Intitulé du cours : Santé et Pathologies des Animaux Aquacoles

Niveau : Aquaculture 4
Nombre de crédits : 2
Semestre: 8
Répartition du volume horaire : 30h CM : 15 h TD : TP : 10h TPE : 5h
Pré requis : Microbiologie générale, Ichtyologie, immunologie, nutrition et alimentation,
Ecotoxicologie Hygiène normes et qualité des systèmes de production, Biosécurité et bonnes
pratiques aquacoles.
Responsable du cours
Noms et prénoms : Pr Tchoumboue
Téléphone : (237) 696155369
E-mail : j.tchoumboue@yahoo.fr
Grade : Professeur Emérite
Membres

1
Compétence visée : Produire des animaux aquacoles sains et réduire l’impact des pathologies sur la production
aquacole

Objectifs généraux :

-Maîtriser les notions de base en santé et pathologies des animaux aquacoles;

-Maîtriser l’importance des mesures de prévention et traitement des principales pathologies des animaux aquacoles
en vue de contribuer à l’augmentation du potentiel de production en ressources halieutiques en général et plus
particulièrement en poissons.

Objectifs spécifiques:

- Donner une classification sommaire de santé et pathologie des animaux aquacoles;

-Ressortir, expliquer le déterminisme de la santé et pathologies des animaux aquacoles;

- Améliorer la santé des animaux aquacoles (production);

-Identifier les principaux agresseurs abiotiques et biotiques des poissons et les moyens de lutte;

-Identifier les principaux agresseurs abiotiques et biotiques des crevettes et ressortir les méthodes de lutte ;

-Déterminer les principaux agresseurs abiotiques et biotiques des tortues (reptiles) et des Amphibiens et énumérer les
méthodes de lutte ;

- Répertorier les principales pathologies des tortues et leurs premiers soins.

2
PRESENTATION GENERALE DU COURS: Pourquoi cet EC?

Elevage: actions anthropiques /conduite d’élevage (densité de mise

en charge, confinement des hôtes, modification des comportements des
animaux, contacts Homme-animaux, introduction de nouvelles espèces
dans un nouveau biotope, vidange, élevage intégré, fertilisation des
étangs, polyculture, conduite d’alimentation, types d’infrastructures
d’élevage, non respect des mesures biosécuritaires…)

Modification de l’équilibre naturel de l’écosystème aquatique/

perturbation des chaînes alimentaires

Non atteinte des valeurs des caractéristiques animales (normatives)

souhaitées/ santé animale: Pathologies/zootechniques/vétérinaires
-Baisse des performances zootechniques Pertes économiques
-Mortalités massives d’animaux aquacoles considérables
Certaines maladies d’animaux aquacoles transmissibles à l’Homme:
3
anthropozoonose Problème de santé publique
 Cet EC avise donc les Ingénieurs Halieutes de l’existence des maladies
potentielles ou qui pourront apparaître si des prophylaxies sanitaires/hygiène
adéquates ne sont pas observées sur toute la chaîne de production des animaux
aquacoles. Ce cours est une contribution à la production des animaux
aquacoles sains.

Prolongement par continuité de l’EC ICHAQ422 (Aqua 2)

Enfin la sante et pathologies évoquées sont essentiellement zootechniques

(processus de détermination, production et amélioration des caractéristiques
animales) et vétérinaires. Ces dernières peuvent être dues aux bioagresseurs
d’origine virales (viroses), bactériennes (bactérioses), fongiques (mycoses),
parasitaires (parasitoses : helminthes, annélides, arthropodes, mollusques) puis les
pathologies génétiques, d’origine abiotique c’est-à-dire liées aux caractéristiques
physico-chimiques du milieu d’élevage et idiopathique/causes inconnues.
4

