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Chimie Organique Généarale

SMC – S3

Structure des Composés Organiques

Nomenclature en Chimie organique

Isomérie et Stéréoisomérie

Effets électroniques

Les Intermédiaires réactionnels


Composition de la matière vivante et de la matière minérale

Les importantes caractéristiques de la matière composant les êtres vivants

Les 4 atomes du vivant,


C, H, N et O
Domaines d’applications de la chimie organique
Structure des Composés Organiques

Le carbone (C) est l'élément majeur de cette chimie, mais il n'est pas le seul. A coté
de cet atome, on retrouve de l'hydrogène (H), de l'oxygène (O), de l'azote (N) et
bien d'autres (Cl, Br, S …)

Formule brute CxHyOzNt

Détermination de la structure

* Etablissement de sa formule brute CxHyOzNt.

* la manière dont les atomes sont liés les uns aux autres
Structure des Composés Organiques
Détermination de la formule brute

Soit un composé organique de formule brute CxHyOzNt et de masse molaire M.

%C + % H + %N + %O = 100 %
12x + y + 16z + 14t = M
MC = 12
12x y 14t 16z M MO = 16
= = = = MH = 1
%C %H %N %O 100
MN = 14

Pourcentage du C, H, N, Br, Cl C technique de l’analyse élémentaire (ou centésimale)


% O = 100 - somme des pourcentages de tous les autres éléments

Masse Molaire C spectrométrie de masse


Détermination des indices x, y, z et t : x = %C * M/1200
y = %H * M/100
z = %O * M/1600
t = %N * M/1400
Structure des Composés Organiques
Formule structurale

En chimie minérale : une formule brute une seule formule structurale


En chimie Organique : une formule brute plusieurs formules structurales
Isomères
Théorie de Kékulé : carbone est tétravalent,
Hydrogène et les halogènes (Br, Cl, F, I) sont monovalents
Oxygène et le soufre sont divalents
Azote est trivalent.

C
Le carbone C : 4 liaisons simples (liaison s)
1 liaison double (liaison p) et 2 liaisons simples C
2 doubles liaisons C
1 liaison triple et 1 liaison simple C
L’oxygène O : 2 liaisons simples O
1 liaison double O N
L’azote N : 3 liaisons simples
1 liaison double et 1 liaison simple N
1 liaison triple N
L’hydrogène H
et les halogènes : 1 liaison simple H Cl
Hybridation des orbitales atomique du carbone

Structure électronique du carbone (Z = 6)

1 s2 2 s2 2 p2 ne peut expliquer ni la tétravalence du C dans


la molécule du méthane (CH4), ni la valeur de
ses angles qui sont égale 109°28

Etat excitée : combinaison linéaire des orbitales atomiques (OA) 2s et 2p

justifié la tétravalence, il ne justifie :


ni la géométrie : orbitales atomiques perpendiculaires
ni l’identité de la liaison (C-H) dont la distance est égale à 1.10 Å.

Concept de l’hybridation

Hybridation sp3
Hybridation sp2
Hybridation sp
Hybridation des orbitales atomique du carbone
Hybridation sp3 : Combinaison linéaire des quatres OA (2 s, 2px, 2py et 2pz)

- 4 orbitales hybrides équivalents


- Leur direction est dirigé vers le sommet d’un tétraèdre régulier.
- Le carbone est tétragonale.
- L’angle de valence étant de 109°28.
- Libre rotation entre C-C, distance 1.54 Å C

Hybridation sp2 : Combinaison linéaire des trois OA (2s, 2px et 2pz)


2py reste pure.

Hybridation sp: Combinaison linéaire des deux OA (2s et 2px)


2 py et 2 pz restent pures.

C C

- Leur direction est dirigée vers le


sommet d’un triangle. - Le carbone est linéaire (diagonale)
- Le carbone est trigonale. - L’angle de valence est de 180°
- L’angle de valence est de 120° - rotation interdite entre C=C, distance 1.38 Å
- rotation interdite entre C=C, distance 1.48 Å
Structure des Composés Organiques
Formule structurale

Degré d’insaturation: fournit des informations sur la saturation d’une molécule CxHyOzNt

di = x - y/2 + t/2 + 1

x : nombre d’atomes tétravalents (C)


y : nombre d’atomes monovalents (hydrogène, halogène)
t : nombre d’atomes trivalents (N)
(L’oxygène n’est pas pris en considération)

Si di = 0 molécule est saturée (pas de dl, tl ou cycle)


Si di = 1 1 instauration : 1 double liaison
1 cycle.
Si di = 2 2 insaturations : 1 liaison triple
2 liaisons doubles
2 cycles
1 liaison double et 1 cycle.

Exemple : C3H6O
di = 3 - 6/2 + 1 dl
le composé est insaturé cycle
di = 1
Structure des Composés Organiques
Formule structurale

Exemple : C3H6O
di = 3 - 6/2 + 1 dl
le composé est insaturé cycle
di = 1

Structures possibles
OH
CH3 CH3
HO
OH

H H3C CH3
H3C
O O

O
OH H3C
Structures des molécules organiques
Formes structurales

Formule développée plane : donne l’enchaînement des atomes dans la molécule

H H H H H H H H
H C C N H H C C C H H C C C C N H
H O H H H O

Formule semi-développée : ne représente que les liaisons entre atomes de carbone


et carbone-hétéroatomes.

HO CH2 CH2 NH2 CH3 CH CH2 HC C CH CH NH


OH
Formule semi-développée simplifiée (topologique ou perspective)
* carbone-carbone sont représentées par des segments.
* les atomes d’hydrogène, ne sont pas représentés.

OH
NH2 NH
HO
Nomenclature en Chimie organique

Règles de nomenclature ont été fixées pour la chimie organique


par l’IUPAC : Union Internationale de Chimie Pure et Appliquée.

Trouver le nom d’une molécule connaissant la structure.

Trouver la structure d’une molécule connaissant le nom


Nomenclature en Chimie organique

* hydrocarbures saturés et insaturés acycliques


ou cycliques
alcanes
alcènes
alcynes
Les composés organiques
* hydrocarbures aromatiques (benzène)

* composés portant une fonction


acide carboxylique (R-CO2H)
ester (R-CO2R’)
halogénure d’acide (R-CO2X)(avec X halogène = Cl, Br, F, I)
amide (R-CONR’R’’)
nitrile (R-CN)
aldéhyde (R-CHO)
cétones (R-CO-R’)
alcool (R-OH)
amine (R-NR’R’’)
thiol (R-SH)
éther (R-O-R’)
anhydride (R-CO-O-CO-R’)
Nomenclature en Chimie organique

Généralement le nom est constitué

Substituant Chaine carbonée principale Doublet pC/C Fonction principale

par ordre précidé par cyclo en cas de aucun , ane Voir ordre de priorité
alphabétique chaine cyclique C=C , ène des fonctions
C C , yne
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) saturés et insaturés

Nom : radical + terminaison


ane Alcane (CnH2n+2)
ène Alcène (CnH2n) (double liaison)
yne Alcyne (CnH2n-2) (triple liaison)
èn yne double et triple liaison

