Chapitre IV – Les enzymes : des biocatalyseurs
Les protéines sont le support moléculaire du phénotype et indirectement responsable du
phénotype macroscopique.
Les protéines (qui peuvent être des enzymes) sont synthétisées à partir de l’ADN (information
génétique). Des différences au niveau de la séquence d’une protéine peuvent entraîner l’apparition
de nouveaux phénotypes (alternatifs).
Les enzymes sont des protéines qui interviennent dans les nombreuses réactions chimiques qui
ont lieu au sein de l’organisme.
Problèmes : Comment les enzymes peuvent-elles :
- agir sur les réactions chimiques qui se déroulent au sein de l’organisme ?
- être responsables de l’apparition de nouveaux phénotypes ?
I- La notion de catalyseur (voir TP8)
A- Définition
Un catalyseur est une substance qui :
- n’intervient pas dans l’équation d’une réaction (il se retrouve intact à la fin de la réaction)
- agit à très faible concentration
- et accélère la vitesse de la réaction (qui peut se faire mais plus lentement sans catalyseur).
B- Etude d’une réaction biochimique en présence d’enzyme
L’amylase permet d’effectuer la réaction d’hydrolyse de l’amidon (Exemple (TP8))
- sans intervenir dans l’équation de la réaction
- avec une vitesse accélérée (sans elle la vitesse est très lente)
- avec une faible concentration en enzyme (l’enzyme est retrouvée intacte en fin de réaction et
n’intervient pas dans l’équation de la réaction, c’est pour cela qu’elle peut agir à faible
concentration.)
- avec une action optimale pour des conditions compatibles avec la vie (température égale à 37°C
et pH proche de 7)
L’amylase est un catalyseur biologique.
Les enzymes sont des biocatalyseurs qui accélèrent les réactions du métabolisme : elles sont
essentielles à la vie cellulaire et elles permettent ainsi un fonctionnement correct de
l’organisme (sans elles, la vie ne pourrait exister).
Rappel : Le métabolisme cellulaire correspond à l'ensemble des réactions chimiques qui se
déroulent à l'intérieur de chaque cellule d'un être vivant et qui permettent notamment à la
cellule de se maintenir en vie, de se reproduire (se diviser) ,…
II- Les propriétés enzymatiques (voir TP9)
A- Les enzymes et leurs substrats
Le substrat est la molécule dont l’enzyme catalyse la transformation.
Les enzymes sont capables d’agir sur un seul substrat, par exemple la GOD ne dégrade que le
glucose et l’amylase n’hydrolyse que l’amidon.
Les enzymes sont spécifiques d’un seul substrat.
B- Les enzymes et leurs réactions
Exercice : Etude de la spécificité de réaction des enzymes (voir exercice du TP9)
Certaines enzymes sont capables de catalyser des réactions :
- de dégradation : hydrolyse (amylase), oxydation (GOD), …
- ou de synthèse : synthèse d’amidon, synthèse d’ADN, ….
Mais chaque enzyme n’est capable pour un substrat donné de catalyser qu’un seul type de réaction
enzymatique : par exemple, la Maltase n’effectue que la dégradation du maltose en glucose, elle
n’est pas capable de synthétiser de l’amidon à partir de maltose.
Les enzymes sont spécifiques d’une seule réaction.
III- Le mode d’action des enzymes (voir TP10)
A- L’influence de la concentration en enzyme et en substrat
Voir TP n°10 GOD et différentes concentrations en substrat
L’activité enzymatique s’évalue en mesurant la vitesse de la réaction c’est à dire :
- la quantité de produit formé en fonction du temps
- ou la quantité de substrat qui disparaît au cours du temps.
Correction du graphe Vi = f [C]
Plus la concentration de substrat est importante, plus la vitesse initiale de la réaction augmente :
dans ce cas la concentration en substrat est le facteur limitant pour la réaction.
Puis pour des concentrations plus importantes en substrat, la quantité de produit obtenu reste
constante quelle que soit la concentration en substrat : la vitesse maximale de la réaction est
atteinte.
L’enzyme est alors le facteur limitant pour la réaction. Il y a saturation des enzymes.
Plus il y a d’enzyme plus la quantité de produit formé lors de la réaction est importante.
