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pratiques et industrielles.
Une Cellule : C’est un mini réacteur de quelque microns microréacteur avec des milliers de
catalyseurs appelés enzymes
•Enzymes • Vaccins
• Ethanol • Polysaccharides
• Hydrogène
un être vivant :C'est une structure qui présente les caractères suivants:
Cellules eucaryotes : avec noyau et d'autres organites tous limités par une membrane,
Cellules procaryotes sans noyau ni tout autre compartiment interne limité par une
membrane.
CELLULES EUCARYOTES En gênéral 1000 à 10000 fois plus grandes que les cellules procaryotes.
Le noyau:délimité par une enveloppe nucléaire contient l’ADN sous forme de chromosomes
où est stockée l’information génétique.
Le cytoplasme: limité par la membrane plasmique qui contrôle les échanges entre la cellule
et son environnement
Enveloppe nucléaire :C'est une zone différenciée du réticulum endoplasmique avec lequel
elle est en continuité. Elle isole du cytoplasme l'ADN nucléaire et les protéines associées.
Lysosomes Et endosomes, c'est un ensemble très polymorphe de vésicules et de vacuoles
contenant des enzymes lytiques.
Appareil de Golgi C'est un ensemble de saccules, les dictyosomes, lieux de synthèse et de
modification des glucides et des glycoprotéines et sorte d'ateliers de « finition » et «
d'emballage » pour certains produits du métabolisme cellulaire ( grains de sécrétion )
Les bactéries Ce sont des cellules sphériques ou en forme de bâtonnets de quelques microns
( 0,5 à 3 um ).
Les bactéries peuvent se répliquer rapidement en se divisant simplement en 2, ce
phénomène est appelé « Scissiparité ». Dans les conditions optimales, une seule cellule peut
se diviser toutes les 20 mn et donner naissance à 4 milliards de cellules en moins de 11
heures
Les mucoplasmes Ce sont des microorganismes de diamètre 0,1 à 0,3 um, qui mènent une
existence de parasite des cellules animales ou vegetales.
Les virus Ce sont des entités plus petites que les bactéries ( environ 10 m ) . Leur parenté
avec le monde vivant est lointaine puisqu'ils sont incapables de se reproduire par leurs
propres moyens.
Pour se reproduire, ils doivent obligatoirement injecter leur matériel génétique à une cellule
eucaryote ou procaryote qui effectuera les synthèses qu'il faut, conformément à
l'information reçue.
Adénovirus Ce sont des virus qui s'attaquent aux bactéries.
Rétrovirus Ce sont des virus très allongés en forme de baguette creuse de longueur 3000 Å
et de diametre 170Å
Le rétrovirus type est le virus de la mosaïque du tabac ( V.M.T.)
Une bactérie contient 3.10^3 espèces différentes de protéines et 10^3 espèces différentes
d'acides nucléiques,
L'homme contient 5 10^6 espèces différentes de protéines.
Comme on connaît environ 10^6 organismes vivants différents, on a presque :
o 10^11 protéines différentes,
o 10^10 acides nucléiques différents
Principales biomolécules :
L'eau est le solvant universel de la matière cellulaire. C'est un solvant idéal des substances polaires
et ioniques et le milieu où s'effectuent la plupart des réactions métaboliques de la cellule. La
dissociation de l'eau et sa participation aux réactions acide-base sont fondamentales pour les
fonctions des protéines et des acides nucléiques.
2(H+) +O—>H2O
L'hypothèse d'une hybridation sp3 des orbitales atomiques de l'oxygène O en présence d'une
répulsion entre les deux doublets électroniques restant libres de l'oxygène O, pernet d'interpréter la
structure quasi-tétraédrique/ décrivant bien la molécule d'eau réelle.
Les substances participant aux liaisons hydrogène de l'eau sont donc hydrophiles et relativement
solubles dans l'eau. En revanche, les substances dites hydrophobes sont contraintes par l'eau à se
regrouper afin de minimiser leur action de rupture sur le réseau des liaisons hydrogène de l'eau.
Les molécules apolaires interrompent le réseau des liaisons hydrogène de l'eau. Elles sont donc
hydrophobes et totalement insolubles dans l'eau.
LES GLUCIDES
D'origine surtout végétale, les glucides, ou sucres, résultent de l'activité photosynthétique des
végétaux. Ils forment un ensemble de substances très variées allant de petites molécules à de
macromolécules de très grande taille.
Certaines de ces substances représentent la principale source d'énergie des cellules animales et
végétales : Soit immédiatement utilisable (glucose), Soit sous forme de réserve ( amidon, glycogène,
dextranes ).D'autres jouent un rôle structural ( cellulose, chitine,.)ou de reconnaissance cellulaire.
Les glucides répondent à la formule générale (CH2O)n et sont ainsi dénommés hydrates de carbone.
