Biologie générale

Année universitaire 2023/2024 Pr. IBRAHIMI Manar

manar.ibrahimi@gmail.com

1
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Introduction

➢ La biochimie est la science qui étudie la structure et les propriétés des molécules
qui constituent les êtres vivants (glucides, protéines, lipides, …) et d'autre part, qui
étudie les réactions de transformations (métabolisme) de ces molécules : les
réactions de dégradation (catabolisme), et les réactions de biosynthèse
(anabolisme).

2
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Introduction

L'organisme est
constitué de milliers
d'espèces différentes de
molécules organiques et
minérales:

3
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.2 Les principaux éléments

Cellule

Composés inorganiques Composés organiques

Toutes les molécules sans squelette
fait d’atomes de carbones liés à de
l’hydrogène, par exemple le gaz
carbonique (CO2 ), l’eau (H2 O):
L’eau et les sels minéraux
Un composé chimique lorsqu’il
possède au moins un atome de
carbone lié au minimum à un atome
d’hydrogène:
Les glucides, lipides, protéines,
acides nucléiques

4
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.2 Les principaux éléments
Les éléments rencontrés dans le vivant

5
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Eau et sels minéraux

Teneur en eau de différents êtres vivants

6
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Eau et sels minéraux
a. Eau
➢ Substance incolore et transparente, molécules la plus abondante dans la
cellule (= 70% de sa masse).

➢ Elle est indispensable à la vie; le corps en contient plus de 60%. L'eau est
répartie différemment suivant les organes:
- Le liquide gastrique en contient 95 à 99%
- Les tissus comme les muscles 75 à 80%
- Le squelette 22%

➢ A l'intérieur de l'organisme, l'eau joue un rôle de transporteur. Elle

participe au maintien de l'homéostasie, elle est responsable de la
lubrification des muqueuses.
7
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Eau et sels minéraux
a. Sels minéraux

➢ Les éléments minéraux sont un ensemble d'atomes indispensables à la vie. Ils

interviennent dans de nombreuses activités de l'organismes telles que les
mouvements de l'eau, la contraction musculaire...
➢ Les sels minéraux représentent environ 5% de la composition chimique de la
cellule.
➢ Exemples:
▪ Tissu musculaire :6%
▪ Tissus osseux: 66%
➢ Les sels minéraux existent sous forme de cations et anions:
▪ Cations: Na+, K+, Ca2+
▪ Anions: Cl-, HPO4--, HCO3-
8
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.1 Eau et sels minéraux
a. Sels minéraux

➢ Selon les quantités mises en jeu dans l'organisme, les sels minéraux sont
couramment divisés en 2 groupes:
- les éléments principaux ou macroéléments: Ca, P, K, Cl, Na, Mg
- les éléments traces ou oligoéléments: Fe, Zn, Cu, Mn, I, Mo, etc.

9
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Glucides
a. Définitions

➢ Ce sont des macromolécules organiques formées de petites unités appelées

oses, contenant du carbone, l'hydrogène et de l'oxygène, ayant habituellement
la formule :

➢ Les glucides comportent:

➢ plusieurs fonctions alcool (-OH)
➢ soit une fonction aldéhyde (Aldose) / soit une fonction cétone (cétose)

10
3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Glucides

11
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.2 Glucides
b. Classification des glucides

Classification des glucides

Monosaccharides Disaccharides Polysaccharides

12
 Monosaccharides
Ce sont les glucides les plus simples avec une formule chimique constituée
d'un multiple de CH2O. Le plus connu est le glucose.
Glucose (C6H12O6)
Fructose (C6H12O6)
Galactose (C6H12O6)
Disaccharides
Les monosaccharides peuvent se lier deux à deux :

Saccharose :
glucose + fructose Saccharose + H2O

= réaction de condensation
(une molécule d'eau est libérée)

Maltose : glucose - glucose

Lactose : glucose - galactose
Polysaccharides
C’est l’association d’un grand nombre de monosaccharides
pour former des polymères.
polymères de glucoses (glu-glu-glu-glu….glu)
• Amidon
• Glycogène
• Cellulose
 Grain d'amidon

