FACULTY OF NATURE AND LIFE SCIENCES.

ORAN 1

Bioinformatique

Pr : HASSAINE O .

Année académique: 2022 / 2023

Présenté par: Mahieddine fatima zohra

Introduction
La bioinformatique, est ensemble de méthodes, de logiciels et
d’applications en ligne qui permettent de gérer, manipuler, et
analyser des données biologiques.
La bioinformatque met en jeu plusieurs champs disciplinaires :
Informatique , Mathématiques formelles , Statistiques

Le lysozyme est une enzyme bactériolytique de type hydrolase produite par les
cellules des lignée granulocytaire et monocytaire et sécrétée dans de
nombreux nombreux liquides biologiques (sérum, salive colostrum, mucus
nasal, larmes, urines, lait...).

Le but
Extrait un arbre phylogénétique de c-type lysozymes

Méthodologie

Figure 1 : Ncbi sur google

 Figure 2 : Recherche sur Ncbi
On selectione proteins sur ncbi puis on ecrit le nom de la séquece a recherche dans
la barre de recherche.

Figure 3 : Résultas des séquence sous forme Fasta

on clique sur fasta . et on copier la séquence.
Figure 4 : Coller la séquence sur bloc-notes .

Figure 5 : Tout les séquences du proteines .

Figure 6 : Molecular biology freeware for windows sur google

Figure 7 : instaler le Mega

Figure 8 : Entre sur Edit alignment , entrer sur create a new alignment , entrer
sur Protien

Figure 9 : coller tout la séquence du proteins

 Figure 10 :Entrer sur Edit puis fasta . Resultats d'alignments
-L'aligment nous permet de calciler le score . Entrer sur alignment puis sur
Align by Clutaw
Regler les parametres qui permet la constitution de notre arbre phylogénie

Figure 10 : Entrer sur Deta puis phelogenetic . Analyis Entrer sur costucl test
Neighbo-joing. Regler les parameter
 Figure 10 : Résultats de notre arbre phylogénie

Discussion
La phylogénie moléculaire a pour but de reconstruire les relations de parenté
entre des séquences de nucléotides ou d’acides aminés. On peut ainsi étudier
les relations de parenté entre les espèces qui les portent mais, aussi,
l’évolution du génome. En particulier, pour chaque famille multigénique, on
 peut déterminer l’importance relative des événements de duplications et de
transferts horizontaux de gènes.
Un arbre phylogénétique a été construit sur la base des séquences d'acides
aminés de trois types différents de lysozymes en utilisant la méthode de
liaison voisine dans MEGA version 5.0 (Tamura et al. 2011)

Conclusion
Le but de la phylogénie est de comprendre les relations de parenté, de
retracer l'historique évolutif d'un gène, d'une famille de gènes ou d'une
espèce. Les arbres phylogénétiques sont une très bonne manière de
schématiser et d'appréhender ces relations rapidement.