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BIOTECHNOLOGIE : mot qui désigne l'utilisation au sens large des propriétés du vivant à des fins

pratiques et industrielles.

Une Cellule : C’est un mini réacteur de quelque microns microréacteur avec des milliers de
catalyseurs appelés enzymes

Procédés alimentaires : Procédés pharmaceutiques :

•fromage, pain, yaourts, •Antibiotiques

• Boissons bière, vins, jus de fruit, saké • Vitamines

• Amidons et sucres • Hormones

•Enzymes • Vaccins

Procédés énergétiques : Procédés chimiques :

• Méthane • Matières premières pour l'industrie chimique

• Ethanol • Polysaccharides

• Hydrogène

Environnement : Transformation de biomasse renouvelable :

• Stations de boues activées • Valorisation de produits cellulosiques,

• Filtres bactériens. • Valorisation de sous produits agroalimentaires.

 un être vivant :C'est une structure qui présente les caractères suivants:

Une organisation,La croissance et le développement,L'existence d'un métabolisme,La reproduction

 Cellules eucaryotes : avec noyau et d'autres organites tous limités par une membrane,
 Cellules procaryotes sans noyau ni tout autre compartiment interne limité par une
membrane.

CELLULES EUCARYOTES En gênéral 1000 à 10000 fois plus grandes que les cellules procaryotes.

 Le noyau:délimité par une enveloppe nucléaire contient l’ADN sous forme de chromosomes
où est stockée l’information génétique.
 Le cytoplasme: limité par la membrane plasmique qui contrôle les échanges entre la cellule
et son environnement
 Enveloppe nucléaire :C'est une zone différenciée du réticulum endoplasmique avec lequel
elle est en continuité. Elle isole du cytoplasme l'ADN nucléaire et les protéines associées.
 Lysosomes Et endosomes, c'est un ensemble très polymorphe de vésicules et de vacuoles
contenant des enzymes lytiques.
 Appareil de Golgi C'est un ensemble de saccules, les dictyosomes, lieux de synthèse et de
modification des glucides et des glycoprotéines et sorte d'ateliers de « finition » et «
d'emballage » pour certains produits du métabolisme cellulaire ( grains de sécrétion )
 Les bactéries Ce sont des cellules sphériques ou en forme de bâtonnets de quelques microns
( 0,5 à 3 um ).
 Les bactéries peuvent se répliquer rapidement en se divisant simplement en 2, ce
phénomène est appelé « Scissiparité ». Dans les conditions optimales, une seule cellule peut
se diviser toutes les 20 mn et donner naissance à 4 milliards de cellules en moins de 11
heures
 Les mucoplasmes Ce sont des microorganismes de diamètre 0,1 à 0,3 um, qui mènent une
existence de parasite des cellules animales ou vegetales.
 Les virus Ce sont des entités plus petites que les bactéries ( environ 10 m ) . Leur parenté
avec le monde vivant est lointaine puisqu'ils sont incapables de se reproduire par leurs
propres moyens.
 Pour se reproduire, ils doivent obligatoirement injecter leur matériel génétique à une cellule
eucaryote ou procaryote qui effectuera les synthèses qu'il faut, conformément à
l'information reçue.
 Adénovirus Ce sont des virus qui s'attaquent aux bactéries.
 Rétrovirus Ce sont des virus très allongés en forme de baguette creuse de longueur 3000 Å
et de diametre 170Å
 Le rétrovirus type est le virus de la mosaïque du tabac ( V.M.T.)
 Une bactérie contient 3.10^3 espèces différentes de protéines et 10^3 espèces différentes
d'acides nucléiques,
 L'homme contient 5 10^6 espèces différentes de protéines.
 Comme on connaît environ 10^6 organismes vivants différents, on a presque :
o 10^11 protéines différentes,
o 10^10 acides nucléiques différents

Principales biomolécules :

L'eau est le solvant universel de la matière cellulaire. C'est un solvant idéal des substances polaires
et ioniques et le milieu où s'effectuent la plupart des réactions métaboliques de la cellule. La
dissociation de l'eau et sa participation aux réactions acide-base sont fondamentales pour les
fonctions des protéines et des acides nucléiques.

