Cours d’épidémiologie de base

Faculté de Médecine/Université Quisqueya

Année 2023

Karine Sévère, MD, MS, MPH

DU Prise en Charge de la Douleur
DU Pédagogie en Sciences de la Santé
1
 Objectifs
 Objectif pédagogique global: Connaître les principes de l’analyse d’un signal pouvant représenter une
menace de santé publique et savoir le signaler aux autorités compétentes. . .

 Objectifs pédagogiques détaillés.

– Citer les repères historiques de la SE
– Comprendre le concept et l’importance de la SE
– Savoir repérer dans la pratique clinique les événements pouvant représenter une menace pour la santé publique
– Savoir initier l’analyse de ces événements de santé dans une perspective de contrôle et d’alerte
– Savoir orienter et prendre les premières mesures nécessaires
– Connaître les structures à alerter
– Savoir alerter les structures internes à l’établissement et les autorités compétentes
– Expliquer les étapes de la SE
– Discuter de la qualité d’un système de SE
– Lister les pathologies à déclaration obligatoire en Haïti

2
 Historique
Fin 1600: Analyse des rapports de mortalité dans la préparation des planifications des plans de santé (Von Leibnitz)

1700 Les statistiques sont utilisées en Europe pour décrire des phénomènes de santé

1600-1700 Les certificats de décès utilisés comme indicateurs de l’état de santé d’une population

1800- 1900 • Analyse les données pour faire avancer les politiques en matière de santé publique (Farr)
• Plusieurs pays demandent aux médecins de rapporter sur des pathologies spécifiques pour activer les
préventions locales et contrôler certaines activités comme la mise en quarantaine de certaines personnes
exposées à certains vecteurs
1800-1900 Rapports de mortalité et de morbidité pour faire des corrélations avec les conditions de vie (Shattuck)

Fin 1800 Aux États-Unis et en Europe les médecins sont de plus en plus contraints de rapporter certains cas de maladie
communicables aux autorités sanitaires locales comme le choléra, la tuberculose, la peste.
1925 Tous les états des États-Unis commencent à participer au rapport national de morbidité

1935 Première enquête sur la santé est conduite aux États-Unis

1943 Les registres sur le cancer sont établis au Danemark

Années 1960 La surveillance est utilisée pour cibler les campagnes de vaccination pour la variole menant à l’éradication de la
maladie
L’OMS agrandit son concept de surveillance pour inclure une variété de problèmes de santé publique au-delà des
maladies infectieuses
Années 1980 Introduction des ordinateurs permet une meilleure décentralisation de l’analyse des données

1990-2000 L’internet est de plus en plus utilisé pour la transmission et le rapport des données 3
 Définition
« Collecte continue et systématique, l’analyse et l’interprétation de
données de santé essentielles pour la planification, la mise en place et
l’évaluation des pratiques en santé publique, étroitement associée à la
diffusion en temps opportun de ces données à ceux qui en ont besoin.

L’étape finale du cycle de la surveillance est l’application de ces données

au contrôle et à la prévention des maladies et accidents»

Thacker SB. Surveillance. In : Gregg MB, editor. Field Epidemiology New

York: Oxford University Press, 1996:16-32.

4
 La surveillance épidémiologique
 Pourquoi ?
 Suivre des tendances
 Décrire le phénoméne de santé au niveau collectif
 Détecter l’émergence de phénomènes représentant un danger pour la
santé publique

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 La surveillance épidémiologique
 But:
 Afin de mettre en place rapidement les investigations complémentaires
appropriées
 Limiter la diffusion du phénomène
 Contribuer à l’évaluation des politiques de contrôle et de prévention
 Suggérer des hypothèses pour la recherche

 Implications :
 Système continu
 Processus standardisé
 Construit en fonction des besoins définis à priori
 Résultats utiles au moment où le décideur en a besoin 6
7
 Qu’est-ce qu’un système?
Un système de surveillance est un réseau de :
• Personnes
• Activités
qui peuvent fonctionner sur le plan local et international

Personnes
Matériaux,
Intrants Equipements Extrants
Normes,
Procédures,
Pratiques

Ensemble organisé et structuré permettant la transformation d’une

“matière première” en un “produit fini” 8
 Importance
 Localement: bases pour identifier les personnes qui ont
besoin de:
 Traitement
 Prophylaxie
 Education

 Plus largement: informer sur la direction de la politique des

programmes de santé publique

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Système de surveillance:
Objectifs
 Alerter Urgences sanitaires

 Décrire Importance et tendance

 Évaluer Impact de la lutte

 Chercher Axes de recherche 10

Alerter
 Détecter les problèmes nécessitant une intervention
d’urgence :
 Dépassement d’un seuil épidémique
 Cas groupés
 1 cas d’une pathologie rare et grave
 Problèmes émergents
 Changements dans les pratiques de santé

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 Signal d’alerte: événement de santé ou d’exposition à un risque
infectieux pouvant révéler une situation d’alerte et qui nécessite une
investigation afin de le valider et de le considérer ou non comme une
alerte.

