien aura un certain degré de
stabilité
 Résistance acquise
Caractéristiques

• Cinq mécanismes majeurs de résistance aux

antibiotiques sont connus pour être associés à
des modifications sur le chromosome:
– 1. Perméabilité ou absorption réduite.
– 2. Efflux amélioré.
– 3. Inactivation enzymatique.
– 4. Altération ou surexpression de la cible
médicamenteuse.
– 5. Perte d'enzymes impliquées dans l'activation du
médicament. Ce mécanisme est relativement
nouveau.
 Résistance acquise
Caractéristiques

• une. Perméabilité ou absorption réduite

– Le premier mécanisme est la réduction de la
perméabilité ou de l'absorption des bactéries.
• La porine de Neisseria gonorrhea peut acquérir des
mutations qui peuvent entraîner une résistance à la
pénicilline et à la tétracycline.
• Enterobacter aerogenes porin, peut acquérir des
mutations qui provoquent une résistance aux
céphalosporines.

– Escherichia coli vers des antibiotiques

hydrophobes (pénicillines G et M, macrolides).
 Résistance acquise
Caractéristiques
• b. Augmentation de l'activité d'efflux
• De nombreux exemples du deuxième
mécanisme,
– Un efflux de tétracycline a été découvert au début
des années 1980.
– les systèmes enzymatiques de la paroi cellulaire
observés avec les souches d'E coli, Staphylococcus
aureus, ou alors Pseudomonas aeruginosa vers les
cyclines et les fluoroquinolones
– Certaines substances bactériennes se lient au
répresseur, soulagent la suppression et provoquent
 Résistance acquise
Caractéristiques
• C- Inactivation enzymatique
• Cas de Les bêta-lactamases, qui peuvent cliver les
antibiotiques bêta-lactamines et provoquer une
résistance.
• Enzymes d'inactivation des aminosides, qui peuvent
ajouter des groupes acétyle, adényle et phosphoryle
pour inactiver l'antibiotique.
• La chloramphénicol acétyl transférase et la
streptogramine acétyl transférase peuvent ajouter un
groupe acétyle pour inactiver les deux antibiotiques,
respectivement.
• Haemophilus influenzae, qui produit des β-lactamases,
 Résistance acquise
Caractéristiques
• ré. Altération de la cible du médicament ou
surexpression
• Le médicament n'est plus capable de réagir avec lui
(ribosomes, enzymes de synthèse de la paroi
bactérienne, etc.) comme on le voit dans les
antibiotiques Streptococcus pneumoniae et bêta-
lactamines. Les exemples comprennent:
– Streptococcus pneumoniae et antibiotiques bêta-
lactamines.
– Présistance à l'énicilline, due à des altérations de la
liaison à la pénicilline protéines.
– La mutation entraîne une surexpression de la cible
 Résistance acquise
Caractéristiques
• e. Perte d'enzymes lors de l'activation du
médicament
• Comme je l'ai noté précédemment, la perte
d'enzymes impliquées dans l'activation des
médicaments est un mécanisme relativement
nouveau de résistance aux médicaments.
• Dans ce cas, l'antibiotique lui-même n'a
AUCUNE activité DIRECTE contre les bactéries.
• Il repose plutôt sur l'activation par une enzyme
bactérienne.
 Résistance mutationnelle
• La résistance mutationnelle comprend:
– Modification du site cible
• Résistance à la streptomycine: mutations dans
les gènes de l'ADNr (rpsL), résistance aux ß-
lactamines: modification des PBP (protéines de
liaison à la pénicilline))
• Perméabilité ou absorption réduite
• By-pass métabolique
– c'est-à-dire résistance au triméthoprime:
surproduction de DHF (dihydrofolate) réductase
ou thi- mutants dans S. aureus)
• Derépression des systèmes d'efflux multidrogues
 Résistance acquise
extrachromosomique
• Ce phénotype est disséminé par des plasmides ou des
transposons
• Inactivation des médicaments
– c'est-à-dire les enzymes modifiant les aminosides,
les ß-lactamases, la chloramphénicol
acétyltransférase
• Système Efflux
– ie efflux de tétracycline
• Modification du site cible
