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FACULTE DE MEDECINE
DEPARTEMENT DE MEDECINE
COURS DE 3ème ANNEE MEDECINE
MODULE DE MICROBIOLOGIE
Dr T.DJERBOUA
Pharmacien maitre assistant en microbiologie
LABORATOIRE DE BIOLOGIE MEDICALE
Les Zoonoses représentent un totale de 60% des maladies infectieuses atteignant l’homme
Ces maladies ont un impacte sanitaire et économique important que ce soit a l’échelle humaine,
animale et environnementale
Plusieurs agents de zoonoses constituent des outils idéals pour le bioterrorisme pour plusieurs de leurs
propriétés notamment la virulence et la contagiosité
La santé animale fait partie intégrante de la santé humaine et en représente ainsi un bon indicateur
sur l’interaction de l’homme avec son environnement
Dans cette définition il y’a les notions
METAZOONOSES
ORTHOZOONOSES CYCLOZOONOSES SAPROZOONOSES
PHEROZOONOSES
A) LES ORTHOZOONOSES (Zoonoses directes): Ce sont des zoonoses ou l’entretien de l’agent causal nécessite une seule
espèce de vertébrés (mais en admet plusieurs) qui permet la transmission à l’Homme
Exemples :
Brucellose
Campylobacterioses
Salmonelloses mineures, Colibacillose (EHEC) et Pseudotuberculose
Charbon
Leptospirose
Fievre Q
Tuberculose
Psittacoses
Pasteurellose
Tularémie
Maladie des griffes du chat…
B) LES CYCLOZOONOSES: Le cycle infectieux requiert plusieurs espèces de vertébrés, seules une ou certaines d’entre elles
étant responsable(s) de la contamination humaine Exemple : Echinococcose
C) LES METAZOONOSES (Zoonoses vectorielles) : La transmission entre hôtes réservoirs et/ou hôtes incidents se fait grâce à un
vecteur invertébré dans lequel l’agent zoonotique se modifie ou se multiplie
Ex : Maladie de Lyme , Peste, Rickettsioses, Ehrlichioses, en plus de maladies virales comme les ARBOVIROSES = arthropod
born virus (fièvre jaune, Dengue, Chikungunya, Fièvre West Nile, Zika…)
D) LES SAPROZOONOSES : Ce sont des zoonoses qui nécessitent le passage de l’agent causal dans le milieu extérieur.
Ex : La listériose.
III.Zoonoses et maladies emergentes / reemergentes
A) Maladie émergente: une infection dont l'incidence chez les humains a augmenté au cours des deux dernières décennies ou dont
le risque d'augmentation de l'incidence est vraisemblable dans un futur proche
B) Maladie ré-émergente : Maladie ayant déjà sévi dans le passé dans une région donnée et dont l’incidence réelle augmente de
manière significative
Ces deux concepts sont relatifs a une région donnée, une maladie peut être endémique dans une région et inexistante dans une
autre, le fait qu’elle apparaisse dans la région indemne classe la maladie comme (émergente) dans cette région
Les zoonoses représentent 75% des agents impliqués dans les maladies émergentes et réémergentes.
Ex : Le Chikungunya est une maladie endémique en Afrique , mais a émergé comme menace mondiale depuis les années 2000
III.Zoonoses comme agents de bioterrorisme
DEFINITION: Le bioterrorisme correspond a l’utilisation illégale ou la menace d'utilisation, de micro-organismes ou de toxines
issus d'organismes vivants pour produire la mort ou la maladie chez les humains, les animaux ou les plantes. L’objectif étant de
créer la peur et / ou d'intimider les gouvernements ou les sociétés ou une population donnée sur un plan politiques, religieux ou
idéologique (En bref c’est l’utilisation d’agent biologiques (bacterie , toxine , virus , parasite) dans a des fins terroristes)
Les agents infectieux, en particulier les bactéries et les virus zoonotiques constituent des outils de choix pour le bioterrorisme :
✓ Facilité d’acquisition : internet, collections (ATCC par exemple) ou dans le milieu extérieur.
✓ Facilité et économie de production : la plupart des agents ayant les plus haut taux de mortalité sont relativement faciles a cultiver en masse.
Ex : pour une arme qui causerait 50% de mortalité /Km2, l’anthrax couterait 1dollar / 4 Milliards de Dollars pour une arme nucléaire.
✓ Infectivité : ces bactéries sont hautement infectieuses, d’où un petite quantité qui ce propage rapidement ex : Peste, cholera, Anthrax…
(dépendant aussi du cycle infectieux de la bactérie, la voie de transmission ex : aérienne dans les grandes villes )
✓ Facilité de livraison et inapparence lors de la distribution ( libération des bactéries a distance , de manière prolongée , indétectable.)
✓ Les agents zoonotiques infectent l’homme et l’animal et sont de ce fait a l’origine de dégâts majeurs chez la population
humaine et animale.