Nbre de C Radical Nbre de C Radical

1 méth 10 déc

2 éth 11 undéc

3 pro 12 dodéc

4 but 13 tridéc

5 pent 14 tétradéc

6 Hex 15 pentadéc

7 Hept 20 iecos

8 Oct 21 heniecos

9 Non 22 Docos
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcanes : CnH2n+2

Le nom des alcanes comporte un préfixe indiquant le nombre d’atomes de carbone


de la chaîne suivi de la terminaison ane

Formule structure Préfixe Nom


brute (C P)
(CnH2n+2)
CH4 CH4 méth méthane
C2H6 CH3-CH3 éth éthane
C3H8 CH3-CH2-CH3 prop propane
C4H10 CH3-CH2-CH2-CH3 but butane
C5H12 CH3-CH2-CH2-CH2-CH3 pent pentane
C6H14 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH3 hex hexane
C7H16 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH3 hept heptane
C8H18 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH3 oct octane
C9H20 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH3 non nonane
C10H22 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH3 déc décane
C11H24 undéc undécane
etc
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcanes : CnH2n+2

Le nom des alcanes comporte un préfixe indiquant le nombre d’atomes de carbone


de la chaîne suivi de la terminaison ane

butane propane

pentane
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcènes: CnH2n

Le composé est nommé en remplaçant la terminaison «ane» de l’alcane


correspondant par « ène ».

Formule structure Chaine Nom


brute Principale
(CnH2n)
C2H4 CH2=CH2 éth éth-1-ène Éthène
C3H6 CH3-CH=CH2 prop prop-1-ène Propène
C4H8 CH3-CH2-CH=CH2 but but-1-ène Butène
C5H10 CH3-CH2-CH2-CH=CH2 pent pent-1-ène Pentène
C6H12 CH3-CH2-CH2-CH2-CH=CH2 hex hex-1-ène Hexène
C7H14 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH=CH2 hept hept-1-ène Heptène
C8H16 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH=CH2 oct oct-1-ène Octène
C9H18 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2=CH2 non non-1-ène Nonène
C10H20 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH=CH2 déc déc-1-ène Décène
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcynes: CnH2n-2

Le composé est nommé en remplaçant la terminaison «ane» de l’alcane correspondant par «yne».

Formule structure Chaine Nom


brute Principale
(CnH2n)
C2H2 CH≡CH éth éth-1-yne éthyne
C3H4 CH3-C≡CH prop prop-1-yne popyne
C4H6 CH3-CH2-C≡CH but but-1-yne butyne
C5H8 CH3-CH2-CH2-C≡CH pent pent-1-yne pentyne
C6H10 CH3-CH2-CH2-CH2-C≡CH hex hex-1-yne hexyne
C7H12 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-C≡CH hept hept-1-yne heptyne
C8H14 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-C≡CH oct oct-1-yne octyne
C9H16 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-C≡CH non non-1-yne nonyne
C10H18 CH3-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-C≡CH déc déc-1-yne décyne
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) saturés et insaturés

Non : radical + terminaison


ène Alcène (CnH2n) (double liaison)
yne Alcyne (CnH2n-2) (triple liaison)
èn yne double et triple liaison

2 4 6 2 4 6
2 4
3 1 3 7
3 1 5 5
1
8

Nombre de liaison double liaison triple liaison


Numérotation :
2 diène diyne
• plus petit numéro à la liaison multiple
3 triène triyne (double et triple).
4 tetraène tetrayne • En cas d’égalité, le plus petit numéro est
affecté à la double liaison.
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures ramifiés linéaire (acyclique)

(Substituant)

Non : substituant + radical + terminaison


ane aucun double et triple liaison
ène double liaison
yne triple liaison
èn yne double et triple liaison

Chaine principale (radical) doit :


1. contenir le nombre maximum de liaisons multiples (liaison double et liaison triple).
2. être la plus longue possible (plus grand nombre d’atomes de carbones).
3. contenir le nombre maximum de doubles liaisons.
4. porter le nombre maximal de substituants. En cas d’égalité, elle doit contenir celui qui
portera le numéro le plus petit dans la numérotation de la chaîne.
S’il y a toujours égalité, elle doit contenir le premier substituant dans l’ordre
alphabétique.
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcanes ramifiés : CnH2n+2

* Chercher la chaîne carbonée la plus longue : c’est la chaîne principale, elle aura le nom de
l’hydrocarbure correspondant.

* Chercher les substituants liés à la chaîne principale, les nommer en remplaçant la terminaison
ane par yl.

* Numéroter la chaîne principale, de façon à donner les indices les plus bas aux substituants.

* Les substituants sont ensuite rangés par ordre alphabétique devant le nom de l’hydrocarbure,
en indiquant leurs positions.

C H3
1 2 4 6
3 5 7 3+4 = 7
C H3 C H 2 C H C H C H 2 C H2 C H3 4+5 = 9 7<9
7 6 5 4 3 2 1

C H3

• chaîne principale : 7 atomes de carbone : heptane


• substituants : 2 CH3 : diméthyl - 3,4

3,4-diméthyl heptane
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcanes ramifiés : CnH2n+2

3
3+4+6 = 13
toujours (2-méthyl propyl)-6
2
5+7+8= 20 13 < 20 méthyl-4
1
2 6 8 10
10 C : déc 4
1 3 5 7
9 7 5 3 9 1
10 8 6 2
4
Br

bromo-3

3-bromo-4-méthyl-6-(2-méthylpropyl) décane

1 2 3 4 5 6 7
7 C : hept
CH3 CH2 CH2 CH CH2 CH2 CH3
1CH
CH3 CH3 (1-méthy éthy)-4
2
4-(1-méthyléthyl) heptane
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcanes ramifiés : CnH2n+2

2 4 4
1 3 6 7 5
5 6
3
2

3,4-diéthyl hexane 1
2-méthyl-4-propyl heptane

Numérotation :

1. Les numéros les plus petits doivent être attribués aux substituants.
En cas d’égalité, le plus petit numéro est attribué au premier substituant dans l’ordre alphabétique.
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcènes ramifiés : CnH2n

Chaine principale doit :


- le plus grand nombre de doubles liaisons.
- le plus grand nombre d’atomes de carbone
- le nombre maximal de substituants.
- En cas d’égalité, elle doit contenir le premier substituant dans l’ordre alphabétique

3 1
4 2
3 4
1 2 5

2-méthyl pent-2-ène

2-propyl buta-1,3-diène
Numérotation :

1. le numéro le plus petit doit être attribué aux doubles liaisons


2. Les numéros les plus petits doivent être attribués aux substituants.
En cas d’égalité, le plus petit numéro est attribué au premier substituant dans l’ordre alphabétique.
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques) Alcynes ramifiés: CnH2n-2

CH3 CH2 CH CH2 C C-CH3 hept-2-yne


7 6 5 4 3 2 1

CH3
CH3-CH2-C C CH CH2 C C-CH3 5-méthyl non-2,6-diyne
9 8 7 6 5 4 3 2 1

Chaine principale doit :


- le plus grand nombre de liaisons multiples triples
- le plus grand nombre d’atomes de carbone.
- le nombre maximal de substituants.
- En cas d’égalité, elle doit contenir le premier substituant dans l’ordre alphabétique.

