Université Cheikh Anta Diop

Ecole Supérieure Polytechnique

Département Génie Chimique et Biologie Appliquée

Fatou thiam Diaw

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 Objectifs du Chapitre: 2

▪Connaître les principaux groupes de

biomolécules contenus dans la cellule et
pouvoir les classer.

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▪ I. Généralités
▪ II. Constituants biochimiques de la
cellules eucaryote

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 Les molécules cellulaires

Composés organiques:
Composés inorganiques: ▪ Glucides
▪ Eau ▪ Lipides
▪ Sels ▪ Protéines
▪ Acides nucléiques

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I. Généralités

Le globe terrestre est composé surtout de

fer, d'oxygène, de silicium et de magnésium
(matière inerte).
Tous les êtres vivants sont composés
principalement de carbone, d'oxygène,
d'hydrogène et d'azote ( c'est pourquoi on
parle d'une unité chimique des êtres
vivants).
Ces éléments chimiques s'organisent pour
former des molécules (= assemblage de
plusieurs atomes) plus ou moins complexes.

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 I. Généralités

Les êtres vivants se caractérisent

par leur matière carbonée et
leur richesse en eau.
L’unité chimique des êtres
vivants est un indice de leur
parenté.

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La Cellule procaryote est ainsi constituée de:
70% d'eau
1% ions inorganiques
29% molécules organiques de tailles diverses : petites (~ 5%) et macromolécules (~ 30 %): ce
sont les biomolécules

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 Organisation des
molécules de la Vie

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 II. Constituants biochimiques de la
cellules eucaryote

les principaux constituants moléculaires de la

cellule sont:
▪ Molécules inorganiques
▪ L'eau et
▪ sels minéraux
▪ Molécules organiques
▪ Les glucides
▪ Les lipides
▪ Les protides
▪ Les acides nucléiques
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II. 1. L’eau

L'eau (H2O) est de loin la molécule la plus abondante

dans les cellules : la plupart des êtres vivants
contiennent en masse plus de 60% d'eau. Elle
intervient dans un grand nombre de réactions
chimiques cellulaires (hydrolyses par exemple).
D’un point de vue chimique, l’eau est caractérisée par
son moment dipolaire, qui lui permet d’établir des
liaisons électrostatiques avec les molécules chargées,
et sa forte capacité d’établir des liaisons hydrogènes.

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 L’eau
L’eau a une importance multiple dans les
cellules.
En premier lieu, le contenu cellulaire est
essentiellement aqueux, l’eau jouant un rôle de
solvant des molécules organiques et minérales
(comme les ions minéraux) présents dans les
compartiments intracellulaires.
Ce rôle de solvant est permis par les liaisons
que peut établir la molécule d’eau avec les
molécules solubles.
De même, d’autres molécules ne peuvent pas
établir de liaisons avec l’eau: ces molécules
Structure atomique de hydrophobes ont tendance à se regrouper entre
la molécule d'eau elles, « échappant » ainsi à l’eau.

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 Moins favorable
énergétiquement

Mauvais solvant des molécules

HYDROPHOBES
(car apolaires)

dans l’eau, ces molécules se

regroupent entre elles par
interaction hydrophobe
Plus favorable
énergétiquement

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Paradoxalement, la forte
présence d’eau permet donc
l’organisation de structures
basées sur des molécules
hydrophobes (ou partiellement
hydrophobes), comme la
membranes plasmique

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 II. 2. Les minéraux
Les sels minéraux: Calcium (Ca), Phosphore (P),
Potassium (K), Sodium (Na), Chlore (Cl), Magnésium (Mg). Ces
sels minéraux sont présents dans l’alimentation sous forme de
sels (Chlorure de sodium, phosphate de calcium), ils sont
essentiels au bon fonctionnement de l’organisme et à son
développement

Les oligo-éléments: Fer (Fe), Fluor (F), Zinc (Zn), Cuivre

(Cu), Sélénium (Se), Iode (Id), Chrome (Cr). Ils sont présents
dans les éléments en très petites quantités (teneur inférieure à 1 mg/kg de poids corporel)

et interviennent dans de nombreuses réactions chimiques.

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15
 II. 3. Les molécules organiques

Les molécules organiques peuvent

présenter des structures complexes
toutes constituées à l’origine de petites
molécules simples, que l’on peut
qualifier d’éléments unitaires.

