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I- Introduction à la Bactériologie
C’est quoi un micro-organisme ???
Définition
✓L'eau,
✓L'air
✓Le sol
✓Chez le végétal
✓Chez l'animal
✓ Chez l'homme, à leur surface et dans
leurs cavités naturelles.
Classification
Cellule
animale
Cellule d’une
bactérie
Cellule
végétale
Les "procaryotes"
Dans ce groupe, il y a:
Bactérie, chlamydia, rickettsie, mycoplasme,
spirochète et actinomyces.
Les "eucaryotes"
Elle consiste à:
➢Caractériser les bactéries,
➢Les classer sur la base de leur similitude en groupes ou taxons,
(genres, espèces...),
➢Appliquer le code international de la nomenclature bactérienne
pour les nommer (Exp: Escherichia coli ),
➢Identifier de nouveaux organismes et déterminer leur
appartenance ou non a l’une des espèces connues.
Taxonomie bactérienne
Streptocoques
Streptococcus
2
Tétrades
1 3
Grappes de raisin Staphylococcus aureus
2
Les bâtonnets
Bacilles isolés
Rhodospirillum sodomense
Les bâtonnets
Diplobacilles
Les bâtonnets
Streptobacilles
Lactobacillus delbrueckii
Les bâtonnets
Streptobacilles
Lactobacillus delbrueckii
Les formes spiralées
Rigide "exosquelette"
a. Les phospholipides
b.Les protéines
c. Les glucides
d.Les enzymes
Fonctions de la membrane
Peptidoglycane
Staphylocoques Streptocoques
Cocci à Gram négatif
COLORATION DE GRAM
Bacilles à Gram positif
a) Chromosome
c) le cytoplasme
chlorophylles
- La phototrophie bactériochlorophylle
Caractéristique des
organismes vivants qui tirent
- La chimiotrophie leur énergie à partir de la
lumière par photosynthèse.
Nicotinamide adénine
dinucléotide phosphate
Définition de la respiration
Processus énergétique :
- dont le point de départ est l’oxydation d’une molécule
ce qui libère des électrons pris en charge par un
coenzyme qui se trouve ainsi réduit,
- et au cours duquel la réoxydation des coenzymes
réduits met en jeu une chaîne de transporteurs avant la
réduction d’un accepteur final, le plus souvent minéral, ce
qui permet la production d’une grande quantité d’ATP.
Accepteur final (oxydant 2) =
- O2 : respiration aérobie
- autre composé minéral (NO3-, NO2-, SO42-, CO2 …) : respiration
anaérobie
- Parfois molécule organique comme fumarate
Définition de la fermentation
Processus énergétique :
- dont le point de départ est l’oxydation d’une
molécule ce qui libère des électrons pris en charge
par un coenzyme qui se trouve ainsi réduit,
- et au cours duquel la réoxydation des
coenzymes réduits s’effectue directement sans
passage par une chaîne de transporteurs, l’accepteur
des électrons étant une molécule organique.
Quelques voies d’oxydation
dans le cas de glucose
➢ Principale voie métabolique utilisée par les
microorganismes pour oxyder le glucose : la glycolyse.
Deux mécanismes
possibles de synthèse de NAD+ NADH,H+
l’ATP :
• au niveau des réactions,
• par la chaîne respiratoire
Chaîne
respiratoire
Oxydant 2 Réducteur 2
Les trois grands temps
Permet :
- la réoxydation des coenzymes réduits par le transfert
des électrons au niveau d’une chaîne respiratoire vers le
dioxygène
- la production d’une grande quantité d’ATP.