L'eau est le résultat de la combinaison de deux atomes d'hydrogène à un atome d'oxygène.

2(H+) +O—>H2O

L'hypothèse d'une hybridation sp3 des orbitales atomiques de l'oxygène O en présence d'une
répulsion entre les deux doublets électroniques restant libres de l'oxygène O, pernet d'interpréter la
structure quasi-tétraédrique/ décrivant bien la molécule d'eau réelle.

INTERACTIONS HYDROPHILES ET HYDROPHOBES

Les substances participant aux liaisons hydrogène de l'eau sont donc hydrophiles et relativement
solubles dans l'eau. En revanche, les substances dites hydrophobes sont contraintes par l'eau à se
regrouper afin de minimiser leur action de rupture sur le réseau des liaisons hydrogène de l'eau.

Les molécules apolaires interrompent le réseau des liaisons hydrogène de l'eau. Elles sont donc
hydrophobes et totalement insolubles dans l'eau.
LES GLUCIDES

D'origine surtout végétale, les glucides, ou sucres, résultent de l'activité photosynthétique des
végétaux. Ils forment un ensemble de substances très variées allant de petites molécules à de
macromolécules de très grande taille.

Certaines de ces substances représentent la principale source d'énergie des cellules animales et
végétales : Soit immédiatement utilisable (glucose), Soit sous forme de réserve ( amidon, glycogène,
dextranes ).D'autres jouent un rôle structural ( cellulose, chitine,.)ou de reconnaissance cellulaire.

Les glucides répondent à la formule générale (CH2O)n et sont ainsi dénommés hydrates de carbone.
Ils peuvent être classés en OSES qui sont des Monosaccharides et en OSIDES qui sont des produits de
condensation de monosaccharides donnant des Oligosaccharides ou des Polysaccharides.

Les Oses : Ce sont des sucres simples appelés aussi monosaccharides, non
hydrolysables,cristallisables,très solubles dans l'eau, mais peu solubles dans les solvants organiques,
ayant une saveur sucrée plus ou moins forte.

Les oses sont des polyalcools (présence du groupe hydroxyle-OH) dom l'une des fonctions alcool est
oxydée soit en fonction aldéhyde : classe des ALDOSES, soit en fonction cétone : classe des CETOSES.

La présence d'un carbone asymétrique ou Chiral dans le Glycéraldéhyde donne deux isomères, qui
sont des images l'un de l'autre dans un miroir. Ils ont les mêmes propriétés chimiques et ont donc le
même nom, mais n'ont pas les mêmes propriétés physiques et sont alors distingués par le préfixe D
ou L ce sont donc 2 énantiomères. Selon la position du OH porté par le carbone asymétrique. Le
mélange équimolaire de ces 2 formes constitue une solution racémique. L’aldotétrose possédant 4 C
donne 2 configurations D et 2 configurations L.

Les aldopentoses ont 3 carbones asymétriques donnant par conséquent 8 stéréoisomères. Le plus
important est le D-Ribose qui est un constituant des acides nucléiques.

Parmi les 16 hexoses possibles de formule chimique C6H1206, 3 seulement existent naturellement et
sont : Le Glucose, Le Mannose, Le Galactose.

Les Cétoses

Le cétose le plus simple est le Dihydroxyacétone Comme dans le cas des aldoses, il y a des cétoses de
la « série D» et des cétoses de la « série L ».Le principal des cétoses a 6 atomes de carbone : C'est le
Fructose. On trouve également un cétose à 7 atomes de carbone : C'est le Sédoheptulose jouant un
rôle important dans le métabolisme glucidique.

