Chap3 1 Enveloppes 2012

UE C0SE1001
UNITE et DIVERSITE du VIVANT
BIOLOGIE MICROBIENNE
Introduction
I - unité du vivant
II - diversité du monde microbien
III - structures et fonctions liées aux contraintes de la vie
unicellulaire :
1. les enveloppes cellulaires
2. génome
3
3. reproduction – prolifération
UE SE1001
UNITE et DIVERSITE
UNIT IV RSIT du VIVANT
III 1 Les
III.1 L enveloppes
l cellulaires
ll l i
III.1 Les enveloppes
pp cellulaires
A) Toute cellule est entourée par une membrane plasmique
B) Les enveloppes externes
C) Les enveloppes intracellulaires

III.1 LES ENVELOPPES CELLULAIRES
A)) Toute cellule est entourée p

par une membrane plasmique
p q
1. Les membranes sont constituées de phospholipides et de

protéines
2. La diversité des lipides
3. Structure
4. Renforcement par des dérivés terpéniques
5. Rôles de la membrane plasmique

MEMBRANE PLASMIQUE
1. Les membranes sont constituée de phospholipides et de protéines
50% de protéines et 50% de lipides

MEMBRANE PLASMIQUE
2 La diversité des lipides

2.
• Liaisons ester ou liaisons éther
Archées
Isoprénoïdes ramifiés
liés au glycérol (éther)
Bactéries et Eucaryotes
Acides gras liés au
glycérol (ester)
MEMBRANE PLASMIQUE
• Une diversité de radicaux
Phosphatidyléthanolamine (bactéries) Phosphatidylglycérol (eucaryotes)
CH2OH
CHOH
CH2
Grande diversité (archées)

MEMBRANE PLASMIQUE
3. Structure
Bicouche phospholipidique : fluidité

Epaisseur 10nm
MEMBRANE PLASMIQUE
BACTERIE : structure en double couche
ARCHEE : structure en simple couche

MEMBRANE PLASMIQUE
4. Renforcement par des dérivés terpéniques
Ergostérol (champignons)
Phytostérols : Stigmastérol,
sitostérol (végétaux)
MEMBRANE PLASMIQUE
5. Rôles de la membrane plasmique
• Barrière perméable et sélective

MEMBRANE PLASMIQUE
• Nombreuses fonctions grâce aux

enzymes qui lui sont associées
MEMBRANE PLASMIQUE
Vi
Vivre sous des
d ttempératures
é t élevées
él é
• Renforcement de la structure des protéines

• Lipides membranaires ramifiés + proportion de lipides tetra éther
(monocouche)
Vivre sous des températures basses
• Modification de la composition en acides aminés des protéines pour

maintenir la flexibilité
• Augmentation de la proportion d’acides gras insaturés dans les
membranes (maintient de la fluidité)
.........................

1. Constituants majeurs : les polysaccharides
2. Cellulose et paroi des végétaux
3. Chitine et p
paroi des champignons
pg
4. Les enveloppes des bactéries
5. Les enveloppes des archées
6
6. Test des protozoaires
7. Comparaison
8. Rôle

ENVELOPPES EXTERNES
1. Constituants majeurs : les polysaccharides
• Cellulose : un polymère de glucoses

((liaisons 1-4))
• Chitine : un polymère d’acétylglucosamines
(liaisons 1-4)
• Peptidoglycane = muréine : un hétéropolymère

d’acétylglucosamine + acide N-acétyl-muramique
(li i
(liaisons 1-4)
1 4)
• Pseudomuréine : polymère d’ acétylglucosamine et

d’acide acétylalosaminuronique (liaisons 1-3)
ENVELOPPES EXTERNES : VEGETAUX
2. Cellulose et p
paroi des végétaux
g
Quelques cas particuliers…
Dépôts de calcaire :
Dépôts de silice : Coccolithophoracée
Diatomées
ENVELOPPES EXTERNES : CHAMPIGNONS
3. Chitine et paroi des champignons

ENVELOPPES EXTERNES : BACTERIES
4. Les enveloppes des bactéries

a) La paroi
• Unité : la muréine
Muréine = peptidoglycane
o La paroi est présente chez la plupart des bactéries (sauf les mycoplasmes)
Mycoplasma pneumoniae
(x 130.000)
o La paroi permet de répartir la plupart des bactéries en deux groupes.

