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U. Médéa/ Cours de Chimie Organique 1/ R.

Khalladi Chapitre IV

Chapitre IV

La Stéréochimie

I. Isomérie

Isomérie

Stéréoisomérie Isomérie plane

Isomérie de Isomérie de Isomérie Isomérie

conformation configuration de fonction de position

Isomérie
de chaine
Conformères Enantiomères Diaséréoisomère
sss

On distingue deux types d’isomérie :


 Isomérie plane ou de constitution
 Isomérie stérique ou stéréoisomérie

I.1. Isomérie plane :


Les isomères de constitution ou de structure ont des formules brutes identiques mais
diffèrent par le fait que leurs atomes sont liés d’une manière différente. On distingue
trois types :

I.1.1 Isomérie de fonction


Les isomères ont la même formule brute et renferment des fonctions chimiques
différentes.

Exemple : les isomères qui existes pour la formule moléculaire C3H6O sont trois.

Fonction alcool (propanol) fonction aldehyde (propanal) fonction cétone (propanone)

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Remarque :
Un cas particulier de l’isomérie de fonction est appelé « tautomérie ». Deux tautomères
sont deux isomères de fonction en équilibre entre eux, qui résultent de la transformation
d’un groupe fonctionnel en un autre par déplacement (migration) facile et rapide d’un
atome d’hydrogène entre deux atomes.

Exemple :

I.1.2 Isomérie de position


Dans ce cas, les isomères ont des fonctions chimiques identiques, l’enchaînement des
atomes de carbone est le même, mais la position d’un ou de plusieurs fonctions sur la
chaîne principale est différente.

Exemple : pour la formule C4H10O, on peut avoir les deux structures d’alcools
suivantes.

Alcool primaire (butanol) Alcool secondaire (butan-2-ol)

Remarque :
Dans les composés aromatiques contenant deux substituants portés par deux carbones
(du cycle benzène) différent, on distingue trois isomères de position : ortho, méta et
para.

Exemple : pour l’acide Chlorobenzoïque on a :

ortho méta para

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I.1.3 Isomérie de chaîne


Ici, les isomères ont la même formule brute et renferment les mêmes fonctions
chimiques, mais se diffèrent par un enchaînement différent des atomes de carbone.

Exemple : pour la formule C5H12 on peut avoir une structure linéaire et deux autres
ramifiées.

Pentane 2-méthylpentane 2,2-diméthylpropane

II. Stéréoisomérie ou stéréochimie


La stéréochimie consiste en l’étude des caractéristiques structurales des molécules dans
l’espace (stéréoisomères) et leurs effets sur leurs propriétés physiques et chimiques.
Ainsi, elle traite des molécules dont les atomes sont liés les uns aux autres dans le même
ordre, mais différent par leur disposition dans l’espace.

II.1. C’est quoi un stéréoisomère ?


On appelle stéréoisomères, des isomeres qui ont la même formule developpée plane et
des agencements differents de leurs atomes dans l’espace. On distingue deux types :
 Stéréoisomères de conformation
 Stéréoisomères de configuration

III. Modes de représentation des structures dans l’espace

III.1. Représentation projective ou convention de Cram


C’est la représentation la plus utilisée en chimie organique. Où, les liaisons sont
représentées comme suivant :

liaison dans le plan de la feuille


liaison en avant du plan
liaison en arrière du plan

Dans les composés aliphatiques, selon le nombre d’atomes dans la chaîne principale, on
distingue deux cas:

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 Un atome de carbone : Deux liaisons sont dans le plan de projection, les autres dans un
plan perpendiculaire.
 Plusieurs atomes de carbone: Les liaisons qui unissent les deux carbones extrêmes et
une liaison de chaque carbone sont dans le plan de la feuille (plan de projection), les
autres liaisons dans un plan perpendiculaire.

Exemple :

Méthane éthane hexane

III.2. Représentation en perspective ou cavalière:


Dans le cas de l’éthane et du cyclohexane on a la forme suivante. Elle concerne surtout
les cycles.

III.3. Représentation de Newman


En projection de Newman la structure tétraédrique est projetée sur le plan de la feuille
dans la direction d’une des liaisons C-C. Les carbones de cette liaison sont figurés
respectivement par un point (carbone situé à l’avant) et par un cercle (carbone situé à
l’arrière). Comme exemple on donne la représentation du 1,2-dibromoéthane :

Cram Newman décalée

Cram Newman éclipsée

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Remarque :

La projection selon une double liaison C=C, est aussi réalisable. Ce système étant plan
(sp2) les projections des liaisons de chaque carbone éthylénique forment entre elles un
angle de 180°.