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 a. Les Glucides (sucres)

Comme les autres molécules organiques étudiées par la suite (lipides,

protides, acides nucléiques), les glucides ou sucres sont des
assemblages plus ou moins longs et linéaires formés par
polymérisation de molécules élémentaires. Ces "sucres
élémentaires" sont appelés oses et contiennent trois types d'atomes :
C, H et O
2 catégories de sucres: sucres simples et sucres complexes

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18
Des sucres simples (sucres «rapides») sont de
petites molécules: glucose, fructose, galactose,
saccharose. Ce sont des molécules énergétiques

Des sucres complexes (sucres «lents») sont de

grosses molécules constituées de plusieurs sucres
simples assemblés, se sont souvent des formes de
mise en réserve du sucre: amidon chez les
végétaux, glycogène
chez les animaux, ce sont aussi les «fibres»:
cellulose

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 b. Les Lipides

Les lipides se définissent essentiellement par leurs

caractéristiques physiques: faible solubilité dans
l’eau (voire nulle), et solubilité dans les solvants
organiques apolaires (éther, acétone,
cyclohexane…).
Il existe deux types de lipides:
les lipides vrais (lipides simples et lipides
complexes)
les lipoïdes

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 Les lipides simples ou homolipides: ce sont des esters
d'acides gras et d'alcools.

Pour former un lipide

simple: l’acide gras
(saturés ou insaturés)
s’estérifie avec un
alcool formant ainsi des
esters d’acide gras

Acides
Gras

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L’alcool qui permet l’estérification
des AGs peut être le glycérol

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 Importance des lipides simples dans les
cellules: fonction de réserve (Triglycérides)

Tissu adipeux blanc :

1 = «vacuole» lipidique au
sein de l'adipocyte
2 = cytoplasme (très mince)
et noyau
3 = vaisseau sanguin
(artériole)
4 = collagène

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Triglycérides
dans les tissus
adipeux brun

24
 Les lipides complexes ou hétérolipides, constituants
des membranes biologiques s'organisant en bicouche.

25
Les lipoïdes, molécules liposolubles dérivées d'unités isoprène.
a) Les terpènes.

26
Les lipoïdes, molécules liposolubles dérivées d'unités isoprène.

b) Les stéroïdes (cholesterol).

Formule Représentation Liaisons avec les phospholipides au

développée schématique sein de la bicouche lipidique

27
Exemples de stéroïdes

28
 c. Les protéines
Les protéines sont le principal composant des cellules, représentant plus de
50% de leur poids sec.
La forme des protéines est très variable : elle va des longues fibres présentes
dans les tissus conjonctifs et les cheveux aux globules compacts et solubles
capables de traverser la membrane des cellules.
Les protéines sont des macromolécules dont le poids moléculaire varie de
quelques milliers à plus d'un million d'unités.
Elles sont spécifiques à chaque espèce vivante et à chaque organe. On estime
qu'il existe environ trente mille protéines différentes chez l'Homme, dont 2%
seulement ont été décrites. Les protéines servent à construire et à entretenir
les cellules, et leur dégradation chimique fournit de l'énergie, produisant près
de 4 kilocalories par gramme.

29
c. Les protéines
Les acides aminés sont les
constituants de base des protéines

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Les protéines se composent d'un enchaînement linéaire d'acides aminés liés par
des liaisons peptidiques. Cet enchaînement possède une organisation tridimensionnelle
(ou repliement) qui lui est propre. De la séquence au repliement, il existe quatre niveaux
de structuration de la protéine.

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 • Structure primaire

Il y a 20 acides aminés. On peut donc représenter

la structure chimique d’une protéine comme un
texte sur un alphabet de 20 lettre.
Exemple: l’insuline:

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKA

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 Structure secondaire
Une hélice alpha résulte de la
succession d'angles φ de -
57o et d'angles ψ de -47o.
Les feuillets beta (β-sheet en anglais) se forment quand des
parties de la longue chaîne polypeptidique se replient et se
longent l'une l'autre, côte à côte, en formant des pont
hydrogènes avec la voisine. On parle de feuillets beta
parallèles quand les chaînes vont dans le même sens et
d'antiparallèles quand elles vont dans des directions opposées.
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 Structure tertiaire

organisation supérieur aux hélices α ou

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aux feuillets β en sous-unités
 Structure quaternaire

La structure quaternaire d'une protéine multimérique est la manière

dont sont agencées les différentes chaînes protéiques, ou sous-unités,
à l'état natif les unes par rapport aux autres. 35
 d. Les acides nucléiques

L’ensemble formé d’un ose et d’une base azotée est un nucléoside.

L’ose est soit un ribose (un pentose à 5C), soit un désoxyribose.
Les cinq carbones de l’ose sont numérotés de 1 ’ (relié à la base
azotée) à 5’; le désoxyribose présente un hydrogène (H) sur son
carbone 2’.
La base azotée est une petite molécule organique comprenant un
cycle double (bases puriques: A et G) ou simple (base
pyrimidique: C, T, U) comprenant plusieurs atones d’azote. Elle est
fixée sur le C1’ par une liaison N-osidique.

Un nucléotide est ainsi un nucléoside phosphorylé par un

phosphate, sur le 5e carbone de l’ose (Ex. AMP: Adénosine
MonoPhosphate).
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Nucléosides et nucléotides

Base + sucre: liaison N-osidique

37
Nomenclature des unites nucléotidiques

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 Structure Secondaire
ADN : repliements
dans l’espace

Structure Primaire ADN: 39

séquence
Fin…

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