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DE LA CELLULE
I - Introduction
Les principaux constituants chimiques des cellules Procaryotes et Eucaryotes sont
les composés inorganiques (eau, éléments minéraux et oligoéléments) et
organiques (glucides, lipides, protides et acides nucléiques).
Le tableau 1, représente l’analyse de la composition chimique d’une cellule
Procaryote (bactérie) et d’une cellule Eucaryote (animale)
1- Eau
L’eau est le composé le plus abondant dans la cellule vivante. Chez l’homme, elle
représente environ 60 à 65 % du poids du corps, ce pourcentage est plus élevé chez
l’embryon (95%). Chez les invertébrés marins, 80 à 90 %, chez les végétaux 75 à 80%.
L’eau représente, en moyenne, 70% du poids de la cellule.
a) Caractéristiques et propriétés
La molécule d’eau se présente, globalement, sous une forme tétraédrique et comporte
deux donneurs et deux accepteurs de liaisons hydrogènes. On peut envisager que
l’oxygène d’une molécule d’eau établisse des liaisons hydrogènes avec plusieurs
molécules d’eau voisines.
L’oxygène attire le nuage électronique et
constitue une charge partielle négative
alors que les hydrogènes présentent une
charge partielle positive : l’eau est une
molécule polaire.
Molécule de H2O
• Les molécules qui établissent des liaisons avec l’eau sont des molécules
Hydrophiles (polaires ou chargées). Par exemple, chaque particule ionisée
est entourée d’une coque de molécule d’eau qui inhibe les interactions
électrostatiques avec d’autres ions (exemple : Ion potassium K+ entouré de
sa coque de molécules d’eau). Exemple : NaCl.
• Ce processus, par lequel une enveloppe de molécules d’eau entoure
chaque ion ou molécule polaire -dissoute- s’appelle hydratation.
b) Rôles physiologiques:
Les rôles de l’eau sont multiples:
* excellent solvant pour la solubilisation des éléments chimiques à l’intérieur de la
cellule. Solvant pour les sels minéraux et pour de nombreux constituants organiques
porteurs de radicaux dits polaires ou hydrophiles libres.
* milieu de dispersion : pour les macromolécules du hyaloplasme, ou pour les
éléments chimiques et figurés des liquides biologiques (sang, liquide céphalo-
rachidien, liquides interstitiels).
* réactif chimique qui participe à des réactions biochimiques à l’intérieur de la
cellule (Ex : Réactions métaboliques).
** réactions d’oxydoréductions.
** réactions acido-basiques : NaOH+ HCl → NaCl + H2O
* stabilisateur : l’eau intervient dans la :
** stabilisation des structures cellulaires comme au sein des bicouches
phospholipidiques des membranes, les protéines et d’autres
macromolécules sont tous stabilisées par un effet hydrophobe lié à
l’élimination de l’eau des régions non polaires et en formant des liaisons
hydrogènes avec des groupes polaires.
** stabilisation de la température, l’eau absorbe de la chaleur dans un
milieu plus chaud et libère de la chaleur lorsqu’elle se trouve dans un
milieu plus froid.
* tampon: une solution tampon est une solution capable d’absorber une
certaine quantité d’acide ou de base sans entraîner une forte variation de pH.
Le pH du sang humain doit être fixé dans un domaine, relativement, étroit
autour de 7,4 afin d’assurer la survie cellulaire, il peut être maintenu grâce à
des systèmes tampons faisant intervenir des carbonates, des phosphates ou des
protéines plasmatiques. Les solutions tampons qui maintiennent le pH sanguin
à 7.2 sont, principalement, l’acide carbonique et le bicarbonate.
* maintient de l’équilibre osmotique : l’eau intervient dans le maintien de
l’équilibre des solutés à l’intérieur ou à l’extérieur de la cellule
(Homéostasie). La diffusion de l’eau à travers la membrane cellulaire, ainsi
que, l’équilibre hydrique entre la cellule et son milieu sont essentiels aux
organismes.
