Ministère de l’Enseignement Supérieur

et de la Recherche Scientifique

MASTER 2 SVT- 2017-2018

Examen de GénétiqueECUE1 : Techniques d’amélioration génétique des

Plantes (2h30)

(1er semestre, 1ère session)

COURS MAGISTRAL 1

Question 1 (4pts): Quelles sont les contraintes rencontrées dans l’amélioration génétique des plantes
pérennes ?
-Contrainte liée à la durée d’exploitation des cultures
- les caractères sur lesquels portent les analyses ne sont pas toujours très précis
-Contrainte liée au dénombrement chromosomique et au problème de maturation des embryons
-Contrainte liée aux explants
-Contraintes environnementales (sécheresse, stress, adaptation, feux de brousse)

Question 2 (4 pts) : Quels sont les aspects positifs en amélioration des plantes pérennes ?
-Maintien du polymorphisme génétique
-Rôle déterminant dans la régulation des échanges génétiques avec les autres populations de plante
-les variétés obtenues sont de plus performantes

Question 3 (4pts) : Qu’est-ce que la sélection assistée par marqueur ?

C’est une technique de sélection basée sur l’utilisation de marqueurs moléculaires, de petits
segments d’ADN situé près d’un gène d’intérêt (Ex : résistance à une maladie) dans l’ADN de la
plante.

Question 4 (4pts) : Quels sont les objectifs de la sélection assistée par marqueurs ?

Son objectif est de déterminer précisément la présence ou l’absence du (ou des) gènes d’intérêt
recherché (s) dans les plants en cours de sélection.

Question 5 (4pts) : Quel est l’intérêt de la sélection assistée par marqueurs ?

Elle présente un intérêt important dans les programmes d’introgression d’un gène d’intérêt dans une
variété élite par rétrocroisement.
Question 6 (4pts) : Quels sont les avantages de la sélection assistée par marqueurs ?
-Elle est plus rapide : quelques jours d’analyse au laboratoire suffisent pour établir un diagnostic de
la présence ou de l’absence des gènes d’intérêt dans les plants en cours de sélection.
-Elle est plus précise : Détection fiable de la présence ou de l’absence du gène recherché.
- Elle est non destructive : L’analyse des plants est réalisée dans une très faible quantité de matériel
végétal (1m2 de feuille).
-Elle est non influencée par des facteurs environnementaux.

Question 7 (4pts) : Quels sont les inconvénients de la sélection assistée par marqueurs ?
-Elle n’est pas compétitive en termes de temps et de coût par rapport aux méthodes de sélection
traditionnelles
-Elle est souvent inefficace pour la sélection de caractères agronomique à déterminisme génétique
complexe.

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COURS MAGISTRAL(1er semestre, 1ère session)

Question 7 (4pts) : Quels sont les applications de la sélection assistée par marqueurs ?
-Conversion de lignées pour un transgène (Ex : Introgression du gène Bt chez le maïs).
-Constitution de génotypes
-Recherche fondamentale
-Secteur agronomique et industrielle
-Production de molécules d’intérêt thérapeutique

Question 8 (4pts) : Quels sont les avantages de la sélection massale ?

-les récoltes sont de plus en plus productives
-Biodiversité conservée par les individus « hors critère de sélection »
- Obtention de nouvelles variétés cumulant de bonnes propriétés.

Question 9 (4pts) : Quels sont les inconvénients de la sélection massale?

-Diminution de la biodiversité maintenue par l’homme
-Sélection empirique et imparfaite des semences des individus les plus intéressants
-Hasard de la reproduction de l’espèce
-Croisement des individus ayant des propriétés différentes très aléatoires.
-la reproduction et la stabilisation de l’espèce aléatoire nécessite du temps

Question 10 (4pts) : Définissez le rétrocroisement

 République de Côte d’Ivoire

Union-Discipline-Travail
C’est le croisement d’un hybride avec l’un de ses parents ou avec un
individu similaire sur le plan génétique à l’un de ses parents, de manière à obtenir un descendant
ayant une identité génétique plus proche de celle du parent.

Question 11 (4pts) : Quels sont les avantages du rétrocroisement?

-Accroissement de la fréquence des gènes recherchés
-Préservation de la combinaison « élite »

Question 12 (4pts) : Quels sont les inconvénients du rétrocroisement?

