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ISOMERIE ET

STEREOISOMERIES

1
Introduction

La formule d’une molécule nous renseigne sur le type et le nombre d’atomes


constituants la molécule. Ces atomes peuvent avoir des dispositions
géométriques (arrangement) différentes, on aura alors des molécules
différentes. Ces molécules ont donc des propriétés différentes et ils doivent
avoir des noms différents. On dit qu’il s’agit de structures isomères.

2
Définition

Les isomères sont des espèces chimiques de même formule brute qui diffèrent par :

 L’ordre ou la nature des liaisons (isomérie de constitution ou structurale


ou plane);
 Ou par la disposition des atomes dans l’espace (stéréoisomérie ou isomérie
stérique ).

3
4
I. ISOMÉRIE DE CONSTITUTION (ISOMÉRIE
PLANE OU STRUCTURALE)

Deux molécules qui possèdes la même formule brute mais ont des formules
développées planes différentes. Les isomères ont des propriétés physiques,
chimiques et biologiques différentes. On distingue trois types d’isomérie :

 Isomérie de fonction

 Isomérie de squelette ou de l’enchaînement (chaîne)

 Isomérie de position

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1. Isomérie de squelette ou de l’enchaînement (chaîne)

Des isomères qui différent par leur chaîne carbonée. Ces isomères
sont caractérisés par leurs propriétés chimiques identiques et des
propriétés physiques différentes.
Notons aussi, qu’une isomérie de squelette peut exister entre les
hydrocarbures cycliques et les alcènes aliphatiques (acycliques).

Butane Isobutane
2,3-dimethylbutane 3-methylpentane Teb=-0,5°C Teb=-10°C

F. Brute : C6H14 F. Brute: C4H10


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2. Isomérie de position

Ces isomères ont le même groupement fonctionnel, la même chaine


carbonée mais c’est la position de la fonction sur la chaine carbonée
qui change.
Leurs propriétés chimiques sont généralement voisines, mais leurs
propriétés physiques sont différentes (température d’ébullition,
densité, …).
Exemple :

pentan-3-one pentan-2-one 7
3.Isomérie de fonction

Ils ont des groupements fonctionnels différents. Leurs propriétés


sont complètement différentes. Le seul lien entre eux la formule
brute.

Exemple : C3H6O

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Remarque: Tautomérie

C’est un cas particulier de l’isomérie de fonction. Deux isomères de fonction en


équilibre entre eux . C’est la transformation d’un groupe fonctionnel en un autre par
déplacement (migration) facile et rapide d’un atome d’hydrogène entre deux atomes.

O OH
H2
C C H2C C

H H H
Enol
Aldéhyde

H
HN C C CH3
H H2N C C CH3
H H
H
Imine Enamine

9
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II. STÉRÉOISOMÉRIE

Stéréochimie : C’est l’étude des arrangements dans l’espace des atomes


d’une structure donnée (constitution bien définie).

Stéréoisomères : ce sont des isomères qui ont la même formule développée


plane mais qui diffèrent par l'arrangement spatial (disposition géométrique) de
leurs atomes.

On distingue deux types de stéréoisomèrie:


Isomérie de configuration
Isomérie de conformation

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Représentation des stéréoisomères

Il existe différentes manières de représenter les stéréoisomères dans


l’espace:
1. Projection Cram
2. Projection en perspective

3. Projection de Newman

4. La projection de Fisher

12
1. Projection Cram

Pour représenter une molécule contenant un carbone sp3 dans l’espace on


utilise la représentation projective (ou représentation de Cram).

13
Exemple : 1,2-dichloro-1-iodo-2-bromoéthane
Représentation de Cram ou conventionnelle

Dans le plan
Cl
Cl
Br En avant

En arrière
I
H H 14
2. Projection en perspective

La projection en perspective, appelée aussi projection cavalière, est


identique à la formule développée spatiale (on représente d’une façon différente
les H vers l’avant et vers l’arrière du plan).

