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pourraient être en compétition sont chez les Eucaryotes, souvent localisées dans
des compartiments sub-cellulaires distincts.
I.1.1.1. Notion d'énergie libre:variation de Gibbs
En permanence, une cellule capte de l'énergie du milieu extérieur ,céde une partie de cette
énergie au milieu extérieur sous forme de chaleur et transforme le reste de cette énergie en
travaux cellulaires. La variation d'énergie libre de Gibbs ΔG' mesure la partie de l'énergie d'un
système qui produit un travail utile.
• Quand ΔG' est négative, la réaction se déroule spontanément.
• Quand ΔG' est positive, la réaction ne peut avoir lieu sans un apport d'énergie libre de
Gibbs d'une autre réaction qui lui est couplée.
• Quand ΔG' = 0, la réaction ne peut plus effectuer de travail utile, elle se déroule à l'équilibre.
La mesure de l'énergie libre de Gibbs nécessite de définir un état standard. Les conditions
standard sont le pH = 7 et une concentration [H+] de 10-7 M.
La variation d'énergie libre de Gibbs standard est désignée par ΔG°'.
Variation d'énergie libre de Gibbs et constante d'équilibre:
Pour une réaction quelconque : A + B <===> C + D
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c'est l'énergie libre de Gibbs libérée lors de l'hydrolyse de l'ATP qui est utlisée pour
les différents travaux cellulaires. L'ATP est un triphosphate de nucluosides dans lequel une
liaison ester phosphate relie le phosphate α à l'oxygène 5' du ribose et une
liaison phosphoanhydride relie les phosphates α et β (Fig.1).
La nicotinamide adénine dinucléotide contient la nicotinamide qui est l'amide de l'acide (Fig.3).
De cette relation, il ressort que la concentration physiologique des métabolites régit la variation
d'énergie libre d'une réaction, donc sa spontanéité et le sens dans lequel elle se déroule.
a.Les réactions irréversibles :
Les réactions sont des réactions métaboliquement irréversibles qui se caractérisent par des
valeurs de ΔG' très négatives.Les réactions irréversibles régulent le flux des voies métaboliques.
Ces réactions sont catalysées par des enzymes qui sont en quantités limitées dans la cellule.La
transcription des gènes qui codent ces enzymes est soumise à des mécanismes de
régulation extrêmement fins.Ces enzymes ont des propriétés catalytiques particulières et sont le
plus souvent des enzymes à régulation allostérique .Les réactants ou les produits de ces réactions
sont souvent des métabolites qui modulent l'activité d'enzymes qui catalysent d'autres réactions
en aval ou en amont. Ces métabolites sont appelés effecteurs de l'activité enzymatique.
b.Les réactions réversibles :
Les réactions biochimiques pour lesquelles le rapport des concentrations physiologiques des
métabolites est proche du rapport des concentrations à l'équilibre, sont dites au voisinage de
l'équilibre. Ces réactions sont donc facilement réversibles.Pour ces réactions, la moindre
tendance à s'éloigner d'un état proche de l'équilibre est immédiatement rétablie par le très haut
pouvoir de catalyse des enzymes qui les contrôlent.
I.2.2. Quantité d'enzymes synthétisées
le contrôle de la quantité d'enzymes synthétisées est donc un autre moyen de régulation du
métabolisme.Ce contrôle s'exerce de diverses manières:
a. Le niveau de transcription des gènes
b. La modulation de l'activité et de la localisation des facteurs de transcription.
c. La régulation post-transcriptionnelle
I.2. 3. Activité des enzymes
Il existe différents mode de régulation de l'activité des enzymes , les modifications post-
traductionnelles modifient la structure des protéines et modulent ainsi leur fonction. La
modulation de l'activité par les effecteurs allosteriques qui modifient la conformation des
enzymes, donc leur activité enzymatique.
I.2.4. Signaux extracellulaires
Les signaux extrinsèques jouent un rôle capital dans la régulation . Les signaux extracellulaires
émanent d’hormones, de stimuli divers, de stress et d’autres cellules.Ces signaux sont captés par
des récepteurs de différents types :
• soit la molécule signale pénètre dans la cellule pour se lier à un récepteur cytoplasmique
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• soit la molécule signale se lie au domaine extracellulaire d’un récepteur transmembranaire
Il existe divers types de récepteurs transmembranaires:
-les récepteurs ionotropes qui sont des protéines qui ouvrent des cannaux ioniques
-les récepteurs métabotropes qui sont couplés à une proteine G
-les récepteurs métabotropes dotés d’une activité enzymatique intrinsèque qui est déclenchée par
la fixation du ligand (recepteur insuline).Ensuite, des messagers dits “secondaires” vont relayer
le signal jusqu’à la cible intracellulaire par un ensemble d’évènements que l’on appelle
la transduction du signal .Parmi les messagers secondaires, on peut citer l’AMP cyclique, le
calcium et la calmoduline. Cette cascade d’évènements de signalisation met en jeu des proteines
kinases qui phosphorylent des enzymes induisant une modification de la structure de ces
enzymes qui se traduit par une diminution ou une augmentation de leur activité enzymatique
(Fig.6).