Les chaînes de transport des électrons sont :
- situées dans la membrane plasmique des bactéries et
dans les mitochondries des levures et des moisissures
- constitués de composés dont les potentiels d’oxydo
réduction sont tels que chaque membre peut être réduit par
la forme réduite du composé précédent
- constitués de composés qui, certains, transportent des
électrons et des protons et d’autres qui ne transportent
que des électrons
E. coli
Bilan énergétique de la respiration
La respiration aérobie
-Chez les eucaryotes : 38 ATP par mole de glucose
-Chez les bactéries : un peu plus faible que 38 ATP par
mole de glucose, mais de toute façon plus que par
fermentation
Définition
Processus producteur d’énergie en anaérobiose dans
lequel la réoxydation des coenzymes réduits met en jeu
une chaîne de transporteurs d’électrons où l’accepteur
terminal d’électrons est une molécule minérale autre que
O2 (ou éventuellement le fumarate).
La respiration anaérobie
Flavin mononusléotide
La fermentation
Fermentation lactique:
glucose acide lactique + énergie
enzymes
Fermentation alcoolique:
Acide
pyruvique Acide pyruvique Acid pyruvique
+
oxygène
Dioxyde de carbone
Acide lactique +
Dioxyde de carbone
+
+ alcool
eau +
4 ATP
+
36 ATP 4 ATP
Fermentation lactique
Il vient tout juste d’être question des exemples les plus connus : la
fermentation anaérobie d’aliments utilisée par les industries laitière,
brassicole et vinaire. On a adapté une grande partie de cette
technologie à la fabrication d’autres produits industriels, tels que
l’insuline et l’hormone de croissance humaine, en ayant recours à des
microorganismes génétiquement modifiés. La biotechnologie se sert
aussi de la fermentation industrielle pour fabriquer des substances
utiles à partir de cellules végétales ou animales. Ainsi, on emploie des
cellules animales pour produire des anticorps monoclonaux.
Les diverses techniques de
culture
Les microorganismes peuvent servir d’aliments en tant que tels, mais ils sont très
généralement utilisés comme agents pour convertir des aliments de bases tels que le
produire des agents de sapidité ou des exhausteurs de goût et contribuer dans ce cas à
la qualité des aliments. Les compléments alimentaires obtenus par des fermentations
nutritionnelle de l’aliment.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Aliments
Protéines d’organismes unicellulaires
La biomasse microbienne brute, qualifiée de protéines d’organismes unicellulaires, ou
SCP (de l’anglais Single-Cell Protein), peut être utilisée comme source d’alimentation
humaine et animale. Les SCP sont intéressantes dans les régions où les conditions
climatiques sont défavorables aux cultures et pour les populations soumises à un
risque élevé de famine. Une source potentielle de nourriture consiste alors à cultiver
des bactéries ou des levures en présence de substrats non comestibles pour
l’homme, ces microorganismes servant alors directement de nourriture.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Agaricus bisporus et Lentinus edulus font partie des principaux champignons cultivés
aux Etats-Unis et sont couramment commercialisés dans les épiceries. Aucun des
matériaux utilisés pour la préparation du compost nécessaire pour la croissance des
champignons n’est onéreux et n’est utilisable pour une autre application. Les
champignons sont cultivés à une température et une hydrométrie contrôlées et à
l’obscurité.
Agaricus bisporus
Lentinus edulus
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Les champignons ont une faible valeur nutritive et sont consommés généralement en raison
de leur texture et de leur goût caractéristique. Ils sont peu riches en protéines, quasiment
dépourvus d’acides gras et ne contiennent que de faibles taux de vitamines B.