– c'est-à-dire méthylation dans le composant 23S de
la sous-unité ribosomale 50S: Erm méthylases
• By-pass métabolique
 Mécanismes bactériens de résistance aux
antibiotiques
• Les bactéries ont développé des phénotypes de
résistance aux AB à travers différents.
• Ces mécanismes peuvent soit modifier chimiquement
l'antibiotique, le rendre inactif (puis non efficace) par
élimination physique de la cellule, (transporteurs ABC)
ou
– Le mode le plus courant est l'inactivation
enzymatique de l'antibiotique.
– Une enzyme cellulaire existante est modifiée pour
réagir avec l'antibiotique de telle sorte qu'elle
n'affecte plus le micro-organisme.
• modifier le site récepteur ciblé afin qu'il ne soit pas
reconnu par l'antibiotique.
– Une stratégie alternative utilisée par de
nombreuses bactéries est l'altération du site cible
de l'antibiotique.
 Résumé des mécanismes
• modifier le site
récepteur ciblé afin
qu'il ne soit pas
reconnu par
l'antibiotique.
– Une stratégie
alternative
utilisée par de
nombreuses
bactéries est
l'altération du
site cible de
Pourriez-vous ajouter des commentaires à la figure?
l'antibiotique.
 Transfert de gène vertical
• La fréquence de mutation spontanée pour la résistance
aux antibiotiques est d'environ 10-8- dix-9.
– Sinon, cela signifie que UNE sur 108- dix9 les
bactéries dans une infection développeront une
résistance par le biais du processus de mutation.
• Dans Escherichia coli, on estime que la résistance à la
streptomycine est acquise à un taux proche à 10-9
lorsqu'il est exposé à des concentrations élevées de
streptomycine.
• La mutation est un événement très rare et peut être
réparée; MAIS le très grand nombre d'organismes en
peu de temps en raison du taux de croissance rapide, il
ne faut pas longtemps avant que la résistance ne se
• Une fois que les gènes de résistance se sont
développés, ils sont transférés directement à toute la
descendance de la bactérie lors de la réplication de
l'ADN.
– C'est ce qu'on appelle transfert de gène vertical ou
alors évolution verticale.
• Le processus est strictement une question d'évolution
darwinienne guidée par les principes de la sélection
naturelle
• une mutation spontanée dans le chromosome bactérien
confère une résistance à un membre de la population
bactérienne.
• Dans l'environnement sélectif de l'antibiotique, le type
sauvage (non mutants) est tué et le mutant résistant est
 Transfert de gène horizontal
• C'est l'autre mécanisme au-delà de la mutation
spontanée qui est responsable de l'acquisition
de la résistance aux antibiotiques.
– Latéral ou transfert de gène horizontal (HGT)
• I ce processus, matériel génétique contenant un
petit segment d'ADN peut être transféré entre
des bactéries individuelles de la même espèce
ou même entre des espèces différentes.
• HGT se produit par au moins trois mécanismes
principaux (mécanismes d'arbre de transfert
génétique)
– transduction,
• La transduction se produit lorsque des virus spécifiques
de bactéries (bactériophages) transfèrent de l'ADN entre
deux bactéries étroitement liées.
– transformation ou
• parties d'ADN présentes dans l'environnement extérieur
en raison de autre lyse bactérienne reprise par les
bactéries du milieu extérieur
– Conjugaison: La conjugaison se produit lorsqu'il y a un
contact direct cellule-cellule entre deux bactéries
(étroitement liées)
 Propagation de la résistance

Pouvez-vous ajouter des commentaires à

l'illustration?
 Mécanismes de transfert horizontal
de gènes
• Les effets combinés des taux de croissance rapides
vers de grandes densités de cellules, des processus
génétiques de mutation et de sélection, et de la
capacité à échanger des gènes, expliquent les taux
extraordinaires d'adaptation et d'évolution qui
peuvent être observés chez les bactéries.