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II.Métabolisme du glycogène
II.1. Glycogénolyse
Le glucose est une source d’énergie fondamentale et préférentielle du cerveau. Le glucose
sanguin provient de trois origines, le glucose alimentaire ingéré au moment de la prise des repas
(disaccharide, amidon et glycogène), la néoglucogenèse trop lente pour répondre à une demande
immédiate et la dégradation du glycogène hépatique.
Le glycogène est un polysaccharide composé de plusieurs unités d'oses, constitué de chaînes de
résidus glucose reliées par une liaison α-1,4.Ces chaînes sont reliées entre elles par des
branchements α-1,6.
II.1.1. Séquence des réactions enzymatiques
II. 1.1.1. Phosphorolyse du glycogène
La phosphorolyse est catalysée par la glycogène phosphorylase. Cette enzyme coupe la
liaison α (1-4) à partir de l'extrémité non réductrice et fixe sur le carbone 1 du glucose libéré
un groupement phosphate, en donnant du glucose 1-P. La phosphorolyse est répétée de façon
séquentielle sur le glycogène jusqu'à 4 résidus glycosyles sur chaque chaîne avant la liaison α
(1-6). La structure résiduelle est appelée dextrine limite (Fig.7)
II.1.1.2. Glucosyl-4,4-transférase
Elle intervient sur la dextrine limite en enlevant sur chaque chaîne de la dextrine limite un
oligosyle formé de 3 résidus glucose pour aller allonger une autre chaîne de la dextrine limite
permettant ainsi la reprise de la phosphorolyse sur cette chaîne.
II.1.1.3 . α (1- 6) Glucosidase
L’hydrolyse des résidus glucose reliés par la liaison α (1-6) est realiseé par la glucosidase en
libèrant les glucoses.Après l’action de ces trois enzymes le glycogène libère essentiellement du
glucose 1-P et une faible quantité de glucose.
Le glucose1-P est isomérisé en glucose-6-P par la phosphoglucomutase. Le glucose 6-P peut
entrer dans la glycolyse dans le foie et dans le muscle. Mais l’objectif de la dégradation du
glycogène hépatique est avant tout le maintien de la glycémie. Pour ce faire seul le foie,
après dégradation du glycogène, dispose de la glucose 6-phosphatase, permettant l’hydrolyse
du glucose 6- en glucose et l’excrétion de ce dernier dans le sang. L’ensemble de la séquence
des réactions de dégradation du glycogène est résumé dans la figure 7.
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Figure 7.Réactions de la glycogénolyse
II.1.2. Régulation de la glycogénolyse
Le métabolisme énergétique du glycogène est sous contrôle hormonal. L’adrénaline et le
glucagon dirigent le catabolisme et la production de l’énergie , l’insuline contrôle
l’anabolisme orienté vers le stockage de l’énergie. Les effets de ces 2 groupes d’hormones
sont antagonistes, ce qui nécessite une régulation coordonnée.On distingue la régulation
hormonale et la régulation par les ions Calcium.
II.1.2.1.Régulation hormonale
Le glucagon et l’adrénaline (épinéphrine) sont les deux principales hormones qui
contrôlent la dégradation du glycogène. Il existe deux glycogène phosphorylases, l'une
musculaire et l'autre hépatique. Chacune existe sous deux formes, forme a (active) et
forme b (inactive). La phosphorylase musculaire est formée de 4 sous-unités, groupées
en dimères (forme inactive), possédant chacune un groupement séryle. Lorsque les OH des
sérines sont phosphorylés, les dimères s'assemblent en tétramère (forme active).La
phosphorylase hépatique est dimérique. La forme dimérique (b) inactive peut passer à la forme
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dimérique (a) active par phosphorylation.Les deux phosphorylases s'interconvertissent l'une
dans l'autre grâce à l'action de deux enzymes, la phosphorylase kinase (passage de la forme
inactive à la forme active par phosphorylation) et la phosphorylase phosphatase (hydrolyse du
groupement phosphate) (Fig.8).
muscles striés, est déclenché par le relargage de grandes quantités d’ions Ca2+ par le
réticulum endoplasmique. la calmoduline une petite protéine responsable , qui fixe 4 ions
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Notre organisme dispose de deux voies métaboliques permettant de faire diminuer la
concentration de glucose dans le sang, la glycolyse ou la mise en réserve du glucose par la
glycogénogénèse.
II.2.1.Séquences des réactions enzymatiques
II.2.1.1. Isomérisation du glucose 6 en glucose 1-6
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La glycogénine, elle-même, peut rajouter quelques unités glucose liées par des liaisons
(1-4) pour terminer le primer (Fig.10).
Les glycogènes synthases sont des enzymes du foie et des muscles qui transfèrent un radical
glucosyl- de l’UDP-glucose à l’extrémité d’une branche d’une molécule de glycogène. Elles
libèrent le coenzyme UDP.Le produit de l’activité de la glycogène synthase (amylopectine) a
une structure non branchée.L’enzyme branchant transfère des glucoses d’une liaison α-1,4 sur
une liaisonα-1,6 en créant une nouvelle branche à la molécule de glycogène.
