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SVT2- CH4- TP12

Fiche protocole 1 : Comparer des séquences de nucléotides


avec le logiciel GENIEGEN
Matériel :
- Logiciel Géniegen + FT
- Dossier numérisé TP12 : Séquences_Dugongs_Nv-Caledonie

Comparaison des différents allèles d’un gène


- Menu Fichier, charger des séquences : Dans la fenêtre Ouvrir, regarder dans, Ress ‘classe’, dossier
Séquences_Dugongs_Nv-Caledonie, sélectionner tous les fichiers = 22 séquences D-loop de 22
individus différents (cliquer sur la 1e séquence, puis touche maj enfoncée, cliquer sur dernière
séquence puis ouvrir)

- Menu Action, Alignement : Dans la fenêtre « alignement de Séquences », les séquences de


nucléotides s’affichent et la première séquence est la séquence de référence pour la comparaison
(toutes les séquences sont comparées à la première) :
o lorsque les nucléotides sont identiques entre 2 séquences, ils sont remplacés par
un trait d’union (ou tiret haut) : ---- ;
o si un nucléotide est différents il est noté en clair (A, ou T ou C ou G)
o si un nucléotide manque, il est remplacé par un tiret bas : _

Fiche protocole 2 : Simuler l’évolution génétique d’une population


avec le logiciel Dérive génétique
Matériel :
- Logiciel Evolution : https://svt.spip.ac-rouen.fr/spip.php?article30
Puis ouvrir le zip avec « WinRAR archiver »

Comprendre le jeu :
• les couleurs représentent chacune un allèle d’un caractère (exemple : allèle bleu du gène de la couleur de
peau chez la grenouille).
• les dés représentent le nombre de descendants que chaque individu va donner (donc limité
artificiellement à 6).
• la population 1, 2, etc… sera la population formée de l’ensemble des descendants obtenus suite au lancer
de dé pour chaque individu de départ (exemple : le lancer de dé donne 5 pour la bille bleue donc celle-ci
aura 5 descendants).
• G 1, 2 etc sélectionne les 6 individus de la population 1, 2, etc… capables de se reproduire (car vivants,
fertiles)
• la génération suivante est constituée de ces 6 individus (et permet de revenir au début).
Le principe du jeu :
• Créer une succession de générations au sein d‘une population par tirages au sort (lancer de dés)
successifs, pour voir comment évolue la fréquence des allèles d’un gène au cours des générations au sein
d’une population.

Consignes :
1) Jouer jusqu’à la 12ème génération ou jusqu’à ce qu’une seule couleur l’emporte.
2) Comparer avec le résultat d’un camarade ou rejouer et comparer les résultats des 2 parties.
3) Expliquer quel est le facteur qui fait varier les fréquences alléliques au cours du temps.
4) Expliquer l’expression « dérive génétique », nom donné à ce mécanisme de l’évolution ici illustré.

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