Exemple : le but-2-ène

III.4 Représentation de Fisher (voir V.2.7)


Cette projection est utilisée pour représenter les molécules ayant un, ou plusieurs
carbones liés à des substituants différents, elle sera traitée dans la partie V.

IV. Isomérie de conformation :


Les liaisons chimiques sont relativement souples, elles peuvent se tordre, s'allonger, les
angles peuvent s'ouvrir ou se fermer et les atomes peuvent se toucher ou se gêner. D’où
la notion de conformation.

IV. 1. Définition :
Une conformation est un arrangement possible obtenue par rotation autour d’une liaison
simple σ. Les différentes formes que peut prendre une même molécule sont appelées
conformations.

IV.2. Conformation de la molécule de l’éthane (H3C-CH3)


Faisons tourner d’un angle θ un groupement méthyle par rapport à l’autre, une infinité
de conformations sont possibles.

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 Formes éclipsées : θ = 0°, θ = 120° et θ = 240°


 Formes décalées gauche : θ = 60° , θ = 300°
 Formes décalée anti : θ = 180°

Le diagramme d’énergie potentielle de l’éthane en fonction de l’angle de torsion θ est.

Selon ce diagramme :

 la conformation éclipsée représente l’état énergétique le plus élevé de l’éthane.


 et la conformation décalée (anti) est la plus stable (par ce que les atomes
d’hydrogènes sont les plus éloignés les uns des autres ≡ pas de gêne stérique).

Remarque :

 La différence d’énergie entre la valeur maximale et la valeur minimale d’énergie


potentielle est appelée barrière d’énergie. Elle représente l’énergie d’agitation
thermique pour que les molécules passent d’une conformation à l’autre, à la suite des
chocs intermoléculaires.

 Pour l’éthane monosubstitué par un Cl, OH, N,.., la conformation la plus stable est
celle de la forme décalée gauche (θ = 60°, θ = 300°). Ceci est dû aux forces
d’hydrogène entre le H et ces atomes ayant des doublets libres.

IV.3. Conformation de la molécule de butane


En observant la molécule H3C-CH2-CH2-CH3 selon l’axe Carbone2-Carbone3, on
obtient les conformations suivantes.

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θ = 0° θ = 60° θ = 120° θ = 180° θ = 240° θ = 300°

La conformation décalée anti. C1-C4 (un méthyle en haut et l’autre en bas) pour un
angle de torsion θ=180° est la plus stable.

IV.4. Conformation des chaînes cycliques cas du cyclohexane


A partir de trois carbones, une chaîne peut se fermer sur elle-même et former un cycle.
Nous étudierons les conformations du cyclohexane.

D’après la représentation en perspective du cyclohexane, on constate que les douze


liaisons C-H se divisent en deux types :
 six liaisons axiales, perpendiculaires au plan moyen du cycle (verticales sur le
dessin).
 six liaisons équatoriales, situées approximativement dans le plan moyen du cycle.

Les conformations les plus importantes du cyclohexane sont les formes chaise et bateau.
Notons que, la conformation la plus stable est la forme chaise, avec une différence
d’énergie égale à 6.9 kcal/mol. Ceci est dû à l'encombrement entre les deux hydrogènes
trop proches dans la conformation bateau.

Remarque :

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Lorsque le cyclohexane est substitué, la forme chaise pour laquelle le substituant se


trouve en position équatoriale est la plus stable. En effet, pour les conformations chaise,
toutes les liaisons sont décalées, ce qui est favorable énergiquement. Le cas est différent
pour les autres conformations, telles que des conformations bateau et des conformations
croisées. A température ambiante, l’agitation thermique permet d’obtenir toutes les
conformations.

Exemple :
Les formes les plus stables pour le méthylcyclohexane et le 1,2-diméthylcyclohexane
sont respectivement :

V. Isomérie de configuration

V.1. Configuration :
La configuration d’une molécule est la disposition de ses atomes constitutifs dans
l’espace, sans tenir compte des rotations autour des liaisons simples (les conformations).
Formellement, pour passer d'un stéréoisomère de configuration à un autre, il faut rompre
des liaisons covalentes et les permuter. On distingue deux types d’isoméries de
configuration.
 Isomérie géométrique
 Isomérie optique

V.1.1. Règles de priorité ou règles de CIP

Les règles qui permettent de déterminer l'ordre de priorité des quatre substituants d’un
carbone tétraédrique sont basées sur les règles de Cahn, Ingold et Prelog (Connue par
C.I.P.