Nombre de liaison triple liaison


Numérotation :
2 diyne
• plus petit numéro aux triples liaisons
3 triyne
• En cas d’égalité, le plus petit numéro au substituants.
4 tetrayne
Nomenclature en Chimie organique
Nom des substituants
Les substituants sont des atomes ou groupes d’atomes branchés par une liaison
à l’un des carbones de la chaîne principale.
- dérivés des hydrocarbures : nommés en remplaçant le « e » par « yl »

* –CH3 : méthyl ; –CH2−CH3 : éthyl; –CH2− CH2− CH3 : propyl


* –CH=CH2 : éthényl (vinyle), –CH2−CH=CH2 : prop-2-ényl
* –C≡CH : éthynyl ; –C≡C-CH3 : prop-1-ynyl

- Halogènes : nommés « halogéno » (fluoro, chloro, bromo, iodo).

Quand un substituant est lui-même substitué, on l’écrit entre parenthèses. Le carbone


du substituant qui assure le branchement avec la chaîne principale est obligatoirement
numéroté «1» Structure Nom courant Nom systématique
CH3
1
CH
Isopropyl 1-méthyléthyl
CH3

CH3
1
CH CH2 Isobutyl 2-méthylpropyl
CH3
CH3 1
CH Sec butyl 1-méthylpropyl
H3C CH2
CH3
1
H3C C Tert butyl 1,1-diméthyléthyl
CH3
CH3 1
H3C C CH2 Néopentyl 2,2-diméthylpropyl
CH
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures linéaires (acycliques)

Chaine principale doit :


- le plus grand nombre de liaisons multiples (doubles et triples).
- le plus grand nombre d’atomes de carbone.
- le plus grand nombre de liaisons doubles.
- le nombre maximal de substituants.
- En cas d’égalité, elle doit contenir le premier substituant dans l’ordre alphabétique.

Numérotation :
1. le numéro plus petit doit être attribué aux liaisons multiples
2. le numéro le plus petit doit être attribué aux doubles liaisons
3. Les numéros les plus petits doivent être attribués aux substituants.
4. Le plus petit numéro est attribué au premier substituant dans l’ordre alphabétiqu
3 1
2 2 4
4 3 5
1
1
2
3

2-(2-méthyl propyl) buta-1,3-diène 3-éthynyl penta-1,3-diène


Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures ramifiés linéaire (acyclique)
3 1
2 Br
4
3 5 7
1 6
1 2 4
2 1
3 2

2-(2-méthyl propyl) buta-1,3-diène 3-bromo-5-méthyl-4-(1,1-diméthyl éthyl) heptane


ou ou
2-isobutyl buta-1,3-diène 3-bromo-5-méthyl-4-tertbutyl heptane

2
Br 3 2 3 1
1 1 3 2
4
6 4 1
5 3 4
2 1
2 5 2
1
7 3
6
4-bromo-2.2-diméthyl-3-(1-méthyl éthyl) hexane 5-méthyl 3-(1,2-diméthyl propyl) hept-1-ène 2-(2-méthyl propyl) buta-1,3-diène

Br
2
4
1 3
5

4-bromo-2-méthyl pent-2-ène
Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures cycliques saturés et insaturés

Non : substituant + cyclo radical + terminaison


ane aucun dl et tl
ène dl
diène 2 dl

2 4

1 3

cyclopropane cyclohexane cyclopentane


1
4 4
3 Br
3 5 32
5 2
4
6
2 3-cyclopentyl but-1-ène 23
1
6
1 5 1

2-méthylcyclohex-1,3-diène 3-éthyl cyclopent-1-ène 5-bromo-6-éthènylcyclohex-1,3-diène


Nomenclature en Chimie organique
Hydrocarbures aromatiques

Benzène : ou

Non : substituant + benzène

1,2- o : ortho
1,3- m : méta
1,4- p : para

méthylbenzène éthénylbenzène 1,2-diméthylbenzène


toluène vinylbenzène o-diméthylbenzène
o-xylène

1 2
6
2 1 3

5 3 4
6
4 5

1,4-éthylméthylbenzène 1,2,4-triméthylbenzène 1-éthyl-2,3-diméthylbenzène


p-éthylméthylbenzène
p-éthyltolène
Nomenclature en Chimie organique
Composés fonctionnels
O O O
C C C C O C
OH O C X (X = Cl, Br, I, F) O O

acide ester halogénure d'acide anhydride


(CO2H) (CO2R) (COX) (COOCO)

O O O
C C C C N
H N

aldéhyde amide cétone nitrile


(CHO) (CONH2) (CO) (CN)

C OH C SH C O C C N

alcool Thiol Ether amine


(OH) (SH) (COC) (NH2)
Nomenclature en Chimie organique
Composés fonctionnels

Substituant Chaine carbonée principale Doublet pC/C Fonction principale

par ordre précidé par cyclo en cas de aucun , ane Voir ordre de priorité
alphabétique chaine cyclique C=C , ène des fonctions
C C , yne
Nomenclature en Chimie organique
Détermination de la fonction principale du nom
Fonction Formule Substituant : Fonction principale
Ordre fonction secondaire
priorité
Acide acide …..oïque Chaine acyclique
Carboxylique COOH Carboxy
acide ….. carboxylique Chaine cyclique
Esters …. oate de R Chaine acyclique
COOR R-oxycarbonyl Chaine cyclique
…. carboxylate de R
Halogénures halogénure de ….oyle Chaine acyclique
d’acyles COX halogénoformyl halogénure Chaine cyclique
de….carbonyle
Amides amide Chaine acyclique
CONH2 carbamoyl
carboxamide Chaine cyclique
Nitriles nitrile Chaine acyclique
CN cyano
carbonitrile Chaine cyclique
Aldéhydes Oxo (a) al Chaine acyclique
CHO
Formyl (b) Carbaldéhyde Chaine cyclique
Cétones C=O oxo one
Alcools OH hydroxy ol
Amines NH2 amino amine
Ethers Oxydes R’OR R-oxy oxyde de R et de R’

(a) : le carbone de CHO compté dans la chaine principale


(b) : le carbone de CHO non compté dans la chaine principale
Nomenclature en Chimie organique

Détermination de la Chaine Principale


Dans le cas d’un composé fonctionnel, la chaîne principale est celle qui comporte
par ordre de préférence :

- le plus grand nombre de fonctions principales


- Egalité, le plus grand nombre de liaisons multiples (doubles et triples).
- Egalité, le plus grand nombre d’atomes de carbone.
- Egalité, le plus grand nombre de liaisons doubles.
- Egalité, le plus grand nombre de substituants
- Egalité, possède le substituant de plus petit numéro
- Egalité, possède le premier substituant dans l’ordre alphabétique

Numérotation de la Chaine Principale

* Donner les indices les plus bas aux fonctions principales


* Egalité, donner les indices les plus bas aux liaisons multiples
* Egalité, donner les indices les plus bas aux liaisons doubles
* Egalité, donner les indices les plus bas aux substituants
* Egalité, donner le numéro le plus petit au substituant nommé le premier
par ordre alphabétique
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Acides carboxyliques
OH

Un acide carboxylique est nommé en suffixe :


acide …. oïque. Lorsque la chaine principale est linéaire
acide …. Carboxylique Lorsque la chaine principale est cyclique

CO2H : Fonct Principale acide ….oique


Chaine Pricipale: linéaire

5 3 1 5 3 1
6 CO2H 4 2 CO2H
4 2

acide hexan-1-oique acide pentan-1-oique


(ou acide hexanoique) (ou acide pentanoique)

