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thme 5

variation gntique et sant

Exploitation des documents par les activits

Chapitre 2 Variations du gnome


et maladie
Unit

Une maladie gntique : la mucoviscidose


Connaissances du programme

[pp. 248-249 du manuel de llve]

Doc. 1 et 2 (Sinformer partir dun schma, mettre en relation des informations). Les symptmes de la mucoviscidose sont un encombrement des bronches associ une toux, des expectorations voire une insuffisance respiratoire, des troubles digestifs lis une atteinte de la fonction hpatique et pancratique et une strilit chez 95 % des hommes malades et chez certaines femmes (doc. 1). Latteinte respiratoire est due une obstruction des bronches par un mucus anormalement pais et visqueux qui est difficilement vacu par le battement des cils de lpithlium bronchique. De plus, les bactries non vacues sont lorigine dinfections chroniques qui dtruisent progressivement le tissu pulmonaire, ce qui amplifie latteinte respiratoire (doc. 2). Doc. 3 (Sinformer partir dun document). La mutation

plasme et dgrade dans sa quasi-totalit avant quelle natteigne la membrane plasmique apicale des cellules pithliales pulmonaires o elle exerce normalement sa fonction. En consquence, les ions chlorures saccumulent dans les cellules pithliales pulmonaires, ce qui provoque indirectement la diminution de la fluidit du mucus. Celui-ci spaissit, devient difficile vacuer et conduit la maladie.

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse ou


en construisant un schma bilan). Un schma bilan semblable celui de la page 259 peut tre propos. Lensemble des documents montre que le phnotype de la mucoviscidose sexprime diffrentes chelles : molcule (perte de la phnylalanine en position 508 de la protine CFTR), cellule (diminution de lexpression du canal CFTR, baisse de la concentration en ions chlorures dans le mucus, augmentation de la viscosit et paississement du mucus), de lorgane (obstruction des bronches, destruction des poumons) et de lorganisme (toux, expectorations, insuffisance respiratoire). Par ailleurs, les effets observs ces diffrentes chelles sont lis : la perte dun rsidu phnylalanine provoque une baisse de lexpression de la protine CFTR au niveau membranaire ; lpaississement du mucus qui sensuit provoque une obstruction des bronches, laquelle peut tre lorigine dune insuffisance respiratoire dans les cas les plus graves.

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations : pour tablir le lien entre le phnotype macroscopique et le gnotype. La mucoviscidose est une maladie frquente, provoque par la mutation dun gne qui est prsent sous cette forme chez une personne sur 40 environ. Le phnotype malade comporte des aspects macroscopiques qui sexpliquent par la modification dune protine.

consiste en une dltion de trois nuclotides entre les codons 507 et 508. Cette mutation ne provoque ni de dcalage de cadre de lecture ni de changement dacide amin en position 507 (ATC et ATT codent pour lisoleucine), mais elle provoque la perte du rsidu phnylalanine en position 508 de la protine.

Bien quaucune connaissance concernant une autre maladie gnique ne soit attendue, un lve doit pouvoir ltudier partir de documents fournis, lobjectif tant pour le professeur que llve sache tablir le lien entre le phnotype dune maladie autosomique et le gnotype. Le lien entre phnotype et gnotype devra tre tabli diffrentes chelles lies les unes aux autres (protine, cellule, organe, organisme) en comparant le phnotype dun individu malade celui dun individu sain. Les lves devront avoir abord auparavant les chapitres du thme 1 du programme de Premire S qui abordent les relations gne/protine, mutation/phnotype et le lien entre phnotype molculaire, phnotype cellulaire et phnotype macroscopique. Nous prsentons ici les manifestations cliniques dune forme svre de la mucoviscidose lie la mutation la plus commune (mutation DF508 exprime ltat homozygote, doc. 3), mais le professeur doit tre conscient que dautres mutations existent dont certaines pouvant conduire des formes moins svres de la maladie (par exemple, mucoviscidose sans insuffisance pancratique). En ce sens, il devra veiller choisir des documents en lien avec la mutation choisie. Des ressources multimdia sont accessibles en ligne : www.atlasducorpshumain.fr/thorax/88-mucoviscidose.html. La page douverture du chapitre, qui prsente un clich dune cellule scrtrice de mucus borde par deux cellules pithliales cilies, peut tre utilise pour expliquer le mcanisme de scrtion et dvacuation du mucus au niveau des bronches dun individu sain.

Doc. 4 et 5 (Communiquer par un schma et mettre en rela-

Conseils et suggestions
Lobjectif de ce chapitre est de comprendre comment une ou des altrations du gnome peuvent conduire une pathologie. Le choix de la mucoviscidose et du diabte de type 2 permet de distinguer les maladies dterminisme monognique avec transmission mendlienne et les maladies multigniques dont le dterminisme rsulte dinteractions complexes entre gnotype et environnement. Les raisonnements mis en jeu sont de nature probabiliste. Ltude de la transmission de la mucoviscidose permet de raliser un calcul fond sur lanalyse de lascendance familiale et de tableaux de croisement. Ltude du dterminisme du diabte de type 2 repose sur des notions dpidmiologie et sur le concept de facteur de risque. Dans les deux cas, la comprhension du dterminisme de la pathologie et de son mode de transmission justifie les campagnes de prvention, les stratgies de prise en charge mdicale et fonde les politiques de sant publique. Les objectifs de connaissance de cette unit sont de comprendre une maladie gnique autosomique, donc de comprendre comment une anomalie gntique porte par un chromosome autosome peut conduire une maladie svre. Les lves savent que le fonctionnement cellulaire est assur grce des protines en gnral et notamment des enzymes dont la synthse est gouverne par le gnotype. On constate la frquence leve dune maladie dans une famille sans quelle soit contagieuse. Ce constat et les connaissances de la classe de troisime permettent de formuler lhypothse que la maladie est transmise gntiquement. La mucoviscidose est suggre par le programme en raison de sa frquence (cest la plus frquente des maladies gntiques autosomiques rcessives en Europe), mais le professeur pourra, sil le souhaite, choisir un autre exemple.
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tions des documents). Le schma attendu est donn la page 256 du manuel. Chez lindividu malade, la protine CFTR mutante (canal ions chlorures), bien que fonctionnelle, est pige dans le cyto-

Unit

Prvenir et soigner la mucoviscidose


Connaissances du programme

[pp. 250-251 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


tudier un arbre gnalogique pour valuer un risque gntique. Recenser, extraire et organiser des informations : pour comprendre les traitements mdicaux (oxygnothrapie, kinsithrapie) et les potentialits offertes par les thrapies gniques.

Seuls les homozygotes pour lallle mut sont malades. Ltude dun arbre gnalogique permet de prvoir le risque de transmission de la maladie. On limite les effets de la maladie en agissant sur des paramtres du milieu. La thrapie gntique constitue un espoir de correction de la maladie dans les cellules pulmonaires atteintes.

Conseils et suggestions
Cette unit vise dans un premier temps calculer le risque de transmission dune maladie gntique. Lexemple trait ici est toujours la mucoviscidose, maladie monognique transmission autosomique rcessive. Conformment au programme, ltude portera sur larbre gnalogique dune famille atteinte par la mucoviscidose. Ltude de larbre pourra tre loccasion de rappeler comment se fait la transmission dun couple dallle (doc. 4) et de confirmer que la mucoviscidose est bien une maladie autosomique (une proportion sensiblement gale dhommes et de femmes est touche par la maladie au sein dune famille) et rcessive (la maladie est transmise par des porteurs sains).

Pour le calcul du risque, les lves pourront sappuyer sur leurs connaissances de mathmatiques sur le calcul de probabilits. En France, le dpistage nonatal systmatique de la mucoviscidose a permis de rvaluer ds 2003 lincidence de la maladie environ un nouveau-n sur 4 600 naissances, soit une frquence de sujets htrozygotes (porteurs sains) de lordre de 1 sur 34. Cette valeur sera la base de tous les calculs de probabilit. Cette unit aura galement pour objectif denvisager les traitements qui augmentent lesprance de vie des malades et de prsenter les espoirs et les limites de la thrapie gnique. Exploitation des documents par les activits

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Doc. 1, 5 et 6 (Mettre en relation des donnes). Le graphique


montre que lesprance de vie est de 35 ans pour les enfants qui sont ns en 2000 [au Canada] alors quelle ntait que de trois ans dans les annes 1950. Laugmentation de lesprance de vie des malades depuis 1960 est dabord due lutilisation des antibiotiques (vers 1950) puis des soins appropris qui aident mieux vacuer le mucus (kinsithrapie) ou lutter contre linsuffisance respiratoire (oxygnothrapie). Le dpistage systmatique de la maladie depuis 2002 en France permet de traiter les enfants malades ds le plus jeune ge, ce qui a encore augment lesprance de vie (elle est de 46 ans en France pour les enfants qui sont ns en 2008). Enfin, depuis une dizaine dannes, les patients svres ont la possibilit de subir une greffe pulmonaire pour un gain desprance de vie de 5 ans environ.

