1) Chapitre 2 : Composition chimique de l’organisme

Rappel : Atomes et molécules

Les unités de matière qui forment tout les corps chimiques sont appelées atomes
Chaque type d’atome (carbone,..) est appelé élément chimique et est désigné par une
abréviation.
Il existe un peu plus de 100 éléments chimiques dans l’univers, mais seuls 24 sont essentiels à
la structure et la fonction du corps humain (dont 4 principaux CHON).

La totalité de l’atome sera électriquement neutre (autant d’électron que de protons).

Si un atome gagne ou perd un électron, il acquiert une charge électrique → deviennent des
ions. Ceci dépendant de l’électronégativité.
+ : Cations - : Anions
Les atomes qui s’unissent ensemble deviennent une molécule.
L’électronégativité : capacité d’un atome d’attirer les électrons.
Les différents types de liaisons chimiques
- Liaison ionique
➔ Grande différence d’électronégativité
➔ Deux ions de charge opposé qui s’attire
➔ + et – qui s’attirent
➔ Perte total d’un électron (complétement gagner ou perdu)
- Liaison covalente
➔ Partage d’électron
➔ Liaison la plus forte
➔ Un électron mis en commun qui appartient tout autant à l’oxygène qu’à l’azote
- Liaison covalente polaire
➔ Mise en commun inégale d’électrons
➔ Soluble dans l’eau
➔ Dépends du nombre de protons dans le noyau
- Liaison covalente apolaire
➔ Moins soluble dans l’eau
➔ Mise en commun égale d’électrons (partage a 50/50)
➔ Différence d’électronégativité égal à 0
Chaque type d’atome forme un nombre donné de liaisons covalente
H : 1 seule liaison covalente
O : 2 liaisons covalentes
N : 3 liaisons covalentes
C : 4 liaisons covalentes
Liaison d’hydrogène
Un atome d’hydrogène se lie à un ou des atomes et forme une molécule polaire.
Le côté électropositif peut se lier au côté électronégatif d’une autre molécule.
Liaisons inter ou intramoléculaires (H avec O,N,F) faibles mais importantes.
Cassure de liaisons d’hydrogènes : agitation des molécules
Lignes en pointillés : liaison d’hydrogène
Lignes pleines : liaison covalente
➔ Individuel : faible
➔ Grand nombre : rôle important
Résumé (de la plus grosse force de liaison à la plus faible)
1) Liaisons covalentes
2) Liaisons ioniques
3) Liaisons d’hydrogènes
La solubilité moléculaire
Molécule hydrophile : molécule qui de dissout dans l’eau (polaires et ionisées → Chargées)
Molécule hydrophobe : molécule qui ne se dissout pas dans l’eau (apolaires C-H → Neutre)
Les molécules amphipathiques
Dans l’eau, ces molécules s’agrègent en amas sphériques. Leur régions polaires établissent
des liaisons H avec les molécules d’eau à la surface de l’amas, alors que les régions apolaires
se regroupent à distance de l’eau.
Les molécules des membranes cellulaires sont amphipatiques.
Les principales molécules organiques de l’organisme
Une molécule dite organique se caractérise par la présence d’atomes de carbone (C-H).
Elles ont les propriétés nécessaires pour exécuter les diverses fonctions complexes nécessaires
au maintien de la vie.
- Hydrates de carbone (1% du poids corporel)
- Lipides (15%)
- Protéines (17%)
- Acides nucléiques (2%)

1) Les hydrates de carbone

Ils jouent un rôle central dans les réactions chimiques qui apportent de l’énergie aux cellules
L’énergie est stockée dans les liaisons chimiques → ATP
Glucides : apportent de l’énergie, génèrent l’ATP
- Les monosaccharides de glucose
6 carbones et 6 molécules d’eau
- Le saccharose/Disaccharide
Formé par les liaisons de deux monosaccharides, glucose et fructose avec extraction d’eau.
- Le polysaccharide/Glycogène
Glycogenèse : Synthétisation du glucose vers du glycogène.
Il est stocké dans les muscles et le foie.
Rôle de carburant disponible, stocké au sein de chaque monosaccharides de glucose.
L’hydrolyse de glycogène (glycogénolyse) aboutit à la libération de sous-unités de glucose
dans le sang.
 2) Les lipides
Ils sont composés essentiellement d’hydrogène et de carbone
Liaison covalente neutres, apolaires.
Rôle physiologique : source d’énergie (ATP), composants majeurs de toutes membranes
cellulaires, isolants, etc.
Quatre sous-classes :
- Acide gras
Contiennent de l’énergie au niveau des liaisons entre atomes de carbone et d’hydrogène.
➔ Le glycérol et les acides gras sont les principales sous-unités qui se combinent pour
donner des triglycérides et des phospholipides (3 AG + 1 G = 1 Triglycéride)(2A=1P)
- Triglycérides
Indice de bonne santé. Graisse que l’on va stocker.
Ils constituent la majorité des lipides de l’organisme (graisse).
Combinaisons de différents types d’acides gras = multitudes de triglycérides différents :
- Acides gras de longueurs différentes
- Degrés de saturation différents
Saturés : graisse animale
Insaturés : graisse végétale
Ils circulent dans le sang. Ils sont stockés dans le tissu adipeux. Par hydrolyse → Libération
d’acides gras dans le sang → Energie
- Phospholipides membranaires
Molécules amphipatiques
Bicouches des membranes cellulaires
- Stéroïdes
 3) Les protéines
➔ Rôle essentiel dans le processus physiologique
Elles sont constituées de C,H,O,N
Elles nous aident à récupérer.
Ce sont des macromolécules contenant des milliers d’atomes : structure et conformation
tridimensionnelle importante
Les sous-unités des protéines sont les acides aminés (AA).
La forme d’une protéine détermine sa fonction.
Récepteur : Formes idéales des protéines
Acides aminés
Les protéines sont des polymères d’acides aminés.
20 acides aminés.
20 chaines latérale différentes → synthétisé par leur corps
➔ Les acides aminés essentiels viennent de l’alimentation.
Tous différents et des propriétés chimiques différentes.
Liaison peptidiques
L’assemblage d’acides aminés se fait par des liaisons peptidiques
Celles-ci forment un polypeptide (au moins 50AA)

