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Introduction
I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
2
Introduction
I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Structure de la membrane plasmique 5
espace central
couche périphérique
cytoplasme
A appliquer en TD2
Structure de la membrane plasmique 6
200 nm
Mise en évidence par une réaction spécifique des glucides
LA MEMBRANE PLASMIQUE 7
Introduction
I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Isolement de membrane plasmique 8
▪ La pression osmotique joue sur la forme des cellules : exemple sur des hématies
15 sec. Centrifugation
Introduction
I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
La chimie du vivant : le carbone 11
- Base du vivant
- Atome pouvant établir 4
liaisons covalentes avec
différents atomes
- Chaines carbonées :
molécules organiques
- Chaines carbonées de
plusieurs types
- Constitution des
macromolécules
Le vivant en a pompé le carbone dans l’atmosphère pour se former. Il y a 4,3 milliards d’années, le dioxyde de
carbone aurait représenté jusqu’à 25 % de l’atmosphère terrrestre . En 1950, il n’en représentait plus que 0,03 %3
La chimie du vivant : le carbone 11
- Base du vivant
- Atome pouvant établir 4
liaisons covalentes avec
différents atomes
- Chaines carbonées :
molécules organiques
- Chaines carbonées de
plusieurs types
- Constitution des
macromolécules
Le vivant en a pompé le carbone dans l’atmosphère pour se former. Il y a 4,3 milliards d’années, le dioxyde de
carbone aurait représenté jusqu’à 25 % de l’atmosphère terrrestre . En 1950, il n’en représentait plus que 0,03 %3
12
LES MACROMOLECULES BIOLOGIQUES
Biomolécules
constitutives Liaison(s)
Macromolécules Rôles biologiques Exemple
covalentes
(Sous-unités)
• Stockage et
Liaison expression de • ADN
Acides nucléiques Nucléotides
phosphodiester l’information • ARNs
génétique
• Tubuline
• Structures
Protéines Acides aminés Liaison peptidique • Enzyme
• Fonctions
• Immunoglobuline
• Glycérol
• Membranes • Cholestérol
• Sphingosine • Liaison ester
Lipides • Energie • Triglycérides
• Acides gras • Liaison amine
• Pigments • Lycopène
• Phosphate
• Soutien • Cellulose
Oses Liaison
Glucides • Energie • Glycogène
(glucose) glycosidique
• Communications • Amidon
UE de Chimie et UE LU1SV002 du S2
La chimie du vivant : l’eau 13
liaison
hydrogène
Dans l’eau, la liaison hydrogène a une longueur de 2,8 Å (0,28 nm ou 0,28.10-9 m).
La chimie du vivant : l’eau, et ses interactions 15
Organisation tridimensionnelle de l’eau
“Eau” = assemblage transitoire de molécules d’H2O par des liaisons hydrogènes
La chimie du vivant : l’eau, et ses interactions 16
▪ NaCl = ions Na+ et Cl- liés par des liaisons ioniques (ou électrovalentes).
▪ Liaison ionique : liaison électrostatiques entre deux ions de charge
opposée.
▪ Na+ et Cl- dissociés par les molécules d’eau
2d- 2d- d+ d+
2d- 2d- d+ d+
La chimie du vivant : l’eau, et ses interactions 17
Molécules capables de former des liaisons hydrogène avec des molécules d’eau
(hydrophile = “qui aime l’eau”)
d+
2d- d+
Ces molécules hydrophiles ou
polaires possèdent des
groupements polaires
d+ 2d-
2d-
d+
Ces groupements polaires constituent des fonctions polaires avec d’autres atomes
C O H C O H
O H
C C O C N
H H
• phosphate H3PO4
• fonction acide COOH
O O
O H O P O H O- P O-
C
O H
O O-
forme ionisée
H
20
Les molécules non polaires sont constituées de groupements non polaires tels que :
d+
2d-
d+
L’huile ne se dissout pas dans l’eau. L’huile est insoluble dans l’eau
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MOLECULES HYDROPHBES OU APOLAIRES
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I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Les macromolécules – les protéines 24
Acide aminé
Fonction acide
Fonction amine
C’est la nature de la chaîne latérale (R) qui permet la distinction entre les 20 acides aminés
Les macromolécules – les protéines 25
Les macromolécules – les protéines 26
Structure primaire
Les macromolécules – les protéines 27
Acide aminé
Structure primaire
chaînes
acide aminé latérales
polaires
séquence
Les macromolécules – les protéines 27bis
Glucose cyclique
37
Les macromolécules – les glucides 31
Dérivés des monosaccharides
Les macromolécules – les glucides 32
Les oligosaccharides
Des exemples..
