Informations générales sur la session

• Debut des cours: 1ere semaine du mois de septembre 2023

• modalités d'enseignements: Virtuelle sur la plateforme Zoom/
Google meet.
• 2 crédits / semaine
• Evaluations
– devoir de recherche 10%
– Quizz #1: 4eme semaine du mois de septembre : 10%
– Quizz #2: 4eme semaine du mois d'octobre: 10%
– Quizz #3: 4eme semaine du mois de Novembre: 10%
– Examen final: 60%
Généralités sur le métabolisme
Dr Estinfil Jean-Yves
Pré-réquis
• Cours de Chimie Générale et organique
• Notions en biochimie Structurale
• notions en biologie Moléculaire et Cellulaire
Quid Biochimie métabolique???
la biochimie est la discipline à l’interface de la biologie et de la
chimie.

Carl Neuberg est ainsi souvent désigné comme le père de la

biochimie moderne. La biochimie est la discipline scientifique
qui étudie la composition de la matière vivante ainsi que les
réactions chimiques permettant le maintien de la vie.
Cette discipline peut être divisée en trois spécialités qui,
combinées les unes avec les autres, permettent de mieux
comprendre les caractéristiques extraordinaires du vivant :

1) la biochimie structurale est consacrée à l’étude des

structures chimiques des molécules (acides nucléiques,
protéines, glucides, lipides, vitamines, ions…) qui constituent les
êtres vivants ainsi que leurs fonctions et interactions ;
2) la biochimie génétique (souvent nommée biologie moléculaire)
s’intéresse plus particulièrement aux molécules et aux réactions
chimiques permettant la transmission et l’expression du message
génétique responsable du maintien des caractéristiques des
organismes au cours du temps et des générations ;

3) la biochimie métabolique, qui inclut la thermodynamique et

l’enzymologie, étudie quant à elle les réactions chimiques
aboutissant à la synthèse, par les organismes vivants, des
molécules qui les constituent ainsi qu’à la production d’énergie
nécessaire à la vie.
objectifs
a la fin du cours, les étudiants devraient etre capable de:
• comprendre le metabolisme basal de l'organisme
• connaitre l'importance du metabolisme dans la regulation de
l'organisme.
Plan du cours
• Généralités sur le metabolisme
– Anabolisme
– catabolisme
• Les composants fondamentaux du métabolisme
• le metabolisme des cellules
• les voies métaboliques
• les biomolécules
• conclusion
Le métabolisme
Classiquement, le métabolisme est défini comme l'ensemble des
réactions chimiques au sein d'un organisme.

Ces réactions permettent la dégradation et la synthèse de

molécules appartenant aux trois lignées glucidique, lipidique et
protidique ainsi que l'extraction et l'utilisation d'énergie à
partir de celles-ci.
Le métabolisme
Les moyens mis en œuvre par le métabolisme se
nomment :
• activité – réactivité ;
• interdépendance.
Metabolisme-Activité
Elle est non seulement basique par nécessité de maintenance de
la structure de l'organisme, mais également adaptative tant
générale que régionale ou locale envers toutes les sollicitations
de la dynamique du vivant.
Metabolisme-Reactivité
Elle permet de répondre à tout événement métabolique
perturbateur afin de préserver la stabilité de la structure de
base de l'organisme et, au besoin, de mettre en place de
nouvelles conditions de stabilité dans le but de maintenir in
fine son unité structuro-fonctionnelle.
Métabolisme-Interdépendance
Le métabolisme constitue un réseau de réactions chimiques
strictement coordonnées dans lequel les activités de chaque cellule
répondent à ses besoins. Chaque activité se définit non seulement
par l'ensemble des caractéristiques qui la délimite,
ce qui pourrait tendre à l'isoler, mais surtout par les liens qu'elle
entretient avec les autres activités présentes dans la cellule.

