Chimie Organique

Voici le cours de chimie organique.
Choisissez dans le Programme de l’internat en pharmacie les notions qui seront

traitées lors de la séance de compléments de cours en chimie organique.
Chapitre 9. Analyse des composés chiraux.

- stéréoisoméries (Z/E et R/S)
- relations dénantiomérie/diastéréoisomérie
- principe de la séparation de composés chiraux
Chapitre 10. Principales propriétés structurales et physico-chimiques des

fonctions organiques : alcool, phénol, amine, thiol, aldéhyde, cétone et acide
carboxylique. Applications à la dérivatisation. Stéréo-isoméries.
- alcools, phénols, thiols
- amines
- aldéhydes et cétones
- acides carboxyliques
- nomenclature
- spectrométrie IR
- spectrométrie de masse (SM)
- spectrométrie RMN
- principe de la dérivatisation
Préparation à l’internat en pharmacie

UE préparation
à l’internat en pharmacie
Chimie Organique
Propriétés structurales et physico-chimiques

Alcools – Phénols – thiols - amines
Planches de cours
Yen VO HOANG

ALCOOLS – PHÉNOLS - THIOLS

ALCOOLS
1 - Définition: R OH
Classification:
R''
R CH2 OH R CH OH R C OH
R' R'
Nomenclature:
Suffixe: ol Préfixe: hydroxy
Structure: H −δ
Caractère acide faible
O +δ (pKa ≈ 16-19)
R H
H Rupture de la liaison O-H
H −δ
Nucléophile
O
R +δ H
Rupture de la liaison C-O
H

2. Propriétés physiques
liaison hydrogène et OH
Alcools généralement liquides

alcools polaires, miscibles avec l’eau (PM faible)
alcools moins volatiles que les éthers (de même PM)

Acidité des alcools
L’acidité augmente si :
présence de substituants électronégatifs
stabilisation par résonance

de l'anion alcoolate
O O O O O

3. Propriétés structurales
Spectrophotométrie UV-visible
Le groupement OH n’est pas un chromophore UV-visible

Spectrométrie IR
bande A (large): vibration de valence de OH entre 3300 et 3700 cm-1

bande B: vibration de déformation de OH entre 1200 et 1400 cm-1
bande C: vibration de valence de CO entre 1000 et 1200 cm-1

Spectrométrie de masse
Pas de pic moléculaire
Perte de OH : M-17
Perte du groupe R le plus volumineux
Perte d’eau pour les alcools primaires : M-18
Perte d’eau et d’oléfine: M-(18-28) soit M-46

Spectrométrie RMN
Proton OH
Pic large :
2 à 4 ppm
Proton en α
CHH-OH :
3 à 4 ppm

4. Propriétés chimiques Rupture de la liaison C-O
Déshydratation des alcools
Réactions de substitution nucléophile

H
R OH + H Cl Cl + R O R Cl + H2O
H
H
O H
H+
- H2O - H+
CH3 CH2 OH CH3 CH2
CH3 CH2 O CH2 CH3 CH3 CH2 O CH2 CH3
H
O CH2 CH3
H
Réaction d’élimination Formation de l’alcène le plus substitué

H
CH3 CH2 CH2 OH + H+ + HSO4 CH3 CH CH2 O CH3 CH CH2 + H2O
H
H
HSO4

4. Propriétés chimiques Rupture de la liaison O-H
Formation d’éther
déprotonation avec Na, NaNH2, NaH -> alcoolates
2R OH + 2Na 2 R O Na + H2
R OH + NaNH2 R O Na + NH3
R OH + NaH R O Na + H2
Formation d'éthers: substitution nucléophile
R O
+ R' X R O R' + KX
K

Estérification

Estérification
Avec R1CO2H
O H O
R O + R1 C R1 C + H2O
H OH ∆ O R
Mécanisme: catalyse acide

H H
O O
O H O H O H R O
R -H
R1 C R1 C R1 C R1 C O R1 C + H2 O
R R1 C O
OH OH OH O H O R
OH OH2
H

Avec R1COCl et (R2CO)2O Rupture de la liaison O-H
O N O
R OH + R1 C R1 C + HCl
Cl O R
O
R1 C O
R OH + O R1 C + RCO2H
R1 C O R
O
-δ O
R1 +δ R O
Mécanisme: C O C R C + HCl
AdN + EN = SN Cl Cl HO R1 O R1
R OH
Avec R1SO2Cl
O O
R OH + R1 S Cl R1 S O R + HCl Mécanisme:
AdN + EN = SN
O O
Acétalisation
Formation d’acétal
R1 R1 O R
H
2 R OH + C O C + H2O
R2 R2 O R