II.2. 1.4 .Elongation de la chaîne par la glycogène synthase
L’élongation de la chaîne est assurée par la glycogène synthase qui transfère le résidu
glucosyle de l’UDP-glucose à l’extrémité non réductrice de la chaîne du primer et réalise de
façon séquentielle la liaison (1-4) suivant la réaction :
Glycogène (n glucose) + UDP-glucose glycogène [(n+1)] glucose + UDP
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L’UDP est reconverti ensuite en UTP par une nucléoside diphosphate kinase en
présence de l’ATP. ATP+UDP UTP+ADP
II. 2.1.5. Formation des chaînes latérales
A tous les 8 résidus glucose sur la chaîne linéaire synthétisée par la glycogène
synthase, se forme une branche donnant au glycogène une structure fortement ramifiée .
Les ramifications sont assurées par une enzyme branchante glycosyl (4,6) transférase.
Elle prélève un oligoside de 5 à 8 résidus glucose de l’extrémité non réductrice de la chaîne
en élongation et l’attache sur un glucosyle de la chaîne principale par une liaison (1-6).
II. 2.2. Régulation de la glycogénogenèse
La glycogène synthase existe sous deux formes, forme active (déphosphorylée) et forme
inactive (phosphorylée). L’interconversion entre les deux formes est sous le contrôle
d’une protéine phosphatase insulino-dépendante et de la protéine kinase A. L’activation de
la glycogène synthase est le résultat d’une série de réactions en cascade provoquées
par l’insuline. L’insuline se fixe sur son récepteur et forme un complexe récepteur-
insuline. La tyrosine kinase phosphoryle une tyrosine d’un premier substrat protéique
appelé IRS-1 (Insulin receptor substrate 1). IRS-1- va initier une série de réactions de
phosphorylations en cascade dont la dernière étape est la phosphorylation,
d’une protéine phosphatase (insulino-dépendante). Cette dernière déphosphoryle la
glycogène synthase et lui restitue son activité.La synthèse du glycogène est ainsi
initiée ou relancée. Il faut ajouter que l’insuline favorise l’activité de l’estérase qui
hydrolyse AMPc en AMP, ce qui réduit la teneur de la protéine kinase A active et, par
voie de conséquence, favorise la synthèse du glycogène (Fig.10).
.
Figure 11.Régulation de glycogène synthase
Références bibliographiques
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III.Glycolyse
III.1.Introduction
la glycolyse est une voie métabolique qui transforme une molécule de glucose en deux
molécules de pyruvate.Cette conversion s'accompagne de la production nette de deux
molécules d'ATP.
La voie glycolytique se déroule dans le cytoplasme et pratiquement toutes les cellules la
possèdent. Pour certaines cellules, c'est même la seule source d'ATP. La glycolyse peut
être schématiquement divisée en deux phases
• la phase hexose qui consomme 2 molécules d'ATP.
• la phase en triose qui forme 4 molécules d'ATP.
Le glucose est le "fuel" énergétique de la plupart des organismes. La réaction de
combustion complète du glucose est C6H12O6 + 6 O2 6 H2O + 6 CO2
Ce rôle du glucose comme source énergétique essentielle est la raison pour laquelle il
occupe une position centrale dans le métabolisme.
Chez les animaux et les plantes, le glucose a trois destinées :
- le stockage sous forme de polysaccharides (glycogène, amidon, cellulose, saccharose ...)
- l'oxydation en pyruvate par la glycolyse ou la voie de Entner-Doudoroff.
- l'oxydation en ribose 5-phosphate par la voie pentoses phosphates .
Chez les organismes anaérobies (ou dans le muscle en forte contraction), le pyruvate subit
les réactions de la fermentation alcoolique ou de la fermentation lactique.
III.2. Sources de glucose
a. Le glycogène: C'est un polysaccharide , composé de plus de 20 unités d'oses .
b.L'amidon:C'est un polymère linéaire de 600 à 1000 résidus glucose . β amylase est
une exoglycosidase qui catalyse la libération progressive de résidu maltose à partir des
extrémités non réductrices de l'amidon.
c. Le saccharose ou sucrose
C'est l'une des principales sources alimentaires d'α-D-glucose .Il est hydrolysé par
la saccharase en α-D-glucopyranose et en β-D-fructofuranose.
d.Captation du glucose par les cellules :
Transport par diffusion facilitée , dans le sens d’un gradient de concentration , aide de
transporteurs membranaires.il ya 4 sortes transporteurs membranaires :
Glut1 et 3 présents partout assurant un transport minimum;
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Glut 4 : dans les muscles et tissu adipeux avec affinité élevée pour le glucose, fonctionnels
à faible glycémie, insulino-dépendants
Glut 2 : dans le foie et pancréas , faible affinité pour le glucose , fonctionnels à glycémie
élevée, non dépendants de l‟insuline .
II.3. Réactions de la phase hexoses de la glycolyse
a. La réaction catalysée par l'hexokinase ou la glucokinase
hexokinase est une enzyme qui catalyse la phosphorylation de certains autres hexoses le D-
fructose et le D-mannose.La glucokinase est l'isoforme IV de l'hexokinase que l'on trouve
dans le foie. Cette réaction consomme 1 molécule d'ATP par molécule de glucose. C'est
donc une réaction trés exergonique , donc irréversible (ΔG°' = - 4,0 kcal.mol-1)
b. La réaction catalysée par la glucose 6-phosphate isomérase
La glucose 6-phosphate isomérase transforme un aldohexose en cétohexose.
Cette réaction requiert le magnésium.Dans les conditions standard ΔG°' = + 0,4 kcal.mol-1.
c. La réaction catalysée par la phosphofructokinase-1
Cette enzyme phosphoryle le fructose 6-phosphate pour former le fructose 1,6-
bisphosphate.