Structure cyclique des oses


C'est sous forme cyclique que se présentent les oses dans les structures biologiques.
La cyclisation des molécules d'oses est due à l'interaction de la fonction Aldéhyde ou Cétone avec
une molécule d'eau H2O ou un groupement hydroxyle OH d'une fonction alcool pour former un
composé d'addition interne du type hémi-acétal.
Dans la molécule de glucose par exemple, les angles interatomiques dans la chaîne carbonée sont
tels qu'ils peuvent permettre une sorte de fermeture sur elle-même de la molécule amenant le
groupement aldéhydique à réagir avec la fonction alcool portée soit par le carbone n°5, soit par le
carbone n°4.
Le cycle formé est ainsi
● Hexagonal, du type d'un corps organique, le pyranne, c'est la forme
pyrannose. Le pont oxvdique formé est (1 - 5 ).
● Pentagonal, du type du furanne c'est la forme furannose. Le pont oxydique formé est (1 - 4
● La forme pyrannose est la plus fréquente chez les hexoses
● La forme furannose chez les pentoses.
La formation du cycle transforme le carbone n°1 de l'aldose ou le carbone n°2 du cétose en carbone
asymétrique conduisant pour l'ose à la formation de 2 diastéréoisomères. Ces deux formes, appelées
a et B, sont des isomères optiques mais non des énantiomères car elles ne sont pas image l'une de
l'autre dans un miroir. On leur donne le nom d'anomères car elles ne diffèrent que par la
configuration des substituants du carbone n°1 pour l'aldéhyde et du carbone n°2 pour la cétone :
● Quand l'hydroxyle anomérique OH est en position Trans par rapport au
groupement CH20H excèdentaire, c'est l'anomère a ,
● Quand c'est en position Cis, c'est l'anomère B.
En fait, les formes stables des oses à l'état libre sont pyranniques. Les cycles hexagonaux
correspondants ne sont pas plans mais adoptent dans l'espace des formes « chaise » ou « bateau »
avec une prédominance de la forme chaise qui est plus stable dans le cas du D-glucose.
Les Osides
* Ce sont des polymères obtenus par condensation de plusieurs molécules d'oses. On distingue alors
● Les Holosides:
Qui sont formés par la réunion exclusive d'oses et classés suivant le nombre n d'oses qui entrent
dans leur constitution:
diholesides,triholosides, tétraholosides, ...
➔ Si n < 10 , Ce sont des Oligoholosides ou Oligosaccharides (chaînes courtes).
➔ Si n > 10 , Ce sont des Polyholosides ou Polysaccharides ( chaînes longues)
● Les Hétérosides :
Oui sont formés par la réunion d'oses et d'autres substances de nature non glucidique appelées
Aglycone ( protéines, lipides, ...).
Liaison Osidique
Les osides sont des composes dans lesquels l'hydroxyle du groupement hémiacétalique du carbone
anomérique d'un ose a été condensé avec un groupement hydroxylique ( alcool ou phénol ). La
liaison qui relie l'ose à l'alcool ou au phénol est appelée Liaison O-Osidique ou
Glucosidique.L'hydrolyse de cette liaison Osidique peut se produire:
en milieu acide, /sous l'action d'enzymes Hydrolases ou Osidases
★ Les osidases présentent principalement 2 types de spécificité :
Elles sont spécifiques d'un radical osyl donné, Elles sont spécifiques d'une configuration anomérique
donnée ( a-Glucosidase, B-Glucosidase,)
● Les Holosides
DISACCHARIDES:
➢ Le Maltose :
C'est un disaccharide constitué de 2 molécules de glucose :
Dans le maltose la liaison osidique est du type & (1-4). Il existe aussi un isomère du maltose qui est
l'Isomaltose dont la liaison osidique est du type a (1 - 6 )
Maltose et Isomaltose n'existent pas à l'état libre, ce sont le produit d'hydrolyse de polyosides (
glucogène, amidon )
➢ Le Lactose :
C'est le sucre du lait, un disaccharide constitué de B-galactose et de glucose. Il est aussi le seul
disaccharide réducteur existant à l'état libre.
➢ Le Cellobiose:
C'est le produit de dégradation de la cellulose, c'est un disaccharia constitué de 2 molécules B-
glucose
Le Cellobiose est hydrolvsable par une B-glucosidase. Une telle
enzyme n'existe nos 0se S les sucs digestifs de l'homme et de ce fait la cellulose n'est pas un aliment
pour l'homme
➢ Le Saccharose:
C'est le sucre ordinaire ou sucrose, abondant dans la betterave et la canne à sucre et composé de a-