Certaines bactéries ont été cultivées dans un premier temps pour l’alimentation animale. Par
exemple, l’utilisation de méthanol, substrat peu coûteux, par les bactéries oxydant ce
substrat a permis leur production dans de grands fermenteurs en Grande-Bretagne pour
servir comme SCP dans l’alimentation des poulets.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Fromages et yaourts
Les yaourts et les autres produits laitiers fermentés sont des aliments couramment
utilisés à travers le monde. Les yaourts commercialisés sont fabriqués à partir de lait
pasteurisé écrémé par perte d’eau ou l’ajout de lait en poudre. Ce lait épaissi est
inoculé par un mélange de Streptococcus thermophilus et de Lactobacillus bulgaricus
et incubé à 45°C pendant 12 heures. La croissance de S. thermophilus produit de
l’acide lactique et L. bulgaricus contribue -à l’apport en acide lactique et en arômes
pour apporter son goût caractéristique au yaourt.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Le fromage est un aliment ancien dont les premières utilisations précèdent sans
doute les premiers écrits de l’histoire. La fabrication du fromage a pour origine le
Moyen-Orient. Elle s’est répandue ensuite par la Grèce et Rome dans l’Europe du
Nord et l’Angleterre et enfin dans le reste du monde. Plusieurs centaines de variétés
de fromages sont fabriquées, dont plusieurs sont très semblables et ne diffèrent que
par le nom.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Des bactéries qui fermentent le lactose en acide lactique sont ajoutées au lait. Ces
microorganismes acidifiants sont des souches de Streptococcus lactis, Lactobacillus
cremoris, Lactobacillus bulgaricus ou Streptococcus bulgaricus. Certaines de ces
bactéries sont piégées dans le caillé et restent dans le fromage où elles sont alors
impliquées dans le processus de maturation ou affinage.
Le caillé, une fois séparé du petit-lait (lactosérum), est mis en forme. Ce processus
implique un ajustement du pH, un salage, et une mise en forme physique pour assurer
un contenu en humidité et une production acide convenable, tous ces éléments
contribuant aux caractéristiques finales du fromage.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Les fromages à pâte molle sont affinés durant quelques semaines, les semi-durs
durant quelques mois et les fromages à pâte dure, comme le parmesan, pendant au
moins un an.
Certaines caractéristiques spécifiques des fromages sont les résultats de la
croissance bactérienne. Les bactéries productrices d’acide propionique sont
responsables des trous caractéristiques présents sur les fromages « suisses »
(emmental, gruyère) et l’acide propionique est responsable du goût fort de ces
fromages.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Levures
Les cellules de levure peuvent être des sources de SCP ou employées en
tant que complément alimentaires. Un certain nombre de composés
biochimiques commerciaux, tels que des enzymes, des nucléotides ou des
vitamines naturelles, sont obtenus à partir de levures. Un composant
commun des milieux de culture microbienne est l’extrait de levure, constitué
de la fraction soluble dans l’eau de levures autolysées. Cet extrait est une
source de vitamines B, d’acides aminés et d’autres facteurs de croissance.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
La cellule de levure :
C’est un organisme vivant de la famille des champignons, appelés
scientifiquement :
“Saccharomyces cerevisiae”.
Elle se nourrit de sucre et possède la propriété de transformer les
sucres naturellement présents dans la farine en dioxyde de carbone et
en alcool.
Cette transformation se nomme “fermentation alcoolique”.
La levure de boulangerie
La cellule de levure :
C’est un organisme vivant de la famille des champignons, appelés
scientifiquement :
“Saccharomyces cerevisiae”.
Elle se nourrit de sucre et possède la propriété de transformer les
sucres naturellement présents dans la farine en dioxyde de carbone et
en alcool.
Cette transformation se nomme “fermentation alcoolique”.
La levure de boulangerie
Les levures : les micro-organismes les plus cultivés
Elles sont utilisées dans de nombreuses industries :
• Brasserie (Bière)
• Industrie vinicole (vins & champagne)
• Industrie des arômes.
• Industrie pharmaceutique (enzymes, vitamines, hormones,
vaccins, insuline).
• Agroalimentaire (exhausteurs de goût, aliments diététiques
enrichis en fer, zinc, chrome sélénium).
• Alimentation animale (produits probiotiques).
• Boulangerie – Viennoiserie
La levure de boulangerie
Vie de La levure
La levure possède la particularité de vivre avec ou sans air :
Vie aérobie
La levure en présence d’air (aérobie) respire, l’énergie utilisée
lui permet de se reproduire.
Cette fonction est utilisée dans la fabrication industrielle de la
levure.
La levure de boulangerie
La levure de boulangerie
Schéma de fonctionnement :
La membrane cellulaire fonctionne comme une barrière régulatrice
entre le milieu intérieur et le milieu extérieur (régulateur de la pression
osmotique).
