Cahier coop

Objectifs chapitre 1

1 les macromolécules

1.1
Une macromolécule est une molécule organique de très grande taille, composé de
plusieurs milliers de molécules plus petites, assemblées ensemble généralement par
déshydratation. Il existe quatre classes de macromolécules organiques, soit les Glucides,
les lipides, les acides nucléiques ainsi que les protéines. De ces quatre classes, trois sont
aussi des polymères, soit des molécules composées de chaines de monomères
semblables ou identiques, toutes attachés ensemble par des liaisons covalentes. Un
monomère est l’unité structurale de base des polymères, il s’agit de molécules simples
qui peuvent être attachés ensemble par déshydratation pour former des polymères et
ensuite des macromolécules

1.2
La déshydratation est un procédé de fusion entre deux monomères. C’est cela qui
permet aux monomères de s’assembler en chaine afin de synthétiser un polymère. On
appelle ce procédé déshydratation, car un monomère se départit d’un atome
d’hydrogène tandis qu’un autre se défait d’un groupement hydroxyle, les deux
monomères peuvent ainsi créer une liaison covalente entre eux et une molécule d’eau
est synthétisée et libérée par la liaison polaire entre l’hydrogène et l’hydroxyle. Ce
processus anabolisant requiert de l’énergie pour ce faire. Le processus inverse existe
aussi, il s’agit de l’hydrolyse. On catalyse un polymère en y insérant une molécule d’eau
entre deux monomères. La liaison covalente entre les deux se brise, le monomère qui se
sépare de la chaine l’un prend le groupement Hydroxyle tandis que celui qui devient le
dernier monomère du polymère prend l’atome d’hydrogène

2 Glucides

2.1
Le glucose, C6H12O6, un monosaccharide aldose à 6 carbones, hexose, ayant un
groupement carbonyle à l’extrémité et plusieurs groupement hydroxyle, se replie en
hexagone car le carbone 1 de la chaine linéaire se lie à l’oxygène du carbone 5. Le
glucose est le monosaccharide le plus courant. Il est le combustible de base de la
respiration cellulaire et de la fermentation, il est aussi utilisé pour synthétiser d’autres
molécules organiques comme les acides aminés et les acides gras à partir de son
squelette carboné.
2.2
Un disaccharide est représenté sous la forme de deux monosaccharides liés ensemble
par une liaison glycosidique

2.3
Les polysaccharides sont des polymères composés de plusieurs monosaccharides, ils se
présentent sous forme de chaines d’hexagones verts. Ils servent de réserves d’énergies
pour la respiration cellulaire (amidon, glycogène) ou de structures (cellulose, chitine). La
cellulose est la composante principale des parois des cellules végétale, elle y confère sa
grande résistance. La chitine est la base des exosquelettes des insectes

3 lipides

3.1
Les lipides ne sont pas des polymères car ils ne présentent pas des structures répétées,
ce sont quand même des macromolécules (selon prof). Ils ont comme caractéristique
d’être principalement hydrophobes, car ils sont constitués d’hydrocarbures. Il existe
trois catégories de lipides, soit les triglycérides, les phosphoglycérolipides et les
stéroïdes.

3.2
Les triglycérides/ graisse sont composés de Glycérol (3C comprenant chacun hydroxyle)
attaché à trois d’acides gras qui ont tous un carboxyle à l’extrémité attachée au Glycérol.
Liaisons esther entre carboxyle acide gras et Glycérol. Les acides gras peuvent soit être
saturés ou insaturés. Le gras saturé se retrouve dans les graisses animales, l’acide gras
est saturé en atome d’hydrogène, il est donc droit et solide à température pièce. Elle
emmagasine deux fois plus d’énergie que l’amidon pour une même masse. Elle cause
toutefois l’accumulation de plaques d’athéromes dans les artères, ce qui mène à de
nombreuses maladies et problèmes coronaires et artériels comme l’insuffisance
cardiaque, l’athérosclérose, la crise cardiaque ou l’AVC. Les gras insaturés, présents
dans les graisses végétales, sont identifiables par le fait que les acides gras ne sont pas
saturés en hydrogène. Il y a alors au moins une liaison double entre deux carbones, ce
qui donne un angle à l’acide gras. Cet angle est responsable du fait que les gras végétaux
sont liquides à température pièce. Les graisses servent à stocker de l’énergie à long
terme, qui servira d’énergie de dernier recours, à isoler les tissus du corps contre le froid
et à protéger et soutenir les organes vitaux.

