TP 6 : Rôle des enzymes dans les réactions métaboliques

Rappel : De nombreuses transformations biochimiques se réalisent dans une cellule : c’est ce que l’on
appelle le métabolisme.
Les cellules utilisent la matière première puisée dans leur milieu en la transformant grâce ces réactions
biochimiques.
Contexte : Dans la famille de Pierre, son frère présente une maladie rare : l’albinisme. Il souhaite comprendre
ce qui se déroule dans les cellules de son frère et comment expliquer cette défaillance.
Objectifs : Montrer que des molécules indispensables interviennent pour la transformation des substrats en
produits pour ces transformations biochimiques
Moyens : documents, expérience et logiciel

La teinte de la peau est liée à l’accumulation dans l’épiderme

d’un pigment sombre, la mélanine.
Deux types de cellules épidermiques sont impliqués : les
mélanocytes qui synthétisent la mélanine et les kératinocytes
où la mélanine va se disperser. Tous les individus possèdent le
même nombre de mélanocytes, quelle que soit la teinte de la
peau, mais la synthèse de mélanine est plus ou moins
importante suivant les sujets. De plus, l’exposition de la peau
au soleil intensifie cette synthèse. Le derme est la couche
profonde de la peau, recouverte par l'épiderme. L’hypoderme
est une couche de tissu adipeux et de tissu conjonctif située sous
le derme.
Observation d’une coupe de peu humaine au

microscope optique (M.O. x40)

Capacités Activité a: un tissu complexe : la peau

testées Aide : livre p 58

1/ Identifier les différents types cellulaires en complétant le schéma suivant :

Cellule accumulant de la
mélanine : ………………………
 Activité b: La voie métabolique spécialisée de la mélanine
Aide : livre p 58
2/ -Suite à votre lecture, retrouver le substrat et les produits de la voie métabolique
Utiliser des
outils et
spécialisée de la synthèse de la mélanine et préciser les molécules nécessaires à cette
mobiliser des série de transformations.
méthodes …………………………………………………………………………………………………………………………………………..……….
pour
apprendre ……………………………………………………………………………………………………………………………………………..…….
(recenser, ………………………………………………………………………………………………………………………………………..………….
extraire,
organiser et
exploiter des
informations)

3/ Proposer un protocole expérimental permettant de montrer que les enzymes

(ici la tyrosinase) sont indispensables dans la formation de la mélanine.
…………………………………………………………………………………………………………………………………………………..
………………………………………………………………………………………………………………………………………………….
………………………………………………………………………………………………………………………………….…………….
Concevoir,
créer,
réaliser 4/ Réaliser le protocole (à l’aide de la fiche « protocole expérimental »)
(utiliser des
outils pour
5/ Exploiter vos résultats sous une forme pertinente (tableau)
mettre en
œuvre une
démarche
scientifique)

Activité c : La réponse génétique à l’albinisme

6/ Expliquer à partir du doc 3 et du logiciel Geniegen/Anagène (visualisation des
séquences de nucléotides) pourquoi un individu albinos ne produit pas de mélanine.
Pour cela, les résultats de cette étude seront consignés dans un tableau comparatif.
Au préalable, rappeler la définition :
Allèle = ……………………………………………………………………………………………………………………………………..
L’albinisme se traduit par une dépigmentation générale (cheveux, peau, yeux) liée à un
défaut de synthèse des mélanines.
La tyrosinase résulte de l’expression d’un gène, situé sur le chromosome 11, dont
différents allèles ont été séquencés.

a) Lancer le logiciel GENIEGEN/ANAGENE/GENIEGENETIQUE afin d’analyser des séquences

d’allèles du gène de la tyrosinase :
(à partir du fichier fournit par le professeur dénommé « Alleles-tyr.edi »))
b) 9 séquences s’affichent correspondants chacune à un allèle du gène codant pour la tyrosinase :
Tyrcod1 et Tyrcod2 sont des allèles issus d’individus normaux,
les autres sont issus d’individus albinos.
c) Comparer l’allèle Tyrcod 1 (qui sert de référence) avec l’allèle Tyrcod 2 ainsi que les 2 allèles
Tyralb A2 et Tyralb A3 (individus albinos).
Pour cela : cliquer gauche pour les sélectionner les 3 séquences et les comparer puis :
Traiter  comparer les séquences  comparaison simple (ou affichage puis comparaison)
Rappel : les tirets représentent l’équivalence dans les nucléotides
d) Sous une forme adaptée, résumer vos comparaisons : (tableau)
-la différence au niveau de la séquence de nucléotides
- la différence au niveau de la production de mélanine
-la différence au niveau des caractéristiques de ces personnes
e) En conclusion : proposer un court texte pour définir de manière plus précise un allèle
 TP 6 CORRECTION: Rôle des enzymes dans les réactions métaboliques

Rappel : De nombreuses transformations biochimiques se réalisent dans une cellule : c’est ce que l’on
appelle le métabolisme.

Les cellules utilisent la matière première puisée dans leur milieu en la transformant grâce ces
réactions biochimiques.

Objectifs : Montrer que des molécules indispensables interviennent pour la transformation des
substrats en produits pour ces transformations biochimiques.

Moyens : Exemple de la voie métabolique de la synthèse de mélanine.