R1 R1 R1 R1 O H
C O +H C O H C O H C
R2 R2 R2 R2 O R
O H H
R
H
H H
O R
O H R1 O R R1 OR
R1 R1 O H R1
C + H2O C C + H
C + H C
R2 O R O R R2 O R R2 O R R2 O R
R2
Hémiacétal
4. Propriétés chimiques
Oxydation
Oxydants forts: Na2CrO7, H2SO4/H2O ou KMnO4
Oxydants faibles: MnO2 ou CrO3, Pyridine
Formation d’aldéhyde, de cétone ou d’acide en fonction de la classe

de l’alcool et de l’oxydant.
O O O
O
(I) R CH2 OH R C R C
H OH
R1 R'
O
(II) R CH OH R C
O
R1
O
(III) R C OH
R2

Formation d’acide à partir d’un alcool primaire
Na2Cr2O7 + H2SO4 + H2O Na2SO4 + 2H2CrO4
O
H2CrO4 O
R CH2 OH R CH O Cr OH R C + H3O + HCrO3-
+ H O H
H 2O
H2O + H2CrO3
O OH O OH
OH H CrO
2 4 -
R C + H2O R CH R C O Cr OH R C + H3O + HCrO3
H OH + H O O
H2O
H2O + H2CrO3
Formation d’aldéhyde à partir d’un alcool primaire

O
CrO3 O N
R CH2 OH R CH O Cr OH R C + HCrO3
H
H O H
N
N

PHENOLS
1 - Définition: Ar OH
Classification:
R
OH
Nomenclature:
Suffixe: -phénol Préfixe: phénoxy- ou hydroxy-
Structure: R −δ Caractère acide

O (pKa ≈ 10)
H +δ Rupture de la liaison O-H
R O Nucléophile
O
Rupture de la liaison C-O
H
Ar Electrophile

phénols généralement solides

formation de liaisons hydrogènes
propriétés acides -> phénates
Spectrométrie UV-visible
le noyau aromatique est chromophore
Spectrométrie IR
bande A: 3125 à 3700 cm-1
bandes aromatiques: 3000 à 3100
et 1600 à 1640 cm-1
ion moléculaire intense
Spectrométrie RMN
OH : 4,5 à 6 ppm
Protons aromatiques : 7 à 8 ppm
Formation d’éther
Déprotonation avec NaOH: formation de phénates
Ar OH + NaOH Ar O Na + H2O
les phénates sont plus nucléophiles que les alcoolates
Formation d'éthers: substitution nucléophile

pas d’éliminations
Ar O
+ R' X Ar O R' + NaX
Na

4. Propriétés chimiques Rupture de la liaison C-O

Substitution électrophile aromatique

Oxydation
Les phénols sont très oxydables et utilisés comme antioxydants

THIOLS
1 - Définition: R SH
Classification: R''
R CH SH R C SH
R CH2 SH
R' R'
Nomenclature:
Suffixe: -thiol Préfixe: thio-
Soufre plus gros et moins électronégatif
H −δ Caractère acide faible
Structure:
S +δ (pKa ≈ 9-12)
R H
H
Rupture de la liaison S-H
H −δ
Nucléophile
S
R +δ H
Rupture de la liaison C-S
H
moins de liaisons hydrogènes que les alcools

Thiols plus volatils que les alcools
Thiols : odeur généralement nauséabonde
propriétés acides -> thiolates

Formation de thioéthers
déprotonation avec NaOH
R SH + NaOH Ar S Na + H2O
les thiolates sont plus nucléophiles que les alcoolates
Formation de thioéthers: substitution nucléophile

très peu d’éliminations
R S
+ R' X R S R' + NaX
Na

Oxydation des thiols
Oxydant faible: H2O2
Oxydant fort:
HNO3

Oxydation des thioéthers
Oxydant faible: NaIO4
Soufre
asymétrique
Oxydant fort:
HNO3

1 – Définition
AMINES
Classification
R NH2 R NH R N R''
R' R'
Nomenclature
suffixe: …amine préfixe: amino
Structure
Caractère basique
Propriétés nucléophiles
H(R)
C C N
H H(R1)
Rupture de la liaison C-N
et de la liaison C-H

