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Phosphate Aldéhyde Cétone Sulfhydryl
Façon d’activer/désactiver
une fct° protéique
Ajout = Kinase
Suppr = Phosphatase
A. Liaisons Covalentes
Antioxydant :
Glutathion, Vit E & C (intracell ++)
Acide urique (extracell)
B. Non Covalente
Interaction hydrophobe :
Hydrophobes : éviter le contact avec l’eau
III. Acides Aminés
A. Introduction
Cadre des protéines : grec protos = premier, + important, car :
Cellule : > 50% des molécules (poids sec)
Structure liée au code génétique
Molécule induisant formation d’autres molécules (enzymes)
+ 2 AA rajoutés :
Sélénocystéine : homme/bactérie
Sélénium prend la place du soufre dans la cystéine (mais formée à partir sérine)
Sert product° Glutathion peroxydase (lutte DRO)
Thioréduxine réductase / désiodase (métabolisme hormone thyroïdienne)
300 AA
Glutamate (+)
Glycine (-)
Acide γ aminobutyrique (GABA) : dérivé Glutamate (-)
2) Propriétés Physiques
17 AA = 1 C*
2 AA = 2 C* (Thréonine / Isoleucine)
Glycine = 0 C*
Bactérie : présence peptides à A.A. de type D (D alanine & D glutamine paroi bactérie)
Insensibilité L-peptidase humaine
260nm (ADN,ARN)
Rapport 280nm (protéines)
DO : Densité Optique
A : Absorbance
L : longueur de la cuve
I : intensité lumineuse
DO = A = log(I0/I) = ε.c.l
ε et l fixes donc : A = K (constance) . [c]
4) Propriétés Acido-Basiques
pH < pHi (pH acide) pH = pHi (pH neutre) pH > pHi (pH basique)
Nombreux H+ Nombreux OH-
AA capte les H+ « Zwittérion » AA libère des H+
COO- → COOH (sel interne) COOH → COO-
NH3- prédomine NH3- → NH2
AA Chargé + Pas de Migration Acide chargé -
AA migre vers la cathode AA migre vers l’anode
(pôle -) (pôle +)
AA = cation AA = anion
Conséquences Biologiques :
pH Physiologique Cellulaire : nbx AA ionisés / liaisons électrostatiques
Analytique :
électrophorèse des AA : pH fixe (tampon) s/ acétate de cellulose
1) Dépôt, 2) Migration et 3) Révélation ninhydrine (bleu-violet)
5) Hydrophobie / Polarité
C. Nomenclature
1) A.A. Apolaires (9)
# 5 AA Aliphatiques :
~ Glycine (Gly / G)
~ Leucine (Leu / L)
~ Isoleucine (Ile / I)
2 C*
Déficit en céto-acide décarboxylase des acides α-cétoramifiés (Val, Leu, Ile) ou thiamine
(cofacteur) [dégradation tellement lente, considérée inefficace]
# 1 AA Soufré :
~ Méthionine (Met / M)
# 2 AA Aromatiques :
~ Phénylalanine (Phe / F)
Pathologie : Phénylcétonurie
Normalité :
Phénylalanine-hydroxylase
Phénylalanine Tyrosine
- DOPAMINE
Bactérie qui :
Pousse inhibée par la L-β2-thiénylalanine
Pousse Stimulée par Phénylalanine (malgré la L-β2)
[Phe] en corrélation avec la pousse bactérienne
~ Tryptophane (Trp/W)
Hétérocycle indole
A l’origine de :
Mélatonine : alternance jour/nuit (circadien)
Sérotonine : satiété, sommeil, humeur
Kynurénine (tics psychiatriques)
# 1 A.A. Cyclique
~ Proline (Pro/P)
~ Sérine (Ser/S)
~ Thréonine (Thr/T)
2 C*
Fonction Alcool II
~ Tyrosine (Tyr/Y)
Origine :
Des hormones Thyroïdiennes
De la DihydroxyPhénylalanine (DOPA) → Dopamine
Intermédiaire d’autres catécholamines
Neuromédiateur des neurones dopaminergiques du SNC / locus niger
(touché par Parkinson)
Implication réaction émotionnelle, apprentissage et mouvement fins
Si déficit → maladie de Parkinson / Traitement par L-DOPA
~ Asparagine (Asn/N)
~ Glutamine (Gln/Q)
# Soufré
~ Cystéine (Cys/C)
~ Histidine (His/H)
Origine de l’histamine
~ Lysine (Lys/K)
~ Arginine (Arg/R)
8 Essentiels :
→ Val, Leu, Ile, Mét, Phe, Trp, Thr, Lys
2 Semi-Essentiels :
→ His, Arg [grossesse, croissance]
D. Réactions liées au Groupe Carboxylique des A.A.
1) Activation des A.A.
ARNt : adaptateur (bras anticodon avec ARNm + bras AA, terminé par l’AA à
incorporer)
2) Formation de sels
R – COOH → RCOO- Cat+
Enzyme :
Ex : oxydase de glucose EC 1. 1. 3. 4
Notion de cofacteurs :
Non protéique
Simple : atome ionisé (Zn2+), molécule d’eau
Complexe : coenzyme (ex : Vit du groupe B)
K1 K3
Cinétique enzymatique : équation Michaelis – Menten
K2
o Neurotransmetteur
o Médiateur allergique :
mastocytes → vasodilatation capillaire, inflammation
Flore bactérienne, intoxicat° alimentaire (poisson cru mal préparé/pourri)
Tyrosine
Adrénaline
Tyrosine BH4
Hydroxylase Phényléthanolamine
BH2 N-Méthyl Transférase
L-DOPA
Noradrénaline
Phosphate de Vit C
Décarboxylase Pyridoxal Dopamine
des A.A. Hydroxylase
Aromatiques
Dopamine
Absence Dopamine
→ maladie de Parkinson (locus niger)
2) Désamination