glucose et B-fructose. Il n'est pas réducteur comme les disaccharides précédents.
● POLYSACCHARIDES:
➢ L'Amidon:
C'est un polysaccharide très, répandu dans le monde végétal et y constitue la principale réserve
glucidique ( sous forme de graines : blé, maïs, riz,
L'Amidon ( PM : 10^6-10^8) associe deux types de polymères : l'Amylose et l'Amylopectine, dans des
proportions variable selon l'origine de l'amidon.
➔ L'Amylose:
C'est un enchaînement linéaire non ramifié d'unités D-glucose ( 200 à 4000 résidus ) unies par des
liaisons Osidiques a(1-4)
➔ L'Amylopectine:
ou tsoamylose, c'est un enchaînement d'uités D-glucose unies par des liaisons a(1-4) avec
ramification par des liaisons a(1-6)
➢ Le Glucogène:
C'est le polysaccharide de réserve chez les animaux où il se présente sous forme de sphères appelées
particules-B, principalement dans le foie, les muscles et le cœur des mammifères.
Sa structure est semblable à celle de l'amylopectine mais compte davantage de ramifications a(1-6)
car elle est pius arborescente ( PM ~10^7)
➢ La Cellulose:
C'est un composant principal des parois cellulaires des plantes et de certains champignons. C'est un
biopolymère constitué de longues chaînes dans lesquelles des résidus BD-glucose ( 2000 à 3000 )
sont reliés par des liaisons B(1-4). Le Cellobiose est d'ailleurs considéré comme l'unité ou le
monomère constitutif de la Cellulose.
Si les liaisons a(1-4) dans l'amidon tendent à former des hélices qui ne peuvent que s'apparier pour
former des doubles hélices en tout, les liaisons B(1-4) forment des feuillets étirés en rubans pouvant
former de gigantesques réseaux suite aux liaisons hydrogène et hydrophobes entre résidus de
chaînes voisines.
Il résulte -que les molécules de Cellulose s'associent en faisceaux à des échelles de plus en plus
grandes, chaque niveau d'association faisant appel aux faisceaux ( fibrilles ) formés au niveau
inférieur
Rubans>Microfibrilles>Fibrilles>Fibres
➢ Les Dextranes :
Ce sont des polysaccharides élaborés par divers bactéries. Ils résultent de la condensation d'unités
aD-glucose suivant des liaisons a(1-6) avec des branchements a(1-4) ou a(1-3).
➢ FRUCTOSANES:
L'Inuline :
C'est un biopolymère constitué presque exclusivement de fructose et d'un peu de glucose. Les
molécules de fructose sont liées par des liaisons B(2-1).
L'Inuline constitue la réserve d'hydrate de carbone dans les racines des plantes.
Le Levane:
Ce sont des chaînes d'environ 20 résidus fructose reliés par des liaisons B(2-6) et terminés par un
résidu glucose. Le Levane se trouve dans les feuilles d'herbage.
❖ Les Hétérosides
GLUCOPROTEINES:
Association avec une partie protéique par liaison O-osidique avec un aminoacide ayant une fonction
OH libre ou par liaison N-osidique avec un aminoacide ayant une fonction NH2 libre.
GLUCOLIPIDES :
Association d'une partie glucidique ( pôle hydrophile ) et d'une partie lipidique ( pôle hydrophobe )
par liaison covalente.
NUCLEOTIDES:
S. Association d'un ose ( le D-ribose ou le 2-desoxy-D-ribase ) et d'une
base azotée ( pyrique ou pyrimidique ) par liaison N-osidique.
COENZYMES:
Ceratins Coenzymes renferment des molécules d'oses dans leur structures.
Les lipides : Le terme Lipides désigne les matières grasses, huileuses ou cireuses, extraites
des organismes vivants. Ce sont des composés de structure très variable caractérisés par
leur: INSOLUBILITE dans l'EAU, SOLUBILITE dans les SOLVANTS ORGANIQUES ( Benzène,
Chloroforme, Ether, Toluène, )
Les Lipides remplissent de nombreuses fonctions biologiques: -Réserves importantes de
combustible pour la cellule/Précurseurs de métabolites spécifiques récepteurs ou
modulateurs du métabolisme ( hormones, vitamines)/Composants majeurs des
biomembranes/Barrières protectrices et isolantes ( contre la déshydratation, les infections,
la chaleur, les agressions physiques ).
Composition chimique :
Lipides Complexes (saponifiables): -Glycérides : esters d'acides gras et de
glycérol/Phosphoglycérides : lipides contenant une molécule de glycérol et une molécule de
H3P04 ( acide phosphorique )/Sphingolipides : lipides contenant une molécule de
sphingosine/Cires : alcools gras supérieurs ou esters d'acides gras et de monoalcools (alcools
