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SVT au lycée
Cours de Mme Marquet et M Viora

1-2 Des édifices ordonnés

: les cristaux (SVT)

Livre p30-31-32-33-34-35

Introduction : observation de cristaux

Grotte de la mine de Naica : il s’agit d’une

cavité d’environ 35 m de long sur 20 m de
large et 8 m de haut, bourrée de gigantesques
cristaux de gypse (sélénite).

Les flocons de neige sont composés de six

branches de structure plus ou moins complexe,
formant une figure à géométrie hexagonale.

A/ Structure cristalline dans les roches

magmatiques et sédimentaires

TP Observation microscopique de cristaux

Les cristaux que l’on trouve dans la nature,

dans les roches par exemple, peuvent être
identifiés grâce à leurs propriétés
macroscopiques et microscopiques.

Observation en classe de quelques

échantillons : basalte, granite, sel (cubique et
en bloc), gypse (fer de lance et en bloc),
obsidienne, micas, cristaux bleus, silex taillé,
os, coquilles, nacre.

gypse CaSO₄,2 H₂O

Toutes les roches sont constituées d’un

assemblage de minéraux. Les minéraux sont
définis par leur composition chimique et
l’agencement de ses atomes suivant un motif
ou maille élémentaire se répétant de façon
ordonnée pour former un cristal. Dans la croûte
terrestre, les silicates constituent 97% des
roches dont le squelette est le tétraèdre de
silicium et d’oxygènes, SiO4.Il y aussi d’autre
roche comme le calcaire qui est du carbonate
de calcium ou de magnésium (CaCO3 ou
MgCO3).
http://svtlvceadevienne.comdapreshttp://svt.ac-

Roche Minéral Cristal Maille Atomes

Solidenaturelconstitué Solideauxformes Formegéométriquedéterminée
Solidenaturelconstitué
deplusieursminéraux d'unassemblagedeminéraux géométriquesparticulières parlepositionnementdesentités
chimiquesquilacomposent.

Granite SiO2(quartz) (Sio,)* chargés(ions)

Oxygène
(anion)

0-
Silicium
1cm 280pm (cation)
2cm

Lastructurecristallineestla Maillerhomboédrique
répétitiond'unitésélémentaires (ils'agits'unparallélépipèdecarles
composéesd'unemailleetdes facessontdesparallélogrammes).
Biotitenoire entitéschimiquesqu'elle
Feldspath Quartzgrismat contient.
blanc

Livre p36-37 : les cristaux dans les roches

Diaporama : structures cristallines dans des

roches magmatiques et sédimentaires

Bilan : Un composé de formule chimique

donnée peut cristalliser sous différents types
de structures qui ont des propriétés
macroscopiques différentes. Ainsi les minéraux
se caractérisent par leur composition
chimique. Celle-ci conditionne leur maille, donc
leur organisation cristalline qui détermine
finalement leur forme à l’état solide. On les
appelle alors des cristaux.

B/ Des conditions de cristallisation

différentes selon la température

TP Cristallisation de la vanilline avec une vidéo

montrant les résultats à obtenir

Le refroidissement d’un magma (ensemble de

minéraux fondus), s’accompagne de la
cristallisation progressive des minéraux.

E
n
fo
n
ct
io
n
solide cristallisé, solide amorphe
d
e
la vitesse de ce refroidissement, la
cristallisation va se dérouler
– lentement ce qui donne une roche grenue,
constituée de gros cristaux, tous jointifs
– rapidement et une partie du magma ne va
pas cristalliser et donner du verre ce qui donne
une roche microlithique, constituée de petits
cristaux noyés dans un verre.

Dans le cas des solides amorphes,

l’empilement d’entités se fait sans ordre
géométrique. C’est le cas du verre. Certaines
roches volcaniques contiennent du verre, issu
de la solidification très rapide d’une lave.

lame mince de rhyolite au microscope polarisant

En regardant dans le diaporama les systèmes

cristal
logra
phiqu
es du
mica
(biotit
e) et
de la
halite,
expliq
uer
leurs
clivages
clivag
es
respectifs (compléter le tableau suivant )

minéral système aspect explicatio

cristallographique du
(dessiner la clivage
maille)

biotite
(mica)

chlorure
de
sodium
(halite)

Pour aller plus loin

Relier la structure cristalline de certains

matériaux vus dans le chapitre sur l’albédo à
leur propriétés de réflexion de la lumière. Cet
article de Pour la Science « Du noir presque
parfait » (28/05/2019) revient en particulier sur
l’absorption presque totale permise par la
structure cristalline du Vantablack.

