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BIOENERGETIQUE

Dr A Samba , enseignant chercheur


assistant biochimie et biologie moléculaire FMPO- UCAD,
Md Biochimie et Génie génétique
OBJECTIFS

• 1°) Définir les termes : entropie, enthalpie, énergie libre


standard, potentiel rédox.

• 2°) Déterminer la ∆G°’ des couples impliqués dans une


réaction.

• 3°) Déterminer la ∆E°’ des couples impliqués dans une


réaction.

• 4°) Définir la valeur énergétique du transfert d’électrons.


PLAN
I. Généralités
II. Principes fondamentaux de thermodynamique
II.1. Rappel des lois
II.2. Energie libre
II.3. Energie libre standard
II.4. Potentiel d’oxydo-réduction
II.5. Réaction couplée
II.6. Composés et liaisons riches en énergie
I. GÉNÉRALITÉS
 La bioénergétique est le domaine de la biochimie
qui correspond à l’étude de la transformation et
de l’utilisation de l’énergie par les cellules.

 Formes variées d’énergie : énergie électrique;


énergie mécanique; énergie chimique; énergie
calorique; énergie lumineuse ( Interconversion)
I. GÉNÉRALITÉS
 ENERGIE : Nécessaire au fonctionnement de tout
organisme vivant.

 Radiations solaires = Source primaire directement


utilisée par autotrophes (photosynthèse)

 Les hétérotrophes tirent leur énergie de la


consommation des autotrophes comme aliment.
I. GÉNÉRALITÉS
 Dégradation des aliments en 3 étapes:
– 1ère étape : Dégradations digestives des aliments
donnant des métabolites simples
• Glucides → oses simples
• Lipides → acides gras et glycérol
• Protéines → acides aminés
I. GÉNÉRALITÉS

– 2ème étape : Les métabolites simples subissent des


dégradations spécifiques avec production de petites
quantités d’énergie et formation d’intermédiaires
métaboliques donnant naissance directement ou
indirectement à des intermédiaires du cycle de Krebs.
I. GÉNÉRALITÉS

– 3ème étape : La dégradation des métabolites est


parachevée par le cycle de Krebs et la chaîne
respiratoire mitochondriale. Cela aboutit à la
formation de H2O de CO2 et de l’énergie (souvent stockée
sous forme d’ATP) dont la cellule a besoin.
II. PRINCIPES FONDAMENTAUX DE
THERMODYNAMIQUE
II.1. Rappel des lois
 1ère Loi : L’énergie totale d’un système et de son
milieu extérieur est constante : c’est le principe de la
conservation de l’énergie
 2ème Loi : Toutes les modifications physiques ou
chimiques tendent à s’effectuer dans une direction
telle que l’énergie utile subit une dégradation
irréversible en une forme désordonnée, distribuée au
hasard et appelée ENTROPIE « S ». (correspond au
désordre d'un système. Elle permet de donner un sens à la
réaction et ne peut qu’augmenter. S=0 correspond à un
état parfaitement ordonné)
II.2. Energie libre (∆G)
C’est la fraction énergétique utilisable par

combustion totale. Elle diffère de L’ENTHALPIE

(H) qui est l’énergie totale contenue dans un

composé et libérée sous forme de chaleur si l’on

opère à pression constante.

∆G = ∆H - T∆S
 ∆G = modification d’énergie libre du système
réactant

 ∆H = modification de l’enthalpie

 ∆S = variation de l’entropie

 T = température absolue exprimée en degré Kelvin


II.3. Energie libre standard (∆G°)
Chaque réaction possède une modification énergétique
libre caractéristique appelée énergie libre standard
(dans les conditions standard de température et de
pression). Elle correspond à une variation des
potentiels chimiques standard entre les produits et les
réactifs. Elle est liée à la constante d'équilibre K de la
réaction par la relation :
∆G° = - 2,303 RT log K’ eq

 R = Constante des gaz (1,987 cal/mol)

 K’eq = constante d’équilibre de la réaction

 A pH standard 7,0 l’énergie libre standard est

désignée par ∆G°’