Compétence Objectifs pédagogiques
s ciblées opérationnels (OPO)
-Définir les concepts de
santé, pathologie, hygiène
-Ressortir et comparer les
types de santé animale
(zootechnie, vétérinaire)
-Distinguer les
Produire pathologies zootechniques
et vétérinaires et médicale
des -Expliquer le
animaux déterminisme de la santé et
pathologies des animaux
aquacoles
aquacoles
sains et -Expliquer le lien entre
santé, hygiène et
réduire
pathologie
l’impact -Améliorer la santé des
des animaux aquacoles
(production)
pathologie
-Montrer le lien entre
s sur la pathologies aquacoles et
santé publique: Zoonoses
production
aquacole
PLAN DU COURS
TITRES DES CHAPITRES Durée
partie théorique Partie Cas pratiques Cours TP TPE
pratique
Chapitre I: Généralités Exploitation 3h 2h
I.1. Concept de santé des vidéos
I.1.1 Définitions, synonymes et
relatives aux
typologie
I.1.2. Déterminisme exogène et
notions de
endogène santé , hygiène
I.2. Concept d’Hygiène et pathologie
I.3. Binôme Hygiène- santé
I.4. Notions de pathologies
I.4.1. Définitions et synonymes
I.4.2.Typologie de Pathologies:
zootechnique, vétérinaire et médicale
I.4.3. Déterminisme des pathologies
I.4.4. Canevas d’une étude
épidémiologique
I.5. Trinôme Santé-hygiène-Pathologie
I.6. Animaux aquacoles
I.6.1. Définitions et synonymes
I.6.2. Liste des animaux aquacoles
I.7. Amélioration de la santé animale
I.8. Pathologies aquacoles et santé
publique
I.9. Maladies des animaux aquacoles
notifiables à L’OIE
I.10. Autres définitions
5
Compétences Objectifs Pédagogiques TITRES DES CHAPITRES Durée
Opérationnels (OPO) partie théorique Partie pratique Cas pratiques Cours TP TPE
Reconnaitre, Identifier, Chapitre II : Dissection des Exploitation de 4h 2h 2h

diagnostiquer les Principales poissons et des photos et

maladies courantes à
helminthiases des observation de vidéo illustrant
animaux aquacoles divers groupes divers
helminthes de quelques
II.1. Monogènoses d’helminthes helminthes
animaux aquatiques
II.2. Trématodoses chez les
(poissons, crustacées,
II.3. Cestodoses poissons
grenouilles) et les II.4. Nématodoses
Produire des animaux méthodes de lutte II.5.Acanthocephaloses
aquacoles sains et
Chapitre III :
Dissection des Observation 4h 2h 2h
réduire l’impact des Reconnaitre,
Principales protozoses
animaux des photos et
pathologies sur la Identifier,
des animaux aquacoles
aquacoles et vidéo illustrant
production aquacole diagnostiquer les mise en divers
maladies courantes à III.1 Pathologies des évidence des protozoaires
poissons causées par les protozoaires des animaux
protozoaires de protozoaires aquacoles
quelques animaux
III.2. Pathologies des
aquacoles (poissons, mollusques causées par
crustacées, les protozoaires

grenouilles) et III.3. Pathologies à

déterminer les protozoaires des
crustacées
méthodes de lutte
6
Compétences objectifs visés TITRES DES CHAPITRES Durée

partie théorique partie pratique cas pratiques Cours TP TPE

Reconnaitre, Identifier, Chapitre IV : Principales Exploitation des 4h
pathologies bactériennes, documents
diagnostiquer les
virales et fongiques des relatifs aux
maladies courantes animaux aquatiques pathologies
d’origine bactérienne, bactériennes,
IV.1. Pathologies
fongiques et
virale et fongique chez bactériennes des animaux
virales des
quelques animaux aquacoles
tortues, poissons,
aquatiques (poissons, IV.2. Pathologies virales crustacées et
crustacées, grenouilles) des animaux aquacoles amphibiens

Produire des animaux et les méthodes de lutte IV.3. Mycoses des

aquacoles sains et réduire animaux aquacoles

l’impact des pathologies Reconnaitre, Identifier, Chapitre V : Quelques Exploitation des 3h 2h