Isomérie des amines
Mélange racémique indédoublable
N
CH3 CH
CH 3 3
Inversion de l’azote:
CH3 N inactif sur la LP
H3C CH3
Ammoniums quaternaires chiraux
R''' R''
Cl -
+ R
N + R'
R'' N
R Cl -
R' R'''

amines généralement liquides

formation de liaisons hydrogènes, plus faibles que les alcools
propriétés basiques -> ammoniums
la fonction amine n’est pas chromophore
Spectrométrie IR
bandes larges N-H à 3250 à 3500 cm-1 (absente amines III)
amine primaire cisaillement N-H: ≈ 1600 cm-1
pic moléculaire impair (nbre d’azote impair)
perte de R1 par fragmentation -> ion iminium stabilisé par résonance
NH2 NH2 NH2

amines généralement liquides

formation de liaisons hydrogènes, plus faibles que les alcools
propriétés basiques -> ammoniums
la fonction amine n’est pas chromophore
Spectrométrie IR
bandes larges N-H à 3250 à 3500 cm-1 (absente amines III)
amine primaire cisaillement N-H: ≈ 1600 cm-1
fragmentation -> ion iminium stabilisé par résonance
Spectrométrie RMN
NH : pic large 1,5 à 3 ppm
Proton en α : 2 à 3 ppm
4 – Propriétés chimiques
Basicité des amines
Amines aliphatiques
R NH2 + HCl RNH3, Cl
Composés Ph-NH2 NH3 Me3N MeNH2 Me2NH

pKa 4,6 9,2 9,8 10,6 10,7
Amines aromatiques
NH2 NH2 NH2 NH2 NH2

4 – Propriétés chimiques Basicité des amines
Hétérocycles basiques
Hétérocycles basiques aromatiques
pKa = 7.0

4 – Propriétés chimiques Rupture de la liaison N-H
Alkylation des amines
Formation d’amines
NH3 + R X R NH3 X R NH2 + HX
Formation de sel d’ammonium quaternaire
R2 R2
R N + R3 X R N R3 X
R1 R1
Rupture de la liaison C-N
Elimination
Formation d’alcène
AgOH
Si R = C4H9 CH3
OH
N ∆
AgI + + H2O + (CH3)3N
CH3
CH3

Acylation des amines
Formation d’amides I, II, III
R1 O O
NH + R C R C + HCl
R2 Cl N R2
R1
O
R1 R C O
NH + O R C + RCO2H
R2 R C N R2
O R1
-δ O
R +δ R O
Mécanisme: C O C R C + HCl
AdN + EN = SN Cl Cl H 2N R1 HN R1
R1 NH2

Sulfonylation des amines
Formation de sulfonamides I, II, III
O O Mécanisme:
NH + R S Cl R S N + HCl AdN + EN = SN
O O
Réaction avec les dérivés carbonylés

Réaction avec les amines I => Formation d’imines
H
R NH2 + C O C N R + H 2O
Réaction avec les amines II => Formation d’énamine

R R1 H R R1
C O + HN C N + H2O
R' R2 R' R2

UE préparation
Chimie Organique
Propriétés structurales et physico-chimiques

Aldéhydes – cétones – acides carboxyliques
Planches de cours
Yen VO HOANG

ALDEHYDES – CETONES
DERIVES CARBONYLES

1 - Définition:
ALDEHYDES – CETONES
suffixes al et one
O
O méthanal ou formaldéhyde H 3C C
H C propanone ou acétone
CH3
H O
H 3C C éthanal ou acétaldéhyde
H O
O butan-2-one
propanal ou propionaldéhyde C
C
H
Préfixe : oxo
O CH3
O
C OH
C H3C C
H C
N O
4-oxobutanenitrile Acide 2-méthyl-4-oxopentanoïque

carbonylés généralement liquides

formation de liaisons hydrogènes
composés volatiles et inflammables

composés solubles avec les solvants
Spectrophotométrie UV-visible
Le groupement C=O n’est pas un chromophore UV-visible

Spectrométrie IR
Aldéhydes bandes A et B: vibration de valence de CH entre 2820 et 2720 cm-1

bande C: vibration de valence de CO entre 1720 et 1730 cm-1
Cétones bande C: vibration de valence de CO entre 1705 et 1725 cm-1

Aldéhydes Pic caractéristique à M-1
R
O H + R C O
Pic moléculaire important

Cétones Perte du groupe R le plus volumineux

Spectrométrie RMN
Aldéhydes Proton HC=O : 9,5 à 10,5 ppm
Aldéhydes et cétones Proton en α CHH-C=O : 2 à 3 ppm
RMN C13 C=O : ≈ 200 ppm

