L2SV CHIMIE BIO-ORGANIQUE

EXERCICE 1 : OXYDORÉDUCTION

Les 3 réactions ci-dessous sont issues du métabolisme du pyruvate :

a- Calculer pour chaque réaction le degré d’oxydation global moyen du carbone.

b- Préciser la nature chimique de X.
c- Qu’en déduisez-vous ?

CH3 – C – COOH CH3 – C – COO - + X

O Pyruvate O

CH3 – C – COOH + X CH3 – CH – COOH

O OH Lactate
Pyruvate

CH3 – C – COOH CH3 – C – H + CO2 + x

O Pyruvate O acétaldéhyde

EXERCICE 2 : EFFETS MÉSOMÈRES

La dégradation (-oxydation) des acides gras inclut une étape d’addition d’eau sur les
acides - insaturés. Quel est le produit d’addition obtenu ? Justifiez votre réponse.

R – C C – C – SCoA + H2O

H H O

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EXERCICE 3 : EFFETS MÉSOMÈRES ET STABILISATION DE CHARGES

L’action d’une base sur une cétone conduit à la formation d’un carbanion stabilisé.
Lequel ? Justifiez votre réponse.

H H
- H+ en  ou 
R – C – C – C –

EXERCICE 4 : EFFETS MÉSOMÈRES ET STABILISATION DE CHARGES

La synthèse des terpènes débute par la perte d’un groupement pyrophosphate à partir
d’un composé en C5 ; IPP ou DMAPP (Le DMAPP est obtenu par isomérisation de
l’IPP). Lequel de ces deux composés est l’initiateur de cette synthèse ? Justifiez votre
réponse.

O O O
Isomérase O
O – P- O – P – OH O – P- O – P – OH
OH OH
IPP DMAPP OH OH

O O
+
O – P- O – P – OH
OH OH
IPP

O O +
O – P- O – P – OH
OH OH
DMAPP

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 O
EXERCICE 5 : EFFETS O
MÉSOMÈRES O O
ET STABILISATION DE CHARGES
-
R – C – O – P- O – P – OH R - C+ + O – P- O – P – OH
L’ouverture d’un époxyde catalysée par un proton conduit à la formation d’un
OH OH : OH OH
carbocation intermédiaire

H+
OH
Mono O O
oxygénase H+ +

La synthèse de certains leucotriènes implique H l’ouverture d’un époxyde intermédiaire

issu de l’oxydation de l’acide arachidonique
H+ selon la
+ séquence réactionnelle suivante :

COOH

O
Acide arachidonique

+ H 2O + H +

COOH COOH
HO HO

OH

diHETE HO LTB4

a- Proposer un mécanisme permettant d’expliquer la formation des deux

leucotriènes.
b- Proposer une expérience de marquage isotopique permettant de vérifier votre
hypothèse.

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EXERCICE 6 : ISOMÉRISATION

Dans la glycolyse, la rupture du Fru 1,6 bis P conduit à la formation du glycéradéhyde-

3-P et de la dihydroxyacétone-P. Ce second composé est ensuite isomérisé en
glycéradéhyde-3-P. Quel est le mécanisme de cette isomérisation ?

H O
CH2OH

O OH

CH2O-P CH2O-P

Dihydroxyacétone P Glycéraldéhyde 3P

EXERCICE 7 : ALDOLISATION

Dans la première étape du cycle acide citrique, la condensation de l’acétyl-CoA sur

l’oxaloacétate conduit au citrate. Quel est le mécanisme de cette condensation ?
Justifiez votre réponse.

O O

CH3 – C – SCoA + HOOC – CH2 – C – COOH

acétyl-CoA oxaloacétate

EXERCICE 8 : RETROALDOLISATION

Dans la glycolyse, la rupture du Fru1,6-bis-phosphate conduit à deux molécules à 3

carbone. Lesquelles ? Justifiez votre réponse.

CH2O - P

O
HO
OH
OH

CH2O - P
Fru1,6 bisP

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EXERCICE 9 : CONDENSATION DE CLAISEN

La condensation de 2 acétyl-CoA conduit à un composé. Lequel ? Justifiez votre

réponse.