sur la production aquacole diagnostiquer les photos et vidéo
arthropodes, mollusques et
illustrant divers
parasitoses à annélides parasites des arthropodes et
arthropodes et animaux aquacoles annélides,
V.1. Principaux parasites
annélides de quelques
arthropodes parasites des d’animaux
animaux aquatiques animaux aquacoles aquacoles
(poissons, crustacées, V.2. Quelques annélides
grenouilles) et les parasites des animaux
aquacoles
méthodes de lutte.
V.3. Mollusques parasites
des poissons
7
Compétences objectifs visés TITRES DES CHAPITRES Durée
partie théorique partie pratique cas pratiques Cours TP TPE
Reconnaitre, Chapitre VI : Pathologies Exploitation 2h 2h
des photos et
Identifier, d’origine abiotique,
vidéos
idiopathique et héréditaire
diagnostiquer les illustrant
VI.1. Maladies d’origine
maladies diverses
abiotique: affections
courantes
-Caractéristiques physico- d’origine
Produire des animaux d’origine chimiques de l’eau abiotique,
aquacoles sains et abiotique, -Intoxications/polluants génétique et
réduire l’impact des génétique et -alimentation idiopathique
-Sol, topographie
pathologies sur la idiopathique de
- Traumatisme (blessures,
production aquacole quelques
fractures, piqures) source de
animaux
stress
aquatiques VI.2. Pathologies génétiques
(poissons,
VI.3. Pathologies
crustacées,
idiopathiques: tumeurs
grenouilles) et
les méthodes de
lutte.

8
 Chapitre 1: Généralités
1.1. Concept de santé
1.1.1 Définitions, synonymes et typologie
1.1.2. Déterminisme exogène et endogène
1.2. Concept d’Hygiène: définitions et synonymes
1.3. Binôme Hygiène- santé
1.4. Notions de pathologies
1.4.1. Définitions et synonymes
1.4.2.Typologie de Pathologies: zootechnique, vétérinaire et médicale
1.4.3. Déterminisme des pathologies
1.4.4. Canevas d’une étude épidémiologique
1.5. Trinôme Santé-Hygiène-Pathologie: liens et différences
1.6. Animaux aquacoles
1.6.1. Définitions et synonymes
1.6.2. Liste des animaux aquacoles
1.7. Amélioration de la santé animale
1.8. Pathologies aquacoles et santé publique: Zoonoses
1.9. Maladies d’animaux aquacoles notifiables à l’Office International des Epizooties (OIE)
1.10. Autres définitions

9
Principales pathologies vétérinaires des animaux aquacoles

10
 Santé-Hygiène-Pathologies/zootechniques, vétérinaires, médicales

Facteurs biotiques ou bioagresseurs

Facteurs abiotiques: - Bactéries, virus,
Caractéristiques physico- - Champignons microscopiques
chimiques du milieu - Protozoaires: ciliés, flagellés, coccidies
d’élevage (apicomplexa), microspiridies,
myxosporidies, haplosporidies (coccidies)
- climat, sol, topographie
- Helminthes (vers): monogènes, trématodes
- Polluants
(digènes), cestodes, acanthocéphales,
- Alimentation aspidogastres, nématodes (vers ronds)
-Arthropodes (branchioures, copépodes,
isopodes)
- Annélides (sangsues)
- oiseaux, mammifères, poissons
- Traumatisme: fracture, blessure, piqures
- Génétiques (héréditaires ou non, congénitales,
acquises)

11
Types de cycles? hôtes? Parasites?
 Monogenoses

Doc 17: Schéma d'un Gyrodactylus Doc 18: Schéma d'un Dactylogyrus

Ectoparasites hermaphrodites des poissons: branchies, peau tube digestif

Gyrodactylus: vivipares

12
Doc 19: Body structure of some monogeneans. A) Dactylogyrus, B) Thaparocleidus, C) Gyrodactylus, D)
Diplozoon (twin worms)

Cycle de vie des monogènes

bain à Praziquantel: 10 mg/litre pendant 3-48 h ou administré une seule fois et oralement
13
en mélangeant 50mg/kg du poids vif à l’aliment du poisson
Trématodes

Cycle évolutif des trématodes

14
 a b c d

Infestation des branchies (a) et de la nageoire caudale (b) et peau (e) par les métacercaires de
Clinostomum sp, Maladie des points noirs (c) et infestation de la bouche par les métacercaires d’
Doc 22: Infestation
Alaria alata (d) des branchies (a) et de la nageoire caudale (b) et peau (e) par les métacercaires de
Clinostomum sp,sous
-Mébendazole forme
Maladie d’aliments
des points noirs (c) ou
et infestation
de bain de la bouche parles
antiseptique: métacercairesdes
destruction d’ Alaria alata (d)
métacercaires
-Vidange de l’étang, désinfection par la chaux vive permet d’éliminer les mollusques.
15
Cestodes: vers rubanés