aliphatiques ou stérols )/Glycolipides : lipides contenant des sucres.
Lipides Simples (insaponifiables): -Terpènes/Stéroïdes/Prostaglandines.
Rôle biologique:
-Lipides de réserve : glycérides/Lipides des membranes cellulaires : phospholipides,
stéroides/glycolipides, sphingolipides./Lipides de revêtement : cires
Les Acides Gras (AG ) : Ce sont des Acides Monocarboxyliques, généralement à nombre pair
d'atomes de carbone et à chaîne linéaire. Mais il existe également des Acides Gras à nombre
impair d'atomes de carbone et à chaîne ramifiée.
Propriétés physiques des AG:
-insolubles dans l'eau/solubles dans les solvants organiques.
La solubilité est d'autant plus importante que le nombre de carbones (C)
ou de doubles liaisons ( = ) est élevé.
-Plus l'AG est saturé plus son point de fusion est élevé. Il est solide à la température
ambiante ( c'est le cas du beurre riche en AG saturés ).
-Plus l'AG est insaturé plus son point de fusion est bas. Il est liquide à la température
ambiante ( c' est le cas de l'huile riche en AG insaturés ).
Propriétés Chimiques des AG :
-Reagissent avec la SOUDE ou la POTASSE /Forment des SELS ou SAVONS solubles dans l'eau
c'est la SAPONIFICATION./Les AG réagissent aussi avec les ALCOOLS pour donner des ESTERS.
Quant aux AG Insatures :
-Ils peuvent fixer des atomes ( Br, CI, I, H)
-Ils sont facilement oxydables à l'air ( rancissement des huiles d'oi emploi d'antioxydants
pour la conservation).
On distingue les groupes suivants:
AG Aliphatiques Saturés :
• ChH2n02
AG Aliphatiques Insaturés:
• monoéthéniques : CnH2n-202 • diéthéniques: ChH2n-402 *triéthémiques : ChH2n-602
• tétraéthéniques : CnH2n-802
Les AG Naturels Insaturés sont sous forme CIS qui est moins stable et plus réactive que la
forme TRANS.
Lipides Complexes
Les Glycérides :
Ce sont des composés obtenus par ESTERIFICATION des fonctions
ALCOOLS du GLYCEROL avec les AG.
On distingue des MONO, DI et TRIGLYCERIDES. Ces derniers constituent la forme habituelle
de stockage des AG cellulaires.
De point de vue structure spatiale des GLYCERIDES, les 3 chaînes d'AG se disposent
symétriquement dans l'espace formant entre elles un angle de 120°
Les Phosphoglycérides
Ce sont des DIACYLGLYCERIDES dans lesquels la fonction Alcool du Glycérol est estérifiée par
l'ACIDE ORTHOPHOSPHORIQUE ( H;PO4 ).
Les ACIDES résultants sont des acides forts car la fonction acide de l'acide phosphorique qui
estérifie le Glycérol est la fonction la plus faible.
Les Sphingolipides :
Ce groupe diffère des phosphoglycérides par la présence de la SPHINGOSINE a la place du
Givcérol. La Sphingosine ou SPILINGENINE est un ALCOOL AMINE comportant une double
Liaison.
Dans les Lipides à base de Glycérol, les liaisons entre les Acides Gras et le Glycérol sont des
liaisons ESTER. Ici, par contre, c'est une liaison AMIDE qui relie les Acides Gras à la
SPHINGOSINE, formant ainsi un CERAMIDE
Lipides Simples
Les Terpènes: Ce sont des dérivés dont l'unité moléculaire de base est l'ISOPRENE
PERHYDROCYCLOPENTANOPHENANTRENE:
Co composé consiste en Quatre Cycles ( notés de A à D.) fusionnes ensemble, les atomes
étant numérotés ainsi qu'il est indique sur la figure. De nombreuses variations sont alors
possibles, qui affectent :
-d'une part le nombre et la position des doubles liaisons.
-d'autre part la nature des groupes substitués,
et donnent naissance à une grande variété de molécules aux propriétés biologiques très
diverses.
Les sterols :
Les Stérols, caractérisés par un groupe hydroxyle OL en C3 et divers autres groupes en Cit,
sont très répandus. Le Stérol le plus abondant chez les animaux est le CHOLESTEROL
Cholesterol :
Le Cholestérol est un constituant important de la membrane plasmique.
Il est aussi le précurseur des hormones stéroides, de la vitamine D et des seis biliaires.
Les PROTEINES sont des molécules trop grosses; ce sont des MACROMOLECULES dont la masse
molaire varie de 6000 à plus d'un million. Elles sont des constituants cellulaires essentiels qu'on
trouve dans tous les organismes vivants à des taux variables mais bien importants. représentent
l'expression du patrimoine génétique