C'est précisément cette spécificité qui la rend participante à

l'activité cellulaire globale, d'où, outre cette notion de fonction,
celle d'unité cellulaire qui se voit dès lors intégrée en un ensemble.
Dualité catabolisme – anabolisme : aspect
apparent du métabolisme
l'activation métabolique se manifeste sous cet aspect en conjuguant
deux phases :
• l'une de mobilisation : le catabolisme qui regroupe les réactions de
recrutement et de libération des éléments énergétiques et moléculaires;
• l'autre de construction et/ou de reconstruction :l'anabolisme qui
regroupe les réactions de synthèse moléculaire, consommatrices
d'énergie.
Ces deux fonctions, intimement dépendantes l'une de l'autre, sont
indissociables dans leur enchaînement : il ne peut y avoir d'anabolisme
sans catabolisme et inversement.
Dans cette dualité permanente :
• la phase catabolique apparaît première en tant
que préparatrice de la phase anabolique ;
• le caractère second de la restauration anabolique témoigne de
l'orientation permanente de l'organisme vers la restitution ad
integrum. Cette recomposition est une activité fondamentale
au sens plénier du terme, car témoignant de la constante
volonté de maintien de la structure.
Ce cycle catabolisme – anabolisme signifie en effet pour
l'organisme une obligation de maintien par le renouvellement
permanent de sa structure.
Les composants fondamentaux du
Métabolisme
Eau
Principal composant métabolique dans l'organisme, l'eau y est
présente dans tous ses secteurs – intra, péri et extracellulaire –
alors que ses propriétés physico-chimiques rendent compte de
son exceptionnel pouvoir de solubilisation pour un grand
nombre de substances tant organiques qu'inorganiques.
Oxygène
La plupart des réactions chimiques d'un organisme habitant,
temporairement, la planète Terre nécessite la présence de
l'oxygène et s'effectue ainsi en aérobiose. En effet, des quatre
types de réactions chimiques (oxydoréduction, hydrolyse – dés-
hydratation, transfert de groupements chimiques et synthèse),
la première est la plus importante pour l'extraction et le
transfert d'énergie au niveau cellulaire : l'oxygène présente ainsi
un rôle majeur dans la fourniture énergétique.
Lignée glucidique
Le glucose, monosaccharide, est le glucide clé car :
• précurseur dans la synthèse de tous les autres
glucides.
• principal carburant métabolique, voire exclusif
pour le cerveau et le fœtus
• la quasi-totalité des glucides d'origine alimentaire se voit
transformée en glucose ; par ailleurs, un grand nombre de
composés non glucidiques, car lipidiques et protidiques,
s'avèrent glucoformateurs.
les voies métaboliques
Le métabolisme s’effectue par étapes: une voie métabolique est
une succession de réactions biochimiques qui s’enchaînent, le
produit d'une réaction étant lui-même transformé à son tour, et
ainsi de suite.

Chaque réaction nécessite l’intervention d'une macromolécule

appelée enzyme qui catalyse la réaction. Or les enzymes sont
des produits de l'expression des gènes. Ainsi, le métabolisme
dépend de l'équipement spécialisé des cellules, qui différé selon
les cellules et les organismes.
Certaines molécules sont impliquées dans plusieurs voies
métaboliques. Elles constituent alors des « plaques tournantes»
permettant l'interconnexion des voies métaboliques. C'est par
exemple le cas du glucose.

Ce produit de la photosynthèse est aussi le métabolite dégradé

lors de la respiration cellulaire, ou lors de la fermentation
alcoolique.Il intervient également comme matière première
dans la synthèse de macromolécules comme l'amidon, le
glycogène, la cellulose, ou encore d'autres molécules organiques
Les métabolismes sont donc complémentaires: la respiration des
êtres vivants serait impossible sans la photosynthèse réalisée
par les plantes.

Ainsi, les cellules des êtres vivants échangent de la matière et de

l'énergie entre eux et avec leur environnement.
L'ensemble des réactions du métabolisme cellulaire constituent
des voies interconnectées entre elles. Par leur métabolisme, les
êtres vivants échangent de la matière et de l'énergie avec leur
milieu et avec d'autres organismes.
Les biomolécules
Une biomolécule est une molécule qui participe au métabolisme
et à l'entretien d'un organisme vivant, par exemple les glucides,
les lipides, les protéines, l'eau et les acides nucléiques.

Les biomolécules, « bios » signifiant vie en grec, comprennent

les acides aminés, les lipides, les acides nucléiques, les protéines,
et les glucides.
les acides aminés
Les acides aminés (ou aminoacides) sont une classe de
composés chimiques possédant deux groupes fonctionnels : à la
fois un groupe carboxyle –COOH et un groupe amine –NH2.

