Le catabolisme : réactions génératrices d’énergie

I. la glycolyse
La glycolyse est une voie universelle de dégradation du glucose. Chez les organismes
aérobies elle constitue la première étape de l’oxydation du glucose, par contre chez les
anaérobies c’est l’unique voie de dégradation du glucose. Dans tous les cas, le
pyruvate est le produit final de la glycolyse. Dans certains tissus comme le muscle
squelettique et chez certains microorganismes comme les bactéries lactiques, le
pyruvate est réduit en lactate. Ce processus est appelé fermentation lactique. Chez
d’autres organismes comme les levures, le pyruvate est transformé en éthanol plus du
dioxyde de carbone, c’est la fermentation alcoolique.
La fermentation est le terme général qu’on utilise pour qualifier la dégradation
anaérobie du glucose. Chez les aérobies en fonctionnement normal, le pyruvate est
catabolisé en deux phases pour donner de l’eau et du CO2. Par définition la glycolyse
est une voie métabolique linéaire. Elle se déroule en dix étapes.

-
2CH3CHOHCOO (Fermentation lactique)
-
C6H12O6 2CH3COCOO 6CO2 + 6H2O (Respiration)
10 étapes
Glucose Pyruvate 2CH3CH2OH + 2CO2 (Fermentation alcoolique)

1. Les étapes de la glycolyse

Tous les métabolites de la glycolyse sont phosphorylés. Cette phosphorylation a trois
significations :
- Au pH physiologique, ces groupements phosphates sont chargés négativement,
ils ne peuvent pas s’échapper de la cellule, ce qui évite la perte des métabolites
- Les composés phosphorylés sont à l’origine de la conservation de l’énergie
métabolique
- Les groupements phosphates serviraient de point de reconnaissance pour les
enzymes assurant la transformation
La glycolyse se déroule dans le cytosol. Elle comporte dix étapes qui peuvent être
divisées en deux phases.
 1.1. La première phase de la glycolyse
Elle comporte 4 étapes et se caractérise par le fait que tous les intermédiaires sont à
6 atomes de carbone.
- La 1ère réaction de la glycolyse
C’est la phosphorylation du glucose en glucose-6-phosphate.

CH2O P
CH2OH ADP
ATP O
O
(HOH)
(HOH)
glucokinase ou
hexokinase
glucose-6-phosphate
glucose

La réaction est irréversible de la gauche vers la droite. La glucokinase est spécifique

du D-glucose, l’hexokinase l’est moins. Elle peut transformer d’autres hexoses de la
série D tels le D-mannose et le D-fructose.
- La 2ème réaction de la glycolyse
C’est la conversion du glucose-6-phosphate en fructose-6-phosphate.

CH2O P P OCH2 CH2OH

O
O
(HOH)
phosphoglucosomérase

glucose-6-phosphate fructose-6-phosphate

La réaction est réversible. La phosphoglucoisomérase catalyse réversiblement la

réaction dans les deux sens avec la même affinité pour le glucose-6-phosphate et le
fructose-6-phosphate.
- La 3ème réaction de la glycolyse
C’est la phosphorylation du fructose-6-phosphate en fructose-1,6-diphosphate.
 ATP ADP P OCH2 CH2O P
P OCH2 CH2OH O
O

phosphofructokinase
fructose-6-phosphate fructose-1,6-diphosphate

C’est une réaction irréversible. La phosphofructokinase (PFK) est une enzyme de

régulation de la glycolyse.
- 4ème réaction de la glycolyse
C’est la dernière réaction de la première phase. Il s’agit du clivage du fructose-1,6-
diphosphate en deux trioses phosphate.

CH2O P
O CHO
CH2O P
C O + CHOH
aldolase CH2OH CH2O P
dihydroacétone glycéraldéhyde-
CH2O P phosphate 3-phosphate
(DHAP) (G3P)
fructose-1,6-diphosphate

L’équilibre est favorable à la réaction inverse, mais du fait qu’un des produits est
consommé la réaction sera tirée vers la droite.