3.3
Les phosphoglycérolipides sont constitués de deux acides gras, d’un Glycérol et d’un
groupement phosphate. Ils sont disposés de sorte qu’ils ont deux « queues », les acides
gras et une « tête » le groupement phosphate. Le Glycérol lie ces deux composantes
ensemble. Les PGL ont la caractéristique d’être à la fois hydrophobe et hydrophile : le
groupement phosphate possède une charge négative et peut donc énormément réagir
avec l’eau, tandis que les acides gras sont composés de d’hydrocarbures et donc
hydrophobe (H2O c’est polaire, alors que les hydrocarbures ne sont pas polaires). En
milieu naturel, ils s’assemblent en bicouche, les têtes hydrophiles vers l’extérieur et les
queues hydrophobes vers l’intérieur, de sorte que les queues se touchent et les têtes
sont aux extrêmes de cette paroi. Les PGL sont ainsi les composantes majeures des
membranes cellulaires, ils forment la barrière entre l’extérieur et l’intérieur de la cellule.

3.4
Le stéroides sont reconnaissables par leur squelette à quatre cycles carbonés liés à des
groupements fonctionnels variables. Le cholestérol est un stéroïde responsable de
fabriquer les hormones sexuelles (testostérone et œstrogène) et d’ajuster la fluidité des
membranes plasmiques animales

4. Protéines

4.1
Les protéines ont 8 fonctions

Protéines de Transport hémoglobine

Protéines réceptrices
Protéines enzymatiques
Protéines de Structures
Protéines de défence
Protéines d’entreposage
Protéines hormonales
Protéines contractiles
récepteur cellules
enzymes digestives
collagène, kératine
anticorps
ovoalbumine
insuline
actine et myosine

4.2
Les acides aminés sont composés d’un groupement amine (NH2) et d’un groupement
carboxyle liés ensemble par un carbone alpha qui est lui-même attaché à un hydrogène
ainsi qu’à une chaine latérale variable

4.3
Une chaine polypeptidique/ un polypeptide est un polymère d’acides aminés. Les acides
aminés sont liés entre eux par des liaisons peptidiques qui sont faites par
déshydratation. La chaine débute toujours par un groupement amine et termine
toujours par un carboxyle.

4.4
Pour former une protéine fonctionnelle, il ne faut pas seulement faire un polypeptide,
ce polypeptide doit avoir une forme tridimensionnelle spécifique à la protéine voulue.
Pour atteindre ce résultat final, trois ou quatre étapes sont nécessaires : 1. L’assemblage
de la chaine polypeptidique, ce qui forme la structure primaire. 2. La stabilisation de
certaines régions par des liaisons hydrogène entre des atomes d’hydrogènes et
d’oxygènes de la chaine polypeptidique, ce qui créé des structures hélicoïdales alpha et
des feuillets plissés beta. Cela forme la structure secondaire. D’autres liaisons entre les
chaines latérales des acides aminés se font ensuite et les groupements latéraux des
acides aminés non-polaires se replient vers le centre de la protéine pour ne pas entrer
en contact avec l’eau. Ces liaisons forment la structure tertiaire. La structure
quaternaire n’est d’usage que dans les plus grosses protéines dotées d’au moins deux
polypeptides. Les sous-unités vont ainsi faire des liens entre les chaines polypeptidiques.

4.5
La dénaturation des protéines est la perte des caractéristiques des protéines. La
protéine devient inactive par la destruction de sa conformation. Il ne reste plus que sa
chaine polypeptidique intacte, mais toutes les liaisons des 2e, 3e et 4e structures ne sont
plus présentes. La protéine n’est plus qu’un long fil d’acide aminés et ne peut plus
effectuer ses fonctions. La dénaturation survient lorsque son environnement change
drastiquement. Une variation de pH, de concentration de sels, de température de
produits chimique peut entrainer la dénaturation de la protéine.

