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Fondement de biologie: lexique

Michel Elisa
Huskens Chloé
2020-2021
Chap 1
Virus: → parasite moléculaire, considéré comme non-vivant et constitué d’ADN
→ acide nucléique devenu infectieux
→ moteur de l’évolution
/!\ ce n’est pas une cellule
Reproduction conforme: clonage
Reproduction non conforme: reproduction sexuée (à la base de la diversité biologique)
Téléonomie: propriété de poursuivre sa propre fin, d’avoir un projet (→ être vivant lutte pour sa
survie)
Morphogenèse autonome: propriété de réaliser sa propre forme
Invariance: capacité de se maintenir tel quel (ex: les chiens ne font pas des chats)
Opéron: ensemble de gènes participant à une fct de l’organisme
Cybernétique: science qui étudie le mécanisme d’auto-régulation
Êtres vivants: groupe relié par des liens de parentés, ils partagent tous une histoire
Généalogie: liens de parenté entre individus à travers les générations
Phylogénie: liens de parenté entre espèces à travers l’évolution
Evolution darwinienne: propriété propre aux vivants
Organite: unité fonctionnelle limitée par une membrane dans une cellule
Tissu: ensemble de cellules de structure semblable, spécialisées dans une même fonction
Population: groupe d’individus
Ecosystème: caractérise un milieu dans lequel les conditions physico chimiques sont relativement
homogènes et permettent le développement d'un ensemble d'organismes vivants (ex: une forêt)
Homéostasie: capacité d’un système vivant à maintenir cst un nombre de paramètres alors que son
environnement change
Résilience: capacité d’un système vivant à “réparer” un dommage qui lui a été causé
Biologie synthétique: construire de nouveaux systèmes et fcts biologiques
Théorie synthétique de l’évolution : relie l’évolution des espèces aux mécanismes de l’hérédité.
Induction : construit des principes généraux sur base d’observations.
Déduction : prédit des résultats scientifiques sur base de principes généraux.
Hypothèse : est élaborée sur base d’observation et doit générer des prédictions qu’il est possible de
tester.
=> hypothèse est rejetée si ce qu’elle prédisait ne peut pas être verifier par l’observation ou
l’expérimentation.
Expérience: sert à tester une hypothèse.
Chapitre 2
Polarité : différence d'électronégativité dans une molécule.
Cohésion de molécules d’eau : tendance des molécules à s'attirer l’une aussi autres par des liens
d'hydrogène. Responsable de la tension de surface de l’eau
Adhésion de molécules eau: association des molécules d’eau avec d’autres polaires. Permet l’eau de
monter dans l’arbre par exemple.
Isomère : molécules ayant la même formule brute mais avec des structures différentes
2 énantiomères: isomères tel que l’un est l’image dans le miroir de l’autre
Chirale : isomères tel que l’un est l’image dans le miroir de l’autre

