Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
2
La
nature
du
vivant
Introduction
Introduction
Dans
lUnivers,
il
y
a
118
lments
chimiques
diffrents
connus,
dont
94
existent
l'tat
naturel
sur
Terre.
Mis
part
l'hydrogne
et
une
petite
partie
de
l'hlium,
qui
ont
exist
ds
le
dbut
de
l'Univers,
tous
les
autres
lments
naturels
ont
t
fabriqus
l'intrieur
de
plusieurs
gnrations
d'toiles
par
des
ractions
thermonuclaires.
Abondance
relative
des
lments
chimiques
dans
lUnivers
Au
rythme
des
supernovae
(explosion
dtoiles
massives)
et
des
nbuleuses
plantaires
(formations
des
systmes
plantaires),
des
molcules
chimiques
se
forment
dans
le
milieu
interstellaire
(entre
les
toiles).
Cette
formation
dlments
(nuclosynthses)
ne
se
limite
pas
des
lments
simples,
des
molcules
complexes
se
forment
galement.
Bref
aperu
des
molcules
chimiques
prsentes
dans
le
milieu
interstellaire
Pour
que
lvolution
molculaire
se
poursuive,
il
faut
un
milieu
dense,
qui
favorise
les
contacts,
un
milieu
protecteur
et
un
milieu
temprature
modre
qui
acclre
les
ractions
sans
dtruire
les
molcules
fragiles.
Ces
conditions
sont
ralises
sur
les
plantes.
Cest
donc
sur
la
Terre
que
nous
allons
poursuivre
la
dcouverte
de
la
nature
du
vivant.
1-
La
composition
des
tres
vivants
Les
tres
vivants
sont
constitus
dlments
chimiques
disponibles
sur
le
globe
terrestre.
Le
tableau
priodique
des
lments
ou
table
de
Mendeleev
rpertorie
lensemble
des
lments
disponibles
sur
Terre.
Les
lments
avec
une
bordure
continue
grise
peuvent
tre
trouvs
naturellement
sur
Terre,
sous
la
forme
d'un
ou
plusieurs
isotopes
stables.
Les
lments
avec
une
bordure
en
tirets
noirs
apparaissent
naturellement
lors
de
la
dsintgration
d'autres
lments
chimiques,
mais
n'ont
pas
d'isotopes
plus
anciens
que
la
Terre.
Les
lments
avec
une
bordure
en
pointills
bleus
sont
artificiels
(lments
synthtiques),
crent
par
lHomme.
Cest
donc
partir
de
lensemble
de
ces
atomes
et
des
molcules
complexes
interstellaire
(voir
introduction)
que
les
molcules
de
la
vie
(les
briques
du
vivant)
ont
merg.
2-
La
biochimie
de
la
vie
2-1-
Le
monde
inerte
et
le
monde
vivant
Les
proportions
des
lments
chimiques
sont
diffrentes
dans
le
monde
inerte
(qui
est
sans
activit
propre
ex
:
les
minraux
constitutifs
des
roches,
leau
de
mer)
et
dans
le
monde
vivant
.
Tableau
de
comparaison
de
labondance
relative
des
lments
entre
le
vivant
et
linerte
On
distingue,
en
fonction
de
leur
importance
chez
les
tres
vivants,
les
lments
majeurs
qui
sont
en
quantit
suprieure
1%,
les
lments
biognes
dont
limportance
est
moindre,
et
les
oligolments
souvent
prsents
ltat
de
traces
et
dont
labsence
entraine
diverses
carences.
Le
silicium
est
abondant
dans
la
lithosphre
o
il
forme
de
trs
nombreux
composs
stables
tandis
que
lazote,
rare
dans
la
lithosphre,
est
un
constituant
important
des
tres
vivants.
Loxygne
est
un
lment
commun
au
monde
vivant
et
au
monde
minral.
La
liste
des
lments
les
plus
abondants
de
la
biosphre
peut
se
rsumer
symboliquement
par
la
formule
CHNOPS
(Carbone,
Hydrogne,
Azote(N),
Oxygne,
Phosphore,
Soufre)
2-2-
La
richesse
en
eau
du
vivant
La
majorit
de
loxygne
et
de
lhydrogne
contenu
dans
un
organisme
vivant
est
sous
la
forme
deau.
Cette
eau
participe
aux
ractions
chimiques
de
lorganisme
et
est
un
lment
stabilisant
majeur
du
monde
vivant.
Les
tres
vivants
sont
constitus
majoritairement
deau.
Pour
lHomme,
la
quantit
deau
varie
en
fonction
de
lge
2-3-
les
molcules
chimiques
constitutives
des
tres
vivants
Les
lments
chimiques
se
rpartissent
dans
les
diverses
molcules
chimiques
des
tres
vivants.
