Activité 1.

4 : Découvrir la molécule d’ADN grâce à un logiciel de

modélisation
Réaliser un protocole, Modéliser, Utiliser le numérique.

Les cellules somatiques* spécialisées d’un organisme renferme toutes le même caryotype, car
elles proviennent par divisions successives de la cellule œuf. Le noyau renferme les
chromosomes constitués d’Acide DésoxyriboNucléique (ADN) et de protéines. Cette longue
molécule est le support de l’information génétique déterminant les caractères génétiques des
individus.

Cellules somatiques : cellules d’un organisme à l’exception des cellules sexuelles (gamètes)

Problématique : Comment l’information est-elle contenue dans les chromosomes, et que

devient-elle dans les cellules spécialisées ?

On cherche à identifier l’organisation spatiale des différents éléments qui composent la

molécule d’ADN.
Pour cela nous utilisons le logiciel Libmol : https://libmol.org/ (logiciel de visualisation de
molécule)

1) Ouvrir une fenêtre Libmol : https://libmol.org/

2) A gauche dans fichier (mot clé) rentrez : ADN, et sélectionnez ADN 14 paires de
bases
3) Aller dans Commandes, Sélectionner « tout », Représenter « bâtonnets »,
« chaînes »
Déterminez le nombre de chaînes ou brins qui composent la molécule.
La molécule d’Adn est composée de 2 chaînes (ou brins)
Décrivez en une phrase la forme générale en 3D
La molécule a une forme de « spirale », « queue de cochon » … on dit que c’est une double
hélice en spirale.
Et schématisez la forme générale de cette molécule de manière simplifiée
(Légendes : chaine ou hélice A et chaine ou hélice B).
Hélice
Chaîne A
Titre : schéma d’une portion de
Brin
la molécule d’ADN

Hélice
Chaque chaîne A et B
4) ColorerChaîne
« résidus »B
de la molécule est Brin
constituée d’une
succession d’unités, les
1 nucléotides.
qui sont tous deux invariables
Un nucléotide est
constitué par la liaison
De combien de nucléotides différents est constituée chaque chaîne ou hélice de la molécule la
molécule d’ADN ? Nommez-les.
La molécule est constituée de 4 nucléotides :
 A : adénine
 C : cytosine
 G : guanine
 T : thymine

5) Colorer « résidus », « chaines latérales et squelette »

En gris : chaînes invariables des nucléotides composés de sucres (désoxyribose) et

phosphates.
En couleur : les bases azotées des nucléotides.

Décrivez l’organisation spatiale des chaînes A et B (position respective latérale ou centrale

des parties variables et invariables de la chaine)
En position latérale se trouve les parties invariables des chaines. Alors qu’en position
centrales se trouvent les parties variables des chaines = les nucléotides.

6) Onglet en haut à droite de l’écran (logo réglages)

« Sélectionner les interactions à afficher »
« Liaisons hydrogène »

Visualisez et noter le nombre de liaisons hydrogène entre nucléotides des chaînes opposées.
Entre les nucléotides C et G il y a 3 liaisons hydrogènes
Entre les nucléotides A et T il y a 2 liaisons hydrogènes.

7) Aller dans l’onglet « séquences », vous aurez les séquences des deux chaines, c’est à
dire l’ordre des nucléotides de chaque chaîne.

Pourquoi peut-on dire que les deux chaînes de la molécule d’ADN sont complémentaires par
les bases azotées de leurs nucléotides ?
En regardant la séquence, on peut voir que C est toujours en face de G et que A est toujours
en face de T.
8) Complétez le schéma simplifié distribué de la molécule d’ADN (titre, légendes,
utilisation de couleurs...)

Coloriez :
- en jaune les bases azotées,
- en vert les phosphates (partie la plus externe de la chaine invariable)
- en bleu les désoxyriboses (sucre).

Entourez en rouge un nucléotide sachant qu’un nucléotide comprend :

- un phosphate,
2
 - un sucre
- et une base azotée appartenant à une même chaine

Ajoutez dans les bases, leur nom avec A pour adénine, G pour guanine, C pour cytosine
et T pour thymine. Attention à respecter la complémentarité.

Placer les légendes chaîne A et chaîne B

Schéma de la structure de la molécule d’ADN.