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COURS 3
Prof Thierry BERGHMANS
Institut Jules Bordet
Valérie DURIEUX, PhD
valerie.durieux@ulb.be
Année académique 2020-2021
1. INTRODUCTION
2
QU’EST CE QUE LA MÉDECINE?
3
QU’EST CE QUE LA MÉDECINE?
https://fr.wikipedia.org/wiki/Médecine
4
COMMENT PRATIQUER LA MÉDECINE?
Au lit du patient Théorie
6
FACTEURS IMPLIQUÉS DANS LA
DÉCISION MÉDICALE
Facteur Humain/Psychologique
- Participation du patient ou de
l’entourage à la décision
- Rôle de la psychologie, Choix
d’éléments socioculturels, Preuves
du
d’éthique, de mœurs, de
patient
convictions philosophiques ou
religieuses, de données Expérie
économiques
nce du
praticie Facteur scientifique et
n professionnel
- Basé sur les
connaissances médicales
- Médecin ou équipe
médicale
77
QUE SIGNIFIE « FACTUEL »?
http://www.larousse.fr/dictionnaires/francais/factuel_factuelle/32622
8
DÉFINITION DE LA MÉDECINE FACTUELLE
9
MÉDECINE FACTUELLE: NOUVELLE MODE?
10
RÉDUCTIONNISME OU ÉPIDÉMIOLOGIE
11
MÉDECINE FACTUELLE
12
SACKETT,
BRITISH MEDICAL JOURNAL 1996
13
14
FACTEURS IMPLIQUÉS DANS LA DÉCISION
MÉDICALE
Médecine
Choix factuelle
Preuves
du
patient
15
CE QU’EST ET N’EST PAS LA
MÉDECINE FACTUELLE
16
2. COMMENT RÉPONDRE À UNE
QUESTION SCIENTIFIQUE?
17
Un homme de 22 ans, sans antécédents médicaux spécifiques,
fait une chute à ski.
La radiographie montre une fracture du tibia.
Faut-il réaliser une ostéosynthèse chirurgicale?
18
COMMENT RÉPONDRE À CETTE QUESTION?
http://www.mysteresdumonde.fr/categ/paranormal/96-chamanisme.html
19
20
21
22
COMMENT RÉPONDRE À UNE QUESTION
SCIENTIFIQUE?
1. Formuler la question
– Claire, précise
http://www.mysteresdumonde.fr/categ/paranormal/96-chamanisme.html
23
FORMULER VOTRE QUESTION
Un homme de 22 ans, sans antécédents médicaux spécifiques, fait une chute à ski.
La radiographie montre une fracture du tibia.
Faut-il proposer une ostéosynthèse chirurgicale?
24
COMMENT RÉPONDRE À UNE QUESTION
SCIENTIFIQUE?
1. Formuler la question
– Claire, précise
2. Définir un plan de
recherche
http://www.mysteresdumonde.fr/categ/paranormal/96-chamanisme.html 25
LA STRATÉGIE PICO
26
LA STRATÉGIE PICO
Adulte
P Patient/problème Pas de co-morbidités
Fracture tibia
I Intervention Ostéosynthèse
Plâtre
C Contrôle Immobilisation
Pas d’ostéosynthèse
Guérison de la fracture
Temps jusqu’à guérison
O Objectif Récupération fonctionnelle
Douleur
Coût
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RECHERCHE DE LITTÉRATURE
• Sites (PubMed/Medline …)
• Transformation de l’équation PICO en
termes MeSH
• Utilisation des sites
28
MEDLINE VIA PUBMED
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 29
RECHERCHE AVANCÉE
Recherche
par
champs
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/advanced/
RECHERCHE AVANCÉE
Une recherche sur "Lung cancer"[tiab] ou sur "Lung cancer"[tw] n’aurait pas ramené cet article!
Recherche à l’aide du
thésaurus MeSH
33
RAPPEL : FORMULER LES CONCEPTS
34
LANGAGE COURANT VS CONTRÔLÉ
35
LANGAGE COURANT VS CONTRÔLÉ
Document 3 Document 5
…..cancers……… …..cancers………
Requête : cancer
Document 3 Document 5
…..cancers……… …..cancers………
Requête : cancer*
Document 3 Document 5
…..cancers……… …..cancers………
Document 3 Document 5
…..cancers……… …..cancers………
Requête : "Neoplasms"[Mesh]
Document 3 Document 5
…..cancers……… …..cancers………
Forces
• permet de trouver des articles dont le titre et l’abstract ne
sont pas représentatifs du sujet
• permet de trouver des articles sans abstract
• diminue le bruit documentaire
Faiblesses
• de nombreux articles ne disposent pas (encore) de MeSH
• des articles sont "mal" indexés
• il n’existe pas de MeSH pour tous les concepts
• augmente le silence documentaire
THÉSAURUS MESH
Interrogeable via la MeSH database
42
MESH DATABASE
43
NOTICE DE DESCRIPTEUR
44
NOTICE DE DESCRIPTEUR (SUITE)
Synonymes
et termes
associés
46
VISUALISER LES MESH ATTRIBUÉS
47
EXHAUSTIVITÉ VS PRÉCISION
50
51
3. Comment sélectionner
l’information?