Doc. 7 (Sinformer partir dun schma et dun texte). La thrapie gnique constitue un espoir de gurison dans la mesure o elle consiste faire exprimer le gne CFTR sauvage dans les cellules de lpithlium bronchique. Pour cela, on introduit le gne sauvage dans un vecteur viral comme ladnovirus, le virus responsable des rhumes. Le vecteur doit en outre tre rendu inoffensif par limination de ses gnes de virulence et demeurer capable dinfecter les cellules pithliales pulmonaires. Les avantages de la mthode sont quelle constitue un espoir de correction de la maladie et que les essais cliniques ont montr quil est possible dintroduire le gne CFTR dans les cellules pithliales. Les inconvnients sont que le gne sauvage ne peut pas tre directement introduit dans les cellules souches de lpithlium pulmonaire (des administrations rptes de vecteur doivent tre ralises) et que la raction immunitaire du patient diminue lefficacit du traitement.

comme un donneur dordres, les vaisseaux et le sang comme trait dunion entre les organes et les muscles, le foie et le tissu adipeux comme les effecteurs assurant soit une baisse soit une hausse de la glycmie. La boucle de rgulation est rsume p. 257. Le texte de lgende souligne le grand nombre de protines impliques dans la transmission du message port par linsulinmie. Les connaissances des lves sur la synthse des protines (pp. 48-69 du manuel lve) permettent de formuler lhypothse que la mutation de lun des nombreux gnes codant ces protines peut aboutir un drglement de la glycmie.

Doc. 2 et 4 (Calculez un risque de transmission dune maladie).


Le ftus III-5 a dj un frre malade, ce qui signifie que les parents II-5 et II-6 sont des porteurs sains portant la mutation ltat htrozygote (doc. 2). Dans ces conditions, la probabilit quils donnent naissance un enfant malade est de (doc. 4).

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse).


Voir le rsum de lunit 2, page 256.

Doc. 3 et 4 (Calculez un risque de transmission dune maladie).


Le dtail des calculs de transmission pour chaque cas est donn dans le tableau de la page 256.

Unit

Une maladie mtabolique : le diabte de type 2


Connaissances du programme

[pp. 252-253 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations pour identifier : lorigine multignique de certaines maladies ; linfluence des facteurs environnementaux. Comprendre que dterminer les facteurs gntiques ou non dune maladie repose sur des mthodes particulires qui constituent les fondements de lpidmiologie.

Le plus souvent, limpact du gnome sur la sant nest pas un dterminisme absolu. Il existe des gnes dont certains allles rendent plus probable le dveloppement dune maladie sans pour autant le rendre certain. Un exemple de maladie (maladie cardio-vasculaire, diabte de type II) permet dillustrer le type dtudes envisageables.

Doc. 1, 2 et 6 (Sinformer pour tablir une relation entre diffrents documents). Le doc. 2 permet de retrouver le fonctionnement normal de la boucle de rgulation (cas tmoin) : une ingestion de glucose est rapidement suivie dune scrtion importante dinsuline (insulinmie huit fois plus importante qu jeun) limitant la hausse de la glycmie ; lorsque la glycmie a diminu, la scrtion dinsuline cesse. Chez les patients diabtiques de type 1, linsulinmie reste quasi nulle. La hausse de glycmie trs importante dmontre la ncessit de linsuline pour viter lhyperglycmie. Chez les patients diabtiques de type 2, linsulinmie volue presque normalement, mme si lamplitude des variations est plus faible que chez le tmoin ; pourtant la glycmie augmente fortement et durablement : la prsence de linsuline na pas suffi empcher lhyperglycmie. Cest donc en aval de la scrtion dinsuline que la boucle de rgulation de la glycmie est perturbe, l o de nombreuses protines sont impliques dans la transmission du message. On peut donc localiser (schma p. 257) les dysfonctionnements dans la boucle de rgulation. Le doc. 6 montre lintrt des traitements qui visent faire baisser la glycmie en renforant leffet de linsuline (augmentation de sa scrtion ou sensibilisation des cellules cibles) ou en favorisant la consommation de glucose (activit physique). Le doc. 2 montre galement que linsulinoscrtion est plus leve jeun chez le patient de type 2 que chez le tmoin : linsuline est donc anormalement efficace, et on comprend que les cellules du pancras, en permanence sollicites, puissent finalement spuiser (doc. 6)

prvalence, qui recense tous les malades, rcents ou anciens. Cette notion est distinguer de celle dincidence, qui ne regroupe que les cas rcents (pour le diabte de type 2, ceux apparus au cours de lanne coule). Le doc. 3 montre une forte augmentation de la prvalence sur 30 ans, donc une pidmie. La carte montre une ingale rpartition dans le monde. On peut ce stade proposer que les populations prsentent des susceptibilits diffrentes en raison de leur patrimoine gntique et/ou de leur environnement et mode de vie : rgime alimentaire en Amrique du Nord, facteurs gntiques en Arabie Saoudite ou Amrique du Sud. Le doc. 4 montre que le diabte de type 2 reprsente la forme la plus rpandue de diabte et apparat tardivement au cours de la vie. Ce facteur ge explique sans doute en partie la faible prvalence du diabte de type 2 en Afrique. La France apparat peu touche sur la carte (doc. 3) mais la prvalence augmente constamment (doc. 5) : on peut ainsi complter la notion dpidmie avec extension de la maladie dans une population o elle tait auparavant peu prsente. Le diabte de type 2 est donc une maladie en fort dveloppement, avec de grandes ingalits selon la rgion du monde et lge de la population.

Doc. 5 et 6 (Mettre en relation des documents). Laugmentation de la prvalence et la gravit des consquences font du diabte de type 2 une maladie grave. Les dcs quil cause et les handicaps quil gnre justifient une politique de sant publique. Les personnes traites sont effet dautant mieux prises en charge quelles sont diagnostiques un stade prcoce. La prvention, le dpistage, une prise en charge mdicamenteuse et des rgles dhygine de vie peuvent retarder lapparition ou laggravation de la maladie. en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse). Le diabte se caractrise par des hyperglycmies, notamment aprs les repas, durables et non rgules. La forme la plus frquente et en trs forte progression actuellement est le diabte de type 2, caus par une diminution de lefficacit de linsuline. La forte progression de la maladie dans le monde et en France justifie que lon parle dpidmie. Cette pidmie touche principalement des sujets gs de plus de 45 ans. Elle entrane de graves complications, causant des handicaps et des dcs prmaturs.

Doc. 3 A 5 (Sinformer partir de graphiques et mettre en


relation des documents). Cette srie de documents prsente une approche pidmiologique de la maladie et introduit la notion de

Conseils et suggestions
Le programme suggre de traiter un exemple de maladie dterminisme multignique, diabte de type 2 ou maladies cardiovasculaires. Le choix sest port sur le diabte de type 2, maladie moins polymorphe que les maladies cardiovasculaires et exemple repris en classe de Terminale S. Le cas dune maladie cardiovasculaire, lathrosclrose, est abord sous la forme dun exercice Objectif bac, p. 283. Lunit 3 vise prsenter les caractristiques du diabte : bases physiologiques, tiologie, pidmiologie et consquences. Il est fait appel au concept de boucle de rgulation abord en classe de Seconde. Les fondements de lpidmiologie permettent de souligner le caractre pidmique de cette pathologie. La page de gauche de cette unit 3 sera donc loccasion de discuter la notion
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dpidmie, (augmentation de la prvalence dune maladie dans une population o elle tait auparavant peu ou pas prsente). Le caractre pidmique nest donc pas ncessairement associ celui de contagiosit. Limportance de la pathologie en termes de sant publique ayant t dmontre, les lves pourront ensuite aborder les causes gntiques et environnementales du diabte de type 2.

Unit

Les causes du diabte de type 2


Connaissances du programme

[pp. 254-255 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Comprendre les conditions de validits daffirmations concernant la responsabilit dun gne ou dun facteur de lenvironnement dans le dclenchement dune maladie. Savoir choisir ses comportements face un risque de sant pour exercer sa responsabilit individuelle ou collective.

Exploitation des documents par les activits

Doc. 1 (Sinformer partir dun schma). Le schma prsente


des organes assurant quatre rles : stockage temporaire du glucose, consommation du glucose, production dun messager : linsuline, transport du glucose et de linsuline. Le pancras apparat donc

En gnral les modes de vie et de milieu interviennent galement et le dveloppement dune maladie dpend alors de linteraction complexe entre facteurs du milieu et gnome.