-Il fonctionne mal pour les caractères quantitatifs
-Il est restreint pour les caractères récessifs
-Risque de maintien de milliers de gènes « étrangers » dans le cultivar « élite »
-Moins compétitif en termes de temps dans la sélection d’un nouveau cultivar

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Question 13 (4pts) : Quelles sont les différentes techniques d’amélioration génétique des plantes ?
-sélection massale
-sélection récurrente
-sélection généalogique
-méthode Bulk
-sélection par filiation monograine
-le rétrocroisement
-sélection assistée par marqueur
-sélection génomique GARAVITO 42

Question 14 (4pts) : Quelles sont les différences majeurs entre caractères quantitatifs et caractères
qualitatifs ?
 République de Côte d’Ivoire

Union-Discipline-Travail
-Les caractères quantitatifs sont mesurables, alors que les caractères
qualitatifs ne sont pas mesurables
- Les caractères quantitatifs sont des caractères à variation continue, les caractères qualitatifs des
caractères à variation discontinue.
-Les caractères quantitatifs sont tributaires du milieu, les caractères qualitatifs ne sont pas tributaires
du milieu.
- Les caractères quantitatifs sont sous influence d’un très grand nombre de gènes
-les caractères qualitatifs sont sous influence d’un petit nombre de gènes, voire d’un seul gène.

Question 15 (4pts) : La sélection récurrente réciproque peut-elle être appliquée indifféremment chez
les plantes autogames ou allogames ? Justifiez votre réponse.

Non, car chez les plantes autogames la durée du cycle, les nombreuses générations d’autofécondation
avant l’inter croisement et l’étroitesse de la base génétique sont des facteurs limitant.

Question 16 (4pts) : Quelle est la composante de la sélection qui est le meilleur indicateur à la
réponse à la sélection ?

C’est la variance génotypique, car la dominance et l’épistasie ne se transmettent pas. Elles changent
selon la combinaison génique.

Question 17 (4pts) : Définissez le test polycross.

C’est une fécondation libre entre elles de n structures (clones, lignées, inbred, familles,…) dont on
veut comparer les aptitudes générales à la combinaison.

Question 18 (4pts) : Définissez une variété synthétique

Une variété synthétique est une population artificielle résultante de la multiplication sexuée pendant
un nombre de génération de la descendance en fécondation libre d’un nombre limité de constituants
(clones et lignées) sélectionnés pour leur valeur propre et/ ou leur valeur en combinaison.

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Question 19 (4pts) : Quelles sont les méthodes permettant d’apprécier la valeur d’un individu en
croisement ?

1) Les fécondations libres (allogames uniquement) : On compare les descendants de chaque

génotypes librement pollinisé. Cette méthode est simple et facile à réaliser. Cependant, elle présente
deux limites :
a) l’information qu’elle apporte ne concerne que les AGC, c-à-d les effets additifs ;
b) la population pollinique est rarement la même pour chaque individu.

2) Le test Top-cross : les structures génétiques à étudier (familles, lignées ou clones) sont
pollinisées par un testeur commun qui peut être une variété, une population ou un hybride. Cette
méthode présente trois améliorations par rapport à la fécondation libre:
a) les structures à tester sont en général représentées par plusieurs individus, ce qui permet une
meilleure exploitation dans l’espace et dans le temps de la population gamétique mâle ;
b) l’hybridation peut être effectuée de manière contrôlées ;
c) l’on peut prendre pour testeur une structure bien définie et équilibrée qui est donc très stable.
Lorsque le testeur est une structure génétique à base large, l’estimation obtenue est une AGC. Par
contre, si le testeur est à base étroite, les résultats du top-cross ne reflètent qu’une ASC vis du testeur.

3) Le test Polycross : dans le polycross, c’est la population pollinique des structures en étude qui
constitue ce testeur. Le polycross se définit donc comme la fécondation libre entre elles de n
structures (clones, lignées inbred, familles etc…) dont on veut comparer les aptitudes générales à la
combinaison.
Afin que cette population pollinique soit équilibrée, on répète chacun des n sous-ensemble
constituants soit en les disposant aléatoirement, soit en étudiant un arrangement systématique pour
que chaque structure se trouve également au voisinage de chacune des autres. L’ensemble constitué
par le polycross est évidemment isolé de toute source extérieure de pollen.