Peptide : petite protéine de moins de 50AA

Structure des protéines

Toutes les protéines ont de multiples niveaux de structures.
Elles ont une conformation tridimensionnelle (forme) unique.
La forme de la protéine détermine son activité biologique.
Conformation en anse : protéine pas encore replié
 - Structure primaire
Séquence d’AA sous forme de polypeptide (chaine).
Différents types de liaisons.
- Structure secondaire (Hélice alpha et Feuillet béta)
Un AA peut former une liaison avec un AA et les liaisons d’H formeront une espèce d’hélice.
Différence entre hélice alpha et feuillet béta : Les liaisons qui s’unissent.
➔ Deux liaisons d’H qui s’unissent et crée un REPLIEMENT
Déroulement de la mise en place des structures de la protéine.
1. Présence d’une liaison ionique et covalente
2. La structure primaire s’entoure d’une certaine manière au niveau des hélices alpha et
du feuillet béta
3. Tout se replie encore grâce au interactions hydrophobes et hydrophiles

- Structure tertiaire
Association de deux chaines d’acides aminés.
C’est à partir de la structure tertiaire que la protéine devient fonctionnelle.
- Structure quaternaire
Plus d’une chaine polypeptidique : protéines multi numériques.
L’hémoglobine est constituée de 2 chaines alpha identiques et de 2 chaines béta identiques.
La fonction de l’hémoglobine est de transporter l’oxygène dans le sang sous 4 unités
(polypeptides).

Les mutations
Mutation : modification de la structure primaire qui engendre des modifications aux niveaux
des autres structures (secondaire, tertiaire et quaternaire)
Ce sont des conséquences dévastatrices.
 4) Les acides nucléiques
Rôle important dans le stockage, expression et transmission de l’information génétique.
Deux classes d’acides nucléiques : acide désoxyribonucléique (ADN) et acide ribonucléique
(ARN).
Acide désoxyribonucléique (ADN)
Macromolécule présente dans le noyau de chaque cellule.
Elle contient toute l’information génétique (génome).
➔ Molécule à double brin.
2 chaines de nucléotides forment une double hélice. Ces 2 chaines sont maintenus par liaisons
hydrogènes entre une base purique (A/T) sur une chaine et pyrimidique (G/C) sur l’autre.
Acide ribonucléique (ARN)
Très proche chimiquement de l’ADN.
Synthétisé dans les cellules à partir de l’ADN (transcription).
Il intervient dans le décodage de l’info génétique.
C’est un support intermédiaire pour synthétiser les protéines.
Une seule chaine de nucléotides (Cytosine, Guanine, Adénine et Uracile)
Les nucléotides
Les nucléotides sont les sous-unités des acides nucléiques.
Ils sont constitués d’un sucre (désoxyribose), d’une base et d’un phosphate.
L’ADN contient le sucre désoxyribose. L’ARN a le ribose (groupement OH où il manque 1
désoxyribose).
4 bases azotés : Adénine, Guanine, Cytosine et Thymine ( et Uracile pour ARN).
Des liaisons phosphate-sucre relient en séquence des nucléotides pour former des acides
nucléiques.
Des liaisons hydrogènes entre les bases nucléotides de l’ADN déterminent la spécificité de
l’appariement des bases : Adénine/Thymine et Guanine/Cytosine.
Adénosine triphosphate (ATP)
Son hydrolyse en ADP s’accompagne d’une libération d’énergie.
On utilise l’ATP pour les réactions cellulaires consommatrices d’énergie (production de force
et de mouvement, transport actif de molécule à travers membranes, synthèse de molécules
organiques)
ATP : molécule transporteuse d’énergie issue des molécules énergétiques vers les processus
cellulaires nécessitant de l’énergie
NB
Testostérone : présent chez les garçons et chez les filles
Œstrogènes : présent uniquement chez les filles
Cholestérol : Bon → HDL / Mauvais → LDL
Cortisol : hormones du stress