Product ion , extraction et purification de Cellulase par
différents espèces Matériel et Méthodes Isolement, criblage et identification de champignons cellulolytiques: Les champignons ont été isolés à partir de copeaux de bois collectés sur le campus de Gandhi Krishi Vigyan Kendra (GKVK).du campus de Gandhi Krishi Vigyan Kendra (GKVK), Bangalore . Les copeaux de bois ont été immergés dans de l'eau distillée pendant 1 h et 0,1 ml de liquide a été inoculé.pendant 1 h et 0,1 ml du liquide a été inoculé sur un milieu desur un milieu carboxy-méthyl-cellulose (CMC) composé de 1% de CMC, 0,5 g de tartrate d'ammonium, 0,1 g deKH2PO4, 0,005 g MgSO4.7H2O, 0,1 g d'extrait de levure,0,0001 g CaCl2.2H2O, 1,6 g d'agar et 100 ml d'eau distillée.distillée. Les champignons capables de produire de la cellulase ont été sélectionnés par la méthode du colorant rouge Congo.par la méthode du colorant rouge Congo et les isolats ont été sélectionnés sur la base de la largeur de la zone de détection.ont été sélectionnés sur la base de la largeur de la zone de dégagementautour des colonies sur les plaques fongiques. Le champignonproduisant la zone de dégagement la plus large a été sélectionnépour le présent travail. L'identification morphologique et moléculairemoléculaire de l'isolat sélectionné a été réaliséeà l'aide du séquençage de l'ITS 1. La séquence a été soumise à laGen Bank et le Pour la coloration de l'activité, 1% de CMC Caractérisation des enzymes Coloration de l'activité
(w/v) a été ajouté à 1% d'agarose (w/v)
dissous dans 25 ml de tampon phosphate 0,05 M (pH 7.0)et versé sur les boîtes de Pétri après avoir été chauffé. Des puits ont été perforés et 0,05 ml de solution enzymatique a été transféré dans chaque puits et incubé dans une chambre humide à 25 C pendant 24h. Le gel est coloré avec 1% de colorant rouge Congo et la formation d’une zone jaune Le pH le plus approprié requis pour une cellulase maximale,l’activité a été déterminée en faisant varier le Effet du pHe t de l a te mpéra ture sur l a production d’e nz ymes
pH de 3 à 9 en utilisant différentes solutions tampons.
La température optimale a été déterminée en vérifiant l’activité enzymatique à des températures allant de 5 à 50 °C. Effet de divers ions métalliques et de réactifs sur l'activité enzymatique Le rôle des ions métalliques, le cas échéant, sur l’activité enzymatique a également été vérifiée. Ions métalliques tels que Ca2+, Mg2+, Fe2+,Na+, K+, Mn2+, Co2+, Hg2+, Cu2+, Fe3+ et Zn2+ étaientessayé à une concentration de 5 mM. Les mesures ont été réalisée en présence de différents groupes spécifiques des réactifs comme l’EDTA, la FDS, le béta-mercaptoéthanol, le PMSF,DTT, azoture de sodium et Triton X-100, pré- incubés dansles échantillons pendant une demi-heure. L’activité a été analyséepar des méthodes de dosage standard. Détermination des paramètres cinétiques Purified enzyme was incubated with various concentrations of soluble pure CMC substrate in 4.8 mM sodium citrate buffer pH 4.8, at temperature 45 C. Kinetic parameters KM and Vmax were calculated by Linewea
L’enzyme purifiée a été incubée avec diverses
concentrations de substrat CMC pur soluble dans 4,8 mM tampon de citrate de sodium pH 4,8, à la température 45 C. Les paramètres cinétiques KM et Vmax ont été calculés par Parcelles Lineweaver-Burk.ver-Burk plots. Les cellulases sont connues pour décomposer la cellulose en structures monomères, c’est-à-dire sous- unités de glucose. Pour tester l’activité de l’enzyme isolée du champignon, pure la carboxyméthylcellulose (CMC, 1 %) a été utilisée dans les tôles fortes test. Dans le milieu complété par le colorant Congo red et l’iode, une zone de clairance a été produite autour de la colonie fongique à cause de l’enzyme dégagé. La largeur de la zone de dégagement indique la capacité de l’enzyme à hydrolyser la cellulose. Travail fait par Gohel et al. [17] suggère que l’enzyme dégrade la CMC pure et est connue pour montrer une zone de dégradation. L’enzyme décompose le polysaccharide à cause de laquelle la zone entourée par l’enzyme se réduit à des monosaccharides plus petits. Le colorant ne peut pas se lier efficacement au monosaccharideet qui aboutit à la formation d’une zone dégagée. Ila été suggéré par Gomashe et al. [13] que les colonies fongiques présentant une zone de dégradation plus large sontproducteurs de cellulase. Dans la présente étude, Trichodermalongibrachiatum (KM274866) s'est avéré être le meilleur dégradeur de cellulose parmi tous les champignons testés, avec une zone de dégagement maximale comme le montre la figure 1. La relation phylogénétique de l'isolat fongiquea montré une similarité de 99 % avec Trichoderma longibrachiatum. Il a donc été considéré comme un nouvel isolat local de l'espèce T. longibrachiatum.l'espèce T. longibrachiatum. Lorsque la quantité de cellulase produite par l'isolat de Trichoderma longibrachiatum sur le substrat naturel, c'est-à-dire la bagasse de canne à sucre, a été comparée à la quantité produite par