Institut des Sciences Vétérinaires, Cours de bio-informatique

Université de Blida 1 2020/2021

Cours 5

Les génomes modèles et les projets

génomes
Un organisme modèle ?? :

Voies métaboliques

Voies Régulatrices

Voies développementales

Les gènes qui déterminent ces processus.

1. Les organismes appartenant à des espèces
ayant :

• Un génome de petite taille et totalement séquencé.

• Une facilité de reproduction au laboratoire (avec un

cycle de vie court) et/ou une facilité de mise en culture.

• Des fonctions d'intérêt, partagées avec l'homme.

2. Ils peuvent être utilisés comme modèle pour étudier la
fonction de gènes chez l'homme.

Ainsi, toutes les connaissance structurales et fonctionnelles

acquises chez ces organismes modèles deviennent applicables
chez l'homme.
Recherche de gènes d’intérêt chez les génomes modèles.
Comment?

Etude d’aspects particuliers du phénotype par:

Observation d’une caractéristique particulière.

Recherche du gène correspondant.

Etude du gène et de la protéine.

Inactivation du gène et observation des conséquences.

Expression dans un autre organisme.

 La transgénèse

Implanter un ou plusieurs gènes dans un organisme vivant.

Le transgène

C’est la séquence isolée d’un gène, transférée d’un

organisme à un autre, lors de la mise en œuvre de la
transgénèse. Ce transgène pourra exprimer dans
l’organisme transformé.
Objectif et domaines d’application de la transgénèse

Elle est utilisée largement dans les industries

pharmaceutique et agroalimentaire. Elle permet d’obtenir
des variétés végétales ou animales résistantes au stress
biotique ou abiotique. Ces nouvelles variétés sont
regroupées sous le terme : Organismes Génétiquement
Modifiés (OGM).
Les projets concernant les génomes animaux

la souris et le rat au centre de la recherche

sur les génomes grâce à plus d’un siècle de
recherche en génétique.

• Les avantages majeurs pour ces rongeurs:

Grand nombre de lignées (plus de 100 lignées de

généalogie connue).

Beaucoup d’aspects en commun avec l’homme liés au

développement, à la physiologie et aux aspects génétiques
des maladies.
Vertébrés modèles en recherches biomédicales (1)

Poisson-zèbre « Danio rerio » (Zebrafish).

Modèle d’étude pour l’embryogénèse, la neurogénèse et

l’organogénèse car:

• Embryogénèse rapide et transparente.

• Facilité de culture.
Vertébrés modèles en recherches biomédicales (1)

Glofish

Aquariophilie

Bio-indicateur
Vertébrés modèles en recherches biomédicales (2)

Poisson-coffres différents mais proches

du point de vue évolution:

Tétraodon nigrovividis Fugu rubripes

Possèdent des génomes

exceptionnellement petits
Vertébrés modèles en recherches biomédicales (2)

Des espèces de poissons d’intérêt commercial ou

écologique tels:

Les cichlidés Les percidés Les salmonidés

Vertébrés modèles en recherches biomédicales (3)

Les chats et les chiens, pourquoi?

Pour effectuer des comparaisons car Il existe une équivalence

pour de nombreuses maladies humaines, telles le diabète,
l’arthrite, les tumeurs et les maladies métaboliques héréditaires.
Vertébrés modèles en recherches biomédicales (3)

Sur Les primates : le singe Rhésus et le chimpanzé. Pourquoi?

• Pour étudier l’origine de la diversité du système immunitaire.

• Les mécanismes de résistance aux pathogènes.

• La résistance humaine au VIH…

Les projets d’organismes invertébrés

• Caenorhabditis elegans: ver nématode (1998).

www.wormbase.org

• Drosophila melanogaster (2000).

www.flybase.bio.indiana.edu

C’est les premiers génomes d’organisme pluri-cellulaires

eucaryotes a avoir été totalement séquencés.
Les projets concernant les micro-organismes

Escherishia Coli: Séquencé en 1997.

Heamophilus influenzae (1995).

Mycoplasma genitalium (1995).

Saccharomices cerevisiae (1997).