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2. Projection de Newman

la molécule est regardée dans l’axe d’une liaison simple C-C entre deux
atomes de carbone voisins. Les liaisons issues des deux atomes sont
projetées sur un plan perpendiculaire à l’axe de la liaison étudiée :

Cl
Cl Cl
Br Cl Br

I I H
H H H
16
Ligne de liaison Projection en perspective Projection de Newman

17
d

18
2. La projection de Fisher

Le chimiste allemand E. Fischer (prix Nobel, 1902) à qui l'on doit notamment
la détermination de la stéréochimie complète du glucose, est le créateur d'un mode
de représentation très utilisé dans la chimie des sucres. Les conventions sont les
suivantes :
 Les traits verticaux représentent les liaisons en arrière du plan de la
figure.
 Les traits horizontaux représentent les liaisons en avant du plan de la
figure
 La chaîne carbonée la plus longue est placée verticalement et
numérotée de haut en bas.

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2. La projection de Fisher(suite)

Exemple de l’alanine : CH3-CH(NH2)-COOH

20
21
22
A. ISOMERIE DE CONFORMATION
Définition
On appelle conformation d’une molécule, les diverses dispositions de ses
atomes dans l’espace qui ne diffèrent que par une rotation autour d’une
plusieurs liaisons σ.

Les isomères de conformation ne sont pas séparables

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Etude des conformations des chaines aliphatiques

Les différentes formes obtenues par rotation autour


d’une liaison σ sont appelées conformères ou
rotamères.

Pour une même molécule, il existe des


conformations privilégiées (plus stables) que
d’autres. Elles correspondent aux plus faibles
valeurs d’énergie potentielle (Ep).
24
Stéréoisomérie de conformation
Cas de l’éthane

 Il y a libre rotation de la
liaison simple C1 – C2. On
note  l’angle de torsion
de cette liaison (angle
rotation autour de la liaison C-C dièdre). Il y a une infinité
de conformère, autant que
d’angle .
On peut tracer l’énergie
de la molécule en fonction
de .
Cela s’appelle une
étude conformationnelle.
décalée éclipsée décalée
25
= 0°

= 60°

26
Cas de l’éthane:
Lors de la rotation autour de l’axe C-C, il y a distorsion des
angles et des longueurs de liaison: la liaison C-C s’affaiblit;
interaction l’énergie potentielle augmente.

Eclipsée énergie de rotation


ou
Conformation éclipsée énergie de torsion

interaction

Conformation décalée
Décalée Décalée
Conformation la plus stable

Barrière de rotation : 12 kJ/mol (2,9 kcal/mol) 27


rotation libre autour des liaisons simples
Cas du butane:

Conformation la
moins stable

Conformation la
plus stable

28
80 % de anti(D)

20 % de gauches (B et F).

29
configuration décalée configuration décalée configuration décalée

configuration éclipsée configuration éclipsée configuration éclipsée

30
Remarque :
Dans certains cas, la conformation décalée gauche est plus stable
que la conformation décalé anti à cause de l’existence de la liaison
Hydrogène intramoléculaire qui stabilise la molécule.

H L.H
OH O
H H H Cl

H H H H
Cl H

Conformation décalée Conformation décalée


anti moins stable que gauche stabilisée par
la décalée gauche l'existance de L.H
intramoléculaire 31
Stéréoisomérie de conformation
H H
H H
Cas du cyclohexane:
H H
H H
H H
H H

32
33
Stéréoisomérie de conformation
Cas du cyclohexane:
Comment dessiner un cyclohexane

34
35
Cas du cyclohexane:
Quelques autres conformations du cyclohexane

 chaise : plus stable, toutes liaisons décalées


 bateau : moins stable, présence de liaisons éclipsées
 les autres conformations sont encore moins stable) 36
Encombrement

Conformation Chaise Conformation Chaise


est Favorisée est Favorisée

37
Cas du cyclohexane:
Interaction entre les deux hydrogènes

Conformation bateau

éclipsés

Projection de Newman Bateau croisé


Tous les atomes d’hydrogène sont éclipsés Les atomes d’hydrogène sont légèrement décalés
(conformation plus stable)
38
Cas du cyclohexane:

H
équatorial H
H H
H
H H
H
axial H H
H H
Conformation chaise

H H

H H
Dans la conformation chaise, tous les
hydrogènes sont en position décalée; cette
H H
conformation est la plus stable.
H H
Projection de Newman
39
Cas du cyclohexane substitué:
Lorsque le cyclohexane est substitué, la forme chaise pour laquelle le
substituant se trouve en position équatoriale est la plus stable.