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Conseils et suggestions
Les raisonnements mis en jeu dans cette unit sont de nature probabiliste. Lobjectif est de faire dcouvrir la notion de facteur de risque et notamment dallle de prdisposition. Cette tude sappuie sur les mthodes statistiques qui fondent lpidmiologie. La premire page prsente les mthodes de biologie molculaire et le concept de facteur de risque. Pour comprendre le principe des animations, on peut utiliser une animation en ligne : www.cea.fr/var/cea/storage/static/fr/ jeunes/animation/aLaLoupe/biopuce/puceAdn.htm. Le dterminisme multignique du diabte de type 2 nest pas simple tablir : cette information est donc donne llve. De mme, la notion de facteur de risque dpasse les connaissances mathmatiques des lves. Sa prsentation a donc t simplifie. La page de gauche prsente plusieurs exemples de facteurs de risque, gntiques et environnementaux, pour aboutir la notion dinteraction entre gnome et environnement. Lexercice 4, p. 261 prolonge la rflexion sur leffet cumulatif de plusieurs allles dfavorables et de facteurs environnementaux ou comportementaux.

la protine code est peut-tre active en rponse larrive dinsuline pour favoriser le stockage de glucose ; pour dautres enfin, on doit simplement constater quils constituent un facteur de risque gntique. La possession de plusieurs allles dfavorables de diffrents gnes de prdisposition a des effets cumulatifs complexes. Si tous ces gnes avaient des effets totalement indpendants, il suffirait de multiplier les facteurs de risques de chacun des gnes pour obtenir le facteur de risque global dun individu. Toutefois, certaines associations sont synergiques ou au contraire ont des effets compensateurs. Le graphique complte ce document en montrant que les gnes de prdisposition sont des gnes dont le fonctionnement est altr mais pas nul (contrairement au gne CFTR responsable de la mucoviscidose). Ainsi, le dclenchement de la mucoviscidose est li la possession de deux allles non fonctionnels dun seul gne. Le diabte de type 2 rsulte, lui, du dysfonctionnement partiel de nombreux gnes.

et ltat de sant : un rgime alimentaire trop gras ou trop sucr, la sdentarit, lobsit ou lge notamment sont des facteurs de risque importants. Chacun de ces facteurs contribue faiblement au

dclenchement du diabte, mais lexposition un nombre lev de facteurs de risque rend probable la maladie.

Chapitre 2 Variations du gnome


et maladie
Unit

Les caractristiques dun cancer


Connaissances du programme

[pp. 264-265 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Comprendre les causes multiples pouvant concourir au dveloppement de certains cancers et identifier des mesures de prvention possibles.

Doc. 4 et 5 (Mettre en relation des documents). Le doc. 4


montre lexistence de facteurs gntiques, le doc. 5 montre quun changement de mode de vie est galement associ un dveloppement de la maladie. La baisse dactivit physique et lamlioration de lalimentation lie au dveloppement conomique nont pas t compenses par une adaptation du rgime alimentaire ou un dveloppement des activits physiques de loisir. Dans le cas de lInde, cet effet environnemental est amplifi par lexistence dun terrain gntique dfavorable.

[] La formation dun clone cellulaire est parfois le commencement dun processus de cancrisation. La connaissance de la nature des perturbations du gnome responsable dun cancer permet denvisager des mesures de protection (vitement des agents mutagnes, surveillance, vaccination).

Exploitation des documents par les activits

Conseils et suggestions
Les objectifs de cette unit sont de dfinir les diffrentes tapes de lapparition dun cancer et les caractristiques des cellules cancreuses, et de justifier la ncessit des politiques de prvention. Les principales tapes cliniques de lapparition dun cancer pithlial (cancer du col de lutrus) sont prsentes, mais le professeur pourra choisir, sil le souhaite, dautres exemples. Le cancer de la peau peut tre une bonne alternative dans la mesure o : il est le seul cancer dont on peut suivre lvolution lil nu ; il permet dvoquer certaines mthodes de prvention (usages de crmes solaires, limiter lexposition au soleil, etc.). Un atelier (p. 285) sur le dpistage prcoce du cancer aborde la question du diagnostic travers une recherche sur Internet.

Doc. 1 A 3 (Sinformer et mettre en relation des documents).


Le doc. 1 fournit linformation cl : le fonctionnement anormal de plusieurs gnes est ncessaire pour dclencher un diabte de type 2. Les diffrents allles des gnes du patrimoine gntique humain sont connus grce au squenage des gnomes. Ils se distinguent les uns des autres par des diffrences souvent ponctuelles, les SNP. Ces SNP peuvent tre facilement tudis grce aux puces ADN (doc. 2). Ces techniques permettent dobtenir rapidement le gnotype des individus, sans mme avoir squencer les gnes intressants. Chaque puce ADN permet dtudier le polymorphisme gntique de plusieurs milliers de gnes simultanment. Il est donc possible dobtenir la frquence dun allle donn dans une population importante (doc. 3). On peut ainsi calculer la prvalence du diabte de type 2 dans une population possdant un allle donn et dans une population semblable mais ne le possdant pas. Lexistence dune diffrence de prvalence entre ces populations permet dimpliquer le gne tudi dans le dclenchement de la maladie. La comparaison des prvalences permet ainsi de caractriser des allles favorisant la maladie ou au contraire effet protecteur. On parle souvent de gnes de prdisposition, mais il sagit en fait dallles de prdisposition. Le doc. 3 prsente la notion de facteur de risque de manire gnrale, la possession dun allle donn pouvant tre tudie au mme titre quun facteur environnemental (comportement alimentaire par exemple).

Doc. 5 7 (Mettre en relation des documents). Le doc. 6


montre que 80 % des diabtiques de type 2 sont en surpoids ou obse. Navement, on peut tablir deux liens entre obsit et diabte. Le diabte, caractris par une hyperglycmie conduirait un stockage de glucose, converti en graisses dans le tissu adipeux (doc. 1, p. 252). Le doc. 7 contredit cette hypothse : lobsit est un facteur de risque trs important (presque 10 comparer avec la possession dun allle dfavorable de TCF7L2, seulement 1,35, doc. 4). Les personnes obses sont des personnes ayant un dsquilibre du mtabolisme nergtique. Le glucose tant le principal mtabolite nergtique, il est normal quun trouble comme lobsit perturbe la rgulation de la glycmie. Chez la souris, le tissu adipeux est dailleurs connu pour scrter une hormone rendant les cellules rsistantes linsuline la rsistine. Laccumulation de graisse aboutit donc une baisse de sensibilit des cellules cibles de linsuline.

Les tumeurs ainsi formes pourront ensuite grossir grce la mise en place de nouveaux vaisseaux sanguins qui les alimenteront en nutriments et en dioxygne (doc. 3). Lorsquune tumeur prsente une taille suffisamment importante, elle est susceptible dentraver le fonctionnement normal des organes et de mettre en pril la vie dune personne.

Exploitation des documents par les activits


Doc. 1 A 3 (Sinformer partir de documents). Ces documents mettent en lumire les trois principales tapes de lapparition dun cancer : La premire tape correspond lapparition dun cancer non invasif visualis sur le 2e clich du doc. 1. ce stade, la prolifration de certaines cellules de lpithlium utrin produit des tumeurs solides qui restent toujours localises dans lpithlium. Au stade invasif, certaines cellules cancreuses acquirent la capacit de migrer hors de leur tissu dorigine. Elles quittent lpithlium et gagnent un tissu plus profond (ici, le myomtre). Le doc. 2 prsente le stade le plus avanc : le cancer mtastatique. Sur ce clich de Petscan, de nouvelles tumeurs appeles mtastases sont visibles au niveau du foie. Elles sont formes partir dune tumeur primaire localise dans un autre organe, dont des cellules cancreuses ont gagn la circulation sanguine pour se fixer dans cet organe.
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Doc. 4 et 5 (Sinformer partir de documents). Le doc. 5 montre clairement que le pourcentage de survie cinq ans aprs le diagnostic est dautant plus faible que le cancer est dpist un stade avanc. 94 % des patients dont on a diagnostiqu un cancer superficiel restent en vie 5 ans aprs le diagnostic, alors que ce pourcentage est de seulement 5 % chez des patients dont on a diagnostiqu un cancer mtastatique. Ce constat justifie les politiques de dpistage prcoce du cancer qui permet dliminer les lsions prcancreuses, voire de petites tumeurs (doc. 4).

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse).


Le diabte de type 2 est caus par deux grands types de facteurs qui ont t mis en vidence par des tudes pidmiologiques. Les facteurs qui sont associs une plus forte prvalence du diabte de type 2 sont appels facteurs de risque. Les progrs dans la connaissance du gnome humain ont montr que certains allles de gnes normalement prsents dans nos cellules favorisent lapparition de la maladie. Ces allles rendent le fonctionnement des cellules lgrement moins efficaces dans la rgulation de la glycmie. Certaines populations concentrent un nombre lev de ces allles prdisposant au diabte de type 2. Par ailleurs, le mode de vie
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Doc. 1 et 4 (Sinformer pour tablir une relation entre diffrents documents). Le doc. 4 montre que certains allles augmentent faiblement le risque de diabte de type 2. Certains gnes sont directement impliqus dans la rgulation de la glycmie, comme SLC30A8 dont lexpression favorise la scrtion de linsuline. Pour dautres comme TCF7L2, on ne peut que formuler des hypothses :
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Doc. 6 et 7 (Sinformer et mettre en relation des donnes). Le doc. 6 prsente un clich de cellules cancreuses (cellules HeLa) en culture dont le noyau a t marqu en bleu et le cytoplasme en vert laide de molcules fluorescentes. Ces cellules adhrent au fond de la bote de culture et prolifrent (de nombreuses figures de division sont visibles). Le doc. 7 prsente les principales caractristiques des cellules cancreuses mtastatiques en culture par rapport des cellules saines : division indfinie (cellules immortelles ), pas dinhibition de la division au contact des cellules voisines (do un empilement des cellules cancreuses), capacit migrer dans les tissus. Les cellules cancreuses mtastatiques au sein de lorganisme prsentent les mmes proprits : prolifration indfinie au sein dune tumeur, absence dinhibition de contact (do une prolifration incontrle) et capacit des cellules migrer et former des mtastases dans les tissus. en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse).
Voir le rsum de lunit 1 page 276.
Thme 5 ChapiTre 2

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Unit

Les bases gntiques des cancers


Connaissances du programme

[pp. 266-267 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations pour identifier lorigine des facteurs de cancrisation (agents mutagnes).