Leur rôles : Régulateurs-Catalyseurs-Transporteurs-Eléments de structure-Eléments contractiles-


Récepteurs de message.

Elles représentent donc l'expression phénotypique sélective du génotype de laquelle dépend la


spécialisation tissulaire.
Au plan chimique, les PROTEINES sont composées de Carbone, d'Oxygène, d'Hydrogène, d'Azote et le
plus souvent de Soufre.

Les PROTEINES sont des Polymères d'AA monomères. La diversité infinie des PROTEINES est le
résultat de la combinaison de ces 20 AA accolés l'un après l'autre et de la multiplicité de telle
séquence.

Classes de PROTEINES: -Les HOLOPROPTEINES : qui sont des protéines simples composées
uniquement d'AA,

-Les HETEROPROTEINES : qui sont des protéines conjuguées composées d'AA et d'AUTRES
SUBSTANCES.

Les Acides Aminés sont des Acides Organiques qui portent un groupement fonctionnel

AMINE (-NH2 sur le carbone porteur du groupementCARBOXYLE (-COOH ) dit CARBONE α.

Les Acides Aminés AA répondent donc à la formule générale :

A l’exception de la proline qui est un acide imine.

Le groupement R est appelé Chaîne Latérale ou Résidu et est spécifique à chaque AA. Ils donnent aux
AA leur degré de polarité, d'hydrophobicité, leur caractère acide, basique ou neutre en solution dans
des conditions de pH physiologiques. Un Acide Aminé ( AA ) est habituellement désigné par un
SYMBOLE a 3 lettres: Lysine = Lys; Arginine = Arg;

Propriétés physiques et chimiques des AA : les AA absorbent dans la lumière UV. L'absorption varie
avec la longueur d'onde. Cette variation constitue le Spectre d'Absorption.

Le Carbone o des AA est toujours asymétrique sauf pour la Glycine. Il en résulte que les AA sont actifs
sur la lumière polarisée et qu'ils existent donc sous 2 formes énantiomères D et L. A de rares
exceptions, ce sont les AA de forme L qui sont assimilés par les organismes vivants.

C'est le pH de demi-dissociation (un pH où les concentrations s'égalisent). Il indique la facilité avec


laquelle la dissociation a lieu.

Il y a également un pH où l'AA se comporte comme une substance ELECTRIQUEMENT NEUTRE, c'est à


dire qu'il ne migre pas dans un champ électrique : C'est le POINT ISOELECTRIQUE [AA+]=[AA-]

La molécule AA +ou- n'a pas de charge électrique nette sur la molécule: il s'agit de la FORME
ISOELECTRIQUE ou ZWITTERONIQUE présente à pH ISOELECTRIQUE. Au Point Isoélectrique, le pli,
correspond à la demi-somme des deux pk entourant la forme électriquement neutre

Les peptides : sont formés par des ENCHAINEMENTS d'AA liés entre eux par des liaisons appelées
LIAISONS PEPTIDIQUES.