Capacités Activité a
testées
1/ Identifier les différents types cellulaires en complétant le schéma suivant :

Mélanocyte

Utiliser des
outils et
2/ Retrouver le substrat et les produits de la voie métabolique spécialisée de la
mobiliser des synthèse de la mélanine.
méthodes pour Préciser les molécules nécessaires à cette série de transformations.
apprendre Substrat = tyrosine, Produits intermédiaires (carré, losange…) et Produit final =
(recenser,
mélanine, Molécules nécessaires : ENZYMES
extraire,
organiser et Tyrosine Mélanine
exploiter des 3/ Proposer un protocole expérimental permettant de montrer que les enzymes sont
informations) indispensables dans la formation de la mélanine.
Mettre en solution le substrat + enzyme ainsi que le témoin : substrat + eau

4/ Réaliser le protocole (à l’aide de la fiche « protocole expérimental »)

5/ exploiter vos résultats sous une forme pertinente.

-Un schéma des tubes est attendu et un tableau des résultats

Concevoir, créer,
réaliser
(utiliser des outils
pour mettre en
œuvre une
démarche
scientifique)

5)
Tube 1 Tube 2 Tube 3
Expérience Tyrosine+ eau Tyrosinase + eau Tyrosine +
Tyrosinase
Observation reste incolore= Coloration claire= coloration brune=
« je vois que » pas de mélanine pas de mélanine mélanine produite
produite produite
Interprétation Le substrat seul Enzyme seule ne l’enzyme
« je peux donc (tyrosine) ne produit pas de transforme la
dire que » produit pas de mélanine tyrosine en
mélanine mélanine.
Conclusion : Substrat Produit
ENZYME

-On voit que :

en présence de l’enzyme, une coloration brune apparait = mélanine
sans enzyme = reste incolore = pas de mélanine
-On en déduit que l’enzyme transforme la tyrosine en mélanine.
Bilan BO :
Le métabolisme dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule (organites, et les
macromolécules qui sont les enzymes) ;
Enzyme = molécule de type protéine qui participe à une réaction chimique.
6/ Expliquer à partir du doc 3 et du logiciel Geniegen/Anagène pourquoi un individu
albinos ne produit pas de mélanine.
Pour cela, les résultats de cette étude seront consignés dans un tableau comparatif.

L’albinisme se traduit par une dépigmentation générale (cheveux, peau, yeux) liée à un
défaut de synthèse des mélanines.
La tyrosinase résulte de l’expression d’un gène, situé sur le chromosome 11, dont
différents allèles ont été séquencés.

Allèle Tyrcod1 (normal) TyralbA2 (anormale) TyralbA3(anormale)

Caractéristiques de Normal Albinos Albinos
l’individu visible
Caractéristiques de tyrosinase tyrosinase NON tyrosinase NON
l’individu au niveau fonctionnelle fonctionnelle fonctionnelle
cellulaire =présence de =absence de mélanine =absence de mélanine
mélanine
Je compare par -Le nucléotide 575 -Le nucléotide 575
rapport à Tyr cod 1 : Adénine est remplacéAdénine est
« Je vois que…. » par la Cytosine remplacé par la
-A partir du
Cytosine
nucléotide 731 : la
-Le nucléotide 533
séquence n’est plus la
Guanine est
même
remplacé par l’
Adénine
« Je peux donc dire 1. Un gène est une séquence de nucléotides qui peut être
que … » différente selon les individus sans pour autant être
malade= ce sont les allèles normaux.
On dit que les allèles normaux codent pour une enzyme
normale/saine. (ex : TYR cod 1 et 2)allèles
2. Les allèles (TYR alb 2 et 3) présentant des changements de
nucléotides (appelés « mutation ») semblent expliquer la
maladie albinisme : les allèles mutés ne permettent plus de
produire une enzyme fonctionnelle ( la tyrosinase
disfonctinnelle ne peuvent plus transformer la tyrosine en
mélanine)nte selon les individus sans pour autant provoquadie.
 Fiche protocole : Synthèse de la mélanine

1. Laver et découper en morceaux un pied de champignon.

2. Broyer les champignons dans le mortier avec 20 mL d’eau froide et un peu de sable (2 pincées).
Le broyage ne doit pas durer plus de 30 secondes.
3. Filtrer pour obtenir un extrait de champignon.
4. Remplir 3 tubes selon les proportions suivantes :
Aide question 5)
Tube 1 Tube 2 Tube 3
Expérience Tyrosine+ eau Tyrosinase + eau Tyrosine +
Tyrosinase(extrait
de champignon)
Observation reste incolore= Coloration claire= coloration brune=
« je vois que » pas de mélanine pas de mélanine mélanine produite
produite produite
Interprétation Le substrat seul Enzyme seule ne l’enzyme
« je peux donc (tyrosine) ne produit pas de transforme la
dire que » produit pas de mélanine tyrosine en
mélanine mélanine.
Conclusion : Substrat Produit
ENZYME
 Schéma bilan du métabolisme : rôle des enzymes

Enzyme fonctionnelle Enzyme non

fonctionnelle

Fabrication de Mauvaise ou
mélanine aucune fabrication
de mélanine

Personne Personne
normale « albinos »
 Autre schéma possible :
Schéma bilan du métabolisme : rôle des enzymes