- Quels critères pour choisir une
étude?
52
QUELS CRITÈRES POUR CHOISIR UNE ÉTUDE?
• Type d’étude?
• Niveau de preuve?
• Valeur du journal?
53
TYPE D’ÉTUDE
54
PRINCIPAUX TYPES DE PUBLICATION
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COMMENT RÉPONDRE À UNE QUESTION
SCIENTIFIQUE?
• Etudes rétrospectives
• Etudes de cohorte
1. Formuler la question • Etudes cas-contrôle
• Etudes épidémiologiques
– Claire, précise • Etudes non-interventionnelles
2. Définir un plan de • Etudes interventionnelles
– Etudes de phase I
recherche – Etudes de phase II
3. Choisir le design d’étude – Etudes de phase III
– Etudes de phase IV
le plus approprié – Etudes randomisées de supériorité, de
non-infériorité et d’équivalence
• Etudes d’implémentation
• Etudes de pharmaco-économie
• Etudes translationnelles
http://www.mysteresdumonde.fr/categ/paranormal/96-chamanisme.html
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ETUDES RÉTROSPECTIVES
• On va chercher des
données déjà enregistrées
– Dossier médical
– Registres
– Banques de données
nationales
–…
• On sélectionne les
données qui vont être
enregistrées
• On les cherche au
moment de la visite du
patient
– Examen clinique
– Biologie
– Radiologie
– …
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LA STRATÉGIE PICO
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QUELQUES POINTS IMPORTANTS À CONSIDÉRER
POUR UNE ÉTUDE PROSPECTIVE (1)
61
NIVEAU DE PREUVE
62
C’EST QUOI UN NIVEAU DE PREUVE?
63
UNE DÉFINITION DU NIVEAU DE PREUVE
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NIVEAU DE PREUVE ET QUESTION POSÉE
• Etudes
LITTÉRATURE DE
ü Etiologie SYNTHÈSE
Méta-analyse
ü Diagnostic Revue systématique
ü Thérapeutique
ETUDES
ü Pronostic Etudes randomisées
INDIVIDUELLES
ü Biomarqueur Etude de cohorte
Etude cas-témoin
Etude transversale
Série de cas
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UN EXEMPLE D’ÉCHELLE DE NIVEAU DE
PREUVE
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ADAPTER LE NIVEAU DE PREUVE À LA
QUESTION POSÉE
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“VALEUR” DU JOURNAL
LES INDICES DE CITATION
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69
“IMPACT FACTOR”
70
Van Noorden, Nature 2016
71
BUT DE L’IMPACT FACTOR
72
73
74
75
INDICE H
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SCHEMATIC CURVE OF NUMBER OF CITATIONS VERSUS
PAPER NUMBER, WITH PAPERS NUMBERED IN ORDER OF
DECREASING CITATIONS.
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EVALUER LA QUALITÉ DES INFORMATIONS
• Lecture critique
– L’article m’intéresse-t-il? Est-il relevant pour ma
pratique et/ou la question posée?
– Les biais potentiels ont-ils été évalués, peuvent-ils
impacter sur la qualité de l’étude?
• Instruments spécifiques d’évaluation de la
qualité
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RÈGLES COMMUNES
1. Objectif de l’article
3. Type d’article
4. « peer-reviewed » ?
5. Conflits d’intérêt ?
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RÈGLES COMMUNES (1)
1. Objectif de l’article
– Principal: à chercher dans le titre, l'introduction
(souvent en fin), les considérations statistiques.
– Secondaires: valeur exploratoire.
3. Type d’article
– faits cliniques (« case reports »)
– études originales
– revues
– enquêtes ("survey")
– éditoriaux, commentaires, lettres, articles d’opinion
ou d’agrément
4. « peer-reviewed » ?