4 - Propriétés chimiques
Structure
Réactivité
+δ
-δ
C O C O C O
Caractère insaturé (réaction d’addition nucléophile)
O base de Lewis
C C
H H(R)
Réactivité propre aux aldéhydes
Caractère acide de l’H en α du carbonyle

Addition nucléophile
Nu = organomagnésien
Et2O
C2H5 +δ -δ +δ anhydre C 2H 5 O MgCl C 2H 5
-δ H2O, H+ OH
C O + C 3H 7 MgCl C C
H 3C C3 H 7 H 3C C3 H 7
H 3C
Nu = hydrure H-
1) NaBH4,
R1 H2O R1 OH
4 C O 4 C
2) H3 O+ (R2)H
(R2)H H
Nu = H2O => gem-diol instable

OH
R1 R1
C O + H2O C
R2 OH
R2
4 - Propriétés chimiques Addition nucléophile
Addition d’alcools/thiols
formation d’acétal
O R
R1 H
R1 C + H2O
C O +2 R OH
R2 O R
R2
formation de thioacétal
R1 R1 SCH3
H
C O + 2 CH3SH C + H2O
R2 R2 SCH3

4 - Propriétés chimiques Addition nucléophile
Addition d’amines
Formation d’imines (voir amine)

H
R NH2 + C O C N R + H2O
Amine I Imines (Z et E)
Formation d’énamine
R R1 H R R1
C O + HN C N + H2O
R' R2 R' R2

Structure
Réactivité
+δ
-δ
C O C O C O
Caractère insaturé (réaction d’addition nucléophile)
O base de Lewis
C C
H H(R)
Réactivité propre aux aldéhydes
Caractère acide de l’H en α du carbonyle
Tautomérie: équilibre céto-énolique
H3C CH3 H 2C CH3 H3C H H 2C H

C C C C
O OH O OH
Mobilité des H en α
Enolisation
Catalyse acide:
H H H
CH CH CH
C C CH
C C
+ + H
O O O
H H OH
H
Catalyse basique:
B
H
CH CH CH
CH C C C
C + B
O O OH
O
H

Rupture de la liaison C-Hα
Alkylation
1) LDA, THF
CH3 anhydre, -60°C H 2C R
H 3C C H 3C C
O 2) R Br O
Halogénation => Formation d’α-bromocétone
CH3 H CH2 Br
H 3C C + Br Br CH3 C + H Br
O O
Réaction haloforme => Formation d’acide (sous forme de sel)

Br Br
Br2 Br-Br
CH3 CH2 Br O Na
excès C Br
excès
R C R C R C R C + CHBr3
O NaOH NaOH O
O O HO

Rupture de la liaison C-Hα et addition nucléophile sur C=O
Aldolisation
Auto-addition catalysée en milieu acide ou basique
Formation d’aldol
H3C H OH -
H3C H H3C O
2 ∆
+ H2O
O ou H + OH - ou H +
OH O H
- H2 O
Réaction de
Formation de cétol
crotonisation
H 3C CH3 OH H 3C
-
H 3C CH3 ∆ H 3C O
2 + H 2O
O OH - ou H +
ou H + OH O - H2 O CH3 CH3
Réaction inverse: Rétro-aldolisation

Réduction
Hydrogénation catalytique: H2, Pt, Ni ou Pd
R1 H2 R1 OH
C O C
(H)R2 Cat,t,P H
(H)R2
Réduction chimique : Na/EtOH
R1 2 Na R1 OH
C O C
EtOH H
(H)R2 (H)R2
ou Zn/HCl
R1 Zn, Hg R1
C O CH 2
HCl, ∆ R2
R2

Oxydation des aldéhydes

O Réaction de Cannizzaro
O
C CH2 OH C
H NaOH O
2 Na
+
100°C
Mécanisme:
O O O
C C C
H
H OH
OH + H
OH O
C
H
O O O
C C CH2 OH C
OH H
O
+ H +

1 - Définition:
Acides carboxyliques
Nomenclature
Suffixe : acide … -oïque Préfixe : carboxy-