Doc 33 : Structure des cestodes

16
 Doc 37 : Cycle de vie des cestodes
Praziquantel: oralement à raison de 50 mg/kg de poissons permet d’élimer les
cestodes Rayonnement UV 17
Nématodes: Vers ronds

Doc 28: Cycle vital d’Eustrongylides

18
Clarias jaensis présentant des signes cliniques ante-mortem (cercles) formés par les
kystes de Eustrongylides

19
 kystes de Contracaecum (a), kyste b) et larves (c) de Eustrongylides
Antihelminthiases: Fenbendazole , Ivermetine, Levamisole, Piperazine,
20
oralement contre les vers adultes.
Doc 31 : Anatomie des acanthocéphales et acanthocéphales fixés dans la
muqueuse intestinale de poisson
21
Doc 32 : Cycle de vie des acanthocéphales
22
Bithiniol:20 000 ppm dans la nourriture
 Protozoaires des animaux aquacoles

Doc 4. Flagellate parasites infecting fish. A) Ichthyobodo necator, B) Cryptobia branchialis, C)

Trypanoplasma borelli, D) Trypanosoma danilewskii, E) Spironucleus elegans

Doc 5. Ciliate parasites of fish. A)

Chilodonella piscicola, B) Trichodina sp.,
C) Trichodinella sp., D) Apiosoma sp., E) Doc 12: Nodular coccidiosis in the gut of
Capriniana piscium, F) Balantidium common carp
23
ctenopharyngodoni
 Microsporidies

Parasites intracellulaires de tous les animaux: protozoaires aux mammifères

spores unicellulaires (ovales, arquées, piriformes) de très petites tailles ( 3 à 5 µm)
Forme des xénômes (tumeurs)
24
Ultrastructure des Microspores
25
 Myxosporidies

A C D
B E

A et B : genre Myxobolus ; C : genre Myxidium ; D ; genre Thelohanellus ; E :genre Henneguya

a : vue de face b : vue de profil

cp : capsule polaire cv : cellule valvaire

fp : filament polaire ls : ligne de suture
s : sporoplasme vi : vacuole iodophile
pc : prolongements caudaux

26
Cycle de de vie des Myxosporidies (Myxobolus cerebralis)
27
Kystes de myxosporidies localisés
dans divers organes des poissons