• Pour ces raisons, l'adaptation bactérienne (résistance)

à l'environnement antibiotique semble s'opérer très
rapidement tout au long de l'évolution
• C'est pourquoi les bactéries évoluent
rapidement
– Implications cliniques et fondamentales
• Recherche continue
• Etc.
• Plus de flexibilité requise de la part des
bactériologistes car les bactéries sont si
flexibles!
• Sources de la résistance microbienne à AB comprend

• Antibiotiques dans les aliments et l'eau

• Infiltration d'eau municipale vers les eaux souterraines
• Utilisation sans discernement d'antibiotiques dans
l'agriculture et la pratique vétérinaire
L'utilisation non thérapeutique d'antibiotiques en élevage
• Utilisation irresponsable d'antibiotiques chez les animaux
d'élevage
• Une telle résistance peut ensuite être transmise aux
agents pathogènes humains par des mécanismes de HGT.
• La principale préoccupation est l'utilisation
d'antibiotiques comme additifs alimentaires donnés
aux animaux d'élevage pour favoriser la croissance et
la maladie

• Résistance aux antibiotiques dans les cultures

génétiquement modifiées
Les gènes de résistance aux antibiotiques sont
utilisés comme "marqueurs" dans les cultures
génétiquement modifiées.

• Les gènes sont insérés dans la plante dans les

premiers stades de développement afin de détecter
• Utilisation inappropriée d'antibiotiques dans
l'environnement médical
• Prescription abusive par le personnel médical
• Utilisation d'AB non thérapeutique par les patients

• Comment l'homme peut-il lutter avec succès contre

la résistance AB? Quel pourrait être l'avantage d'une
lutte réussie contre la résistance AB?
 Résumer les discussions sur la
résistance des abdos
• La découverte des antibiotiques a été un saut dans la
médecine moderne.
• Ils ont pu arrêter la croissance ou tuer de nombreux
types de micro-organismes.
• Cependant, les bactéries se sont avérées beaucoup plus
innovantes et adaptatives que nous ne l'imaginions et
ont développé une résistance aux antibiotiques à un
rythme toujours plus rapide.
• Les mauvaises pratiques et la mauvaise gestion n'ont
fait qu'exacerber la situation.
• Nous pourrions bientôt revenir à un état de santé
médicale aussi désastreux que celui qui s'était
produit avant l'utilisation des antibiotiques.

• Cependant, avec plus de recherche, une

éducation du public et une réglementation bien
pensée, les problèmes peuvent être résolus.

• Plusieurs stratégies sont actuellement utilisées

pour trouver de nouveaux composés
antibactériens et de nouvelles stratégies sont en
cours de développement et d'essai.
• Non seulement il y a un problème à trouver de
nouveaux antibiotiques pour combattre maladies
anciennes (car des souches de bactéries résistantes
sont apparues), il y a un problème parallèle pour
trouver de nouveaux antibiotiques à combattre
nouvelles maladies.
– E. coli O157: ulcères gastriques H7,
– Maladie de Lyme,
– syndrome de choc toxique,
– streptocoques «mangeurs de peau»).
• N'ont décrit que récemment, par exemple
– Et il existe déjà de larges schémas de résistance chez ces agents
• De nouveaux antibiotiques seront bientôt
nécessaires pour remplacer les molécules qui
conservent jusqu'à présent l'efficacité des
bactéries
– d'autant plus que des résistances commencent à
émerger chez eux dans l'environnement sélectif de
la chimiothérapie antibiotique.
• Parallèlement à la vaccination, l'utilisation
d'antibiotiques a contribué à améliorer la
durée de vie moyenne des êtres humains dans
les communautés (pays) où ils sont
soigneusement utilisés.
• D'après les développements ci-dessus, on remarque
que les antibiotiques (comme d'autres antimicrobiens)
peuvent sauver des vies
• Ils peuvent également être dangereux pour les
utilisateurs, que ce soit directement ou indirectement
à court et à long terme, au niveau individuel, au
niveau communautaire et même au-delà des
frontières.
• Si certains antibiotiques sont relativement sûrs;
d'autres ne devraient être utilisées que s'il n'y a pas
d'autres alternatives pour contrôler une infection.

• Discutez des techniques de mesure pendant les