Chitine :
- forme modifié et azoté de glucose
- Exosquelette des crustacé et insectes
- Paroi cellulaire des mycètes, champignon vrais
Glucose: Monosaccharide simple .
Glucane : polymère de glucoses avec liaisons alpha
Cellulose:
- polymères de glucose, polysaccharide formé de chaînes de glucose, liées entre elles pour
former une fibre.
Plantes
Fructose: isomère de la glucose.
Glycérol : sucre à 3 Carbon qui se trouve avec les acides gars
Amidon : glucane ou polymère de glucose .
Plantes
Fonction: stockage d’énergie
Glycogène : autre polymère de glucose avec l’amidon
Fonction: stockage d’énergie
Animaux
Lipide : corps gras, molécule hydrophobe
Triglyceride :
- lipide constitué de glycérol et attacher 3 acides gras (apolaires et hydrophobes)
- huile (triglycéride liquide à t° ambiante) ou graisse (triglycéride solide à t° ambiante)
- Fonction: stockage d’énergie
Phospholipide : glycérol, avec deux acide gras, phosphate et groupe R polaires
Fonction: membranes
Phospholipide/phosphoglycéride:
- molécule constituée de glycérol avec 2 acides gras + structure hydrophile
- polaire et/ou chargé,
- de nature variable ayant été phosphorylée ⇒ molécule avec “tête” hydrophile & “queue”
hydrophobe de 2 acides gras (= molécule amphiphile)
Nucléotide: molécule constituée d’un sucre (ribose) phosphate portant une “base azotée” (ex: ATP)
Polynucléotide: polymère de nucléotides formé par liaison entre le phosphate d’un nucléotide et le
ribose d’un autre (ex: ADN avec ses 4 nucléotides = A, T, C, G; ARN avec ses 4 nucléotides = A, U, G,
C)
ADN :
- constitué de 2 polynucléotides (= bicaténaire)
- liés entre eux (en sens inverse) par des liaisons hydrogène entre bases azotées (= double
hélice) (A-T & C-G = bases azotées complémentaires) ⇒ appariement intermoléculaire
- Fonction : codage de gènes
ARN:
- constitué d’un seul polynucléotide (= monocaténaire),
- peut former des liaison entre bases azotées complémentaires de la même molécule ⇒
appariement intramoléculaire
- Fonction: nécessaire à l'expression des gènes
ATP: nucléotide triplement phosphorylé, énergie libérée par rupture hydrolytique de la 3e liaison
phosphate
Condensation déshydratante:
- créer une liaison covalente en éliminant de l’H2O
- Permet de synthétiser polymère biologique
Hydrolyse:
- contraire de la déshydratation => rupture d'une liaison en ajoutant de l’eau.
- Permet la dégradation enzymatique de polymère
Monosaccharides : réserve de carbone et énergie libre, donc de l’énergie qui peut être utiliser pour
faire des choses
Saccharose : disaccharide composé de glucose et fructose
Polysaccharide : sucre complexe constitué par la polymérisation de monosaccharides (= oses) (réserve
de carbone et d’énergie libre)
Phosphoryle: phosphate lié à une molécule organique (carbonée)
Polypeptide: polymère d’acides aminés liés par des liens peptidiques (= condensation déshydratante
de 2 a.a avec fct carboxylique -COOH de l’un et fct amine NH2 de l’autre)
N.B.: → a.a se lient entre eux à l’intérieur du même polypeptide, déterminant son repliement et donc
sa forme
→ il existe 20 acides aminés (a.a) différents dans les protéines
Protéine:
- macromolécule constituée d’un ou plusieurs polypeptide(s) différent(s)
- acides aminés, peut être de fonction ou de structure
- Fonction protéines de fct : catalyse et transport
- Fonction protéines de structure : support
Acide aminé:
Acide aminé polaires: n'interagissent qu’entre eux car fuient l’eau
Acide aminé polaires non chargés: distribution d’e- hétérogène au sein de la molécule
Acide aminé chargés: forment liaisons ioniques
Attraction de Van der Waals: interaction de très petite distance entre molécules apolaires
Structure primaire d’une protéine: séquence des a.a
Structure secondaire “ “ : formes élémentaires permises par interactions spécifiques entre a.a
Structure tertiaire “ “ : association éléments de structure secondaire dans l’espace, créant une
forme d’ensemble
Structure quaternaire “ “ : plusieurs polypeptides s’associant par des liaisons faibles (parfois
covalente)
Motifs d’une protéine: associations d’éléments de structure secondaire de protéines partageant ou non
les mm fcts
Domaines d’une protéine: parties fonctionnelles à l’intérieur d’une protéine (ex: domaine catalytique,
domaine transmembranaire, etc.)
Protéine chaperonne: protéine qui vise à mouler correctement une autre protéine mal pliée à l’aide,
par exemple, d’ATP (car bonne forme de la protéine indispensable pour sa fct)
Dénaturation d’une protéine: rupture des liaisons faibles de la protéine qui altère donc sa structure
Micelles: particules supramoléculaires sphériques formées par des phospholipides dispersés dans
l’eau
Cellule: “poche d’eau à l’intérieur de l’eau” ⇒ besoin d’une membrane amphiphile pour délimiter
volume cellulaire
Microfilaments et filaments intermédiaires: réseau de protéines à l’intérieur de la cellule (protéines
extrinsèques = qui ne traversent pas membrane, qui sont seulement liées à sa surface), peuvent
interagir physiquement avec certaines protéines transmembranaires (protéines intrinsèques = qui
traversent la membrane)
Matrice extracellulaire: réseau non rigide de plusieurs protéines structurales
Cholestérol: petite molécule lipidique hydrophobe
Protéines transmembranaires: assurent rôles multiples
→ transporteur
→ enzyme (= catalyseur protéique)
→ réception + transmission info
→ adhérence entre cellules (= 2 cellules s’attachent l’une à l’autre), spécifique aux cellules animales
→ fixation cytosquelette (pour cellules eucaryotes)
N.B.: une protéine intrinsèque présente un ou plusieurs domaine(s) transmembranaire(s)
Diffusion: mvt spontané/passif (= ne demandant pas d’énergie) de molécules/ions jusqu’à état
d’équilibre énergétique (du + concentré au - concentré)
→ s’applique aussi au déplacement passif de solutés à travers membrane