– sur invitation, accepté d'emblée sur décision du
rédacteur en chef ou soumis à l'avis d'experts à
conditions de soumission des textes aux auteurs
87
5. CONFLITS D’INTÉRÊT ?
88
5. CONFLITS D’INTÉRÊT ?
89
90
RÈGLES SPÉCIFIQUES POUR LA LECTURE
D'UN ARTICLE ORIGINAL
93
POUR ÉTABLIR MA SÉLECTION D’ÉTUDES
94
5. QUELQUES SITES DE
MÉDECINE FACTUELLE
95
CEBAM
96
97
COCHRANE LIBRARY
98
99
http://www.minerva-ebm.be/
100
https://www.ebmpracticenet.be/fr/Pages/Welkom.aspx
101
https://kce.fgov.be/fr
102
PETIT RÉSUMÉ PRATIQUE
1. Définir la 2. Source
question d’information
103
PETIT RÉSUMÉ PRATIQUE
3. Stratégie de
1. Définir la 2. Source recherche
question d’information
PICO
104
PETIT RÉSUMÉ PRATIQUE
5. Appliquer
3. Stratégie les données
1. Définir la 2. Source de recherche 4. Données
de MF à la
question d’information sélectionnées
PICO résolution du
problème
105
QUELQUES EXEMPLES DE
STRATÉGIE DE RECHERCHE
BIBLIOGRAPHIQUE
106
Recherche rapide au lit
du patient
EXHAUSTIVITÉ VS PRÉCISION : EXEMPLES
= construction du PICO
P
[Pathologie, Population, Cancer du poumon
Patients, Problème]
I Dermatomyosite
[Intervention]
C /
[Comparaison]
O /
[Outcomes, objectifs]
FORMULATION DES CONCEPTS EN MESH
LIMITATION DU NOMBRE DE RÉSULTATS
Revue systématique de littérature
EXHAUSTIVITÉ VS PRÉCISION : EXEMPLES
= construction du PICO
P
[Pathologie, Population, Cancer du poumon
Patients, Problème]
C /
[Comparaison]
O /
[Outcomes, objectifs]
LISTE DES SYNDROMES CONNUS
• Anémie hémolytique autoimmune • Syndromes paranéoplasiques neurologiques
• Aplasie de l’érythropoïèse - Polyneuropathies : sensitive de Denny-
Brown, sensitivo-motrice, proximale
• Thrombocytopénie autoimmune - Neuropathies autonomes
• Syndrome d’Evans (1+3) - Polyradiculites
• Leucopénie et aplasie médullaire - Syndrome de Lambert-Eaton
(pseudomyasthénie)
autoimmune
- Myasthénie
• Angiooedème - Myotonie
• Syndrome des antiphospolipides et lupus - SLA paranéoplasique
érythémateux - Myélopathie nécrosante
- Dégénérescence spinocérébelleuse subaiguë
• Polyarthrite - Encéphalomyélites : limbique, etc.
• Dermatopolymyosite - Dégénérescence cérébelleuse
• Glomérulonéphrites - Myélinolyse centrale pontine
- Syndrome opsoclonus-myoclonus
• Erythema gyratum repens gammel - Syndrome de l’homme raide (Stiff-Man)
• Erythrodermies - Dégénérescence rétinienne
• Epidermolyses bulleuses
• Pemphigus paranéoplasique Source principale : Rüther U, Nunnensiek C,
Bokemeyer C, editors. Paraneoplastic
syndromes. Basel: Karger; 1998
FORMULATION DES CONCEPTS
116
http://www.hetop.eu
FORMULATION DES CONCEPTS
= descripteurs MeSH
MeSH Synonymes
red-cell aplasia, pure (sans exploser) • Red Cell Aplasia, Pure
TS = Anemia, Diamond-Blackfan • Erythrocyte Aplasia
[congénital] • Aplasia, Erythrocyte
• Aplasias, Erythrocyte
• Erythrocyte Aplasias
• Pure Red-Cell Aplasia
• Aplasia, Pure Red-Cell
• Aplasias, Pure Red-Cell
• Pure Red Cell Aplasia
• Pure Red-Cell Aplasias
• Red-Cell Aplasias, Pure
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COMBINAISON DES CONCEPTS
P criterion Searched MeSH terms, free-text keywords and phrases
Lung cancer lung neoplasms/ OR bronchial neoplasms/ OR carcinoma, bronchogenic/ OR
carcinoma, non-small-cell lung/ OR small cell lung carcinoma/ OR pancoast
syndrome/ OR lung neoplasm*.ti,ab OR lung cancer*.ti,ab OR lung
carcinoma*.ti,ab OR lung tumour*.ti,ab OR lung tumor*.ti,ab OR pulmonary
neoplasm*.ti,ab OR pulmonary cancer*.ti,ab OR pulmonary carcinoma*.ti,ab
OR pulmonary tumour*.ti,ab OR pulmonary tumor*.ti,ab OR bronchial
neoplasm*.ti,ab OR bronchial cancer*.ti,ab OR bronchial carcinoma*.ti,ab OR
bronchial tumour*.ti,ab OR bronchial tumor*.ti,ab OR bronchogenic
neoplasm*.ti,ab OR bronchogenic cancer*.ti,ab OR bronchogenic
carcinoma*.ti,ab OR bronchogenic tumour*.ti,ab OR bronchogenic
tumor*.ti,ab OR pancoast* syndrome*.ti,ab OR pancoast* tumor*.ti,ab OR
pancoast* tumour*.ti,ab
I criteria Searched MeSH terms, free-text keywords and phrases (to be combined
with the OR operator)
Autoimmune Anemia, Hemolytic, Autoimmune/ OR Anemia, Hemolytic/ OR hemolityc
Hemolytic anemia*.ti,ab
Anemia
Red-Cell Aplasia Red-Cell Aplasia, Pure/ OR Pure Red Cell Aplasia*.ti,ab OR Erythrocyte
Aplasia*.ti,ab
119
VÉRIFICATION 1
= 86 documents trouvés
EXTRAIT DE L’ÉQUATION
122
DIAGRAMME DE FLUX