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69,
No. 2 (2017)
ARTICLE DE RÉVISION
I II
Melaine González García, Javier San Juan Galán, Fidel Ernesto Morales
III I
Vicente Anselmo J. Otero González
I
Centre d'études sur les protéines. Faculté de biologie. Université de La
Havane. La Havane Cuba.
II
Laboratoire National de Référence de Mycologie. Institut de Médecine
Tropicale "Pedro Kouri". La Havane Cuba.
III
Département de Chimie Générale. Faculté de Chimie. Université de La
Havane. La Havane Cuba.
RÉSUMÉ
ABSTRAIT
INTRODUCTION
Les peptides antimicrobiens (PAM) ont été découverts il y a plus de 90 ans.
L’un des premiers signalés est la gramicidine, puisque sa découverte a eu
lieu en 1939 et que son efficacité dans la protection contre l’infection à
pneumocoque a été démontrée. En 1941, un autre PAM, la tyrocidine, a été
découvert et présentait une activité contre les bactéries Gram-positives et
Gram-négatives. La même année , la purothionine PAM a également été
isolée de la plante Triticuma estivum , qui s'est révélée efficace contre les
1
champignons et les bactéries pathogènes.
Bien que les premiers PAM aient été découverts il y a plusieurs années, les
recherches sur ce sujet ne sont devenues pertinentes que dans les années
1980, lorsque les cécropines et les magainines ont été découvertes. Depuis,
plus de 5 000 PAM ont été isolés à partir de diverses sources et d’autres ont
1
été synthétisés par des méthodes chimiques.
Ces molécules sont codées dans le matériel génétique par des familles
multigéniques qui comprennent les cathélicidines, les défensines, les
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cécropines, les dermaseptines et les pleurocidines. Ils subissent
différentes modifications post-traductionnelles, qui peuvent altérer
significativement leur activité. Ceux-ci comprennent l'amidation carboxy-
terminale, l'halogénation, le traitement protéolytique, l'isomérisation des
acides aminés, la formation de ponts disulfure et, dans une moindre mesure,
la glycosylation ; Par conséquent, plusieurs isoformes du même peptide
9
peuvent être formées, comme c’est le cas des hepcidines.
Les PAM qui agissent directement sur les micro-organismes peuvent être
répartis en tenant compte de la cible cellulaire. L’une de ces cibles est la
membrane cytoplasmique, car elles ont une grande affinité pour cette
structure des cellules microbiennes. Ceci est fondamentalement dû aux
différences qui existent entre les cellules microbiennes et celles de l'hôte,
comme l'existence de composants anioniques (lipopolysaccharides, LPS,
chez les bactéries à Gram négatif, acides téichoïque et lipotéichoïque chez
les bactéries à Gram positif, ou 1,3 -β glucane et phosphomannanes à la
surface des champignons), composition et distribution des phospholipides
(phosphatidyl glycérol et cardiolipine chez les bactéries et
phosphatidylinositol chez les champignons) et différences de potentiel
transmembranaire (-130 à -150 mV dans les cellules de mammifères et -90
7
à -110 dans cellules microbiennes). Un exemple de ces PAM est la famille
des cathélicidines qui se caractérisent par la lyse de la cellule par des
12
perturbations directes de la membrane.
Une autre structure qui constitue une cible pour l’action antimicrobienne de
ces molécules est la paroi cellulaire. Initialement, ce mécanisme a été décrit
pour les PAM procaryotes tels que la nisine A, mais il a ensuite été
également établi pour certains eucaryotes tels que la plectasine. On sait que
l'action de la nisine A sur la paroi cellulaire se fait par la formation de
complexes avec le lipide II, qui est un précurseur de cette structure et inhibe
13
donc sa synthèse. D'autres PAM présentent des cibles intracellulaires qui
exercent leur activité antimicrobienne en inhibant des processus essentiels
à la cellule tels que la synthèse des protéines et la réplication de l'ADN. Il a
été démontré que les peptides riches en proline tels que la drosocine et
l'apidaécine ont la capacité de se déplacer vers le cytosol et d'inhiber l'action
14
du DnaK.