Interaction 1,3-diaxiale Plus stable de 7,1 kJ/mol (1,7 kcal/mol)

Interaction 1,3-diaxiale

Conformation très défavorisée Conformation la plus stable


40
Cas du cyclohexane:
Lorsque le cyclohexane est polysubstitué, les substituants les
plus volumineux se placent de préférence en position équatoriale.
Pour ces substituants, la variation d’énergie DGº = Gax - Geq (kcal /
mol) entre la position axiale et la position équatoriale est importante:

Groupe DGº(kcal/mol) Groupe DGº(kcal/mol)


Methyle - 1.7 -Cl - 0.4
Ethyle - 1.8 -Br - 0.5
Isopropyle - 2.1 -OH - 0.9
tert-Butyle -5 -OAc - 0.7
Phenyle - 3.1 -NH2 - 1,4
-COOH - 1,4

41
42
B. ISOMERIES DE CONFIGURATION
Définition
Des stéréoisomères de configuration sont des stéréoisomères
dont le passage de l’un à l’autre nécessite la rupture d’une
liaison avec des énergies importantes.

Les isomères de configuration ne sont pas superposables, ce sont des


espèces isolables qui possèdent des propriétés physico, chimiques
différentes.

On distingue deux types de stéréoisomères de configuration :


 ÉNANTIOMÈRES,
 DIASTÉRÉOISOMÈRES. 43
1.Enantiomères

Définition

Deux stéréoisomères de configuration sont énantiomères s’ils


sont images l'un de l'autre dans un miroir et non superposables.

Miroir Miroir

44
Non superposables à leur image dans un miroir

Images Images non


superposables superposables

H H H
H
C C
Br C Br Br F C Br
H H Cl F
Cl Cl Cl
Non
Identiques Identiques

H H F H
C C
C Cl C H Br H Cl F
Br H Cl Br
Cl Br
45
1.1 Chiralité

Un objet est chiral s’il n’est pas superposable à son image.

46
1.1 Chiralité

Un objet est chiral s’il n’est pas superposable à son image.


Une molécule est chirale si elle…
 n’a ni centre, ni plan de symétrie.
contient un seul stéréocentre.
Plan de symétrie Pas de plan de symétrie

Br Br
*
C F C
H Cl Cl
H H
47
1.1 Chiralité (suite)

Un stéréocentre est un carbone (Sp3) qui possède 4


substituants différents et pas de plan de symétrie.

Br H
C* C Br
F Cl H
H Cl
Exemples de carbones qui ne sont pas stéréocentres: CH2, CH3,
C=C, CC, et C=O.
O

OH 48
1.2 Activité optique
Le pouvoir de dévier la lumière polarisée.
Les différents énantiomères d’une substance chirale ont, de façon
individuelle, une activité optique.
Le pouvoir rotatoire est mesuré par un polarimètre.

49
Polarimètre

Viseur pour la
Cellule échantillon Echelle lecture de l’angle
Entrée de la lumière de rotation
non polarisée
monochromatique

Polariseur Manette pour aligner


l’analyseur
50
Pouvoir rotatoire

Pour chacun des 2 énantiomères d'une molécule chirale, on définit un


pouvoir rotatoire spécifique donné par la loi de BIOT :

𝑡
α : angle de rotation optique observée (en degré).
α λ = l : longueur de la cuve contenant la solution (en dm).
𝐼. 𝑐 C : concentration de la solution (en g/ml).
t : température (°C).
l: longueur d’onde de la lumière incidente.