Sel : …oate de … O
R C
O Na

Nomenclature triviale
H-COOH acide formique

CH3-COOH acide acétique
CH3- CH2- COOH acide propionique
CH3- CH2- CH2- COOH acide butyrique
acide benzoïque

acides liquides (C < 8) puis solides (C > 8)

formation de liaisons hydrogène
Formation de dimères grâce à des ponts hydrogène
propriétés acides -> sels d’acides carboxyliques

premiers acides solubles dans l’eau
Acidité

sels d’acides gras
=> savons ou
=> micelles sphériques

le groupement COOH n’est pas un chromophore UV-visible
Spectrométrie IR
bande large de vibration de valence de OH entre 2500 et 3300 cm-1
bande de vibration de valence de CO entre 1680 et 1710 cm-1
ion moléculaire faible
perte de OH (M-17)
perte de COOH (M-45)
Spectrométrie RMN du proton

OH : 10 à 13 ppm
Protons en α : 2 à 2.6 ppm (8.1 pour l’acide formique)
Spectrométrie RMN du C13

C=O: 170 à 180 ppm

Structure
Base de Lewis
O
H
R' C C Réactions
H OH d’addition nucléophile
Réactions de
substitution nucléophile
Mobilité des H en α du C=O, de la C≡N

4. Propriétés chimiques Substitution par AN + EN
Estérification
Avec ROH
O H O
R O + R1 C R1 C + H2O
H OH ∆ O R

H H
O O
O H O H O H R O
R -H
R1 C R1 C R1 C R1 C O R1 C + H2 O
R R1 C O
OH OH OH O H O R
OH OH2
H

Addition nucléophile
Addition d’organolithiens
Formation de cétones
O O
1) 2 R1Li Solvant: Et2O ou THF anhydre
R C R C
2) H3O+ R1
OH
Mécanisme: CH3 Li O Li
O O
CH3Li
C C CH3
C
O Li O
OH
CH4 Li
OH O
H3O
C CH3 C + H2O
OH CH3

Alkylation en α
O 1) LDA O
-60°C
R C R C
OH
Z Z
OH
2) R1-X
3) H3O+ R1
Mécanisme:
O O
C C
OCH3 OCH3 + NH
H 2
O
C Li
N OCH3 O
2 Li
C
+δ CH3 OCH3 + LiCl
-δ Cl CH3
Halogénation en α
formation d’α-bromoacide
O
O
1) P, Br2 C
C OH
OH 2) H2O
Br
Mécanisme :
P, Br2 H
O OH O
O (PBr3)
C +
C C C Br
Br Br Br
OH
Br
Br
Br
O O
H2O
HBr + C C + HBr
Br OH
Br Br

Réaction de Piria
formation de cétone à partir d’acide
O
O 1) Ba(OH)2
2 R + CO2
R R
OH 2) ∆ >300°C
Application: formation de cétone en série cyclanique
O O
C Ba(OH)2 C
OH O 2 ∆
Ba O
OH O
C C
O O

Nomenclature
Acides carboxyliques R-COOH Acide … -oïque -
Acides sulfoniques R-SO3H Acide … ane sulfonique -
Anhydrides d’acides R-CO-O-CO-R’ Anhydride … - oïque -
Esters R-CO-O-R’ (R)…-oate de (R’)…-yle -
Halogénure d’acides R-CO-X Halogénure d’…-yle (R)…-yle
Amides R-CO-NH2 …-anamide -
Nitriles R-CN … -anenitrile cyano-
Aldéhydes R-CHO … -al oxo-
Cétones R-CO-R’ … -one oxo-
Alcools R-OH … -ol hydroxy-
Amines R-NH2 … -ylamine amino-

H H
H3C H
OH H3C
C C H COOH
Acide propanoïque
Acide éthane sulfonique
Anhydride propanoïque
Propanoate de méthyle
Bromure de propanoyle
Prop-2-èneamine
Propanenitrile
3-hydroxybutanal
N,n-diméthyléthylamine

H H
H3C COOH
H
H3C HO NH2
H COOH H H
(2R,3S)-3-méthylpentan-2-ol
(Z)-1-chloropropène
(2S,3E)-3-méthylpent-3-èn-2-ol

La dérivatisation
Objectif :
• Modifier les propriétés physiques et / ou chimiques d’un composé qui ne peut être
analysé directement
• Permettre son isolement et / ou son identification
=> Par réaction chimique sur le produit à analyser, on synthétise un sous-produit dont les
propriétés facilitent son analyse par chromatographie.
Réaction fiable, complète, à large domaine d’application
Deriv-
ANALYTE O-H ANALYTE O dérivé
• COMPOSES polaires Dérivés : moins polaires, stables