Des modifications accidentelles du gnome peuvent se produire dans des cellules somatiques et se transmettre leurs descendantes. Elles sont lorigine de la formation dun clone cellulaire porteur de ce gnome modifi.

protine (mutation du gne du rcepteur lEGF) soit sa suractivation (mutation du gne RAS). Ces mutations activent la voie des facteurs de croissance, mme en absence de facteur de croissance (doc. 6), et accroissent donc le rythme de division des cellules mutes. linverse, certaines mutations impliques dans le dveloppement dun cancer peuvent se traduire par linactivation dune protine.

Cest le cas de la protine p53 que lon retrouve inactive dans 50 % dune des formes du cancer du poumon. Dans tous les cas, on retrouve dans la grande majorit des cancers plusieurs mutations appartenant lune et/ou lautre des deux catgories.

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse). Voir le rsum de lunit 2, p. 276.

Unit

Conseils et suggestions
La page douverture du chapitre, qui prsente des cellules cancreuses exprimant un gne impliqu dans le dveloppement dun cancer, peut tre utilise comme point de dpart de lunit pour mettre en vidence des modifications gntiques spcifiques aux cellules cancreuses. Cette unit vise montrer que les proprits spcifiques des cellules cancreuses rsultent de modifications gntiques, que lapparition dun cancer peut tre favorise par certains agents mutagnes (comme les UV) et, enfin, que plusieurs types de mutations sont susceptibles de saccumuler au sein dun clone de cellules cancreuses. Les lves ont dj tudi en classe de Seconde et dans le premier thme du programme de Premire S la notion de mutation ainsi que les diffrentes tapes du cycle cellulaire. Lexercice 6 de la p. 281 permet dapprofondir ces notions et dtablir le lien entre lapparition dune nouvelle mutation, la modification des proprits des cellules cancreuses et le stade davancement dun cancer. Cet exercice montre clairement que la cancrisation est un processus multi-tapes rsultant de laccumulation progressive de plusieurs mutations au sein des cellules. On dveloppe ici le rle du gne p53 dans lapparition de certains cancers mais de nombreux autres gnes peuvent tre tudis (pRB pour le rtinoblastome, par exemple) Le professeur pourra garder lesprit quil existe deux grands types de mutations impliques dans les cancers : celles qui conduisent linactivation dun gne bloquant normalement le cycle cellulaire (gnes suppresseurs de tumeurs : p53, pRB, etc.) et celles qui conduisent la suractivation dun gne impliqu normalement dans la progression dans le cycle cellulaire (oncognes RAS, rcepteur lEGF, MDM2, etc.).

Doc. 2 et 3 (Mettre en relation des donnes et interprter des


rsultats exprimentaux). Lanalyse du doc. 2 et du doc. 3 montre quil existe 2 types de rponse cellulaire en fonction de la dose dUV (un agent mutagne) : Lorsque des cellules en culture sont irradies par une dose moyenne dUV (comprise entre 10 et 20 J. m-2), les cellules ne se divisent plus et elles rparent leur ADN : on constate en effet une augmentation de lexpression des gnes p21 (un gne bloquant le cycle cellulaire) et p53R2 (un gne de rparation de lADN). Lexpression de ces deux gnes est induite par la protine p53 (doc. 3) qui saccumule dans les cellules exposes aux UV (doc. 2). - Lorsque des cellules en culture sont irradies par une forte dose dUV (comprise entre 20 et 50 J. m-2), beaucoup de cellules meurent (le pourcentage de cellules mourantes est dautant plus fort que la dose dUV est importante). Cette mort cellulaire est galement induite par laccumulation de la protine p53 (doc. 3). Ces deux rponses induites par p53 suite une irradiation par les UV empchent laccumulation de mutations dans les cellules dans la mesure o p53 induit une rparation de lADN (pour de faibles doses dUV) ou induit directement la mort cellulaire lorsque le nombre de mutations accumules est trop important (pour de fortes doses dUV). Pour ces raisons, la protine p53 prserve lintgrit du gnome.

Cancers et agents mutagnes


Connaissances du programme

[pp. 268-269 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations pour identifier lorigine des facteurs de cancrisation (agents mutagnes). Comprendre les causes multiples pouvant concourir au dveloppement de certains cancers (cas des cancers pulmonaires) et identifier des mesures de prvention possibles.

Des modifications somatiques du gnome surviennent par mutations spontanes ou favorises par un agent mutagne. La connaissance de la nature des perturbations du gnome responsables dun cancer permet denvisager des mesures de protection (vitement des agents mutagnes).

Conseils et suggestions
Lobjectif de cette unit vise dgager la notion de facteur de risque du cancer. Dans le chapitre prcdent (chapitre 1, unit 4, pp. 254-255), les lves ont tabli que la possession dallles dfavorables constituait un facteur de risque pour le diabte de type II. Dans cette unit, ils auront montrer que des agents qui perturbent lexpression du gnome en provoquant des mutations, favorisent la cancrisation. Ainsi, un comportement risque peut modifier le gnome de certaines cellules et dclencher une pathologie. Lexemple choisi est celui du benzopyrne de la fume de cigarettes, impliqu dans les cancers pulmonaires. Lexemple du benzne peut tre abord grce lexercice 5 p. 281. Des ressources complmentaires dintrt peuvent tre mobilises, comme celles publies sur le site www.tabac-info-service.fr.

Doc. 3 et 4 (Sinformer). Le doc. 3 rappelle le flau que constitue le tabagisme des jeunes : dbuter la cigarette vers 15 ans implique un risque lev de cancer du poumon se dclenchant vers 45 ans seulement. Le cancer du poumon est alors une cause de mortalit non ngligeable. Au cours des annes 2005 2010, le taux de fumeurs quotidiens a augment dans la population gnrale. Seul le pourcentage de jeunes filles fumeuses est plus faible en 2010 que cinq ans auparavant. Les pouvoirs publics peuvent donc influencer directement lvolution de la mortalit par des campagnes de prvention, notamment auprs des jeunes. Doc. 5 (Sinformer et raisonner). Le doc. 5 rappelle que la

Doc. 2 et 7 (Sinformer et raisonner). Le doc. 7 prcise que

lapparition dun cancer rsulte de laccumulation de plusieurs mutations affectant certains systmes de rgulation cellulaire (dont celui impliquant le gne p53, qui conduit soit llimination des cellules cancreuses soit la rparation de lADN). En permettant la rparation des mutations spontanes ou induites, la protine p53 protge ainsi les cellules de la cancrisation.

Exploitation des documents par les activits

Doc. 1 et 2 (Sinformer et mettre en relation des documents).


Le doc. 1 rvle la grande similitude de lvolution du taux de tabagisme et de celle du taux de mortalit par cancer du poumon. Le doc. 2 prouve que le tabagisme est un facteur de risque de dclenchement du cancer, avec un effet de la dose : le risque relatif augmente avec la consommation. On peut souligner labsence de seuil : ds la premire cigarette, le risque augmente. Le doc. 1 rvle un dcalage entre laugmentation de la quantit de cigarettes consommes et la mortalit denviron 30 ans. La baisse du tabagisme chez lhomme, enregistr depuis 1980 saccompagne dune baisse actuelle de la mortalit masculine. Chez les femmes, la tendance est encore malheureusement la hausse, le taux de tabagisme nayant dcru que rcemment.

Exploitation des documents par les activits

Doc. 4 A 7 (Sinformer et raisonner). Une premire classe

fume de cigarettes contient de nombreuses substances nocives dont le benzopyrne. Sa transformation dans lorganisme conduit un produit hautement ractif, le BPDE, qui ragit avec la guanine. Celle-ci sapparie plus avec une cytosine, mais avec une adnine. On constate alors quen deux tapes de rplication, la modification dun des brins de lADN conduit au remplacement dune paire G/C par une paire T/A. Cette modification de la squence en nuclotide est bien une mutation. Le benzopyrne est donc lgitimement considr comme un agent mutagne.

Doc. 1 (Analyser et interprter des rsultats exprimentaux).