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Acides carboxyliques
OH

Un acide carboxylique est nommé en suffixe :


acide …. oïque. Lorsque la chaine principale est linéaire
acide …. Carboxylique Lorsque la chaine principale est cyclique

CO2H : Fonct Principale acide … oique


Chaine Pricinpale: linéaire

CH3
5 1
3 CO2H
4 2

acide 3-méthyl pent-4-èn-1-oique

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Acides carboxyliques
OH

2 CO2H : Fonct Principale acide … dioique


Chaine Pricinpale: linéaire

5 3 1 CO2H : Fonct Principale acide …


HO2C 4 2 CO2H Chaine Pricinpale: cyclique carboxylique

CO2H
acide 3-butyl pent-2-ène-1,5-dioique 2
3 1
4 6
5

Acide 3-méthyl cyclohex-2-ène-


1-carboxylique
Chaine Principale comporte
- le plus grand nombre de fonction principale

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
• Choix, plus petit numéro à la liaison multiple
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Amides
NH2

CONH2 prioritaire nommée CONH2 secondaire nommée


Amide (chaine principale est linéaire) carbamoyl
Carboxamide(chaine principale est cyclique)

CONH2 : Fonct Principale amide


Chaine Pricinpale: linéaire

O O
5 3 1 5 3 1
6 4 2 C 4 2
NH2 NH2
hexan-1-amide
3-méthyl pent-4-èn-1-amide
(ou hexanamide)

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Amides
NH2

CO2H : Fonct Principale Chaine Pricinpale: linéaire Acide oique

CONH2 : Fonct secondaire carbamoyl

5 1
6 4
3
CO2H
H2NOC 2

Acide 6-carbamoyl-3-méthyl hex-4-èn-1-oique

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Amides
NH2

2 CO2H : Fonct Principale Chaine Pricinpale: linéaire Acide dioique

CONH2 : Fonct secondaire carbamoyl

CONH2
5 3 1
HO2C CO2H
4 2

Acide 3-carbamoyl pentan-1,5-dioique

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Amides
NH2

CONH2: Fonct Principale Chaine Pricinpale: cyclique carboxamide

5
4
1 CONH2
3 2

4,5-diméthyl cyclopent-1,4-diène-1-carboxamide

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
• Choix, plus petits numéros aux liaisons multiples
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Aldéhyde
H

CHO prioritaire nommée CHO secondaire nommée


al (chaine principale est linéaire) oxo: carbone compté parmi Carbone CP
Carbaldéhyde (chaine principale est cyclique) formyl: carbone con compté parmi C CP

CHO : Fonct Principale al


Chaine Pricinpale: linéaire

O O
5 3 1 5 3 1
6 4 2 C 4 2
H H
hexan-1-al
3-méthyl pent-4-èn-1-al
(ou hexanamide)

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Aldéhyde
H

CO2H : Fonct Principale Chaine Pricinpale: linéaire Acide oique

CHO : Fonct secondaire Carbone compté Oxo

5 1
6 4 CO2H
3
OHC
2

Acide 3-méthyl-6-oxo hex-4-èn-1-oique

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Aldéhyde
H

CO2H : Fonct Principale Chaine Pricinpale: linéaire Acide oique

CHO : Fonct secondaire Carbone non compté formyl

CHO
5 3 1
6 4 2 CO2H

Acide 3-formyl hex-4-ène-1-oique

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale
- Choix, le plus grand nombre de liaisons multiples

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
Nomenclature en Chimie organique O
C
Composés fonctionnels Aldéhyde
H

CHO: Fonct Principale Chaine Pricinpale: cyclique carbaldéhyde

5
4
1 CHO
3 2

4,5-diméthyl cyclopent-1,4-diène-1-carbaldéhyde

Chaine Principale comporte


- le plus grand nombre de fonction principale

Numérotation
• plus petit numéro à la fonction principale
• Choix, plus petits numéros aux liaisons multiples
Composés polyfonctionnels
OH NH2
OH NH2
2 4
2 4 O 1 3 5
1 3 5
H

4-amino-3-méthyl pentan-2-ol 4-amino-2-hydroxy-3-éthyl pentan-1-al

5
Fonction principale
6 4 OH Fonction secondaire
CN
3 O 4 6
2 CO
1 5 2H
2 HO2C
3
1 CO2H

Acide 4-hydroxy-3-oxo hex-5-én-1-oique


Acide 2-cyano-5-phényl hex-3-ène-1,6-dioique

CN
HO CO2H O 3 1
2 HO 4 2 CO2CH3
3 1 5
6
4 6
5 Br
CHO
O
Acide 2-cyano-4-cyclopentyl-6-formyl-3-hydroxy 4-(1-bromo éthyl)-6-hydroxy-5-oxo hexanoate
-5-oxo cyclohex-2-ène-1-carboxylique de méthyle
Représenter une molécule à partir d’un nom

Acide 4-éthyl-6-hydroxy-5-oxo hexanoique


Fonction principale : CO2H
Chaine carbonée : 6 C
alcane : pas de dl et tl
O Substutiant : C2H5 en position 4
3 1
CO2H OH en position 6
HO
5 4 C=O en position 5
6 2

3-amino-2-bromo-4-éthyl-5-hydroxy cycopent-2-ène-1-carbaldéhyde
Fonction principale : CHO
Chaine carbonée : cycle à 5 C
1 double liaison en position 2
Br Substutiant : NH2 en position 3
Br en position 2
H2N C2H5 en position 4
2 OH en position 5
3
1 CHO
4
5
C2H5

OH
Isomérie et Stéréoisomérie

CxHyOzNt plusieurs isomères

On observe deux types d’isomérie :

• Isomérie plane ou de constitution (structurale)


isomères diffèrent par l'ordre ou la nature des liaisons qui relient les atomes
entre eux

• Isomérie stérique ou stéréoisomérie (stéréochimie)


Etude des arrangements dans l’espace des atomes d’une structure donnée
(constitution bien définie)
Isomérie et Stéréoisomérie
Formule Brute
CxHyOzNt

Isomères
dans le plan dans l’espace tridimentionnel

Isomères de constitution Stéréoisomères

Chaine position Isomères de Isomères de


configuration conformation
Fonction

Isomères Isomères
Géométriques optiques
Isomérie de constitution

Isomérie de chaîne : Les isomères de chaîne ont des squelettes carbonés différents.