39
DIFFERENTS NIVEAUX D’ORGANISATION DE LA MATIERE VIVANTE 33
Molécules et macromolécules biologiques
formées par liaisons covalentes entre atomes
structurées (conformées) par liaisons faibles intramoléculaires
Niveau 1 :
biomolécules
Niveau 7 : Niveau 2 :
organisme Niveau 3 : macromolécules
complexes
supramoléculaires
Niveau 6 :
organe
Niveau 5 :
tissu
Niveau 4 :
cellule
et ses organites
LA MEMBRANE PLASMIQUE 34
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I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Lipides membranaires 35
chaînes carbonées
“tête“
domaine apolaire domaine
polaire
Lipides membranaires 35
chaînes carbonées
“tête“
domaine apolaire domaine
polaire
acide gras
glycérol
acide gras
P alcool
Phosphatidylsérine PS Phosphatidylcholine PC
Les diférents phosphoglycérides
membranaires
Phosphatidylinositol PI
Phosphatidyléthanolamine PE
Lipides membranaires 37
Sphingolipides
sphingosine
Le cholesterol
noyau stérane
polycyclique
domaine apolaire
chaîne
hydrocarbonée
Lipides membranaires 39
acide gras
glycérol
acide gras
ose
Sphingoglycolipide (animaux)
sphingosine
Milieu extra-cellulaire
Hémi-membrane externe
Bi-couche lipidique
Hémi-membrane interne
Cytoplasme
Lipides membranaires dans l’eau 42
Milieu extra-cellulaire
Hémi-membrane externe
Bi-couche lipidique
Hémi-membrane interne
Cytoplasme
espace central
couche périphérique
cytoplasme
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1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Les protéines dans l’eau 44
Milieu extra-cellulaire
Hémi-membrane externe
Domaine
Bi-couche lipidique transmembranaire
hydrophobe
Hémi-membrane interne
Pont disulfure
inter-chaîne
Domaine
hydrophile
Milieu extracellulaire
Pont disulfure
oligosaccharides
intra-chaîne
Hélice -transmembranaire
Domaine
Bi-couche lipidique hydrophobe
Groupement sulfhydryle
Cytoplasme
(environnement réducteur)
Domaine
hydrophile
56
Les protéines membranaires 48
Protéines périphériques
Milieu extra-cellulaire
Bi-couche lipidique
protéine périphérique
Cytoplasme liée à un lipide
membranaire par un
protéine périphérique protéine périphérique motif
ancrée à la membrane interagissant avec une oligosaccharique
par un lipide isoprénique protéine
transmembranaire
Les protéines membranaires 49
Milieu extra-cellulaire
Bi-couche lipidique
Cytoplasme
Les protéines membranaires 50
Milieu extra-cellulaire
Bi-couche lipidique
Cytoplasme
Bi-couche lipidique
Cytoplasme
Domaine hydrophobe
Domaine hydrophile
Monomères de
détergents
Micelles de
Membrane plasmique
détergents
Triton-X100
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I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
54
Modèle en bi-couche lipidique en mosaïque fluide proposé par Singer et Nicholson (1972)
Cohérence du modèle avec la structure trilamellaire observée en microscopie électronique
A appliquer en TD2
LA MEMBRANE PLASMIQUE 56
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I. Structure de la membrane plasmique
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2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
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2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Fluidité membranaire 57
protéine
protéine membranaire membranaire
Fusion
cellulaire
hétérocaryon
t = 5 mn
« recourbé »
Linéaire
Fluidité membranaire : composition en lipides 59
augmentation
de la fluidité
cholestérol
diminution
de la fluidité
cholestérol
A appliquer en TD2
Fluidité membranaire : température 62
Pt de
Nom C C=C Formule
fusion
+
Acide palmitoléique 16 1 CH3-(CH2)5-CH=CH-(CH2)7-COOH
0,5°C
30°C à 10°C
faible
fort
Fluidité membranaire : mouvements des lipides membranaires 65
diffusion latérale
“flip-flop”
flexion rotation
LA MEMBRANE PLASMIQUE 66
Introduction
I. Structure de la membrane plasmique
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2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Asymétrie membranaire : les glucides 67
glycocalyx cytoplame noyau membrane plasmique
Glycoprotéine
Glycoprotéine Glycoprotéine
Glycoprotéine
Glycoprotéine Protéoglycane
Protéoglycane
Glycoprotéine
transmembranaire
transmembranaire adsorbée
périphérique
adsorbée transmembranaire
transmembranaire
transmembranaire
ose
GLYCOCALYX
Glycocalyx
BICOUCHE
Bicouche lipidique
LIPIDIQUE
Glycolipide
Cytoplasme
Asymétrie membranaire : les lipides 68
Oligosaccharide
Milieu extra-cellulaire
Pont disulfure
Cytoplasme P Phosphorylation
LA MEMBRANE PLASMIQUE 70
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I. Structure de la membrane plasmique
1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
71
Les radeaux lipidiques sont des micro-domaines spécialisés de la membrane plasmique,
caractérisés par une composition particulière en lipide.