Les acides α-aminés jouent un rôle fondamental en biochimie

comme constituants élémentaires des protéines : ils se
polymérisent en formant des liaisons peptidiques
qui aboutissent à de longues chaînes macromoléculaires
appelées peptides :
les lipides
Les lipides sont une classe hétérogène de molécules qui ont en
commun les caractéristiques suivantes :
• ce sont des substances d'origine biologique
• elles sont très peu solubles dans l'eau mais solubles dans des
solvants organiques comme l'éther, le chloroforme, le
méthanol, l'hexane…
• Les lipides ont un rôle essentiel comme constituant des
membranes biologiques (cholestérol, phospholipides,
glycophospholipides).
• Ils constituent la structure de certaines hormones (hormones
stéroïdes) et de certaines vitamines.
les Acides nucléiques
Les acides nucléiques sont des polymères dont l’unité de base,
ou monomère, est le nucléotide. Ces nucléotides sont reliés par
des liaisons phosphodiester.

Il existe deux types d’acides nucléiques : l'acide

désoxyribonucléique (ADN) et l'acide ribonucléique (ARN).
L’ADN contient l’information génétique. L’ARN est la copie de
l'ADN (souvent en un seul brin alors que l'ADN est une double
hélice =
deux brins)
les protides
Une protéine est une macromolécule biologique composée
d’une ou plusieurs chaînes d'acides aminés liées entre elles par
des liaisons peptidiques (chaine polypeptidique).

En général, on parle de protéine lorsque la chaîne contient un

grand nombre d’acides aminés, et de peptide pour des
assemblages de petite taille
les glucides
Les glucides constituent le groupe des composés organiques les
plus abondants dans la nature. Synthétisés essentiellement par
les végétaux, ils constituent pour les organismes hétérotrophes,
une source énergétique de premier ordre.

Les glucides sont aussi appelés sucres. Leur nom se termine en

général par le suffixe "ose" (ex: Saccharose qui est le sucre de
table, glucose, maltose, lactose, cellulose, ...)
les glucides
• Les oses, ou monosaccharides, sont les plus simples des
glucides. Ce sont des polyalcools portant une fonction
aldéhyde ou cétone voisine d'une fonctionalcool, non
hydrolysables et doués d'un pouvoir réducteur. Ils ont pour
formule brute : Cn(H2O)n.

• Les osides sont les polymères d’oses, La classification des

osides est basée sur deux éléments essentiels : la présence ou
non d'un groupement aglycone de nature non glucidique et le
nombre de molécules d'oses constituant l'oside
les glucides
Les glucides sont également connus sous les noms suivants, qui
désignent habituellement des groupes spécifiques de glucides
• sucres
• glucides simples et complexes
• amidon résistant
• fibres alimentaires
• prébiotiques
• sucres intrinsèques et ajoutés
Les glucides représentent une partie essentielle de notre
alimentation. Plus important encore, ils fournissent à notre
corps l’énergie nécessaire pour exécuter ses fonctions les plus
évidentes, telles que se déplacer ou penser, mais également les
fonctions “en arrière-plan”, celles que nous ne remarquons la
plupart du temps même pas.
Les glucides décomposés principalement en glucose sont la
source d’énergie préférée de notre corps, étant donné que les
cellules dans notre cerveau, dans nos muscles et autres tissus
utilisent directement les monosaccharides pour couvrir leurs
besoins énergétiques.
Les glucides sont l’un des trois macronutriments dans notre
alimentation et, en tant que tels, ils sont essentiels au bon
fonctionnement de l’organisme. Ils se produisent sous
différentes formes, allant des sucres, en passant par les amidons
et jusqu’aux fibres alimentaires, et sont présents dans beaucoup
d’aliments que nous consommons.
Points Clés
• le metabolisme est l'ensemble des reactions chimiques qui se
produisent dans l'organisme.
• il presente une phase anabolique et une phase catabolique;
ces deux phases sont interdependantes.
• le metabolisme est possible grace à des composants tels l'eau,
l'oxygène, la lignée glucidique et d'autres biomolécules
nécessaires aux bons fonctionnements du corps.