(hydrosolubles, t° eb ↑,…) Introduction de groupement pour
• groupes fonctionnels => ANALYSE EN CHROMATOGRAPHIE
adsorption, dégradation
• au sein d’un matrice complexe
Silylation -Si(R)3
Exemple : Silylation par BSA [N,O-Bis(trimethylsilyl)acétamide]
Fonctions concernées : RO-H, RS-H, R2N-H

Remplacement d’un hydrogène mobile par un groupe trialkylsilyle tel que le
triméthysilyle (TMS) ou le t-butyldimethylsilyle (t-BDMCS).
Réactivité : alcools (ol I > ol II > ol III) > phénols > acides > amines > amides
Technique la plus couramment employée

Très facile d’obtenir des dérivés stables via cette technique
Dérivés silylés : moins polaires, plus stables thermiquement

Dérivés silylés plus volatils, pouvant être analysés en CPG
Introduction de groupement deutérosilylé pour l’identification de MS (GCMS)
Composés de départ régénérés dans l’eau

Acylation -CO-R
Exemple : Acylation par un anhydride perfluoré : HFBA [Heptafluorobutyric anhydride]
Fonctions concernées : RO-H, RS-H, R2N-H -> esters, thioesters, amides
Remplacement d’un hydrogène mobile par un groupe acyle

par action d’un acide, halogénure d’acide ou anhydride d’acide
Utilisation : dérivatisation de composés très fortement polaires et multifonctionnels

comme les sucres et les acides aminés
Dérivés acylés : moins polaires

Introduction de groupement perfluoroalkyle : Amélioration de la sensibilité
de détection ECD (Electron Capture electron) et FID (Flamme Ionisation
Detection)

Alkylation -R
Exemple : BF3/t-BuOH
Fonctions concernées : RCOO-H, RS-H, R2N-H, RCONH2 -> esters, thioethers,

amines/amide N-alkylés ou N-arylés, sulfonamides
Remplacement d’un hydrogène mobile par un groupe aliphatique ou aromatique
L’application la plus courante est la transformation d’acides en esters

correspondants, souvent méthyl-esters.
Dérivés alkylés : moins polaires que les produits de départ

Dérivés beaucoup plus stables dans le temps que les dérivés silylés qui sont
eux plus faciles à obtenir.

Dérivatisation chirale
Action d’un réactif chiral avec un composé racémique pour former un mélange de
deux diastéréoisomères séparables en CPG ou HPLC sur des phases achirales ou
chirales

UE préparation
Chimie Organique
Stéréoisoméries – Analyse de composés chiraux
Planches de cours
Yen VO HOANG

STEREOISOMERIES
Stéréoisomères: Isomères de même formule développée, différant par la

disposition spatiale de leurs atomes

1. Définition
Isoméries
Isomérie plane : Isomères de constitution Isomérie spatiale = « stéréoisomérie » :

- Composés ayant la même formule brute Isomères dans l’espace
- Mais des formules semi-développées différentes - Composés ayant la même formule brute
- Composés ayant la même formule semi-
développée (constitution)
- Mais des orientations/directions spatiales des
atomes, ou groupements d’atomes, différentes
Formule Brute : C6H12O
Isomérie de Constitution
= isomérie de fonction
- propriétés chimiques
P H différentes.
H O
L
H OH
A aldéhyde alcool
N Isomérie de Position
E - variation de la position du
groupement fonctionnel.
**Isomère de Squelette *** Isomères de Position

OH 4 3
1
3 OH 2 1
2
5 4 5
4 3
2 1
HO

**Isomère de Squelette *** Isomères de Position
OH 4 3
1
3 OH 2 1
2
5 4 5
4 3
2 1
HO
S Isomérie Géométrique = Isomérie Configurationnelle

= diastéréoisomères Pi , même formule brute, même constitution
*S - dûe à la présence d'une
P T double liaison.
E H
A R - variation de la répartition
dans l'espace.
E H
T O - même propriétés chimiques H OH H OH
I mais propriétés physiques E Z
différentes.
I S
O Isomérie Optique = Enantiomérie
A M - stéréoisomères étant l'image
E l'un de l'autre dans un miroir,
L et non superposables. H
R H
I - carbone asymétrique, molécule R S
E E chirale. * *
- mêmes propriétés chimiques et physiques H OH H OH
à part la déviation de la lumière polarisée
(composé lévogyre ou dextrogyre)
* stéréoisomères : isomères avec la même formule de constitution, qui diffèrent par l'arrangement des
atomes dans l'espace. Il existe des stéréoisomères de configuration (Z/E pours les alcènes, Cis/Trans pour
les alcanes cycliques, R/S...) et de conformation (eclipsée/décalée..)
Diastéréoisomérie géométrique
Diastéréoisomères:
• Stéréoisomères dont les configurations ne sont pas images séculaires
• Stéréoisomères qui ne sont pas énantiomères (images dans un miroir)

Enantiomérie
Enantiomères:
• Stéréoisomères ayant des configurations opposées
• Stéréoisomères images l’un de l’autre dans un miroir et non superposables
Un objet chiral est un objet qui n'est pas superposable à son image
dans un miroir plan.

