Chapitre 1 :

Chimie organique Introduction

Marine PEUCHMAUR
Anne universitaire 2010/2011
Universit Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits rservs.
Chimie Chimie Organique
1. Introduction
2. Lhybridation
3. Structures et formules des molcules organiques
1. Introduction
1.1. Bref historique
1.2. Domaines dapplication
1.3. Les objectifs fondamentaux
1.1. Bref historique
Chimie organique :
Substances issues des
tres vivants (animaux et
vgtaux)
Chimie minrale (ou
inorganique) :
Substances issues du monde
minral (terre, eau,
atmosphre)
Premire dfinition

1828 : Friedrich Wlher : Synthse de lure

Composs
organiques
Composs
inorganiques
NH
4
+
NCO

H
N
H
H
H
N
C
O
cyanate dammonium
CO(NH
2
)
2
C
NH
2
O
H
2
N
ure
1.1. Bref historique
Premire dfinition (suite)
1828 : Friedrich Wlher : Synthse de lure
1965 : Robert B. Woodward : Prix Nobel pour ses travaux
de synthse (cortisone)
1987 : Jean-Marie Lehn : Prix Nobel pour la synthse de
molcules cages (cryptands)
Marcelin Berthelot : synthse dun grand nombre
de composs organiques (thylne, benzne)
Dfinition actuelle
Chimie organique : Chimie des composs du carbone dorigine
naturelle ou produits par synthse
Etude des structures des composants des substances organiques naturelles ;
Reproduction par synthse de produits naturels puis synthses de drivs (amlioration proprits)
Synthse de produits totalement nouveaux (matires plastiques, parfums, armes, mdicaments)
O
O
O
HO
H
OH
H H
cortisone
N
O
O
N
O
O
O
O
cryptand [2,2,2]
1.2. Domaines dapplication
Chimie
Organique
Textile
Produits agroalimentaires
Produits cosmtiques
Engrais, pesticides, insecticides
Polymres
Carburants/combustibles
Peintures, vernis, colles
Mdicaments
O
N
3
HO
N
NH
O
O
AZT ou zidovudine
O
O
N
2-cyanoacrylate de mthyle
(super glue)
N
N
N
Cl
N
H
N
H
Atrazine
(herbicide)
Cl Cl
Cl Cl
Cl
DDT
(insecticide)
O
H
N
O
N
H
n
Nylon
O
O O
O
n
Polythylne trphtalate (PET)
(polyester)
N
HN
N
Cl
Chloroquine
N
N
OH
S O O
ONa
S
O
O
ONa
Azorubine ou carmoisine
(E122)
Octane
N
H
O
O
OH NH
2
OCH
3
O
Aspartame
(E951)
O
OH
-tocophrol
(vitamine E)
1.3. Les objectifs fondamentaux
tablir des relations structure proprits des molcules
Comprendre les mcanismes des ractions
Prvision des ractions
Dveloppement de mthodes
pour la synthse de
nouvelles molcules organiques
2. Lhybridation
2.1. Rappels
2.2. Dfinition de lhybridation
2.3. Lhybridation sp
3
2.4. Lhybridation sp
2
2.5. Lhybridation sp
2.6. Tableau rcapitulatif
2.1. Rappels
Reprsentation des OA s et p
Thorie VSEPR
Liaison covalente
par interaction de 2
OA (recouvrement
orbitalaire)
Incompatibilit
z
x
y
z
x
y
z
x
y
OA s
OA p
x
OA p
y
OA p
z
2.1. Rappels (suite)
Exemple : H
2
O
Explication : orbitales hybrides
1
H : 1s
1
H
Les orbitales p
y
et p
z
intervenant dans la formation des liaisons sont
orthogonales daprs la reprsentation des OA donc langle form par
les liaisons (HOH) doit tre de 90.
H
O
H

