Thème 1-A-5 : Les enzymes des molécules aux propriétés

biocatalytiques

Comment expliquer cette incapacité à découper des grosses molécules ou à digérer le

lactose?

1-Les enzymes des catalyseurs biologiques

Les enzymes sont des protéines qui accélèrent la vitesse des réactions normalement
possibles dans des conditions compatibles avec la vie (température, pH). Au cours d’une
réaction, une enzyme catalyse la transformation d’un ou plusieurs substrats en produits.
Elles agissent à faible concentration et se retrouvent intactes à la fin de la réaction. Ce sont
des biocatalyseurs.

2-Le mode d’action des enzymes

L’étude de la vitesse des réactions enzymatiques s’appelle la cinétique enzymatique.
L’activité d’une enzyme est déterminée par la vitesse à laquelle elle catalyse la réaction.
Cette vitesse peut être évaluée en quantité de substrat ou de produit apparu en fonction du
temps.
La vitesse est maximale au début de la réaction : c’est la vitesse initiale. Elle se
détermine graphiquement par le tracé de la tangente à l’origine. Pour une quantité
d’enzyme donnée, cette vitesse augmente proportionnellement à la quantité de substrat
jusqu’à un certain seuil appelé Vmax. La vitesse initiale de la réaction n‘augmente plus
même si la quantité de substrat augmente. Cela se visualise sur le graphique par un
plateau qui traduit une saturation de l’enzyme pour des concentrations en substrat élevées.
L’enzyme ne peut plus catalyser la transformation d’autres molécules de substrat même si
la concentration de celui-ci augmentait.
Au cours de la réaction, l’enzyme s’associe transitoirement à un ou des substrats ce qui
forme un complexe enzyme-substrat. Quand le substrat a été transformé en produit celui-
ci se détache. L’enzyme toujours intacte peut catalyser la transformation d’autres
molécules. La vitesse maximale de réaction correspond au moment où toutes les
molécules d’enzymes sont engagées dans une réaction.

E+S ES P+E

Graphique Vi=f(S). il y a peu de

complexes enzymes-substrat pour
de faibles concentrations en
substrat, la vitesse initiale de la
réaction est faible. Elle augmente
avec la concentration en substrat
jusqu’à un certain seuil qui
correspond à un nombre maximum
de complexes enzyme substrat
 3-La double spécificité des enzymes
Comme toutes les protéines, les enzymes ont une structure tridimensionnelle déterminée
par l’enchainement des acides aminés qui les composent. Ce qui est la conséquence de
l’expression des gènes les codant. Lors de la réaction enzymatique, une interaction étroite
s’établit entre l’enzyme et son substrat. Cette interaction s’établit au niveau d’une zone
particulière de l’enzyme : le site actif.
Il s’agit d’une cavité tridimensionnelle qui a une forme complémentaire de celle du substrat.
Certains de ces acides aminés se lient au substrat et permettent ainsi la formation du
complexe enzyme-substrat. Cette zone est appelée site de fixation responsable de la
spécificité de substrat.
D’autres acides aminés de cette cavité réagissent avec le substrat et le transforment en
produit. Cette zone est appelée site catalytique responsable de la spécificité de
réaction.
Le site actif est donc constitué de deux parties, ce qui explique la double spécificité des
enzymes. Cette interaction étroite étant nécessaire au fonctionnement de l’enzyme, il est
possible d’inhiber l’action de l’enzyme, en occupant par exemple le site de l’enzyme et en
empêchant ainsi la fixation du substrat sur l’enzyme.

Représentation du site actif d’une

enzyme Magnard

Double spécificité des enzymes Hachette

4-Les enzymes, marqueurs de la spécialisation cellulaire

Les enzymes étant issues de l’expression du génome, les acides aminés qui les constituent
sont donc déterminés génétiquement, ce qui explique les propriétés de spécificité de
substrat et de réaction des enzymes
Toute mutation peut donc modifier les acides aminés de l’enzyme. Si l’acide aminé modifié
fait partie du site actif, alors l’activité de l’enzyme peut être modifiée ou supprimée.
Les gènes contenus dans le génome ne s’expriment pas tous dans une cellule. Les cellules
d’un organisme ne possèdent donc pas toutes les mêmes protéines.
Ainsi certaines enzymes ne sont présentes que dans quelques types cellulaires de
l’organisme.
Le contenu des cellules en enzymes et les enzymes étant spécifiques, alors seules les
réactions dont les enzymes sont présentes sont possibles dans la cellule: il y a donc
spécialisation cellulaire.
Les enzymes sont donc des marqueurs de la spécialisation cellulaire. Les propriétés à
l’échelle moléculaire ont donc des conséquences importantes à l’échelle de la cellule.