Pouvoir rotatoire
Mesure expérimentale du pouvoir rotatoire
ou de l’activité optique d’une molécule:
Déviation
Lumière
de la lumière
polarisée α
polarisée
échantillon
Molécule chirale
Lumière polariseur
Longueur de la cuve analyseur
naturelle
Loi de Biot c concentration en g/cm3

Pouvoir rotatoire [α]D = α / l x c l (en dm)
spécifique Raie D du sodium
droite : dextrogyre ; signe +

gauche : lévogyre ; signe -

Enantiomérie à C*
Représentation de Cram

Configuration absolue de C*
Configuration: disposition spatiale des atomes d’une molécule sans tenir compte
des possibilités de rotation autour des liaisons σ
a 1) Classement des groupements avec les règles
séquentielles de Cahn, Ingold et Prelog
*C bd 2) Observation du sens de rotation des groupements
bd cc
a≠b≠c≠d a
a a
C d C
c
b c c b
b R
a
a a
b C d C b c
c b
c S
Configuration absolue de C*
a>b>c>d a
a
Lecture directe d C c
b c
b
S
a a
Lecture indirecte b C c
b c
d
S R

Enantiomérie à C*
Représentation de Cram

Enantiomérie à C*
Représentation de Fisher (sucres, acides aminés)
NH2 COOH
H CH3 H NH2
COOH CH3
Série D
NH2 COOH
CH3 H NH2 H
COOH CH3
Série L
Cas de 2 C*
22= 4 stéréoisomères possibles

Cas de 2 C*
22= 4 stéréoisomères possibles
1 Br
Exemple : 1-bromo-2-chlorocyclohexanes
2 Cl
1 Br Br
cis
IO Cl
2 Cl
(1R,2S) (1S,2R)
IG
IG IG
Br Br
trans IO
(1R*,2R*) Cl Cl
(1R,2R) (1S,2S)
Cas du composé meso

Cas du composé meso
1 Br
Exemple : 1,2-dibromocyclohexanes
2 Br
1 Br
cis
2 Br
Inactif sur la LP
Méso (RS)
IG IG
Br Br
trans
Br IO Br
RR SS
Couple d’énantiomères
Enantiomères
mêmes propriétés physiques

action opposée sur la lumière polarisée (mesure de αD)
notés (+) ou (-)
Nomenclature R,S ne préjuge pas du signe de αD, mais deux énantiomères ont
des αD de signes opposés
Nomenclature D,L ne préjuge pas de la nomenclature R,S, ni du signe de αD
racémate noté (+/-) (mélange équimolaire des deux énantiomères): αD = 0
Diastéréoisomères
Propriétés physiques différentes

Solubilité (séparables par cristallisation,séparables en phase achirale)
Points de fusion distincts
Propriétés spectrales distinctes (RMN 1H,13C)

ANALYSE DE COMPOSÉS CHIRAUX

Principes de l’analyse de composés chiraux
Séparation d’énantiomères par formation de diastéréoisomères:
A (±) + B* (-) A (+) B* (-) + A (-) B* (-)
séparation
A (+) + B* (-) A (+) B* (-)
A (-) + B* (-) A (-) B* (-)
A Analyte (mélange de deux énantiomères)

B* réactif chiral lévogyre ou dextrogyre (produits naturels)
A (±) Racémique B* diastéréoisomères

----------------------------------------------------------------------------
acide base sels
acide alcool esters
base acide sels
alcool acide esters
Exemples de Dérivatisation préalable
Analyte Analyte dérivatisé
Réactifs de dérivatisation
Dérivatisation => ester
O O
Analyte OH + Analyte O dériv