1.2. La deuxième phase de la glycolyse

La principale caractéristique c’est que tous les intermédiaires sont tricarbonés.
- La 5ème réaction de la glycolyse
Le dihydroacétone phosphate (DHAP) et le glycéraldéhyde-3-phosphate (G-3-P)
entrent en interconversion conduisant à l’équilibre à 97% de DHAP et 3% de G-3-P.
 CH2O P CHO
C O CHOH
CH2OH triose phosphate CH2O P
isomérase glycéraldéhyde-
dihydroacétone
phosphate 3-phosphate
(DHAP) 97% (G3P) 3%

Par cette réaction, les carbones 1, 2 et 3 d’une part et les carbones 4, 5 et 6 du glucose
d’autre part deviennent indiscernables. Le G-3-P étant l’intermédiaire de la glycolyse,
il va poursuivre la réaction.
- La 6ème réaction de la glycolyse
C’est l’oxydation du G-3-P en acide 1,3-diphosphoglycérique.

+ + O
NAD + Pi NADH + H C OP
CHO
CHOH CHOH

CH2O P CH2O P
G3P déshydrogénase
ac 1,3-diphosphogly
glycéraldéhyde-3-phosphate cérique

Il s’agit d’une oxydation d’un aldéhyde libre en un anhydride mixte d’acides

carboxylique et phosphorique.

O O O-
C H C O P O
-
O
acy l phosphate

L’acyl phosphate ainsi formé est très riche en énergie.

- La 7ème réaction de la glycolyse
Cette réaction est capitale puisqu’il y a conservation d’énergie métabolique sous
forme d’ATP. Au cours de cette réaction, il y a transfert d’un groupement phosphate
riche en énergie, du carboxyle de l’acide 1,3-diphosphoglycérique à l’ADP pour
former de l’ATP.
 O O
ADP ATP -
C OP C O
CHOH CHOH
CH2O P phosphogly cérate CH2O P
kinase
ac 1,3-diphosphogly cérique 3-phosphogly cérate
(3PG)

Il s’agit d’une phosphorylation au niveau du substrat car la formation de l’ATP est

couplée à l’oxydation enzymatique d’un métabolite.
- La 8ème réaction de la glycolyse
Il s’agit d’une conversion du 3-phosphoglycérate (3PG) en 2-phosphoglycérate (2PG).
Il y a déplacement du phosphate de la position 3 à la position 2 du glycérate.

O H2O -
- O O
C O C
CHOH CH OP
CH2O P phosphoglucomutase CH2OH

3-phosphogly cérate 2-phosphogly cérate

(3PG) (2PG)

- La 9ème réaction de la glycolyse

C’est une déshydratation du 2-phosphoglycérate en phosphénolpyruvate.

-
O O H2O O
C O C
CH OP
CO P
CH2OH énolase
CH2
2-phosphogly cérate
phosphoénolpy ruv ate
(2PG)
PEP

Le PEP formé est un composé très riche en énergie

La 10ème réaction de la glycolyse
Il y a transfert d’un phosphate du PEP sur l’ADP
 O ADP ATP - -
O COO COO
C
COH C O
CO P
pyruvate kinase CH2 CH3
CH2
phosphoénolpyruvate énol pyruvate pyruvate
PEP (instable)

2. La réduction du pyruvate
C’est une réaction supplémentaire qui prolonge la glycolyse dans les conditions
anaérobies. Le pyruvate est normalement le produit final de la glycolyse dans les
conditions aérobies. Le NADH formé lors de la déshydrogénation du G3P doit
normalement être oxydé au niveau des chaînes respiratoires par l’oxygène. Toutefois,
lorsque des efforts musculaires sont sollicités, il se crée des conditions momentanées
d’anaérobiose parce que l’oxygène est plus consommé qu’il n’est apporté aux muscles.
En ce moment le pyruvate va être rapidement converti en lactate avec l’oxydation du
NADH en NAD+.

