Bioénergétique

des réactions biochimiques

 Echange d’énergie
Comment l’énergie est-elle utilisée par les organismes vivants ?
Une cellule
 produit
 climatise Toutes ces
 transporte fonctions
nécessitent
 communique
de l’énergie
 détruit

La bioénergétique étudie l’approvisionnement, l’utilisation

et les transferts d’énergie dans la cellule.
 Défin
iniitions

La thermodynamique est l’ensemble des principes décrivant les

flux et les échanges dans les systèmes considérés.

Un système est une partie de l’univers, le reste de l’univers

étant considéré comme l’environnement.

SYSTE
STEM
ME OUVERT
Environnement

Matière Système Echange de matière et/ou d’énergie

énergie
ORGANISMES VIVANTS
 Défin
iniitions

Bioénergétique
Etude de l’approvisionnement, de l’utilisation et du transfert
d’énergie

La cellule

• capte l’énergie du milieu extérieur

• cède une partie de l’énergie sous forme de chaleur
• transforme le reste en mécanisme biochimique
le plus souvent via l’ATP
 Défin
iniitions

Bioénergétique

La biochimie, et particulièrement les réactions

enzymatiques, suivent les lois de la thermodynamique

Ces lois permettent de répondre aux questions suivantes :

- Prédire si une réaction est possible spontanément

- Prédire le sens des réactions biochimiques

1er Principe : Conservation de l’énergie

La quantité totale d’énergie d’un système reste constante

quelque soit les transferts énergétiques réalisés.

L’énergie se transforme mais ne se perd jamais.

 Différe
érenntes formes d’é
’énnerg
ergiie

Energie lumineuse

Les énergies sont interchangeables car rien ne

se crée, rien ne se perd
La contraction musculaire, qui a pour but de produire un
mouvement, nécessite l’hydrolyse de l’ATP

ATP ADP + Pi

Energie

L’énergie chimique (la rupture d’une liaison de l’ATP)

s’est ainsi transformée en énergie mécanique
 Echange d’énergie
Par convention

- Toute énergie reçue par un système est notée positivement

- Toute énergie fournie par un système est notée négativement

Positif Négatif
Système
 Energie interne (U), Enthalpie (H)
Soit une réaction

A B
Etat initial Etat final
U finale – U initiale = ∆U = Q-W
Où Q = quantité de chaleur échangée avec le système
W = travail effectué par le système sur environnement ou inversement

W = P x V où P = pression Dans la cellule => W = 0

V = volume

Au cours réaction, variation d’énergie interne (= variation d’enthalpie)

DU = DH
2nd Principe : Augmentation de l’entropie

ENTROPIE :
Mesure du degré de désordre au sein d’un système

Un système évoluera toujours d’un état ordonné

vers un état moins ordonné

Le second principe régit la spontanéité d’une réaction

 Energie libre (G)
L’énergie libre de Gibbs (G) mesure l’énergie d’un
système qui produit un travail utile dans des conditions de
température constante et de pression constante

G = H-TS
∆G = ∆H-T∆S

A l’équilibre : ∆G = 0

La variation de l’énergie libre de Gibbs (∆G) permet de

prévoir le sens d’une réaction
Soit la réaction suivante :

A B
Si ∆ G < 0
•La réaction est dite exergonique ou spontanée
de
A vers B

Si ∆G > 0

•La réaction est dite endergonique

Si ∆G = 0

•La réaction se fait sans consommation d’énergie

 Réactions Réactions
exergonique
quess endergoniques
Energie libre Energie libre

∆G0’ < 0 ∆G0’ > 0

Libération Consommation
substrats d’énergie substrats d’énergie

produits produits

réaction réaction
La réaction spontanée se fera dans le sens

- d’un plus grand désordre

- d’un niveau d’énergie plus faible

- de la formation de composés plus stables

Energie

Instable
 Etat standard ou Etat de référence

Afin de pouvoir comparer les paramètres thermodynamiques de

différentes réactions biochimiques, un état standard doit
être défini

Température………………………………25°C
Pression…………………………………………1atm
Concentration réactifs …………1M
pH……………………………………………………….7

La variation d’énergie libre standard est alors désignée ∆G0’

 ∆G’0 et Keq
Soit la réaction suivante :