Répartition basée sur la coloration de Gram (1884) : bactéries Gram+ et
b é i Gram-
bactéries G
• Diversité
La paroi des bactéries Gram positif

La paroi des bactéries Gram négatif

Lipopolysaccharide
Gram +
Gram -
Cabeen et Jacobs‐Wagner (2005). Nature reviews / Microbiology 3: 601‐610

…en résumé….
Bactéries à Gram positif Bactéries à Gram négatif
Aspect en microscopie Une couche épaisse et amorphe. Deux couches séparées par un
électronique espace clair.
Présence d'une membrane Non Oui
externe
Présence d'un espace Non Oui
périplasmique
Peptidoglycane Épais (10 à 80 nm), représente Mince (2 à 6 nm), représente
40 % du poids sec, détermine la moins de 10 % du poids sec,
morphologie bactérienne. détermine la morphologie
b éi
bactérienne.
Acides téchoïques Présents Absents
Présence de protéines Possible : liaisons covalentes Fréquente
avec le peptidoglycane
peptidoglycane, rôle
éventuel dans le pouvoir
pathogène, rôle éventuel dans
l'antigénicité spécifique.
Présence de polysaccharides Possible : antigènes spécifiques Possible
de groupe pour certaines
espèces
Lipopolysaccharides Absents Présents
b) La couche S
Constituée de protéines ou de glycoprotéines généralement d'un poids

moléculaire élevé (40 à 200 kDa), disposées régulièrement
Couche S
c) La capsule
Élément facultatif
Constituée de polysaccharides
d) Slime
Polysaccharides de surface libérés dans le milieu (bactéries aquatiques surtout)
Formation de masses gluantes auxquelles adhérent des matières en suspension

ENVELOPPES EXTERNES : ARCHEES
5. Les enveloppes des archées
a) Des protéines de surface : S-layer
Couche principalement composée

d’une seule protéine ou
glycoprotéine de 40 à 200 kD qui
est le p
plus souvent associée à la
membrane plasmique. Gram +
Certaines archées ne possèdent pas

de couche S
Gram -
La couche S est largement répandue chez les archées. On la trouve aussi dans différents
groupes phylogénétiques de bactéries. Elle pourrait donc être la première structure
pariétale apparue.
Ces protéines ont la propriété de s’assembler (6 monomères maximum)

pour former des structures cristallines,
cristallines très organisées,
organisées présentant
différentes symétries.
b) Une couche protéique supplémentaire dans certains cas
Couche
C h ttrès
è peu perméable
é bl
Très stable
Confère une très grande résistance
c) Existence d’un
d un pseudopeptidoglycane chez certaines archées
Pseudomuréine : acide acétylalosaminuronique et acétylglucosamine

(liaisons 1,3) ; polymères reliés par des peptides de 3 acides aminés.
RAPPEL : Muréine = acide acétylmuramique et acétylglucosamine (liaisons 1,4)

1 4) ; polymères
reliés par des peptides de 4 acides aminés
NB : aucune homologie entre les protéines impliquées dans la biosynthèse de la muréine

et celles impliquées dans la biosynthèse de la pseudomuréine, ce qui suggère que les 2
voies de synthèse ont évolué séparément.
Archées Bactéries
Gram +
Gram -
Albers et al. (2006). Nature reviews / Microbiology 4: 537‐547
Cabeen et Jacobs‐Wagner (2005). Nature reviews / Microbiology 3: 601‐610

ENVELOPPES EXTERNES : PROTOZOAIRES
6. Test des protozoaires
Les Foraminifères
Entourés d'un test le plus souvent

calcaire ppossédant plusieurs
p loges
g et
muni d'un ou plusieurs foramen
1 cm
Calcarina
ENVELOPPES EXTERNES : PROTOZOAIRES
Les Radiolaires Actinopodes

p
Squelette
S l tt composéé de
d spicules
i l radiaires
di i ett
symétriques, le plus souvent siliceux.
ENVELOPPES EXTERNES : COMPARAISON
7. Comparaison des enveloppes
Membrane Paroi
Archées Pseudo-peptidoglycan
Pseudo peptidoglycan
Isoprénoïdes– ether
ou protéines
Bactéries AG - ester Peptidoglycan (+ capsule parfois)
Mycètes AG - ester Chitine
AG - ester Cellulose, Si, Ca