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 Règle 1. Les atomes directement liés au C concerné sont classés par numéro
atomique (Z) décroissant : en affectant le numéro 1 au plus lourd et le numéro 4 au
plus léger.

 Règle 2. Si les atomes directement attachés à ce carbone sont les mêmes, il faut voir
les substituants de ces atomes et appliquer la règle 1 (Il faut comparer les atomes
rang par rang et s’arrêter à la 1ère différence).

 Règle 3. Les doubles ou triples liaisons sont décomposées en 2 ou 3 liaisons simples,


en rajoutant des atomes fictifs (fantômes) entre parenthèses.

 Règle 4. Dans le cas de la présence de 2 isotopes, c'est l'isotope le plus lourd (selon
le nombre de masse) qui précède.

Exemple sur R1 :
Br > Cl > F > O > N > C > H.

Exemple sur R2 :

-CH2OH > -CH2-CH3 > -CH3 > H

Exemple sur R3 :

Exemple sur R4 :
3
H (T)> 2H (D)>1H et 14
C > 13C > 12C.

V.2. Isomérie géométrique


Ce type d’isomérie est rencontré dans les composés qui possèdent une double liaison
(C=C, C=N, N=N, ..) ou un cycle. La présence de ces deux insaturations rend la
molécule plus rigide.

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V.2.1. Cas des alcènes


Si les deux carbones éthyléniques portent chacun deux substituants différents, on peut
distinguer deux structures différentes non superposables nommés comme suivant.

 Nomenclature Cis et Trans : Les quatre substituants sont identique deux à deux

 Si les 2 substituants identiques se trouvent du même côté d'un plan défini par la
liaison C=C ; il s’agit de l’isomère " Cis".
 Si les 2 substituants identiques se trouvent de part et d'autre du plan défini par
la liaison C=C ; il s’agit de l’isomère " Trans ".

Exemple : le 1,2-dichloroéthylène présente deux isomères géométriques.

 Nomenclature Z et E : Les deux substituants de chaque carbone sp2 sont classés


entre eux (1er et 2ème) selon les règles CIP.

 Si les deux substituants prioritaires (classés 1ers) sont du même côté par
rapport à la double liaison, l’isomère est dit Z (de l’allemand ‘Zusammen’=
ensemble)

 Si les deux substituants prioritaires (classés 1ers ) ne sont pas du même côté
par rapport à la double liaison, l’isomère est dit E (de l’allemand
‘Entgegen’ = opposé).

Exemple : Selon les règles CIP on a :


Cl > H et Br > CH3 ; CH3 > H et CH2CH2CH3 > CH2CH3

(Z) 2-Bromo-1-chloropropène (E) 3-éthylhex-2-ène

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Remarque :
Les isomères Z et E sont doués de propriétés chimiques et physiques différentes.

Exemple : Température de fusion (TF) de deux diacides qui sont des isomères
géométriques.

V.2.2. Cas des alcènes avec n doubles liaisons


Pour un composé contenant n doubles liaisons, le nombre maximal d’isomères
géométriques est 2n.
Exemple: hepta-2,4-diène CH3-CH=CH-CH=CH-CH2-CH3

n=2 ⇒ il y a au maximum 4 isomères géométriques : (Z,Z) ; (Z,E) ; (E,Z) ; (E,E)

V.2.3. Cas des cycloalcanes


Dans un cycle disubstitué, où les deux substituants identiques sont portés par deux
carbones différents, la rigidité du cycle entraîne l’existence de deux isomères
géométriques.

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 Lorsque les substituants identiques sont du même côté du plan moyen du cycle
l’isomère est dit ‘Cis’.
 Lorsque les substituants identiques sont de part et d’autre du plan moyen du cycle,
l’isomère est dit ‘trans’.

Exemple :

V.2. Isomérie optique

V.2.1. Chiralité
La chiralité (du grec, la main) c’est la non superposition de l’objet et de son image par
rapport à un miroir plan. Aussi une molécule est dite chirale si elle n’est pas
superposable à son image.