Ils peuvent être classés en OSES qui sont des Monosaccharides et en OSIDES qui sont des produits de
condensation de monosaccharides donnant des Oligosaccharides ou des Polysaccharides.
Les Oses : Ce sont des sucres simples appelés aussi monosaccharides, non
hydrolysables,cristallisables,très solubles dans l'eau, mais peu solubles dans les solvants organiques,
ayant une saveur sucrée plus ou moins forte.
Les oses sont des polyalcools (présence du groupe hydroxyle-OH) dom l'une des fonctions alcool est
oxydée soit en fonction aldéhyde : classe des ALDOSES, soit en fonction cétone : classe des CETOSES.
La présence d'un carbone asymétrique ou Chiral dans le Glycéraldéhyde donne deux isomères, qui
sont des images l'un de l'autre dans un miroir. Ils ont les mêmes propriétés chimiques et ont donc le
même nom, mais n'ont pas les mêmes propriétés physiques et sont alors distingués par le préfixe D
ou L ce sont donc 2 énantiomères. Selon la position du OH porté par le carbone asymétrique. Le
mélange équimolaire de ces 2 formes constitue une solution racémique. L’aldotétrose possédant 4 C
donne 2 configurations D et 2 configurations L.
Les aldopentoses ont 3 carbones asymétriques donnant par conséquent 8 stéréoisomères. Le plus
important est le D-Ribose qui est un constituant des acides nucléiques.
Parmi les 16 hexoses possibles de formule chimique C6H1206, 3 seulement existent naturellement et
sont : Le Glucose, Le Mannose, Le Galactose.
Les Cétoses
Le cétose le plus simple est le Dihydroxyacétone Comme dans le cas des aldoses, il y a des cétoses de
la « série D» et des cétoses de la « série L ».Le principal des cétoses a 6 atomes de carbone : C'est le
Fructose. On trouve également un cétose à 7 atomes de carbone : C'est le Sédoheptulose jouant un
rôle important dans le métabolisme glucidique.
Les PROTEINES sont des Polymères d'AA monomères. La diversité infinie des PROTEINES est le
résultat de la combinaison de ces 20 AA accolés l'un après l'autre et de la multiplicité de telle
séquence.
Classes de PROTEINES: -Les HOLOPROPTEINES : qui sont des protéines simples composées
uniquement d'AA,
-Les HETEROPROTEINES : qui sont des protéines conjuguées composées d'AA et d'AUTRES
SUBSTANCES.
Les Acides Aminés sont des Acides Organiques qui portent un groupement fonctionnel
Le groupement R est appelé Chaîne Latérale ou Résidu et est spécifique à chaque AA. Ils donnent aux
AA leur degré de polarité, d'hydrophobicité, leur caractère acide, basique ou neutre en solution dans
des conditions de pH physiologiques. Un Acide Aminé ( AA ) est habituellement désigné par un
SYMBOLE a 3 lettres: Lysine = Lys; Arginine = Arg;
Propriétés physiques et chimiques des AA : les AA absorbent dans la lumière UV. L'absorption varie
avec la longueur d'onde. Cette variation constitue le Spectre d'Absorption.
Le Carbone o des AA est toujours asymétrique sauf pour la Glycine. Il en résulte que les AA sont actifs
sur la lumière polarisée et qu'ils existent donc sous 2 formes énantiomères D et L. A de rares
exceptions, ce sont les AA de forme L qui sont assimilés par les organismes vivants.
La molécule AA +ou- n'a pas de charge électrique nette sur la molécule: il s'agit de la FORME
ISOELECTRIQUE ou ZWITTERONIQUE présente à pH ISOELECTRIQUE. Au Point Isoélectrique, le pli,
correspond à la demi-somme des deux pk entourant la forme électriquement neutre
Les peptides : sont formés par des ENCHAINEMENTS d'AA liés entre eux par des liaisons appelées
LIAISONS PEPTIDIQUES.
On désigne un PEPTIDE en commençant toujours par l'AA dont l'AMINE est LIBRE ( Extrémité N-
terminale ) et en terminant par lAA dont le CARBOXYLE est LIBRE ( Extrémité C-terminale).
Structure des protéines : Structure primaire : La succession des AA liés par la Liaison Peptidique
constitue le squelette de la Chaîne Polypeptidique.
Structure Secondaire : Elle traduit l'existence de Structures Répétitives (motifs successifs) résultant
des interactions entre AA appartenant à une même chaîne ou à des chaînes différentes.