III.Zoonoses comme agents de bioterrorisme
Classification des Agents de bioterrorisme:
Critères de catégorisation : basée sur le risque global posé par l’agent infectieux
Agents viraux de catégorie A : agents des fièvres hémorragiques (Arenaviridae : virus lassa et virus machupo , Bunyaviridae : fièvre Crimée-
Congo et fièvre de la vallée du rift , Filoviridae : Ebola et Marburg), Poxviridae : Virus de la VARIOLE
Catégorie B :
Agents viraux de catégorie B : Virus des encéphalites (venezuelian equine encephalitis VEE, Eastern equin encephalitis EEE)
Agents toxiniques de catégorie B : toxine epsilon de C.perfringens, enterotoxine B de S.aureus .
Agents parasitaires de catégorie B : Cryptosporidium parvum.
Agents bactériens de catégorie C : Mycobacterium T MDR et XDR et autre bactéries Multi résistantes.
Agents viraux de catégorie C : HIV , SARS (coronavirus) , Nipah virus , Hentavirus. Certaines lignées de la grippe (H1N1).
G\ BRUCELLA et Brucellose
4.1) INTRODUCTION:
Zoonose mondiale ayant plusieurs appellations : Fièvre de
Malte, fièvre ondulante , Mélitococcie , Maladie de Bang
, due a des bactéries du Genre Brucella , germe
essentiellement retrouvé chez les mammifères
Isolée en 1887 par Bruce chez l’homme a Malte puis en 1895 par Bang
comme l’agent causal de l’avortements contagieux des troupeaux , le lien
zoonotique entre les deux maladies fut établi puis unifié par Evans en 1918
Des formes chroniques peuvent également survenir chez certains patients.. Mary Elizabeth et David Bruce Bernhard Lauritz Frederik Bang
La bactérie Brucella est également reprise dans la liste des agents potentiels
de bioterrorisme.
P\Proteobacteria
C\Alphaproteobacteria
O\ Rhizobiales
F\Brucellaceae
G\Brucella
En terme d’espèces , la classification reste floue et sujet a débat d’une part en raison des divergences phénotypiques et de spectre d’hote , mais
d’autre part la convergence génotypique. A ce titre les outils génétiques ne distinguent qu’une seule espèce :
B. Melitensis
la classification phénotypique classique, basée notamment sur le spectre d’hote et les caractères antigéniques en distingue 12 sous espèces chacune
subdivisée en plusieurs biovars dont :
Brucella melitensis : espèce type, agent isolé des cas de fièvre de Malte , infecte le plus souvent les Ovins et les Caprins
Brucella abortus touche plusieurs animaux de compagnie ou d’élevage (Bovins, Equidés, Chiens…)
Brucella suis notamment chez les porcins
Brucella ovis chez les Ovins préférentiellement
Brucella canis chez les chiens
Brucella neotomae et microti chez les petits mammifères comme les rongeurs
Brucella ceti et pinnipedialis chez les grand mammifères marins et les dauphins
Brucella papionis chez les singes
Brucella vulpis chez les renards
La pathogénicité pour l’homme varie en fonction de l’espèce et du biovar
B) Circonstances de contamination :
-Eleveurs
-Bergers
-Vétérinaires
-Personnel d’abattoir
-Bouchers
-Agriculteurs
-Producteurs de lait et dérivés
-Chasseurs
-personnel de laboratoire de microbiologie
Ceux sont de petits coccobacilles à Gram négatif, non capsulés, non sporulés. Immobiles mais a l'état frais,
ils sont animés de forts mouvements browniens pouvant conduire à détecter une fausse mobilité
Il s’agit d’une bactérie intracellulaire facultative . Elle est sensible a la chaleur, aux désinfectants et
antiseptiques cependant , non dérangée elle survit longtemps dans le milieu extérieur (plusieurs mois)
• Brucella spp est une bactérie FASTIDIEUSE, exigeante ,
4.2) CARACTERES CULTURAUX
nécessitant des milieux enrichis et une longue période
d’incubation
Brucella spp a pour cible principale les phagocytes ainsi que d’autres
cellules du système réticulo-endothélial.
➢ Rarement, la fusion de ces granulomes donne naissance à des lésions à Granulome de Bang
centre caséifié appelées «Brucellome».
➢ Une phase chronique peut s’installer avec la persistance (au-delà d’un an)
de foyers infectieux dans un ou plusieurs organes et/ou systèmes et ce, en
raison de la capacité de ses bactérie a persister et a se multiplier dans les
phagocytes
Brucellome Hépatique
4.3) POUVOIR PATHOGENE : La BRUCELLOSE
Cette maladie se caractérise par son important polymorphisme avec des manifestations cliniques peu spécifiques, surtout au début de la maladie.
Après la phase d’incubation, la Brucellose évolue classiquement en trois phases et la clinique est présentée de façon un peu arbitraire en fonction
de ces phases.
Cette maladie est dans 90% des cas pauci-symptomatique ou
asymptomatique.
➢ A ce stade la maladie peut d’emblée se focaliser, les atteintes les plus fréquentes touches la région sacro-iliaque testiculaire et pulmonaire.