 Rotation vers la droite (sens aiguilles montre) est dit dextrogyre


noté (d) ou (+)
 Rotation vers la gauche (sens inverse d’aiguilles montre ) est dit
lévogyre noté (l) ou (-) 51
Un énantiomère pur a un pouvoir rotatoire.

H 3C CH 3 H 3C CH 3

H 3C CH 3
O O
Pouvoir rotatoire du d- Pouvoir rotatoire du l-
camphre = camphre =
+ 44.26º - 44.26º
Un mélange 50-50 des deux énantiomères (un mélange racémique) a un pouvoir rotatoire de 0º et est
optiquement inactif.

52
Une molécule chirale et son énantiomère ont les mêmes propriétés physiques et
chimiques mais des propriétés biochimiques et une propriété optique différente:

Exemple: Un précurseur de la dopamine, utilisé comme traitement dans la maladie


de Parkinson, existe sous deux formes énantiomères. seul l'énantiomère L-DOPA
a une activité thérapeutique :

53
1.3 Configuration

Arrangement dans l’espace des substituants portés par un


stéréocentre; définie par un ensemble de règles séquentielles
(Cahn-Ingold-Prelog = C.I.P.). Ces configurations sont dites le
plus souvent R (rectus) ou S (sinister).

La configuration adoptée par convention, sur la base d'un


classement par rang de priorité des substituants (règles de
Cahn, Ingold et Prelog), est indépendante du pouvoir rotatoire
mesuré expérimentalement (un énantiomère de configuration S
peut être lévogyre ou dextrogyre et inversement).

54
Règles de Cahn, Ingold Prelog

Règle 1 :
Un atome de numéro atomique (Z) plus élevé a la priorité sur un atome de
numéro atomique plus faible
atome I Br Cl SO3H F OH NH2 CH3 H

Z 53 35 17 16 9 8 7 6 1

CH2OH
Exemple :

Z(O) > Z(N) > Z(C) > Z(H)


H OH
1 2 3 4
NH2
55
Règles de Cahn, Ingold Prelog

Règle 2 :
Quand deux substituants directement liés au centre étudié (substituant de
premier rang) ont même priorité, on examine les atomes qui leur sont liés
(deuxième rang).

56
Règles de Cahn, Ingold Prelog
Règle 3 :

Les liaisons multiples sont considérées comme autant de liaisons simples et


chaque atome engagé dans une liaison multiple sera écrit autant de fois qu’il
porte de liaisons.

57
Détermination de la configuration R/S du carbone
asymétrique):
On classe les substituants selon les règles de préséance de Cahn, Ingold et
Prelog (N° 1>2>3>4)

On regarde la molécule suivant l'axe de la liaison C*(4)

2 2
COOH HOOC
1 1
HO OH
R H4 4H
CH3 H 3C S
3 3

Si la rotation (1) vers (2) vers (3) se fait dans le sens des aiguilles d'une
montre, le carbone asymétrique est dit R ("rectus") 58
Détermination de la configuration R/S du carbone
asymétrique):
On classe les substituants selon les règles de préséance de Cahn, Ingold et
Prelog (N° 1>2>3>4)

On regarde la molécule suivant l'axe de la liaison C*(4)

2 2
COOH HOOC
1 1
HO OH
R H4 4H
CH3 H 3C S
3 3

Si la rotation (1) vers (2) vers (3) se fait dans le sens inverse des aiguilles
d'une montre, le carbone asymétrique est dit S (« sinister") 59
Donner la configuration...