Cl dériv
S
N N
O
O N
CF3
H3C + Cl
NH OH O Ph OCH3
H3C CH
3
TIMOLOL
Chlorure d 'acide de Mosher
(MTPA - (R)-2-methoxy-3,3,3-trifluoro
-2-phenylpropanoïque )
S S
N N N N
O N O N
H3C O H3C O
NH O O + NH O O
H3C CH CF3 H3C CH CF3
3 3
Ph Ph
OCH3 OCH3
TIMOLOL dérivatisé
Dérivatisation => carbonate
O O
Analyte OH + Analyte O
Cl O-dériv O-dériv
S
N N
O
O N
H3C + Cl O
NH OH O
H3C CH
3
TIMOLOL
Chloroformiate de menthyle
S S
N N N N
TIMOLOL dérivatisé
O N O N
H3C O H3C O
NH O O + NH O O
H3C CH O H3C CH O
3 3

Dérivatisation => ester
O O
couplage
+ dériv OH Analyte
Analyte OH O dériv
O OH
OH
N
+
S
menthol
Cl
conditions de couplage
Métabolite du clopidogrel
O O O O
N
+ N
S Cl S Cl

Dérivatisation => carbamate
O
O
C
Analyte NH2 + N dériv Analyte HN N dériv
H
O
N CH3
C
O N O
+
HN
O
NH2
lénalidomide (1R)-(1-phényléthyl)-isocyanate
O O
O N + O N
HN HN
O H O H
HN N CH3 HN N CH3
O O

Dérivatisation => amide
O O
couplage
+ dériv NH2 Analyte
Analyte OH NH dériv
CH3 H2N CH3

OH
CH3
+
O
H3C
Ibuprofène (1R)-1-phényléthylamine
Conditions
de couplage
CH3 CH3
H H
N CH3 N CH3
CH3 CH3
+
O O
H3C H3C

Dérivatisation pour CPG
Analyte Analyte dérivatisé Réactifs de dérivatisation

Dérivatisation pour CPL
Analyte Analyte dérivatisé Réactifs de dérivatisation

Dérivatisation pour CPL- fluorimétrie
Exemples de réactifs de dérivatisation

Formation de diastéréoisomères labiles
dans la phase mobile

Formation de diastéréoisomères
labiles sur la phase stationnaire
Par inclusion dans une cavité chirale

Par inclusion dans une cavité chirale

Par transfert de charges

Par transfert de ligands de cations métalliques


Chimie Organique

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Voici le cours de chimie organique.

Choisissez dans le Programme de l’internat en pharmacie les notions qui seront

Chapitre 9. Analyse des composés chiraux.

Chapitre 10. Principales propriétés structurales et physico-chimiques des

Préparation à l’internat en pharmacie

Propriétés structurales et physico-chimiques

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Alcools généralement liquides

Préparation à l’internat en pharmacie

présence de substituants électronégatifs

stabilisation par résonance

Préparation à l’internat en pharmacie

Le groupement OH n’est pas un chromophore UV-visible

Préparation à l’internat en pharmacie

bande A (large): vibration de valence de OH entre 3300 et 3700 cm-1

Préparation à l’internat en pharmacie

Perte d’eau pour les alcools primaires : M-18

Perte d’eau et d’oléfine: M-(18-28) soit M-46

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Réactions de substitution nucléophile

Réaction d’élimination Formation de l’alcène le plus substitué

Préparation à l’internat en pharmacie

déprotonation avec Na, NaNH2, NaH -> alcoolates

Formation d'éthers: substitution nucléophile

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Mécanisme: catalyse acide

Préparation à l’internat en pharmacie

Mécanisme: catalyse acide

Oxydants faibles: MnO2 ou CrO3, Pyridine

Formation d’aldéhyde, de cétone ou d’acide en fonction de la classe

Préparation à l’internat en pharmacie

Na2Cr2O7 + H2SO4 + H2O Na2SO4 + 2H2CrO4

Formation d’aldéhyde à partir d’un alcool primaire

Préparation à l’internat en pharmacie

Structure: R −δ Caractère acide

Préparation à l’internat en pharmacie

phénols généralement solides

propriétés acides -> phénates

Déprotonation avec NaOH: formation de phénates

les phénates sont plus nucléophiles que les alcoolates

Formation d'éthers: substitution nucléophile

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

moins de liaisons hydrogènes que les alcools

propriétés acides -> thiolates

Préparation à l’internat en pharmacie

déprotonation avec NaOH

les thiolates sont plus nucléophiles que les alcoolates

Formation de thioéthers: substitution nucléophile

Préparation à l’internat en pharmacie

Oxydant faible: H2O2

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Préparation à l’internat en pharmacie

Mélange racémique indédoublable

Ammoniums quaternaires chiraux

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