➢ Des formes grave tel que l’endocardite brucelienne peuvent etre observés.
2) LA BRUCELLOSE SUBAIGUE FOCALISEE:
➢ Cette forme est marquée par des localisations septiques secondaires isolées
ou multiples,. Les localisations les plus observés sont :
➢ Localisations ostéo-articulaires+++ :
En l’absence de tout épisode antérieur, immédiatement ou à distance d’une brucellose aiguë ou focalisée.
✓ Touche particulièrement les sujets soumis à des contacts antigéniques répétés (vétérinaires,éleveurs,…)
✓ Expressions cliniques fonctionnelles générale subjective dite « patraquerie brucellienne » : asthénie profonde physique,
psychique, sexuelle, troubles du caractère, douleurs musculaires, névralgiques,articulaires.
DIAGNOSTIC DIAGNOSTIC
DIRECT INDIRECT
RECHERCHE
CULTURE DES
ANTICORPS
BIOLOGIE IDR A LA
MOLECULAIRE MELITINE
(abandonnée)
DIAGNOSTIC
DIRECT
A partir de nombreux prélèvements : hémoculture, LCR, ponctions d’abcès et de liquides des
séreuses , os, moelle osseuse…
CULTURE La culture apporte la preuve formelle de la maladie, en phase aigue la probabilité d’une culture
positive est élevée, elle permet entre autre le typage des isolats bactériens et les tests de
sensibilité aux antibiotiques
L’obstacle principale a cette pratique reste le risque infectieux pour le personnel de laboratoire et
nécessite des postes de sécurité microbiologique type III
Permet a la fois la détection et le typage des isolats directement a partir des prélèvements,
BIOLOGIE intéressante au cours des rechutes après traitement
MOLECULAIRE
-elle est réservés a certains laboratoires..
Plusieurs tests sérologiques sont disponibles pour le diagnostic de la Brucellose.
DIAGNOSTIC
INDIRECT Leurs intérêt est variable selon le stade de la maladie et le type d’anticorps détecté.
Ils sont un outil précieux mais sont limités par les problèmes techniques relatif a la sérologie ainsi
que ceux de sensibilité et de spécificité.
EPREUVE A
L’ANTIGENE
TAMPONNE
RECHERCHE
DES LE SERODIAGNOSTIC
ANTICORPS DE WRIGHT
TESTS TYPE
IMMUNOFLUORESCENCE
INDIRECTE ET ELISA
EPREUVE A
RECHERCHE
DIAGNOSTIC L’ANTIGENE
DES
INDIRECT TAMPONNE
ANTICORPS
EAT
Appelé aussi Card test ou Rose Bengale , il s’agit d’une réaction d’agglutination
simple entre les IgG et une suspension de Brucelles inactivés et colorés au rose
Bengale
L’avantage de ses technique est leur positivité précoce qui reste tout le long de l’évolution de la maladie parfois meme une
« trace sérologique » est retrouvé dans les formes chroniques.
NEG
+
PROFIL DE SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES
Cependant en raison de la nature meme de la bactérie, de sa pathogénie ainsi que des aspects pharmacologiques des
antibiotiques , seuls certains sont utilisables dont :
- Cyclines +++
- Rifampicine +++
- Aminoglycosides
- Cotrimoxazole
- Β-Lactamines
Ces antibiotiques doivent etre actives sur les formes intracellulaires et extracellulaires
Le traitement est sous forme d’associations bactéricides le plus souvent bi-ou tri (ex Doxycycline + Rifampicine +/
aminoside comme la Gentamicine ou la Streptomycine) associée selon le cas a un traitement chirurgical (ex drainage d’abcès,
changement valvulaire…)
La durée du traitement est variable en fonction du stade de la maladie (03 semaines a plusieurs mois)
La maladie peut rechuter, il n’existe pas d’argument formel a la guérison (preuve du temps)
7) PROPHYLAXIE DE LA BRUCELLOSE
La protection de l’homme :
Exposition professionnelle : port de gants et de masques
Eviter la consommation de lait non pasteurisé et ses dérivés frais non pasteurisés.
LESSONS A RETENIR DES ZOONOSES
- Les zoonoses « vivent » et donc changent. La mise en œuvre par l'homme de mesures de lutte adaptées à l'épidémiologie de
chaque zoonose peut en limiter les effets néfastes. Mais le pouvoir d'adaptation de nombreux couples agent pathogène-réservoir
animal se révèle considérable et demeurera un danger permanent, exigeant beaucoup d'efforts et d'investissements pour
l'endiguer
- La recrudescence mondiale est dus en réalité à de très nombreux agents et est la conséquence de divers facteurs parmi les quels :
.Epidémie de SIDA
.Précarité socio-économique
.la mondialisation
- Elle débute sur l’échelon local et repose sur la vigilance du biologiste , vétérinaire et du clinicien (ONE HEALTH)
-Elle nécessite par conséquent une bonne formation et une bonne coordination avec les divers institutions responsable