Canal: facilitateur de diffusion (transporteur) interagissant avec les molécules d’eau (port), est
spécifique
Porine: canal à large port ⇒ laisse passer bcp de chose ⇒ non spécifique
Uniporteur: facilitateur de diffusion (transporteur) n’ayant pas besoin de molécules d’eau pour “faire
passer les choses” (→ mvt de bascule ds membrane)
Osmose: cas particulier de diffusion ⇒ diffusion de molécules d’eau à travers membrane
semi-perméable (laisse passer l’eau & retient solutés ⇒ membrane cellulaire), l’eau va diluer la
solution la plus concentrée
Solution isotonique: concentration solutés à l’intérieur de la cellule = concentration extérieure cellule
⇒ pas de différence de pression & eau pas en mvt
Solution hypotonique: concentration tot. en soluté + faible à l’ext. de la cellule qu’à l’int. ⇒ l’eau
rentre dans la cellule qui gonfle sous la pression et éclate (pour cellule végétale: membrane entourée
par paroi résistant à la pression = état de turgescence qui est l’état normal de la cellule)
Solution hypertonique: solution ext. + concentrée que solution int. ⇒ la cellule perd de l’eau ⇒
volume cellulaire se contracte, la cellule reste à pression atmosphérique qui est celle de la solution
Transport non spontané/actif: déplacement de solutés contre leur gradient d’énergie, demande de
l’énergie (le plus souvent, ATP)
Pompe sodium/potassium: complexe protéique intrinsèque de la membrane plasmique assurant
déplacement d’ions Na+ et K+ (tous 2 contre leur gradient d’én.) Comment?
→ modificat° de la configuration de la pompe par la liaison puis l’hydrolyse d’un grpmt phosphoryle
donné par molécule ATP
Homéostasie du sodium et du potassium: régulation des concentrations de ces ions dans les cellules
animales
Endocytose: la membrane d'une cellule enveloppe et absorbe une particule (invagination membrane)
Phagocytose: endocytose de grosses molécules
Pinocytose: endocytose de petites molécules
Exocytose: exportation de matériaux cellulaires en dehors de la cellule grâce aux vésicules
membranaires (sécrétion cellulaire)
Amphiphile : qui aime les deux
Chapitre 3
Ubiquiste: organisme qu’on trouve partout, tel que les bactéries
Biofilm : pellicule de bactéries
Holobionte : organisme accompagner de tous ses organisme
Prébiotique : qui favorise le développement des microbiotes
Extremophile : adapté à des conditions extrême.
Organite : composant cellulaire limité par une membrane
Noyau :
- limité par 2 membranes et chaque membrane est bicouche de phospholipide
- Pores nucléaires : permet de faire rentrer des truc comme ARN du noyau
- Nucléole : nucléole est le plus gros sous-compartiment du noyau des cellules eucaryotes. Cet
espace particulier du noyau n'est pas délimité par une membrane, il n'est donc jamais
considéré comme un organite.
ARN :
- transcription de l’ADN mais il peut sortir du noyau
- Différents type : ARN messager ; ARN ribosomal
- ARN messager : il est lu par le ribosome pour la création de protéines
Cytoplasme :
- volume délimité par la membrane plasmique
- Chez prokaryote, n’est pas compartimenté
Ribosomes :
- machines à créer les polypeptides par polymérisation
- Assemblage ADN, ARN
- Constitué de deux unité qui s’assemble pour lire
- Va lire par triplet les nucléotides ( =acides aminés ) et le code pour synthétiser et donc créer
des protéines
Nucléoïde :
- ATTENTION pas nucleole car il n’a pas de noyau
- 1 seul chromosomes circulaires chez prokaryote
Membrane plasmique :
- Lipidique, phospholipidique
Inavagination de la membrane :
- augmentation de la surface de la membrane pour maximiser la surface de la membranes
plasmique pour un volume
- Pk ? Comme pour la photosynthèse oxygénique a besoin de chlorophylle qui est hydrophobe
=> one le mets donc dans la membrane qui va s’invaginer pour que la membrane devienne un
panneau solaire pour capter plus d’énergie
Membrane photosynthétique :
- repliement de la membrane plasmique et c’est là où seront les cellules de photosynthèse
- ATTENTION -> membrane plasmique = membrane photosynthétique
Paroi :
- sucre, associations de saccharide et peptide => peptidoglycane
Capsule :
- polysaccharide gélatineuse ( allusion à la formation de gel car sucres avec bcp d’eau)
- Peut ou pas exister => différentes matière organique
Flagelle :
- existence fréquence car aide à être en mouvement active ( donc dépense de l’énergie)
- Long poil propulseur
Flagelline :
- protéine dont la rotation propulse la cellule
- Énergie provient du passage de protons de l’un côté à l’autre de la membrane ( libère de
l’énergie en sortant de la cellules )
Périplasme :
- Espace entre la la paroi et la membranes plasmique
- Proton accumuler à cet endroit là car la pompe car c’est la pompe à protons qui déplace les
protons à l’intérieur et extérieur
Pompe : machine qui bouge des organismes contre leurs gradients d’énergie
Liaison ester :
- entre carbon and oxygen et le carbon a une double liaison
- Attache les chaînes carbonées d’acides gras sont attachées au glycérol chez les bactéries et
eucaryotes
- Liaison entre un groupe alcool (-OH) (ds cours, glycérol → hydrophile) et un groupe acide
carboxylique (-COOH) (ds cours, 2 acides gras → hydrophobes), formée par élimination d'une
molécule d'eau (H2O) ⇒ liaison entre le O et le C
Liaison ether :
- Liaison entre le CH2 et le O
- Attache les chaînes carbonées d’acides gras sont attachées au glycérol chez les Archées
Respiration aérobie :
- oxydation du carbon
- = libératrice d’énergie
Peptidoglycane :
- polysaccharide = peptide + glucane
- Composant de la paroi bactérienne maintenant la forme des cellules et assurant une
protection mécanique contre la pression osmotique. Il forme une couche fine chez les
bactéries à Gram négatif et une couche épaisse chez les bactéries à Gram positif
Gram positif :
Gram négatif
jt’ai mis une image pcq c difficile à expliquer et en plus je pense qu’il demandera pas ça pcq c trop
compliqué et il s’est pas attardé dessus