- formol : 400 ppm appliquées aux étangs

-vert malachite : 0,1 à 0,15 ppm ou un mélange de vert
malachite à 0,05- ppm et de formol à 50 ppm, appliqué
28
aux étangs
LV3: vaisseau intra lamellaire; HT: hypertrophie; N: nécrose; DCE: dégénérescence des cellules; DGL:
dégénérescence des lamelles branchiales, ; HP: hyperplasie
Branchies (a) de Cirrhinus mrigala (carpe Indienne) infestée par un plasmode (P) de
Myxobolus nanokiensis (b) et coupe sagittale illustrant un plasmode de type LV3 (c et d)
puis les effets histopathologiques (e) 29
 Quelques maladies bactériennes chez les poissons
Nom de la maladie Agent causal
Bactériose septicémique Aeromonas hydrophila,
De la famille des
Vibrionacés, Eubactériale,
distribution mondiale.
Maladie causée par Edwardsiella ictaluri,
Edwardsiella ictaluri famille des entérobactéries,
Eubactériale.
Gangrène des poissons Edwardsiella tarda famille
des entérobactéries,
Eubactériale.
Vibriose Vibrio anguillarum, famille
des Vibrionacés,
Eubactériale
Maladie causée par Flexibacter columnaris,
Flexibacter columnaris famille des Cytophagacés,
Cytophagale.
Mycobatctériose Mycobacteium fortuitum,
famille des Mycobactères,
actinomycète.
Principaux symptômes
Anorexie ; Nage littorale,
Nécrose profonde évoluant en lésions
ouvertes ; Exophtalmie Dégénérescence
des nageoires
Intestin vide d’aliment.
-Sévère hémorragie de la peau
-Forte rougeur des mâchoires ;
Ballonnement ; Lésions très ouvertes au
milieu de la tête.
-Hémorragie de pétéchies ;
-Présence dans le muscle de gangrène
(petites à grandes) pleine de gaz
nauséabond.
Symptômes semblables à ceux de A.
hydrophila. Taux de mortalité 70 à 80 %
dans forme sévère.
-Lésions nécrotiques sur les lamelles
branchiales qui seront détruites
finalement ; Septicémie généralisée.
Symptômes souvent pas visibles ; parfois Thérapie : pas de bon résultat, mais la Kanamycine est conseillée
nage littorale la tête vers la bas, scoliose,
nécrose tout au long du rein.
Traitement curatif ou préventif
Thérapie : -Terramycine dans l’aliment à la dose de 2,5 g/ 45 kg de
poisson par jour pendant 10 à 12 jours ; Terramycine, chloromycétine
ou érythromycine en injection 20 mg/ 0,5 kg de poids vif pendant 3
jours.
Prophylaxie : Observer bonne mesure sanitaire de conduite
d’élevage.
Thérapie : Terramycine dans l’aliment à la dose de 2,5 g/ 45 kg de
poisson par jour pendant 10 à 12 jours ;
Prophylaxie : Observer bonne mesure sanitaire de conduite
d’élevage.
Thérapie : Terramycine dans l’aliment à la dose de 2,5 g/ 45 kg de
poisson par jour pendant 10 à 12 jours ; Prophylaxie : Observer
bonne mesure sanitaire de conduite d’élevage. Isoler et détruire les
sujets malades.
Thérapie : ne donne pas de bons résultats Prévention : Vacciner les
sujets jeunes avec de la sulfamérazine (264 mg/ kg poids vif/ jour
pendant 3 jours), de l’oxytétracycline (77 mg/ kg poids vif/ jour
pendant 3 jours).
Thérapie : Terramycine dans l’aliment à dose 2 ppm pendant 10 à 12
jours.
Prévention : Bonne mesure sanitaire d’élevage.
dans l’aliment à la dose de 100 mg/ kg poisons pendant 5 à 10 jours
30
furonculose, Aeromonas Koi herpesvirus disease
salmonicida (necrotic changes on the gills
of common carp

Doc 10: Pustules de Lymphocystis sp

Pustules de Lymphocystis sp 31
 Maladies virales rencontrées chez les poissons, agents étiologiques, principaux
symptômes et méthodes de lutte
Nom de la maladie
Lymphocytose (Figure 10)
Nécrose pancréatique infectieuse
(NPI)
Nécrose hématopoïétique
infectieuse (NHI) Figures 11 et 13
Maladie virale du poisson chat
(CCVD)
Septicémie hémorragique virale
(SHV)
Agent causal
Lymphocystis johnstonei
Famille des Iridovirus;
distribution mondiale.
Virus de NPI
Famille des Réovirus ;
distribution mondiale.
Famille des Rhabdovirus,
distribution mondiale.
Ictalurus punctatus, famille
des Herpesvirus
Famille de Rhabdovirus
distribution mondiale.
Principaux symptômes
- Hypertrophie des écailles :
présence de pustules et de
verrues, Sujets infectés pas
esthétiques ; Mortalité rare.
-Nage en vrille;
- Hydropisie (ballonnement);
-Taux de mortalités élevés (80 à chlore (eau de javel).
90 %) dans la forme sévère ;
Parfois de mortalité sans signes
apparents.
Nage erratique sur le littoral ;
-Ensellement (scoliose) du dos.
-Nage littoral excentrique à la
verticale; Ballonnement ;
-Sévère exophtalmie ;
-Anémie des branchies ;
-Taux de mortalité 100 % dans
forme sévère.
-Nage en vrille ; Oedèmes;
-Hémorragies viscérales;
-Exophtalmie ;
-Anémie branchiale.
Traitement curatif ou préventif
-Pas de traitement curatif ;
-En prévention : Ecarter les sujets
malades et les brûler, désinfecter les lieux d’élevage avec du
chlore (eau de javel).
-Pas de traitement curatif ; En prévention : Ecarter les sujets
malades et les brûler, désinfecter les lieux d’élevage avec du
-Pas de traitement curatif ; En prévention : Ecarter les sujets
malades et les brûler, désinfecter les lieux d’élevage avec du
chlore (eau de javel).
Pas de traitement curatif ; En prévention : Ecarter les sujets
malades et les brûler, désinfecter les lieux d’élevage avec du
chlore (eau de javel) ; Désinfecter les œufs et connaître la
provenance des individus.
-Pas de traitement curatif ;
-En prévention : Ecarter les sujets malades et les brûler,
désinfecter les lieux d’élevage avec du chlore (eau de javel) ou
de la soude à 0,2 % pendant 1 mn.
32
MYCOSES DES POISSONS
Pathologies Agents pathogènes
Saprolignose Saprolignia sp, Achlya sp et
Dictyuchus sp,
famille des Saproligniacés,
distribution panzootique
Branchiomycose (Gillrot Branchiomyces sanguinis
disease)
Ichtyosporidiose Ichtyophonus hoferi,
distribution panzootique
Poisson attaqué par Saprolegnia (a) et infection secondaire à
Saprolegnia
Principaux symptômes
-Nage dandinant ;
-Développement d’un duvet
cotonneux.
-Cause l’asphyxie des poissons ;
-Taux de mortalité 100 % sous la
forme sévère.
-Présence de pustules de la taille de
grain de sable sur la peau ;
-Nécrose pouvant évoluer en lésion
ouverte ;
-Lordose et scoliose présentes en cas
isolés.
Traitement curatif ou
préventif
Thérapie : Oxalate de vert de
malachite dans l’eau d’étang
jusqu’à concentration 0,05 à
0,1 ppm.
Prophylaxie : Désinfection des
oeufs avec du Wescodyne à la
dose de 25 ppm pendant 5 à 10
mn ; éviter les blessures lors
des manipulations.
Thérapie : donne de mauvais
résultats. Observation des
bonnes conditions d’élevage.
Thérapie : pas de traitement
curatif approprié. Les poissons
infectés sont porteurs à vis.
Prophylaxie : Désinfection des
lieux d’élevage avec du chlore
est fortement conseillée.
33
QUELQUES ARTHROPODES ET ANNELIDES PARASITES DES POISSONS:
branchioures, copépodes, isopodes, sangsues