Pour maintenir l’équilibre cellulaire, l’eau se déplace du milieu le moins
concentré en soluté (milieu hypotonique) vers le milieu le plus concentré
en ce soluté (milieu hypertonique) jusqu’à l’équilibre (isotonie) : ce
phénomène est appelé osmose.
2- Eléments minéraux et Oligoéléments
carbone a
résidu R
Les 20 acides aminés qui composent les protéines
b) Les Peptides
Un peptide est une courte chaîne d’acides aminés dont le nombre est < 51
Chaque acide aminé est incorporé dans la chaîne par établissement d’une liaison
peptidique : La réaction du groupement α–carboxylique d’un acide aminé avec le
groupement α-amine d’un autre acide aminé permet à ces deux aminoacides de s’unir par
formation d’un amide avec l’établissement d’une liaison peptidique (avec élimination
d’une molécule d’eau).
( ─ C ─ N─ )
║ |
O H
Liaison peptidique = liaison amide
Les Peptides sont des structures chimiques très importantes sur le plan
biologique, en particulier, les Peptides hormonaux et les Peptides
antibiotiques.
Exemples :
- Ocytocine agit sur la contraction du muscle utérin,
- Vasopressine présente une action hypertensive et antidiurétique,
- Insuline est secrétée par les cellules béta des îlots de Langerhans
pour abaisser la glycémie.
c) Les Protéines
b) structure secondaire:
La structure secondaire d’une protéine fait référence à des régions de repliement régulier
de la chaîne polypeptidique par interaction entre acides aminés voisins. Les deux types de
structure secondaire les plus communs sont l’hélice a et le feuillet b plissé.
Types d’interactions
intervenant dans le
repliement de la
chaîne protéique.
- L’hélice a a un arrangement hélicoïdal des acides aminés dans la chaîne
polypeptidique maintenue par des liaisons Hydrogènes parallèles à l’axe de l’hélice a.
Exemple de protéine structurée en hélice α : la protéine alpha kératine. Les ongles,
la couche cornée de la peau, la corne des animaux, les cheveux, les poils et les
plumes sont toutes des structures essentiellement constituées de kératine.
Hélice a
- Dans un feuillet b, les liaisons Hydrogènes se forment entre des régions
adjacentes du polypeptide qui, soit :
* ont la même orientation (feuillet b parallèle),
* sont orientées dans des directions opposées (feuillet b antiparallèle).
Exemple. : Les fibroïnes de soie sont des protéines fibreuses de structure
en feuillet β, aussi appelées protéines de soie.
E + S ES E + P
Enzyme Substrat Complexe enzyme-substrat Produit de la R°
• Le site actif est une entité tridimensionnelle, souvent une fissure située à la surface de
la protéine, dans laquelle le substrat est lié par de multiples interactions faibles.
- Les Hydrolases :
A-B + H-OH AH + B-OH
** les protéases, les lipases, les glycosidases, la DNase, la RNase
- Les Oxydo-réductases
** les déshydrogénases, les transporteurs d’hydrogène, transporteurs d’électrons.
A- + B A + B-
Pour qu’une réaction biochimique puisse se dérouler, il est nécessaire
de franchir la barrière énergétique qui correspond au passage des
molécules de substrat dans un état de transition. L’état de transition
possède l’énergie libre la plus élevée de tous les composés intervenant
dans la réaction. La différence d’énergie libre entre le substrat et l’état
de la transition est appelée énergie libre d’activation de Gibbs
(DG**). La catalyse enzymatique baisse (DG**), augmentant ainsi la
vitesse de la réaction.
La différence de niveau d’énergie entre les substrats et les produits est
appelée la variation d’énergie libre de Gibbs (DG)
Un (DG) négatif indique que la réaction est favorable du point de vue
thermodynamique dans le sens indiqué.
Un (DG) positif indique que la réaction est défavorable et nécessite un
apport d’énergie pour pouvoir se dérouler dans le sens indiqué
(hydrolyse de l’ATP source d’énergie en exemple)
•On les trouve en petites quantités à l’état libre, mais en grandes quantités liées à d’autres
molécules par des liaisons esters ou, parfois, amides. C’est sous cette dernière forme qu’ils
existent dans les aliments.