Cellules animal : sans parois => on développer des poches pour prélever les nutriments
Cellules végétales :
- avec parois qui sont attaché par de la pectine
- Plaste = différente familles
- Tonoplaste = membrane de la vacuole
Reticulum endoplasmique
- rugueux :
- à l’intérieur se trouve une zone interne appelé lumière qui n’est pas du cytosol
- Est couvert de ribosomes qui vont créer des protéines à l’intérieur de la lumière du
reg
- Lisse :
- Synthèse des lipides
Appareil de golgi :
- empilement de dictyosomes ( espèces de sac ou saccules )
- Lieu de trafic de vésicules
Sécrétion chemin :
- création protéines dans la lumières du reg
- Invagintaion de la memebrane du reg et va se déplacer vers l’appareil de golgi dans vésicules
de transport
- Va arriver en contacte avec le dictyosome et va former membrane ( attention même
membrane que celle du RE )
- Ensuite va traverser les différentes couches de l’appareil de golgi où différentes enzymes va
attacher des sucres sur les protéines = transports transgolgien
- A la fin se trouve dans Vésicules de sécrétion contient protéines totalement glycogynée qui va
aller fusionner avec la membrane plasmique et va donc décharger le matériel dehors pk
Lysosomes: organites issus des vésicules golgiennes et contenant des hydrolases, enzymes digestives.
=> pour digestion
Vacuole :
- digestion chez les plantes
- Vaste enclave aqueuse limité par une membrane simple appeler tonoplaste
- Grandi car contient 1) beaucoup de substance hydrosoluble ( eaux ??) 2) beaucoup de
réserves de saccharose
Peroxysome :
- matériel cellulaire qui va prendre les molécules de peroxyde d'hydrogène ( eau oxygénée
H2O2) pour l’éliminer car eau oxygénée est toxique.
- Selon l’équation, H2O2 + H2O—> 2H2O + O2 ( + aide de catalyse )
Mitochondria :
- Organisme animal et végétale
- Siège de la respiration aérobie => va amener bcp d’énergie via la substrat de O2
- A son propre adn car contient des ribosomes indépendantes du noyau et donc créer propre
protéines ( car avant mitochondria était une bactérie )
- Composant
- Crête : invagination de la membrane pour augmenter la surface membranaire où se
déroule une suite de réactions oxydatives menant à la fabrication d’ATP.
- Ribosome
- ADN
- Matrice: contient des enzyme pour la dégradation carbonée
- Membrane externe : est percé de pores pour que les molécules puissent entrer dans
l'espace inter membranaire
Famille des plaste : que chez les végétaux
Chloroplaste
- rôle anabolique : de biosynthèse => la photosynthèse fabrique des sucres avec du CO2 et H2O
grâce à l’énergie de la lumière
- 3 membranes: externe, interne et membrane thylakoïde
- membrane thylakoïde : plus interne et contient les pigments de chlorophylle. Se créer par
invagination de la membrane interne et se détache après.
Scénario endosymbiotique :
- Théorie que les organistes sont des bactéries qui ont été phagocytées et qui ont été maintenu
dans le cytoplasme et non pas digérer
- Origine de la cellule nucléée phagocytante ( celle qui a avaler les autre et donc avec membrane
plasmique ) est inconnu : 1) bactérie dont génome a été remplacé par archée 2) ce serait une
archée
Cytosquelette:
- provient des protéines
- Permet de disposer les différentes organites dans la cellule comme un squelette mais attention
le cytosquelette est en dynamique constante de montage et démontage de protéines
- Les vésicules de transport vont utiliser le cytosquelette
- Composant :
- Micro filament : protéine actine
- Microtubule : cylindre creux composé protéine tubuline ( il y’a différent type de
tubuline)
- Filament intermédiaire
Microtubules:
- sont attachés au centrosomes et créer une flexion
- Aménage le volume et
Centrioles ( animaux uniquement) :
- organite composé de 9 triplet de microtubules
- Là que se passe la création des microtubules
- Organisation des microtubules = aménagement volume et on mets différents organismes
Centrosome ( animaux et plantes ) :
- Organite composé de 2 centrioles perpendiculaire sans membrane
- Il est donc responsable de la formation du fuseau mitotique microtubulaire lors de la division
cellulaire, sur lequel se déplacent les chromosomes.
- Chez les végétaux comme il n’y a pas de centriole, on parle plus d’un organisateur des
microtubules que centrosome
Activité cytosquelette:
- Des protéines relient la vésicule à la microtubule et un protéine motrice consomme de
l’énergie sous forme d’ATP pour faire coulisser l’ensemble sur le « rail » de microtubule.
- On décrit les paires de
- protéines dynactine (protéine d'attachement) / dynéine (la protéine motrice) et
- kinectine (protéine d’attachement) / kinésine (protéine motrice): celles-ci assurent le
déplacement des vésicules dans des sens opposés.
Flagelle(long)/ cils (court):
- Extension de la cellule et provoque le mouvement en solution aqueuse grâce à des protéines
motrices de dynéine.
- Composé de doublet de microtubules
Croissance secondaire des paroi
- voir bota lol
Matrice extra cellulaire:
- que chez les animaux car ils n’ont pas de paroi
- constituée de protéines souvent glycosylées
- Réseaux de protéines
Intégrines:
- protéines transmembranaires qui établissent une continuité entre la matrice extracellulaire et
le cytosquelette, donc entre l’extérieur et l’intérieur.
Chapitre 4
Thermodynamique : étude les formes et transformation d’énergie
Énergie libre : énergie totale du système G que je peux utiliser en travail
Réaction Endergonique :
- demande de l’énergie donc deltaG>0 => il y’a aura plus d’énergie dans le produit
- Actif car demande énergie
- Non spontané
Réaction exergonique :
- produit de l’énergie, il est libérateur d’énergie donc deltaG<0
- Passif
ATP:
- Réaction exergonique
- Molécule qui apporte de l’énergie au organismes endergonique
- Couplage hydrolyse de l’ATP, va fournir de l’énergie
- Coenzyme
- Régénérer par la respiration mitochondrie
- Est stocké dans des liaisons entre ses groupes phosphates terminaux.