A B

G’A = G’oA + RT Ln[A] R = constantes des gaz parfaits = 8,31 J/mol/K

G’B = G’oB + RT Ln [B] T = Température en Kelvin

DG’ = DG’o + RT Ln [B]/[A]

 ∆G’0 et Keq
• A l’équilibre
A B Pas d’échange d’énergie ∆G’ = 0

Constante d’équilibre de
la réaction (Keq)

Donc ∆G’o = - RT Ln Keq

 Couplage réactionnel

Des réactions thermodynamiquement défavorables

(endergoniques) peuvent être couplées à des réactions
thermodynamiquement favorables (exergoniques)

La somme des ∆G0’ doit être négative

 Couplage réactionnel
Exemple :

1ère éta
étap
pe de la gly
glyccolyse : Glu
luccose -> Glu
luccose 6P

Réaction 1 : Glucose + Pi -> G6P ∆Go’1 = +3 kcal/mol (endergonique)

Réaction 2 : ATP -> ADP + Pi ∆Go’2 = -7 kcal/mol (exergonique)

1 + 2 Glucose + ATP -> G6P + ADP ∆G0’ = -4 kcal/mol

Réa
éac
ction poss
ossiible
 Coupl
uplaage énergétique

Les réactions endergoniques de la synthèse des Macromolécules

sont dépendantes des réactions exergoniques de l’oxydation
de la nourriture.

Ce couplage est effectué par quelques intermédiaires

« riches en énergie » dont l’hydrolyse exergonique est
couplée aux réactions endergoniques.
 Liaisons à haut potentiel énergétique

Liaison dont la rupture libère beaucoup d’énergie et

dont la synthèse consomme beaucoup d’énergie

Liaison Anhydride de l’acide phosphorique

Liaison Thioester
Liaison Enol phosphate
Liaison Amide phosphorique
https://chem.libretexts.org/Bookshelves/Organic_C
hemistry/Supplemental_Modules_%28Organic_Ch
emistry%29/Anhydrides/Properties_of_Anhydrides

https://chem.libretexts.org/Bookshelves/Organic_C
hemistry/Map%3A_Organic_Chemistry_%28Bruice
%29/26%3A_The_Organic_Chemistry_of_Metaboli
c_Pathways/26.03%3A_The_High-Energy_Charac
ter_of_Phosphoanhydride_Bonds
 Adénosine triphosphate (ATP)

L’ATP est la molécule universelle pour transférer l’énergie libre.

Liaison ri
riches
en éne
nerrgie

∆G0’ = -7 kcal/m ol
AMP

ADP

ATP
 Adénosine Triphosphate : ATP

Hydrolyse
L’ATP peut perdre 1 ou 2 liaisons phosphoanhydre

ATP ADP + Pi Perte d’1 ∆G0’ = -7 kcal/mol

ATP AMP + PPi Perte d’2

Chaleur PPi = pyrophosphate inorganique

L’adénylate kinase catalyse la réaction permettant l’interconversion

des 3 nucléotides puriques

ATP+AMP ADP + ADP

Adénylate
kinase
 Interconversion ATP-ADP

Liaisons phosphoanhydride

Adénosine - Pi Pi Pi

ATP
Energie disponible pour
Energie provenant la synthèse chimique
de la lumière
ou des aliments et le travail cellulaire

énergie

Adénosine - Pi Pi
+ Pi
ADP Phosphate
inorganique (Pi)
 Lumière
Nourriture

ATP ADP

Exemples
Energie

Synthèse Energie électrique Chaleur

molécules (nerfs)

Mouvement cellulaire Transport molécules

(ex: contraction contre gradient de
musculaire) concentration

ADP
ADP + Pi
ATP + Pi ATP
 Liaison anhydride de l’ac
’aciide
phosph
sphoorique
1,3 Bis phosphogly
lyccérate

Liaison riche en énergie

∆G0’ = -12 kcal/mol

 Tra
Transfe
ferrt de gro
rou
upe ph
phoosph
phor
ory
y le

Les composés du groupe 1 donnent leur phosphate à l’ADP pour former ATP
Les composés du groupe 2 reçoivent leur phosphate de l’ATP
 Rôle central de l’ATP dans la cellule

Apporte l’énergie nécessaire dans les réactions endergoniques

Est un donneur de groupement phosphate et d’énergie dans

les réactions de phosphorylation
Ex: Reaction 1 de la glycolyse
 Liaison Thioester

