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Pour survivre et se multiplier, les cellules doivent notamment synthétiser leurs nombreuses molécules organiques. Ces réactions
nécessitent de l’énergie et de la matière. Le métabolisme est l'ensemble des transformations biochimiques qui se déroulent dans une
cellule.
Ces réactions font intervenir des enzymes. Les enzymes sont des protéines donc des produits de l'expression des gènes.
Une enzyme est une protéine qui accélère le déroulement d’une réaction chimique. Après son intervention au cours de la réaction,
elle conserve ses propriétés (elle n’est pas consommée comme un réactif) et peut continuer à agir. Une molécule qui accélère une
réaction tout en conservant son état initial en fin de réaction est un catalyseur. Les enzymes sont donc appelés catalyseurs
biologiques ou biocatalyseurs.
Les molécules transformées par une enzyme sont appelées substrats et les molécules fabriquées sont appelées produits.
Ex: l'amylase est une enzyme dont le substrat est l'amidon, elle catalyse son hydrolyse et permet la formation de sucres réducteurs
(produits).
Les enzymes sont essentielles pour les êtres vivants car elles permettent le déroulement des réactions chimiques à des vitesses
compatibles avec la vie.
Les enzymes présentes dans une cellule déterminent les réactions qui peuvent avoir lieu et contribuent ainsi de façon très importante
au phénotype cellulaire. Toutes les cellules ne possèdent pas les mêmes enzymes car elles n'expriment pas toutes les mêmes gènes.
Cette différence d'équipement enzymatique est en partie responsable de la spécialisation des cellules au sein d'un organisme
pluricellulaire. Les enzymes sont donc un marqueur de cette spécialisation.
Remarque: les gènes codant pour des enzymes indispensables au fonctionnement de base des cellules sont exprimés dans toutes les cellules.
Les propriétés des enzymes sont liées à leur mode d'action et à leur nature.
Une enzyme agit en formant une association étroite avec son substrat, on parle d'un complexe enzyme-substrat. Lorsque la réaction
est terminée, ce complexe se dissocie en libérant l'enzyme et le produit de la réaction. On peut résumer l'intervention d'une enzyme
de la manière suivante:
E + S → formation du complexe E-S temporaire permettant la catalyse de la réaction → E + P
rq: une enzyme peut utiliser en même temps plusieurs substrats et former plusieurs produits.
Les enzymes sont des protéines, elles sont donc constituées d'une chaîne d'acides aminés ayant une structure tridimensionnelle
précise. Le site actif d'une enzyme est le lieu où le substrat et l'enzyme interagissent.
Les acides aminés du site actif d'une enzyme donnée permettent d'interagir avec un substrat précis et de catalyser une réaction
précise. Le site actif est donc responsable de la double spécificité d'une enzyme.
Une mutation peut entraîner le changement de la forme d'une enzyme ou des acides aminés constituant le site actif et ainsi modifier
ou annuler son activité.