Cours Ecologie Marine L3 Aquaculture

Université Hassiba Benbouali de Chlef
Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie

Département Eau, Environnement et
Développement durable
Licence: Aquaculture et pisciculture
Dr. HAFSAOUI Imed Email: imedhafsaoui@yahoo.fr

PR GRAMME
Chapitre 1 Introduction
Chapitre 2 Facteurs écologiques du milieu aquatique
Chapitre 3 Domaine benthique
Chapitre 4 Domaine pélagique
Chapitre 5 Necton
Chapitre 1: Introduction
Semestre 1 LICENCE Aquaculture et pisciculture
Définitions
Biocénose est un groupement d'êtres vivants correspondant par sa composition,

par le nombre d'espèces et d'individus dans certaines conditions moyennes du
milieu à un groupement d'êtres vivants qui sont liés par une dépendance réciproque
et qui se maintiennent en se reproduisant dans certains endroits d'une façon
permanente.
Biotope C’est une aire géographique de surface ou de volume variable, soumise à

des conditions écologiques, dont les dominantes sont homogènes.
Population C‘est l’ensemble des individus d’une même espèce dans un espace
précis. L’halieute utilise souvent le terme de «stock» ; c’est un ensemble assez
similaire généralement limité à une espèce et même à une fraction géographique.
Peuplement C’est l’ensemble des individus appartenant à un groupe systématique

d’ordre élevé vivant dans un biotope déterminé. Par exemple, on parlera du
peuplement de petits Cétacés de la Méditerranée occidentale, et de la population de
Delphinus delphis de la région de Gibraltar.
Ecologie des milieux marin et continentaux Dr. HafsaouI imed

Définitions
Espèce: Ensemble de tous les individus semblables ayant en commun des

caractères morphologiques et physiologiques héréditaires et qui sont capables de se
reproduire entre eux en engendrant des individus.
Espèce caractéristique exclusive: c'est-à-dire strictement inféodées, quelles que

soient leur abondance et leur dominance à un biotope donné.
Espèce caractéristique préférentielle: c'est-à-dire plus abondantes dans un

biotope que dans tous les autres.
Espèce endémique: une espèce naturellement restreinte à une zone limitée, dont
la géographie est cernée; une espèce endémique est contraire à une espèce
cosmopolite. Généralement, le terme d'endémisme est limité en usage aux
organismes supérieurs, les animaux et les plantes.

Définitions
Espèce indicatrice: un organisme dont la présence fournit des informations sur la

condition totale de l'écosystème et sur les autres espèces de cet écosystème. La
présence ou l'abondance de l'espèce a une signification écologique particulière,
"indiquant'‘ par exemple une évolution, un état de référence particulier, la présence
d'autres espèces...
Les espèces pionnières: constituent les premiers organismes à coloniser un milieu

après son apparition (île volcanique) ou après une catastrophe naturelle (incendie,
crue, etc.). Au fur et à mesure qu'elles modifieront le milieu, elles seront remplacées
par d'autres espèces moins spécialisées ou plus exigeantes.
Notion d’enclave: C’est un terme qui est employé pour définir l’existence locale et
pour des raisons microclimatiques, d’une biocénose à l’intérieur d’une surface
occupée par une autre biocénose.
Notion de faciès: un faciès est représenté dans une biocénose lorsque la

prédominance locale de certains facteurs écologiques, entraîne le développement
exagéré d’une ou d’un petit nombre d’espèces sans que la composition qualitative
de la biocénose soit modifiée (richesse spécifique constante).

Définitions
Notion d’étage: est l’espace vertical du domaine benthique marin où les conditions
écologiques sont sensiblement constantes ou varient régulièrement entre les deux
niveaux critiques, marquant les conditions limites des étages consécutifs.
Niveau critique: C’est l’espace qui marque la limite entre deux étages successifs,
ce sont les niveaux qui marquent le changement des conditions des facteurs
écologiques d’un étage à un autre. Par conséquent, c’est une limite floue où on
assiste à un passage progressif entre deux étages consécutifs. A des facteurs
écologiques différents vont apparaître des peuplements caractéristiques.
Notion d’horizon: C’est une subdivision verticale élémentaire au sein d’un même
étage. Entre deux horizons d’un même étage on note une légère différence des
conditions écologiques. Un ensemble d’horizons forme un étage et chaque horizon
constitue un sous étage.
Notion de système: C’est un ensemble d’étages présentant un ou plusieurs

facteurs écologiques communs.