Formule brute
C4H10

Isomérie de fonction : Les isomères diffèrent par la fonction chimique

Formule brute Propriétés chimiques


C3H6O et physiques différentes

Isomérie de position : Les isomères diffèrent par la position de la fonction chimique

Formule brute
C3H8O
Stéréoisomérie

Etude des arrangements dans l’espace des atomes d’une structure

nécessaire d’utiliser des représentations graphiques qui rendent compte de leur géométrie
structurales
Représentation projective ou de cram (tridimensionnelle)

Conventionnelles

Représentation de Fischer C Représentation de Newmann


projection dans un plan dans
projection selon unleaxe
plan
en arriére du plan
Csp3
en avant du plan
c b a b
d

f c f
a e d e
Stéréoisomérie
Représentation (projection) de Newmann selon l’axe Carbone a-Carbone b

a CH3
b H b CH3a
Cl H
Cl 3 2 2
2 1
1 2 3 Oeil
OH
f H OH C2He5 H
d
c e
C2H5d f c
projective
Newmann
Newmann projective
selon l'axe C2-C3
eclipsée

a f
CH3 a
d f d
H Cl 1
2
1 2 2 Oeil
3
d
HO b
c d H c
C2H5
b
projective
Newmann Newmann
décalée selon l'axe C3-C2
Stéréoisomérie
Représentation de Fischer

CO2H C de plus petit indice


1 CO2H

2C
3 HO H
H ..
OHC
OH Chaine carbonéé
principale
CHO

Projective

Representation de Fischer
1 H
HO2C OH CO2H

.. HO H

NH2 H NH2
H3C
H
CH3
projective

Conditions
Chaine principale dans le plan du même coté
Observateur regarde la molécule du coté opposé du plan de la chaine principale
Stéréoisomérie
Représentation de Fischer

1 H H
1
HO2C OH HO2C CO2H
OH
rotation de 180°
.. HO H
ne change pas la molécule
H2N H H2N H
CH3 H3C
H NH2
CH3
projective projective

Representation de Fischer

1 H 1 H
HO2C CO2H
OH HO2C OH
permutation pair H
.. HO

ne change pas la molécule H2N H


CH3 H
H2N H3C
H NH2 CH3
projective projective
Stéréoisomérie
Isomérie de conformation

conformations d’une molécule : les diverses dispositions des atomes dans l’espace
qui ne diffèrent que par une rotation autour d’une ou plusieurs liaisons σ

Conformères ou rotamères
Représentations de Newmann
Représentations de Cram

d d d
a f ea a
Observ. rotation a 
b e
180° b e
b c f
d c f
c
rotation 60°

a d
e
θ = 0° θ = 60° θ = 120° θ = 180° θ = 240° θ = 300°
b
Conformations privilégiées les f
c plus caractéristiques
Stéréoisomérie
Isomérie de conformation

Représentations de Cram

H3C H H3C CO2H


HO
rotation
180° H H
H
CO2H Br OH
Br

deux isomères de conformations ou conformères

Représentations de Newmann

CH3 CH3
Cl H C2H5 Cl
rotation
120°
H OH H OH
C2H5 H
Stéréoisomérie
Analyse conformationnelle
définir la nature des conformères, d’en déduire les plus stables et donc les plus
abondants (majoritaire)

partiellement décalée partiellement eclipsée totalement décalée


totalement eclipsée

1 1
3 5

2
4 6
partiellement eclipsée partiellement décalée
Stéréoisomérie
Isomérie de conformation

Stabilité interactions

>
décalée eclipsée
plus stable

CH3
H H

H H
C2H5

Anti : plus stable


pas d'interactions
entre CH3 et C2H5
Stéréoisomérie
Isomérie de conformation

Stabilité CH3 CH3


H H H C2H5
<
H H H H
C2H5 H

Anti : plus stable moins stable


pas d'interactions plus d'interactions
entre CH3 et C2H5 entre CH3 et C2H5
Stéréoisomérie
Etude conformationnle du cyclohexane
6 CH2
5 1 H2C CH2
ou représentation plane
4 2
H2C CH2
CH2
3

Plus stable Plus stable


Liaison équatoriale

Liaison équatoriale

Liaison équatoriale
Stéréoisomérie
Etude conformationnle du cyclohexane

Position 1-2 ou 1-4: axiale-axiale (a,a) : Trans


équatoriale-équatoriale (e,e) : Trans
axiale- équatoriale (a,e) : Cis
équatoriale-axiale (e,a) : Cis

Position 1-3 : axiale-axiale (a,a) : Cis


équatoriale-équatoriale (e,e) : Cis
axiale- équatoriale (a,e) : Trans
équatoriale-axiale (e,a) : Trans

5 1
6

4 3 2
Stéréoisomérie
Etude conformationnle du cyclohexane
Conversion

liaisons axiales liaisons équatoriales


liaisons équatoriales liaisons axiales
Stéréoisomérie
Etude conformationnle du cyclohexane
Exemple 1 : 1-Methylcyclohexane
CH3
H
H CH3

5% 95% (la forme équatoriale)

Exemple 2 : 1,2- Diméthylcyclohexane.


CH3 H3C
H
H CH3
Cis CH3

(a,e) (e,a)
Même stabilité
CH3
H
1
H CH3
Trans
CH3

CH3 (e,e)
(a,a)
Interactions diaxiales la conformations
Réplsions de Van der Waals la (+) stable (e,e)

En général, la conformation la plus stable est (e,e)


Stéréoisomérie
Isomérie de configuration
Stéréoisomères configurationnels : les isomères dont le passage de l’un à l’autre,
nécessite la rupture d’une (ou plusieurs) liaison(s) s ou p.

Isomères de
configurations

Isomères Isomères
Géométriques optiques
Concernant les composés Concernant les composés
possédant une double liaison possédant un carbone
(Alcène) asymétrique

Diastéréoisomères Enantiomères Diastéréoisomères


Z ou E

Diastéréoisomères
Cis ou Trans
Stéréoisomérie
Isomérie de configuration

Chiralité : c’est la non superposition d’un objet et de son image par rapport à un
miroir plan. Une molécule est dite chirale (active) si elle n’est pas superposable à
son image/à un miroir plan.
achirale (inactive) dans le cas contraire.

En chimie organique, si un stéréoisomère possède un plan, un axe ou


un centre de symétrie, alors il est achirale.
Carbone asymétrique : Un carbone sp3 est asymétrique s’il possède quatre
substituants différents. Il est noté C*.
Cl
a

a # b # c# d
C*
H3C
c Br
b
H
d
Stéréoisomérie
Eléments de symétrie
Plan
P CH3 CO2H
C2H5
H

C2H5 CH3 CH3


C2H5
H CH3
P

Axe H3C CH3 H3C CH3

H H
H H
P

Centre
H3C H H3C Cl
i H
i
H
H CH3 Cl CH3
Stéréoisomérie
Isomérie optique

Deux molécules (qui contient des C*) qui sont images par rapport à un miroir et
non superposables : ce sont des énantiomères (ou isomères optiques).
Exemple 1 Exemple 2
Image
miroir
CH3 CH3
2 2 H
H Cl Cl
3 3 H
H Cl Cl

CH2CH3 CH2CH3

[α]3 = - [α]4
pouvoir rotatoire pouvoir rotatoire
positif négatif
[α]2 = +12 [α]1 = -12 Molécules chirale (active)

Propriétés physiques et chimiques identiques mais des activités inverses


sur la lumière polarisée (pouvoir rotatoire opposés)

Mélange racémique est un mélange équimolaire (50% + 50%) ou (concentrations


égales) des deux énantiomères [α] = 0 Mélange achiral (inactif)
Stéréoisomérie
Isomérie optique

On appelle diastéréiosomères : deux stéréoisomères qui ne sont pas énantiomères

Exemple Miroir
CHO
CHO

H OH H OH

HO H OH H

H OH OH H
H OH H OH

CH2OH CH2OH
ne sont pas image

D-glucose D-galactose
[α]1 = + 52.7 [α]2 = + 80

- Propriétés physiques et chimiques totalement différentes


- Pouvoirs rotatoires différents
Stéréoisomérie
Importance de la séparation des énantiomères