Dans le plan du
tableau

1 a
1
d
4
c
2
b 2 3
3
Derrière le plan devant
du tableau
S

60
Donner la configuration...

Dans le plan du
tableau

1 a 1
d
4
3 c
b 3 2
2
Derrière le plan devant
du tableau
R

61
62
Détermination de la configuration en représentation
de Fischer
CO2H CO2H CO2H

H H OH H OH
HO CH2OH
CH2OH CH2OH

Regard

2
CO2H S, mais 4 (Hydrogène)
4 1
H OH
horizontal, donc R
CH2OH

Aldéhyde R-glycérique

63
Détermination de la configuration en représentation
de Fischer
H H
H

HO 2C OH HO 2C OH
HO 2C
CH2OH
HO CH2OH CH2OH
Regard

4
H
S, 4 (Hydrogène) vertical,
2 HO 2C OH 1
donc S
CH2OH

3 Aldéhyde S-glycérique

64
Donner la configuration.

4
H H
3 1
1
Br C Cl C 2
CH3 SH
HO R
CH3
3 S
2 4

H
3

H3C C 2

1
COOH
H 2N
R 65
2. Diastéréoisomères

Définition
Deux stéréoisomères de configuration qui ne sont ni images ni
superposables. Ils ne possèdent pas les mêmes propriétés
physico-chimiques ; ils peuvent donc être plus facilement
séparés par distillation, recristallisation ou chromatographie.

Il y a deux cas de diastéréoisomérie

 molécules ayant des doubles liaisons

 molécules ayant plusieurs C *

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2.1 Isomérie géométrique des éthyléniques

La présence d'une double liaison C=C (éthylénique), C=N (imine…) ou N=N


(diazonium) empêche la rotation des deux atomes l'un par rapport à l'autre.
Si chacun de ces deux atomes porte 2 groupements différents, il peut exister
deux configurations distinctes appelées stéréoisomères géométriques ou
diastéréoisomères de type Z/E.
classer A et B d'une part, et E et F d'autre part,
par ordre de priorité selon les règles de
A E Cahn-Ingold-Prelog:
- lorsque les deux groupes prioritaires sont du
même côté de la double liaison:
B F
isomère Z (Zuzammen)
- lorsque les deux groupe prioritaires sont de
part et d'autre de la double liaison:
isomère E (Entgegen)
67
Exemple 2-chlorobut-2-ène

1
1 Cl CH3 1 2 H3C CH3

2
H3C H 2 1 Cl H
2

isomère Z isomère E

(Z)-2-chlorobut-2-ène (E)-2-chlorobut-2-ène

68
Cas particulier
si deux substituant sont identiques mais différent par la
configuration absolue, donc R est prioritaire par rapport à S.

H3C H
Exemple :
(1)
HO R OH
(1')

S
H3C (2') OH
(2)
H3C H

cis (Z)
69
2.2 Isomérie cyclanique

Pour un composé cyclique, les substituants peuvent se trouver


d'un même coté du plan moyen du cycle ou de part et d'autre
Si les substituants sont d'un même coté du plan moyen du cycle,
il s'agit de l'isomère cis
Si les substituants sont de part et d'autre du plan moyen du
cycle, c'est l'isomère trans
H3C CH3 H3 C

CH3
Cis Trans
70
Exemples

(Cis ou Z)-1,2-dichlorocyclobutane (trans ou E)-1,2-dichlorocyclobutane

H3C H H3C CH3

H CH3 H H
trans-1,2-diméthylcyclopentane cis-1,2-diméthylcyclopentane
71
Cas de cyclohexane

Dans le cyclohexane chaque atome C possède une liaison


axial et une équatorial dirigées en sens inverse. Cependant,
dans le cyclohexane disubstitué on aura l’isomérie cis/trans.

Si les deux substituant sont en position :


a
(a,a) ; (e,e) même sens Cis (Z)

(a,e) ; (e,a) sens opposé Trans (E)


e
e

a
72
2.3 Isomérie des molécules comportant
plusieurs C*

 Cas de deux carbones asymétriques non identiques


Il existe 2 configurations pour chaque atome de carbone
soit 4 stéréoisomères (2n avec n nombre de C ici égal à 2)

énantiomères
R,R S,S

Diastéréoisomères Diastéréoisomères

R,S S,R
énantiomères 73
Exemple :

74

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