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C'est une réaction trés exergonique, donc irréversible : ΔG°' = - 3,4 kcal.mol-1 .
d. La réaction catalysée par l'aldolase
L'aldolase scinde le fructose 1,6-bisphosphate en 2 trioses , le glycéraldéhyde 3-phosphate
et un cétose, la dihydroxyacétone phosphate.
Dans les conditions standard : ΔG°' = + 5,7 kcal.mol-1 donc la réaction est impossible dans
le sens de la coupure du fructose 1,6-bisphosphate.
III.4.Réactions du tronçon trioses
a. La réaction catalysée par la triose phosphate isomérase
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C'est une métaloenzyme et le magnésium est indispensable à son acticité catalytique . Dans
les conditions standard : ΔG°' = + 0,4 kcal.mol-1.Cependant, le phosphoénolpyruvate formé
contient une liaison énol phosphate. Le potentiel énergétique de cette liaison est parmi les
plus élevés : ΔG°'hydrolyse = - 14,8 kcal.mol-1.
f. La réaction catalysée par la pyruvate kinase
Cette enzyme catalyse la transformation du phosphoénolpyruvate en pyruvate avec
synthèse d'ATP par phosphorylation au niveau du substrat. Cette réaction forme 1
molécule d'ATP par molécule de glucose.C'est une réaction trés
exergonique, irréversible :ΔG°' =- 7,5 kcal.mol-1
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.
III.5. Bilan de la glycolyse
chaque molécule de glycéraldéhyde-3-phosphate va permettre la formation de 2 molécules
d'ATP.Le bilan énergétique de la glycolyse est une synthèse nette de 2 molécules d'ATP
par molécule de glucose.
glucose + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ 2 pyruvates + 2 ATP + 2 NADH + 2 H+ + 2 H2O
1er tronçon 2 moles d'ATP consommées par mole de glucose .2ème tronçon jusqu'au
pyruvate 4 moles d'ATP formées par mole de glucose et 2 moles de NADH + H+ formé par
mole de glucose.
III.6. Déstinées du pyruvate en anaérobiose:
Le pyruvate a deux déstinées en anaérobiose, il est transformé en lactate dans de nombreux
types de cellules ou en éthanol et CO2 chez la levure (fermentation alccolique).
en aérobiose, il entre dans le processus de phosphorylation oxydative.
III.6.1. La fermentation alcoolique par les levures
Au cours de la fermentation alcoolique, le pyruvate est d'abord décarboxylé en
acétaldéhyde et CO2 par la pyruvate décarboxylase .
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III.7.2.Maltose
Le maltose est un diholoside formé de l'α-D-glucopyranosyl-(1,4)-β-D-glucopyranose
maltose , il est hydrolysé par une maltase en 2 résidus α-D-glucopyranose.
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III.7.3. Lactose
Le lactose est le disaccharide du lait.,il est hydrolysé par une lactase intestinale en α-D-
glucopyranose et en α-D-galactopyranose qui sont envoyés dans la circulation sanguine.
III.7.4. Galactose
Il est d'abord phosphorylé en galactose 1-phosphate par la galactokinase. Le galactose 1-
phosphate réagit avec l'UDP-glucose dans une réaction catalysée par la galactose 1-
phosphate uridyltransférase. Les produits de cette réactions sont le glucose 1-phosphate et
l'UDP-galactose.La phosphoglucomutase convertit le glucose 1-phosphate en glucose 6-
phosphate qui entre dans la glycolyse. L'UDP-galactose catalysé par la galactose 1-
phosphate uridyltransférase, est recyclé en UDPG par l'UDP-G 4'-épimérase.
III.7.5. Mannose
Le mannose est d'abord phosphorylé en mannose 6-phosphate par l'hexokinase puis
isomérisé en fructose 6-phosphate par la mannose 6-phosphate isomérase.
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III.8.Régulation de la glycolyse
La glycolyse produit de l'énergie rapidement mais sur de courtes durées. La régulation de
la glycolyse est liée aux besoins énergétiques de la cellule.Les sites de régulation de la
glycolyse correspondent aux 3 étapes irréversibles de cette voie métabolique. Ce sont les
réactions catalysées par des enzymes à régulation allostérique (Tab.3).
Tableau 3: activateurs (A) et des inhibiteurs (I) des 3 enzymes clé de la régulation de la
glycolyse
hexokinase* phosphofructokinase pyruvate kinase
G 6-P I
F1,6-BP A
F2,6-BP A A
ATP) I (concentrations > 10-3 M I
ADP A A
AMP A I
acétyl CoA I
NADH A puis I
citrate I I
PEP I A
Pi A
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Références bibliographiques
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IV.Néoglucogenèse
IV.1. Introduction
La néoglucogenèse ou gluconéogenèse est la synthèse de molécules de glucose à partir de
substances non glucidiques .Le glucose est comme source d’énergie nécessaire à toutes les
cellules, indispensables aux cellules glucodépendantes (globules rouges et cerveau) et aux
cellules qui, en anaérobiose, dépendent de la glycolyse (muscles).C’est un précurseur
indispensable à la biosynthèse de molécules d’intérêt biologique. Elle est 90% hépatique et 10%
dans le cortex rénal.
