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Khalladi Chapitre IV
Chapitre IV
La Stéréochimie
I. Isomérie
Isomérie
Isomérie
de chaine
Conformères Enantiomères Diaséréoisomère
sss
Exemple : les isomères qui existes pour la formule moléculaire C3H6O sont trois.
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Remarque :
Un cas particulier de l’isomérie de fonction est appelé « tautomérie ». Deux tautomères
sont deux isomères de fonction en équilibre entre eux, qui résultent de la transformation
d’un groupe fonctionnel en un autre par déplacement (migration) facile et rapide d’un
atome d’hydrogène entre deux atomes.
Exemple :
Exemple : pour la formule C4H10O, on peut avoir les deux structures d’alcools
suivantes.
Remarque :
Dans les composés aromatiques contenant deux substituants portés par deux carbones
(du cycle benzène) différent, on distingue trois isomères de position : ortho, méta et
para.
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Exemple : pour la formule C5H12 on peut avoir une structure linéaire et deux autres
ramifiées.
Dans les composés aliphatiques, selon le nombre d’atomes dans la chaîne principale, on
distingue deux cas:
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Un atome de carbone : Deux liaisons sont dans le plan de projection, les autres dans un
plan perpendiculaire.
Plusieurs atomes de carbone: Les liaisons qui unissent les deux carbones extrêmes et
une liaison de chaque carbone sont dans le plan de la feuille (plan de projection), les
autres liaisons dans un plan perpendiculaire.
Exemple :
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Remarque :
La projection selon une double liaison C=C, est aussi réalisable. Ce système étant plan
(sp2) les projections des liaisons de chaque carbone éthylénique forment entre elles un
angle de 180°.
Exemple : le but-2-ène
IV. 1. Définition :
Une conformation est un arrangement possible obtenue par rotation autour d’une liaison
simple σ. Les différentes formes que peut prendre une même molécule sont appelées
conformations.
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Selon ce diagramme :
Remarque :
Pour l’éthane monosubstitué par un Cl, OH, N,.., la conformation la plus stable est
celle de la forme décalée gauche (θ = 60°, θ = 300°). Ceci est dû aux forces
d’hydrogène entre le H et ces atomes ayant des doublets libres.
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La conformation décalée anti. C1-C4 (un méthyle en haut et l’autre en bas) pour un
angle de torsion θ=180° est la plus stable.
Les conformations les plus importantes du cyclohexane sont les formes chaise et bateau.
Notons que, la conformation la plus stable est la forme chaise, avec une différence
d’énergie égale à 6.9 kcal/mol. Ceci est dû à l'encombrement entre les deux hydrogènes
trop proches dans la conformation bateau.
Remarque :
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Exemple :
Les formes les plus stables pour le méthylcyclohexane et le 1,2-diméthylcyclohexane
sont respectivement :
V. Isomérie de configuration
V.1. Configuration :
La configuration d’une molécule est la disposition de ses atomes constitutifs dans
l’espace, sans tenir compte des rotations autour des liaisons simples (les conformations).
Formellement, pour passer d'un stéréoisomère de configuration à un autre, il faut rompre
des liaisons covalentes et les permuter. On distingue deux types d’isoméries de
configuration.
Isomérie géométrique
Isomérie optique
Les règles qui permettent de déterminer l'ordre de priorité des quatre substituants d’un
carbone tétraédrique sont basées sur les règles de Cahn, Ingold et Prelog (Connue par
C.I.P.
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Règle 1. Les atomes directement liés au C concerné sont classés par numéro
atomique (Z) décroissant : en affectant le numéro 1 au plus lourd et le numéro 4 au
plus léger.
Règle 2. Si les atomes directement attachés à ce carbone sont les mêmes, il faut voir
les substituants de ces atomes et appliquer la règle 1 (Il faut comparer les atomes
rang par rang et s’arrêter à la 1ère différence).
Règle 4. Dans le cas de la présence de 2 isotopes, c'est l'isotope le plus lourd (selon
le nombre de masse) qui précède.
Exemple sur R1 :
Br > Cl > F > O > N > C > H.
Exemple sur R2 :
Exemple sur R3 :
Exemple sur R4 :
3
H (T)> 2H (D)>1H et 14
C > 13C > 12C.
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Nomenclature Cis et Trans : Les quatre substituants sont identique deux à deux
Si les 2 substituants identiques se trouvent du même côté d'un plan défini par la
liaison C=C ; il s’agit de l’isomère " Cis".
Si les 2 substituants identiques se trouvent de part et d'autre du plan défini par
la liaison C=C ; il s’agit de l’isomère " Trans ".
