TP actine myosine

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Ouvrir dans la banque de données la molécule myosine 1
Le site de fixation de la tête de myosine correspond aux acides aminées 530 à 550 de la chaîne lourde
de la myosine. Faites apparaître ce site en couleur et en mode « sphère »
Visualisez et identifiez les autres atomes/molécules présents et qui ne correspondent pas à la
myosine.

Ouvrir deux autres fenêtre libmol

Ouvrir à partir l’ENT le fichier pdb proposé. On y visualise deux molécules de myosine dans deux états
différents.
Ne faites apparaître que les myosines
Vous allez devoir montrer que la tête de myosine fait un angle avec le reste de la molécule et que cet
angle varie au cours du cycle

Visualiser les molécules en mode « squelette »

Colorez les chaînes constitutives de la molécules
Faites apparaître le site de fixation de myosine sur l’actine en couleur et en mode « sphère »

Pour comparer l’angle que fait la tête de myosine avec le reste de la chaîne on va utiliser un acide
aminé présent dans le site de fixation à l’actine (le 45 par exemple) et deux autres acides aminés aux
extrémités des chaînes lourdes (le 531 et le 909)

Mesurez l’angle constitué par ces trois acides aminés dans les deux situations
Rendez compte de votre travail dans un document adapté à la problématique