Les principaux précurseurs sont le pyruvate/ lactate (1/3) provennant des globules rouges et
des cellules musculaires. L’Alanine (1/3) issue des cellules musculaires et le glycérol (1/12)
qui provient du catabolisme des triglycérides.
La néoglucogenèse intervient pendant le jeûne entre les repas.Le lactate, l’Alanine et le
glycérol sont les précurseurs les plus importants. La néoglucogenèse hépatique fournie environ
50g de glucose par jour, soit le tiers de la consommation tissulaire quotidienne.
IV.2. Réactions de la néoglucogenèse
IV.2.1. Néoglucogenèse à partir du pyruvate: La néoglucogenèse utilise en sens inverse
les réactions réversibles de la glycolyse, elle ne peut utiliser les 3 réactions irréversibles,
elle doit les contourner par des réactions spécifiques.
1- Glucose + ATP Glucose 6- + ADP (hexokinase)
2- Fructose 6- + ATP Fructose-1,6-bis + ADP (Phosphofructokinase 1)
3- PEP + ADP Pyruvate + ATP (Pyruvate kinase)
IV 2.1.1. Formation du PEP à partir du pyruvate:
Pour obtenir cette phosphorylation du pyruvate il y a coopération entre la mitochondrie et
le cytosol. La réaction se déroule en deux phases :
- Phase mitochondriale: Le pyruvate produit dans le cytoplasme est exporté dans la
mitochondrie, carboxylé par la pyruvate carboxylase. L’enzyme est une ligase à
biotine. L’ATP est nécessaire.
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Figure 16 .Néoglucogenèse
IV.3. Néoglucogenèse à partir de précurseurs autres que le pyruvate :
IV.3.1. Néoglucogenèse à partir de lactate du muscle
Le lactate produit quitte le muscle et gagne le foie. Au niveau du foie le lactate est transformé en
pyruvate par réaction inverse catalysée par lactate déshydrogénase hépatique. Par la néoglucogenèse le
glucose sera ultérieurement remis à la disposition des muscles (cycle de Cori).
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Le glycérol qui provient de la dégradation des triglycérides dans le tissu adipeux, peut rejoindre la
néoglucogenèse par l’intermédiaire de la Dihydroxyacétone phosphate DHAP.Seul le foie et le rein
disposent du glycérol kinase.
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La PFK2 est désactivée par phosphorylation, en présence de l’ATP, par la protéine kinase
A, ce qui arrête la production du fructose-2,6-bisP. En même temps la même protéine
kinase A stimule par phosphorylation l’activité de la FBP2 permettant la
déphosphorylation du fructose-2,6-bisP en fructose 6-P. La baisse de la concentration
cellulaire en fructose-2,6-bisP active la néoglucogenèse. Inversement l’insuline, par ses
réactions en cascade, conduit à l’activation, par phosphorylation, d’une protéine
phosphatase insulino-dépendante. Cette dernière permet la déphosphorylation à la fois de
PFK2-P et de FBP2-P. La synthèse de fructose-2,6-bisP peut reprendre avec comme
conséquence la stimulation de la glycolyse et l’arrêt de la néoglucogenèse.
• Le cortisol enfin, par l’intermédiaire d’un récepteur nucléaire, active la transcription de
plusieurs gènes d’enzymes de la gluconéogénèse : transaminases, pyruvate carboxylase,
PEPCK, fructose 1,6-diphosphate phosphatase et glucose 6-phosphate phosphatase.
• Références bibliographiques
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acyles (R-C=O).Ces groupes sont liés au coenzyme A par des liaisons thioester, liaisons à
haut potentiel énergétique (ΔG°' = - 9 kcal/mol)
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L'activité de la PDH est très finement régulée car elle joue un rôle central dans le
métabolisme énergétique . En effet, la réaction catalysée par la PDH met en relation,la
glycolyse,la néoglucogènèse et l’oxydation des acides gras avec le cycle de Krebs.
De plus, l'activité de la PDH est importante également dans la régulation du flux de la
transformation du glucose en malonyl-CoA, nécessaire à la synthèse des acides gras.
Dans le cytosol, le citrate est hydrolysé par l'ATP-citrate lyase pour former l'oxaloacétate
et l'acétyl-CoA .cet acétyl-CoA peut être converti en malonyl-CoA (précurseur des acides
gras) par La PDH se trouve sous deux formes, une forme active déphosphorylée et une
forme inactive phosphorylée. L’activité de la PDH dépend donc d’une kinase et d’une
phosphatase qui interviennent sur l’enzyme. La kinase et la phosphatase sont elles mêmes
sujettes à des régulations (Fig.23).
V.2.Cycle de KREBS
Le cycle tricarboxylique, appelé encore cycle de Krebs, dégrade les produits terminaux des
oses, acides gras et de nombreux acides aminés.Il est intra mitochondrial, joue un rôle
central dans la néoglucogenèse, la lipogenèse et l’interconversion des acides aminés.
Le Cycle de Krebs est le principal fournisseur d’hydrogène (sous forme de coenzymes
réduits) à la chaîne respiratoire mais ne peut avoir lieu qu’en présence d’O2. Il a lieu dans
toutes les cellules ayant accès à O2 et possédant des mitochondries.