Action de la membrane cellulaire comme agent régulateur des
échanges : substances nutritives, air, alcool, gaz carbonique, eau ….
Présence dans le cytoplasme des éléments indispensables : noyau,
vacuole (sucs cellulaires), mitochondries (support d’O2), et enzymes.
La levure de boulangerie
Vie anaérobie
La levure de boulangerie
Vie anaérobie
Doses usuelles
En panification directe.
On admet des doses usuelles et maximales de levure de :
• 20 g à 40 g par litre de coulage,
• 10 g à 24 g par kg de farine soit environ 1 à 2% du poids de farine.
La levure de boulangerie
Incorporation de la levure
Elle peut être émiettée sur la pâte en début de pétrissage ou délayée dans
l’eau de coulage si la température de celle-ci est modérée.
• délayée dans l’eau froide, elle voit son action ralentie,
• délayée dans l’eau chaude (température supérieure à 50°C) elle est
détruite,
• délayée dans l’eau tiède (température supérieure à 40°C) elle est affaiblie.
La température optimale pour son action est comprise entre 24 et 30°C.
La levure de boulangerie
La levure de boulangerie
Qualités d’une levure fraîche : principaux critères
Influence de l’hydratation
L’eau facilite l’activité de la levure, en dissolvant les constituants
fermentescibles, et en favorisant l’action des enzymes La baisse de
l’hydratation ou augmentation de la consistance de la pâte ralentit
l’activité levurienne.
La levure de boulangerie
Influence du pH :
L’acidité optimale pour l’action de la levure se situe entre un pH de 4,5
et 6. Le ph du pain réalisé sur direct se situe vers 5,6 et 5,7.
La levure de boulangerie
Influence de la température :
Depuis les années 1950 les souches de levures ont été méthodiquement
sélectionnées, hybridées afin d’améliorer leur puissance fermentative et leur
conservation.
La levurerie utilise les caractéristiques de vie aérobie de la levure pour la
production industrielle.
Une cellule de levure peut donner naissance à une nouvelle cellule toutes les
20 minutes, ainsi, en 3 jours une seule cellule a produit 17 millions de cellules
nouvelles.
La levure de boulangerie
Fabrication de la levure
Fabrication de la levure
La levure de boulangerie
3e Etape : Extraction
En fin de fermentation, le mélange est de nouveau centrifugé pour
séparer la levure des résidus de mélasse. Cette opération peut être
répétée plusieurs fois, avec un lavage à l’eau. On obtient alors de
la levure-crème, qui est refroidie à la température de +4°C.
La levure de boulangerie
4e Etape : Déshydratation
Au sortir des centrifugeuses, la crème de levure contient encore
plus de 30 % d’eau extra-cellulaire. Cette eau est éliminée sur un
tambour rotatif sous vide.
La levure de boulangerie
5e Etape : Conditionnement
La levure, raclée sur le filtre rotatif, tombe dans une trémie pour y être
malaxée (incorporation d’air) et finalement envoyée dans un tube d’extrusion
pour former un boudin pâteux continu. En sortie, le boudin est découpé en
blocs de 500 g qui sont immédiatement emballés dans du papier alimentaire
sulfurisé.
La levure peut être aussi livrée sous forme de Crème de levure à la suite de la
3e étape. (Voir illustration ci-dessus)
La levure de boulangerie
La levure de boulangerie
La fermentation panaire
La détente
Elle suit le divisage et précède le façonnage. La détente est d’autant plus
importante que le divisage est plus brutal ; elle permet à la pâte de se relaxer
et de mieux « passer » l’opération de façonnage. La fermentation continue
évidemment pendant la détente, c’est pourquoi, sa durée est dans la
pratique, souvent incluse dans celle du pointage.
La détente peut se faire sur un « tour » ou dans un meuble « parisien » et
plus généralement dans une armoire spéciale (ou chambre, dite « à
balancelles ») où température et humidité relative sont mieux maîtrisées.