De leur côté, les PAM qui ont une action indirecte sur les micro-organismes
interagissent avec le système immunitaire inné par différentes voies. De
manière générale, ils modulent la réponse pro-inflammatoire et anti-
inflammatoire par l'altération des voies de signalisation, recrutent
directement ou indirectement des cellules effectrices telles que les
phagocytes, favorisent la maturation des cellules dendritiques et la
quinze
différenciation des macrophages, ainsi que l'apoptose.
POTENTIALITÉS THÉRAPEUTIQUES
Les PAM pourraient être utilisés comme agents thérapeutiques dans le
traitement de maladies infectieuses et/ou en complément d’une thérapie
avec des antibiotiques conventionnels, car ils présentent une synergie avec
16 17
ceux-ci. Dans des études réalisées par Nuding et al. , il a été démontré
que les peptides HBD1 - HBD3, HNP1, HD5 et LL-37, lorsqu'ils sont
combinés avec les antibiotiques tigécycline, moxifloxacine et méropen, ont
un effet synergique qui favorise l'activité antimicrobienne contre les agents
toxinogènes. et non toxigènes de Clostridium difficile . La bacitracine a
également montré ce comportement en association avec des antibiotiques
B.18
topiques tels que la néomycine et la polymyxine
Concernant l'activité antivirale, on sait que les défensines ont une activité
contre les virus enveloppés et nus, bien qu'avec des mécanismes d'action
différents. Certains agissent directement sur les enveloppes virales, les
glycoprotéines et les capsides tandis que d'autres se lient aux récepteurs
cellulaires, empêchant leur interaction avec le virus ou inhibant la réplication
19
virale. Par exemple, il a été démontré dans des études in vitro que les α-
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défensines HNP-1 à -3 et HD-5 bloquent l’infection par le papillomavirus.
Il a également été décrit que les cathélicidines ont un effet inhibiteur sur la
vingt-et-un
réplication in vitro des lentivirus.
On sait que les PAM antifongiques peuvent avoir une activité fongicide ou
fongistatique, et qu'ils peuvent présenter ou non une activité antibactérienne
en même temps qu'ils exercent leur action contre les champignons. L’un des
PAM antifongiques décrits est le Cm-p5. Dans les études réalisées par
24
Lopez-Abarrategui et autres , il a été démontré qu'il possède une activité
fongistatique in vitro contre Candida albicans avec une concentration
minimale inhibitrice de 10 µg/mL. D'autres, comme NaD, ont une activité
puissante contre plusieurs champignons pathogènes tels que Fusarium
oxysporum, Botrytis cinerea, Aspergillus niger, Cryptococcus sp. , ainsi que les
25
levures Saccharomyces cerevisiae et C. albicans . L'action antifongique de
ce peptide est médiée par la formation de granules dans le cytoplasme et la
26
mort cellulaire.
Les PAM ayant une action indirecte sur les micro-organismes ont également
été évalués dans des études cliniques. Des études in vitro ont démontré
l'efficacité des dérivés de la lactoferrine humaine tels que hLF1-11 et de ses
formes recombinantes telles que la Talactoferrine-α contre les bactéries
résistantes aux antibiotiques utilisés en clinique et les souches de C.
29
albicans résistantes au fluconazole. De son côté, la société canadienne
Inimex Pharmaceuticals a développé des PAM dotés de ce mécanisme
d'action et des données préliminaires montrent qu'ils réduisent
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considérablement la charge de S. aureus in vivo dans un modèle murin.
La toxicité est une autre caractéristique des PAM qui limite leur utilisation
comme agents thérapeutiques, c'est pourquoi il est suggéré de masquer ces
molécules à l'aide de différentes formulations telles que celles liposomales.
29
Il a été démontré que ces formulations renforcent l'activité des peptides
contre les micro-organismes pathogènes tout en réduisant leur toxicité et
leur sensibilité protéolytique. Cette stratégie a été évaluée par Yang et
34
autres en utilisant le peptide WLBU-2, et il a été démontré que les
liposomes modifiés avec ce peptide présentaient une activité in vitro contre
les souches de SARM et de Pseudomonas aeruginosa .