•Les acides gras sont :
- le plus souvent, mono-carboxylique (- COOH),
- à nombre pair d’atomes de carbone (entre 4 et 40),
- soit saturés (absence de double liaison entre les atomes de C )
-soit insaturés (présence d’une ou plusieurs doubles liaisons entre les atomes de C ),
C17H31-COOH
B - Classification des lipides
Les lipides appartiennent à deux classes :
• Lipides Simples= homolipides : C, H, O
• Lipides Complexes = hétérolipides : C, H, O, N, P, S
1) Lipides simples (Homolipides)
Ils sont formés, uniquement, d’esters d’Acides Gras.
Réaction d’estérification
Le rôle biologique des Cérides est variable selon les espèces: ce sont surtout des
revêtements de protection et, beaucoup plus rarement, des substances de réserves.
Les Animaux et l’Homme ne peuvent pas métaboliser les Cérides (cad les dégrader),
c. Les Stérides
Ce sont des esters d’Acides Gras (en C16 ou C18) et d’alcools de type stérols
(alcool polycyclique).
Cholestérol
Exemples :
- Oléate de cholestérol,
- Palmitate de cholestérol,
- Stéarate de cholestérol.
Acide stéarique
stéarate de cholestérol.
Phosphatidylcholine
• Ils sont les plus abondants des phospholipides membranaires (couche externe),
• se trouvent dans le cerveau, le foie, le jaune d’œuf…
• Le dipalmitoyl-phosphatidylcholine est un surfactant pulmonaire, son absence
chez les prématurés est un syndrome de détresse respiratoire.
2. Phosphatidyléthanolamines (PE): représentent 10% des phospholipides du cerveau
et du muscle.
3. Phosphatidylsérines (PS): abondant dans le tissu nerveux cérébral et dans la gaine
de myéline.
❑ Ils ont une structure analogue des phosphoglycérolipides sauf que le glycérol est
remplacé par un amino-alcool: la Sphingosine (amino-glycol éthylénique en
C18).
❑ Les Sphingolipides se différencient des autres lipides par le fait que l’Acide Gras
n’est pas engagé dans les molécules par l’intermédiaire d’une liaison ester mais
par une liaison amide avec la fonction amine primaire de la Sphingosine.
❑ L’association entre un Acide Gras et la Sphingosine donne une Céramide qui est
un précurseur pour des Sphingolipides plus complexes (Cérébrosides,
Sphingomyélines, Gangliosides).
Formation de la molécule de céramide
Fixation d’un AG
Sphingosine
Acide gras
H2O
Représentation schématique
d’une molécule de phospholipide
Formule de la sphingosine, de la
céramide, d’un sphingophospholipide et
d’un sphingoglycolipide
❑ Les Céramides permettent :
- le maintien de l’intégrité épidermique,
- la signalisation cellulaire dans les cas de l’apoptose (mort cellulaire),
- la différenciation et prolifération cellulaire,
- les interactions membranaires.
cérébroside
Exemples de Glycolipides:
•Cérébrosides (glycosylcérébrosides) (1 ou plusieurs hexoses)
● Sphingosine + AG + D-Galactose (exemple : cérébrogalactosides).
● Sphingosine + AG + D-Glucose (exemple : cérébroglucides).
•Gangliosides (un ou plusieurs hexoses et l’acide neuraminique)
● Sphingosine + AG + chaîne de plusieurs oses (2, 3 ou 4) et acide N-acétyl-neuraminique
(NANA) = acide sialique (dérivés d’oses) (jusqu’à 4)
•Sulfatides : Sphingosine + AG + ose sulfaté : galactocérébrosides sulfatés (SO42-))
Sphingomyéline
Cérébrosides
cérébroside
cérébroside
Gangliosides
Molécules de Sphingolipides
sulfatide
Sphingosine + Acide Gras + galactose sulfaté
Les Lipoprotéines
• Les Lipoprotéines transportent les lipides du plasma (V.L.D.L., L.D.L. et H.D.L.) d’un
tissu à l’autre, permettant ainsi le transport de composés hydrophobes (lipides) dans
un milieu hydrophile (plasma sanguin).