Thorie VSEPR
2.1. Rappels
Exemple : CH
4
4 liaisons identiques, impossible
expliquer avec les orbitales s et p
Explication : orbitales hybrides
Thorie VSEPR
2.2. Dfinition de lhybridation
Hybridation des orbitales atomiques (OA) = mlange (combinaison linaire) des
OA dun atome appartenant la mme couche lectronique (ns, np) de manire
former de nouvelles orbitales qui permettent de mieux dcrire qualitativement les
liaisons entre atomes.
Il existe 3 types dOA hybrides sp
3
, sp
2
et sp.
Cohrence entre ces nouvelles orbitales et la thorie VSEPR
Source : biomimetic.crihan.fr/coursorga/hybridationcours.ppt
2.3. Lhybridation sp
3
Lhybridation sp
3
rsulte de la combinaison linaire d1 orbitale s avec 3 orbitales p
dun atome (les OA s et p appartenant la mme couche lectronique).
Pour le carbone (CH
4
) :
1 OA de type s + 3 OA de type p
4 OA hybrides sp
3
identiques
Orbitales hybrides
dgnres
4 liaisons CH identiques
Thorie VSEPR : AX
4
, figure de rpulsion ttradrique
6
C : 1s sp
3
6
C : 1s 2s 2p
4 OA
4 OA hybrides
identiques
2.3. Lhybridation sp
3
(suite)
Pour loxygne (H
2
O) :
Thorie VSEPR : AX
2
E
2
, figure de rpulsion ttradrique (molcule coude)
8
O : 1s 2s 2p
8
O : 1s sp
3
4 OA
4 OA hybrides
2.4. Lhybridation sp
2
Lhybridation sp
2
rsulte de la combinaison linaire d1 orbitale s avec 2 orbitales p
dun atome (les OA s et p appartenant la mme couche lectronique).
Pour le carbone (C
2
H
4
) :
1 OA de type s + 3 OA de type p
3 OA hybrides sp
2
identiques + 1 OA de type p
Thorie VSEPR : AX
3
, figure de
rpulsion triangle plan
Liaison double : +
C C
H
H H
H
6
C : 1s sp
2
p
6
C : 1s 2s 2p
3 OA
3 OA hybrides
identiques
1 OA p non
hybride
2.5. Lhybridation sp
Lhybridation sp rsulte de la combinaison linaire d1 orbitale s avec 1 orbitale p dun
atome (les OA s et p appartenant la mme couche lectronique).
Pour le carbone (C
2
H
2
) :
1 OA de type s + 3 OA de type p
2 OA hybrides sp identiques + 2 OA de type p
Thorie VSEPR : AX
2
,
figure de rpulsion linaire
Liaison triple : + +
C C H H
6
C : 1s sp p
6
C : 1s 2s 2p
2 OA
2 OA hybrides
identiques
2 OA p non
hybrides
2.6. Tableau rcapitulatif
Orbitales
hybrides
AX
n
E
m
n+m
Figurede
rpulsion
Anglesdeliaisons
thoriques
Typede
liaisons
Liaison
sp
3
4 Ttradrique 109,5 Simple
sp
2
3
Trigonale
(plane)
120 Double +
sp 2 Linaire 180 Triple ++
Dans le cas du carbone
3. Structures et formules des
molcules organiques
3.1. Ecriture des molcules organiques
3.2. Reprsentation plane des structures spatiales
3.1. Ecriture des molcules organiques
Formule brute
Elle donne la formule de composition de lespce considre, cest--dire les atomes qui la
composent et leur nombre respectif.
Exemples : C
2
H
6
(thane)
C
2
H
6
O (thanol ou mthoxymthane)
Formule dveloppe
Elle fait apparatre toutes les liaisons formant la molcule considre.
Exemples : C
2
H
6
(thane) C
2
H
6
O (thanol ou mthoxymthane)
Formule semi-dveloppe
On ne fait apparatre que les liaisons entre les atomes de carbone et les atomes autres que
lhydrogne.
Exemples : C
2
H
6
(thane) C
2
H
6
O (thanol ou mthoxymthane)
C C H H
H
H
H
H
C C O H
H
H
H
H
H H C
H
H
O C
H
H
H
H
3
C CH
3
H
3
C CH
2
OH H
3
C O CH
3
3.1. Ecriture des molcules organiques (suite)
Formule compacte
On ne fait pas apparatre de liaison, mais on range les atomes par groupes.
Exemples : CH
3
CH
3
(thane)
CH
3
CH
2
OH (thanol) ou CH
3
OCH
3
(mthoxymthane)
Formule topologique
Dans cette reprsentation on omet lcriture des atomes de carbone ou dhydrogne : un
carbone se situe la jonction de deux traits (liaisons).
Exemples : C
2
H
6
(thane) C
2
H
6
O (thanol ou mthoxymthane)
Quelque soit le type dcriture utilis, seul lenchanement des atomes
est spcifi, laspect gomtrique de la molcule napparat pas ici.
OH
O
3.2. Reprsentation plane des structures spatiales
A. Reprsentation conventionnelle de Cram
La reprsentation de Cram permet de spcifier la gomtrie
dune molcule en faisant apparatre les liaisons en perspective.
Trait plein : liaison dans le plan de la
feuille.
Trait gras ou en triangle plein (la pointe
tant du ct de latome dans le plan) :
liaison hors du plan et en avant.
Trait pointill ou triangle hachur (la
pointe tant du ct de latome dans le plan) :