Le plus souvent, l'action pharmacologique d'un médicament n'est portée que par un
seul des énantiomères. Le second, dans le meilleur des cas se révèle inactif, mais il
peut arriver qu’il ait une activité thérapeutique complètement différente de celle de
l'autre

Molécule inactif biologiquement


Stéréoisomérie
Isomérie optiques: Pouvoir Rotatoire
ou spécifique
Mesuré à l’aide du polarimètre

ℓ = 1 dm
c = concentration en g/ml
Unité du pouvoir spécifique rotatoire en °⋅ml⋅g−1⋅dm−1
Les pouvoirs rotatoires spécifiques sont additifs [α]: pouvoir rotatoire
spécifique
α ou [α] > 0 : la molécule est dextrogyre noté (d) ou (+) α: pouvoir rotatoire

α ou [α] < 0 : la molécule est lévogyre noté (l) ou (-)

Stéréoisomère est optiquement active lorsqu’elle possède un pouvoir rotatoire [𝛼] # 0


Stéréoisomère est optiquement inactive lorsqu’elle possède un pouvoir rotatoire [𝛼] = 0
Stéréoisomérie
Exemples de molécules importantes : Données caractéristiques

Substance active 20
[] D (c = 1, H2O)
SUCRES

Saccharose + 66.45

Fructose - 92.2

D glucose + 52.7

Maltose + 138.5

OH

NH2

2-aminopropanol
25
[] D = + 21.8 (c = 2, EtOH)
Stéréoisomérie
Isomérie optiques : Configuration Absolue
Configuration d’une molécule : la disposition de ses atomes dans l’espace
(sans tenir compte des différentes rotations).
Pour distinguer deux stéréoisomères (énantiomères ou diastéréoisomères) d’un
composé chiral, on détermine la configuration absolue des C* de chaque stéréoisomère.
Cette détermination de la configuration se fait selon la procédure suivante :
1°) On classe les 4 substituants du C* par ordre de priorité décroissant selon les règles
3
de Cahn, Ingold et Prélog 3(CIP) 3 3
permutation
4 4 Oeil 4 4 Oeil
1 2
2°) On2 regarde
1
le pair
C* selon l’axe opposé au substituant
1 classé 4ième.
2
2 1
Le carbone C* étant au premier plan et le 4 ième subst étant dirigé vers l’arrière.

3°) Si pour passer du 1èr substituant


3 au 2ième substituant puis au 3ième, on 3tourne dans
le sens des aiguilles d’une montre, on a la configuration R (Rectus : droite).
Si on tourne dans le sens inverse c’est S (Sinister : gauche).
2 1 1 2

Configuration R Configuration S
Stéréoisomérie
Règles de Cahn, Ingold et Prélog (CIP)

Règle I: La séquence de priorité se fond sur le numéro atomique Z du premier


atome rencontré sur le substituant envisagé . L’atome de numéro atomique
supérieur est alors prioritaire par rapport à celui de numéro atomique inférieur.
C? I > Br > Cl > S > F > O > N > C > H
O C C Z : 53, 35, 17, 16, 9, 8, 7, 6, 1
1 ?
H4

Règle II: Quand les atomes directement liés au carbone asymétrique sont identiques,
on compare les atomes situés au degré d’éloignement immédiatement supérieur
et on applique la règle I. H
H
O
2

C
H
O C C H
1
H4 C O
3 [O]
C est considéeé comme C O
H H
[N]
C N est considéeé comme C [N]
Règle III : Les liaisons multiples sont considérées
[N]
comme autant de liaisons simples
[CH2]
CH CH2 est considéeé comme C [CH2]
H
Stéréoisomérie
Configuration absolue

Configuration d’une molécule (R ou S): la disposition de ses atomes dans l’espace


(sans tenir compte des différentes rotations).
d

Soit une molécule de configuration R a C c

1 2 3 4
Classement des substituants : a>b>c>d

Représentation :
1a 2 permutaions c3
a b puis
4 b c 4
d d
2
b a
= rotation 1
3
c b2

Configuration R Configuration R
Stéréoisomérie
Configuration absolue

Cl

Soit la molécule suivante de configuration R


H C OH

NH2

1 2 3 4
Classement des substituants : Cl > OH > NH2 > H
Z= 35 8 7 1

Représentation :
1 Cl 2 permutaions 3 NH2
Cl OH puis
4 OH NH2 4
H H
2
OH Cl
= rotation 1
2
3
NH2 OH

Configuration R Configuration R
Stéréoisomérie
Détermination de la configuration absolue

Exemple 1 3 Cl Z = 17

1 2 3 4
4 C 2
Z=1 H I > Br > Cl > H
Br
Z = 35
I 1
Z = 53
Configuration S

Exemple 2 1 Cl

1 2 3 4
4 C 2
H
H 1 H
Cl > CH2CH3 > CH3 > H
H CH2CH3
C6 H3C 3
H
Cl C C H
17 6
H Configuration R
H1 C
6
H
H
Stéréoisomérie
Détermination de la configuration absolue

Exemple 3

1 Cl

1 2 3 4
2 C 3
Cl > NH2 > CH3 > H
H2N CH3
H 4

On lit S
Configuration R
H classer 4ème en avant du plan
Stéréoisomérie
Détermination de la configuration absolue

Exemple 4
Cl
1 2 3 4
C 4 Cl > NH2 > CH3 > H
H2N H
H3C

Configuration S

H classer 4ème dans le plan

2 permutaions = rotation 1 Cl

4 C 3
H classer 4ème en arrière du plan
H CH3
H2N 2

Configuration S
Stéréoisomérie
Détermination de la configuration absolue

2
Exemple 3 CO2H
1 2 3 4

4 1 Cl > CO2H> CH3 > H


H Cl

3
CH3

On lit S
Configuration R
H classer 4ème sur horizontale
3
CHO
Exemple 3 1 2 3 4
2 1 Br > NH2> CHO > CH3
H2N Br

4 CH3

On lit R
Configuration R
CH3 classer 4ème sur Verticale
Stéréoisomérie H 1
H H
1ère Cas : Composé avec un seul C* C6
O
O C C O
8 6
H1 O
acide 2-hydroxypropanoïque 8
H

Rep. Cram 1 2 3 4
2 CO2H
OH > CO2H > CH3 > H
4
H
CH3
HO1 3 1 C*

un nombre pair
de permutations 21 = 2 stéréoisomères
conserve (Enantiomères)
la configuration de C*

Rep. Fischer 2
CO2H CO2H

1 4
H OH HO H On lit R
H (4) sur l’horizontale
CH3 3 CH
3

Conf R Conf S
Stéréoisomérie
Exemples de molécules importantes : Données caractéristiques

Antibiotiques même Formule brute

H NH2 Configuration R H2N H Configuration S


C C
C NH H H C NH H H
S O S
HO O CH3 HO CH3
N CH3 N CH3
O O

COOH COOH
Amoxicilline autre activité pharmaceutique

Enantiomères
Stéréoisomérie
2ème Cas : Molécules avec deux C*
1 2 3 4 acide 2,3-dihydroxy-
C2*: OH > CO2H > C3 > H 4-oxo-butanoïque
1 2 3 4
2 C*
C3*: OH > CHO > C2 > H
Miroir Miroir
4 2
H CO2H HO2C H HO CO2H HO2C OH 22 = 4 stéréoisoméres
1
23 2 2 2
HO OH H H
Cram 4H 3 H
3 H 3 H
3 3
HO CHO OHC OH HO CHO OHC
1 OH
2