Subdivisions et étagements
Adlittoral: il est le dernier étage continental, où

les conditions plus extrêmes (avec de plus fortes
variations des paramètres physico-chimiques)
ne permettent l’installation que de quelques
espèces, tels que les lichens ou la salicorne.
Lichens Benthique Salicorne

Supralittoral: il est le premier étage marin. Il n’est jamais

immergé, même à marée haute, mais reste fortement humidifié
par les embruns, l’importance de cet étage dépend fortement
de la force des vagues: plus elles sont nombreuses et
puissantes plus l’étage est étendu.
On peut y retrouver les lichens, mais également des
cyanobactéries qui vont être broutés par des petits mollusques
marins appelés « littorines », des crustacés etc.
Cyanobactéries Benthique Littorines

Médiolittoral: il est submergé à chaque marée haute et

découvert lors des marées basses. Cet étage est
soumis à la contrainte des vagues et des marée. Il est
peuplé par des organismes plus polyvalents qui
supportent des périodes plongées d’immersion et de
sècheresse. On parle a lors d’espèces résistantes, à
forte capacité d’adaptation.
Les Patelles Algue brune

Benthique
Infralittoral: il reste totalement immergé,

même à marée basse la limite inférieur de cet
étage correspond à la limite de pénétration de
la lumière, et la capacité des espèces à réaliser
la photosynthèse.
Phanérogames Algue rouge

Benthique
Circalittoral: il se situe au delà de l’étage

infralittoral, là où les algues photopiles commencent
à se faire rares. Il se termine lorsque les organismes
sciaphiles (nécessitant très peu de lumière)
disparaissent à leur tour.
Algue coralligène
Benthique

Le système aphytal qui ne comporte plus que des animaux comprend 3 étages :
•l' étage bathyal qui correspond aux peuplements qui se développent sur le talus
continental et son pied en pente douce,
•l' étage abyssal comprend les peuplements de la grande plaine à pente très faible
qui succède au talus continental,
•l' étage hadal qui englobe les ravins et les fosses profondes (5100 mètres dans la
fosse de Matapan au large du Péloponnèse) mais qui en Méditerranée ne présente
aucune espèce caractéristique (la température étant voisine de 13° C dès la
profondeur de 300 m alors que dans l'Océan elle diminue avec la profondeur). On
note toutefois la présence de bactéries barophiles capables de supporter les très
fortes pressions qui règnent à ces profondeurs.

Pélagique
Épipélagique (de la surface jusqu'à 200 mètres) - Espace où la lumière est

suffisante pour permettre la photosynthèse, les plantes et animaux étant largement
concentrés dans cette zone. Cet espace est aussi appelé zone photique.
Mésopélagique (entre 200 et 1 000 mètres) - La lumière arrivant à pénétrer ces

profondeurs est insuffisante pour la photosynthèse. Le nom vient du grec μέσον
(meson), « milieu ». Cet espace est aussi appelé zone aphotique.
Bathypélagique (entre 1 000 mètres et 4 000 mètres) - À cette profondeur,

l'océan est presque entièrement sombre (avec simplement les organismes
bioluminescents). Il n'y a pas de plantes vivantes et la plupart des animaux
survivent en consommant la neige marine des détritus tombant des zones au-
dessus, ou par la chasse d'autres organismes. Les calmars géants vivent à cette
profondeur, où ils sont chassés par le cachalot. Le nom vient du grec βαθύς
(bathys), « profond ».
Pélagique
Abyssopélagique (de 4 000 mètres jusqu'à la croûte océanique) - Aucune lumière

quelle qu'elle soit ne pénètre à cette profondeur. La plupart des êtres vivants sont
aveugles et albinos. Le nom vient du grec άβυσσος (abyssos), « abysse »,
signifiant « sans fond » (dans les temps anciens, on croyait que l'océan était sans
fond).
Hadopélagique (les profondeurs des failles océaniques, jusqu'à 11 000 mètres) -