On constate que les souris transgniques super-p53 (qui expriment une copie supplmentaire du gne p53) sont moins sensibles la cancrisation que les souris sauvages (40 semaines aprs lexposition des souris un agent cancrigne, seules 30 % des souris super-p53 sont mortes, alors que 90 % des souris sauvages sont mortes). On en dduit donc que le gne p53 protge les cellules de la cancrisation.

de mutations est illustre par le doc. 4 qui prsente une partie du caryotype dune cellule cancreuse (issue dun liposarcome, un cancer du tissu adipeux). On y observe un chromosome gant surnumraire comportant 50 copies du gne MDM2. Ici, la cancrisation rsulte dune augmentation du nombre de copies de ce gne qui code pour une protine dgradant p53. Cette cellule, par la suractivation de la protine MDM2, a donc acquis la capacit de contourner le systme de rgulation impliquant p53. Le doc. 5 montre quon a retrouv dans certains cancers du poumon dautres mutations de ce type, qui conduisent soit la surexpression dune

Doc. 5 A 7 (Sinformer et raisonner). Lobjectif est ici de dmontrer que le benzopyrne est effectivement cancrigne. Le doc. 5 montre que le benzopyrne est mutagne. Plus prcisment, le doc. 7 montre quune exposition au benzopyrne accrot le taux de guanines modifies, l encore dose dpendante. Le doc. 6 rvle quune exposition au benzopyrne augmente la probabilit de dvelopper une tumeur, avec un effet de la dose [N.B. : Dans lexprience originale, il sagit de tumeurs hpatiques en rponse

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Thme 5 ChapiTre 2

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SVT 1reS ditions Belin 2011

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du benzopyrne introduit dans la nourriture.] On peut donc en conclure que le benzopyrne induit des modifications des guanines et quau-del dun certain seuil, le nombre de guanines modifies est assez lev pour aboutir la formation de tumeurs. Deux explications sont possibles, non exclusives : avec trop de guanines modifies, les systmes de rparation de lADN sont dbords et des mutations apparaissent ; partir dun seuil de concentration de benzopyrne, donc de modification de guanines, il y a suffisamment daltrations du gnome pour que le dveloppement cellulaire soit anormal, de type tumoral.

mutagne du benzopyrne. La spcificit des cancers du poumon chez les fumeurs rside donc dans la frquence leve de mutations pouvant rsulter de labsorption du benzopyrne.

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse).

Doc. 8 Les cellules de cancer du poumon, issues de patients

fumeurs comme non-fumeurs, prsentent des mutations du gne p53 qui peuvent conduire la cancrisation (voir p. 266). Ces mutations sont de type G-C > T-A, dont on sait quil correspond leffet

La fume de cigarette contient de nombreuses substances nocives. La mieux caractrise est le benzopyrne qui est transform en BPDE dans lorganisme. Celui-ci est un agent mutagne qui altre lexpression gntique. Le gne p53 fait partie des gnes altrs par le BPDE. Il en rsulte une accumulation facilite de mutations dans tout le gnome : celles qui permettent la survie et la prolifration favorisent la cancrisation et le dveloppement des cellules qui les portent. Les cellules du poumon tant les plus exposes au benzopyrne de la fume de cigarette, le tabagisme dclenche tout particulirement des cancers dans cet organe.

tiront un cancer que chez 0,08 % des femmes infectes (20 % des 0,4 % prcdents). On note que le cancer ne se dclenche que 15-20 ans aprs linfection. Le mcanisme de la cancrisation peut tre voqu en utilisant le doc. 3 de la p. 266 : la destruction de la protine p53 par des protines virales confre aux cellules prsentant des lsions la capacit de prolifrer sans rparation, donc en accumulant des anomalies.

Doc. 3 et 4 (Sinformer et raisonner). La date de vaccination

est justifie par limpratif de protger les jeunes filles avant toute exposition un risque dinfection chronique, cest--dire avant les premiers rapports sexuels (doc. 3), Le premier rapport sexuel nayant que trs rarement lieu avant lge de 15 ans (doc. 4), la vaccination chez les jeunes filles est donc recommande ds lge de 14 ans. Elle peut tre faite dans les quelques annes qui suivent, au moment de lexposition au risque.

trs grande taille. De plus, les modlisations du doc. 6 montrent que la vaccination devrait fortement rduire, mais sans les faire disparatre totalement, les infections par HPV16/18. En parallle, lincidence de cancers du col de lutrus devrait chuter et tre divise par un facteur 4 5, mais l encore sans totalement sannuler. La vaccination est donc efficace lchelle de la population, mais ne permet de protger lensemble des individus. Un dpistage de contrle est donc indispensable en complment de la vaccination. Un cancer sera dautant mieux soign quil est diagnostiqu tt.

Unit

Doc. 1, 5 et 6 (Sinformer et raisonner). La campagne laffirme


Cancers et virus
Connaissances du programme
[pp. 270-271 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations pour identifier lorigine des facteurs de cancrisation (infections virales).

(doc. 1) : le dpistage du cancer de lutrus par frottis est indispensable que lon soit vaccine ou non. Le doc. 5 montre quil est facile de reprer des cellules prcancreuses et donc dintervenir avant lapparition de toute tumeur. On repre notamment dans le clich du bas quelques trs grosses cellules, prsentant des noyaux de

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse). La plupart des cancers du col de lutrus sont associs une infection chronique par les HPV 16 ou 18. Ces virus sont contracts lors des premiers rapports sexuels et dbouchent dans de trs rares cas et aprs 15-20 ans sur des cancers dont un tiers des patientes dcdent. Ces virus favorisent la cancrisation en altrant notamment le fonctionnement de la protine p53. La vaccination contre HPV16 et 18 assure une trs bonne protection contre ces infections et surtout contre lapparition du cancer du col de lutrus. Cette vaccination, associe un dpistage rgulier permettra terme une diminution de lincidence de cancers de lutrus et de la mortalit associe.

Des modifications somatiques du gnome surviennent par mutations spontanes ou favorises par un agent mutagne. Dautres sont dues des infections virales. La connaissance de la nature des perturbations du gnome responsables dun cancer permet denvisager des mesures de protection (surveillance, vaccination).

Unit

Comprendre limportance, en matire de sant publique, de certains virus lis la cancrisation (hpatite B, papillomavirus) et connatre les mthodes de prvention possibles.

Le mode d'action des antibiotiques et leurs limites


Connaissances du programme

[pp. 272-273 du manuel de llve]

Conseils et suggestions
Aprs lunit 3, consacre aux agents mutagnes, lunit 4 aborde la question des perturbations gnres par une infection virale chronique. Le choix des papillomavirus et des cancers du col de lutrus a t guid par lactualit des campagnes de prvention de ce cancer. la diffrence de la vaccination contre lhpatite B, qui fait dsormais partie du calendrier vaccinal (une grande proportion des lves de lyce a t vaccine ds lenfance), la vaccination contre les papillomavirus responsables de cancers de lutrus est rcente et facultative. Les jeunes filles lves de Premire sont directement concernes par ces campagnes de vaccination. Il est intressant de saisir loccasion de discuter du lien entre virus et cancer et du raccourci vaccin anti-cancer souvent voqu propos de ce vaccin. On pourra galement rappeler lintrt de la vaccination contre lhpatite B, au moyen dinformations publies sur le site www.hepatites-info-service.org. Il est aussi possible de construire des exercices avec des documents trs comparables ceux prsents dans cette unit, en utilisant les donnes pidmiologiques prsentes sur le site de lINVS (www.invs.sante.fr). Des vues de cellules HeLa en culture, issues de mtastases dun cancer du col de lutrus, sont galement disponibles sur le site www.exploratorium.edu/imaging_station/research/cancer/story_ cancer4.php. Elles enrichiront lobservation du doc. 5.
78 Thme 5 ChapiTre 2

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Concevoir et mettre en place un protocole permettant de montrer la sensibilit de micro-organismes diffrents antibiotiques. Recenser, extraire et organiser des informations pour identifier la sensibilit ou la rsistance de micro-organismes diffrents antibiotiques.

La question du dpistage du cancer est approfondie par latelier Enqute, p. 285, qui prend appui sur deux exemples de cancers au sujet desquels il est utile dinformer les lves : le cancer du sein et celui de la peau.

Des mutations provoquent une variation gntique dans les populations de bactries. Parmi ces variations, certaines font apparatre des rsistances aux antibiotiques.

Exploitation des documents par les activits

Conseils et suggestions
Pour aborder cette unit, il peut tre utile de rappeler que certaines maladies infectieuses sont causes par des bactries. Une catgorie de molcules (dorigine naturelle ou synthtique) permet de lutter spcifiquement contre les bactries : les antibiotiques. Lobjectif de cette unit est de montrer que certaines bactries peuvent tre rsistantes aux antibiotiques (doc. 1 4), et que cette rsistance est dorigine gntique (doc. 5 6). Lantibiogramme du doc. 1 peut tre ralis avec une culture dEscherichia coli si on dispose dun incubateur. On peut souligner cette occasion que ce type dapproche est mis en uvre par le corps mdical pour proposer un traitement adapt aux patients dont linfection est rsistante aux antibiotiques utiliss en premire intention (voir lexemple du doc. 4). Ltude des doc. 2 et 3 permet de visualiser leffet dun antibiotique aux chelles cellulaire et molculaire, sans que ces informations soient retenir.

Doc. 1 A 3 (Sinformer et mettre en relation des documents).

Laffiche et sa lgende (doc. 1) rappellent que le cancer du col de lutrus est le deuxime cancer fminin. Sa frquence dans ses phases prcoces en fait un cancer souvent diagnostiqu tard, compromettant lefficacit des traitements.