Doc 39 : Copépode parasite sur le corps et les branchies Doc 40 : Sangsues sur la tête et nageoires caudale

Doc 41 : Marques de lamproie sur les poissons Doc 42 : Branchioure (Poux de poisson), Argulus sp

Doc 43 : Hirudinées ectoparasites des poissons Doc 44 : Cycle de vie des copépodes Doc 45 : Cycle de vie des hirudinées
34
 Prophylaxie: désinfection de l’eau avec la chaux vive

Lutte curative: changement de la source d’approvisionnement en eau +

élimination des sujets atteints par incinération.

35
 Tableau 5 : Maladies des animaux aquatiques notifiables à L’OIE (Office international des épizooties)

Animaux aquatiques Maladies notifiables à l’OIE

Poissons Syndrome d’ulcère épizootique (alphanomyces invadans)
Nécrose hématopoïétique épizootique (Rana virus)
Septicémie hémorragique virale (Rhabdovirus)
Virémie printanière de la carpe (Rhabdovirus)
Iridovirose de la daurade japonaise
Herpes virus de la carpe Koi
Infection par le virus de l'anémie infectieuse du saumon (Herpes)
Nécrose hématopoïétique infectieuse (Orthomyxovirus)
Infection par l’alphavirus des salmonidés
Infection à Gyrodactylus Salaris (monogènes)
Crustacées Peste de l’écrevisse (alphanomyces astaci)
Infection par le virus de la tête jaune (Okavirus)
Maladie des queues blanches
Maladie des points blancs (Whispovirus) Cameroun
Syndrome de Taura (Dicistroviridae)
Hépatopancréatite nécrosante
Myonécrose infectieuse (Totivrus)
Nécrose hypodermique et hématopoïétique infectieuse
(Bredvidensovirus) Cameroun
Mollusques Infection à Bonamia exitiosa (Protozoaire)
Infection à Bonamia ostreae (Protozoaire)
Infection à Marteilia refringens (Protozoaire)
Infection à Perkinsus marinus (Protozoaire)
Infection à Perkinsus olseni (Protozoaire)
Infection à Xenohaliotis californiensis (Rickettsie)
Infection par l'herpèsvirus de l’ormeau
Amphibiens Infection à Batrachochytrium dendrobatidis (Cameroun)
Infection à ranavirus (Cameroun) 36