• Abondantes dans le sérum sanguin et dans le tissu nerveux.
• Elles sont, aussi, présentes dans les membranes plasmiques. Ce sont de volumineuses
molécules polaires formées par l’association non covalente de protéines et lipides.
3 – Glucides
A - Définition :
• Les glucides sont des composés ternaires (C, H, O), universellement,
répandus dans les tissus des végétaux (70% du poids sec) qui les
élaborent par la voie de la photosynthèse à partir de CO2 et H2O et les
fournissent aux animaux (5% du poids sec).
• Les glucides constituent un ensemble de substances dont les unités de
base sont les sucres simples appelés oses.
B - Quelques exemples de glucides d’importance physiologique
C- Rôles biologiques des Glucides
N.B. Seul les oses sont adsorbés par l’intestin mais pas les osides.
1) Les Oses
a) Définition :
• Les Oses, de formule brute CnH2nOn sont composés d'une chaîne carbonée non ramifiée,
de 3 à 7 carbones, ne comportant que des liaisons simples.
• Ce sont des molécules comportant (n-1) fonctions alcools, portées sur tous les carbones
sauf un, qui porte une fonction réductrice de type cétone ou aldéhyde (fonction
carbonyle).
❑ Si la fonction réductrice est de type aldéhyde, on a un ose de type aldose ; la fonction
carbonyle est portée par le premier carbone. Exemple : glucose (C6H12O6)
❑ si la fonction réductrice est de type cétone, on a un ose de type cétose; la fonction
carbonyle se trouve sur le second carbone, Exemple le fructose.
- le nombre d’atomes de carbone : de trois à sept Carbone (triose, tétrose, pentose, hexose...)
Structure
cyclique
Exemples de dérivés d’oses
Les oses possèdent plusieurs dérivés comme :
- les osamines (remplacement d’un groupement hydroxyle OH du C2 par un
groupement amine NH2). Ceci ne concerne que les Oses de type Aldose.
- Les désoxyoses (enlèvement d’un atome d’oxygène) : cas du désoxyribose
qui est un dérivé du ribose.
- Les acides uroniques, dérivés d’Aldose dans lesquels la fonction alcool Ière
OH en C6 est remplacée par un groupement carboxylique (COOH).
Acide N-acétylneuraminique
2) Les Osides :
Certains oses existent dans la nature à l’état libre, tel que le glucose ou le fructose
mais le plus souvent, les oses se trouvent associés soit :
* entre eux : Holosides (associations ne comportant que des oses)
* entre eux et avec des substances diverses de nature non glucidiques :
Hétérosides
• Les osides sont, donc, des molécules glucidiques qui donnent par hydrolyse
soit, uniquement des molécules d’oses (Holosides) ou bien des molécules
d’oses et des substances non glucidiques (Hétérosides).
• Les Oses entrant dans la composition des Osides peuvent être identiques ou
différents.
a) Les Holosides :
Les Holosides se forment suite à l’établissement d’une ou plusieurs liaisons
osidiques (liaisons glycosidiques) entre les oses.
La dénomination se fait en indiquant les carbones des deux oses impliqués
dans la liaison osidique. On distinguera suivant la présence ou l’absence d’un
OH libre sur le carbone anomérique.
• des osides réducteurs
• des osides non réducteurs
Deux oses sont unis, entre eux, par une liaison osidique (glycosidique) pour donner un
diholoside. Selon le mode de liaison des 2 oses, le diholoside peut être non réducteur ou
réducteur.
* Diholoside non réducteur :
Il y a condensation de la fonction hémiacétalique de chaque ose
par une liaison osidique entre les deux oses.
* Diholoside réducteur :
Il y a condensation d’une fonction hémiacétalique d’un ose avec une fonction
alcoolique d’un second ose par une liaison osidique. Il reste donc dans le
diholoside un -OH hémiacétalique libre responsable du pouvoir réducteur de la
molécule.