L'étude de la configuration spatiale des atomes mis en jeu dans la liaison Peptidique montre que les
Quatre Atomes du Groupe sont situés dans un même plan, et que l'Oxygène et l'Hydrogène sont
toujours en position TRANS par rapport à la Liaison C-N.La valeur très élevée de l'énergie minimale
qu'il faut fournir pour observer une rotation autour de la Liaison Peptidique (20 kcal) confirme la
Planéité du Groupe Peptidique toujours observée, à l'état cristallin comme en solution : la Liaison
Peptidique est STABILISEE PAR RESONANCE.
Les conformations particulièrement stables correspondent aux situations où les molécules sont
disposées de manière à former le maximum de LIAISONS HYDROGENE entre un donneur N-H d'un
groupe peptidique et un accepteur, l'Oxygène C-0, d'un autre groupe peptidique
CONFORMATION EN HELICE α :Les plans peptidiques successifs s'enroulent autour d'un axe, faisant
entre eux un angle de 100%, et sont translatés de 1,5 A le long de l'axe.
L'hélice comporte 360 / 100 = 3,6 AA par tour, le pas de l'hélice étant 1,5 x 3,6 = 5,4 A.
Les groupes C=0 et N-H peptidiques sont sensiblement parallèles à l'axe de l'hélice, dans une
disposition favorisant le maximum de Liaisons Hydrogène. Les Résidus R sont disposés à l'extérieur
de l'hélice. Les hélices α d'aminoacides de la série L ont un pas à droite. Mais chaque fois que la
PROLINE (ou l’HYDROXYOPROLINE) apparaît dans la chaîne peptidique, elle interrompt l'hélice et
crée une courbure de la chaîne.
Plusieurs chaînes sont associées par des Liaisons Hydrogène entre C=0 d'une chaîne et N-il d'une
autre, l'ensemble prenant l'aspect d'un FEUILLET PLISSE. Les Résidus R sont disposés de part et
d'autre des plans zigzagants du feuillet plissé, les liaisons CaR étant parallèles.
Structure Tertiaire :C'est le REPLIEMENT d'une chaîne polypeptidique déjà ordonnée en STRUCTURE
SECONDAIRE. C'est une organisation dans l'espace qui confère à une protéine sa forme et ses
propriétés biologiques ( structures compactes et extrêmement enroulées ). Dans cette forme repliée
( ou état natif), les régions hydrophobes sont enfouies à l'intérieur de la molécule et non présentées
à sa surface, ou elles seraient en contact avec le milieu aqueux.
Filament d’actine : L'hélice protéique d'ACTINE contient un double brin de sous-unités protéiques
globulaires dans lequel chaque sous-unité établit un contact avec 4 autres sous-unités.
L'hélice protéique de COLLAGENE est composée de 3 chaînes protéiques allongées qui s'entreiacent
sur une longue distance pour donner une structure en bâton très solide.
Des sous-unités protéiques globulaires assemblées en réseau hexagonal peuvent former un feuillet
plat ou un tube. C'est le cas de l'enveloppe protéique cylindrique qui constitue le virus de la
mosaïque du tabac (VMT) en enfermant tout simplement sa logue et unique molécule d'ARN
*Les Protéines GLOBULAIRES: Appelées aussi SPHEROPROTEINES en raison de leur forme OVOIDE.
Elles sont généralement PLUS SOLUBLES.
selon la SOLUBILITE : *Les ALBUMINES : Ce sont les protéines les PLUS SOLUBLES dans l'EAU.
* Les GLOBULINES: Qui sont SOLUBLES dans des Solutions SALINES Diluées.
* Les PROTAMINES et Les HISTONES : Ce sont des protéines BASIQUES de faibles Poids Moléculaires.
Elles sont SOLUBLES.
*Les PROLAMINES et Les GLUTELINES: Ce sont des protéines VEGETALES. Elles sont INSOLUBLES
dans l’EAU mais SOLUBLES dans les Solutions ACIDES et BASIQUES Diluées.
*Les SCLEROPROTEINES: Oui sont INSOLUBLES dans l'EAU ou dans les Solutions ACIDES et BASIQUES
( Actine, Myosine, Fibroine, Kératine, Collagène ).
* Les HETEROPROTEINES: Qui contiennent en plus de la chaîne polypeptidique, une partie NON
protéique appelée GROUPEMENT PROSTHETIQUE qui est lié à la protéine par une Liaison
Covalente.Dans cette classe très hétérogène on distingue :
§ Les LIPOPROTEINES : Certaines protéines sont liées à des LIPIDES par des Liaisons Van der
Waals ou des Liaisons Ioniques ( Protéines Membranaires )
Les Enzymes Ce sont des Protéines Spécialisées dans la CATALYSE des REACTIONS BIOLOGIQUES.
Certaines ENZYMES ne doivent leur ACTIVITE qu'à leur
STRUCTURE PROTEIQUE tandis que d'autres nécessitent en outre des Structures Non Protéiques ou
COFACTEURS. Le Cofacteur peut être un ION METALLIQUE encore appelé COENZYME