Bilan :
La
matire
organique
caractristique
des
tres
vivants
est
matrialise
par
un
nombre
restreint
de
catgories
molculaires.
Ce
constat
peut
justifier
lide
dune
relative
unit
chimique
du
vivant.
Cette
unit
chimique
des
tres
vivants
est
un
indice
de
leur
parent.
Voici
quelques
exemples
de
molcules
biologiques
produites
par
les
tres
vivants
:
3-
Les
cellules
sont
les
units
de
bases
de
tous
les
tres
vivants
La
cellule
(du
latin
cellula
qui
signifie
petite
chambre)
est
lunit
structurale
des
tres
vivants.
Elle
constitue
lunit
de
base
de
la
construction
dun
organisme.
Les
tres
vivants
peuvent
tre
composs
:
Un
procaryote
(du
latin
pro,
avant
et
du
grec
karuon,
noyau)
est
un
tre
vivant
dont
les
cellules
ne
comportent
pas
de
noyau
ni
d'autres
organites.
Les
premiers
procaryotes
taient
peut-tre
dj
prsents
il
y
a
plus
de
3,6
milliards
dannes.
Schma
dune
cellule
de
procaryote
type
(tous
les
procaryotes
de
possdent
pas
lassociation
de
lensemble
des
structures
cellulaires
prsentes
sur
le
schma)
Quelques
exemples
de
cellules
procaryotes
Metallireducens
bacteria
Salmonella
sp.
Francisella
tularensis
Escherichia
coli
Streptococcus
pneumoniae
Staphylococcus
sp.
3-3-
La
cellule
eucaryote
La
majorit
des
organismes
vivants
actuellement
rpertoris
sont
des
eucaryotes.
Leurs
tailles
et
leurs
complexits
sont
trs
variables,
allant
de
lorganisme
unicellulaire
des
pluricellulaires
hautement
organis,
comme
le
squoia
ou
une
baleine.
Par
souci
de
simplification,
nous
regrouperons
les
organismes
eucaryotes
en
4
grandes
familles
:
les
animaux,
les
vgtaux,
les
champignons
et
les
protistes.
(Remarque
:
cette
classification
est
arbitraire
et
ne
correspond
pas
la
classification
phylogntique
actuelle,
que
vous
apprendrez
plus
tard)
Spirogyra
sp.
Amoeba
proteus
Arcella
sp
Euglena
clavata
B
-
Quelques
exemples
de
cellules
appartenant
des
organismes
pluricellulaires
Daphnia
sp.
Cellules
pidermiques
Cellule
pidermique
Cellules
pidermiques
de
Primula
veris
Loasacea
sp.
Kleina
tomentosa
Macrophages
humains
Hmaties
et
lymphocyte
Aspergillus
fumigatus
Neurone
de
rat
attaquant
un
parasite
humain
4
-
Les
caractristiques
structurales
des
cellules
eucaryotes
Les
organismes
eucaryotes
(du
grec
eu,
vrai
,
et
du
grec
karuon,
noyau)
sont
caractriss
principalement
par
des
cellules
spares
du
milieu
extrieur
par
une
membrane
:
la
membrane
plasmique
ou
membrane
cellulaire.
Elles
possdent
galement
un
noyau
dlimit
par
une
membrane,
la
membrane
nuclaire.
Le
compartiment
intracellulaire
comprend
de
nombreux
organites,
des
lments
intracellulaires
spcialiss
qui
sont
dlimits
par
une
ou
deux
membranes
qui
baignent
dans
un
liquide
appel
cytosol.
Lensemble
des
organites
plus
le
cytosol
constitue
le
cytoplasme.
La
plupart
des
organites
sont
prsents
chez
les
cellules
eucaryotes
animales
et
vgtales,
certains
cependant
sont
spcifiques
des
cellules
vgtales.
Le
programme
gntique
dun
individu
(caractristiques
physiques,
mtaboliques,
etc.)
est
contenu
dans
le
noyau
des
cellules
eucaryotes.
5-3-La
nature
chimique
de
la
molcule
dADN
Une
molcule
dADN
est
forme
de
deux
chaines
(ou
brins)
enroules
lune
autour
de
lautre
en
double
hlice.
Chaque
brin
est
constitu
de
lassemblage
dunits
lmentaires
appeles
nuclotides.
Un
nuclotide
est
form
par
lassociation
de
trois
types
de
molcules
diffrentes
:
Un
sucre
:
le
dsoxyribose
Un
acide
phosphorique
Une
base
azote.
Il
existe
4
bases
azotes
diffrentes,
donc
4
nuclotides
diffrents
:
Adnine,
Thymine,
Guanine,
Cytosine
Pour
former
la
double
hlice,
les
nuclotides
sassocient
deux
deux
(par
complmentarits
de
bases).