- -
COO COO
+ +
C O + NADH + H CHOH + NAD
CH3 lactate CH3
déshydrogénase
pyruvate lactate

Cette réaction est effectuée de façon conjoncturelle par les animaux. Certaines
bactéries anaérobies facultatives connues sous le nom de bactéries lactiques
l’effectuent en permanence.

3. Bilan de la glycolyse aérobie

1. G + ATP G6P + ADP + Pi

2. G6P F6P
3. F6P + ATP FDP + ADP + H+
4. FDP 2 trioses phosphate
5. 2 trioses phosphate + 2Pi+ 2NAD+ 2PG + 2NADH + 2H+
6. 2PG + 2ADP 2. 3-PG + 2ATP
7. 2. 3-PG 2. 2-PG
8. 2. 2-PG 2PEP
9. 2PEP +2H+ 2ADP 2Pyr + 2ATP
Σ G + 2Pi + 2 ADP + 2NAD+ 2Pyr + 2ATP + 2NADH + 2H+
+ 2H2O

NB : Dans le bilan on retrouve 9 réactions car l’étape d’isomérisation a été omise.

4. Bilan de la glycolyse anaérobie

Σaérobie G + 2Pi + 2 ADP + 2NAD+ 2Pyr + 2ATP + 2NADH + 2H+

+ 2H2O
Ferm 2Pyr + 2NADH + 2H+ 2Lact + 2NAD+
Σanaérobie G + 2Pi + 2ADP 2Lact + 2ATP + 2H2O

5. Alimentation dela glycolyse

Entrée des polysaccharides comme le glycogène

(D-Glc)n Glc-1-P + n-1

(D-Glc)
glycogèneglycogène
phosphorylase

Glc-1-P Glc-6-P
phosphoglucomutase

Entrée des disaccharides

CH2OH CH2OH CH2OH

O O O
(HO
H) 2 (HO
H)
O malatase ou
-glucosidase
maltose 2 glucoses
 CH2OH
O CH2OH CH2OHO
O
O (HOH) +
CH2OHO CH2OH
invertase ou
-fructosidase
CH2OH
glucose fructose

CH2OH CH2OH
CH2OH
CH2OH O O
O
O (HO
H)+ (HO
H)
O (HO
H)
lactase ou
-galactosidase
galactose glucose
lactose

Ces réactions ont lieu dans le tube digestif. La β-galactosidase n’est pas une enzyme
permanente chez les adultes, elle est abondante chez les nourrissons.
Destinée du galactose
 D-Gal + ATP D-Gal-1-P + ADP
galactokinase

UDP-Glc Glc-1-P

Gal-1-P UDP-Gal
uridyl transférase

UDP-Gal UDP-Glc
épimérase
PPi UTP

UDP-Glc Glc-1-P
phosphorylase
UDP = uridyldiphosphate

6. Régulation de la glycolyse
Outre les voies d’alimentation, voie où le glycogène est transformé en glucose, la
principale voie conduisant le glucose au pyruvate est régulée à deux niveaux :
La première étape est catalysée par la fructose phosphate kinase et la deuxième par la
pyruvate kinase.

Régulation de la glycolyse

La fermentation alcoolique
La fermentation alcoolique est le seul apanage des levures. Celle-ci ferment le glucose
en éthanol et du CO2. Les étapes sont celles de la fermentation lactique jusqu’au
pyruvate.
 CO2 2NADH+2H+ 2NAD+
O
2CH3 C COO- 2CH3 CHO 2CH3 CH2OH
pyruvate alcool
décarboxylase déshydrogénase

Bilan de la fermentation alcoolique

C6H12O6 + 2ADP 2 Pi 2CH3 CH2OH+ 2CO2 + 2ATP + 2H2O