La fermentation panaire
Salamis Jambons
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Choucroute
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Les cornichons
Sont produits en plaçant de petits concombres dans une saumure contenant de
l’aneth et d’autres agents de saveur. La concentration en sel (NaCl), initialement de
5%, est augmentée à 15,9% sur une période allant de 6 à 9 semaines. La forte
concentration en sel permet d’extraire les sucres des concombres pour fermenter en
acide lactique. Ainsi, la production artisanale des cornichons est le résultat de la
fermentation lactique par la biomasse endogène des concombres. La production
commerciale est accomplie après stérilisation des concombres et ajout de cultures de
Pediococcus cerevisiae et L. plantarum pour assurer l’obtention d’un produit uniforme.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Cornichons
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Le chocolat
Est dérivé du caco, une graine ou fève contenue dans les fruits d’une plante
qui pousse en Asie, en Afrique et en Amérique du sud. Les fèves sont
extraites du fruit et fermentées en caisses durant plusieurs jours. La
fermentation a lieu en deux étapes :
(a) les sucres de la pulpe sont convertis en alcool
(b) l’alcool est oxydé en acide acétique. Les levures impliquées dans la
production d’alcool au cours de la première étape sont essentielles pour
le développement du goût et de l’arôme du chocolat.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
Les olives
La fermentation des olives a lieu après un traitement par 1,6 à 2% de lessive
de soude à 24°C durant 4 à 7 heures. Ce traitement retire le principe amer
(oleuropéine) de l’olive verte. La lessive est retirée par rinçage et les olives
sont placées dans des tonneaux en chêne avec un ajout de 7% de sel.
L’ensemble est inoculé par Lactobacillus plantarum et fermenté pendant 8 à
10 mois.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
La sauce au soja
Est préparée en mélangeant des grains de soja trempés et chauffés à la vapeur avec
du blé écrasé en présence d’Aspergillus oryzae ou A. soyae. Ce mélange est incubé
plusieurs jours au cours des quels les grains libèrent les sucres fermentescibles, les
peptides et les acides aminés. Ces grains couverts de champignons sont ensuite
placés en milieu liquide et du sel est graduellement ajouté jusqu’à une concentration
finale de 18%. La période d’incubation totale est d’un an à température ambiante.
L’addition de sel conduit au remplacement des champignons filamenteux par des
bactéries productrices d’acide lactique et de levures. Les bactéries et les levures
prédominantes sont respectivement des souches de Lactobacillus delbrueckii, et de
Saccharomyces rouxii. Le liquide résultant de cette longue fermentation est la sauce
au soja. Les solides sont pressés et utilisés pour l’alimentation humaine ou animale.
Aliments, agents de sapidité, compléments alimentaires,
vitamines et boissons
La vendange
La vendange
Fabrication du vin : le processus en 5 étapes
La vendange
La vendange
Une fois les raisins triés, ils sont prêts à être égrappés et foulés.
Pendant des années, les hommes et les femmes l’ont fait
manuellement, en piétinant les raisins. Aujourd’hui, la plupart des
vignerons le font à l’aide d’une machine. Des presses
mécaniques écrasent ou foulent le raisin. On obtient alors ce
qu’on appelle le moût. Il s’agit simplement de jus de raisin
fraîchement pressé qui contient les peaux, les graines et les
débris solides. La presse mécanique a incroyablement amélioré
les conditions sanitaires mais aussi la longévité et la qualité du
vin.
Fabrication du vin : le processus en 5 étapes
Le foulage et le pressurage
Fabrication du vin : le processus en 5 étapes
Le foulage et le pressurage
La fermentation
La fermentation
Fabrication du vin : le processus en 5 étapes
La fermentation
La clarification
La clarification
Fabrication du vin : le processus en 5 étapes
La clarification
Après la maturation, les vins sont mis en bouteille, qui sont soit
fermées par un bouchon de liège ou par une capsule à vis selon
la préférence du vigneron.
Fermentations et alimentation