Une autre alternative pour optimiser l'activité des PAM consiste à obtenir de
nouveaux peptides grâce à la synthèse de dérivés cycliques contenant des
combinaisons d'acides aminés D et L, et à la synthèse de PAM par
mimétisme moléculaire à l'aide de peptoïdes, qui diffèrent des peptides en
ce que la chaîne latérale est attaché à la structure de l’amide azoté plutôt
qu’au carbone. Ces modifications rendent les PAM résistants aux protéases.
35
45
Banerjee et autres ont obtenu des peptides-stéroïdes en introduisant des
analogues du tripeptide RGD (séquence reconnue par plusieurs intégrines) à
des stéroïdes reconnus par les membranes cellulaires, avec une activité
antagoniste élevée des intégrines ανβ3, enzymes responsables du
processus d'adhésion cellulaire. D'autres PAM chimiquement modifiés
comprennent le KSL doté d'une puissante activité bactéricide et fongicide,
ainsi que le peptide Bac8c dérivé de la bacténécine, qui possède une activité
puissante contre un large groupe de bactéries à Gram négatif et à Gram
46
positif ainsi que contre les levures.
Certains des peptides qui ont récemment été modifiés chimiquement sont
le KABT-AMP et l'upérine 3.6, qui ont une structure amphipathique en hélice
36,
α. Dans les études réalisées par Lum et al. quatre dérivés (KU1, KU2, KU3
et KU4) ont été synthétisés pour renforcer leur action antifongique, obtenus
en sélectionnant et en fusionnant des fragments de ces PAM. Ces peptides
hybrides ont montré une activité puissante contre C. albicans par rapport à
leurs peptides parentaux et un effet synergique en combinaison avec des
antifongiques conventionnels. De plus, ils avaient une faible activité
hémolytique mais une activité cytotoxique significative dans deux lignées de
cellules épithéliales humaines.
Sur ce sujet, plusieurs recherches ont été réalisées à Cuba dans le but
d'introduire des modifications chimiques dans des peptides synthétiques et
naturels pour le développement de candidats thérapeutiques et vaccinaux
contre différentes maladies. Un exemple en est la polymérisation d'un
peptide cyclique synthétique dérivé de la boucle 4 de la protéine PorA du
sérogroupe B de Neisseria meningitidis pour augmenter son
immunogénicité, ce qui permettrait son utilisation comme candidat vaccin.
Dans cette étude, il a été prouvé que cette stratégie améliore la réponse
immunitaire in vitro chez plusieurs lignées de souris vis-à-vis du peptide
31
cyclique non polymérisé.
CONCLUSIONS
Les PAM ont été étudiés avec attention ces dernières années en raison des
divers effets biologiques qu'ils présentent, car ils peuvent être utilisés
séparément comme antimicrobiens ou en combinaison avec des
antibiotiques en raison de leur effet synergique, également comme
immunomodulateurs et/ou composés neutralisant les endotoxines.
Cependant, in vivo , ils n’ont pas démontré une bonne activité
antimicrobienne, c’est pourquoi diverses alternatives sont suivies pour
optimiser leur action dans le but de les utiliser comme agents
thérapeutiques à l’avenir.
RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
1. Wang G. Peptidologie computationnelle, méthodes en biologie
moléculaire. Dans : Zhou P, Huang J (éd.). Méthodes améliorées de
classification, de prédiction et de conception de peptides antimicrobiens.
New York : Springer Science+Business Media ; 2015. p. 44-66.
2. Arias CA, Murray BE. Insectes résistants aux antibiotiques au 21e siècle –
Un super défi clinique. N Engl J Med.2009;360(5):439-43.
12. Van der Weerden NL, Bleackley MR, Anderson MA. Propriétés et
mécanismes d'action des peptides antifongiques naturels. Cell Mol Life Sci.
2013;70(19):3545-70.
15. Mansour SC, Pena OM, Hancock RE. Peptides de défense de l’hôte :
immunomodulateurs de première ligne. Tendances Immunol.
2014;35(9):443-50.
16. De la Fuente NM, Villarreal J, Díaz MA, García AP. Évaluation de l'activité
des agents antimicrobiens face au défi de la résistance bactérienne. Journal
mexicain des sciences pharmaceutiques. 2016;46(2):7-16.