Le coenzyme A (CoA) : composé à haute énergie libre

impliqué dans le transfert de groupe acyle

CH3-CO S-CoA Acétyl CoA

R-CO S-CoA Acyle CoA

Ces groupes acyls sont liés au coenzyme A par des liaisons thioester,
liaisons à haut potentiel énergétique (∆G°' = -9 kcal/mol).
 Phosphoénol pyruv
uva
ate (PEP)
PEP est un intermédiaire de la glycolyse

Liaison riche en énergie

∆G0’ = -15 kcal/

l/m
mol
Le PEP se trouve au-dessus de l’ATP dans le tableau du transfert de
phosphate: il peut donc donner son phosphate à l’ADP.

Pyruvate
kinase
PEP Pyruvate
ADP

∆G0’= -15 -(-7) = -15 + 7 = -8 kcal/mol

Le muscle possède 2 niveaux de réserve d’énergie :
l’ATP et la créatine phosphate

La créatine phosphate ayant une énergie proche de celle de l’ATP,

l’échange de phosphate est réversible.

Cré
réa
atine Cré
Cr éatine
phos
ospphate

Energi
Energiee mus
uscculaire
 Réactions d’oxydo
do--réduc
ducttio
ion
n
L’énergie chimique peut être conservée sous forme d’électrons
à potentiel énergétique élevé

Les réactions d’oxydo-réduction sont caractérisées par

le transfert d’un électron d’un donneur d’électrons
vers un accepteur d’électrons

Dans les organismes aérobiques, l’accepteur final des électrons

est O2

Nécessité de transporteurs d’électrons

 Pote
Po ten
ntiel redox
Tension en V mesurée entre le système H+/H2 (électrode de référence)
et un autre système contenant le mélange d’un oxydant et
de son conjugué réduit
 Pote
Po ten
ntiel redox
Soit un couple redox:

a réduit b oxydé + n électrons

Le potentiel redox E’ du couple (a-b) est déterminé par la loi de Nernst

et exprimé en volt :

• n : nombre électrons éc
éch
han
ang
gés
• F :con
consstante de Fara
radday : 9650
6500
0 J.mol-1.V
V-1
 Réactions d’oxydo-réduction

2 couples redox :

Ox1 + Red2 Ox2 + Red1

Différence de potentiel

E = E(ox1/red1) – E (ox2/red2)

Selon la loi de Nernst :

 Réactions d’oxydo-réduction
Au cours d’une réaction d’oxydo-réduction, les électrons quittent le
réducteur le plus fort pour l’oxydant le plus fort de façon spontanée

Si E’01 > E’02,

Le réducteur du couple 2 réduit l’oxydant du couple 1

(ou l’oxydant du couple 1 oxyde le réducteur du couple 2)

La réacti
ctioon se fa
faiit de gau
aucche à droite
Une ré
réaacti
tioon d’oxy
xyddoréducti
éductioon est Thermodynamiquement favorisée
Dans le sens des potentiels re
reddox croissa
san
nts
 La règle du gamma

couples Ox1/Red1 et Ox2/Red2, de potentiel respectif E01et E02

tels que

E01 < E02.

Prévision du sens d'une réaction d'oxydo-réduction

Sens de la réaction
 Pouvoir réduc
uctteur des coenzymes

Leur énergie chimique est contenue dans les électrons qu’elles portent à
l’état réduit

Cette énergie est libérée lors de leur réoxydation

Donneur réduit Accepteur oxydé

n e-
Donneur oxydé Accepteur réduit
 Les transpo
porrteurs d’électrons

Transporteurs H+ et e- : Perte d’hydrogène

Coenzymes nicotiniques (NAD, NADP) et flaviniques (FADH2)

(Nicotinamide adénine dinucléotide)

oxydation
NADH, H+ NAD+ + 2 e- + 2H+

FADH2 (Flavine adénine dinucléotide)

oxydation
FADH2 FAD + 2 e- + 2 H+
 Les transporteurs d’élect
ctrrons

Transporteurs e-

Transporte 1 électron

Fe2+ Fe3+ + 1 e-
Réduit Oxydé

Exemple :
les cytochromes :
* possèdent un noyau hémique contenant un atome de Fer
* transporteurs d’électrons de la chaîne respiratoire
mitochondriale