Cellule de pomme de terre

Petits sacs remplis d'amidon dans les cellules d'une

Chaque cellule végétale est entourée d'une paroi riche en pomme de terre. L'amidon a ici été coloré en bleu par de
cellulose. l'iode.
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.2 Glucides
c. Rôles des glucides

Energétique Structurale Reconnaissance

Lors de la dégradation des Entre dans la constitution Reconnaissance

glucides, il y a libération de des tissus entre les cellules
l'énergie

17
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Lipides
a. Définitions

➢ Les lipides sont une classe de molécules biologiques

qui comprennent divers composés hydrophobes, ce qui
signifie qu'ils sont peu solubles dans l'eau.
➢ Les lipides jouent un rôle crucial dans les organismes
vivants, remplissant diverses fonctions, notamment le
stockage d'énergie, la protection des organes, et ils
servent également de composants structurels des
membranes cellulaires.
18
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Lipides

a. Définitions

➢ Les lipides sont des molécules organiques hydrophobes, généralement

composées d'acides gras estérifiés avec un alcool

➢ Les acides gras sont de longues chaînes carbonées à nombre pair de carbones et
portant une fonction acide au niveau du carbone 1.

19
➢ La réaction d'estérification, qui est le processus par lequel les acides gras
sont estérifiés pour former des lipides tels que les triglycérides, peut être
représentée de manière générale comme suit :

Acide gras + Glycérol→ Triglycéride + Eau

➢ Dans cette équation chimique, un acide gras réagit avec le glycérol. Chaque
groupe carboxyle (-COOH) de l'acide gras réagit avec un groupe hydroxyle (-
OH) du glycérol, formant une liaison ester.

➢ Le résultat de cette réaction est la formation d'un triglycéride (un type de

lipidique), avec l'élimination d'une molécule d'eau en tant que sous-produit.
b. Classification des lipides

21
➢ La saponification est une réaction chimique transformant un ester, ici un
lipide, en ions carboxylate et un alcool, i.e. hydrolyse d'un ester en milieu
basique qui permet la synthèse du savon, d'où le nom du processus.

22
 3. Constituants chimiques de la cellule

c. Acides gras
➢ Ils constituent la majorité des lipides.
➢ Il s’agit d’une chaîne carbonée de longueur variable (donnant à la molécule son caractère
hydrophobe (gras) avec une fonction COOH (carboxy).
➢ Ce sont des chaînes d'hydrocarbures avec un groupe carboxyle à une extrémité.

23
 c. Acides gras

➢ Les acides gras (AG): sont de longues chaînes carbonées à nombre pair de
carbones et portant une fonction acide au niveau du carbone 1.

AG saturés AG insaturés
Ils ne comprennent que Ils portent au moins une
des simples liaisons. double ou triple liaison.

24
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Lipides
c. Acides gras

➢ Les acides gras peuvent

réagir avec une
molécule de glycérol
peuvent former un
triglycéride.

25
 3.3 Lipides

c. Acides gras

➢ Triglycéride= molécules
formées de 1 glycérol lié
à 3 acides gras

26
 3.3 Lipides
b. Classification des lipides

Dans la catégorie des lipides à base d’acides gras, on retrouve les acides gras eux-mêmes, ainsi
que deux familles nommées lipides simples et lipides complexes.

Lipides simples Lipides complexes

(C;H;O) (C, H, O, P, S, oses,...)
Glycérides Lipides phosphorés
Stérides Lipides soufrés
Cérides Lipides azotés
▪ Glycérides: sont des esters d'AG et de
glycérol
▪ Stérides: sont des esters d'AG et des stérols
(exemple de stérol: cholestérol)
▪ Cérides: sont des esters d'AG et d'alcool de
27
longue chaines latérales
Stéride = molécules formées d'un squelette de 4 cycles de carbone (noyau stérol).
Le plus connu =
cholestérol (animaux
seulement)
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.3 Lipides

d. Rôles des lipides

▪ les lipides se présentent dans les cellules comme:

- Eléments de structure : les lipides sont à la base des structures de toutes les
membranes cellulaires.
- Eléments de réserve énergétique : ils sont les éléments fondamentaux de
réserves sous forme de triglycérides au niveau du tissu adipeux.
- Eléments de la signalisation cellulaire : Étant donné que les lipides sont de
petites molécules insolubles dans l'eau, ils sont d'excellents candidats pour la
signalisation cellulaire.