Dr Nozman ouvre des géodes sur YouTube et il

s’amuse bien car il en a fait toute une série.

J'AI TROUVÉ DES CRISTA…

C/ Les structures cristallines dans les

organismes biologiques

On retrouve aussi de façon très diverse dans

le monde du vivant, l’état cristallin que ce soit
en tant que squelette interne ou externe (os,
coquilles…), que moyens de défense des
plantes (raphides…), ou même de
dysfonctionnement d’organes (calculs
rénaux…). C’est la biominéralisation.

Les animaux, les plantes, les champignons et

les bactéries élaborent environ 70 types de
biominéraux différents, amorphes ou cristallins,
majoritairement à base de calcium, qui jouent
des rôles variés dans la structure de
l’organisme, la défense, la perception
sensorielle ou encore la prise de nourriture.

1. Mise en place du squelette

Livre page 38 et 39

Les cristaux constituant les squelettes, qu’ils

soient externes ou internes, confèrent le plus
souvent des propriétés mécaniques aux
structures qui les contiennent, et sont ainsi
impliqués dans des fonctions de protection et
de soutien.

Exemple 1 La nacre

L’huitre perlière, Pinctada margaritifera,

construit sa nacre lorsqu’un élément étranger
irritant entre dans la coquille de ces
mollusques. La nacre est construite couche
après couche tout autour afin de s’en protéger,
formant ainsi une ou plusieurs perles. Les
mollusques élaborent leur coquille en
favorisant la précipitation ordonnée de
carbonate de calcium (CaCO3). Le carbonate
de calcium va précipiter soit sous forme de
calcite ou d’aragonite qui adopteront souvent
des caractéristiques cristallines spécifiques.

Calcul : la phase de perliculture nécessaire

pour former une couche de nacre est d’environ
18 mois pour obtenir une épaisseur de 0,6
millimètre. Une perle exceptionnelle de 20 mm
de diamètre aura mis combien de temps à être
élaborée par l’animal ?

La nacre est constituée à 5 % de matière

organique et à 95 % de matière minérale : des
cristaux d’aragonite de formule CaCO3. La
nacre est un assemblage de plaques
polygonales d’aragonite empilées telles des
briques avec des polysaccharides et des fibres
protéiques comme mortier.Elle est construite
comme un mur, avec des briques minérales,
divisé en colonnes dans lesquelles les cristaux
sont organisés selon des directions
préférentielles, différentes des colonnes
voisines. Ceci permet d’éviter l’apparition de
plans de clivage, à l’origine de fractures. La
nacre est 3 000 fois plus dure que l’aragonite
pure, et présente une très grande rigidité et
résistance à la compression.

Exemple 2 Le squelette interne de Homo

Sapiens

La partie externe de l’os, appelée os cortical,

est un tissu osseux compact capable de
supporter de fortes pressions. Il est constitué
d’unités cylindriques, les ostéons, formés de
lamelles concentriques dans lesquelles se
situent les ostéocytes,, les cellules du tissu
osseux. Entre ces cellules, les lamelles sont
constituées de fibrilles .de collagène (protéine
fibreuse) et de matière minérale, les cristaux
d’hydroxyapatite. Le collagène est sécrété par
les ostéocytes.

Bilan de l’analyse des documents 7 et 8

La densité minérale osseuse (DMO) évolue au

cours de la vie :

Jusqu’à l’âge de 20 ans, la DMO augmente :

on passe d’une densité de 0.8 à 1.2 g/cm2. Il
y a donc plus de cristaux d’hydroxyapatite
qui se mettent en place au cours de la
croissance.
De 20 à 50 ans, la DMO stagne puis
diminue fortement après 50 ans. On passe
de 1.2 g/cm2 à 1 g/cm2 pour les hommes et
de 1.2 g/cm2 à 0.6 g/cm2 pour les femmes.
La quantité de cristaux d’hydroxyapatite
diminue donc dans les os à partir de 50
ans. Les femmes sont donc plus
vulnérables à la perte de cristaux
d’hydroxyapatite à partir de la ménopause.