 Alerte: situation pour laquelle un jugement a été porté suite à une

expertise sur le fait qu’elle menace potentiellement la santé publique.

 Epidémie: regroupement temporo-spatial de cas d’une maladie ou

syndrome jugé comme supérieur à ce que l’on attend.
12
 Signal

Evaluation du signal

Menace pour la
Santé Publique

Investigations

Interventions
13
14
Les sources de signaux
 Maladies à déclaration obligatoire (MDO)
 Le signalement
 déclaration obligatoire
 infecions nosocomiales
 d’événements inhabituels par cliniciens, microbiologistes, vétérinaires…
 Centres nationaux de référence (CNR)
 Réseaux de surveillance volontaire
 Surveillance non spécifique et syndromique:
 activité des services de santé,
 mortalité générale et spécifique [grippe]…
 surveillance syndromique à partir des services d’urgence
 Alertes Européennes: réseaux Européens
 Veille internationale institutionnelle
 Rumeurs 15
Sensibilité vs spécificité de l’alerte
 Alerter à bon escient
 Ne pas rater d’alertes graves !
 Ne pas alerter à tort
 Trop d’alerte tue l’alerte !
 Intérêt de l’approche signal/alerte/action qui permet un filtrage
déductif mais nécessite une organisation
 Sinon tendance « à être noyé » de signaux
 Les ressources ne sont pas illimitées

16
 Critères d’analyse d’un signal d’alerte

 Gravité  Caractère inhabituel-inattendu

 Mode de transmission
 Nombre de cas
 Cas groupés
 Sévérité,
 Survenue dans une région inhabituelle
 Décès
 Forme clinique inhabituelle
 Épidémie
 Gravité inhabituelle
 Foyers multiples
 Echec thérapeutique, résistance aux
anti-infectieux
 Echec vaccinal
 Malveillance ?
17
 Décrire
➢ Identifier les populations à risque

➢ Déterminer les facteurs de risque

➢Identifier et quantifier la distribution et la tendance des maladies et

de leurs agents

18
19
Changement de Pratique

20
 Evaluer
 Evaluer les programmes de prévention et contrôle:
 Programme de vaccination
 Programme de lutte antipaludique
 Prévention des maladies à transmission sexuelle

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22
23
24
 Chercher
➢ Emettre et tester des hypothèses
➢ Identifier des axes de recherche
➢ Evaluer de nouvelles méthodes de lutte
➢ Élaborer de nouvelles méthodes d’analyse

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Guider
➢ Diffuser les données sur les maladies et la mortalité

➢ Promouvoir l’utilisation des données

➢ Définir des priorités pour les programmes

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Champs
 La morbidité et la mortalité

 La surveillance sérologique

 La surveillance du biotype et du biotope

 La surveillance des interactions biologiques

 La surveillance de l’apparition d’agents nouveaux

27
Détection des cas
 Définition du cas

 Caractéristiques du sujet

 Identification de la source de déclaration

28
29
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Collecte des données
• Détection des cas

• Notification des cas

• Confirmation des cas

31
Notification du cas

32
33
Sources d’information
 Professionnels de santé
 Laboratoires d’analyses biologiques et médicales
 Systèmes d’information hospitaliers
 Services de police
 Certificats de décès
 Service d’immigration et de protection sanitaire
 Services vétérinaires
 Résultats d’enquêtes
 Centres de références
34
 Les systemes de surveillance: Etudes de 1morbidite
• Systeme des malladies a declaration o,bligatoiire : recueil exhaustif de donnees
permettant une analyse de la situationet de !'evolutionde 31 maladies en France
• Resultats de llabo,ratoire : Centres nationaux de reference (C NIIR), Reseaux de
1

laboratoires
• Reseaux sentiinelllles : m1edecins generalistes volontaires pour reperer le debut et
le developpement d'une epidem1ie (IEx : Groupe regional d'observation de la grippe,
GIROG)
• Registres : pour estimer !'incidence d'une pathologie, rechercher des FdlR et
evaluer les interventions de sante publique
• Systemes de surveillance sp,e,cifique : reseau de surveillance des TMS,
1

surveillance des maladies acaractere professionnel ; pour actualiser l'etat des

connaissances sur une pathologie
• Donnees des bas,es,medico-administratives, : (ExI: IPMSI, DonneesAm1eli,...)
• Grandes, cohortes (Ex : Constances) : grandes plateformes epidemiologiques
1

pour constituer un panorama de la sante, etudier les evolutions des indicateurs

ainsi que les comi0rbidites.
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Stratégies
 Surveillance directe / indirecte

 Surveillance exhaustive / sentinelle

 Surveillance active /passive

36
 Surveillance directe / indirecte
 Surveillance directe
 Recueil de données spécifiquement mis en place pour
répondre aux objectifs de la surveillance
 Maladies à déclaration obligatoire
 Surveillance indirecte
 Utilisation de données d’observation
 Causes médicales de décès

 Registres
 Utilisation de statistiques administratives
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 Surveillance exhaustive / sentinelle

 Surveillance exhaustive:
 Recherche de tous les cas dans l'ensemble de la population
 Maladies graves ou peu fréquentes