Vitesse d’une réaction = quantité de r/ par le temps


- important pour le contrôle
Enzyme:
- jsp
- Protéine avec une activité chimique
- Capable de répondre à des concentrations fluctuantes de son métabolisme environnement ( %
au turnover )
Catalyseur :
- Enzyme
- Abaissements l’énergie d’activation => Va diminuer la quantité d’énergie demandé pour
passer du réactif au produit
- Est spécifique pour chaque substrat
- N’est pas consommée par la réaction donc, lorsque le substrat est libéré, elle est à nouveau
disponible
- Enzyme pour fructose-glucose = invertase
Pyruvate (déshydogénase):
- Multienzymatique, donc enzyme avec liaisons non-covalente
- enzyme importante et complexe
- Important car position intermédiaires dans l’oxydation des sucres
Turnover :
- vitesse réactionnelle divisé par la quantité d’enzyme
- Vitesse à laquelle les enzyme travaillent.
-
Enzyme protéolytique : qui digèrent des protéines
Inhibition competitive :
- lorsqu'un inhibiteur va entrer en compétition sur le site actif/ site de liaisons de l’enzyme et
donc empêche le substrat de s’attacher
- Si la concentration inhibiteur augmente, alors il y aura moins de protéines enzymatique pour
le substrat = > moins de réaction ainsi créer
Inhibition non compétitive:
- inhibiteur se lie à un autre endroit que le site actifs
- Va gêner la mobilité de l’enzyme => l’enzyme change de forme => le substrat ne peut plus
s’attacher sur la site actif car celui ci est déformé
Activateur allostérique : inhibiteur peut également changer la forme de tel sorte que l’enzyme peut
mieux faire la réaction => vitesse de réaction augmente => accélérateur
Rétro inhibition: lorsque l’enzyme a produit beaucoup de produit final, ce produit devient inhibiteur
pour freiner le flux métabolique => donc diminue la production du produit finale en fonction de sa
concentration dans le fluide.
Coenzyme:
- PAS UNE ENZYME
- Substrat réactionnelle
- Va être consommé par des réactions enzymatique qui après consommation va être rapidement
régénérer
- ADP, NAD sont coenzyme
- NAD+ est forme oxydée ( car a perdu ses electron)
- NADH forme réduite ( a reu des electron donc dans la prochaine reaction va pouvoir en
donner)
Réduction : lorsque la molécule va recevoir des électrons pour ainsi devenir réducteur => oxydant
devient réducteur
Oxydation : réducteur devient oxydant donc pert des électron
Réducteur : qui peut donner des électrons parce que il en a reçu
Oxydant: peut recevoir des électrons
=> Ox1 + e- = Red1 ( red 1 va donner electron à ox2)
=> Ox2 + e- = Red2
Glycolyse:
- dégradation de sucres qui permet la production de NaDH
- Se passe dans le cytosole
- Étape : sucre à 6 carbon -> consommation d' ATP -> on énergise le glucose et on attache sur
chaque 2 groupes de phosphate dont le liens est énergisé -> on divise en deux le sucres et
donne 2 sucres à 3 carbone Triose-phosphate - > phosphorylation de l’ADP ajouté en ATP et
on produit 2 ATP par sucre de 3 carbon et à la fin on créer du pyruvate
Pyruvate :
- revoir au dessus => enzyme importante
- Produit de la glycolyse dans le cytosole
- On le fait rentrer dans mitochondrie et il réagit avec le co-enzyme A avec une réaction oxydo
réductrice => se transforme en Acétyl-CoA et du CO2
- Il rentre dans le cycle de krebs pour son apport en C=> articulation entre le glycolyse du
cytosol et la respiration mitochondriale
Cycle de Krebs:
Le cycle de Krebs participe au métabolisme des glucides, des lipides et des protéines, mais il est
surtout connu pour permettre la production d'énergie cellulaire

Le cycle de Krebs produit au total (pour 2 C entrant):