CO2H CO2H CO2H CO2H


2 2 H 2 OH
H OH HO HO
2 H H
Fischer
3 3 H 3 H
H OH HO H
3 OH HO

CHO CHO CHO CHO E : Enantiomères


D : Diastéréoisomères
CO2H
OHC CO2H OHC
OHC
CO2H CO2H
OHC
3 3
2 3
Newmann 2 2 3
H 2
OH OH
OH HO HO H H
HH HO H H OH
H HO

I (2R, 3S) II (2S, 3R) III (2S, 3S) IV (2R, 3R)

Configuration
Erythro Thréo
relative
Stéréoisomérie
3ème Cas : Molécules avec deux C* présentant un plan de symétrie

2 C*

OHC CH CH CO2H
HO OH 22 = 4 stéréoisoméres

Cas de butane-2,3-diol 2 C*

Symétrie
22 = 4 stéréoisoméres
* *
H3C CH CH CH3
2 3 Symétire
HO OH
3 stéréoisoméres
Stéréoisomérie
3ème Cas : Molécules avec deux C* présentant un plan de symétrie
1 2 3 4

Cas de butane-2,3-diol C2*: OH


1
> C3 > CH3 > H
2 3 4 2 C*
C3*: OH > C2 > CH3 > H
Miroir Miroir
H CH3 H3CH H
CH3
HO CH3 H3C OH 22 = 4 stéréoisoméres
2 2 3 OH 2 2
HO H H
Symétire
HO Symétire
H H H H H
3 3 2 3 3
HO CH3 HHO CH HO CH3 H3C OH
3C CH33
OH
H3C 3 stéréoisoméres
3 CH3 CH 2
1
CH 3
3 3
CH3
a, b et c
4 2 2 H OH
CH3
H OH HOH OH
2 H H OH 2 H H
2 OH
2 3 3 OH HO
H OH HOH H
4 3 OH HO
3 H
1 CH3
H
3 CH3 b (2S,
CH 3 3R)
CH3 CH3

H3C CH3 CH a
H3C 3 H3C CH3 CH3
CH3
3 3 D D
2 3 3
2 2 2 E
OH HO OH c d
OH H H HO
HH HO H
HO H H HOH
E : Enantiomère
a (2S, 3R) b (2R, 3S) c (2R, 3R) d (2S, 3S) D : Diastéréoisomère
a et b sont Identiques Thréo
Méso
Optiquement inactif
pouvoir rotatoire [𝛼] = 0
Stéréoisomérie
Configuration relative Erythro et Thréo

C C

B A B A

B A A B

D D

Erythro Thréo

CHO
CO2H CHO
CO2H
Cas des oses
Exemple
H OH
Cl HO
Cl H
H

H OH
Cl H
H OH
Cl

CH
CH23OH CH
CH23OH
Erythrose
Erythro Thréose
Thréo
D-érythrose D-thréose
D D
Stéréoisomérie
Configuration relative Méso

B A
Symétrie
B A

Méso

CO2H CO2H
Exemple

H Cl Cl H

H Cl Cl H

CO2H CO2H
Stéréoisomérie
Configurations relatives D et L
Cas des oses
CHO
CHO
CHO
H OH
OH à droite HO H OH à gauche
H OH HO H

H OH
CH2OH
Conf. D CH2OH Conf. L H OH
D-glycéraldhéhyde L-glycéraldéhyde
Conf. S CH2OH
Conf. R
Enantiomère D- glucose

Enantiomère Enantiomère
(2S, 3S) (2R, 3R) (2R, 3S) (2S, 3R)
Stéréoisomérie
Configuration relative D et L
Stéréoisomérie
Configurations relatives D et L

Cas des acides aminés ( 2-amino acides) 2 1


C CO2H

NH2

NH2 à droite
NH2 à gauche

Conf. D
Conf. L

Conf. R (2S, 3R)

Remarque : D et L n’ont aucun rapport avec (d : dextrogyre) et (l : lévogyre).

[𝛼] > 0 [𝛼] < 0


Les acides aminés naturels se
retrouvent sous forme d’un seule
énantiomère appartenant
à la série L.
Stéréoisomérie
Isomérie géométrique

A C
C C Alcène avec A # B et C # D
B D

Isomérie Isomérie
Cis et Trans Z et E
Stéréoisomérie
Isomérie géométrique

H H H B
Isomérie cis et trans C C C C
A B A H
Cis Trans

Cis Trans

H H H C2H5

C C C C

CH3 C2H5 CH3 H


Cis Trans
Stéréoisomérie
Isomérie géométrique
A C
C C Alcène avec A # B et C # D
Isomérie Z et E
B D

Classement de (A , B) et (C, D) selon le numéro atomique Z

A >B Si A et D de même coté Diastéréoisomère de Conf. Z


D >C Si A et D de coté ≠ Diastéréoisomère de Conf. E
Z : Zusammen (ensemble)
E : Entgegen (opposé)

CH3 > H et CH2CH2CH3 > CH2CH3

CH3 Cl

Z
H C2H5
Stéréoisomérie
Isomérie géométrique
Cas de plusieurs double liaisons
n doubles liaisons 2n diastéréoisomères
Exemple : CH3-CH=CH-CH=CH-C2H5 hept-2,4-diène

H3C1 H H3C H
2 doubles liaisons 2 3 6 7
C C C C
C2H5 H
H 4 5 H
C C C C
4 diastéréoisomères H H H C2H5
(2E, 4Z) hept-2,4-diène (2E, 4E) hept-2,4-diène
(2 trans, 4 cis) hept-2,4-diène (2 trans, 4 trans) hept-2,4-diène

H H H H
C C C C
C2H5 H
H3C H3C
C C C C
H H H C2H5
(2Z, 4Z) hept-2,4-diène (2Z, 4E) hept-2,4-diène
(2 cis, 4 cis) hept-2,4-diène (2 cis, 4 trans) hept-2,4-diène
Stéréoisomérie
Isomérie géométriques
Cas de plusieurs double liaisons

Exemple : Acide α linolénique

Il possède 3 doubles liaisons : (3 cis, 6 Cis, 9 Cis)

3 6 9

Biologistes Chimistes
ω 3, 6, 9 ∆ 9, 12, 15
Réactions en Chimie Organique

Coupure hétérolytique

A ..- B A + B

B + A

Coupure homolytique

. .
A ..- B A + B
Intermédiaires Réactionnels

C + Y Y électronégatif / C

carbocation
Coupure
hétérolytique
Réactions
ioniques Y électropositif / C
C + Y
carbanion
C .. Y

Coupure . .
homolytique C + Y
Réactions radical
radicalaires
Effets Electroniques

Concernent les déplacements des électrons dans les liaisons

Effet inductif
noté I
Concerne le déplacement des e- des liaisons σ.
Il est due à la polarisation d’une liaison s.
Il est favorisé par l'électronégativité relative des atomes .