liaison hors du plan et en arrire.
Exemple : Cas du butane
Liaisons dans le
plan de la feuille
Liaison en arrire
Liaison en avant
H
H H
H H
H
H H H H
C
2
H
5
H
3
C
H
H
Pour reprsenter toute la molcule
Pour mettre en vidence un seul
des carbones (ici, le carbone 2)
Remarque : toutes les liaisons lavant sont du mme ct.
3.2. Reprsentation plane des structures spatiales
B. Reprsentation en projection de Newman
La reprsentation en projection de Newman est utilise pour les molcules possdant au
moins 2 atomes de carbone. Elle consiste dessiner ce que lon voit lorsquon regarde la
molcule suivant un axe CC. Cette reprsentation permet de visualiser aisment les effets
dinteractions striques entre des groupements ports par 2 carbones adjacents.
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
Cas de lthane
Projection de Newman
1. On imagine que lon place un disque au milieu de la liaison C-C.
2. On dessine ce que lon voit lorsquon regarde la molcule selon laxe C-C.
Cas du butane
H
H H
H H
H
H H H H
1
2
3
4
Reprsentation de Cram
Reprsentation de Cram Projection de Newman (axe C1-C2)
Projection de Newman (axe C2-C3)
H
H
H
H
C
2
H
5
H
CH
3
H
H
H
CH
3
H
Remarque : il ny a pas une seule projection de Newman pour une
molcule, elle dpend de langle sous laquelle on souhaite la regarder.
H H
H
H
H H
3.2. Reprsentation plane des structures spatiales
B. Reprsentation en projection de Newman (suite)
Cas dun compos possdant une double liaison
Projection de Newman Reprsentation de Cram
H
3
C H
H C
2
H
5
CH
3
H
H
H
5
C
2
Plan orthogonal la diapositive contenant la double liaison
Exercice : reprsenter selon Cram et en projection de Newman les molcules suivantes :
OH
CH
3
CH
2
CHCH
3
H
3
C Cl
CH
3
CH
2
CHCHCH
3
CH
3
CH
2
CH
2
OH
OH
H
H
H
H H H H
H
H H
H H
H
H H H OH
H H
H Cl
H
H H H CH
3
H
H H
OH
H
H
H
CH
3
H
CH
3
H
H
HO
CH
3
H
C
2
H
5
H
3
C
H
H
CH
3
Cl
3.2. Reprsentation plane des structures spatiales
C. La reprsentation de Fischer
Rgles de la reprsentation de Fischer
la chane carbone la plus longue est verticale et en arrire du plan de projection ;
latome de carbone plac en haut de la chane verticale est celui qui est engag
dans le groupement fonctionnel dont ltat doxydation est le plus lev ;
les 2 autres substituants du C situ dans le plan de la feuille sont en avant du plan
de projection.
CHO
HOH
2
C
H
OH
Groupement
le plus oxyd
Chane la
plus longue
H OH
CHO
CH
2
OH
Reprsentation
de Fischer
D-Glycraldhyde
Exemple :
OHC
HOH
2
C
OH
H
H
OH
OH
H
HOH
2
C CHO
H
OH
HO
H
OH
H
H OH
CHO
CH
2
OH
CHO
OH H
OH H
OH H
CH
2
OH
1
2
3
D-Ribose
CQFR
1. Introduction
2. Lhybridation
3. Structures et formules des molcules organiques
Le tableau rcapitulatif
quivalences : orbitales hybrides / figure de rpulsion (VSEPR)
Les diffrentes critures (notamment topologiques)
Les diffrentes reprsentations
Exercices dapplication
1) Dessinez toutes les structures possibles (formules dveloppes et topologiques)
correspondant aux formules : C
5
H
12
et C
4
H
9
Br. (On se souviendra que latome de brome peut remplacer
chacun des atomes dhydrogne dans la formule des composs C
4
H
10
).
2) Donnez la formule brute des composs suivants :
3) Donnez ltat dhybridation (sp
3
, sp
2
ou sp) des atomes points dans la molcule ci-dessous.
OH
OH
Cl
a) b) c)
(commencez
ventuellement par donner
les formules dveloppes
pour bien dcompter les H)
O
OH
O
O
O
HO
NH
O O
O
O
O
HO
O
Paclitaxel (taxol)
Exercices dapplication
4) Parmi les diffrentes reprsentations de Cram ci-dessous, lesquelles correspondent une
reprsentation correcte du compos A (vrifier le positionnement dans lespace des diffrents groupements).
Donnez une reprsentation de Newman possible du compos A et la reprsentation de
Fischer.
5) Soit deux sucres en reprsentation de Fischer, donnez une reprsentation possible de Cram
et une reprsentation possible en projection de Newman (axe C2-C3) du D-rythrose et du
D-throse.
CHO
OH
OH
H
H
CH
2
OH
CHO
H
OH
HO
H
CH
2
OH
D-rythrose D-throse
1
2
3
4
1
2
3
4
Ph
CO
2
H
NH
2
H
Ph
CO
2
H
H
NH
2
Ph
NH
2
H
CO
2
H
H
2
N
H
CO
2
H
Ph
H
2
N
CO
2
H
H
Ph
H
2
N
H
CO
2
H
Ph
Compos A :
Phnylalanine
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