Question 20 (4pts) :Donnez les deux types d’aptitudes à la combinaison et leurs utilités.

-Aptitude générale à la combinaison (AGC) : C’est la valeur moyenne gamétique. Elle caractérise
l’individu
-Aptitude spécifique à la combinaison (ASC) : Elle caractérise l’écart par rapport aux prévisions
d’additivité des
AGC des géniteurs. Elle caractérise le croisement.
Utilités : Elles apportent des éléments plus précis quant à la qualité de la transmission des caractères
d’un parent à sa descendance.

Question 21 (4pts) :Pourquoi dit-on que les gènes quantitatifs sont des gènes mendéliens ?

C’est parce que les gènes quantitatifs sont soumis aux mécanismes de la ségrégation et de la
disjonction indépendante des différentes paires de gènes.

Question 22 (4pts) :Quelles sont les méthodes utilisées pour déterminer le nombre de gènes
impliqués dans l’expression d’un gène quantitatif ?

-Méthode de la distribution des phénotypes en F2 issues de deux lignées pures

-Méthode basée sur les variances
-Méthode basée sur le marquage moléculaire avec recherche de QTLs
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Question 23 (4pts) : Quand parle-t-on de transgression ?

On parle de transgression lorsqu’en F2 on obtient des individus ayant des moyennes plus faiblesque le
parent a faible moyenne ou/et plus élevées que le parent a forte moyenne.

Question 24 (4pts) : Définissez l’héritabilité

L’héritabilité est le degré de fidélité avec lequel un caractère se transmet.
Elle exprime la proportion de variation totale due à l’effet des gènes.
Elle permet de mesurer l’influence génétique ou l’importance des gènes dans le façonnement d’un
caractère.
-Au sens large H2 =Var G/Var P
-Au sens étroit h2 =Var A/Var P

Question 25 (4pts) : Quelles sont les méthodes d’estimation de l’héritabilité ?

-Estimation par comparaison F1-F2

-Estimation par essais variétaux
-Estimation par régression parent-enfant ou à partir d’un seul parent.

Question 26 (4pts) : Citez les différentes méthodes de sélection et expliquez chacune d’elle.

•Sélection massale
Elle consiste à choisir les plantes les plus intéressantes dans une population et à utiliser leurs graines
comme semences pour la culture prochaine.

•Sélection récurrente
Elle se rapproche à la sélection massale, mais ici les croisements sont contrôlés conduisant à la
sélection de lignées ou d’hybrides.

•Sélection généalogique
Elle consiste à choisir des lignées pendant leur fixation à l’état homozygote.

Avantages Inconvénients

-les parents hétérozygotes présentent une -Elle est imprécise à cause du taux élevé
forte variabilité phénotypique d’hétérozygotie.
-les lignées sont fixées -Perte rapide de variabilité génétique
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Union-Discipline-Travail

-Elle est héritable pour les caractères -Moins efficace pour les caractères peu
héritables héritables.

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•Méthode Bulk
Elle est aussi appelée sélection généalogique différée car la sélection a lieu après fixation des lignées.

Inconvénients
Avantages de la méthode Bulk

-Elle est peu coûteuse et facile à mettre en œuvre. -Risque d’introduction

-Elle permet d’étudier un grand nombre de croisements de biais dans le
-Elle est plus efficace pour les caractères peu héritables que la processus de sélection.
sélection généalogique.
-Diminution lente de la variabilité génétique.

•sélection par filiation monograine

Elle ressemble à la méthode Bulk, mais ici l’étude porte sur la descendance de graines prises
individuellement à chaque étape d’autofécondation

Avantages Inconvénients

-Risque limité de biais par sélection -Elle est coûteuse et la gestion est lourde
naturelle -Risque de perte de matériels
-Elle est compétitive en termes de temps -Si une graine ne germe pas, il est
-Elle permet de limiter la perte de variabilité impossible de retourner en arrière.
génétique
-Elle est efficace pour les caractères peu
héritables.
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• Le rétrocroisement
Aussi appelé back-cross, il est utilisé pour introduire un caractère intéressant comme la résistance à
une maladie par exemple dans une lignée de bonne valeur agronomique.