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V.2.1.Réactions du cycle
La séquence des réactions conduit à l’oxydation complète de l’acétyl-CoA en 2 molécules
de CO2 et à la régénération de l’oxaloacétate, accepteur catalytique du cycle.on distingue
deux phases ,une phase d’oxydation totale de l’acétyl-CoA et une phase où intervient la
séquence de réactions de régénération de l’oxaloacétate.
V. 2.1.1.Phase d’oxydation totale de l’acétyl-CoA
V.2.1.1.1. Formation du citrate
C’est la première réaction irréversible. Acétyl-CoA réagit avec l’oxaloacétate pour former
du citrate , acide tricarboxylique avec une fonction alcool tertiaire.L'enzyme qui intervient
est une lyase la citrate synthase.
V.2.1.1.2. Isomerisation du citrate en isocitrate
La deuxième réaction est réversible, elle se fait en deux temps, départ d’une molécule
d’eau, ensuite fixation de cette molécule d’eau en un endroit différent. alcool tertiaire
isomérisé en alcool secondaire plus facilement oxydable.
V.2.1.1.3. Déshydrogénation et décarboxylation de l’isocitrate en α cétoglutarate
La troisième réaction est irréversible. Il s’agit d’une déshydrogénation et d’une
décarboxylation oxydative avec libération de CO2 et oxydation formation de α -cétoglutarate.
V.2.1.1.4. Formation du succinyl CoA
La quatrième réaction est irréversible.le complexe est semblable à celle qui transforme le
pyruvate en acétyl-CoA, nécessite du CoA et du NAD avec formation de NADH et CO2 .
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V.2.2.Bilan du cycle :
acétyl CoA + 3 NAD+ + coenzyme Q + GDP (ou ADP) + Pi + 2 H2O ---> CoASH + 3
NADH + coenzyme QH2 + GTP (ou ATP) + 2 CO2 + 2 H+
Deux atomes de carbone entrent dans le cycle sous forme d’acétyl-CoA et en ressortent
sous forme de 2 CO2 obtenus au cours des deux décarboxylations au niveau de l’isocitrate
et de l'a-cétoglutarate.
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• Quatre paires d'hydrogène sortent du cycle, trois sous forme de NADH,H+ et une
sous forme de FADH2, ce qui permet la formation de 11 liaisons phosphates riche en
énergie au cours des phosphorylations mitochondriales.
• une liaison phosphate riche en énergie est formée sous forme de GTP.
En conclusion l’oxydation totale de l’acétyl-CoA permet la formation de 12 liaisons
phosphates riches en énergie (12 ATP).
3NADH, H+ 3 X 3 ATP 9 ATP
1FADH 1 X 2 ATP 2 ATP
1GTP 1ATP 1 ATP
Un pyruvate dans le CK 12 ATP
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• Références bibliographiques
Hans Adolf Krebs .1940.The citric acid cycle and the Szent-Györgyi cycle in pigeon breast
muscle.Biochem. J. 34, 775 – 779 Cycle de Krebs. Equipe multimédia . Université Jussieu
.Paris
Bricker .2012 .A mitochondrial pyruvate carrier required for pyruvate uptake in yeast,
Drosophila, and humans. Science 337, 96 - 100
Herzig .2012 .Identification and functional expression of the mitochondrial pyruvate
carrier. Science 337, 93 - 96
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Les réactions de dégradations oxydatives des substrats énergétiques (les glucides, les
lipides et les acides aminés) aboutissent à la production d’énergie par la libération directe
de l’ATP et la formation de coenzymes réduits NADH,H+, et FADH2 qui sont à l’origine
de la synthèse de l’ATP par phosphorylation oxydative.elle a lieu dans la membrane
interne des mitochondries , très imperméable, notamment aux H+ .
1.Réactions d'oxydo-réduction et potentiel de réduction standard.
L’énergie chimique peut être conservée sous forme d’électrons à haut potentiel énergétique
contenus dans les molécules énergétiques.
1.1.Définitions : réducteur - oxydant - réaction et couple redox.
De nombreuses réactions du métabolisme mettent en jeu des transferts d'électrons et bien
souvent de protons. Une même molécule va donc être dans un état réduit ou oxydé .
- L’oxydation : perte d’électron(s) ou d’hydrogène(s).
- La réduction : gain d’électron(s) ou d’hydrogène(s).
- Un oxydant (ox) : est l’accepteur d’électrons
- Un réducteur (red): est le donneur d’électrons
La réaction d’oxydo-réduction implique 2 couples redox (forme réduite + forme oxydée).
Chaque couple est caractérisé par un potentiel , indicateur de sa force réductrice. Plus le
potentiel est négatif, plus le pouvoir réducteur est élevé . Les couples sont classés par
rapport à un couple de référence ( 2H+ / H2 ) , le plus réducteur ( E0’ = - 0,42V ).A
l’opposé, le couple O2 / H2 O a un E0’= + 0,82 V . les électrons sont transférés de la forme
réduite du couple le plus réducteur vers la forme oxydée du couple le moins réducteur.
Une réaction d’oxydoréduction est favorisée dans le sens des potentiels redox croissants,
les électrons passent du couple rédox ayant le potentiel redox le plus faible vers celui dont
le potentiel rédox est le plus élevé.
