TRAVAUX DIRIGES DE BIOCHIMIE METABOLIQUE

BIOENERGETIQUE
CORRIGE
PROF. M. NEJMEDDINE P-2022

Problème 1 :

Calculer la variation de l’énergie libre standard des réactions suivantes, en utilisant la constante
d’équilibre, à 25oC et pH=7.

La variation de l’énergie libre standard est donnée par la relation :

G’o= -2,303 RT log K’e
= -5706,53 log K’e , sachant que R= 8,315 J/mole.K et T= 298K.

a/ Glutamate + Oxaloacétate Aspartate aminotransferase Aspartate +ketoglutarate K’eq=

6,8

G’o= -5706,53 log K’e.

= -5706,53 x log 6,8
= -5706,53 x 0.83
= -4736,42 J/mole
=-4,7 KJ/mole

b/ Dihydroxyacétone phosphate Triose phosphate isomerase Glycéraldéhydes 3-phosphat K’eq =

0,0475

G’o = -5706,53 log K’e.

= -5706,53 x log 0,0475
= -5706,53 x (-1.32)
= 7532,62 J/mole
= 7,53 KJ/mole

c/ Fructose 6-phosphate + ATP Phosphofructokinase Fructose 1,6-biphosphate K’eq=

254

G’o = -5706,53 log K’e.

= -5706,53 x log 254
= -5706,53 x 2,40
= 13695,67 J/mole
= -13,69 KJ/mole
Problème 2 :

Calculer la constante d’équilibre des réactions suivantes, en utilisant la variation de l’énergie

libre standard, à 25oC et pH=7, donnée dans le tableau 2 :
On utilisera la relation : G’o= -2,303 RT log K’e
log K’e = G’o / (-2,303 RT)
= G’o / (-2,303 x 8,315 x 298)
= G’o /-5706,53

a/ Glucose 6-phosphate + H2O Glucose 6-phosphatase Glucose + Pi

G’o = -13,8 KJ/mole = -13800 J/mole,

d’où, log Ke = -13800/-5706,53
= 2,41,
Donc Ke = 257

b/ Lactose + H2O -galactosidase Glucose + galactose

G’o = -15,9 KJ/mole = -15900 J/mole,

D’où log Ke = -15900/-5706,53
= 2,78
Donc Ke = 602

c/ Malate Fumarase Fumarate + H2O

G’o = 3,1 KJ/mole = 3100 J/mole,

d’où log Ke = 3100/-5706,53
=-0,54
Donc Ke = 0,28

Problème 3 :

Considérer l’interconvertion suivante, qui se déroule lors de la glycolyse :

Fructose 6-phosphate glucose 6-phosphate K’eq= 1,97

1. Quelle est le G’o de la réaction aux conditions standard ?

G’o= -2,303 RT log K’e
=-2,303 x 8,315 x 298 x log 1,97
= -1654,8937
= -1,65 KJ/mole
2. Si la concentration du fructose 6-phosphate est ajustée à 1,5M et celle du glucose 6-
phosphate est ajustée à 0,50M, quelle est G?
G= G’o + 2,303 RT log Ke
= (-1654, 89) + 2,303 x 8,315 x 298 x log (0,5/1,5)

1 TD de Bioénergétique (SV4), Printemps 2022 Prof. M. Nejmeddine

 = (-1654, 89) + (5706, 53) x (-0,48)
= (-1654, 89) + (-2739,13)
= -4394,0244
= -4,39 KJ/mole

3. Pourquoi G et G’o sont-elles différentes ?

Aux conditions standard (1M, 1 atm, 25oC et pH 7) G’o est fixe pour n’importe quelle
réaction. Par contre, G est variable et peut être calculée pour n’importe quelle
concentration au cours de la réaction.