 Surveillance sentinelle (échantillon):

 Ensemble d’institutions ou de praticiens qui notifient
régulièrement
 Maladies fréquentes ou peu graves

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 Surveillance active /passive
 Surveillance Passive
 Les sources informent sans relance
 Maladies à déclaration obligatoire
 Surveillance Active
 Recueil des données auprès des sources par le niveau
central
 Registres, suivi de cohorte
 Surveillance Semi-active
 Les sources notifient mais relance périodique
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Comparaison des stratégies

Active Passive

Simplicité - +

Réactivité + -

Représentativité ++ +/-

Coût + -
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Comparaison des stratégies

Sentinelle Exhaustive
Simplicité + -
Réactivité + -
Représentativité - +
Coût - +

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 Analyse
 Vérifier la qualité des déclarations :
 Exhaustivité
 Complétude

 Analyse descriptive de l’information :

 Taux d’incidence.
 Eliminer les principaux facteurs de biais.
 Non-respect des critères de définition.
 Erreurs de calcul.
 Changements de personnel.
 Mouvements de population
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 Analyse
 Les données collectées par les systèmes de surveillance
fournissent des informations descriptives concernant le lieu
et le temps ou un problème de santé est présent et qui est
affecté

 Les systèmes de surveillance fournissent les paramètres

épidémiologiques de base: quand? Où? Qui?

 Brainstorming 43
Temps
 Comparaison du nombre de cas dans un intervalle de temps donné (semaine, mois)
 Ou nombre de cas cumulé à différents moments d’une même année
 Tendances séculaires, cycliques, saisonnières
 Dénominateurs pour calculer les taux

Lieu
 Identifier Origine et cause des cas
 Lieu d’apparition et lieu d’exposition à la maladie
 Utilisation de taux

Personnes
 Groupes affectés
 Caractéristiques démographiques, socio-économiques, comportements
 Calcul des taux
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Analyse
 Formulation d’hypothèses :
 Cas notifiés > cas attendus
 Regroupement de cas
 Sous-groupe plus à risque

 Enquêtes complémentaires:
 Enquêtes transversales
 Approche cas-témoins
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Diffusion
 Systématique et régulière :
 Rétro-information
 Professionnels de santé, les médias, la population

 Adaptée :
 à la situation :
 Téléphone, Télégramme, Téléinformatique, Bulletins, Rapports
 aux destinataires : => Lisibilité et concision.
 Faits observés. Interprétation des faits. Recommandations

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Diffusion
Objectifs :
 Améliorer le niveau de connaissances
 Maintenir le niveau de motivation des participants +++
 Animer le réseau de surveillance
 Pour gestion, planification et prise de décision

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Potentiel de propagation:
 Mode de transmission
 Contagiosité de personne à personne
 Résevoir animal
 Source commune
 Aérienne à diffusion large
 Aliment contaminé en circulation
 Dispositif contaminé
 Lien avec déplacement des personnes et des biens
 Capacité à faire face
 Capacité diagnostique
 Capacité de prise en charge
 Capacité à appliquer les mesures de contrôle
 Capacité à communiquer 48
MESI.ht

49
50
Critères de Qualité d’un système SE
 Simplicité Info minimal
 Flexibilité/Souplesse Facile à modifier
 Acceptabilité Par les sources d’info
 Sensibilité Identifie tous les cas
 Valeur prédictive positive Proportion de cas réels
 Représentativité Description correcte TLP
 Réactivité Capable de donner l’alerte

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 Critères de choix d’un système SE
 Considérations internationales (OMS)
 Intérêt des secteurs
 Incidence annuelle
 Gravité
 Potentiel de Propagation
 Poids socio-économique
 Prévention possible
 Possibilité d’influence sur les politiques de santé
 Perception de risque
 Changements dans les tendances dans les 5 dernières années

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Facteurs d’efficience
 Motivation et qualification des acteurs
 Définition des cas uniformes
 Mécanismes de signalement clairs et simples
 Systèmes de communication et de gestion des données
fonctionnelles
 Support au laboratoire de base et de référence
 Réactivité
 Budget suffisant

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 Mise en place d’un système
 Justification
 Objectifs
 Population surveillée
 Sources et mécanismes de collecte de données
 Type de surveillance désirée
 Plan d’analyse (standards, indicateurs, fréquence, méthodes)
 Flux des données
 Rétro-information

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La surveillance en Haïti
 La surveillance passive
 Utilisation de registres standardisés
 Uniformité des formulaires de rapport
 Acheminement des rapports

 La surveillance active

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56
57
58
59
60
 Maladies sous surveillance
Alerte Précoce Alerte différée
Coqueluche Fièvre Typhoide
Dengue hémorragique Dengue
Méningite méningococcique Décès par Malaria
Paralysie Flasque aigue Syndrome ictérique fébrile
Rage Tétanos
Rougeole Tétanos néonatal
Diphtérie VIH SIDA
Charbon
(CoVid-19)
Choléra
Tout phénomène anormal 61
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63
64
65
66
67