Doc. 2 et 3 (Mettre en relation des donnes et interprter des rsultats exprimentaux). Le doc. 2 souligne lassociation trs forte de deux papillomavirus (HPV16 et 18) et de cancers du col de lutrus : plus de 80 % de ces cancers se dveloppent chez des femmes ayant t infectes par lun de ces virus. Linfection constitue donc un facteur de risque fort. Le doc. 3 peut permettre de rassurer les jeunes filles : il rappelle que linfection par HPV16 ou 18 naboutit que rarement un cancer. Seulement 2 % (10 % des 20 % infectes) des femmes prsenteront une infection chronique, qui dbouchera sur des lsions prcancreuses chez 0,4 % (20 % des 2 % prcdents) et nabou-

Lors de ltude du doc. 4, on peut faire remarquer que lexistence de bactries rsistantes aux antibiotiques a t observe des les premires annes dutilisation des antibiotiques (voir aussi les complments pdagogiques numriques). Pour analyser le doc. 6, les lves devront faire appel leurs connaissances sur lexpression du patrimoine gntique (voir le thme 1). Il pourra tre utile de leur rappeler que le gnome des bactries, comme celui des cellules eucaryotes, sexprime sous forme de protines.

Exploitation des documents par les activits

Doc. 1 (Sinformer partir dun texte et dune photo). Lantibiotique diffuse partir du disque, donc sa concentration dcrot en sloignant du disque. Lantibiotique le plus efficace est

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Thme 5 ChapiTre 2

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celui qui empche la multiplication bactrienne la plus faible concentration, cest--dire celui qui cre la plus grande zone dinhibition (ici le c). Les antibiotiques a et b sont un peu moins efficaces, le d est inefficace.

Doc. 2 et 3 (Sinformer partir dune photo et dun schma ; mettre en relation des donnes). Daprs les documents 2 et 3, la pnicilline empche la formation de la paroi bactrienne, ce qui induit un clatement des bactries. Doc. 4 (Sinformer partir dun texte et formuler une hypothse ). Au cours des 3 premiers jours du traitement, la majorit des bactries est dtruite par la streptomycine. Linfection rgresse. Au bout de 3 jours de traitement, les symptmes rapparaissent, suggrant que des bactries sont rsistantes la streptomycine et continuent se multiplier en prsence de lantibiotique Il faut donc avoir recours un autre antibiotique pour les dgrader. Ces bactries rsistantes taient prsentes ds le dbut de linfection (moment du prlvement), mais ne se sont dveloppes quaprs lutilisation de lantibiotique.

anctre est sensible aux 4 antibiotiques. La souche drive lest beaucoup moins. Les bactries de cette souche ont donc acquis un nouveau caractre au cours des divisions : on peut supposer que ce nouveau caractre est confr par une mutation apparue au cours de la culture.

Doc. 6 (Sinformer partir dun tableau et de sa lgende). La sensibilit de E. coli est corrle la squence de sa beta-lactamase. Le changement dans la squence en acides amins de cette protine peut sexpliquer par un changement de squence (mutation) du gne correspondant (cf. chapitre 3, unit 1) . Dans cet exemple, le changement dun seul acide amin (Arg en Ser en position 164) confre vraisemblablement lenzyme la capacit de dgrader lantibiotique (la ceftazidime). La rsistance des bactries aux antibiotiques repose donc sur une variation de leur gnome.

tion dantibiotiques et rsistance des pneumocoques lchelle europenne (doc. 1), on observe en France une diminution de la sensibilit (donc une augmentation de la rsistance) diffrents antibiotiques chez la bactrie commune E. coli (doc. 2). Cette augmentation de rsistance est rapide : visible en quelques annes seulement. Daprs le doc. 3, ces faits peuvent tre relis : si les antibiotiques ne sont pas utiliss suivant les indications de la notice leur efficacit est attnue.

Doc. 5 (Pratiquer un raisonnement scientifique). Comme pour


le doc. 1, la sensibilit un antibiotique est corrle au diamtre de la zone dinhibition de croissance sur lantibiogramme. La souche

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse). Les antibiotiques limitent la multiplication des bactries, en dtruisant par exemple leur paroi (cest le cas de la pnicilline). Un antibiotique peut devenir inefficace car des mutations dans le gnome de bactries initialement sensibles peuvent les rendre rsistantes cet antibiotique.

Doc. 3 (Communiquer dans un langage scientifiquement appropri). Comme vu dans lunit prcdente, les antibiotiques empchent la multiplication des bactries ; ils nont donc pas deffet sur dautres organismes pathognes comme les virus. Ils doivent tre seulement utiliss pour lutter contre les infections bactriennes. Laugmentation de la rsistance bactrienne, provoque par lutilisation massive dantibiotiques, a pour consquence de diminuer leur efficacit, donc de rendre plus difficile la gurison des maladies bactriennes. Il est donc ncessaire de limiter la consommation dantibiotiques, en veillant ne pas les utiliser sans que cela soit mdicalement justifi et prconis par un mdecin.

diffrentes cultures. Lhypothse A (les mutations sont induites par lenvironnement) est donc rejete. Lhypothse B (les mutations sont alatoires) est retenue : en labsence dantibiotiques, des mutations apparaissent spontanment chez certaines bactries de la population ; certaines de ces mutations confrent la rsistance un antibiotique. En prsence de cet antibiotique, seules les bactries porteuses de la mutation survivent et se multiplient. Elles deviennent alors de plus en plus abondantes dans la population. Lantibiotique est donc un agent de slection de certains individus rsistants dans une population : son utilisation fait croire le taux de rsistance bactrienne.

en conclusion (Communiquer en rdigeant une synthse).

Doc. 4 et 5 (Mettre en uvre un raisonnement scientifique). Les rsultats exprimentaux (doc. 5) montrent quil napparat pas le mme nombre de colonies de bactries rsistantes dans les

Un antibiotique slectionne les bactries qui lui sont rsistantes, ce qui accrot le taux de rsistance dans une population bactrienne. Cet antibiotique est alors moins efficace. Lutilisation inapproprie des antibiotiques (pour des maladies non bactriennes, ou par non-respect de la dose prendre ou de la dure de traitement) est donc dangereuse lchelle dune population. Inversement, une utilisation raisonne des antibiotiques (notamment par une ducation sanitaire de la population) peut permettre de contenir lapparition des bactries rsistantes.

Unit

Le dveloppement de la rsistance aux antibiotiques


Connaissances du programme

[pp. 274-275 du manuel de llve]

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Comprendre, sur un exemple, lapplication du raisonnement volutionniste en matire mdicale.

Lapplication dun antibiotique sur une population bactrienne slectionne les formes rsistantes et permet leur dveloppement. Lutilisation systmatique de traitements antibiotiques peut augmenter la frquence des formes rsistantes par slection naturelle. Pistes. La rsistance aux antibiotiques, les infections nosocomiales.

exerCiCes du thme 5
Les corrigs des exercices des rubriques valuer ses connaissances et S'entraner avec un exercice guid se trouvent la fin du manuel (p. 328). rgulire a deux effets bnfiques par rapport lobsit : pour un mme nombre dallles risque, lIMC est plus faible dune part, laugmentation du nombre dallles risque est associe une augmentation plus lente de lIMC que chez les individus sdentaires. 3. Le doc. 2 montre que le risque de diabte de type 2 augmente de manire exponentielle avec lIMC, pour dpasser 80 % pour un IMC au-del de 35 kg.m-2. Lobsit est donc un facteur de risque pour le diabte de type 2. Lobsit est associe des facteurs de risques gntiques et des facteurs comportementaux (doc. 1). Le diabte de type 2, daprs ces donnes est donc caus par une interaction entre facteurs gntiques (gnes de prdisposition) et environnementaux. Par ailleurs, lobsit est galement favorise par des rgimes alimentaires inadapts lactivit physique. On sait aussi quil existe des gnes de prdisposition au diabte de type 2. On retrouve donc cette double composante, gntique et environnementale, dans le dclenchement de lobsit et du diabte de type 2.

Conseils et suggestions
Dans cette unit sont abordes les causes de laugmentation de frquence de bactries rsistantes ainsi que ses consquences pour la sant humaine. Les doc. 1, 2 et 3 doivent faire poser lhypothse dune corrlation entre lutilisation dantibiotiques et la variation du taux de rsistance des bactries. On peut proposer que cette corrlation soit due un lien de cause effet. Cette hypothse est confirme par le doc. 5. On peut souligner ici que les mcanismes mis en jeu au niveau des populations bactriennes sont universels (apparition de nouveaux caractres par des mutations spontanes alatoires, puis slection des individus ayant le phnotype le plus favorable en fonction des conditions du milieu). Le phnomne de la rsistance bactrienne aux antibiotiques sexplique bien par un raisonnement volutionniste. Le doc. 4, par ailleurs, met en relief limportance historique de lanalyse de ces questions chez les micro-organismes.
78 Thme 5 ChapiTre 2

Dans loptique de lducation la sant, les doc. 1, 2, 3 et lexercice 4 sont loccasion de souligner quun comportement individuel de prise dantibiotique sans prescription mdicale peut avoir des consquences graves lchelle de la population. En prolongement, lexercice 8 illustre un mcanisme qui contribue augmenter la frquence de bactries rsistantes : le transfert de gnes entre bactries.