4.6
Les enzymes sont des protéines catalytiques, leur rôle est d’accélérer diverses réactions
chimiques. Chaque enzyme possède une configuration spécifique qui lui permet de
transformer certaines molécules en d’autres. Elles ont toute un site actif, un endroit où
des substrats se posent et effectuent une réaction. Le site actif maintient les substrats
en place grâce à des liaisons covalentes, abaisse Ea et accélère la réaction désirée en
fournissant un microenvironnement propice, en exerçant de la pression sur les
substrats, en participant à la réaction et en maintenant les substrats en position propice.
Les substrats se transforment ainsi en produits et l’enzyme les libèrent pour
recommencer le processus avec d’autres molécules pareilles.

5. les acides nucléiques

5.1
Les acides nucléiques servent à emmagasiner l’information génétique, à la transmettre
et contribuent à son expression.

5.2
Un nucléotide est composé d’un pentose, d’un groupement phosphate et d’une base
azotée variable. Le pentose est soit du désoxyribose (ADN) ou du ribose (ARN) selon s’il
possède ou non un Oxygène sur le 2e carbone, si non, c’est un désoxyribose et si oui,
c’est un ribose. La base azotée peut varier entre les pyrimidines (C, T, U,) et les purines
(A, G). Plusieurs nucléotides assemblés ensembles donnent un polynucléotide, ce
polynucléotide est soit de l’Acide DésoxyriboNucléique, soit de l’Acide RiboNucléique.
L’ADN est une structure de 2 polynucléotides enroulés l’un autour de l’autre de façon
antiparallèle. Elle comporte les bases azotés A, C, G et T qui sont en couple A-T et C-G,
donc complémentaire. L’ARN ne possède qu’une chaine de nucléotides qui comporte les
bases azotés C, G et A comme l’ADN mais U au lieu de T.

6. Introduction au métabolisme

6.1
Le métabolisme est l’ensemble des réactions chimiques qui occurrent dans le corps,
c’est la chaine des réactions biochimiques d’un organisme, comprenant les voies
anaboliques et cataboliques qui transforment la matière en énergie. Le rôle du
métabolisme constitue à gérer les ressources énergétiques et matérielles de la cellule.
Les voies anaboliques sont les processus de synthèses des molécules, principalement
par déshydratation, ces processus requièrent de l’énergie. Les voies cataboliques font
l’inverse, elles décomposent des molécules complexes en molécules simple et libèrent
de l’énergie de la sorte.

6.2
L’ATP, ou adénosine triphosphate, est composé d’un pentose, de trois groupements
phosphates et d’adénine. Les groupements phosphate peuvent se détacher, ce qui
libère de l’énergie, lors de tels réactions, l’ATP devient de l’ADP, adénosine diphosphate.
L’ATP sert dans toutes les réactions cellulaires, c’est lui qui fournit ou encaisse l’énergie
dégagé ou absorbé lors de réactions et permet ainsi le mouvement de la vie. Après avoir
fourni de l’énergie, en s’hydrolysant, pour quelconque réaction anabolisante
endergonique, l’ATP se départit d’un phosphate qui devient inactif et devient elle-même
de l’ADP et cherche une réaction catabolisante exergonique pour emmagasiner l’énergie
afin de se lier par déshydratation avec un phosphate inactif pour redevenir de l’ATP

Bris+ liaison phosphate

Savoir comment former protéines, conformation, p90

Différence entre info importante et non-importante est un objectif du cours
On veut savoir le plus possible, pourquoi une liaison hydrogène permet d’arriver à une
structure tri-dimensionnelle.

Structure primaire : chaine spécifique d’acides aminés dans un ordre spécifique avec un
début et une fin, varie selon les protéines différentes

Structure tertiaire et quaternaire : pour la forme de la protéine

Tertiaire : gros plis pour faire une structure globulaire. Quelles forces permettent la
structure tertiaire, quelles forces plient la protéine. Se passe dans RE, traduction des
acides aminés, structure 1er, 2e, 3e et 4e.
Le plus gros travail est fait dans RE, Golgi peut modifier un peu, enlever un bout,
contrôle de qualité.