29
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines
a. Définitions

➢ Les protéines sont des macromolécules organiques formées de CHON et parfois de

S, P, S.. et constituées d'une succession d'acides aminés.

➢ Les cellules sont en grande partie constituées de protéines, qui représentent plus

de la moitié de leur poids sec.

➢ Nombre d'acides aminés est restreint = peptide

➢ Nombre d'acides aminés > 50 = protéines

30
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines

b. Classification des protéines

Protéines simples Protéines complexes

Uniquement des acides
aminés Acides aminés + partie non protéique
Exemples:
partie glucidique: Glycoprotéine
partie lipidique: Lipoprotéine

31
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines

C. Acides aminés
Un acide aminé ou aminoacide est un composé comportant toujours une chaîne carbonée
plus ou moins longue, une fonction acide carboxylique (-COOH) et une amine (-NH 2 ). Dans
les acides aminés, qui constituent les peptides et protéines, ces deux fonctions sont
supportées par le même carbone, noté carbone α, d’où le terme d’acides α aminés.

32
Il y a 20 sortes différentes d'acides aminés
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines

C. Acides aminés

➢ La première étape de la formation d’une protéine est la polymérisation des acides

aminés:
➢ Le groupe carboxyle d’un acide aminé se lie au groupe amine d’un autre acide, ce qui
libère une molécule d’eau.
➢ La liaison qui se forme entre les acides aminés est appelée liaison peptidique, d’où le
« polypeptide » tire son nom.

34
 3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines
Liaison peptidique:

35
 d. Structures des protéines

La structure des protéines est définie à plusieurs niveaux : primaire, secondaire, tertiaire et
quaternaire.

36
La protéine assemblée se replie pour former une structure
tridimensionnelle précise:
 3. Constituants chimiques de la cellule

d. Structures des protéines

Structure primaire d’une protéine
La structure primaire d’une protéine est la séquence d’acides aminés reliés dans une
chaîne polypeptidique. Les acides aminés sont maintenus en place par des liaisons
peptidiques.

38
 Exemple : le lysosyme
129 acides aminés

1er acide aminé (Lysine)

129e acide aminé (Leucine)

Structure primaire de la protéine = ordre dans lequel sont

placés les acides aminés.
 3. Constituants chimiques de la cellule

d. Structures des protéines

Structure secondaire d’une protéine

La structure secondaire d’une protéine est constituée par les formes d’hélice alpha et
de feuillet bêta prises par une chaîne polypeptidique. La structure secondaire est
maintenue en place par des liaisons hydrogène.

40
 Hélice alpha ou feuillet bêta

➢ La chaîne polypeptidique peut prendre deux

formes : hélice alpha ou feuillet bêta.

➢ Une hélice alpha est une forme enroulée en

spirale.

➢ Un feuillet bêta est une forme pliée et plate.

➢ Les structures secondaires sont maintenues
ensemble par des liaisons hydrogène.

41
 Certaines parties de la protéine peuvent adopter une forme régulière
= structure secondaire:

Feuillet bêta

Hélice alpha

42
 3. Constituants chimiques de la cellule

d. Structures des protéines

Structure tertiaire d’une protéine
La structure tertiaire d’une protéine décrit la disposition tridimensionnelle des hélices
alpha et des feuillets bêta d’un polypeptide. La structure tertiaire est maintenue en
place par différentes liaisons covalentes et non covalentes.

43
Feuillets bêta

Hélices alpha

Acétylcholinestérase
44
 3. Constituants chimiques de la cellule

d. Structures des protéines

Structure quaternaire d’une protéine
La structure quaternaire d’une protéine est constituée de plusieurs polypeptides
repliés dans leur structure tertiaire et liés. La structure quaternaire est maintenue en
place par différentes liaisons covalentes et non covalentes.

45
46
3. Constituants chimiques de la cellule
3.4 Protéines

e. Rôles des protéines

47
 3. Constituants chimiques de la cellule

3.5 Acides nucléiques

Voir cours Elément 2 : Noyau interphasique

48