Chapitre 1

[pp. 260-262 du manuel]

les effets de laCtivit physique sur lobsit et le diabte de type 2

Mettre en relation des informations et raisonner. Rponses attendues : 1. Un gne de prdisposition est un gne dont certains allles augmentent la probabilit de dvelopper une maladie. Un allle risque est un allle dun gne de prdisposition qui confre un risque plus lev de dvelopper une maladie. 2. Les facteurs gntiques se caractrisent par lexistence dallles risque prsentant un effet cumulatif : plus un individu porte dallles risque, plus son IMC augmente. Cet effet est indpendant de la pratique dune activit physique rgulire ou non. Ds 6 allles risque, lIMC est suprieur la limite dfinissant lobsit. La comparaison des deux courbes montre que lactivit physique

Exploitation des documents par les activits


Doc. 1 (Mettre en relation des donnes). La comparaison de la carte et du graphique montre que plus un pays est consommateur dantibiotiques, plus la proportion de pneumocoques rsistants est leve. Il y a donc une corrlation entre la consommation dantibiotiques et la proportion de pneumocoques rsistants. Doc. 1 A 3 (Sinformer pour tablir une relation entre diffrents documents). En plus de la corrlation entre consomma-

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Thme 5 ChapiTre 2

SVT 1reS ditions Belin 2011

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la reCherChe dun mdiCament Contre la muCovisCidose

Sinformer et raisonner. Rponses attendues : 1. La fluorescence rouge, donc la protine complte, est absente dans toutes les coupes sauf pour la dose la plus leve de PTC124 (60 mg). Dans ce cas, les cellules de souris ont donc permis lexpression du transgne humain et la synthse de la protine complte. 2. La molcule permet dobtenir une scrtion de la protine humaine complte, donc de saffranchir du codon stop prmatur. La protine est synthtise dans le bon organe et dtecte dans le canal o le mucus est scrt. On peut donc penser qu une dose de 60 mg, le PTC124 permet de corriger le dfaut de fonctionnement du gne CFTR des patients atteints de mucoviscidose. 3. Ce traitement ne corrige que le dficit fonctionnel, pas le dfaut gntique : il faudrait donc suivre ce traitement vie, ce qui implique des risques dallergies ou dintolrance, ou de risques de rsistance au traitement.

quun enfant reoive deux allles muts est de soit ou 25 %. tre le vrai jumeau dun malade implique un risque de 100 % de dvelopper la mucoviscidose. 3. Dans le cas de la mucoviscidose, un gne est impliqu : la possession ltat homozygote de lallle mut entrane coup sr lapparition de la maladie. Pour le diabte de type 2, les frquences de la maladie dans les situations 3 et 4 sont plus faibles que pour la mucoviscidose. Il nexiste donc pas un seul gne dont la possession dune version alllique dterminerait coup sr la maladie. On sait en effet quil existe un grand nombre de facteurs risques, certains gntiques et conditionns par des allles risque, qui favorisent (faiblement en gnral) lapparition dun diabte de type 2. On doit donc parler de gnes de prdisposition au diabte de type 2.

un

modle pour tudier le CanCer de lsophage

Pratiquer une dmarche scientifique. Rponses attendues : 1. Le dpt sur un pithlium sophagien reconstitu in vitro de cellules cancreuses prleves chez un malade atteint dun cancer de lsophage conduit aprs plusieurs jours de culture une prolifration des cellules sempilant sur plusieurs couches et une invasion de lpithlium reconstitu. Les cellules cancreuses du clich n 1 prsentent donc les proprits suivantes : elles prolifrent de manire indfinie (ce sont des cellules immortelles ), leur prolifration nest pas inhibe par le contact (elles sempilent sur plusieurs couches de manire incontrle) et elles sont capables de migrer dans les tissus voisins. 2. Les cellules de lpithlium sophagien exprimant la seule mutation n 1 ne prolifrent pas beaucoup (elles sempilent peu et sont inhibes par le contact avec les cellules voisines) et nenvahissent presque jamais lpithlium reconstitu [NB : la mutation n 1 conduit lexpression du gne de la tlomrase, un gne conduisant limmortalisation des cellules]. Les cellules exprimant la fois les mutations n 1, 2 et 3 prsentent en revanche les mmes proprits que les cellules cancreuses du patient atteint dun cancer de lsophage et prsentent un caractre invasif plus marqu. 3. Le clich 2 montre quune seule mutation (n 1) nest pas suffisante pour dclencher un cancer. La comparaison avec le clich 3 montre que le cancer de lsophage apparat lorsque les cellules pithliales accumulent plusieurs mutations . Laccumulation de nouvelles mutations (mutation n 1 puis mutations n 2 et 3) se traduit par lapparition progressive des caractristiques des cellules cancreuses : la mutation n 1 conduit une simple immortalisation des cellules alors que les mutations 2 et 3 conduisent une prolifration incontrle des cellules cancreuses et lacquisition de leur capacit migratoire.

Chapitre 2

[pp. 281-282 du manuel]

vent les rsultats de ces expriences (linhibition de ces gnes suffit limiter la prolifration induite par linfection par HPV16). On peut proposer que les protines du virus activent lexpression du gne c-fos par les cellules infectes et que c-fos favorise la prolifration [N.B. : c-fos est un gne activ par les facteurs de croissance, codant une protine effectivement implique dans la progression dans le cycle cellulaire]. 3. Ces ARN anti-sens ont comme effet de rduire la prolifration cellulaire. Ils peuvent donc tre utiliss pour freiner voire stopper le dveloppement dune tumeur. Ils ne dclenchent toutefois pas de rduction de la tumeur et ne constituent donc pas eux seuls un traitement efficace. Il serait donc ncessaire de leur adjoindre un traitement dtruisant les cellules (chimiothrapie, rayons X, chirurgie) ou compter sur une rponse immunitaire qui dtruirait les cellules tumorales.

baCtries

rsistantes et infeCtions nosoComiales

un

problme de sant publique : les baCtries multirsistantes

le rsultat dun essai de thrapie gnique

Analyser des donnes et formuler une hypothse. Rponses attendues : 1. Le principe est dintroduire dans les cellules une version normale du gne qui est totalement dficient chez les patients atteints de mucoviscidose. Comme le vecteur est un virus qui infecte normalement les cellules des bronches o le gne CFTR est particulirement important, on peut esprer restaurer lexpression de la protine CFTR au bon endroit et donc pallier le dfaut gntique des patients. 2. Trois patients atteignent les 5 % de lexpression normale : le patient 1 pour 108 virus inhals, les patients 1 et 2 pour 109 virus inhals. 3. On constate que cette technique ncessite des doses leves de virus, induisant des risques dintolrance du traitement (allergie). De plus, tous les patients ne rpondent pas aussi bien au traitement. Enfin, leffet du traitement nest pas durable et il faudrait envisager des traitements rpts tout au long de la vie. Le renouvellement rapide de lpithlium bronchique explique la faible dure defficacit du traitement : les virus, rendus inoffensifs, sont limins avec les cellules mortes de lpithlium. Il faut donc rgulirement rintroduire de nouveaux virus.

Rponses attendues : 1. La comparaison des taux dinfections nosocomiales et de bactries rsistantes (doc. 1) montre que ces derniers sont corrls. On peut donc supposer que les bactries rsistantes aux antibiotiques sont une cause des infections nosocomiales. 2. En milieu hospitalier, les patients sont soumis de nombreux traitements antibiotiques pour soigner leur pathologie (si elle est dorigine bactrienne) ou les protger contre dventuelles infections. Le staphylocoque dor, prsent naturellement sur la peau et dans les voies nasales, est donc fortement soumis laction de ces antibiotiques en milieu hospitalier. Ces traitements slectionnent donc des formes de staphylocoques dors ayant acquis une rsistance par mutation spontane. La frquence de ces rsistants est donc plus importante dans les tablissements de sant. De plus, ces staphylocoques dors, parce quils sont prsents sur la peau, peuvent pntrer dans le corps lors dune opration si la peau na pas t bien dsinfecte. Ils peuvent galement remonter par les conduits naturels et provoquer des infections (notamment respiratoires). Enfin, le personnel soignant, qui soccupe de nombreux malades, peut tre un vecteur des staphylocoques dors.