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1. Structure de la membrane plasmique
2. Isolement de membranes plasmiques
II. Composition chimique de la membrane plasmique
1. La chimie du vivant : le carbone et l’eau
2. Les grands types macromolécules biologiques
3. Composition chimique de la membrane plasmique
a. Lipides membranaires
b. Protéines membranaires
III. Architecture de la membrane plasmique
1. Modèle en mosaïque fluide
2. Caractéristiques de ce modèle
a. Fluidité de la membrane
b. Asymétrie de la membrane
3. Les radeaux lipidiques
4. Importance des composants glycosylés de la membrane
Les oligosaccharides, molécules porteuses d’information
73
Gal NAc-Glc
enzyme I
Fucose
74
Fucose Fucose
Gal NAc-Glc
« Receveur universel »
car absence d’anticorps
anti-Ag A et anti-Ag B dans
le plasma
O AB
« Donneur universel »
car n’est pas reconnu par
les anticorps anti-Ag A et
anti-Ag B B
77
H2O H2O
Molécules hydrophobes :
benzène
A appliquer en TD 2
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DIFFERENTS TYPES DE TRANSPORT MEMBRANAIRE
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
Tonneau :
pore membranaire
Tonneau :
pore membranaire
84
Les hélices dans les pores membranaires doivent être amphiphiles
C-term
face hydrophobe
face hydrophile
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
ETAT "PONG"
Milieu extracellulaire
Cytoplasme
ETAT "PING"
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
ATP ADP + Pi
Cytoplasme de la cellule
[Na+] [K+] K+
K+
Plasma sanguin 145 mM 5 mM
micropipette
eau de mer
axone
1 22Na + ATP standart forte sortie de sodium radio-actif dans l’eau de mer
3 22Na + ATP sans ions K+ faible sortie de sodium radio-actif dans l’eau de mer
Pompe “Na+/K+ ATP-dépendante“ de la membrane plasmique 92
Milieu extracellulaire
ions K+
Na+ K+
P P
ions Na+ P
Cytoplasme
ATP ADP
La Pompe Na/K utilise l'énergie issue de la dégradation de l'ATP pour transporter des ions potassium et
sodium contre leur gradient de concentration.
Exemple : TRANSPORT DU GLUCOSE DANS UN ENTEROCYTE 93
Faible
concentration de
glucose
Symport
Na+/glucose
Concentration
élevée en glucose
Transporteur
de glucose
K+ K+
Faible Na
+
Na
+
concentration
de glucose
IV. Transport membranaire
1. Pourquoi un transport membranaire?
2. Organisation du transport membranaire
3. Transport d’ions et de petites molécules
a. Transport passif ou diffusion
b. Transport actif
4. Transport de macromolécules et de particules
a. Endocytose
b. Exocytose
95
Milieu extra-cellulaire
Membrane plasmique
Cytoplasme
ENDOCYTOSE
Vésicule d’endocytose
96
Mécanisme de l’endocytose
pseudopode
membrane
Endocytose
de bactéries
(ex par les
amibes)
cytoplasme
Pinocytose Capture et
absorption de gouttelettes de
milieu extracallulaire contenant
des micromolécules et de solutés
dans de petites vésicules.
… LA MEMBRANE PLASMIQUE
Milieu extra-cellulaire
Membrane plasmique
Cytoplasme
EXOCYTOSE
Vésicule d’exocytose