Question 27 (4pts) :Quels sont les apports de la biotechnologie dans l’amélioration génétique des
plantes ?

La biotechnologie a permis de contourner les barrières reproductives par :

-le sauvetage d’embryons immatures
-la fusion de protoplastes
-gain de temps avec les méthodes du génie génétique.

Question 28 (4pts) : Quelles sont les connaissances utiles pour l’amélioration génétique des
plantes ?
Pour améliorer génétiquement une plante, le généticien doit connaitre :
-le mode de reproduction de la plante
-la variation des caractères quantitatifs
-la notion de génétique quantitative
-l’hérédité des caractères quantitatifs
-le mode de transmission des caractères quantitatifs
-les aptitudes générale et spécifique à la combinaison

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Plantes (2h30)

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Question 29(4pts) : Interprétez les aptitudes à la combinaison

AGC ASC
Faible
-Peu de choix chez les parents -choix des parents avant croisement est
prioritaire
Forte
-Choix efficace chez les -Faire de nombreux croisements avant de
parents choisir les parents

5-Les affirmations suivantes sont-elles vrai ou fausse.

a- Dans la sélection massale, le sélectionneur n’effectue aucun croisement ( V )
b- La disjonction des allèles est observable chez les hybrides F1 ( F )
La disjonction des allèles est observable chez les hybrides F2
c- Le tri des lignées s’effectue à partir de la F2 ( V )
d- Les techniques de génie génétique peuvent accroitre la variabilité génétique ( V )
e- la sélection généalogique permet de sélectionner des lignées pures ( V )
f- Les semences F3 sont récoltés sur les plantes F3 ( F )
Les semences F3 sont récoltées sur les plantes F2
g- La méthode Bulk à l’inconvénient de nécessiter des surfaces importantes ( V )
h- Dans la SSD, on ne conserve qu’une graine par épi de blé ( F )
Dans la SSD, on ne conserve qu’une graine par plant de blé

6- Réponds par vrai ou faux

a- La sélection assistée par marqueur est moins efficace chez les autogames ( )
b- l’héritabilité au sens large est égale à 1 pour une variance de dominance à 100% ( )
C- Le phénomène de la transgression s’observe chez tous les caractères ( F )
Le phénomène de la transgression s’observe chez les caractères quantitatifs
c- L’ASC est caractéristique de l’individu en croisement ( F )
L’ASC est caractéristique du croisement et l’AGC est caractéristique de l’individu en
croisement
d- Dans un top-cross le pollen des structures en étude peut constituer le testeur commun ( F )
e- La sélection généalogique tout comme la sélection massale permet de maintenir la diversité
tout en augmentant la valeur moyenne de la descendance ( F )
La sélection massale diminue la diversité génétique
f- Seule la sélection récurrente et les rétrocroisements permettent de créer des variétés hybrides (
V)
g- La sélection assistée par marqueur est plus avantageux chez les plantes pérennes ( V )
h- Les variétés hybrides simples sont les plus diffusées du fait de leur homogénéité et de leur
homozygotie ( V )
i- L’héritabilité d’un caractère varie d’une localité à l’autre ( V )
j- Dans la superdominance, l’hybride F1 a une valeur plus élevée que le parent ayant la plus
forte valeur ( V )
k- Les QTLs se transmettent comme les gènes mendéliens avec des effets additifs ( V )
l- Les caractères quantitatifs se transmettent soit par additivité, soit par des effets multiplicatifs (
F)
Il y a aussi la dominance partielle, la dominance totale et la superdominance

m- Une héritabilité nulle signifie une absence d’effet génétique ( F )

Car une absence d’héritabilité, ne signifie que des gènes ne sont pas impliqués dans le
contrôle du caractère, seulement que dans cette population, il n’y a pas de variation
génétique des locus impliques ou que les milieux ou se développe cette population sont
tels que différents génotypes sont phénotypiquement identiques.
n- Les fécondations libres permettent d’estimer l’AGC et l’ASC ( F )
Elles permettent d’estimerseulement l’AGC
o- Les milieux dialleles ne permettent pas d’estimer l’ASC ( F )
Ils permettent d’estimer simultanémentl’AGC et l’ASC
p- La SSD favorise la perte de gène et la diminution rapide de la variabilité ( F )
La SSD limite la pertede la variabilitégénétique
q- La sélection récurrente limite la perte de la variabilité ( V )
r- l’hérédité d’un caractère varie d’une localité à l’autre ( F )
Car l’hérédité d’un caractère est lié au matériel génétique et s’exprime toujours dans la
descendance
s- La méthode de sélection d’une plante est imposée par la durée de son cycle de développement
(F)
La méthode de sélection d’une plante n’est pas imposée par la durée de son cycle de
développement
 République de Côte d’Ivoire