Problème 4 : Détermination expérimentale de la variation de l’énergie libre standard (G’o)

de l’hydrolyse de l’ATP.
La mesure directe de G’o l’hydrolyse de l’ATP est techniquement difficile à réaliser, car
la concentration de l’ATP à l’équilibre ne peut être mesurée avec exactitude. Cependant, G’o
de l’hydrolyse de l’ATP peut être déterminée à partir des constantes d’équilibre, plus
stable, des deux réactions enzymatiques suivantes :
Glucose 6-phosphate + H2O → glucose + Pi K’e1=270

ATP + glucose → ADP + glucose 6-phosphate K’e2=890

1. Ecrire la somme des deux réactions.

ATP + H2O → ADP + Pi (on accepte aussi ATP → ADP + Pi)

2. Calculer G’o de l’hydrolyse de l’ATP, à 25oC.

G’°1= -5,706 x log(270) = -13,85KJ/mole
G’°2 = -5,706 x log(890) = -16,82 KJ/mole
G’°= G’°1 + G’°2 = -30,67 KJ/mole
ou bien G’o= -2,303xRT log (Ke1xKe2),
ou bien -2,303xRT (log(Ke1) + log(Ke2))
En déduire le G’o de la synthèse de l’ATP.

G’o synthèse = +30, 67 KJ/mole.

3. Calculer la variation de l’énergie libre pour la synthèse de l’ATP dans l’hépatocyte de

rat, sachant que dans le cytosol de l’hépatocyte de rat le quotient d’action de masse de
l’ATP est : Q= [ATP]/[ADP][Pi]= 533.103 mM-1.
G synthèse =G’o synthèse + 2,303RT log(533) = 30,67 + 5,706 (2,72) = 46,19 KJ/mole

Problème 5 :

Dessiner la courbe représentant G en fonction de lnQ, à 25oC, pour les concentrations

suivantes de l’ATP, ADP et Pi., sachant que G’o de la réaction est de -30,5KJ/mole. Q étant le
quotient d’action de masse de l’ATP (Q= [ATP]/[ADP][Pi]).

2 TD de Bioénergétique (SV4), Printemps 2022 Prof. M. Nejmeddine

 Concentrations en mM

ATP 5 3 1 0,2 5

ADP 0,2 2,2 4,2 5,0 25

Pi 10 12,1 14,1 14,9 10

Ke 0,4 8,87 59,22 372,5 50

In Ke -0,91 2,18 4,08 5,92 3,91
G (KJ/mole) -28,24 -25,098 -20,39 -15,83 -20,81
Q = [ATP]/[ADP] 25 1.36 0,23 0,04 0,2
In Q 0,91 -2,2 -2,65 -6,21 -3,91

0
-4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4
-5

-10
G

-15

-20

-25

-30
InQ= [ATP]/[ADP]

Expliquer à partir de la courbe pourquoi le métabolisme est-il régulé pour garder le rapport
[ATP]/[ADP] élevé ?
D’après la courbe, on observe que :
1. Lorsque le rapport ATP/ADP est faible <<<1, G de l’hydrolyse de l’ATP est basse (moins
négative).
2. Lorsque le rapport ATP/ADP élevé, le G de l’hydrolyse de l’ATP est élevé (plus négative).
On peut en déduire que le métabolisme est régulé pour garder le rapport ATP/ADP élevé car ceci
permet de mettre à disposition une énergie libre élevée (plus négative).

Problème 6 : Réactions d’oxydo-réductions.

Une série de réactions d’oxydo-réductions ont eu lieu au niveau du complexe NADH
déshydrogénase de la chaine respiratoire mitochondriale. Ces réactions sont décrites ci-
dessous ; où Fe3+ et Fe2+ représentent l’atome de Fer dans les complexes Fer-Sulfure, Q est
l’Ubiqinone, QH2 est l’Ubiquinol et E est l’enzyme.