Exemples : main gauche et main droite.

V.2.2. Eléments de symétrie et atome asymétrique


Un élément de symétrie dans une molécule peut être un point, un axe ou un plan.

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Un atome asymétrique est un atome lié à quatre substituants différents. Dans ce cours on
se limite à l’atome de carbone asymétrique. Le carbone asymétrique, noté C*, est un
carbone tétraédrique (sp3), dont les 4 substituants sont tous différents.

Une molécule qui contient un C* n’est pas superposable à son image, elle est chirale. On
dit aussi qu’elle forme un couple d’énantiomères.

Exemple : chiralité du propan-2-ol et de l’acide lactique.

Molécule achirale (non chirale) Molécule chirale

V.2.3. Activité optique ou pouvoir rotatoire


Lorsque un faisceau de lumière polarisée1 traverse une cuve contenant un des
énantiomères d’une substance chirale, à la sortie de la cuve on observe une déviation
(rotation) du plan de polarisation de la lumière d’un angle α. On dit alors que la
substance est optiquement active ou douées de pouvoir rotatoire ou encore posséder une
activité optique. Le pouvoir rotatoire se mesure à l’aide d’un polarimètre.

Pouvoir rotatoire : Le pouvoir rotatoire spécifique noté [α]Tλ d’une molécule


optiquement active constitue une constante physique caractéristique de cette molécule,
tout comme son point de fusion, son point d’ébullition … etc. la valeur de [α]Tλ est
donnée par la loi de Biot.

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La lumière polarisée est composée d’ondes qui oscillent dans une seule direction.

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 observé
  
T

l.C

Avec :
[α]Tλ : pouvoir rotatoir (degrés)
αobservé : angle de déviation observé du plan de la lumière (degrés)
C : concentration de la solution (g/mL)
l : épaisseur de la cuve (dm)
T : température du milieu (°C)
λ : longueur d’onde de la lumière polarisée incidente

V.2.4. Nomenclature L et D
Cette appellation est déduite du sens de déviation du plan de la lumière. Si l’angle
αobservé est conventionnellement positif (déviation du plan vers la droite), la substance est
dite « dextrogyre » notée D (du latin dextro: droite) ou bien (+). Et, s’il est négatif
(déviation vers la gauche), la substance est dite « lévogyre » L (du latin laevus: gauche)
ou bien (-). Cette nomenclature est largement utilisée en biochimie pour les sucres et les
aminoacides.
Pour une molécule chirale ayant deux énantiomères, l’un des deux énantiomères va
dévier la lumière polarisée dans un sens, tandis que l’autre énantiomère va la dévier en
sens contraire avec le même α. Ainsi les énantiomères sont dites isomères optiques ou
inverses optiques (ou antipodes).

Exemple : Pouvoir optique des énantiomères du 2-bromobutane.

Remarque :
Un mélange équimolaire de deux énantiomères est appelé ‘racémique’, ce mélange a un
pouvoir rotatoire nul. Le racémique est optiquement inactif, il est noté (±).La séparation
des deux énantiomères qui composent un racémique est appelée dédoublement ou
résolution.

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V.2.5. Importance de l’énantiomérie


La plupart des énantiomères possèdent des propriétés physicochimiques identiques, à
l'exception de leur pouvoir rotatoire. En effet, ces stéréoisomères présentent des
propriétés chimiques identiques vis-à-vis d'un réactif non chiral. Cependant, vis-à-vis
d'un récepteur2 chiral, leur réactivité peut être très différente. Ce comportement lié à la
notion de pouvoir rotatoire, montre clairement que deux énantiomères peuvent avoir des
propriétés biologiques et pharmaceutiques différentes, voir même, opposés.

En biologie, pour qu'une molécule ait un effet, elle doit interagir avec un site récepteur
particulier dans l’organisme (membranes, enzymes…). Les systèmes biologiques
récepteurs sont constitués de molécules chirales (protéines, glucides, acides
nucléiques…), ils interagissent différemment avec les deux énantiomères d'une molécule
chirale. C’est le principe clef-serrure, la molécule étant la clef et le récepteur est la
serrure.

Exemple :
 Un précurseur de la dopamine, utilisé comme traitement dans la maladie de
Parkinson, existe sous deux formes énantiomères. Seul l'énantiomère L-DOPA a une
activité thérapeutique.