Sinformer et raisonner. Rponses attendues : 1. Daprs le doc. 2, la concentration minimale inhibitrice de trois antibiotiques (ampicilline, piperacilline et cefotaxime) est trs leve pour la souche 05-560 de K. pneumoniae. Celle-ci est donc rsistante ces trois antibiotiques : il est justifi de la qualifier de souche multirsistante. 2. Selon le doc. 2, E. coli seule nest rsistante aucun antibiotique test. Aprs incubation dune souche dE. coli avec la souche 05-560 de K. pneumoniae, la concentration minimale inhibitrice de lampicilline, la piperacilline et la cefotaxime crot considrablement. On peut alors supposer quil y a eu un transfert de gne confrant la rsistance ces antibiotiques entre les 2 souches bactriennes. Le doc. 1 permet de proposer un mcanisme pouvant expliquer ce phnomne : au cours du processus de conjugaison, par lequel des bactries changent des gnes, E. coli recevrait de K. pneumoniae des gnes de rsistance aux 3 antibiotiques.

la

reCherChe dun traitement du CanCer du Col de lutrus

Objectif Bac

[p. 283 du manuel de llve]

Pratiquer une dmarche scientifique. Rponses attendues : 1. Dans le cas tmoin (doc. 1), on constate que le nombre de cellules reste constant : soit elles ne prolifrent pas, soit la prolifration est compense par une mort cellulaire. Pour les cellules infectes, leur nombre augmente : elles prolifrent donc plus quelles ne meurent et leur population saccrot. Pour les cellules infectes, le traitement par des ARN anti-sens conduit une prolifration plus faible : linhibition de lexpression du gnome viral fait dcrotre la prolifration de prs de 60 %, celle de lexpression du gne c-fos de prs de 45 %. Le traitement des cellules infectes par ces ARN anti-sens attnue donc le phnotype tumoral. 2. Linfection par HPV16 stimule la prolifration des cellules. SI ces cellules possdent ou acquirent des anomalies les rendant immortelles et invasives, on assiste une cancrisation. La stimulation de la prolifration ncessite lexpression du gnome viral et de gnes cellulaires comme celui codant la protine c-fos : cest ce que prou-

les Causes dune maladie CardiovasCulaire: lathrosClrose


Rponse attendue : Le doc. 1 est une photographie montrant une plaque dathrome dans une artre. Le doc. 2 est un graphique reprsentant le taux de mortalit due lathrosclrose dans diffrentes populations en fonction de la part dacides gras saturs prsents dans leur rgime alimentaire. On constate que plus la part dacides gras saturs dans le rgime alimentaire est leve, plus la mortalit par athrosclrose est leve (par exemple, un peu moins de 100 morts/10 000 hommes/10 ans avec 3 % dacides gras saturs, mais autour de 300 morts/10 000 hommes/10 ans avec 19 % dacides gras saturs). Le rgime alimentaire, donc le mode de vie, semble donc influencer le dveloppement de la maladie coronaire.

exposition

au benzne et risque de CanCer

Sinformer et formuler une hypothse. Rponses attendues : 1. Le risque relatif augmente avec la dose de benzne, particulirement au-del de 10 ppm.an-1. Lexposition au benzne est donc un facteur de risque de dclenchement de cancers des cellules sanguines. On peut proposer daprs ces donnes que le benzne est un agent cancrigne. 2. Comme pour le benzopyrne du tabac, on peut expliquer cet effet cancrigne par la transformation du benzne en composs oxyds trs ractifs (doc. 1). Ces drivs sont mutagnes ou peuvent altrer la structure des chromosomes. On peut proposer que ces mutations, partir dun certain seuil, altrent le fonctionnement cellulaire en favorisant limmortalisation et la prolifration des cellules.

linfluenCe de lhrdit dans le Cas de la muCovisCidose et du diabte de type 2

Sinformer et raisonner. Rponses attendues : 1. Le tableau 1 montre que certaines familles, dont lun des parents au moins ou lun des enfants dveloppe la maladie avant 50 ans prsentent un risque de diabte de type 2 qui est peu prs le double de la prvalence en France. Ces familles, qui se caractrisent par le partage dun patrimoine gntique prsentent donc un facteur de risque. Ce facteur de risque est gntique. 2. Si un frre ou une sur est malade, alors les deux parents sont porteurs sains, htrozygotes pour lallle mut. La probabilit
80 Thme 5 exerCiCes

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Thme 5 ChapiTre 2

SVT 1reS ditions Belin 2011

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Unit

Le doc. 3 est un graphique reprsentant le risque relatif dathrosclrose en fonction des allles du gne APOE possds par les individus. Lallle e3 est pris comme rfrence (risque relatif gal 1). On constate que lallle e2 confre un risque relatif dun peu moins de 0,6 : il diminue donc le risque dathrosclrose. Lallle e4 confre un risque relatif dun peu moins de 1,2 : il augmente donc le risque dathrosclrose par rapport lallle e3. Outre le rgime alimentaire, des facteurs gntiques semblent donc influencer le dveloppement de la maladie coronaire. Le doc. 4 est un tableau dtaillant les interactions entre gnotype et environnement dans le dveloppement de la maladie coronaire. Lallle e3 est toujours pris comme rfrence. Pour un allle donn (e2 ou e4), on constate quun rgime alimentaire riche en graisses

est associ un risque relatif plus lev de maladie coronaire quun rgime pauvre en graisses (de 0,38 0,82 pour lallle e2, 1,11 1,28 pour lallle e4). On note galement que laugmentation du risque cause par le rgime alimentaire est plus importante pour lallle e2 que pour lallle e4. Au vu des donnes, il semblerait que la protection confre par lallle e2 soit surtout valable lorsque le rgime alimentaire est pauvre en graisses. On peut donc conclure que les facteurs gntiques et les facteurs lis au mode de vie agissent tous deux sur le dveloppement de la maladie coronaire. Il semble, de plus, que linteraction entre gntique et mode de vie soit galement considrer pour valuer le risque de dveloppement de cette maladie.

lil au Cerveau : quelques aspeCts de lil au Cerveau : de la vision quelques aspeCts de la vision
Chapitre 1 De la lumire au message nerveux :
le rle de lil
1
Le trajet de la lumire dans lil
Connaissances du programme
Le cristallin est lun des systmes transparents de lil humain. Il est form de cellules vivantes qui renouvellent en permanence leur contenu. Les modalits de ce renouvellement sont indispensables sa transparence. Des anomalies de forme du cristallin expliquent certains dfauts de vision. Avec lge, sa transparence et sa souplesse peuvent tre altres. [pp. 292-293 du manuel de llve]

thme .1.de 6

Capacits et attitudes mises en uvre dans lunit


Recenser, extraire et organiser des informations et/ou manipuler (dissection, maquette et/ou recherche documentaire) pour : localiser et comprendre lorganisation et le fonctionnement du cristallin ; comprendre certains dfauts de vision.

Conseils et suggestions
La page douverture du chapitre peut tre utilise pour aborder la notion dorgane sensoriel et prsenter dil comme un organe sensoriel spcialis dans la rception de stimuli lumineux. Lobjectif de ce chapitre est de comprendre comment lil produit un message nerveux visuel partir dun stimulus lumineux, en envisageant des implications en matire de sant et en associant cette tude une approche volutive permettant de placer lHomme parmi les primates. Lors de cette premire unit, llve est amen comprendre les phnomnes optiques par lesquels une image est focalise sur la rtine ainsi qu dcouvrir le rle et la structure du cristallin. Il est noter que celui-ci nest pas la seule structure oculaire dvier les rayons lumineux : la corne prsente galement un pouvoir de rfraction lev mais nest pas aborde ici faute dtre mentionne dans le programme. La dissection propose (doc. 1) a t ralise sur un il de veau. Elle peut tre mise en uvre sur des yeux de lapin ( se procurer auprs dun boucher). Cette analyse peut tre complte avantageusement par lutilisation du logiciel Lil et la vision de Pierre Perez (voir latelier informatique p. 326), tlchargeable gratuitement sur le site de lAcadmie de Toulouse. De nombreuses informations complmentaires sur la vision et le cerveau sont disponibles sur le site Internet Le cerveau tous les niveaux, de lUniversit McGill de Montral : http://lecerveau.mcgill.ca La comprhension du trajet de la lumire dans lil sappuie sur des notions du programme de physique : optique gomtrique, fonctionnement optique de lil.

Exploitation des documents par les activits

Doc. 1 et 2 (Manipuler, extraire des informations). La structure


dessine en vert sur la modlisation du doc. 2 doit tre transparente pour laisser passer la lumire et doit faire converger cette lumire sur la rtine pour permettre la formation dune image. Elle doit donc possder les caractristiques dune lentille convergente.

Doc. 2 4 (Extraire et organiser des informations partir de

diffrents documents). La dissection de lil (doc. 1) et le schma de coupe sagittale de lil (doc. 2) montrent quil existe dans lil plusieurs milieux transparents traverss par la lumire : la corne, lhumeur aqueuse, le cristallin, lhumeur vitre. Le cristallin a une forme de lentille et, plac sur un texte, a leffet dune loupe (doc. 3) : il se comporte donc comme une lentille convergente. Une anomalie de forme du cristallin (doc. 4) entrane un dfaut de vision. Le cristallin est donc trs vraisemblablement la structure reprsente en vert sur la modlisation du doc. 2.

Doc. 4 A 6 (Sinformer partir dun tableau et de sa lgende).


Plusieurs caractristiques du cristallin contribuent sa transparence : il est constitu de cellules particulires, vivantes mais dpourvues de noyau et dorganites ; ces cellules sont remplies de cristallines, protines solubles prcisment arranges. La courbure du cristallin peut tre modifie grce aux muscles ciliaires, dont ltat de contraction modifie la convergence des rayons lumineux qui le traversent : cest laccommodation, qui permet de former une image nette sur la rtine lorsque lobjet observ est proche. Le cristallin est dformable car il prsente une certaine lasticit, mais conserve sa structure grce ltroite association des fibres cristalliniennes qui le constituent. Au cours du vieillissement (doc. 4 et 6), le cristallin perd de son lasticit, provoquant des difficults daccommodation et une
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