Le nom dérive de Hadès, dieu de la mythologie grecque régnant sur le monde
souterrain. Cette zone est en très grande partie inconnue et très peu d'espèces y
ont été répertoriées.
Pélagique
Merci
Chapitre 2: Les facteurs écologiques de
milieu aquatique
Facteur lumière
Le facteur lumière et liée a d’autre facteurs qui sont:

 l’éclairement on fonction du lieu géographique
 l’éclairement on fonction des saisons
 l’état du ciel (la nébulosité)
 la turbidité de l’eau

Facteur lumière
Algue photophile
Algue sciaphile
La profondeur de compensation :
C’est la ou les végétaux marin présente un équilibre entre
la respiration et la photosynthèse, cette profondeur se situé
a (-50m) la ou 1% de la lumière de surface arrive ou de là
ver le fond de la consommation d’oxygène et plus importent
que la photosynthèse, autrement dit l’assimilation
chlorophyllienne est faible pour assuré ou algues une
synthèse de matière vivante en surface

Facteur lumière
Les organismes marins sent des espèces qui se déplacent par rapport a la
lumière par le phénomène « phototropistes »
Est la capacité d’un organisme à s’orienter par

rapport à la lumière. Ce tropisme s’effectue soit dans
la direction de la lumière (phototropisme positif ou
organisme phototrope positif), soit dans la direction
opposée (phototropisme négatif ou organisme
phototrope négatif).
Diurne Nocturne

Facteur Salinité
C’est un facteur plus ou moins important, la salinité moyenne serait de 25 PSU %,

elle est variable selon les mers ou océans :
 La salinité océanique : 33-37 PSU
 Mer rouge 41 PSU
 Mer baltique 12 PSU
Espèce euryhaline Espèces sténohalines

(2- 68 PSU) (34-38 PSU)

Facteur Oxygène
L’oxygène est indispensable à tous les espèces aérobies est utilisé par
l’oxydation de la nourriture qui libère de l’énergie nécessaire a toute activité
vitale (nage, chasse, reproduction)
200 cm3 /L
10 cm3 /L
La valeur de saturation dans l’eau de mer = 8 cm3/l (eau froide) et 4.5cm3/l dans
les milieux chaudes

Facteur Oxygène
La zone eutrophe et la zone oligotrophe : il Ya une très grande demande

d’oxygène peut arriver à diminuée ou puiser le milieu et le rendre anoxique ce
qu’il entraîne une dystrophie.
La quantité d’oxygène qui peut être dessous dans l’eau varie en fonction de la
T°C et de la salinité. La décomposition de la matière organique par de
nombreux microorganismes de la colonne d’eau consomme aussi de l’O2
(D.B.O),
Le manque d’O2 souvient surtout en été ou il y a de forte T°C, la concentration

augmente de la salinité et une abondance des végétaux ce qu’il entraîne une
respiration et une consommation importante en O2 pour les organismes marins.
Pendent les périodes estivaux et surtout dans les milieux calme ce qu’il forme
une stratification du milieu avec un gradient d’oxygène. L’O2 est importent pour
le benthos, son absence entraîne la disparition des espèces.

Facteur Oxygène
Exondation : c’est durée relatif d’humectation dont l’action et limité à la

ceinture intertidale.
 La ceinture (zone) intertidale : qualifié l’espace côtier entre limite

extrême des marées
 Cette exondation est très minime en méditerrané : vue qu’il y a

pas beaucoup de marée
 Cette exondation est liée à hydrodynamisme marin (courant

marée, houle, vagues.)
 Le terme d’humectation touche particulièrement 2 étages du

domaine benthique : étage subra littoral et étage médiolittoral

Facteur PH
Le pH influence fortement la diversité biologique des écosystèmes aquatiques.

En effet, la majorité des organismes aquatiques ont besoin d’un pH voisin de la
neutralité (6-9) afin de survivre. Des variations importantes de pH peuvent donc
compromettre certaines de leurs fonctions essentielles telles que la respiration
et la reproduction. Ainsi, les eaux acidifiées sont caractérisées par un déclin de
la diversité biologique.