→ 2 CO2
→ 3 NADH (co-enzyme)
→ 1 FADH2
→ 1 ATP
- continuation de la dégradation de C grâce à cette suite réactionnelle
ATP synthase :
- Pompe à proton. Bouge grâce à l’énergie des protons déplacer.
- En bougeant provoque la synthèse d’ATP
Chimiosmose/Production d’ATP
- ATP est le produit par la dégradation oxydative de C
- Est le source de la plus grande partie de l’ATP produit
Photosynthèse:
- se passe dans les chloroplaste, plus précisément les Thylakoïde où du carbone oxydé CO2 est
transformé en sucre
ATP-synthase : enzyme membranaire fabriquant de l’ATP par phosphorylation d’ADP, grâce à la
différence énergétique du proton d’un côté et de l’autre de la membrane
→ machine rotative actionnée par l’en des p+ déplacés
Force proton-motrice: én libre créée par une différence de concentration de proton de par et d’autre
d’une membrane, destinée à la cellule
/!\ PAS UNE VRAIE FORCE (au sens physique)
Chimiosmose: production d’ATP
Chloroplaste: siège de la photosynthèse
Thylakoïde: double membrane pigmentée qui se trouve à l’intérieur des chloroplastes chez les
végétaux eucaryotes
Photosynthèse: réaction au cours de laquelle du carbone à l’état oxydé CO2 est réduit en sucre CH2O,
est constituée de deux suites réactionnelles (phase claire et phase obscure ou cycle de Calvin
Phase claire: réaction où l’én. lumineuse est convertie en én. chimique sous la forme d’ATP (ADP + P)
et de potentiel réducteur (NADPH)
Cycle de Calvin/phase obscure: utilisation de l’énergie chimique créée pendant la phase claire pour
fabriquer du glucose (molécule organique) à partir du CO2 ⇒ on appelle cela la fixation du carbone
→ ce cycle permet de dévier 1 sucre à 3 carbones sur 6 produits, les 5 autres étant utilisés pour
régénérer 3 molécules à 5 C, qui sont accepteurs de 3 CO2 pour la suite du cycle
Pigment: molécule capable de capter certaines longueurs d’ondes (λ)
N.B.: plus les pigments sont diversifiés dans la plante, plus elle peut absorber de lumière
⇒ én. ++
Chlorophylle: molécule azotée se trouvant dans la membrane thylakoïdale, munie d’un atome de
magnésium et portant une queue hydrocarbonée hydrophobe
→ peut être à l’état oxydé (oxydant fort) ou à l’état réduit (réducteur fort avec e- excité et réducteur
moyen avec e- à l’état énergétique basal)
Photosystème: lieu où la lumière est captée pour la photosynthèse

DIA 27 continuer ou lire le cours jsp synthese + raven


Chapitre 5

Réplication ADN: produire 2 doubles hélices au départ d’une double hélice, toutes identiques entre
elles
Modalité conservative : dans les produit se retrouve 1 brin qui existait déjà et 1 néo synthesiser =>
nouveaux brin totalement identique
Modalité semi-conservative (adoptée par les organismes vivants): chaque brin de la double hélice est
utilisé comme matrice dirigeant ainsi la synthèse du brin complémentaire
Modalité dispersive : chaque brin est un mélange de l’ancien adn et du nouveau.
ADN polymérase :
- C’est une enzyme qui va scanner le brin modèle pour pouvoir en créer un nouveau avec la
replication semi conservative de l’ADN
Pyrophosphate: molécule composée de 2 phosphates libérée lors de l’ajout d’un nucléotide au brin en
croissance lors de la réplication semi-conservative
Scissiparité: division simple des cellules bactériennes
Origine de réplication: point bien précis où à lieu l’initiation de la réplication du chromosome
circulaire unique de la bactérie (se produit avant la division cellulaire)
Centromère:
- étranglement du chromosome
- Réunis les deux chromatides
Protéines d’histones :
- dans noyau eucaryotes
- L’ADN va s’entourer autour
Nucleosome : bobines d’histones qui permettent de condenser l’ADN ( en gros, les histones c’est des
boules et l’ADN enroulé chaque boule ⇒ bobines)
Solénoïde :
- structure en solénoïde , donc des groupe de bobines
- groupe de solénoïde = boucle
Protéines de l'échafaudage :
- scaffold protein
- Permet de tenir les boucles où sont les solénoïde
Chromatide: longue molécule d’ADN condensé
Chromatine: substance de base constitué d’ADN et d’histones (protéines)
N.B.: il n’y a pas d’histones chez les procaryotes
Chromosome: →
- se trouve dans le noyau de la cellule
- contient une seule molécule d’ADN continue
- constitué d’une ou 2 chromatides ( dépend de l’étape de méiose où on se trouve )
- constitué de chromatine
- contient l’ensemble du matériel génétique d’un organite
⇒ double hélice d’ADN → nucléosomes → solénoïdes → boucle de chromatine → rosettes de boucles
de chromatine → chromosome
Paire de chromosomes : 2 chromosomes homologues qui ont presque le même séquençage d’ADN , =>
ils ont les même gènes mais sous forme alléliques différentes
Cellule haploid : n chromosomes
Cellules diploïde : 2n chromosomes
Caryotype :
- représentation des chromosomes dans leur phase métaphasique d’un génome diploïde
- chez l’humain, le caryotype comporte 22 paires de chromosomes homologues et une 23e paire
de chromosomes sexuels
Autosome : chromosomes non sexuel
Hétérosome : chromosomes sexuels ( X et Y)
Locus : emplacement précis d’un gène sur un chromosome

Chromatide sœurs : même chromosomes donc aura la même séquence d’ADN ( sauf si erreur mais
rare )
Chromatide non-sœur : deux chromatides de la même pair de chromosomes homologues mais de de
chromosomes distincts
Cohésine : protéine qui attache 2 chromatides sœurs
Kinetochore : protéine qui attache les chromosomes au micro tubules, ( => ont un rôle dans le
mouvement des chromosomes lors de la division cellulaire)
Allèle :
- petite modification du séquençage d’ADN
- C’est ça qui différencie 2 chromosomes homologues
Mitose : division d’un noyau commence à la fin de G2
Cycle de reproduction sexuée
- est caractérisé par une alternance entre une phase haploïde ( haplophase) et diploïde
(diplophase)
- Que pour les eukaryotes
- Requiert une fécondation
- Conséquence majeur = nouvelle combinaison d’allèles