Exemples :
* le Maltose résulte de l’hydrolyse, lors de la digestion, des PolyHolosides
(Amidon et Glycogène) par les amylases. C’est un diholoside formé de deux
molécules de α-D-glucose, liées par une liaison osidique type α (1-4) entre le
carbone 1 (réducteur) de l’une et le carbone 4 (alcool IIaire) de l’autre. De ce fait,
c’est un oside réducteur. Il est hydrolysé en 2 molécules de glucose par une
enzyme spécifique, la maltase.
* le Lactose (oside réducteur) est le composé glucidique majeur présent
dans le lait de tous les Mammifères. Il est constitué d’une molécule de
Galactose et d’une molécule de Glucose unies par une liaison de type β 1-4
osidique. C’est un diholoside réducteur
*Le Saccharose
C’est le sucre de table. Très répandu dans les végétaux, il est formé par l’association
d’une molécule de Glucose et d’une molécule de Fructose réunies par une liaison
osidique de type α (1-2). C’est un diholoside non réducteur, Il résulte de la liaison
de deux oses : le α-D glucopyranosyl et le β-D fructofuranoside. Il est hydrolysable
par voie enzymatique avec une α glucosidase ou une β fructosidase.
- Les Polyholosides
Ce sont des composés glucidiques à haut poids moléculaire formés de plusieurs centaines voire
de plusieurs milliers d’oses associés par des liaisons osidiques en large chaînes linéaires ou
ramifiées (glycanes). Très répandus dans la nature, ces glycanes jouent un rôle de soutien ou de
réserve pour les cellules bactériennes, animales et végétales. Les Polyholosides, diffèrent les
uns des autres par :
• la nature de leur motif monomérique,
• la longueur de leur chaîne,
• leur degré de ramification,
Ils sont classés en :
- Homoglycanes (homopolysaccharides) dont le constituant élémentaire est le même ose.
* Homoglycanes de réserve :
** Glycogène formé par 104 à 105 résidus de glucose
** Amidon
* Homoglycanes de structure :
** Cellulose
Amidon : Forme hélicoïdale Cellulose : Forme droite
Ce sont des composés associant une chaîne glucidique à un composé non glucidique
appelé aglycane. Selon la nature de l’aglycane, on distingue :
b.1 : Les glycolipides : ils renferment une fraction lipidique associée à la chaîne
glucidique.
Exemples:
* Cérébrosides
* Gangliosides (galactose + fraction lipidique).
Principales Glycoprotéines :
* Hormones hypophysaires : L.H. et F.S.H.
* Haptoglobine du plasma
* Ovalbumine du blanc d’œuf
* Lectines végétales utilisés pour leurs propriétés d’agglutination des globules rouges.
une glycoprotéine
Pour la fraction glucidique on trouve 4 groupes de glucides :
✓ Oses : D mannose D galactose
✓ 6-désoxyhexoses : L fucose (6 désoxy L galactose)
✓ Glucosamine et galactosamine souvent acétylées
✓ Acide N-acétylneuraminique (NANA) souvent terminal qui donne leur
caractère acide aux glycoprotéines.
Ribose
Désoxyribose
- d’une base azoté cyclique (purine ou pyrimidine) :
-Dans l’ADN :
-Dans l’ARN :
b) Liaison glucide-phosphate
c) Formation d’un Nucléotide
La liaison phosphodiester
L’appariement entre les bases est exclusif, il est la conséquence de la complémentarité entre
les molécules (complémentarité stérique) pour qu’il y ait association :
La molécule d’ADN est une molécule bicaténaire constituée par l’association de deux
brins. Ces brins sont unis, l’un à l’autre, par l’intermédiaire de liaisons hydrogènes
associant les bases puriques ou pyrimidiques de chacune des deux chaînes.
Les ARN regroupent les ARNm, ARNt, ARNr. La longueur et le poids moléculaire des
ARN sont inférieurs à ceux de l’ADN, leur durée de vie est courte. Les ARN sont des
molécules