NB: En thermodynamique, l’énergie libre standard
∆G°’
permet de prédire et d'étudier l'évolution d'un système
de réactions chimiques.
La variation de cette grandeur ∆G°’, permet de prédire
le sens dans lequel une réaction chimique se fera.
Ainsi :

 ∆G°’< 0 Réaction EXERGONIQUE


 ∆G°’> 0 Réaction ENDERGONIQUE
 ∆G°’= 0 Equilibre chimique.
II.4. Potentiel d’oxydo-réduction (E°’)
 C’est le potentiel que prend une électrode, dans des
conditions standard (pH 7,0 ; T° 25 °C) lorsqu’elle
est plongée dans une solution du couple
d’oxydoréduction où le rapport (Concentration
forme oxydée / Concentration forme réduite) est
égale à 1. Plus le potentiel est élevé, plus le couple
considéré est oxydant.
 Les réactions d’O.R sont caractérisées par le
transfert d’électrons d’un donneur (RÉDUCTEUR)
vers un accepteur (OXYDANT). Les électrons
passent du système à faible potentiel vers le système
ayant le potentiel le plus élevé .
∆G°’ = - n F∆E°’

n : nombre d’électrons transférés par mole

F : le Faraday = 23 kcal volt-1 (96500 Coulombs)

E°’: Potentiel Standard d’Oxydo-réduction


REMARQUES :

 Pour le transfert de 2 électrons, une variation


d’énergie libre de 10.000 calories correspond à
une d.d.p ( ∆E°’) de ………..

 Une d.d.p de 0,22 volts entre 2 systèmes oxydo-


réducteurs permet la synthèse d’une liaison
phosphate riche en énergie sous forme d’ATP.
Application :
• Transfert de deux électrons du NADH2 à l’oxygène.

• E°’ O2 = 0,82 volts

• E°’ NADH2 = -0,32 volts

• F = 23 Kcal Volt-1

• Synthèse d’un ATP nécessite environ -7,3 Kcal

Combien d’ATP seront synthétisés par ce système ?

Que devient ce nombre si le rendement du système


II.5. Réaction couplée
 Lorsqu’un couple plus réducteur ( potentiel standard bas)
donne des électrons à un autre couple plus oxydant
(potentiel standard élevé), la réaction est exergonique.
 Lorsqu’un couple plus oxydant ( potentiel standard élevé)
donne des électrons à un autre couple plus réducteur
(potentiel standard bas), la réaction est endergonique.
 En enzymologie, ces réactions peuvent être couplées,
l’énergie de la réaction exergonique permettant à la réaction
endergonique de se produire.
II.6. Composés et Liaisons riches en énergie
 Les composés riches en énergie comportent une ou

Plusieurs liaisons facilement hydrolysables et dont

l’hydrolyse s’accompagne d’une très forte diminution

de l’énergie libre (environ -7,3 Kcal/mole).


– Liaisons à faible énergie : < 5 Kcal/mole

– Liaisons riches en énergie : > 5 Kcal/mole

– Liaisons riches en énergie représentées par un tortillon.


PRINCIPALES LIAISONS RICHES EN ENERGIE

TYPE DE EXEMPLE ∆ G°’


LIAISON
Anhydride d’acide GTP - 7,3 Kcal
ATP
ADP
Acyl P Acide 1,3 di P - 10 Kcal
glycérique
Enol phosphate PEP - 14,8 Kcal

Guanidine Créatine P - 10,3 Kcal


phosphate
Thioester Acétyl CoA - 7,5 Kcal
LipoylCoA
II.7. ETAT ÉNERGÉTIQUE
 Réactions énergétiques contrôlées par état énergétique
 Charge énergétique « tamponnée » entre 0,80 et 0,95
 Mesuré grâce à la charge énergétique et au potentiel de
phosphorylation

POTENTIEL DE
CHARGE PHOSPHORYLATION
ÉNERGÉTIQUE

[ATP]
[ATP]+½ [ADP]
[ADP] + [Pi]
[ATP]+[ADP]+[AMP]

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