Algues
Animaux AG - ester Pas de paroi, glycocalyx
Test siliceux,
Protozoaires AG - ester
calcaire
ENVELOPPES EXTERNES : ROLES
8. Rôle des enveloppes
• La paroi maintient la forme de la cellule…
Protoplaste
P t l t de d Protoplaste de
cellule de feuille cellule de feuille
de poireau de chou rouge
…protège …
…assure la flottaison (phytoplancton)
Ceratium
Scenedesmus
…mais peut être toxique (lipopolysaccharides de la paroi des bactéries Gram-)

• La couche S
Rôle de squelette
Adhésion
Résistance (contre protéases des macrophages, contre bactériophages)

• La capsule
Aucun rôle vital (sans capsule la

multiplication
l i li i est possible)
ibl )
Rôle dans le pouvoir pathogène :

s’oppose à la phagocytose
1. Les procaryotes ne sont pas compartimentés

2. Les eucaryotes possèdent des compartiments limités par une ou
plusieurs membranes
p
a) Des compartiments limités par une membrane
b) Mitochondries
c) Hydrogénosomes
yd ogé oso es
d) Chloroplastes
e) Intérêt de la compartimentation
3
3. Des procaryotes particuliers : les planctomycètes
PROCARYOTES : PAS DE COMPARTIMENTATION
1. Les p
procaryotes
y ne sont pas
p compartimentés
p
PROCARYOTES : PAS DE COMPARTIMENTATION
Mais
présence de thylakoides
chez les Cyanobactéries
EUCARYOTES : COMPARTIMENTATION
2. Les eucaryotes possèdent des compartiments limités par

une ou plusieurs membranes
a) Des compartiments limités par une membrane

Stockage, croissance
Information génétique
Dégradation
Synthèse et
maturation des
proténes
té
Synthèse et
maturation des
lipides
Synthèse et sécrétion
b) Mitochondrie
Entourée de deux membranes
Contient du matériel génétique

(ADN)
Siège de la respiration aérobie

Origine endosymbiotique de la mitochondrie
Taille mitochondrie et taille bactérie (1m)
La membrane interne de la mitochondrie

ressemble à la membrane plasmique
bactérienne (chaînes respiratoires)
Mitochondrie Bactérie
Origine endosymbiotique de la mitochondrie
Taille mitochondrie et taille bactérie (1m)
La membrane interne ressemble à la membrane plasmique

bactérienne (chaînes respiratoires)
Ribosomes mitochondriaux sensibles aux

antibiotiq es (chloramphénicol)
antibiotiques
Parenté ADN mitochondrial et ADN

bactérien
ARN 23S
La mitochondrie dériverait d'une -protéobactérie.

U partie ddu génome
Une é bactérien
b é a été
é é transféré
fé é dans
d le
l noyau.
c) Hydrogénosome
Entouré de deux membranes
Siège de la respiration anaérobie
P d’ADN
Pas
d) Chloroplaste
Entouré par deux membranes
Possède des pigments

(chlorophylles, caroténoïdes)
Contient du matériel génétique

(ADN)
Espace
Thylacoïde intermembranaire
Siè de
Siège d la
l photosynthèse
h hè
Stroma
Granum
Origine endosymbiotique du chloroplaste
Génome circulaire comme

chez les bactéries (ADN lié à
la membrane et pas
d histones)
d’histones)
Taille des ARNr identique

dans les chloroplastes et les
bactéries
Taille chloroplaste
p = taille
Cyanobactérie (10m)
Présence de thylakoïdes et
pigments (2 photosystèmes)
comme dans les
Cyanobactéries
Chloroplaste Cyanobactérie
Origine endosymbiotique du chloroplaste
Génome circulaire comme chez les bactéries

(ADN lié à la membrane et pas d’histones)
d histones)
Taille des ARNr identique dans les

chloroplastes et les bactéries
T ill chloroplaste
Taille hl l t = taille
t ill Cyanobactérie
C b té i
(10m)
Présence de thylakoïdes et pigments (2

photosystèmes) comme dans les
Cyanobactéries
Parenté ADN plastidial et

ADN bactérien
ARN 23S
Le chloroplaste dériverait des cyanobactéries

La diversité des chloroplastes

chez les algues
s’explique par 2 voire 3

endosymbioses successives
e)) Intérêt de la compartimentation

p
• Optimise les paramètres favorables aux cinétiques enzymatiques

• Autorise les réactions antagonistes
• Partage des tâches entre les compartiments
• Augmentation
A t ti ded la
l taille
t ill des
d cellules
ll l
• Impose des échanges entre les compartiments
PLANCTOMYCETES
3. Des p
procaryotes
y particuliers
p : les p
planctomycètes
y
The nucleated prokaryote: Gemmata obscuriglobus.