Si les deux substituants prioritaires (classés 1ers) sont du même côté par
rapport à la double liaison, l’isomère est dit Z (de l’allemand ‘Zusammen’=
ensemble)
Si les deux substituants prioritaires (classés 1ers ) ne sont pas du même côté
par rapport à la double liaison, l’isomère est dit E (de l’allemand
‘Entgegen’ = opposé).
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Remarque :
Les isomères Z et E sont doués de propriétés chimiques et physiques différentes.
Exemple : Température de fusion (TF) de deux diacides qui sont des isomères
géométriques.
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Lorsque les substituants identiques sont du même côté du plan moyen du cycle
l’isomère est dit ‘Cis’.
Lorsque les substituants identiques sont de part et d’autre du plan moyen du cycle,
l’isomère est dit ‘trans’.
Exemple :
V.2.1. Chiralité
La chiralité (du grec, la main) c’est la non superposition de l’objet et de son image par
rapport à un miroir plan. Aussi une molécule est dite chirale si elle n’est pas
superposable à son image.
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Un atome asymétrique est un atome lié à quatre substituants différents. Dans ce cours on
se limite à l’atome de carbone asymétrique. Le carbone asymétrique, noté C*, est un
carbone tétraédrique (sp3), dont les 4 substituants sont tous différents.
Une molécule qui contient un C* n’est pas superposable à son image, elle est chirale. On
dit aussi qu’elle forme un couple d’énantiomères.
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La lumière polarisée est composée d’ondes qui oscillent dans une seule direction.
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observé
T
l.C
Avec :
[α]Tλ : pouvoir rotatoir (degrés)
αobservé : angle de déviation observé du plan de la lumière (degrés)
C : concentration de la solution (g/mL)
l : épaisseur de la cuve (dm)
T : température du milieu (°C)
λ : longueur d’onde de la lumière polarisée incidente
V.2.4. Nomenclature L et D
Cette appellation est déduite du sens de déviation du plan de la lumière. Si l’angle
αobservé est conventionnellement positif (déviation du plan vers la droite), la substance est
dite « dextrogyre » notée D (du latin dextro: droite) ou bien (+). Et, s’il est négatif
(déviation vers la gauche), la substance est dite « lévogyre » L (du latin laevus: gauche)
ou bien (-). Cette nomenclature est largement utilisée en biochimie pour les sucres et les
aminoacides.
Pour une molécule chirale ayant deux énantiomères, l’un des deux énantiomères va
dévier la lumière polarisée dans un sens, tandis que l’autre énantiomère va la dévier en
sens contraire avec le même α. Ainsi les énantiomères sont dites isomères optiques ou
inverses optiques (ou antipodes).
Remarque :
Un mélange équimolaire de deux énantiomères est appelé ‘racémique’, ce mélange a un
pouvoir rotatoire nul. Le racémique est optiquement inactif, il est noté (±).La séparation
des deux énantiomères qui composent un racémique est appelée dédoublement ou
résolution.
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En biologie, pour qu'une molécule ait un effet, elle doit interagir avec un site récepteur
particulier dans l’organisme (membranes, enzymes…). Les systèmes biologiques
récepteurs sont constitués de molécules chirales (protéines, glucides, acides
nucléiques…), ils interagissent différemment avec les deux énantiomères d'une molécule
chirale. C’est le principe clef-serrure, la molécule étant la clef et le récepteur est la
serrure.
Exemple :
Un précurseur de la dopamine, utilisé comme traitement dans la maladie de
Parkinson, existe sous deux formes énantiomères. Seul l'énantiomère L-DOPA a une
activité thérapeutique.
Reconnaissance biologique
La thalidomide a été prescrite sous forme racémique dans la fin des années 1950
comme anti-nauséeux pour les femmes enceintes. Il est apparu rapidement que
l’énantiomère R de ce médicament était tératogène, et conduisait aussi à la mort du
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Récepteur : les systèmes biologiques récepteurs
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fœtus. Depuis, il est obligatoire pour les laboratoires pharmaceutiques de tester tous
les stéréoisomères pouvant être générés par le médicament originel.
Exemple :
Remarque :
Aucune relation n’existe entre la configuration absolue (R et S) et la nomenclature (D et
L).
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Exemple:
Molécule de 2,3-dihydroxypropanal.
Exemple :
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E : Enantiomère
D : Diastéréoisomère
Exemple :
Remarques importantes :
Une molécule contenant un atome asymétrique et un seul est nécessairement chirale.
Une molécule contenant plusieurs atomes asymétriques, n’est pas forcément chirale.
Comme le montre l’exemple ci-après.
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Exemple:
On remarque que la forme I est superposable sur la forme II, par simple rotation de
180°. Donc, ils sont identiques et ils représentent une seule molécule qui est achirale et
optiquement inactive. Ceci, est dû à la présence d’un plan de symétrie (plan
horizontale). La forme I (ou II) est appelée forme méso.
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