17. Nuding S, Frasch T, Schaller M, Stange EF, Zabel LT. Effets synergiques
des peptides antimicrobiens et des antibiotiques contre Clostridium difficile.
Agents antimicrobiens Chimother. 2014;58(10):5719-25.
18. Zhang L, Falla TJ. Peptides de défense de l'hôte destinés à être utilisés
comme potentiels thérapeutiques. Curr Opin enquête sur les médicaments.
2009 ; 10(2):164-71.
19. Wilson SS, Mayim ME, Jason SG. Mécanismes antiviraux des défensines
humaines. J Mol Bio. 2013;425(24):4965-80.
20. Wiens ME, Smith JG. La défensine HD5 inhibe l'infection par le virus du
papillome humain 16 via la stabilisation de la capside et la redirection vers
le lysosome. Mbio. 2017;8:1 e02304-16.
23. Zhang Z, Mu L, Tang J, Duan Z, Wang F, Wei L et al. Un petit peptide avec
un potentiel thérapeutique pour l'acné vulgaire inflammatoire. PLoS One.
2013;8(8):e72923.
25. Hayes BM, Bleackley MR, Wiltshire JL, Anderson MA, Traven A et van der
Weerden NL. Identification et mécanisme d'action de la défensine végétale
NaD1 en tant que nouveau membre de l'arsenal antifongique contre Candida
albicans. Agents antimicrobiens Chimother. 2013;57(8):3667-75.
26. Poon I, Baxter AA, Lay FT, Mills GD, Adda CG, Payne JA et al.
L'oligomérisation d'une défensine médiée par le phosphoinositide induit la
synthèse cellulaire. Élife. 2014;3:e01808.
27. Bretzel J, Mohring F, Rahlfs S, Becker K. Peptides antiparasitaires. Adv
Biochem Eng Biotechnologie. 2013;135 : 157-92.
29. Fjell CD, Hiss JA, Hancock RE, Schneider G. Conception de peptides
antimicrobiens : la forme suit la fonction. Nature examine la découverte de
médicaments. 2012;11(1):37-51.
30. Gordon YJ, Romanowski EG, McDermott AM. Un examen des peptides
antimicrobiens et de leur potentiel thérapeutique en tant que médicaments
anti-infectieux. CurrEye Res.2005;30(7):505-15.
32. Kim H, Jang JH, Kim SC, Cho JH. Génération de novo de peptides
antimicrobiens courts avec une stabilité et une spécificité cellulaire
améliorées. J Antimicrob Chemother Res Pract. 2014;69(1):121-32.
34. Yang K, Gitter B, Ruger R, Wieland GD, Chen M, Liu X et al. Liposomes
modifiés par des peptides antimicrobiens pour les bactéries ciblant
l'administration de témoporfine dans la chimiothérapie antimicrobienne
photodynamique. Photochem Photobiol Sci. 2011;10(10):1593-601.
35. Chongsiriwatana NP, Patch JA, Czyzewski AM, Dohm MT, Ivankin A,
Gidalevitz D et al. Peptoïdes qui imitent la structure, la fonction et le
mécanisme des peptides antimicrobiens hélicoïdaux. Proc Natl Acad Sci
USA. 2008;105(8):2794-9.
36. Lum KY, Tay ST, Le CF, Lee VS, Sabri NH, Velayuthan RD et al. Activité de
nouveaux peptides synthétiques contre Candida albicans . Sci Rep
2015;5:9657.
39. Nadolski MJ, Linder ME. Lipipation des protéines. Journal FEBS.2007 ;
274 : 5202-5210.
40. Kaiser A, Gaidzik N, Becker T, Menge C, Groh K, Cai H et al. Vaccins
synthétiques constitués de glycopeptides MUC1 associés à une tumeur et
d'un ligand lipopeptidique du récepteur Toll-like 2. Angew Chem Int Ed.
2010;49:3688-92.
43. Rivera DG, León F, Concepción O, Morales FE, Wessjohann LA. Une
approche multicomposante multiple des podands peptides-peptoïdes
chimériques. Chem Eur J. 2013;19(20):6417-28.