1.2. La ΔG0’ et ΔG d’une réaction d’oxydoréduction
La différence de potentiel de réduction standard, ΔE°', est liée à la variation d'énergie libre
standard par la relation :ΔE0=
ΔG°'réaction = - n . F . ΔE°'réaction
F est la Constante de Faraday:23 Kcal/V
n est le nombre d’electron mis en jeu
Si ΔE0’ < 0 , alors ΔG0’ ˃ 0 : la reaction n’est pas spontanément possible.
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La chaîne respiratoire convertit le pouvoir réducteur des coenzymes réduits en une forme
d'énergie qui alimente la phosphorylation oxydative.
2.2.Description de la chaine respiratoire
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-Le complexe I reçoit les équivalents réducteurs du NADH,H+ et les passe au coenzyme Q, par
le FMN et les protéines à centre fer- Soufre.
- Le complexe II reçoit les équivalents réducteurs du FADH2 et les passent au coenzyme Q par
les protéines Fer-Souffre.
- Le complexe III reçoit les équivalents réducteurs du coenzyme Q réduit (par le complexe I et
II) et les passe au cytochrome c via les cytochromes b et les atomes Fer-Souffre.
- Le complexe IV reçoit les équivalents réducteurs du cytochrome c et les passe à l’oxygène
moléculaire, via les cytochromes a et a3 ainsi que les deux ions du cuivre.
Les complexes I, III et IV sont des pompes à protons, le flux d’électrons à travers ces
complexes s’accompagne d’un passage des protons de la matrice vers l’espace inter-
membranaire. La réduction de NADH,H+ permet le passage de 10 protons et FADH2 de 6
protons (Fig .26).
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Références bibliographiques
• Boyer .1973 .A new concept for energy coupling in oxidative phosphorylation based on a
molecular explanation of the oxygen exchange reactions. PNAS 70, 2837 - 2839
• Fernie .2004 .Respiratory metabolism: glycolysis, the TCA cycle and mitochondrial
electron transport. Curr. Opin. Plant Biol. 7, 254 -261
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2.Régulation
Enzyme régulateur : glucose-6-phosphate déshydrogénase activée lorsque NADPH / NADP
est faible inactivée si NADPH / NADP est élevé. Elle est induite par insuline .Si la demande
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en NADPH est superieur à la demande en ribose ( adipocytes ou globules rouges). 1ère phase
se déroule et forme du NADPH suivie par la 2ème phase qui donne F-6-P et G-3-P qui peuvent
reformer du glucose -6-P . Si la demande en ribose est superieur à la demande en NADPH (
divisions cellulaires très actives) la 1ère phase peut rapidement être inhibée .Le glucose-6-P
emprunte la glycolyse pour former du F-6-P et de G-3-P qui empruntent les réactions
réversibles de la 2è phase pour donner du ribose
3. Rôles du couple NADP+/NADPH,H+ dans la cellule
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Les triglycérides représentent 50% des lipides de l’organisme.Ils ont un rôle de protection des
tissus et source de réserve d’énergie,localisés principalement dans le tissu adipeux, le foie ,
les muscles et l’intestin .Ils sont hydrolysés en acides gras et glycérol, grâce à des lipases ou
à des estérases moins spécifiques, souvent exocellulaires.
Le glycérol entre dans la glycolyse au niveau de la dihydroxyacétone-P. les acides gras,
quant à eux, sont d’abord activés par l’ATP en présence de coenzyme A pour former un
acyl-CoA, lequel est oxydé en β-céto-acyl-CoA. Après hydrolyse, il se forme de l’acétyl-
CoA et un acyl-CoA possédant deux carbones de moins. L’acétyl-CoA formé peut être
incorporé dans le cycle de Krebs.
Les acides gras ont un rôle structural, fonctionnel et énergétique .Le métabolisme des
acides gras comprend : - Le catabolisme par β-oxydation en acétyl-CoA.
- La synthèse à partir de l’acétyl-CoA.
- Les réactions d’élongation et / ou désaturation
La β-oxydation ou hélice de Lynen est la voie du catabolisme oxydatif des acides gras
(Acyl-CoA) en d’acétyl-CoA en aérobie .Toutes les enzymes catalysant cette voie sont
mitochondriales .Les acides gras sont des agents energetiques trés importants sur le plan
quantitatif car ils sont reduits et anhydres et sont oxydes dans de tres nombreux tissus
(tissu adipeux, foie, poumon, rein, coeur, …).
2. β-oxydation des acides gras saturés (nombre pair de Carbones)
Les acides gras sont activés au niveau de la membrane externe de la mitochondrie. Sous
l’action d’une thiokinase le CoA se fixe par une liaison thioester sur le carboxyle de l’acide
gras pour former un acyl CoA.Cette étape est la seule qui requiert de l’energie.L’ATP est
alors transformée en AMP avec production de PPi, l’équivalent de 2 molecules d’ATP sont
hydrolysées.