Interphase
- G1 : permet d’arrêter le cycle cellulaire, un chromosome est constitué d’une chromatide
- S : synthèse de l’ADN , réplication semi-conservative va intervenir, crée les conditions pour
engager la mitose
- G2 : prépare une nouvelle mitose, un chromosome est constitué de 2 chromatides => l’ADN
s’est répliqué + les centrioles se répliquent (cellules animales)

Mitose :
- Prophase :
- chromosomes condensés ⇒ 2 chromatides soeurs
- fuseau mitotique commence à se former
- à la fin, plus de membrane nucléaire
- le complexe de Golgi et le RE se dispersent
- Prometaphase :
- La membrane nucléaire a disparu
- Microtubules vont former des fuseaux
- Centrosomes sont poles vers lesquelles vont se faire la migration
- Métaphase :
- les microtubules (venant des centrioles) s’attachent aux chromosomes par leurs
kinétochore
- les chromosomes sont alignés à l’équateur de la cellule, dans la plaque métaphasique
- les chromosomes sont attachés aux 2 pôles et sont sous tension
- Anaphase :
- les protéines liant les centromères des chromatides soeurs (cohésines) sont
dégradées, libérant les chromosomes
- chromosomes tirés vers les 2 pôles
- les pôles du fuseau s’écartent
- Télophase :
- les chromosomes sont regroupés aux 2 pôles et se décondensent
- enveloppes nucléaires se reforment autour des chromosomes
- le complexe de Golgi et le RE se reforment

Cytocinèse : séparation du cytoplasme en deux , donc séparation de la cellules

Cytocinèse animale: un sillon de clivage se forme et divise les cellules ⇒ constriction (elle démarre
avant la fin de la télophase)
Cytocinèse végétale: une plaque cellulaire (phragmoplaste) se forme et divise les cellules
Plaque métaphysique : Plan médian d'une cellule où les chromosomes fissurés se groupe pendant la
mitose, avant de se séparer en deux stock égaux.
Sillon de clivage : le sillon de division se forme dans un plan perpendiculaire à l'axe du fuseau
mitotique et sépare la cellule en deux. Il peut en effet commencer à se former dès l'anaphase. Le
clivage est dû à un anneau contractile qui est composé principalement d'actine et de myosine
(myosine II).
Matériel pariétal : fait référence à la paroi
Matériel membranaire : pour faire la membrane
Check point :
- points spécifiques contrôlant la progression du cycle
- point de contrôle G1/S (point de départ ou de blocage)
- point de contrôle G2/M
- point de contrôle fusorial

Conjugaison bactéries : processus parasexué consistant à réaliser de nouvelles combinaisons


génétiques sur un chromosome chez les procaryotes
=> transfert unidirectionnel d’ADN d’un cellule donneuse vers une cellule receveuse
Processus parasexué: qualifie le phénomène de conjugaison par son caractère asymétrique
Recombinaison génétique : La recombinaison génétique est un échange d'information génétique
entre deux génomes différents ou bien entre deux chromosomes. Il s'agit en général d'un échange
entre fragments d'ADN.

Phragmoplaste: formée grâce aux vésicules golgiennes amenant le matériel pariétal et membranaire
nécessaire jusqu’à la plaque équatoriale
Plasmide: molécule circulatoire à réplication indépendante du chromosome bactérien
Pilus sexuel: jonction cytoplasmique permettant à la conjugaison à se réaliser
Bactériophage: virus infectant les bactéries, c’est un acide nucléique infectieux (= capable de transfert
horizontal d’une cellule à l’autre)
Capside: enveloppe protéique entourant l’ADN permettant l’infection des bactéries par les phages
Infection par un phage: → le phage adhère à la cellule
→ ADN du phage injecté ds la cellule
→ ADN du phage se réplique et celui de l’hôte se dégrade
→ les particules de phages sont formées avec ADN puis libérées par lyse (rupture)
Phénomène de transduction: ADN hôte est accidentellement encapsidé et délivré à une nouvelle
cellule nouvellement infectée; l’ADN transduit se recombine au chromosome de la cellule infectée ⇒
nouvelles combinaisons d’allèles
Transformation: pénétration d’ADN nu dans une cellule, sans système vecteur ⇒ nouvelles
combinaisons de gènes
Méiose :
- division cellulaire chez les eucaryotes produisant de nouvelles combinaisons d’allèles sur des
chromosomes recombinants (intervient au moment de la formation des cellules sexuelles)
- ne peut être initiée que par des cellules diploïdes (2 chromosomes à 2 chromatides collés
ensemble + 2 chromosomes à 2 chromatides collés ensemble)
- comporte 2 divisions: division réductionnelle et division équationnelle
- la deuxième divisions de la meiosis est une mitose
- Permet le passage de la diplophase vers l’haplophase
Fécondation :
- permet passage de l’haplophase vers le diplophase
- fusion de 2 gamètes (produits de méiose) produisant un zygote