Facteur PH
Le facteur le plus important est la géologie du sol. Si

les calcaires dominent, l’eau sera basique et aura la
capacité de neutraliser les pluies acides. En
présence de roche granitique, l’eau a déjà une
tendance acide et sera très sensible à des apports
supplémentaires en eaux acides.
Le dioxyde de carbone (CO2), issu de la respiration des organismes, a un effet

acidifiant sur l’eau. Toutefois, ce phénomène est en partie compensé par les
organismes qui utilisent le CO2 lors de la photosynthèse, ce qui a pour effet
d’augmenter le pH de l’eau (l’eau devient moins acide). Ainsi, le pH d’un lac
change tout au long de la journée, car l’équilibre entre la photosynthèse et la
respiration des organismes aquatiques varie avec les changements de
température et d’intensité lumineuse.

Facteur PH

Facteur PH

Facteur Edaphique
Les conditions environnementales sont

déterminées plus par les caractéristiques
physiques, chimiques et biologiques du sol
(nature, acidité, basicité, granulométrie, texture,
structure, dureté, porosité, humidité...) que par
le climat. Chacune de ces propriétés va
déterminer un biotope et un écosystème précis
desquels des espèces animales et végétales
dépendent quand elles sont endémiques.
Les facteurs édaphiques comprennent les propriétés physiques, chimiques et

biologiques de la terre, ainsi que les roches sur lesquelles la terre se développe.
Pour les organismes vivant dans la zone, ces facteurs sont primordiaux, et
également pour les plantes. Les plantes se développent et vivent sur de la terre,
sur la surface du sol. Par conséquent, ces facteurs sont des facteurs
environnementaux très importants.

Facteur Edaphique
La granulométrie : c une technique qui permet

de définir les différentes fractions qui compose
le sédiment ou la taille moyenne des grains
(sable 0.02mm-2mm), (gravier >2mm), vases
(<2mm),

Facteur Edaphique

Les Facteurs biotiques
Réactions Réaction
intraspécifiques interspécifiques
La compétition La compétition
La coopération La symbiose
La reproduction Le parasitisme

Relation prédateur/proie


Effet de groupe : est l’ensemble des modifications physiologiques,

morphologiques et du comportement qui apparaissent lorsque plusieurs
individus de la même espèce vivent ensemble dans un espace
raisonnable et avec une quantité de nourriture suffisante.
Effets bénéfiques du groupement des individus de la même espèce .
- L'effet de groupe agit sur la vitesse de croissance

- L'effet de groupe agit sur la fécondité et reproduction.
- La vie en groupe permet en particulier de limiter l'effet des prédateurs
- La vie en groupe aide à la prédation .
- La vie en groupe permet une coopération intraspécifique
- L’effet de groupe peut entraîner des modification morphologiques et
physiologiques spectaculaires chez certaines espèces.

L’effet de masse : A l’inverse de l’effet de groupe, l’effet de masse se

produit, quand le milieu, souvent surpeuplé, provoque une compétition
sévère aux conséquences néfastes pour les individus. Les effets
néfastes de ces compétitions ont des conséquences sur le métabolisme
et la physiologie des individus qui se traduisent par des perturbations,
comme la baisse du taux de fécondité, la diminution de la natalité,
l’augmentation de la mortalité. Chez certains organismes, le
surpeuplement entraine des phénomènes appelés phénomènes d’
autoélimination.

Chapitre 4: Necton
Le terme de Necton (par opposition au plancton) a été proposé

par Ernst Haeckel en 1890. Il représente l’ensemble des
organismes capables de nager dans l’eau contre les courants,
comme c’est le cas des "poissons", de certains oiseaux
(manchots), des crustacés (natantia), des céphalopodes
(calmars, sépia), des tortues et des mammifères marins (baleine,
dauphin).


Gnathostomes
Chondrichthyes Osteichthyes

Chondrichthyes
 4 à 7 paires de fentes branchiales septales

 Squelette cartilagineux, souvent post
(à l’exception chez les Holocéphales).
calcifié, jamais osseux.
 Circulation totalement close.
 Crâne constitué d’une seule pièce.
 Tube digestif à valvule spirale.
 Mâchoires munies d’une dentition plus
ou moins développés.  Lobes olfactifs développés.
 Nageoires paires soutenues par des  Organes copulateurs (claspers,
rayons cartilagineux. ptérygopodes, myxoptérygies) dérivés des
nageoires pelviennes.
 Pièces basales des nageoires soudées
aux ceintures.  Fécondation interne (oviparité, viviparité
placentaire et aplacentaire).
 Nageoire caudale hétérocerque.
 Absence de vessie natatoire.
 Ecailles placoïdes.
 Généralement carnivores ou microphages.
 Bouche ventrale surmontée d’un rostre.
 Essentiellement marins.