1. NADH + H+ + E-FMN → NAD+ + E-FMNH2

2. E-FMNH2 + 2Fe3+ → E-FMN + 2Fe2+ + 2H+
3. 2Fe2+ + 2H+ + Q → 2Fe3+ + QH2

3 TD de Bioénergétique (SV4), Printemps 2022 Prof. M. Nejmeddine

 a. Ecrire la réaction globale :

NADH + H+ + Q → NAD+ + QH2

Pour chacune des 3 réactions (1., 2. et 3.) catalysées par le complexe NADH déshydrogénase,
identifier :
a. Le donneur d’électrons.

1./ ……………..NADH………………………..2./……………E-FMNH2…………………3./…………Fe2+……………

b. L’accepteur d’électrons.
1./………………E-FMN……………… ……2./……………… Fe3+………………………3./……………Q……………………

c. Les paires de couples redox.

1./…………NADH/NAD+ et E-FMNH2/E-FMN…………………
2./………… E-FMNH2/E-FMN ………et ………Fe2+/Fe3+……………………………
3./……… Fe2+/Fe3+……………………et ……………QH2/Q…………………………….
d. L’agent oxydant.
1./……………… E-FMN …………………2./…………… Fe3+………………………3./……………… Q ………………….
e. L’agent réducteur.
1./……………………… NADH …………2./………… E-FMNH2………….……3./……………… Fe2+………………….

Problème 7 : Réactions d’oxydo-réductions.

Quel que soit le couple redox, le potentiel de réduction standard E’o est définit par la réaction
dans la demi-cellule :
Agent oxydant + nē Agent réducteur
Les valeurs E’o pour les couples redox NAD+ /NADH et le pyruvate/lactate sont respectivement,
- 0,32V et -0,19V.

1. Quel couple redox aura tendance à perdre les ē ? Expliquer.

NAD+ /NADH, car il possède le potentiel de réduction E’o le plus négatif.
2. Quel couple est l’agent oxydant le plus fort ? expliquer.
Pyruvate/lactate, car il possède le potentiel de réduction E’o le moins négatif.
3. Commençant par une concentration de 1M de chaque réactant et de chaque produit, à
pH 7 et à 25oC, dans quel sens se poursuivra la réaction suivante ?

Pyruvate + NADH + H+ lactate + NAD+

Dans le sens de la formation du lactate.

4. Quelle est le G’o de la conversion du pyruvate en lactate ?

G’o= -nF E’o
= -2 (96500 J /V.mole) (E’o (accepteur) - E’o (donneur))
= -2 (96500) x (-0,19V – (-0,32V))
= -25090 J/mole
4 TD de Bioénergétique (SV4), Printemps 2022 Prof. M. Nejmeddine
 = -25,09 KJ/mole
5. Quelle est la constante d’équilibre de cette réaction ?
G’o = -2,303 RT logK’e
D’où log K’e = G’o/-2,303RT
= -25090/-5706,53
= 4.57
Donc K’e = 3,7.104

Problème 8. Combien de protons y a-t-il dans une mitochondrie ?

Le transfert les protons de la matrice de la mitochondrie vers le milieu extérieur, permis

d’établir un gradient de pH à travers la membrane interne (l’extérieur est plus acide que
l’intérieur). La tendance des protons à retourner dans la matrice est la force qui sert à synthétiser
l’ATP par l’ATP synthase.

Lors d’une phosphorylation oxydative par une suspension de mitochondrie dans un milieu à pH
7,4 ; le pH de la matrice étant de 7,7.

a) Calculer [H+] dans le milieu extérieur et dans la matrice dans les conditions décrites
ci-dessus.

pH= -log10 [H+] donc,

- Dans la matrice [H+] = 1,99.10-8M. (C1)
- Dans le milieu extérieur [H+] = 3,98.10-8M. (C2)
b) Quel est le ratio « outside-to-inside » des [H+}, en déduire l’énergie liée à cette
différence.
G = 2,3 RT.log10 (C2/C1), Le ratio outside/inside = C2/C1 = 2,
Donc G = 2,3x(8,315)x(298)x(0,3) = 1,7 KJ/mole

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