Division réductionnelle: réduit le nombre des chromosomes de moitié


Division équationnelle: division en tous points semblables à la mitose
Synapsis: processus d’appariement de 2 chromosomes à 2 chromatides
Complexe synaptonémique/synaptonémal: complexe protéique spécifique intervenant dans le
synapsis
Crossing-over: enjambement entre chromatides non soeurs ⇒ recombinaison homologue de leur ADN
et formation de chromatides recombinantes
Chromatides recombinantes: chromatides portant des associations alléliques nouvelles p/r aux
chromatides parentales
→ ex: ABCDE abcde ⇒ aBCDe
N.B.: il existe des hotspots de crossing-over
Gamétogenèse: format° des gamètes par méiose au départ de cellules dites germinales
Ovogenèse: gamétogenèse femelle
Spermatogenèse: gamétogenèse mâle
Synapsis : La synapsis ou appariement est l'union des chromosomes homologues qui donnent des
tétrades, des groupes de 4 chromatides
Spore :
- cellules qui a un rôle particulier dans la reproduction d’un organisme
- Peuvent aussi avoir une origine clonale
- Cf chap 5 = meio spore par mitose donne gametophyte
Le sporophyte: est un organisme diploïde producteur de méiospores.
Le sporange: est un organe producteur de spores.
Le gamétophyte : un organisme haploïde producteur de gamètes.
L’oosphère : le gamète femelle (lorsque l’on peut distinguer les gamètes des deux sexes et que le
gamète femelle est immobile).
Chapitre 6
Phénotypes :
- caractères exprimé par l’individu
- Dominant ou récessif
Génotypes :
- la compositions des facteurs héréditaires
- Homo-hétérozygote
Locus : endroit particulier d’un chromosomes
Dominant: facteur génétique qui prend le dessus.
récessif: facteur qui est faible et donc si est mis avec un dominant => il sera effacé, écrasé par le
dominant ( exemple de la fleur pourpre et blanche => fleur pourpre contient une enzyme, pas la
blanche => si on les mets ensemble, il aura un facteur qui créer l’enzyme donc d’office pourpre )
Homozygote: quand porte deux fois le même facteur héréditaire
Hétérozygote : quand les deux facteur héréditaires sont différents
Lignée pur :
- Homozygote
- quand on fait de l'autofécondation => donne des descendant homogène des hybride
Monohybride : ne parle que de 1 facteur héréditaire ( ex la couleur )
DiHybride: hybridation de 2 paires facteurs héréditaires ( ex la couleur et la forme)
Mono Hybride F1 :
- génération de deux lignée pur, a les deux facteurs héréditaires
- génération homogène car n'exprime que les caractères dominant
Génération F2:
- autofécondation du monohybride F1 = donne une descendance hétérogène
Ségrégation des caractère : hétérogénéité suite à un croisement sexué
Gamètes :
- fabriqué par méiose
- N’a que 1 des deux facteurs héréditaires
- La fécondation va associer au hasard des gamètes du père avec celui de la mère
Première loi de Mendel
- Monohybridisme
- Loi d’uniformité des hybrides de premières générations
- Même probabilité que les deux facteur héréditaire d’une paire se retrouve dans un gamète
- Wikipédia : Loi d'uniformité des hybrides de première génération. Si l'on croise deux
individus d'une même espèce homozygotes relativement à un caractère, tous les descendants
de la première génération, qui sont appelés hybrides F1, sont identiques relativement à ce
caractère, c'est-à-dire tous hétérozygotes.
Deuxième loi de Mendel
- Si paires de facteurs héréditaires => paire d’allègre au niveau d’un individu diploïde lors de la
formation de gamète = chaque gamètes à la même probabilité
- = Ségrégation indépendante des caractères
- Wikipédia : Lorsqu’on croise entre eux, deux des individus de générations F1, on obtient une
génération F2 dans laquelle on trouve les deux versions de la couleur des fleurs dans des
proportions bien définies : trois descendants à fleurs rouges (1 RR homozygote + 2 Rr
hétérozygotes) et un descendant à fleurs blanches (rr homozygote).
- Cette loi est dite « de ségrégation des caractères dans la génération F2 ».
Dominance incomplète :
- lorsque que le dominant n’a pas « tout » donné
- « dosage de gènes »
Ex: rouge (D)+ blanc ( r) = rose ( dominance incomplète )
Codominance :
- lorsque 2 allèles s’exprime semblablement
- Tous les 2 s’exprime en ignorant l’autre
Ex: les types sanguins = certaines produisent des sucres et le types de sang AB produit les
deux sachant que A et B sont tous deux dominant
Épistasie :
- relation de dominance entre gènes de masquage ; entre deux locus , entre deux différents
gènes
Ex: maïs pourpre => 1 précurseur blanc va créer un intermédiaire blanc grâce enzyme A et
puis l’intermédiaire créer l’individu pourpre grâce à l’enzyme B qui contient A et B
Parler du contraire de la ségrégation indépendante ?? ( p10)
Distance physique : en millier de nucléotides
Distance génétique : en cM (= centimorgan ) correspond à une fréquence de recombinaison en
pourcent
Ex : 180 : 1000 = 0,18 descendant recombinant = fréquence 18%
= 18 cM
Groupes de liaisons de gènes : groupe d’allèles qui ont tendance à ségréguer ensemble.
Cartes génétique :
- définit des groupes de liaisons de gènes car groupé sur le même chromosomes
- Exprime les distances entre gènes par leurs fréquences de recombinaison
Test à trois point : permet de repérer les doubles crossing over

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