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Plantes (2h30)

COURS MAGISTRAL(1er semestre, 1ère session)

Les affirmations suivantes sont-elles vrai ou fausse.

i- Dans la sélection massale, le sélectionneur n’effectue aucun croisement ( V )
j- La disjonction des allèles est observable chez les hybrides F1 ( F )
La disjonction des allèles est observable chez les hybrides F2
k- Le tri des lignées s’effectue à partir de la F2 ( V )
l- Les techniques de génie génétique peuvent accroitre la variabilité génétique ( V )
m- la sélection généalogique permet de sélectionner des lignées pures ( V )
n- Les semences F3 sont récoltés sur les plantes F3 ( F )
Les semences F3 sont récoltées sur les plantes F2
o- La méthode Bulk à l’inconvénient de nécessiter des surfaces importantes ( V )
p- Dans la SSD, on ne conserve qu’une graine par épi de blé ( F )
Dans la SSD, on ne conserve qu’une graine par plant de blé
t- La sélection assistée par marqueur est moins efficace chez les autogames ( )
u- l’héritabilité au sens large est égale à 1 pour une variance de dominance à 100% ( )
C- Le phénomène de la transgression s’observe chez tous les caractères ( F )
Le phénomène de la transgression s’observe chez les caractères quantitatifs
v- L’ASC est caractéristique de l’individu en croisement ( F )
L’ASC est caractéristique du croisement et l’AGC est caractéristique de l’individu en
croisement
w- Dans un top-cross le pollen des structures en étude peut constituer le testeur commun ( F )
x- La sélection généalogique tout comme la sélection massale permet de maintenir la diversité
tout en augmentant la valeur moyenne de la descendance ( F )
La sélection massale diminue la diversité génétique
y- Seule la sélection récurrente et les rétrocroisements permettent de créer des variétés hybrides (
V)
z- La sélection assistée par marqueur est plus avantageux chez les plantes pérennes ( V )
aa- Les variétés hybrides simples sont les plus diffusées du fait de leur homogénéité et de leur
homozygotie ( V )
bb- L’héritabilité d’un caractère varie d’une localité à l’autre ( V )
cc- Dans la superdominance, l’hybride F1 a une valeur plus élevée que le parent ayant la plus
forte valeur ( V )
dd- Les QTLs se transmettent comme les gènes mendéliens avec des effets additifs ( V )
ee- Les caractères quantitatifs se transmettent soit par additivité, soit par des effets multiplicatifs (
F)
Il y a aussi la dominance partielle, la dominance totale et la superdominance
ff- Une héritabilité nulle signifie une absence d’effet génétique ( F )
Car une absence d’héritabilité, ne signifie que des gènes ne sont pas impliqués dans le
contrôle du caractère, seulement que dans cette population, il n’y a pas de variation
génétique des locus impliques ou que les milieux ou se développe cette population sont
tels que différents génotypes sont phénotypiquement identiques.
gg- Les fécondations libres permettent d’estimer l’AGC et l’ASC ( F )
Elles permettent d’estimerseulement l’AGC
hh- Les milieux dialleles ne permettent pas d’estimer l’ASC ( F )
Ils permettent d’estimer simultanémentl’AGC et l’ASC
ii- La SSD favorise la perte de gène et la diminution rapide de la variabilité ( F )
La SSD limite la pertede la variabilitégénétique
jj- La sélection récurrente limite la perte de la variabilité ( V )
kk- l’hérédité d’un caractère varie d’une localité à l’autre ( F )
Car l’hérédité d’un caractère est lié au matériel génétique et s’exprime toujours dans la
descendance
ll- La méthode de sélection d’une plante est imposée par la durée de son cycle de développement
(F)
La méthode de sélection d’une plante n’est pas imposée par la durée de son cycle de
développement