On désigne un PEPTIDE en commençant toujours par l'AA dont l'AMINE est LIBRE ( Extrémité N-
terminale ) et en terminant par lAA dont le CARBOXYLE est LIBRE ( Extrémité C-terminale).

Il existe également une valeur de pH où Charges Négatives et Charges positives équivalentes


s'annulent, c'est le POINT ISOELECTRIQUE. L'ensemble des PROTEINES, des PETITS POLYPEPTIDES et
des A4 isolés constitue LES PROTIDES

Structure des protéines : Structure primaire : La succession des AA liés par la Liaison Peptidique
constitue le squelette de la Chaîne Polypeptidique.
Structure Secondaire : Elle traduit l'existence de Structures Répétitives (motifs successifs) résultant
des interactions entre AA appartenant à une même chaîne ou à des chaînes différentes.

L'étude de la configuration spatiale des atomes mis en jeu dans la liaison Peptidique montre que les
Quatre Atomes du Groupe sont situés dans un même plan, et que l'Oxygène et l'Hydrogène sont
toujours en position TRANS par rapport à la Liaison C-N.La valeur très élevée de l'énergie minimale
qu'il faut fournir pour observer une rotation autour de la Liaison Peptidique (20 kcal) confirme la
Planéité du Groupe Peptidique toujours observée, à l'état cristallin comme en solution : la Liaison
Peptidique est STABILISEE PAR RESONANCE.

II EXISTE des POSSIBILITES de ROTATION AUTOUR des LIAISONS Ca-C et N-Ca.

Les conformations particulièrement stables correspondent aux situations où les molécules sont
disposées de manière à former le maximum de LIAISONS HYDROGENE entre un donneur N-H d'un
groupe peptidique et un accepteur, l'Oxygène C-0, d'un autre groupe peptidique

CONFORMATION EN HELICE α :Les plans peptidiques successifs s'enroulent autour d'un axe, faisant
entre eux un angle de 100%, et sont translatés de 1,5 A le long de l'axe.

L'hélice comporte 360 / 100 = 3,6 AA par tour, le pas de l'hélice étant 1,5 x 3,6 = 5,4 A.

Les groupes C=0 et N-H peptidiques sont sensiblement parallèles à l'axe de l'hélice, dans une
disposition favorisant le maximum de Liaisons Hydrogène. Les Résidus R sont disposés à l'extérieur
de l'hélice. Les hélices α d'aminoacides de la série L ont un pas à droite. Mais chaque fois que la
PROLINE (ou l’HYDROXYOPROLINE) apparaît dans la chaîne peptidique, elle interrompt l'hélice et
crée une courbure de la chaîne.

CONFORMATION EN FEUILLET β :La chaîne polypeptidique a une forme en zig-zag, relativement


étendue. deux groupes peptidiques successifs étant séparés par 3,5 A dans la direction de la chaîne.

Plusieurs chaînes sont associées par des Liaisons Hydrogène entre C=0 d'une chaîne et N-il d'une
autre, l'ensemble prenant l'aspect d'un FEUILLET PLISSE. Les Résidus R sont disposés de part et
d'autre des plans zigzagants du feuillet plissé, les liaisons CaR étant parallèles.

Structure Tertiaire :C'est le REPLIEMENT d'une chaîne polypeptidique déjà ordonnée en STRUCTURE
SECONDAIRE. C'est une organisation dans l'espace qui confère à une protéine sa forme et ses
propriétés biologiques ( structures compactes et extrêmement enroulées ). Dans cette forme repliée
( ou état natif), les régions hydrophobes sont enfouies à l'intérieur de la molécule et non présentées
à sa surface, ou elles seraient en contact avec le milieu aqueux.

