Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Programme:
- Base de la microbiologie
- Microbiologie du sol
- Phytopathologie
INTRODUCTION A LA MICROBIOLOGIE
Remarque:
Les virus: non considérés par de nombreux microbiologistes
comme des organismes vivants car non formés de cellules et
incapables de se reproduire par eux-mêmes (les vivants sont des
organismes capables d’engendrer des individus identiques à eux-
mêmes)
LA CELLULE PROCARYOTE
I) Morphologie bactérienne
La taille des bactéries de 1 à 10 microns (μ) ne sont visibles
qu'au microscope (optique ou électronique).
L’aspect morphologique des bactéries (la forme) très variable
3 grands groupes morphologiques:
La coloration Gram:
Une méthode de coloration très utilisée en bactériologie (base de la
classification bactérienne) mise en évidence des bactéries et
de leurs différences au niveau de leur paroi.
Se déroule en 3 temps:
- Coloration des bactéries au violet de gentiane (colorant de
base) et fixation de la coloration par le lugol toutes les
bactéries sont colorées en violet.
Remarque:
La paroi des bactéries Gram- est plus mince et plus riche en lipides
permet l’entrée de l’alcool dans la cellule décoloration
du cytoplasme.
2) La membrane cytoplasmique
Une membrane très mince à apparence brillante qui se trouve à
l’intérieur de la paroi et qui enveloppe le cytoplasme.
Présente en certains endroits des invaginations (repliements vers
l’intérieur du cytoplasme) appelées mésosomes =chondroïdes.
3) Le cytoplasme
C’est un système colloïdal (liquide + substances organiques et
minérales dissoutes) finement granuleux sans organites cellulaires
(pas de mitochondries ni appareil de Golgi) contenant des
ribosomes, des substances de réserves et des chromatophores.
- Les ribosomes (lieux de synthèse des protéines): une seule
cellule bactérienne peut contenir jusqu’à 50.000 ribosomes.
Chaque ribosome est une particule complexe formé d’ARN et de
protéines.
- Les substances de réserve: comme toutes les cellules vivantes,
les bactéries peuvent accumuler des substances organique ou
inorganiques qui forment des réserves (surtout énergétiques) de
la cellule. Ces substances, selon les espèces bactériennes, peuvent
être:
• des réserves organiques: des glucides ou des lipides
• des réserves inorganiques: des substances minérales utiles aux
diverses réactions dans la cellule (exemples: soufre, fer,
manganèse, silice)
4) L’appareil nucléaire
Ce n’est pas un vrai noyau comme chez les cellules eucaryotes car
non limité par une membrane nucléaire et ne contient pas de
chromosomes individualisés mais il assure un rôle équivalent car
c’est le support de l’hérédité (porte les caractères génétiques) de la
bactérie.
L’appareil nucléaire est formé surtout de fibrilles d’ADN.
4) La spore
Quand les conditions sont défavorables à une vie normale,
certaines espèces bactériennes forment une structure dormante
appelée endospore ou spore formation à l'intérieur de la
cellule libération dans le milieu environnant.
1)Source de carbone
En général, les besoins en C,H, O sont satisfaits simultanément
(même source).
Différences selon la source :
– bactéries autotrophes
– bactéries hétérotrophes
3) Source d’énergie
Selon la source d’énergie :
Bactéries phototrophes l’énergie nécessaire au métabolisme
est fournie par des réactions photochimiques (qui utilisent une
source lumineuse )
1) La température
Les bactéries sont thermosensibles: la température influence
considérablement leur nutrition donc leur développement.
Une bactérie se développe dans un intervalle de température (+ ou
– large selon l’espèce) avec:
- Température minimale : Température en dessous de laquelle la
nutrition est stoppée.
- Température maximale : Température au dessus de laquelle la
nutrition est stoppée.
- Température optimale : Température pour laquelle la nutrition
est la plus favorisée.
Remarques :
-La température optimale est toujours plus près de la température
maximale que de la minimale.