Le
changement
dun
seul
nuclotide
de
lADN
peut
entrainer
la
modification
dun
acide
amin
de
la
protine
correspondante.
Ce changement dun seul acide amin modifie la structure de la protine et altre son fonctionnement.
Lenchanement
des
nuclotides
de
lADN
peut
tre
modifi
:
on
parle
alors
de
mutation.
Les
mutations
sont
lorigine
des
nouveaux
allles
des
gnes.
Les
mutations
sont
donc
lorigine
de
la
variabilit
gntique
au
sein
des
espces
(par
exemple
:
couleur
des
cheveux
noir,
blond,
brun).
6-1-Les
agents
mutagnes
Les
mutations
sont
des
vnements
qui
se
produisent
naturellement
et
continuellement
au
sein
de
la
molcule
dADN.
Certains
agents
de
lenvironnement
appels
agents
mutagnes
augmentent
les
frquences
des
mutations.
Il
existe
:
-
Des
agents
physiques
:
rayons
X,
radioactivits,
rayons
ultra-violets,
rayons
cosmiques,
-
Des
agents
chimiques
:
benzne,
nitrosamine,
tolune,
amiante
La
consquence
dune
mutation
est
diffrente
selon
le
type
de
cellules
quelle
affecte
:
A-
Mutations
somatiques
Les
cellules
somatiques
(soma,
corps)
sont
les
cellules
de
lensemble
du
corps.
Les
mutations
somatiques
nont
de
consquences
quau
niveau
de
lorganisme
porteur
de
la
mutation.
B-
Mutations
germinales
Les
cellules
germinales
ou
germen,
sont
issues
des
cellules
souches
et
peuvent
former
les
spermatozodes
et
ovules).
Les
mutations
germinales
peuvent
donc
se
retrouver
porte
par
une
cellule
uf
lorigine
dun
nouvel
individu.
Cette
mutation
va
alors
se
transmettre
de
gnration
en
gnration.
Aujourdhui,
la
plupart
des
gnes
possdent
plusieurs
allles
:
ces
allles
sont
ns
par
mutation
au
cours
de
lvolution
des
espces.
7-
Les
caractristiques
fonctionnelles
des
cellules
Les
cellules
sont
galement
des
units
de
vie.
Le
mtabolisme
regroupe
lensemble
des
ractions
biochimiques
qui
se
droulent
dans
le
milieu
intracellulaire.
Pasteur
en
1857
a
montr
que
la
Levure
de
Bire
(Saccharomyces
cerevisae),
un
Ascomycte
(famille
de
champignons
),
cultive
la
surface
dune
solution
de
glucose
bien
are,
se
dveloppe
abondamment
en
se
multipliant
(prolifre)
en
absorbant
de
loxygne
et
en
rejetant
du
dioxyde
de
carbone.
On
dit
que
la
Levure
est
en
arobiose,
elle
respire.
Lorsque
lon
place
ces
mmes
Levures
(Saccharomyces
cerevisae),
dans
un
flacon
clos,
la
Levure
aprs
avoir
puis
le
peu
de
dioxygne
laiss
sa
disposition,
fermente.
Cette
fermentation
se
traduit
par
une
consommation
de
glucose
et
un
dgagement
de
CO2
avec
apparition
dalcool
thylique
(thanol)
aisment
reconnaissable
son
odeur.
Le
passage
de
la
respiration
la
fermentation
est
rversible
:
la
Levure
remise
en
prsence
dair
respire
de
nouveau.
Cette
alternance
possible
constitue
leffet
Pasteur.
(La
fermentation
est
une
fonction
gnrale
prsente
chez
tous
les
tissus
vgtaux
placs
en
conditions
sans
oxygne.
Mais
contrairement
la
Levure
cette
fonction
ne
permet
pas
la
croissance,
mais
simplement
la
survie
temporaire
du
tissu
vgtal).
Bilan :
Les
conditions
du
milieu
(ici
prsence
ou
absence
de
dioxygne)
contrlent
le
droulement
des
activits
mtaboliques
(respiration
ou
fermentation)
chez
la
Levure
(Saccharomyces
cerevisae)
7-2-
Le
contrle
du
mtabolisme
cellulaire
par
le
patrimoine
gntique
Exemple
chez
la
Levure
:
Chez
la
Levure
(Saccharomyces
cerevisae),
on
connat
des
souches
qui
diffrent
par
la
couleur
des
colonies
quelles
forment
sur
milieu
solide,
colonies
blanc
crme
pour
la
souche
sauvage,
colonies
rose-
rouge
pour
une
souche
mutante.