2 x CH3 – C – SCoA

EXERCICE 10 : RETRO CLAISEN

La condensation de CO2 sur le ribulose 1,5 bisP donne un intermédiaire qui se scinde
en 2 composés identiques. Lequel ? Justifiez votre réponse.

CH2O - P CH2O - P

O HO COOH
+ CO2
OH O 2xX
OH OH

CH2O - P CH2O - P

Ribulose 1,5 bisP

EXERCICE 11 : DECARBOXYLATION

Dans le cycle acide citrique, l’oxydation de l’isocitrate génère une cétone portant des
fonctions carboxyles en ,  et . Cette cétone subit une décarboxylation. Quel est le
produit généré ? Justifiez votre réponse.

OH O

HOOC – CH2 – CH – CH – COOH HOOC – CH2 – CH – C – COOH ?

isocitrate COOH COOH

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EXERCICE 12 : DECARBOXYLATION

Dans la Voie des Hexoses Monophosphates (VHM), l’oxydation du glucose 6P conduit

à l’acide gluconique représenté ci-dessous. Après une seconde oxydation d’une des
fonctions alcool, il se produit une décarboxylation. Quelle fonction alcool est oxydée et
quels sont les structures de X et Y ? Justifiez votre réponse.

COOH

2 OH
Oxydation Oxydation
Glc- 6P HO 3 X Y + CO2
4 OH
5 OH

6 CH2O-P

EXERCICE 13 : VOIES MÉTABOLIQUES

Le transfert de l’acétyl-CoA de la mitochondrie vers le cytosol via la navette au citrate

s’accompagne de l’action cytosolique de l’enzyme malique qui convertit le malate en
pyruvate et CO2 selon la séquence suivante :

OH NADP+ NADPH O O

HOOC – CH2 – CH – COOH HOOC – CH2 – C – COOH CO2 + CH3 – C – COOH

malate oxaloacétate pyruvate

Quel est le mécanisme impliqué dans la formation du pyruvate à partir de

l’oxaloacétate ? Détaillez ce mécanisme et les effets électroniques impliqués.

EXERCICE 14 : VOIES MÉTABOLIQUES

L’assimilation dite « en C1 » chez les bactéries méthylotrophiques permet de former

du fructose 6P à partir de la condensation du ribulose-5P et de formaldéhyde selon la
séquence opératoire représentée ci-dessous. Décrivez les mécanismes mis en jeu.

CH2OH CH2OH CH2OH

OH O
O
H
OH O HO
+ C O
H OH OH
OH
Formaldéhyde OH OH
CH2O-P
CH2O-P CH2O-P
Ribulose 5P
Fructose 6P

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EXERCICE 15 : VOIES MÉTABOLIQUES
L'apiose est un monosaccharide présent dans les parois des plantes. Ce composé est
synthétisé à partir de l'UDP-GlcA en 6 étapes :

COOH COOH
O O O
1 2
OH O OH O OH
HO O-UDP O-UDP O-UDP

OH OH OH
UDP-GlcpA
3
O
O O
5 4
CH O HO O
O-UDP H H
H O-UDP O-UDP

OH O O OH O
HO
6
O

CH2OH
O-UDP

HO OH UDP-Apif

a- Nommer le mécanisme réactionnel mis en jeu pour chacune des 6 étapes.

b- Détailler les mécanismes des étapes 2, 3 et 4.

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EXERCICE 16 : VOIES MÉTABOLIQUES
Le cycle du glyoxylate est un cycle présent dans les plantes et les bactéries.
Ce cycle est similaire au cycle de l’acide citrique et consomme de l’acétyl-CoA mais le
bilan final est différent.

a- Quel le bilan carboné de ce cycle (molécules carbonés entrantes et sortantes) ?

b- Quels sont les mécanismes des réactions 1 et 2 ? Nommez ces réactions.

EXERCICE 17 : VOIES MÉTABOLIQUES

La cyclisation du nérylpyrophosphate conduit au terpinéol. Quel est le mécanisme en

jeu ?

O O Pyrophosphate + X
Néryl PP O – P- O – P – OH

OH OH OH -

Terpinéol

OH

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