Le document 8 montre que le taux de fracture

est important pour les personnes ayant un T-
score de -2.5 : on a 40 fractures pour 1000
personnes. On comprend alors que la solidité
des os dépend de la densité osseuse :

si les os sont riches en cristaux

d’hydroxyapatite alors il y aura moins de
fracture

si les os sont pauvres en cristaux

d’hydroxyapatite alors il y aura plus de
fracture

Conclusion : On peut donc faire le lien entre la

présence de cristaux et la résistance
mécanique du squelette osseux. L’arrangement
spatial des cristaux confère des propriétés de
rigidité et de résistance à la compression. Ces
propriétés sont impliquées dans le rôle de
protection des squelettes.

2.Étude d’un exemple : les calculs

Chez l’être humain, comme chez la plante, le

calcium peut être associé à de l’oxalate au lieu
du carbonate. Si chez la plante, les cristaux ont
une forme d’aiguille permettant une défense
contre les herbivores, chez l’Homme cela
correspond à une pathologie appelée calculs,
liée à une hypercalciurie.

Source
http://beaussier.mayans.free.fr/spip.php?
rubrique264

Les calculs rénaux sont de petites pierres

formées d’acides et de sels minéraux qui se
trouvent dans les reins.

Normalement, ces substances sont diluées

dans l’urine. Toutefois, lorsque l’urine est
concentrée, les minéraux peuvent se
transformer en cristaux solides et former un
calcul.

Pour aller plus loin

L’anatomie des os
l’histologie osseuse

Un article très complet qui donne plein

d’exemples de cristaux d’origine vivante

Livre p 38-39

Les cristaux produits par les êtres vivants (ici

des algues unicellulaires appelées Diatomées)
peuvent conférer des propriétés particulières
aux dépôts sédimentaires (ici, la diatomite)
issus de ces êtres vivants : Une roche peu
connue aux usages insoupçonnés : la diatomite
(25/11/2019) et une vidéo « Le verre des
diatomées » (5′)

exercice 6p44 : Les nano-cristaux des

caméléons

Livre p45 : la densité de la glace (en lien avec

l’organisation moléculaire des
solides/liquides/gaz)

L’organisation moléculaire étant déjà

connue, ce thème aborde une autre forme
d’organisation de la matière : l’état cristallin
qui revêt une importance majeure, tant pour
la connaissance de la nature — minéraux et
roches, squelettes,etc. — que pour ses
applications techniques. La compréhension
de cette organisation fournit l’occasion de
développer des compétences de
représentation dans l’espace.

Savoir fait en physique : Le chlorure de

sodium solide (présent dans les roches, ou issu
de l’évaporation de l’eau de mer) est constitué
d’un empilement régulier périodique (état
cristallin) d’ions. Plus généralement, une
structure cristalline est définie par une maille
élémentaire répétée périodiquement. Un type
cristallin est défini par la forme géométrique de
la maille, la nature et la position dans cette
maille des entités qui le constituent.
Les cristaux les plus simples peuvent être
décrits par une maille cubique que la
géométrie du cube permet de caractériser. La
position des entités dans cette maille distingue
les réseaux cubique simple et cubique à faces
centrées.
La structure microscopique du cristal
conditionne certaines de ses propriétés
macroscopiques, dont sa masse volumique.

Savoir fait en SVT Un composé de formule

chimique donnée peut cristalliser sous
différents types de structures qui ont des
propriétés macroscopiques différentes. Ainsi
les minéraux se caractérisent par leur
composition chimique et leur organisation
cristalline.
Une roche est formée de l’association de
cristaux d’un même minéral ou de plusieurs
minéraux.

Des structures cristallines existent aussi dans

les organismes biologiques (coquille,
squelette, calcul rénal, etc.).

Dans le cas des solides amorphes,

l’empilement d’entités se fait sans ordre
géométrique. C’est le cas du verre. Certaines
roches volcaniques contiennent du verre, issu
de la solidification très rapide d’une lave.

Savoir faire en SPC

Utiliser une représentation 3D

informatisée du cristal de chlorure de
sodium.
Relier l’organisation de la maille au
niveau microscopique à la structure du
cristal au niveau macroscopique.
Pour chacun des deux réseaux (cubique
simple et cubique à faces centrées) :
* représenter la maille en
perspective cavalière ;
* déterminer la compacité dans
le cas d’atomes sphériques tangents ;

* dénombrer les atomes par

maille et calculer la masse volumique du
cristal.

Savoir faire en SVT

Distinguer, en termes d’échelle et

d’organisation spatiale, maille, cristal,
minéral, roche. Les identifier sur un
échantillon ou une image. (TP Observation
microscopique de cristaux)
Mettre en relation la structure amorphe ou
cristalline d’une roche et les conditions de
son refroidissement. TP Cristallisation de la
vanilline

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