Structure Quaternaire : Ce terne désigne l'arrangement et le regroupement dans l'espace des


chaînes polypeptidiques des protéines possédant plus d'une chaîne.Très souvent l'activité biologique
n'existe qu'au niveau de l'OLIGOMERE qui est le petit polymère constitué de deux ou plusieurs
chaînes polypeptidiques séparées en sous-unités Les Liaisons qui unissent les sous-unités et
définissent ainsi la STRUCTURE QUATERNAIRE sont du type faible dont les effets s'ajoutent. Ceci ne
peut se produire que si les surfaces des sous-unités (monomères polypeptidiques ) présentent une
certaine complémentarité

Filament d’actine : L'hélice protéique d'ACTINE contient un double brin de sous-unités protéiques
globulaires dans lequel chaque sous-unité établit un contact avec 4 autres sous-unités.

L'hélice protéique de COLLAGENE est composée de 3 chaînes protéiques allongées qui s'entreiacent
sur une longue distance pour donner une structure en bâton très solide.
Des sous-unités protéiques globulaires assemblées en réseau hexagonal peuvent former un feuillet
plat ou un tube. C'est le cas de l'enveloppe protéique cylindrique qui constitue le virus de la
mosaïque du tabac (VMT) en enfermant tout simplement sa logue et unique molécule d'ARN

Classification des Protéines : Selon la FORME

Selon la Conformation Tridimentionnelle, on distingue

* Les Protéines FIBREUSES : Appelées SCLEROPROTEINES, ce sont des protéines où la structure en


FEUILLET B prédomine. Elles sont INSOLUBLES ( Fibroine, Kératine ).

*Les Protéines GLOBULAIRES: Appelées aussi SPHEROPROTEINES en raison de leur forme OVOIDE.
Elles sont généralement PLUS SOLUBLES.

selon la SOLUBILITE : *Les ALBUMINES : Ce sont les protéines les PLUS SOLUBLES dans l'EAU.

* Les GLOBULINES: Qui sont SOLUBLES dans des Solutions SALINES Diluées.

* Les PROTAMINES et Les HISTONES : Ce sont des protéines BASIQUES de faibles Poids Moléculaires.
Elles sont SOLUBLES.

*Les PROLAMINES et Les GLUTELINES: Ce sont des protéines VEGETALES. Elles sont INSOLUBLES
dans l’EAU mais SOLUBLES dans les Solutions ACIDES et BASIQUES Diluées.

*Les SCLEROPROTEINES: Oui sont INSOLUBLES dans l'EAU ou dans les Solutions ACIDES et BASIQUES
( Actine, Myosine, Fibroine, Kératine, Collagène ).

Selon la COMPOSITION : Les protéines sont de deux types

*Les HOLOPROTEINES : Qui ne contiennent que des AA

* Les HETEROPROTEINES: Qui contiennent en plus de la chaîne polypeptidique, une partie NON
protéique appelée GROUPEMENT PROSTHETIQUE qui est lié à la protéine par une Liaison
Covalente.Dans cette classe très hétérogène on distingue :

§ Les PHOSPHOPROTEINES : Oui contiennent de PACIDE PHOSPHORIQUE estérifiant les


fonctions ALCOOL de la SERINE et de la THREONINE ( Caséine ).

Les GLYCOPROTEINES : Qui contiennent un RESIDU GLUCIDIQUE ( Protéines Membranaires ).

§ Les LIPOPROTEINES : Certaines protéines sont liées à des LIPIDES par des Liaisons Van der
Waals ou des Liaisons Ioniques ( Protéines Membranaires )

Les CHROMOPROTEINES: Ce sont des protéines COLOREES dont le GROUPEMENT


PROSTHETIQUE est un ATOME de Fe, Ca ou Mg ( Hémoglobine, Cytochromes,Catalase, Peroxydase).

Les Enzymes Ce sont des Protéines Spécialisées dans la CATALYSE des REACTIONS BIOLOGIQUES.
Certaines ENZYMES ne doivent leur ACTIVITE qu'à leur
STRUCTURE PROTEIQUE tandis que d'autres nécessitent en outre des Structures Non Protéiques ou
COFACTEURS. Le Cofacteur peut être un ION METALLIQUE encore appelé COENZYME

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