BIM503 Pharmacogénétique et pharmacogénomique

Luc Gaudreau, PhD

Département de biologie
Luc.Gaudreau@USherbrooke.ca

Cours 2
Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies (exemples);
technologies de génotypage;
pharmacodynamie et pharmacocinétique.

6 septembre 2023
Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies
Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies
 Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies (exemples)

MDR1 chez les chiens: MDR1 est un gène qui code pour une P-glycoprotéine essentielle pour le transport de
certaines drogues hors du cerveau. Les mutations qui inactivent le gène MDR1 chez les chiens les rendent donc
sensibles à plusieurs drogues et les symptômes sont assez sévères et incluent la cécité, perte de contrôle
musculaire, tremblements et même la mort.
Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies (exemples)
Which breeds are affected? Dogs may be sensitive to:

Australian Shepherd Antibiotics such as erythromycin and rifampin

Border Collie Anti-cancer drugs such as doxorubicin,
Collie vinblastine and vincristine
English Shepherd Anti-diarrheal drugs such as loperamide (Imodium®)
German Shepherd Certain parasite-control products such as ivermectin (in high
Long-Haired Whippet doses), milbemycin, moxidectin and selamectin
McNab
Miniature Australian Shepherd
Mixed Breed
Old English Sheepdog
Shetland Sheepdog
Silken Windhound
Ivermectin et Covid-19…

https://www.fox13news.com/news/health-experts-call-for-
immediate-end-to-use-of-parasite-drug-ivermectin-for-covid-19

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S01663542
2030201
Exercice 1: Aucun rapport à remettre mais discussion sur Teams le 14 septembre…

D’un point de vue pharmacogénétique pourquoi il ne serait pas bon d’utiliser l’ivermectin
pour traiter la Covid-19?
qst examen
 Influence des mutations face à la susceptibilité aux maladies (exemples)

BRCA1 : gène suppresseur de

tumeur impliqué dans le cancer du
sein et des ovaires. Plusieurs
dizaines de mutations ont été
répertoriés dans différentes
populations…
grne enorme aj bco dintron
 le gene la prot ees inpo pur le reparation simple brin et surtout double brin .
le meca est pas impo.
mais c une prot qui es essentiel pour reprer ladn

Que fait BRCA1 dans les cellules?

Les mutations BRCA et la sensibilité aux agents chimiothérapeutiques…

https://www.nature.com/articles/bjc2015220

bcp dagent chimio font d dommage a ladn

Exercice 2: Aucun rapport à remettre mais discussion sur Teams le 13 septembre…

Est-ce que vous croyez que la stratégie thérapeutique utilisée avec BRCA1 peut aussi
être utilisée avec d’autres gènes suppresseurs de tumeurs et même d’oncogènes ?
gros prob davoir une mutation mais on peu tirer un avabtage davoir cette muta pour traiter des cancer et est ce que sa peu marcher aak dutre gene
Pharmacodynamie et pharmacocinétique...

L’effet thérapeutique d’un médicament dépend :

1) De la pharmacodynamie, i.e. Son action sur l’organisme (la cible);

2) De la pharmacocinétique, i.e. Son « devenir » dans l’organisme.

La pharmacodynamie...

https://fr.wikipedia.org/wiki/Pharmacodynamique
 par coeur

La pharmacocinétique dépend de plusieurs facteurs (ADME)...

1) L’absorption
2) La distribution
3) métabolisme es letap ki est le plus affecte par les muta
4) Excrétion et élimination
http://www.cheneliere.info/cfiles/complementaire/Ma
th_et_med_9782765027485/Pharmacocinetique.pdf

https://fr.wikipedia.org/wiki/Pharmacocinétique

http://www.chups.jussieu.fr/polys/pharmaco/poly/cineti
que.html
Les technologies de génotypage…

-PCR-RFLP;

-Pyroséquençage;

-Genome-Wide Human SNP Array (Affimetrix);

-Genome Analyzer (Illumina).

***Voir article de Falke sur Moodle

https://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_fragment_length_polymorphism

https://www.qiagen.com/kr/resources/technologies/pyros
equencing-resource-center/technology-overview/

https://cancergenome.nih.gov/abouttcga/aboutdata/pla
tformdesign/affymetrixSNP6array

https://www.illumina.com/documents/products/tec
hspotlights/techspotlight_sequencing.pdf
Les trousses de dépistage génétique / pharmacogénétique: un gros party de
$$$$$$$$$$$$

https://geneticsdigest.com/best_ancestry_genealogy_dna_test/indext.html?gclid=Cj0KCQjwiILsB
RCGARIsAHKQWLNHwPZ_oYIn_DSoiHqvt1x434SFw

Et pour les toutous…

https://vgl.ucdavis.edu

https://embarkvet.com/
Le dépistage et la thérapie génique…

https://www.nature.com/articles/d41586-019-01257-9
APP-1 !!!!!!
bref resumer de protocole les fait saillant kess ki distingye c methode (coute cher, accessible ou pas . seul ou en equipe)

Comment faire pour dépister les diverses mutations possibles dans le gène BRCA1 ?
Donner des exemples de méthodologies avec bref résumé de protocole. Avantages et
désavantages de chacune des méthodes etc.

1 Page max, simple interligne, 12 chrs. Seul(e) ou en équipe. Bien identifier votre (vos)
noms SVP. À remettre le 13 septembre 2023 (par courriel à :
luc.gaudreau@usherbrooke.ca). on px lui envoyer une ebauche