d'autres isolats de Trichoderma longibrachiatum,de canne à sucre, a été comparée à la quantité produite dans d'autresrésidus agricoles, la quantité produite dans la bagasseétait la plus élevée parmi tous les substrats testés(Figure 2). Ce résultat est conforme aux conclusions de Singhania et al [18] et de Cunha et al [19] qui ont rapporté que la bagasse de canne à sucre était le substrat le plus productif que la bagasse de canne à sucre est le meilleur inducteur de cellulase dans les champignons.dans les champignons. Ojumu et al [20] ont signalé que l'activité de la cellulase variait en fonction du substrat utilisé pour la culture du champignon.Le Le profil d'élution de la cellulase de Trichoderma longibrachiatum par la méthode FPLC est présentée à la figure 3. L'échantillon a montré un pic majeur à 23,8 ml/min et un pic de conductance à 24,69 ml/min.La pureté de la cellulase des fractions d'élution a été vérifiée par SDS-PAGE (figure 4) et le poids moléculaire de l'enzyme s'est avéré être de 67 § 1 KDa. L'apparition d'une seule bande sur le gel prouve la pureté L'apparition d'une seule bande sur le gel prouve la pureté de la cellulase. Yasmin et al [21] ont rapporté un poids moléculaire de 87 KDa pour la cellulase isolée de Trichoderma viride, ce qui est très élevé et prouve que les champignons produisent également des enzymes ayant un poids moléculaire élevé. Le poids moléculaire obtenu dans la présente étude se compare bien aux valeurs rapportées dans la littérature pour la cellulase de plusieurs bactéries et champignons cultivés sur différents substrats[22]. La figure 5a montre que l'enzyme est stable dans une large gamme de pH, avec une activité maximale à un pH de 4,8. Les résultats de la présente étude sont conformes à ceux de Li et al. les résultats de Li et al. [23], qui ont constaté qu'un pH compris entre4,8 et 5,0 convenait aux champignons pour la production de cellulase. En ce qui concerne l'effet de la température, l'enzyme actuelle a exprimé une activité maximale à une température de 45 C (figure 5b). Les conclusions de Fayyaz et al.[24] qui ont rapporté une température optimale de 40-50 C pour l'enzyme de Planococcus citri sont conformes à nos résultats. L'enzyme était stable à 30-55 C, ce qui pourrait être un facteur positif du point de vue de sa production commerciale. Le tableau 2 montre les effets des réactifs spécifiques au groupe sur l'activité enzymatique. En présence de Triton X 100, l'activité enzymatique s'est accrue de 5,131 U/ml d'enzyme. Le Triton X100 a pu augmenter la perméabilité de la membrane cellulaire, ce qui a permis d'améliorer le transport membranaire et, par conséquent, d'augmenter l'activité de la cellulase. Toutefois, le réactif EDTA a eu un effet négatif sur l'activité de la cellulase, L'EDTA est un agent chélateur de métaux et la réduction de l'activité enzymatique suggère que l'activité peut dépendre de certains chélateurs métalliques nécessaires à des réactions chimiques spécifiques. Il est possible que cela des groupes inorganiques qui sont inactivés par l'EDTA.EDTA. Le SDS, le b-mercaptoéthanol, le PMSF, le DTT et l'azoture de sodium n'ont pas eu d'effet significatif sur les cellules.Des observations similaires ont été faites par Callow et al. etDanmek et al [27,28] . Les constantes cinétiques obtenues à partir d'un tracé de Lineweaver-Burk (figure 6) pour la cellulase de Trichoderma longibrachiatum suggèrent une forte affinité de l'enzyme pour le substrat. Les valeurs KM et Vmax de l'enzyme sont les suivantesde l'enzyme étaient de 0,121 mg/ml et de 0,421 mmol/min. Conclusion Dépistage des copeaux de bois pour les champignons producteurs de cellulase a donné lieu à un isolat de champignon très efficace, identifié comme Trichoderma longibrachiatum, qui est un nouvel isolat de l’espèce disponible localement. La recherche d’un Substrat naturel et peu coûteux pour la culture de le champignon parmi les sources agricoles disponibles localement, aux fins de la production de cellulase, nous a conduits àsugarcane bagasse which is a lignocellulosic agricultural residue. In the present study, sugarcane bagasse was used as the sole carbon source for the cultivation of the fungus. Cellulase produced from this new fungal isolate showed all the characteristics of an efficient enzyme with high substrate affinity and high cellulolytic activity. The enzyme had an optimum pH of 4.8, with enzyme stability over the range 3–6. The optimum temperature was 45 C, with a tolerance range of 30– 55 C. The optimum pH and temperature are most suitable for the industry to mass produce the fungus. Metal ions and the detergent Triton 100 improved the enzyme activity. The purified enzyme had a molecular weight of 67 § 1, KM 0.121 mg/ml, and Vmax 0.421 mmol/min. Its specific activity was 30 U/mg of protein. The above characteristics of the enzyme make it very useful in commercial production of bioethanol (biofuel) from an inexpensive starting material (sugarcane bagasse). Disclosure statemen