-Quand on s’éloigne de la température optimale: inhibition
progressive de la nutrition
2) Le pH :
pH = potentiel hydrogène indique la concentration en protons (H+)
dans le milieu
Cependant, il existe:
-des microorganismes acidophiles se développent à pH acide
(très faible)
-des microorganismes basophiles se développent à pH
basique (très élevé)
5) L’humidité (Aw)
La disponibilité de l’eau dans le milieu : un facteur déterminant
dans la vie des microorganismes (comme pour tout vivant).
L’eau joue deux rôles au cours de la nutrition microbienne:
- c’est le solvant des molécules organiques et inorganiques
- l’eau intervient dans les réactions enzymatiques comme réactif
(réaction d’hydrolyse).
A- Reproduction
Comme tout être vivant, les microorganismes se reproduisent.
n divisions cellulaires
2n cellules filles
G = temps de génération
2) La conjugaison
Un mode de reproduction sexuée qui permet à certaines
espèces bactériennes de survivre dans des conditions difficiles.
Transfert de matériel génétique d'une bactérie donatrice (joue
le rôle de " mâle " ) vers une bactérie réceptrice (jour le rôle de
" femelle « ) par un pont (pili sexuel).
Analogie avec la reproduction sexuelle des Eucaryotes
car il y a recombinaison génétique entre deux bactéries
(parents).
"Mâle" "Femelle"
Accolement, ouverture de l’ADN circulaire et transfert de matériel
génétique de la bactérie donatrice vers la bactérie acceptrice.
Lors des divisions par scissiparité de la nouvelle bactérie formée:
transmission des caractères des 2 parents à la descendance.
B - Paramètres de la croissance
Dans des conditions expérimentales déterminées (in-vitro), la
croissance d’une espèce microbienne (bactérienne) peut être
caractérisée par 2 paramètres d’état qui sont :
le temps de génération G et le taux de croissance μmax = μexpo.
1)Temps de génération
C’est l’intervalle de temps entre 2 divisions cellulaires successives =
le temps que prend une population bactérienne pour doubler en
nombre. Il varie selon les espèces et les conditions du milieu.
μ=n μ=1
t G
Au cours de la croissance d’une espèce microbienne, la vitesse
spécifique maximale est appelée le taux de croissance (μmax)
3) La cinétique de croissance
On étudie la croissance d’une population en analysant la courbe
de croissance d’une culture microbienne. L’espèce
microbienne est ensemencée (cultivée) dans un milieu
liquide (fermé) non renouvelé (sans apport de substrat au
cours de l’incubation donc la quantité de substances nutritives
diminue et la concentration de déchets augmente avec le
temps de culture)
5
4
3 6
1 2
temps de culture
X = nombre d’individus (bactéries)
ou quantité de biomasse (en g/l)
ou DO ou Log DO
1- Phase de latence:
temps d’adaptation des microorganismes au nouveau milieu
⇒la durée de la phase dépend de facteurs internes (type de la
bactérie, état physiologique des cellules…) ou exogènes
(composition du milieu, etc…)
⇒ les cellules ne se divisent pas (leur nombre reste constant) et
μ = 0 (pas de croissance)
2- Phase d’accélération :
Certains individus (déjà adaptés) commencent à se diviser mais
d’autres (non encore adaptés) ne se divisent pas encore la
moyenne donne μ > 0 mais valeur encore faible
4- Phase de ralentissement:
La quantité de substrat (nutriments) dans le milieu a beaucoup
diminuée et devient un facteur limitant de la croissance
⇒ toutes les cellules sont vivantes mais certaines ne se divisent
plus
⇒ le nombre d’individus dans le milieu augmente encore mais
faiblement
⇒ μ diminue (μ < μmax)
5- Phase stationnaire:
Le milieu devient de moins en moins favorable à la croissance car
épuisement du substrat et accumulation des déchets (toxiques)
⇒ Le milieu contient le nombre maximal d’individus mais aucune
cellule ne se divise (pas de croissance)
⇒ la vitesse spécifique de croissance redevient nulle (μ = 0)