Cette
diffrence
au
niveau
du
phnotype
(ensemble
des
caractres
observables
dun
individu)
macroscopique
entre
les
deux
souches
de
Levures
est
due
une
diffrence
biochimique
en
rapport
avec
la
capacit
synthtiser
ou
non
de
ladnine
(un
acide
amin)
partir
de
prcurseurs
(lments
de
bases
servant
la
production
dadnine)
prsents
dans
le
milieu.
La
chane
de
biosynthse
(
fabrication
)
de
ladnine
est
trs
complexe
et
comprend
de
trs
nombreuses
tapes.
Chez
la
souche
mutante
colonies
rouges,
elle
est
interrompue
une
tape
o
le
produit
intermdiaire
form
(AIR)
est
de
teinte
rose
(en
milieu
arobie).
Cest
son
accumulation
dans
une
cellule
de
Levure
qui
confre
celle-ci
une
couleur
lgrement
rose
(la
couleur
rouge
de
la
colonie
est
due
un
effet
de
masse).
N.
B.
Ladnine
(constituant
fondamental
de
lATP,
des
ARN
et
de
lADN)
est
indispensable
pour
la
croissance
des
Levures,
et
donc
la
formation
de
colonies.
Dans
le
cas
dun
milieu
de
culture
o
la
quantit
dadnine
et
la
quantit
dlments
prcurseurs
sont
modrs,
la
formation
de
colonies
de
Levures
mutantes
est
possible
.
En
consquence,
les
Levures
mutantes
croissent,
se
multiplient
tout
en
accumulant
le
produit
intermdiaire,
do
la
couleur
rouge.
Le
gne
ADE2
code
pour
une
enzyme
(une
protine
active)
qui
transforme
le
produit
intermdiaire
color
(AIR)
en
un
compos
CAIR
non
color.
Mcanismes
en
jeu
lors
de
la
production
dune
colonie
de
Levures
de
couleur
rouge
(Phnotype
mutant)
Les
squences
de
lallle
sauvage
et
dallles
muts
du
gne
ADE2
ont
t
tablies.
Bilan :
La
capacit
utiliser
ou
non
les
prcurseurs
de
lAdnine
disponible
dans
le
milieu
est
donc
chez
la
Levure
(Saccharomyces
cerevisae)
une
proprit
lie
au
patrimoine
gntique.
Les
membranes
plasmiques
malgr
leur
diversit
possdent,
sauf
exceptions,
une
structure
identique
:
une
double
couche
de
lipides,
qui
constitue
un
filtre
de
base
permettant
le
passage
des
substances
hydrophobes
(qui
naime
pas
leau),
freinant
celui
des
hydrophiles
(qui
aime
leau).
Des
protines
membranaires
aux
rles
divers
(transferts,
transport...)
En
tant
que
surface
de
contact
avec
l'extrieur
(air,
eau,
milieu
extracellulaire),
elle
assure
aussi
la
transmission
d'informations
ncessaires
la
ractivit
de
la
cellule
aux
changements
de
l'environnement
et
la
coordination
avec
d'autres
cellules.
Elle
permet
aussi
le
passage
de
la
lumire,
de
la
chaleur...
Cette
structure
de
base
(une
membrane
organisant
les
changes
entourant
un
compartiment,
lieu
de
ractions
chimiques
spcifiques)
va
permettre
la
mise
en
place
et
le
maintien
de
flux
de
matire,
d'nergie,
d'information...
traversant
la
cellule.
Conclusion
Les
tres
vivants
sont
constitus
dlments
chimiques
disponibles
sur
le
globe
terrestre.
Leurs
proportions
sont
diffrentes
dans
le
monde
inerte
et
dans
le
monde
vivant.
Ces
lments
chimiques
se
rpartissent
dans
les
diverses
molcules
constitutives
des
tres
vivants.
Les
tres
vivants
se
caractrisent
par
leur
matire
carbone
et
leur
richesse
en
eau.
Lunit
chimique
des
tres
vivants
est
un
indice
de
leur
parent.
De
nombreuses
transformations
chimiques
se
droulent
lintrieur
de
la
cellule
:
elles
constituent
le
mtabolisme.
Il
est
contrl
par
les
conditions
du
milieu
et
par
le
patrimoine
gntique.
La
cellule
est
un
espace
limit
par
une
membrane
qui
change
de
la
matire
et
de
lnergie
avec
son
environnement.
Cette
unit
structurale
et
fonctionnelle
commune
tous
les
tres
vivants
est
un
indice
de
leur
parent.
La
transgnse
montre
que
linformation
gntique
est
contenue
dans
la
molcule
dADN
et
quelle
y
est
inscrite
dans
un
langage
universel.
La
variation
gntique
repose
sur
la
variabilit
de
la
molcule
dADN
(mutation).
Luniversalit
du
rle
de
lADN
est
un
indice
de
la
parent
des
tres
vivants.