Chondrichthyes

Chondrichthyes

Figure 3 : Morphologie générale d’une chimère

Osteichthyes
- Ce groupe est le représenté numériquement (18000 espèces).

- Un squelette calcifié.
- La présence d’écailles dermiques de types ganoïde (Chondrostéens et
Holostéens) ou élasmoïde (Téléostéens).
- Une vessie natatoire close chez les formes évoluées (physocliste) ou
communiquant avec le tube digestif (physostome).
- Des nageoires paires et impaires avec rayons ossifiés et/ou mous.
- Une nageoire caudale hétérocerque (Chondrostéens) ou homocerque
(Téléostéens).
- Un système branchial recouvert par un opercule.
- Une fécondation généralement externe, rarement interne (oviparité et
viviparité).

Osteichthyes
Figure 4. Morphologie générale d’un Osteichthyes

Figure 5 : Malacoptérygiens (du haut vers le bas et de gauche à droite : Clupéiformes,

Cypriniformes, Anguilliformes, Beloniformes, Cyprinodontiformes, Gadiformes).
Figure 6. Acanthoptérygiens (du haut vers le

bas et de gauche à droite : Mugiliformes,
Zeiformes, Perciformes, Pleuronectiformes et
Lophiiformes).





Biologie et écologie de
quelques familles d’intérêt
économique
Clupeidae
Les Clupéidés sont généralement des poissons littoraux et néritiques (zone du plateau
continental). Ils ont un comportement grégaire, migrateur à caractère saisonnier. Cette
famille regroupe principalement 2 espèces: la sardine (Sardina pilchardus) et la
sardinelle ou allache (Sardinella aurita).

Sparidae
Populations côtières
(de gauche à droite,
de haut en bas : sars
Diplodus sargus
sargus, D. vulgaris,
D. annularis ; marbré
Lithognathus
mormyrus ; oblade
Oblada melanura ;
daurade Sparus
aurata, saupe Sarpa
salpa ; bogue Boops
boops).

Sparidae
Populations hauturières (à
gauche, de haut en bas : pageot
Pagellus erythrinus ; Dentis
Dentex macrophtalmus et D.
maroccanus).

Mugilidae

Serranidae

Sciaenidae
Figure 10 : Le corb Sciaena umbra.

Mullidae

Chapitre 5: Domaine pélagique
Le terme de plancton a été introduit pour la première fois par

Hensen en 1887. Il peut se définir comme: l'ensemble des
organismes pélagiques, animaux ou végétaux, entraînés
passivement par les mouvements d'eau. Le phytoplancton
représente la partie végétale de cet ensemble: ce sont des
végétaux marins appartenant au groupe des algues.
Dans une définition plus générale, le phytoplancton est l'ensemble

des organismes végétaux, présents dans le milieu pélagique et
entraînés passivement par les mouvements d'eau dans le plan
horizontal.

Des critères de taille permettent de séparer le plancton en plusieurs classes:

• le picoplancton, inférieur à 2 µm, est constitué de bactéries auto- et
hétérotrophes et de Cyanobactéries;
• le nanoplancton, entre 2 et 20 µm, comprend les petites Diatomées, des flagellés
auto- et hétérotrophes, les Coccolithophoridées et les Silicoflagellés;
• le microplancton est constitué d’organismes dont la taille est comprise entre 20
et 200 µm. Le microphytoplancton est essentiellement constitué de Diatomées et
de Dinoflagellés autotrophes.
• Le microzooplancton, d’importance considérable pour l’écosystème
planctonique, est essentiellement constitué de Dinoflagellés hétérotrophes, de
Ciliés ainsi que des formes juvéniles des Copépodes et d’autres groupes
mésozoo- planctoniques;
• le mésoplancton a des dimensions comprises entre 200 et 2000 µm. Il est
comprend essentiellement des organismes zooplanctoniques (le
mésozooplancton), dont le grand groupe des Copépodes ;
• au-delà, on trouve le macroplancton et le mégaplancton, essentiellement
constitué d’Euphausiacés, de Méduses et de Salpes. On utilise souvent le terme
de métazooplancton pour désigner les organismes de taille supérieure au
mésozooplancton.