Effets
électroniques

Effet Mésomère
noté M
Concerne le déplacement des e- des liaisons π et des doublets
libres n
Il est due à la délocalisation des électrons.
Effets Electroniques
Effet Inductif

Lorsque les 2 atomes sont identiques

liaison est non polarisée

(Moment dipolaire μ = 0)

Lorsque les 2 atomes sont non identiques

liaison est polarisée

Na :Cl

différence d’électronégativité (χ) ↑ Polarité de la liaison ↑

F › O › N = Cl › Br › I = C = S › H › Li › Na
Electronégativité
Effets Electroniques
Effet Inductif

Soit la liaison A-B (avec B plus électronégatif que A).

A est polarisé positivement (électropositif) = électrodonneur


A donneur par effet inductif (noté +I)
B est polarisé négativement (électronégatif) = électroattracteur
B attracteur par effet inductif (noté -I)

Z électronégatif / C
Exemple
+ - C + Z
H3C Cl CH3 +Cl Cl
exemple (- I)
coupure
C Z CH3 donneur par effet inductif (noté +I)
liaison
Cl attracteur
C-Z par effet inductif (notéC-I)
Z électropositif/
C + Z
exemple Na (+ I)
Effets Electroniques
Effet Inductif
groupement isopropyl
+I

halogène
-I

L’effet inductif se transmet au bout de 3 liaisons σ,


au delà de 3 liaisons , il est pratiquement nul.
Effets Electroniques
Effet Inductif

Effet inductif attracteur (- I) Effet inductif donneur (+ I)


Concerne les atomes ou groupes Concerne les atomes ou groupes
d’atomes électronégatifs d’atomes électropositifs

C Y C Z

Halogène : Cl, Br, I, F métaux : Mg, Li , K, Na ….


Hétéroatome : O, S, N, Groupe d’atomes: CH3, CH3CH2,
Groupe d’atomes : OH, OCH3, NH2, SH C(CH3)3
Effets Electroniques
Effet Inductif
Application : Force des acides organiques
O O
R C + H2O R C + H3 O
O-H O

[R-COO ][H3O ]
KH-Cl
a= + H2O ClpKa += H
- log
3O Ka
[R-COOH]

Acidité
[Cl ][H3O ]
R attracteur d’e (-I)Ka =
- départ facile de HpKa = -[H
log K
3O] a Ka
[H-Cl]
pKa

Acidité
R donneur d’e- (+I) départ difficile de H [H3O] Ka
pKa
Effets Electroniques
Effet Mésomère

* s’applique aux liaisons π (double liaison) A C C

* sont dus à la délocalisation des électrons π et des doubles électrons n

* existe dans des systèmes dits conjugués (conjugaison):

A
σCπ C

πσπ : HN=CH-CH=CH2 N exerce un effet mésomère attracteur - M

nσπ : HO-CH=CH2 O exerce un effet mésomère donneur + M


Θ
Θσπ : ΘO-CH=CH O exerce un effet mésomère donneur + M
2
O
σπ : N -CH=CH2 NO2 exerce un effet mésomère attracteur - M
O

Conjugaison Effet Mésomère


Effets Electroniques
Effet Mésomère

A C C

Deux types d'effets mésomères: * Les effets donneurs d'électrons (+ M)


* les effets attracteurs d'électrons (- M).

Effet mésomère Donneur (+ M) Effet mésomère Attracteur (- M)


Concerne les atomes ou groupes Concerne les atomes ou groupes
d’atomes A d’atomes A

Θσπ nσπ πσπ σπ

O- NHR NH2 CHO CN NO2


S- NHCOR OR COR CO2H NO
OH SH CO2R
I Br CONH2
F Cl CONHR

R = alcane = CH3, CH3CH2 ….


Effets Electroniques
Effet Mésomère

O
CH3
Exemple 1
H3C C C C CH3CO exerce un effet attracteur - M
H H CH3CO attracteur par effet mésomère
πσπ
Exemple 2
CH3
H2N C C NH2 exerce un effet donneur + M
CH3 H NH2 donneur par effet mésomère

nσπ

Exemple 3 H
S C C S exerce un effet donneur + M
CH3 H S donneur par effet mésomère

Θσπ
Effets Electroniques
Compétition entre l’effet inductif et l’effet mésomère

Exemple 1 : cas des halogènes (Cl, Br, I et F)


-
Cl CH CH2 Cl CH CH2
Conjugaison n σ π Cl est électronégatif

+M - I (faux)
Mais l’effet mésomère l’emporte toujours sur l’effet inductif

Exemple 2 : cas des hétéroatomes (O, N et S)


-
HO CH CH2 HO CH CH2
Conjugaison n σ π O est électronégatif

+M - I (faux)
Mais l’effet mésomère l’emporte toujours sur l’effet inductif
Effets Electroniques
Effet Mésomère

lorsqu’il y’a conjugaison plusieurs formules électroniques appelées formes


limites ou formes mésomères

πσπ σπ σπ

nσπ Θσπ Θσπ Θσπ


Aromaticité

Règle de Huckel
Une molécule est aromatique si :
- elle est cyclique
- elle est conjuguée
- elle est plane
- elle possède un total de (4m+2) électrons π ou n
(m étant un entier : 1, 2, 3…)

2 e-
2 e-
2 e-
N
CH3
6 e- = 4x1 + 2 10 e- = 4x2 + 2 14 e- = 4x3 + 2 6 e- = 4x1 + 2
Nucléophile symbolisé par Nu

* est un réactif capable de céder un doublet d'électron.

* est un centre à forte densité électronique (chargé négativement)

Exemple OH Cl NH2

Electrophile symbolisé par E

* est un accepteur de doublet d’électron.

* est un centre pauvre en électrons (chargé positivement)

Exemple H Na
Intermédiaires Réactionnels

C + Y Y électronégatif / C

carbocation
Coupure
hétérolytique
Réactions
ioniques Y électropositif / C
C + Y
carbanion
C .. Y

Coupure . .
homolytique C + Y
Réactions radical
radicalaires
Réactions en Chimie Organique

Substitution

C Y + A-B C B + A-Y

Addition
A B
C C + A-B C C

Elimination
A B
C C C C + A-B
Intermédiaires Réactionnels

Coupure
Hétérolytique

C C

Carbocation Carbanion
Obtenu aussi lors
de la protonation d'un alcène

Coupure
Homolytique

C
.
Radical libre
Intermédiaires Réactionnels

CARBOCATION

• Structure plane (C sp2) R2


R1
R3

• Plus les substituants R1, R2 et R3 sont donneurs d’électrons (+I), plus le carbocation
est stabilisé.

• Le carbocation est fortement stabilisé par effet mésomère (+M).


Intermédiaires Réactionnels

RADICAUX

• Structure : Comme les carbocations, ils sont en général plans ce qui correspond
à un carbone sp2.

• Les radicaux ont des filiations de stabilité analogue à celle des carbocations.
Intermédiaires Réactionnels

CARBANION

 Structure pyramidale (C sp3)

R3
R2 R1

• Le carbanion, lorsqu’il est engagé dans un système mésomère acquiert


alors une géométrie plane (C sp2) .

C C C C
O O
Intermédiaires Réactionnels

CARBANION

Essentiellement Stable et Stabilisé par :


• effet inductif attracteur (-I)

• Un effet mésomère attracteur (-M)

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