Reconnaissance biologique

 La thalidomide a été prescrite sous forme racémique dans la fin des années 1950
comme anti-nauséeux pour les femmes enceintes. Il est apparu rapidement que
l’énantiomère R de ce médicament était tératogène, et conduisait aussi à la mort du

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Récepteur : les systèmes biologiques récepteurs

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fœtus. Depuis, il est obligatoire pour les laboratoires pharmaceutiques de tester tous
les stéréoisomères pouvant être générés par le médicament originel.

Thalidomide tératogène Thalidomide non toxique

V.2.6. Configuration absolue


Dans une molécule chirale, la disposition spatiale des 4 substituants du C* est appelée
configuration absolue. La distinction entre les différents énantiomères se fait par une
nomenclature spécifique basée sur les règles C.I.P. La configuration absolue d’une
molécule possédant un seul C* est déterminée selon la procédure suivante :

a) On classe les substituants du C* de 1 à 4 selon les règles CIP.


b) On place le substituant de priorité 4 derrière le C*, et on regarde la disposition
des autres.
c) Si la séquence 1-2-3 va dans le sens des aiguilles d’une montre la configuration
de l’atome de carbone est désignée par le symbole R (du latin rectus, droit). Dans
le cas contraire la configuration absolue est notée S (du latin sinister, gauche).

Exemple :

2-chloropropanol. Acide 2-bromo-2-chloroéthanoïque

Remarque :
Aucune relation n’existe entre la configuration absolue (R et S) et la nomenclature (D et
L).

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V.2.7. Projection de Fisher


Dans cette projection, les liaisons sont représentées par des traits pleins verticaux et
horizontaux, comme suivant :
a) La chaîne carbonée la plus longue est placée verticalement et numérotée de haut en
bas. Le substituant de faible indice de position est placé en haut
b) placer le carbone asymétrique au centre, et projeter les quatre liaisons issues de
l’atome C* sur le plan du papier
c) Les traits verticaux représentent les liaisons en arrière du plan de la figure.
d) Les traits horizontaux représentent les liaisons en avant du plan de la figure

Exemple:
Molécule de 2,3-dihydroxypropanal.

On peut déduire directement la configuration absolue d’un stéréoisomère à partir de la


projection de Fisher comme suivant :

 Si le substituant de priorité 4 est placé verticalement, le sens lu pour la séquence 1-


2-3 donnera la configuration absolue.
 Si le substituant de priorité 4 est placé horizontalement, la configuration absolue
sera l’inverse du sens donné par la séquence 1-2-3.

Exemple :

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V.2.8. Stéréoisomères avec plusieurs carbones asymétriques

Lorsqu’une molécule présente n carbones asymétriques substitués différemment, on peut


avoir 2n stéréoisomères, répartis en des couples d’énantiomères et couples de
diastéréoisomères. Pour n=2, on aura 4 stéréoisomères :

E : Enantiomère
D : Diastéréoisomère

Diastéréoisomères : Ce sont des stéréoisomères de configuration qui ne sont pas image


l'un de l'autre dans un miroir. Contrairement aux énantiomères, les diastéréoisomères ne
possèdent pas les mêmes propriétés physico-chimiques ; ils peuvent donc être plus
facilement séparés par distillation, recristallisation ou chromatographie….

Exemple :

L’écriture (2R, 3S) veut dire : configuration R pour le C* situé en position 2, et


configuration S pour le C* situé en position 3.

 Les formes (I, II) et (III, IV) sont 2 couples d’énantiomères.


 Les formes (I, III) ; (I, IV) ; (II, III) ; (II, IV) sont des couples de diastéréoisomères.

Remarques importantes :
 Une molécule contenant un atome asymétrique et un seul est nécessairement chirale.
 Une molécule contenant plusieurs atomes asymétriques, n’est pas forcément chirale.
Comme le montre l’exemple ci-après.

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Exemple:

On remarque que la forme I est superposable sur la forme II, par simple rotation de
180°. Donc, ils sont identiques et ils représentent une seule molécule qui est achirale et
optiquement inactive. Ceci, est dû à la présence d’un plan de symétrie (plan
horizontale). La forme I (ou II) est appelée forme méso.

Donc : Il y a au total 3 stéréoisomères I, III et IV.


 Une forme méso (I, II).
 Un couple énantiomères (III et IV)
 Deux couples diastéréoisomères (I, III) et (I, IV)

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