Certaines espèces passent leur vie entière dans le plancton: ce sont les
espèces holoplanctoniques (Copépodes, Cladocères, Chétognathes).
D'autres espèces n'y passent qu'une partie (soit la vie larvaire, soit la
vie adulte): ce sont les espèces méroplanctoniques.
Des critères de répartition spatiale verticale dans la colonne d'eau

peuvent également être appliqués: on parle d’épi-, de méso- et de
bathyplancton. Le pleuston est constitué d'espèces vivant à l'interface
air-mer (e.g. Velelles, Labidocera sp.). Enfin, on distingue le plancton
néritique (zones côtières et plateaux continentaux) du plancton
océanique.











Les Diatomées

Les Dinoflagellés

Les Prymnésiophycées

Les Silicoflagellés
Dictyocha fibula

Les Cyanobactéries



Le mésozooplancton
Les Copépodes

Le mésozooplancton
Les Cladocères

Le mésozooplancton
Les Ostracodes

Le mésozooplancton
Les Ostracodes


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Dr. HAFSAOUI Imed Email: imedhafsaoui@yahoo.fr

Chapitre 2 Facteurs écologiques du milieu aquatique

Chapitre 3 Domaine benthique

Chapitre 4 Domaine pélagique

Biocénose est un groupement d'êtres vivants correspondant par sa composition,

Biotope C’est une aire géographique de surface ou de volume variable, soumise à

Peuplement C’est l’ensemble des individus appartenant à un groupe systématique

Ecologie des milieux marin et continentaux Dr. HafsaouI imed

Espèce: Ensemble de tous les individus semblables ayant en commun des

Espèce caractéristique exclusive: c'est-à-dire strictement inféodées, quelles que

Espèce caractéristique préférentielle: c'est-à-dire plus abondantes dans un

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Espèce indicatrice: un organisme dont la présence fournit des informations sur la

Les espèces pionnières: constituent les premiers organismes à coloniser un milieu

Notion de faciès: un faciès est représenté dans une biocénose lorsque la

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Notion de système: C’est un ensemble d’étages présentant un ou plusieurs

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Adlittoral: il est le dernier étage continental, où

Lichens Benthique Salicorne

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Supralittoral: il est le premier étage marin. Il n’est jamais

Cyanobactéries Benthique Littorines

Médiolittoral: il est submergé à chaque marée haute et

Les Patelles Algue brune

Infralittoral: il reste totalement immergé,

Phanérogames Algue rouge

Circalittoral: il se situe au delà de l’étage

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Épipélagique (de la surface jusqu'à 200 mètres) - Espace où la lumière est

Mésopélagique (entre 200 et 1 000 mètres) - La lumière arrivant à pénétrer ces

Bathypélagique (entre 1 000 mètres et 4 000 mètres) - À cette profondeur,

Abyssopélagique (de 4 000 mètres jusqu'à la croûte océanique) - Aucune lumière

Hadopélagique (les profondeurs des failles océaniques, jusqu'à 11 000 mètres) -

Le facteur lumière et liée a d’autre facteurs qui sont:

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Est la capacité d’un organisme à s’orienter par

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C’est un facteur plus ou moins important, la salinité moyenne serait de 25 PSU %,

Espèce euryhaline Espèces sténohalines

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La zone eutrophe et la zone oligotrophe : il Ya une très grande demande

Le manque d’O2 souvient surtout en été ou il y a de forte T°C, la concentration

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Exondation : c’est durée relatif d’humectation dont l’action et limité à la

 La ceinture (zone) intertidale : qualifié l’espace côtier entre limite

 Cette exondation est très minime en méditerrané : vue qu’il y a

 Cette exondation est liée à hydrodynamisme marin (courant

 Le terme d’humectation touche particulièrement 2 étages du

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Le pH influence fortement la diversité biologique des écosystèmes aquatiques.

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Le facteur le plus important est la géologie du sol. Si

Le dioxyde de carbone (CO2), issu de la respiration des organismes, a un effet

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Les conditions environnementales sont

Les facteurs édaphiques comprennent les propriétés physiques, chimiques et