2.2. Transfert intra-mitochondrial des acyl-CoA
La carnitine transporte les acides gras dans la mitochondrie.La carnitine est un acide alcool
azoté largement distribue synthetisé à partir de la lysine et de la methionine.Dans l’espace
intermembranaire, une premiere transférase catalyse le transfert de l’acyl sur la carnitine
pour former l’acylcarnitine.Puis une translocase de la membrane interne de la mitochondrie
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2.3. Clivage des acyl CoA avec libération successive d’acétyl CoA
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Réferences bibliographiques
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Figure 28 .Vue du métabolisme des acides aminés Figure.29. Catabolisme des acides aminés
L’enlèvement de l’azote aminé se fait soit par transamination, commune à tous les acides
aminés sauf la lysine, par désamination oxydative (le glutamate) et par désamination non
oxydative (la sérine, cystéine et la thréonine).Cela conduit à la production de l’ammoniac
(NH3) un composé toxique pour le système nerveux central. Celui-ci est éliminé de
l’organisme sous forme d’urée, par uréogénèse qui est une voie majeure hépatique
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représentant 4/5 de l’azote éliminé, ou sous forme de NH4+ par l’ammoniogénèse rénale
qui est une forme mineure (1/5).Comme les réactions sont couplées on parle de double
transamination et de transamidation
2.1.1. Transamination
La transamination est le transfert d’une fonction amine en position α d’un acide aminé 1
sur une fonction cétone en position α d’un Acide α cétonique 2. Ce transfert de
groupements aminés va permettre la formation d’un acide aminé 2 et d’un acide α
cétonique 1.
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Le squelette carboné des acides aminés peut être transformé en molécules utilisables dans
le métabolisme (cycle de Krebs). On distingue alors deux type d'acides aminés.
- Glucoformateurs : donnent des molécules du cycle de Krebs, pouvant être transformées
en oxaloacétate permettant la création de glucose grâceà la gluconéogénèse.
- Cétoformateurs : permettent de créer du pyruvate ou de l'actéylCoA,utilisable dans le
cycle de Krebs ou à la synthèse de corps cétoniques (Fig.30)
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L'ammoniac composé toxique formé dans les tissus périphériques et le foie à partir des
acides aminés par une série de réactions de transamination et de désamination.il se déplace
vers le foie et vers le rein, principalement sous la forme de glutamine (d’alanine) pour être
éliminé.C’est la synthèse de la glutamine à partir du glutamate par la glutamine synthétase
cytosolique. Le transporteur d’azote entre les différents organes est la glutamine .
La glutamine formée passe dans la circulation sanguine et va dans les reins et le foie ou il y
a reformation du glutamate à partir de la glutamine, sous l’action de la glutaminase avec
libération du NH3.
2.3.2. L’ammoniogénèse
Dans le rein, le NH3 libéré à partir de la glutamine va s’associé avec des H+ pour former
l’ion ammonium (NH4+) qui sera éliminé dans les urines.
2.4. Le cycle de l’urée ou uréogénèse
Au niveau du foie, le NH3 libéré à partir de la glutamine est pris en charge par le cycle de
l’urée c’est l’uréogénèse (Fig .33).Le cycle de l’urée est la voie préférentielle de
l’élimination de l’azote en excès. En effet, on retrouve deux atomes d’azote par molécules
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d’urée. Le cycle de l’urée est fortement consommateur en énergie.C’est un cycle qui fait
intervenir en particulier l’Arginine, l’Ornithine et la Citrulline selon les étapes suivantes :
• Dans la mitochondrie, le bicarbonate (HCO3-) réagit avec du NH4+ et aboutit à la
synthèse d’une molécule appelée le carbamyl phosphate.
• Cette réaction est effectuée par la carbamyl phosphate synthétase et nécessite de
l’énergie (consommation d’ATP).
• Le carbamyl phosphate en présence d’ornithine transcarbamylase va donner de la
citrulline.La citrulline sort de la mitochondrie
• Dans le cytoplasme, la citrulline interagit avec l’aspartate pour donner
l’argininosuccinate sous l’action de l’argininosuccinate synthétase (avec
consommation d’1 ATP).
• L’argininosuccinate va être scindé en fumarate et arginine sous l’action de
l’argininosuccinate lyase.
• L’arginine sous l’action de l’arginase et en présence d’H2O va aboutir à la synthèse
d’ornithine et d’urée.
Bilan de la synthèse de l'urée.
CO2 + NH4+ + 3 ATP + Asp + 2 H2O --> URÉE + 2 ADP + 2 Pi + AMP + PPi +
fumarate
• L’urée est une molécule très hydrosoluble et facilement éliminable au niveau
rénale.
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L’homme ne peut pas synthétiser les acides aminés dits indispensables et qui doivent
être apportés par l’alimentation: Lys, Met, Thr, Ile, Val, Leu, Phe, Trp.Les acides
aminés non indispensables peuvent être synthétisés par l’organisme par des réactions
simples en utilisant des précurseurs métaboliques .Le squelette carboné des acides
aminés provient des intermédiaires de la glycolyse, de la voie des pentoses phosphate
ou du cycle de l’acide citrique.Il ya seulement 6 familles biosynthétiques (Fig.34).
1. L’α-cétoglutarate précurseur du Glutamate, glutamine, proline et arginine *
2. L’oxaloacétate précurseur de l’aspartate, asparagine, méthionine, thréonine, lysineet
Isoleucine.
3. Le 3-phosphoglycérate précurseur de la sérine, cystéine et glycine.
4. Le pyruvate précurseur de l’alanine, valine et leucine.
5.Le phosphoénolpyruvate et l’érythrose -4-phosphate précurseurs du tryptophane,
phénylalanine, tyrosine.
6. Le ribose 5 phosphate précurseur de l’histidine.
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