La catalyse enzymatique dépend de la concentration en enzyme et de la concentration en
substrat disponibles dans le milieu.
B- Les étapes de la catalyse enzymatique
Reprendre le graphe Vi = f [C] : faire des schémas pour chaque étape (TP10 : cinétique
enzymatique/EXAO)
La saturation des enzymes en présence d’une quantité importante de substrat, nous indique :
- qu’il existe une étape de liaison momentanée entre l’enzyme et le substrat.
Pour catalyser une réaction l’enzyme doit d’abord se lier à son substrat et former
transitoirement le complexe enzyme-substrat avant de libérer les produits formés :
Soit l’équation :
E + S  E-S  E + P
complexe
enzyme-substrat
C- L’explication moléculaire de la catalyse
L’influence du pH et de la température sur la réaction enzymatique, nous apprennent :
- que seule une structure tridimensionnelle correcte de la protéine lui permet d’effectuer son
activité enzymatique.
Le substrat se fixe au niveau du site actif de l’enzyme.
Toute modification de cette structure portant sur quelques acides aminés peut entraîner une
perte des capacités fonctionnelles de l’enzyme.
Les propriétés des enzymes (spécificité de substrat et de réaction) s’expliquent par leur
structure 3D et en particulier par celle de leur site actif.
IV- Expression génétique et activité enzymatique des cellules
Voir exemple phénylcétonurie : documents 1 à 4 page 90.
Cellules du foie : Si Gène muté => l’enzyme PAH a une séquence différente au niveau d’un seul aa
=> structure 3D modifiée => ne fonctionne pas => cellule du foie incapable de transformer la
phénylalanine => accumulation de phénylalanine dans le sang (dosage pour test de dépistage) =>
troubles neurologiques (retard mental et troubles du comportement).
Une mutation au niveau d’un gène codant pour une enzyme peut entraîner la modification de
la séquence en acides aminés de cette enzyme (protéine) et donc du phénotype moléculaire.
Toute modification de la structure spatiale des enzymes peut changer leurs activités (perte
ou modification de fonction) et donc entrainer des dysfonctionnements du métabolisme
cellulaire (phénotype cellulaire).
Ce qui peut aussi avoir des conséquences au niveau de l’organisme (phénotype macroscopique).
L’activité enzymatique d’une cellule est le résultat de l’expression de son information
génétique.
Voir exemple chou d’ornement : documents 5 à 8 page 91.
Cellules des feuilles : Si Gènes exprimés différemment => équipements enzymatiques différents pour les
différentes cellules en fonction de l’âge des feuilles => métabolismes différents : production
d’anthocyanes (feuilles jeunes) ou de chlorophylles (âgées) liés à la spécialisation.
Les cellules d’un organisme sont spécialisées : elles ont des fonctions différentes.
Leur fonctionnement dépend de l’équipement enzymatiques qu’elles possèdent (diversité et
quantité d’enzymes).
Toutes les cellules ont la même information génétique mais, en fonction de l’expression de
leurs gènes, leur équipement enzymatique varie.
L’équipement enzymatique d’une cellule correspond à un marqueur de sa spécialisation.
Les enzymes sont des marqueurs de spécialisation.
V- Bilan
Les protéines enzymatiques sont des catalyseurs de réactions chimiques spécifiques dans le
métabolisme d’une cellule : ce sont des catalyseurs biologiques.
Les enzymes présentent une double spécificité : spécificité d’action et de substrat.
La structure tridimensionnelle de l’enzyme lui permet d’interagir avec ses substrats en
formant un complexe enzyme-substrat. Cela explique ses spécificités en termes de substrat
et de réaction catalytique.
Les enzymes, issus de l’expression génétique d’une cellule, sont essentielles à la vie cellulaire
et sont aussi des marqueurs de sa spécialisation.
Notions fondamentales : catalyse, substrat, produit, spécificité.
Schéma bilan : copier le schéma du livre page 93.
Lien avec les chapitres précédents :
La structure tridimensionnelle de l’enzyme peut être modifiée, par exemple suite à des mutations
qui induisent des changements de la séquence en acides aminés.
Ces modifications peuvent donc entraîner une modification de l’activité de l’enzyme (perte de
fonction) ce qui contribue à la réalisation de phénotypes alternatifs au niveau cellulaire puis
macroscopique.