Fuerst. Annu. Rev. Microbiol.2005. 59:299–328
PLANCTOMYCETES
PLANCTOMYCETES
• Les planctomycètes auraient conservé des caractéristiques

d’eucaryotes possédées par l’ancêtre commun (LUCA) aux 3 règnes du
vivant.
PLANCTOMYCETES
• Les planctomycètes auraient conservé des caractéristiques d’eucaryotes possédées par

l’ancêtre commun (LUCA) aux 3 règnes du vivant.
• Les planctomycètes auraient développé des caractéristiques

d’eucaryotes par évolution convergente à cause de besoins adaptatifs et
pression de sélection similaires à ceux subis par les eucaryotes.
• Il y aurait eu transfert de ggènes entre cellules eucaryotes

y et certaines
bactéries qui auraient donné les planctomycètes.
• Les planctomycètes auraient acquis peu à peu des caractéristiques

eucaryotes (compartimentation, endomembranes, endocytose) et les
gènes responsables auraient été transférés dans une cellule dite « proto-
eucaryote » qui serait devenue ll’ancêtre
ancêtre commun à tous les eucaryotes
modernes.

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UNITE et DIVERSITE du VIVANT

A) Toute cellule est entourée par une membrane plasmique

B) Les enveloppes externes

C) Les enveloppes intracellulaires

A)) Toute cellule est entourée p

1. Les membranes sont constituées de phospholipides et de

B) Les enveloppes externes

C) Les enveloppes intracellulaires

1. Les membranes sont constituée de phospholipides et de protéines

50% de protéines et 50% de lipides

2 La diversité des lipides

• Liaisons ester ou liaisons éther

• Une diversité de radicaux

Phosphatidyléthanolamine (bactéries) Phosphatidylglycérol (eucaryotes)

Grande diversité (archées)

Bicouche phospholipidique : fluidité

BACTERIE : structure en double couche

ARCHEE : structure en simple couche

4. Renforcement par des dérivés terpéniques

5. Rôles de la membrane plasmique

• Barrière perméable et sélective

• Nombreuses fonctions grâce aux

• Renforcement de la structure des protéines

Vivre sous des températures basses

• Modification de la composition en acides aminés des protéines pour

A) Toute cellule est entourée par une membrane plasmique

B) Les enveloppes externes

C) Les enveloppes intracellulaires

1. Constituants majeurs : les polysaccharides

• Cellulose : un polymère de glucoses

• Peptidoglycane = muréine : un hétéropolymère

• Pseudomuréine : polymère d’ acétylglucosamine et

Quelques cas particuliers…

3. Chitine et paroi des champignons

4. Les enveloppes des bactéries

o La paroi permet de répartir la plupart des bactéries en deux groupes.

La paroi des bactéries Gram positif

La paroi des bactéries Gram négatif

Cabeen et Jacobs‐Wagner (2005). Nature reviews / Microbiology 3: 601‐610

Constituée de protéines ou de glycoprotéines généralement d'un poids

Polysaccharides de surface libérés dans le milieu (bactéries aquatiques surtout)

Formation de masses gluantes auxquelles adhérent des matières en suspension

5. Les enveloppes des archées

a) Des protéines de surface : S-layer

Couche principalement composée

Certaines archées ne possèdent pas

Ces protéines ont la propriété de s’assembler (6 monomères maximum)

b) Une couche protéique supplémentaire dans certains cas

Pseudomuréine : acide acétylalosaminuronique et acétylglucosamine

RAPPEL : Muréine = acide acétylmuramique et acétylglucosamine (liaisons 1,4)

NB : aucune homologie entre les protéines impliquées dans la biosynthèse de la muréine

Albers et al. (2006). Nature reviews / Microbiology 4: 537‐547

Cabeen et Jacobs‐Wagner (2005). Nature reviews / Microbiology 3: 601‐610

6. Test des protozoaires

Entourés d'un test le plus souvent

Les Radiolaires Actinopodes

Bactéries AG - ester Peptidoglycan (+ capsule parfois)

Mycètes AG - ester Chitine

AG - ester Cellulose, Si, Ca

8. Rôle des enveloppes

• La paroi maintient la forme de la cellule…

…assure la flottaison (phytoplancton)